单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 9381 - 9400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9381 | 2024-08-25 |
Identification and Characterization of CD8+ CD27+ CXCR3- T Cell Dysregulation and Progression-Associated Biomarkers in Systemic Lupus Erythematosus
2023-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202300123
PMID:37875396
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研究论文 | 本研究通过质谱流式细胞术、流式细胞术和单细胞RNA测序，全面分析了263例临床外周血样本中系统性红斑狼疮（SLE）患者的免疫细胞失调情况，并探讨了CD8+ CD27+ CXCR3- T细胞在SLE病理和疾病进展中的作用。 | 本研究首次详细描述了CD8+ CD27+ CXCR3- T细胞在SLE中的失调情况及其与疾病活动性的关联，并构建了动态网络生物标志物（DNB）模型，用于预测SLE的疾病进展。 | NA | 探讨CD8+ CD27+ CXCR3- T细胞在系统性红斑狼疮（SLE）中的失调情况及其作为疾病进展相关生物标志物的潜力。 | CD8+ CD27+ CXCR3- T细胞在系统性红斑狼疮（SLE）中的作用及其作为生物标志物的可能性。 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 质谱流式细胞术、流式细胞术、单细胞RNA测序 | 动态网络生物标志物（DNB）模型 | 外周血样本 | 263例临床外周血样本，包括活动性SLE（aSLE）、缓解期SLE（rSLE）和健康对照（HCs） |
| 9382 | 2024-08-25 |
Loss of ATOH1 in Pit Cell Drives Stemness and Progression of Gastric Adenocarcinoma by Activating AKT/mTOR Signaling through GAS1
2023-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202301977
PMID:37824217
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研究论文 | 研究探讨了ATOH1在胃癌干细胞维持中的作用及其通过GAS1激活AKT/mTOR信号通路促进胃腺癌进展的机制 | 首次揭示了ATOH1通过调控GAS1和RET/AKT/mTOR信号通路影响胃癌干细胞的维持和化疗耐药性 | 研究主要基于小鼠模型和组织样本，需要进一步的人体临床试验验证 | 阐明ATOH1在胃癌干细胞维持中的作用及其分子机制 | 胃癌干细胞及胃腺癌样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 包括小鼠模型和胃腺癌组织样本 |
| 9383 | 2024-08-25 |
A single-cell transcriptomic landscape of innate and adaptive intratumoral immunity in triple negative breast cancer during chemo- and immunotherapies
2022-Mar-08, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-022-00893-x
PMID:35260564
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术评估了两种三阴性乳腺癌小鼠模型在未治疗及化疗或免疫治疗（单独或联合使用）后的肿瘤微环境中的免疫景观 | 首次提供了化疗和免疫治疗在三阴性乳腺癌中主要免疫细胞群体的清晰概览 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证结果 | 探讨化疗和免疫治疗在三阴性乳腺癌中的免疫反应 | 三阴性乳腺癌小鼠模型的肿瘤微环境中的免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 两种三阴性乳腺癌小鼠模型 |
| 9384 | 2024-08-25 |
Single-cell Iso-Sequencing enables rapid genome annotation for scRNAseq analysis
2022-03-03, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyac017
PMID:35143654
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研究论文 | 本文展示了单细胞等位序列测序（Iso-Sequencing）与单细胞RNA测序结合使用，能快速提升3'-UTR注释的效率 | 首次证明单细胞等位序列测序能显著提高3'-UTR注释的完整性，从而改善单细胞RNA测序数据的解读 | 研究仅基于刺鱼（Gasterosteus aculeatus）的数据，其普适性有待进一步验证 | 探索单细胞等位序列测序在提升单细胞RNA测序基因注释准确性方面的应用 | 刺鱼（Gasterosteus aculeatus）的单细胞RNA测序数据 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 使用刺鱼的胚胎单细胞等位序列测序数据和已发表的成体批量Iso-Seq数据 |
| 9385 | 2024-08-25 |
Make war not love: The neural substrate underlying a state-dependent switch in female social behavior
2022-03-02, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2021.12.002
PMID:34982958
