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当前共找到 34043 篇文献,本页显示第 921 - 940 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
921 2025-12-04
Restoring macrophage iron homeostasis by natural carrier-free nanoplatform for the therapy of rheumatoid arthritis syndromes
2025-Dec, Materials today. Bio
研究论文 本研究开发了一种无载体纳米药物RTNs,通过自组装天然产物RBA和TMP,用于恢复巨噬细胞铁稳态以治疗类风湿关节炎综合征 首次利用无载体自组装纳米平台结合天然产物,靶向巨噬细胞铁稳态治疗RA,并整合单细胞测序分析阐明机制 未明确提及样本量细节或长期毒性数据,且研究基于动物模型,临床转化潜力待验证 开发安全有效的策略治疗类风湿关节炎综合征,特别是针对铁过载引发的巨噬细胞极化问题 类风湿关节炎患者(通过佐剂诱导关节炎啮齿动物模型模拟) NA 类风湿关节炎 单细胞测序分析 NA NA NA NA NA NA NA
922 2025-12-04
A practical protocol of processing mineralized tissue for Visium spatial transcriptomics
2025-Dec, Mechanobiology in medicine
研究论文 本文提出了一种用于处理矿化组织以进行Visium空间转录组学分析的优化工作流程 使用Morse's溶液替代传统EDTA脱钙,实现快速脱钙(<24小时)同时保持RNA质量,并强调使用SCHOTT NEXTERION® Slide H(3-D水凝胶涂层)以增强脆弱脱钙骨切片的粘附性 NA 克服矿化组织空间转录组学分析中因脱钙过程导致的RNA完整性和基因检测问题 完整和骨折的小鼠股骨样本 空间转录组学 NA 空间转录组学 NA 空间转录组数据 小鼠股骨样本(具体数量未明确说明) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium Visium V2和Visium HD
923 2025-12-04
Single-cell RNA sequencing reveals immune cell alterations in patients with allergic rhinitis treated with Peiyuan Tong-qiao decoction
2025-Dec, Biochemistry and biophysics reports IF:2.3Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了培元通窍汤治疗过敏性鼻炎患者后免疫细胞的变化 首次在过敏性鼻炎治疗中应用单细胞RNA测序技术,系统揭示了中药治疗后免疫细胞亚群、细胞间通讯及转录调控网络的动态变化 样本量有限,未设置安慰剂对照组,缺乏长期疗效随访数据 探索培元通窍汤治疗过敏性鼻炎的作用机制 过敏性鼻炎患者治疗前后的外周血单个核细胞 单细胞组学 过敏性鼻炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确具体样本数量,仅说明采集了治疗前后的PBMCs样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
924 2025-12-04
Cancer-associated fibroblasts: Recent advances and therapeutic implications
2025-Dec-01, Current opinion in cell biology IF:6.0Q1
综述 本文综述了癌症相关成纤维细胞(CAFs)的最新研究进展及其在肿瘤微环境中的关键作用,并探讨了针对CAFs的治疗策略 整合了单细胞测序和空间转录组学的最新发现,揭示了CAFs的功能异质性、空间组织、时间动态及免疫调节功能,并讨论了靶向CAF亚群的新兴治疗策略 作为一篇综述,未提供原始实验数据,且CAFs的复杂性和治疗靶向性仍需更多临床验证 总结CAFs的生物学特性及其在肿瘤进展和治疗抵抗中的作用,探索靶向CAFs的治疗机会 癌症相关成纤维细胞(CAFs)及其在肿瘤微环境中的功能 数字病理学 癌症 单细胞测序,空间转录组学 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
925 2025-12-04
CellUntangler: Separating distinct biological signals in single-cell data with deep generative models
