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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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9381 | 2025-10-07 |
Gene Regulation of Neutrophils Mediated Liver and Lung Injury through NETosis in Acute Pancreatitis
2025-Feb, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02071-w
PMID:38884700
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证,揭示了中性粒细胞通过NETosis在重症急性胰腺炎介导的肝肺损伤中的关键作用 | 首次系统性鉴定出FPR1、ITGAM和C5AR1作为NETs形成的关键基因,并证明抑制NETs释放可减轻SAP的全身炎症反应和肝肺损伤 | 研究主要基于小鼠模型和公共数据库数据,需要在人类患者中进行进一步验证 | 探索重症急性胰腺炎介导多器官损伤的分子机制 | 小鼠胰腺组织、肝组织、肺组织及外周血 | 生物信息学 | 急性胰腺炎 | 转录组测序, RT-PCR, 免疫组化, ELISA, 免疫荧光, 单细胞测序 | Limma, DEseq2, ssGSEA, ROC分析 | 基因表达数据, 组织切片图像, 血清蛋白数据 | 小鼠胰腺、肝、肺组织及人类外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
9382 | 2025-10-07 |
Starfysh integrates spatial transcriptomic and histologic data to reveal heterogeneous tumor-immune hubs
2025-Feb, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-024-02173-8
PMID:38514799
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研究论文 | 开发了一种整合空间转录组学和组织学数据的计算方法Starfysh,用于揭示肿瘤-免疫异质性空间枢纽 | 无需单细胞RNA测序参考数据,结合原型分析和已知细胞类型标记,能够推断跨多个组织的共享空间邻域 | NA | 开发能够整合空间转录组学和组织学数据的计算方法,以更好地表征复杂组织中的空间动态 | 雌激素受体阳性乳腺癌、三阴性乳腺癌和化生性乳腺癌组织 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学,组织学图像分析 | 深度生成模型 | 空间基因表达数据,组织学图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
9383 | 2025-10-07 |
Meteorin-like protein/METRNL/Interleukin-41 ameliorates atopic dermatitis-like inflammation
2025-Feb, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16150
PMID:38727640
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研究论文 | 本研究探讨了METRNL/IL-41蛋白在特应性皮炎样炎症中的保护作用及其分子机制 | 首次揭示METRNL通过结合KIT受体激活β-Catenin信号通路,抑制免疫细胞扩增来缓解特应性皮炎炎症 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 阐明METRNL在特应性皮炎中的功能作用和调控机制 | 特应性皮炎患者样本和MC903诱导的AD样小鼠模型 | 免疫学 | 特应性皮炎 | 多重免疫染色, 单细胞RNA-seq, RNA-seq | NA | 血清样本, 皮肤组织样本, 测序数据 | 特应性皮炎患者和健康对照的皮肤及血清样本,MC903诱导的AD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, RNA-seq | NA | NA |
9384 | 2025-10-07 |
The analysis of transcriptomic signature of TNBC-searching for the potential RNA-based predictive biomarkers to determine the chemotherapy sensitivity
2025-Feb, Journal of applied genetics
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s13353-024-00876-x
PMID:38722458
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研究论文 | 本研究通过RNA测序分析三阴性乳腺癌患者对化疗敏感性的转录组特征,识别出24个与化疗反应和生存预后相关的基因 | 首次结合FFPE样本RNA测序、乳腺癌细胞系药物敏感性数据和单细胞RNA测序分析,系统识别三阴性乳腺癌化疗敏感性相关基因标志物 | 样本量相对较小(46例),需要进一步验证研究 | 识别三阴性乳腺癌患者新辅助化疗疗效相关的基因表达标志物 | 三阴性乳腺癌患者肿瘤样本和乳腺癌细胞系 | 转录组学 | 乳腺癌 | RNA测序,单细胞RNA测序 | PLSR分析 | 转录组数据,单细胞表达数据 | 46例TNBC患者FFPE样本(26例pCR,20例pPR),63个乳腺癌细胞系,3个已发表单细胞RNA-seq数据集 | NA | RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
9385 | 2025-10-07 |
The potential molecular markers of inflammatory response in KOA with AD based on single-cell transcriptome sequencing analysis and identification of ligands by virtual screening
2025-Feb, Molecular diversity
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11030-024-10854-4
PMID:38622351