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序揭示了雌性小鼠腹侧内侧下丘脑（VMHvl）中两种不同的雌激素受体-1阳性神经元亚型，这些亚型分别控制着雌性小鼠的性接受性和攻击性行为 | 首次阐明了雌性小鼠在不同生殖状态下对同种刺激产生不同行为反应的神经机制 | NA | 探究雌性小鼠在不同生殖状态下社会行为的神经基础 | 雌性小鼠的神经元亚型及其在不同生殖状态下的行为控制 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 神经元活动数据 | NA |
| 9386 | 2024-08-25 |
Single-cell gene fusion detection by scFusion
2022-02-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28661-6
PMID:35228538
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研究论文 | 本文介绍了一种基于单细胞RNA测序（scRNA-seq）的基因融合检测计算工具scFusion，并通过模拟和真实数据集评估了其性能 | scFusion能够高效且敏感地检测基因融合，具有较低的假发现率，并能在单细胞水平上检测到其他方法无法发现的融合事件 | NA | 开发和评估一种新的计算工具，用于在单细胞水平上检测基因融合 | 基因融合在肿瘤发生和进展中的作用 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 五个真实单细胞RNA测序数据集 |
| 9387 | 2024-08-25 |
Klf4 methylated by Prmt1 restrains the commitment of primitive endoderm
2022-02-28, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac054
PMID:35137179
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研究论文 | 研究报告了Prmt1在原始内胚层（PrE）形成中的重要作用，以及Prmt1介导的Klf4甲基化在细胞命运决定中的机制 | 首次揭示了Prmt1通过甲基化Klf4来调控原始内胚层形成的分子机制 | NA | 探索哺乳动物胚胎发育早期原始内胚层形成的分子机制 | Prmt1在原始内胚层形成中的作用及Klf4甲基化的影响 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | RNA | 小鼠胚胎干细胞（mESCs） |
| 9388 | 2024-08-25 |
Single-cell transcriptomics analysis reveals intratumoral heterogeneity and identifies a gene signature associated with prognosis of hepatocellular carcinoma
2022-02-25, Bioscience reports
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BSR20212560
PMID:35169832
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了肝细胞癌患者的肿瘤组织，揭示了肿瘤内异质性并识别出与肝细胞癌预后相关的基因特征 | 首次在单细胞水平上揭示了肝细胞癌的肿瘤内异质性，并识别出与预后相关的基因特征 | 研究仅基于一名肝细胞癌患者的样本，可能需要更多样本以验证结果的普遍性 | 揭示肝细胞癌的肿瘤内异质性并识别与预后相关的基因特征 | 肝细胞癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 5753个细胞，来自一名肝细胞癌患者 |
| 9389 | 2024-08-25 |
A Primer for Single-Cell Sequencing in Non-Model Organisms
2022-02-19, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13020380
PMID:35205423
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研究论文 | 本文介绍了在非模式生物中进行单细胞测序研究的一般工作流程和注意事项 | 探讨了在非模式生物中应用单细胞测序技术的可能性，这有助于深入理解基因型与表型之间的关系及生物变异的基础 | 研究仅限于多细胞动物 | 探索在非模式生物中应用单细胞测序技术，以解决传统模式生物无法触及的问题 | 非模式生物中的单细胞测序 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 9390 | 2024-08-25 |
scInTime: A Computational Method Leveraging Single-Cell Trajectory and Gene Regulatory Networks to Identify Master Regulators of Cellular Differentiation
2022-02-18, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13020371
PMID:35205415
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scInTime的无监督机器学习框架，该框架结合单细胞基因调控网络（scGRNs）和推断的细胞轨迹，用于识别细胞分化的主调控基因 | scInTime框架通过整合不同伪时间点的基因调控网络信息，提供了更易解释的轨迹推断结果 | NA | 开发一种新的计算方法，通过结合单细胞轨迹和基因调控网络来识别细胞分化的主调控基因 | 单细胞RNA测序数据中的细胞分化主调控基因 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督机器学习框架 | 单细胞RNA测序数据 | 多个单细胞RNA测序数据集 |
| 9391 | 2024-08-25 |