2025-Dec-01, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 本文提出了一种名为CellUntangler的深度生成模型,用于从单细胞RNA测序数据中分离不同的生物信号 提出了一种新的深度生成模型,将细胞嵌入到由多个子空间组成的潜在空间中,每个子空间采用适当的几何结构来捕获不同的生物信号,从而能够同时解耦多种过程 未在摘要中明确说明 开发一种能够从单细胞数据中分离不同生物信号的方法 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 深度生成模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
926 2025-12-04
A genome-scale single-cell CRISPRi map of trans gene regulation across human pluripotent stem cell lines
2025-Dec-01, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 本研究构建了一个跨人类多能干细胞系的基因组规模CRISPR干扰扰动图谱,结合单细胞RNA测序,以探索基因调控的遗传背景依赖性 首次在人类多能细胞中实现了跨多个遗传背景的基因组规模CRISPR干扰扰动图谱,结合单细胞RNA测序,揭示了扰动效应的遗传变异 NA 理解人类基因组调控,解析疾病相关突变或基因表达变化的基础 人类多能干细胞系 机器学习 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq),CRISPR干扰 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
927 2025-12-04
Integrating Multiple Clustering Techniques and Performance Measures via Ranking for scRNA-Seq Data
2025-Dec, Statistics in medicine IF:1.8Q1
研究论文 本文提出了一种通过整合多种聚类技术和性能度量来评估和排名单细胞RNA-seq数据聚类方法的新方法 将微阵列数据时代的稳定性度量适应于单细胞数据,并结合多种现有度量来评估聚类技术在不同参数选择下的特性,通过聚合方法对所有度量进行排名 研究仅基于五个已知分组和一个未知分组的数据集进行验证,可能未覆盖所有单细胞数据场景 评估和排名单细胞RNA-seq数据的聚类技术,以提高聚类结果的可靠性和准确性 单细胞基因表达数据 机器学习 NA 单细胞RNA-seq 聚类技术 基因表达数据 六个数据集(五个已知分组,一个未知分组) NA 单细胞RNA-seq NA NA
928 2025-12-04
Characterize Oral-to-Blood Microbial DNA Translocation in Individuals with Cocaine Use Disorder
2025-Nov-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究首次证明通过吸烟或鼻吸方式摄入可卡因的个体,其口腔微生物群失调,并存在选择性的口腔至血液微生物易位 首次在人体中证实可卡因使用障碍(COC)个体存在口腔微生物群失调及选择性的口腔至血液微生物易位,并揭示了其与先天免疫激活的关联 样本量较小(10名COC患者,24名对照),为横断面研究,无法确定因果关系 探究可卡因使用障碍个体口腔是否为循环微生物DNA易位的来源,及其对免疫系统的影响 当前患有可卡因使用障碍的个体(通过吸烟或电子烟方式摄入)及人口统计学匹配的非药物使用对照者 微生物组学,免疫学 物质使用障碍(可卡因使用障碍) 微生物16S rRNA V4区测序,单细胞RNA测序(scRNAseq) NA DNA序列数据,单细胞基因表达数据 34名参与者(10名可卡因使用障碍患者,24名对照) NA 16S rRNA基因测序,单细胞RNA测序 NA NA
929 2025-12-04
Single-cell multiomics reveals macrophage-derived IL-23 and CXCL9/10 drive pathogenic IFNG+IL17+ T cells in immunotherapy-related colitis
2025-Nov-29, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞多组学分析揭示了巨噬细胞来源的IL-23和CXCL9/10驱动IFNG+IL17+ T细胞在免疫治疗相关结肠炎中的致病作用 首次在免疫治疗相关结肠炎中鉴定出具有双重Th1/Th17特征的致病性IFNG+IL17+CD4+ T细胞亚群,并阐明其由组织驻留记忆T细胞分化而来,同时揭示了巨噬细胞通过IL-23和CXCL9/10信号通路驱动该过程的机制 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,需要更大规模的人类队列验证;机制研究虽深入但部分信号通路的具体调控细节仍需进一步探索 阐明免疫检查点阻断治疗相关结肠炎的免疫病理机制,并寻找不影响抗肿瘤疗效的治疗靶点 免疫治疗相关结肠炎患者和小鼠模型中的免疫细胞,特别是IFNG+IL17+CD4+ T细胞和肠道巨噬细胞 数字病理学 结肠炎 单细胞RNA测序, T细胞受体测序, 空间转录组学, 流式细胞术, qPCR, 体内中和抗体阻断, 巨噬细胞耗竭 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, T细胞受体序列数据, 流式细胞术数据, qPCR数据 人类irColitis病变样本和小鼠模型样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