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析探索膝骨关节炎合并阿尔茨海默病的潜在分子标志物和药物靶点 | 首次结合单细胞转录组测序和虚拟筛选技术研究KOA与AD的分子关联机制,并识别出TXNIP、MMP3和MMP13作为新型生物标志物 | 研究机制尚未完全阐明,需要进一步实验验证 | 探索膝骨关节炎影响阿尔茨海默病发展的分子机制,筛选潜在生物标志物和治疗药物 | 膝骨关节炎合并阿尔茨海默病的分子通路和生物标志物 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病, 骨关节炎 | 单细胞转录组测序, 虚拟筛选, 分子动力学模拟 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9386 | 2025-10-07 |
Unraveling the metastatic niche in breast cancer bone metastasis through single-cell RNA sequencing
2025-Feb, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-024-03594-2
PMID:39066875
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示乳腺癌骨转移中的转移微环境特征 | 首次在乳腺癌骨转移中鉴定出具有不良预见的特殊亚型(State 1)细胞,并系统揭示了FN1、SPP1、MDK等关键分子在转移微环境中的复杂相互作用网络 | NA | 研究乳腺癌骨转移的转移微环境特征及其分子机制 | 乳腺癌原发肿瘤、淋巴结转移灶和骨转移灶 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, TCGA数据分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9387 | 2025-10-07 |
Ferroptosis-Related Gene Signatures in Epilepsy: Diagnostic and Immune Insights
2025-Feb, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-024-04385-0
PMID:39052183
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研究论文 | 本研究通过分析铁死亡相关基因在癫痫中的作用,建立了诊断模型并探讨了其与免疫反应的关联 | 首次系统性地识别了7个关键铁死亡相关基因在癫痫中的核心作用,并构建了高效的诊断模型 | 研究样本量相对有限,需要更大规模的验证研究 | 探索铁死亡相关基因在癫痫发病机制中的作用及其诊断价值 | 癫痫患者和小鼠模型的组织样本 | 生物信息学 | 癫痫 | qRT-PCR, 单细胞RNA测序, CIBERSORT, MCP-counter, WGCNA | 诊断模型 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 91名癫痫患者和小鼠癫痫脑组织 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
9388 | 2025-10-07 |
Distinct immunometabolic signatures in circulating immune cells define disease outcome in acute-on-chronic liver failure
2025-Feb-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000907
PMID:38761406
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了急性慢性肝衰竭患者循环免疫细胞中不同的免疫代谢特征与疾病预后的关联 | 首次在单细胞水平上识别出ACLF恢复与非恢复患者经典单核细胞的两种不同免疫代谢状态,并发现淋巴细胞群中普遍存在的应激耐受状态 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现 | 探究急性慢性肝衰竭患者免疫细胞免疫代谢特征与疾病预后的关系 | 急性慢性肝衰竭患者、急性失代偿肝硬化患者和健康个体的循环免疫细胞 | 单细胞生物学 | 肝衰竭 | 单细胞转录组测序,代谢组学,功能验证实验 | NA | 单细胞RNA测序数据,代谢组数据 | ACLF患者、AD肝硬化患者和健康个体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9389 | 2025-10-07 |
High rates of placental inflammation among samples collected by the Multi-Omics for Mothers and Infants consortium
2025-Feb, American journal of obstetrics and gynecology
IF:8.7Q1
DOI:10.1016/j.ajog.2024.04.034
PMID:38697337
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研究论文 | 通过多组学母婴联盟收集的胎盘样本分析显示发展中国家胎盘炎症与早产存在关联 | 首次在发展中国家多中心研究中证实胎盘炎症与早产的关联,并发现地理和人群差异 | 样本量有限(166例早产和175例足月产),仅部分样本进行转录组分析(35例早产和21例足月产) | 分析早产和正常足月产胎盘样本的形态学和基因表达特征 | 胎盘样本(基底板、胎盘或绒毛膜绒毛、绒毛膜板) | 数字病理学 | 产科并发症 | 苏木精-伊红染色,形态学分析,批量转录组学,单细胞RNA测序数据分析 | NA | 组织切片图像,基因表达数据 | 341例单胎分娩(166例早产,175例足月产),其中56例进行RNA分析(35例早产,21例足月产) | NA | 批量转录组学 | NA | NA |
9390 | 2025-10-07 |
Modulation of the Immunological Milieu in Acute Aneurysmal Subarachnoid Hemorrhage: The Potential Role of Monocytes Through CXCL10 Secretion
2025-Feb, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-024-01259-4
PMID:38780865
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研究论文 | 本研究探讨动脉瘤性蛛网膜下腔出血中免疫细胞的作用,重点关注单核细胞通过CXCL10分泌调节免疫微环境 | 首次在aSAH患者脑脊液中鉴定出CD8+CD161+细胞群体,并发现单核细胞亚群高表达CXCL10 | 样本量有限,HMOX1表达差异仅显示趋势而未达显著水平 | 研究动脉瘤性蛛网膜下腔出血免疫反应的细胞和分子机制 | 动脉瘤性蛛网膜下腔出血患者和非动脉瘤性蛛网膜下腔出血患者的脑脊液样本 | 单细胞组学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | aSAH和naSAH患者脑脊液样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9391 | 2025-10-07 |