T-cell dysfunction in the glioblastoma microenvironment is mediated by myeloid cells releasing interleukin-10
2022-02-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28523-1
PMID:35177622
|
研究论文 | 本文通过应用一个集成空间解析和单细胞基因表达数据的计算多维模型，研究了胶质母细胞瘤微环境中T细胞功能障碍的原因 | 本文首次展示了通过集成单细胞和空间转录组学数据的多维模型来探究肿瘤免疫微环境 | NA | 研究胶质母细胞瘤微环境中T细胞功能障碍的机制 | 胶质母细胞瘤中的免疫细胞和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞和空间转录组学 | 多维模型 | 基因表达数据 | 45,615个免疫细胞来自12个肿瘤样本 |
| 9392 | 2024-08-25 |
Ligand-mediated PAI-1 inhibition in a mouse model of peritoneal carcinomatosis
2022-02-15, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2022.100526
PMID:35243423
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研究论文 | 本研究通过功能和转录组实验，识别出STAT3信号通路在腹膜癌病（PC）中的关键作用，并通过综合分析公共数据库和临床队列数据，验证了基于PAI-1水平的分子分层在PC治疗中的潜在应用 | 首次揭示了PAI-1在腹膜癌病中的分泌来源及其作为预后生物标志物的潜力，并提出了基于旁分泌依赖性的治疗新策略 | 研究主要基于小鼠模型和患者来源的异种移植模型，需要进一步的临床试验验证 | 探索腹膜癌病中的关键信号通路及其治疗潜力 | 腹膜癌病细胞、STAT3信号通路、PAI-1水平 | 数字病理学 | 腹膜癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 临床队列研究涉及7,359例患者，前瞻性研究涉及149例患者 |
| 9393 | 2024-08-25 |
Novel Insights into the Stemness and Immune Privilege of Mesenchymal Stem Cells from Human Wharton Jelly by Single-Cell RNA Sequencing
2022-Feb-14, Medical science monitor : international medical journal of experimental and clinical research
IF:2.2Q3
DOI:10.12659/MSM.934660
PMID:35153292
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了人脐带华通胶间充质干细胞（WJ-MSCs）的基因表达，以探讨其干细胞特性和免疫特性 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了WJ-MSCs的基因表达异质性，并发现只有部分细胞具有真正的干细胞特性，同时质疑了WJ-MSCs的免疫特权 | 研究仅限于体外实验，未涉及体内环境下的验证 | 探究WJ-MSCs的干细胞特性和免疫特性 | 人脐带华通胶间充质干细胞（WJ-MSCs） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及的WJ-MSCs细胞数量未在摘要中明确提及 |
| 9394 | 2024-08-25 |
IQCELL: A platform for predicting the effect of gene perturbations on developmental trajectories using single-cell RNA-seq data
2022-02, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009907
PMID:35213533
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研究论文 | 本文介绍了一个名为IQCELL的平台，该平台利用单细胞RNA测序数据直接推断、模拟和研究可执行的逻辑基因调控网络（GRN） | IQCELL平台能够从单细胞RNA测序数据中直接推断出可执行的逻辑基因调控网络，并模拟基本假设以控制干细胞命运 | NA | 开发一个平台，用于从单细胞RNA测序数据中推断、模拟和研究可执行的基因调控网络 | 早期小鼠T细胞和红细胞发育的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 逻辑基因调控网络（GRN） | 单细胞RNA测序数据 | 早期小鼠T细胞和红细胞发育的数据 |
| 9395 | 2024-08-25 |
Single-cell RNA sequencing reveals the multi-cellular ecosystem in different radiological components of pulmonary part-solid nodules
2022-02, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.723
PMID:35184398
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了肺部部分实性结节中不同放射学成分的多细胞生态系统 | 首次在单细胞分辨率下全面剖析了部分实性结节中磨玻璃和实性成分的多细胞生态系统，并揭示了恶性细胞和肿瘤微环境中关键信号通路的转录差异 | 研究样本量较小，仅包括12名未经治疗的患者，可能影响结果的普遍性 | 探讨早期肺腺癌中不同放射学表型的肿瘤微环境和转录特征 | 肺部部分实性结节的磨玻璃和实性成分 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | Seurat v3.1.5 | 单细胞数据 | 12名患者的部分实性结节和5名患者的正常肺组织 |
| 9396 | 2024-08-25 |
Revealing the transcriptional heterogeneity of organ-specific metastasis in human gastric cancer using single-cell RNA Sequencing
2022-02, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.730
PMID:35184420
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了人胃癌器官特异性转移的转录异质性 | 发现了与侵袭特征、腹腔内转移倾向、上皮-间质转化诱导的肿瘤干细胞表型或休眠样特征相关的恶性上皮亚群，并揭示了免疫和基质细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的作用 | NA | 解析胃癌及其转移的肿瘤内和肿瘤间异质性，识别有效的治疗靶点 | 来自6名患者的10个新鲜人体组织样本，包括原发肿瘤、邻近非肿瘤样本及不同器官或组织的转移瘤 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 407个样本的胃癌队列 |
| 9397 | 2024-08-25 |
Autism genes converge on asynchronous development of shared neuron classes
2022-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-04358-6
PMID:35110736
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研究论文 | 本文利用人脑皮质类器官模型，通过单细胞RNA测序和蛋白质组分析，研究了三个自闭症谱系障碍（ASD）风险基因SUV420H1、ARID1B和CHD8的半合子不足对神经元发育的影响。 | 首次揭示了这些基因突变导致的特定神经元类型发育不同步，并展示了这些异常如何受个体基因组背景的精细调节。 | 研究主要集中在类器官模型上，可能与真实人脑环境存在差异。 | 探究自闭症谱系障碍风险基因在人脑皮质中的细胞类型特异性发育异常。 | 三个自闭症谱系障碍风险基因SUV420H1、ARID1B和CHD8的半合子不足对神经元发育的影响。 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、蛋白质组分析 | NA | 细胞、蛋白质 | 超过745,000个细胞和多个来自不同捐赠者的细胞系 |
| 9398 | 2024-08-25 |
Adaptation of the Oxygen Sensing System during Lung Development
2022, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2022/9714669
PMID:35242281
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研究论文 | 研究了在肺发育过程中氧气感应系统的适应性及其目标，即缺氧诱导因子（HIF）调控基因（HRGs） | 通过整合qPCR、免疫印迹、杂交和单细胞RNA测序数据，详细描绘了氧气感应系统在肺发育中的变化 | 系统性缺氧或roxadustat治疗仅显示出HRGs的有限反应 | 理解肺发育从囊状到肺泡阶段的氧气感应系统组件的相互作用，以对抗与早产相关的疾病 | 肺发育中的氧气感应系统和HIF调控基因 | NA | 早产相关疾病 | qPCR、免疫印迹、杂交、单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 9399 | 2024-08-25 |
Insights Gained and Future Outlook From scRNAseq Studies in Autoimmune Rheumatic Diseases
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.849050
PMID:35251048
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNAseq）在自身免疫性风湿病研究中的主要发现，并展望了新兴的单细胞技术（如免疫组库测序和空间转录组学）在扩展对免疫和基质细胞行为的理解方面的潜力。 | scRNAseq作为一种强大的新工具，能够评估风湿病中的生物异质性和单个细胞功能，揭示了新的细胞群和关键分子特征。 | 目前scRNAseq在风湿病领域的应用尚未充分利用新兴的单细胞技术，如免疫组库测序和空间转录组学。 | 探讨scRNAseq在自身免疫性风湿病研究中的应用，并展望新兴单细胞技术在扩展对免疫和基质细胞行为理解方面的潜力。 | 自身免疫性风湿病及其相关细胞和分子机制。 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 9400 | 2024-08-25 |
A Necroptosis-Related Prognostic Model of Uveal Melanoma Was Constructed by Single-Cell Sequencing Analysis and Weighted Co-Expression Network Analysis Based on Public Databases
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.847624
PMID:35242144
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析和加权共表达网络分析，构建了一个与坏死性凋亡相关的葡萄膜黑色素瘤预后模型 | 首次通过单细胞测序和加权共表达网络分析，构建了与坏死性凋亡相关的葡萄膜黑色素瘤预后模型，并通过细胞实验验证了模型中关键基因ITPA的作用 | NA | 研究坏死性凋亡在葡萄膜黑色素瘤中的临床意义，并构建预后模型 | 葡萄膜黑色素瘤患者及其预后 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞测序分析，加权共表达网络分析 | COX回归，Lasso回归 | 基因表达数据 | 使用GEO数据库的GSE139829数据集和TCGA数据进行分析，具体样本数量未详细说明 |