930 2025-12-04
Neutrophil extracellular traps-STC1 positive feedback loop promotes immune evasion and metastasis in bladder cancer
2025-Nov-28, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究揭示了膀胱癌中中性粒细胞胞外陷阱(NETs)与抗吞噬检查点STC1之间的正反馈环路在促进免疫逃逸和转移中的关键作用 首次发现NETs通过TLR2-MAPK-FosL1轴上调STC1,形成NETs-STC1自增强反馈环路,并阐明STC1通过隔离钙网蛋白抑制抗原呈递及分泌形式增强NET形成的新机制 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床验证仍需进一步开展;反馈环路在其他癌症类型中的普适性未明确 探究膀胱癌免疫治疗耐药机制及NETs在其中的作用 膀胱癌患者临床队列、小鼠肺转移模型、肿瘤细胞与中性粒细胞共培养体系 肿瘤免疫学 膀胱癌 免疫荧光染色、扫描电镜、蛋白质组学、单细胞转录组学 小鼠肺转移模型 临床队列数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据、影像数据 多个接受免疫检查点抑制剂治疗的临床队列(具体样本量未明确) NA 单细胞转录组学 NA NA
931 2025-12-04
Cellular dynamics in cerebrospinal fluid unveils the key regulators of intracranial response to immune checkpoint inhibitors in NSCLC brain metastases
2025-Nov-28, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了非小细胞肺癌脑转移患者在接受免疫检查点抑制剂治疗期间,脑脊液和脑转移瘤中的细胞动态变化,并识别出CD4+PDCD1+CXCR6+ T细胞作为颅内治疗反应的关键预测因子 首次在脑脊液中利用单细胞RNA测序构建了高分辨率的细胞动态图谱,并鉴定出CD4+PDCD1+CXCR6+ T细胞这一新型免疫细胞亚群作为免疫检查点抑制剂颅内疗效的阳性预测标志物 样本量相对较小(脑脊液样本n=20),且依赖于外部数据库数据进行整合分析,可能需要更大规模的前瞻性队列验证 探索非小细胞肺癌脑转移患者对免疫检查点抑制剂治疗的颅内反应机制,并寻找预测性生物标志物 非小细胞肺癌伴脑转移的患者 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 蛋白质组学分析, 多重免疫组织化学 NA 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 蛋白质组数据, 免疫组织化学图像 脑脊液样本20例, 外部数据库样本20例, 流式细胞验证队列8例, 蛋白质组学验证队列31例, 多重免疫组化验证队列25例 NA 单细胞RNA-seq NA NA
932 2025-12-04
Blocking PCSK9 suppresses hepatocellular carcinoma immune escape by decreasing FLI1-mediated SPP1 and PD-L1 expression
2025-Nov-28, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究揭示了PCSK9通过NOTCH3/FLI1信号通路上调SPP1和PD-L1表达,从而促进肝细胞癌免疫逃逸的机制,并探索了基于CRISPR碱基编辑和小分子抑制剂的干预策略 首次发现PCSK9通过NOTCH3/FLI1通路调控SPP1和PD-L1表达,介导肝细胞癌免疫逃逸,并开发了新型ABE碱基编辑器和小分子抑制剂parecoxib作为治疗策略 研究主要基于小鼠模型和细胞系,尚未在人体临床试验中验证,且PCSK9抑制剂parecoxib的具体作用机制和长期安全性需进一步研究 揭示PCSK9促进肝细胞癌免疫逃逸的分子机制,并探索靶向PCSK9的治疗策略 肝细胞癌细胞系(Hepa1-6、H22、HepG2)、小鼠肝细胞癌模型、CD8+ T细胞 肿瘤免疫学 肝细胞癌 单细胞RNA测序、流式细胞术、CRISPR腺嘌呤碱基编辑、共培养实验 NA 基因表达数据、单细胞转录组数据、流式细胞数据 多种肝细胞癌细胞系及小鼠模型,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
933 2025-12-04
Spatial transcriptomics expression prediction from histopathology based on cross-modal mask reconstruction and contrastive learning
2025-Nov-25, Medical image analysis IF:10.7Q1
研究论文 本研究开发了一种基于对比学习的深度学习方法,用于从全切片图像预测空间分辨的基因表达 提出了一种结合跨模态掩码重建与对比学习的新方法,无需大规模预训练数据集或抽象语义表征,即可在特征空间建立组织病理学形态与空间基因表达的对应关系 方法在空间转录组数据获取成本高、大规模数据稀缺的场景下表现良好,但未明确讨论其在更广泛组织类型或更复杂疾病模型中的泛化能力 从组织病理学全切片图像预测空间转录组基因表达,以降低数据获取成本并促进肿瘤微环境分析 六种不同疾病数据集的空间转录组数据及对应的全切片图像 数字病理学 肿瘤 空间转录组学 基于对比学习的深度学习模型 图像(全切片图像)、基因表达数据 涉及六个疾病数据集,具体样本数量未明确说明 NA 空间转录组学 NA NA
934 2025-12-04
Integration of spatial and single-cell transcriptomic analysis uncovers cellular and molecular alterations in the hypertensive brain
2025-Nov-24, Life sciences IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过整合空间和单细胞转录组分析,揭示了高血压大脑中的细胞和分子改变 首次结合空间转录组测序和单细胞RNA测序,识别了高血压大鼠下丘脑和延髓中先前未知的脑区及特定神经元亚群,并发现Eno1的上调在神经调控血压中的作用 研究主要基于大鼠模型,人类样本验证有限,且样本量相对较小,可能影响结果的普适性 旨在表征高血压相关中枢神经系统区域的空间和单细胞转录组特征,以揭示神经源性高血压的分子机制 自发性高血压大鼠和正常血压Wistar-Kyoto对照大鼠的下丘脑和延髓组织,以及人类脑组织样本 数字病理学 心血管疾病 空间转录组测序, 单细胞RNA测序, 组织学分析 NA 转录组数据, 图像数据 大鼠样本(自发性高血压大鼠和Wistar-Kyoto对照,4周和10周龄),人类脑组织样本 NA 空间转录组学, 单细胞RNA-seq NA NA
935 2025-12-04
Determining gene specificity from multivariate single-cell RNA sequencing data
2025-Nov-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种基于熵度量的基因特异性测量方法ember,用于从多变量单细胞RNA测序数据中识别基因特异性,并应用于小鼠和人类数据集 通过公理化方法定义了基因特异性测量应满足的四个关键属性,并证明ember是唯一满足这些属性的方法,从而提供了一种更可靠和直观的基因特异性分析工具 未明确讨论ember方法在计算效率或大规模数据集上的可扩展性限制 开发一种基于公理化属性的基因特异性测量方法,以更准确地识别单细胞RNA测序数据中与生物类别或实验条件相关的特异性基因 小鼠八个组织的单细胞RNA测序数据以及来自255个不同个体的人类PBMC单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 小鼠八个组织的样本以及255个人类个体的PBMC样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
936 2025-12-04
Selective modification of glycoprotein substrates by GnT-V in mouse kidney
2025-Nov-21, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究探讨了小鼠肾脏中N-乙酰葡糖胺转移酶-V(GnT-V)对蛋白质底物选择性的机制 通过凝集素辅助蛋白质组学鉴定出ANPEP和MEP1A为GnT-V的主要底物,并揭示了修饰位点的结构特征和极化亚细胞运输在选择性修饰中的作用 研究仅基于小鼠肾脏模型,未在其他组织或物种中验证,且机制细节仍需进一步探索 探究GnT-V在蛋白质选择性糖基化中的机制 小鼠肾脏中的糖蛋白底物,特别是ANPEP和MEP1A 糖生物学 NA 凝集素辅助蛋白质组学、单细胞转录组学 NA 蛋白质组数据、转录组数据 NA NA NA NA NA
937 2025-12-04
Niclosamide suppresses gastric cancer progression through YTHDF2 inhibition-affected lactate metabolic reprogramming
2025-Nov-21, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了胃癌的代谢重编程特征,并发现药物氯硝柳胺通过抑制m6A甲基化调控蛋白YTHDF2来影响代谢基因,从而抑制胃癌进展 首次将氯硝柳胺的抗癌作用与m6A甲基化调控蛋白YTHDF2联系起来,并系统阐明了其在调节乳酸代谢重编程和肿瘤微环境乳酸穿梭中的作用机制 NA 探究胃癌代谢重编程的分子机制,并评估氯硝柳胺通过靶向YTHDF2抑制胃癌进展的治疗潜力 胃癌患者样本、胃癌细胞系 肿瘤代谢 胃癌 非靶向代谢组学、转录组学、单细胞RNA-seq NA 代谢组数据、转录组数据、单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
938 2025-12-04
stTransfer enables transfer of single-cell annotations to spatial transcriptomics with single-cell resolution
2025-Nov-17, Cell reports methods IF:4.3Q2
研究论文 本文提出了一种名为stTransfer的方法,通过整合单细胞RNA测序数据和空间转录组数据,利用图自编码器和迁移学习实现单细胞级别的细胞类型注释 stTransfer方法通过图自编码器和迁移学习最小化scRNA-seq与ST数据集间的信息传递损失,在准确性和鲁棒性上优于现有方法 未在摘要中明确说明 解决空间转录组技术中因检测灵敏度和基因覆盖度限制导致的单细胞级别细胞类型注释难题 斑胸草雀视顶盖的高精度Stereo-seq数据集中的神经元群体 空间转录组学 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 图自编码器, 迁移学习 基因表达数据 未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 Stereo-seq 高精度Stereo-seq
939 2025-12-04
Development of a single-cell derived MDSCs signature score for prognostic risk stratification and therapeutic decision guidance in breast cancer
2025-Nov-17, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过结合单细胞RNA测序与批量多组学数据,开发了一个基于单细胞来源的MDSCs特征基因的预后风险评分模型,用于乳腺癌的预后分层和治疗决策指导 首次系统性地表征了乳腺癌中新的MDSCs基因特征,并建立了一个具有多方面临床转化能力的MDSCs相关标志物评分框架,将MDSCs的基础生物学与精准肿瘤学联系起来 NA 开发一个基于MDSCs特征基因的预后风险评分模型,用于乳腺癌的预后风险分层和治疗决策指导 乳腺癌患者中的髓源性抑制细胞(MDSCs)及其特征基因 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量多组学数据分析 机器学习方法 单细胞RNA测序数据,批量多组学数据 整合了单细胞数据集GSE161529和GSE176078,识别了12,767个MDSCs NA 单细胞RNA-seq NA NA
940 2025-12-04
GPR15 and CD38 define a subset of peripheral blood pathogenic effector Th2 cells associated with active eosinophilic esophagitis
2025-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术,识别了外周血中GPR15+ CD38+致病性效应Th2细胞亚群与活动性嗜酸性食管炎的关联 首次将外周血GPR15+致病性效应Th2细胞与食管组织中的对应细胞直接关联,并发现CD38表达上调可作为活动性疾病的标志,为非侵入性诊断提供了新靶点 样本量相对有限(外周血74例,活检17例;单细胞测序外周血27例,活检10例),且机制研究如环境暴露的具体因素需进一步探索 评估GPR15+致病性效应Th2细胞在嗜酸性食管炎发病机制中的作用及其作为疾病状态生物标志物的潜力 嗜酸性食管炎患者及对照者的外周血和食管活检样本 数字病理学 嗜酸性食管炎 单细胞RNA测序, 流式细胞术 NA 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 流式细胞术:74例外周血样本和17例活检样本;单细胞RNA测序:27例外周血样本和10例活检样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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