The Single-Cell Landscape of Peripheral and Tumor-infiltrating Immune Cells in HPV- HNSCC
2025-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.14.632928
PMID:39868329
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据揭示了HPV阴性头颈鳞癌中外周和肿瘤浸润免疫细胞的动态变化 | 首次在HPV阴性头颈鳞癌中整合多个单细胞数据集,系统描绘了免疫细胞在肿瘤进展和淋巴结转移过程中的动态变化 | 样本量相对有限(29个样本),需要更大规模研究验证发现 | 探索HPV阴性头颈鳞癌的复杂免疫景观以识别潜在治疗靶点 | 头颈鳞癌患者的外周血单核细胞和肿瘤浸润免疫细胞 | 单细胞组学 | 头颈鳞癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫荧光检测 | NA | 单细胞转录组数据,免疫荧光图像数据 | 29个样本,近300,000个免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9392 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing reveals the features of adaptive immune responses in the liver of a mouse model of dengue fever
2025-Jan, Animal models and experimental medicine
IF:3.8Q2
DOI:10.1002/ame2.12454
PMID:38988280
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研究论文 | 通过单细胞测序技术研究登革热小鼠模型中肝脏适应性免疫反应特征 | 首次在登革热小鼠模型中应用单细胞测序技术分析肝脏T细胞免疫反应特征及巨噬细胞与T细胞的免疫相互作用 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类患者中验证 | 探究登革热严重肝损伤中适应性免疫反应的特征和机制 | 轻度或重度登革热小鼠模型的肝组织 | 单细胞生物学 | 登革热 | 单细胞测序,流式细胞术 | NA | 单细胞基因表达数据 | 登革热小鼠模型肝组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9393 | 2025-10-07 |
Comprehensive analysis of cuproptosis-related genes involved in immune infiltration and their use in the diagnosis of hepatic ischemia-reperfusion injury: an experimental study
2025-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000001893
PMID:38935114
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证,探讨铜死亡相关基因在肝缺血再灌注损伤中的免疫浸润作用及诊断价值 | 首次系统研究铜死亡在肝缺血再灌注损伤中的作用机制,构建基于8个铜死亡相关基因的诊断模型,并验证其与免疫浸润的关联 | 研究主要基于公共数据库数据,动物模型验证仅部分基因得到确认,需要进一步实验验证机制 | 研究铜死亡相关基因在肝缺血再灌注损伤中的诊断价值和免疫调控机制 | 肝缺血再灌注损伤患者样本数据和动物模型 | 生物信息学 | 肝缺血再灌注损伤 | 基因表达分析,机器学习算法,单细胞测序,动物模型实验 | LASSO逻辑回归,诊断模型 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | GSE151648数据集,GSE14951微阵列数据集,GSE171539单细胞测序数据集,小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,微阵列 | NA | NA |
9394 | 2025-10-07 |
Critical role of Slc22a8 in maintaining blood-brain barrier integrity after experimental cerebral ischemia-reperfusion
2025-Jan, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism
IF:4.9Q1
DOI:10.1177/0271678X241264401
PMID:39068534
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现Slc22a8在维持脑缺血再灌注后血脑屏障完整性中的关键作用 | 首次通过整合多组学数据鉴定出Slc22a8作为血脑屏障完整性的关键调控因子,并验证其通过Wnt/β-catenin信号通路发挥作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证 | 探究脑缺血再灌注过程中血脑屏障破坏的调控机制 | 小鼠脑缺血再灌注模型中的内皮细胞和周细胞 | 生物医学 | 缺血性脑卒中 | 多组学分析,转录组测序,单细胞RNA测序 | 小鼠大脑中动脉闭塞/再灌注模型 | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 三个转录组测序数据集,E13.5小鼠血脑屏障和非血脑屏障内皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,转录组测序 | NA | NA |
9395 | 2025-10-07 |
Antibiotic use attenuates response to immune checkpoint blockade in urothelial carcinoma via inhibiting CD74-MIF/COPA: revealing cross-talk between anti-bacterial immunity and ant-itumor immunity
2025-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000001901
PMID:38995167
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研究论文 | 本研究探讨抗生素使用通过抑制CD74-MIF/COPA信号通路降低尿路上皮癌患者对免疫检查点阻断治疗的响应 | 首次通过单细胞分析揭示肿瘤内细菌通过CD74-MIF/COPA信号通路连接抗菌免疫与抗肿瘤免疫的分子机制 | 研究基于观察性数据和回顾性分析,需要进一步实验验证因果关系 | 评估抗生素使用对尿路上皮癌患者免疫检查点阻断治疗预后的影响并探索分子机制 | 尿路上皮癌患者和肿瘤免疫微环境 | 肿瘤免疫学 | 尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序,单细胞微生物组分析,批量RNA测序 | NA | 临床数据,转录组数据,微生物组数据 | 3496例UC患者汇总分析,8个UC样本和63185个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
9396 | 2025-10-07 |
Artificial intelligence-based multi-modal multi-tasks analysis reveals tumor molecular heterogeneity, predicts preoperative lymph node metastasis and prognosis in papillary thyroid carcinoma: a retrospective study
2025-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000001875
PMID:38990290
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研究论文 | 本研究通过人工智能多模态多任务分析揭示甲状腺乳头状癌的分子异质性,并预测术前淋巴结转移和预后 | 开发了基于深度学习的多模态模型,整合组织病理学图像、基因组、转录组和免疫细胞数据预测淋巴结转移和疾病无进展生存期 | 回顾性研究设计,样本来源有限(单中心加TCGA数据库) | 探索甲状腺乳头状癌分子异质性,预测淋巴结转移和预后 | 甲状腺乳头状癌患者 | 数字病理 | 甲状腺癌 | DNA二代测序, 单细胞RNA测序, 深度学习 | 深度学习多模态模型, GradCAM | 组织病理学图像, 基因组数据, 转录组数据, 免疫细胞数据 | 1011例PTC患者(256例来自队列1,275例来自队列2,499例来自TCGA) | NA | 单细胞RNA测序, 二代测序 | NA | NA |
9397 | 2025-10-07 |
Prediction of tumor-reactive T cell receptors from scRNA-seq data for personalized T cell therapy
2025-Jan, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-024-02161-y
PMID:38454173
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研究论文 | 开发了一种基于单细胞RNA测序数据的机器学习方法,用于预测肿瘤反应性T细胞受体,以加速个性化T细胞疗法 | 首次结合高通量TCR克隆和反应性验证训练机器学习分类器,以抗原无关的方式识别肿瘤反应性TILs | 未明确说明样本来源的癌症类型多样性及模型验证的广泛性 | 开发快速识别肿瘤反应性TCR的方法以加速个性化T细胞疗法 | 肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)及其T细胞受体(TCRs) | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序,高通量TCR克隆,机器学习 | 机器学习分类器 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9398 | 2025-10-07 |
Glucose deprivation and identification of TXNIP as an immunometabolic modulator of T cell activation in cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1548509
PMID:40260243
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研究论文 | 本研究探讨葡萄糖缺乏条件下TXNIP作为T细胞活化免疫代谢调节剂的作用机制 | 首次将TXNIP鉴定为连接免疫代谢与T细胞活化的关键调节因子,并证明其缺失可增强抗肿瘤免疫反应 | 研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证 | 探索葡萄糖限制条件下T细胞免疫反应的调节机制 | 人类T细胞和肿瘤浸润T细胞 | 免疫代谢 | 癌症 | 混合淋巴细胞反应、多参数流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质分泌数据、细胞功能数据 | 癌症患者的肿瘤浸润T细胞和原代人类T细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9399 | 2025-10-07 |
Combination of anlotinib with immunotherapy enhanced both anti-angiogenesis and immune response in high-grade serous ovarian cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1539616
PMID:40260248
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研究论文 | 本研究探讨安罗替尼联合免疫疗法在高级别浆液性卵巢癌中的抗血管生成和免疫调节作用 | 首次在高级别浆液性卵巢癌中系统评估安罗替尼联合免疫治疗的协同作用机制,通过单细胞RNA测序揭示肿瘤微环境变化 | 样本量较小(36例患者),为回顾性研究,需要更大规模的前瞻性研究验证 | 评估安罗替尼联合免疫疗法对高级别浆液性卵巢癌的治疗效果和作用机制 | 高级别浆液性卵巢癌患者和PBMC-PDX模型 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序,患者来源异种移植模型 | PBMC-PDX模型 | 临床数据,单细胞转录组数据 | 36例高级别浆液性卵巢癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9400 | 2025-10-07 |
Type I IFN receptor blockade alleviates liver fibrosis through macrophage-derived STAT3 signaling
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1528382
PMID:40260261
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研究论文 | 本研究通过阻断I型干扰素受体揭示其通过调节巨噬细胞STAT3信号通路缓解肝纤维化的机制 | 首次证明IFNAR-1阻断通过改变巨噬细胞P-STAT3/P-STAT1比例促进M2型分化,从而缓解肝纤维化 | 研究仅使用CCl4诱导的小鼠模型,未验证其他肝纤维化模型 | 探究I型干扰素信号在肝纤维化中的作用机制 | CCl4处理的肝纤维化小鼠模型 | NA | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |