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当前共找到 41493 篇文献，本页显示第 921 - 940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 921 | 2026-07-02 |
Single-cell analysis of HIV expression and integration sites reveals robust viral expression across diverse chromatin environments
2026-Jun-30, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.00670-26
PMID:42379818
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研究论文 | 通过单细胞分析HIV表达与整合位点，揭示病毒在不同染色质环境中的稳健表达 | 首次结合scRNA-seq和scATAC-seq在同个细胞中测量整合位点与病毒表达，发现HIV表达不受整合位点基因组特征影响，并观察到HIV频繁引起整合位点基因的插入激活 | 未提及具体局限性 | 研究HIV整合位点对病毒表达和潜伏期的影响 | HIV感染的初级CD4 T细胞 | 数字病理学 | 艾滋病 | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞ATAC-seq数据 | 117,610个HIV感染的初级CD4 T细胞（其中1,530个细胞用于整合位点分析） | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 922 | 2026-07-02 |
α-ketoglutarate accumulation orchestrates immunosuppressive metabolic remodeling to drive cetuximab resistance in metastatic colorectal cancer
2026-Jun-30, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-09001-8
PMID:42380087
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研究论文 | 该研究揭示了α-酮戊二酸积累通过免疫抑制性代谢重塑驱动转移性结直肠癌西妥昔单抗耐药的机制 | 首次发现EGFR/GDH1/αKG/ALKBH5轴作为西妥昔单抗反应的关键调节因子，并提出血液αKG监测可识别受益于GDH1抑制的耐药患者 | 未明确提及 | 阐明西妥昔单抗耐药机制并确定EGFR的合成致死搭档 | 转移性结直肠癌中的西妥昔单抗耐药肿瘤细胞及其肿瘤免疫微环境 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 923 | 2026-07-02 |
Spatial transcriptomics in cancer research: insights into tumorigenesis, diagnosis and therapeutics
2026-Jun-30, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-03092-0
PMID:42380096
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综述 | 探讨空间转录组学在癌症研究中的应用，涵盖肿瘤发生、诊断和治疗方面的见解 | 系统总结了空间转录组学在解析肿瘤微环境、免疫细胞浸润及恶性转化机制中的创新应用，并强调了其在癌症亚型诊断、风险分层和个性化治疗中的变革性作用 | 未明确提及具体局限性，但可能包括技术成本高、数据复杂性及临床应用转化挑战 | 阐述空间转录组学如何推动癌症研究，从肿瘤发生机制到精准诊断和治疗的发展 | 癌症组织样本，包括肿瘤区域、基质细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 转录本表达和空间定位数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 924 | 2026-07-02 |
PCGF1-mediated bivalent promoter remodeling enables NK cell immune evasion in non-small cell lung cancer
2026-Jun-30, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-09003-6
PMID:42380149
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research paper | 揭示PCGF1通过双价启动子重塑促进非小细胞肺癌细胞逃逸自然杀伤细胞免疫的机制 | 发现PCGF1在非小细胞肺癌中通过增强抑制性组蛋白修饰（H2AK119ub和H3K27me3）并减少活性组蛋白修饰（H3K4me3）沉积，破坏双价启动子平衡，沉默细胞因子-细胞因子受体通路，从而抑制NK细胞效应功能 | 未提及明显限制，但可能包括对体内模型验证不足或机制在其他癌症中的通用性需进一步研究 | 探究PCGF1在非小细胞肺癌免疫逃逸中的作用及其表观遗传机制 | 非小细胞肺癌细胞系及自然杀伤细胞 | machine learning | lung cancer | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自TCGA队列的分析及体外细胞实验 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 925 | 2026-07-02 |
Metabolic Heterogeneity Across Heart Failure Subtypes Defined by Integrative Multi-Omics Analysis
2026-Jun-30, Journal of cardiovascular translational research
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12265-026-10803-6
PMID:42380371
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研究论文 | 通过整合多组学分析揭示不同心力衰竭亚型间的代谢异质性 | 首次整合代谢组学、遗传学和单细胞转录组学，系统鉴定不同心力衰竭亚型的代谢特征，并发现OGDHL作为心脏代谢重塑的潜在调控因子 | 未提及具体局限性 | 阐明不同心力衰竭亚型的代谢特征及其潜在机制 | 心力衰竭患者及实验性心力衰竭模型 | 机器学 | 心血管疾病 | 代谢组学、孟德尔随机化、单细胞转录组测序 | NA | 代谢物数据、遗传数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 926 | 2026-07-02 |
Machine learning reveals X chromosome transcriptional signatures that classify systemic lupus erythematosus in females
2026-Jun-30, BMC rheumatology
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s41927-026-00669-1
PMID:42381053
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研究论文 | 利用机器学习分析单细胞RNA测序数据，发现X染色体转录特征可用于分类女性系统性红斑狼疮患者 | 首次通过机器学习方法从x染色体基因表达中识别出系统性红斑狼疮的女性特异性转录信号，并发现XCI逃逸基因在分类中起关键作用 | 未提及具体局限性 | 探究X染色体基因表达是否可用细胞类型特异的方式分类女性系统性红斑狼疮 | 228名女性供体的外周血单核细胞（包括CD4+和CD8+ T细胞） | 机器学习 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 集成分类器 (Ensemble of classifiers) | 单细胞转录组数据 | 110万个细胞来自228名女性供体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 927 | 2026-07-02 |
Single-cell-marker-based subtyping and multi-level analyses uncover the prognostic effects, dysregulations and therapeutic indicative potential of an eight-gene signature in lung adenocarcinoma
2026-Jun-30, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04403-2
PMID:42381064
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研究论文 | 基于单细胞标志基因的亚型分类和多层次分析，揭示肺腺癌中八基因标志的预后效应、失调和治疗指示潜力 | 利用单细胞转录组分析结合多组学和多层次分析，识别出基于单细胞标志基因的LUAD亚型和八基因预后标志，并验证其在mRNA和蛋白水平的失调及药物敏感性关联 | 未提及具体局限性 | 开发可靠的肺腺癌预后和治疗标志物 | 肺腺癌患者样本、单细胞数据、TCGA-LUAD数据集、LUAD细胞系 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞转录组分析, RT-qPCR, 蛋白质组学, 免疫组织化学 | 非负矩阵分解、LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据、单细胞RNA-seq数据、蛋白质组学数据 | TCGA-LUAD数据集（样本数未明确）、外部验证数据集、LUAD细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 928 | 2026-07-02 |
Exploring LTB-mediated T cell differentiation as a prognostic marker in triple-negative breast cancer
2026-Jun-30, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-026-02332-6
PMID:42381077
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research paper | 通过转录组和单细胞数据分析，探索LTB介导的T细胞分化作为三阴性乳腺癌预后标志物 | 首次利用无监督聚类识别三阴性乳腺癌的两种免疫浸润表型，并构建基于五个关键基因的预后模型，揭示了LTB通过调节T细胞分化增强免疫浸润的作用机制 | 未明确说明，但基于内容可能是缺乏大规模临床验证或功能实验的深入机制验证 | 研究三阴性乳腺癌的免疫浸润表型分类及其预后价值，并探索关键调控基因LTB在免疫调节中的作用 | 三阴性乳腺癌肿瘤组织及免疫浸润T细胞 | digital pathology | breast cancer | RNA-seq, 单细胞测序 | CNN | 转录组数据, 单细胞数据 | GEO和METABRIC数据库样本，具体数量未详述 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 929 | 2026-07-02 |
Exposure to Ketamine and 2-Fluorodeschloroketamine Impairs Mitochondrial Oxidative Phosphorylation in Human Cerebral Organoids: Implications for Neurodevelopmental Toxicity
2026-Jun-30, Current neuropharmacology
IF:4.8Q1
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研究论文 | 使用人类大脑类器官模型，通过单细胞转录组学分析氯胺酮和2-氟去氯氯胺酮对线粒体氧化磷酸化的影响，揭示其神经发育毒性机制 | 首次利用人类大脑类器官结合单细胞转录组学揭示氯胺酮及其类似物对特定细胞类型的线粒体氧化磷酸化干扰机制 | 尚需进一步验证30 μM浓度在体内暴露水平的相关性，且未完全阐明所有细胞类型特异性的分子机制 | 探究氯胺酮和2-氟去氯氯胺酮对胎儿脑发育的神经毒性分子机制 | 人类大脑类器官和胎鼠原代皮层神经元 | 数字病理学 | 神经发育疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 83,436个细胞（来自对照组和处理组类器官） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 930 | 2026-07-02 |
Integrative Analysis Reveals BPTF, COL1A1, and COL4A2 as Fibroblast-Related Biomarkers Associated with Immune Infiltration in Ovarian Cancer
2026-Jun-30, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 通过整合分析与卵巢癌进展相关的成纤维细胞生物标志物及其与免疫浸润的关系 | 利用单细胞RNA-seq和批量转录组数据，结合hdWGCNA和LASSO方法，首次识别出BPTF、COL1A1和COL4A2作为卵巢癌成纤维细胞相关关键基因，并揭示了它们在肿瘤免疫微环境中的作用 | 这些基因的预后价值及与免疫治疗反应的相关性需要在独立生存队列和治疗反应数据集中进一步验证 | 识别与卵巢癌进展和免疫浸润相关的成纤维细胞生物标志物 | 卵巢癌样本中的细胞亚群及成纤维细胞相关基因 | 机器学习 | 卵巢癌 | 单细胞RNA-seq | LASSO | 基因表达数据 | GSE184880和GSE66957数据集中的卵巢癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 931 | 2026-07-02 |
scVIP: personalized modeling of single-cell transcriptomes for developmental and disease phenotypes
2026-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.20.717759
PMID:42079230
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研究论文 | 提出scVIP，一个将基因表达、细胞类型组成和表型测量整合到单一概率模型中的生成模型，用于个性化建模单细胞转录组以预测发育和疾病表型 | 采用细胞类型感知的多实例学习架构，学习供体嵌入以捕捉进程，同时将表型相关信号定位到特定细胞群体，从而在单细胞和个体表型之间建立可解释的桥梁 | 未提及，但可能包括模型对数据质量的依赖性和计算复杂度 | 开发一个能够精确预测个体表型并推断发展轨迹的生成模型，连接单细胞分子状态与个体水平表型 | 单细胞转录组数据及其对应的个体表型（如发育年龄、疾病进展） | 机器学习 | 亨廷顿病、阿尔茨海默病、类风湿关节炎 | RNA-seq | 生成模型 | 文本 | 在四项应用中使用多个数据集，包括皮质发育、亨廷顿病、阿尔茨海默病和类风湿关节炎数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 932 | 2026-07-02 |
IntegrateRigor: annotation-free integration optimization for cell identity recovery reveals cancer-immune interface niches
2026-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.14.725078
PMID:42182279
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研究论文 | 提出IntegrateRigor框架，无需注释即可优化单细胞与空间转录组数据整合，恢复细胞身份并揭示癌症-免疫界面微环境 | 首次提出数据驱动、无注释、方法无关的积分优化框架，通过基因稳定性评分与整合平衡指标自动选择基因与超参数，无需先验细胞身份注释 | 该方法依赖于批次间稳定性基因的选择，可能忽略某些批次特异性但有生物学意义的基因；对高度复杂或小样本数据集的表现需进一步验证 | 解决单细胞和空间转录组数据整合中过度整合与欠整合问题，实现可靠的细胞身份恢复 | 结直肠癌的单细胞与空间转录组数据集，以及涵盖多种批次间变异来源的多个公开数据集 | 机器学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序， 空间转录组学 | NA | 基因表达数据， 空间转录数据 | 结直肠癌数据集及多个公开数据集 | NA | 单细胞RNA测序， 空间转录组学 | NA | NA |
| 933 | 2026-07-02 |
Spatial transcriptomics uncovers the hybrid molecular identity, ciliated phenotype, and immune signature of adenomyosis lesions
2026-Jun-26, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aea6379
PMID:42341108
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研究论文 | 通过空间转录组学分析，揭示了腺肌症病变的混合分子身份、纤毛表型和免疫特征 | 首次通过空间转录组学对全层人类子宫壁活检进行深度分析，揭示腺肌症病变具有介于子宫内膜和肌层之间的独特转录组谱，并发现其增强的上皮纤毛化特征和候选化合物逆转潜力 | 样本量有限（n=10），且研究基于单一组织类型，可能无法完全代表不同疾病阶段或亚型的异质性 | 阐明腺肌症病变的分子身份和发病机制，为开发靶向、疾病修饰疗法奠定基础 | 全层人类子宫壁活检样本（n=10）中的腺肌症病变区域及其匹配的子宫内膜和肌层组织 | 数字病理学 | 妇科疾病（腺肌症） | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 10个全层人类子宫壁活检样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 934 | 2026-07-02 |
Sympathetic neurons exacerbate atherosclerosis by modulating macrophage function via the NPY/Y1R axis
2026-Jun-24, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
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研究论文 | 该文章研究了交感神经元通过NPY/Y1R轴调节巨噬细胞功能，加重动脉粥样硬化的机制 | 首次揭示交感神经-巨噬细胞轴在动脉粥样硬化中的具体作用机制，特别是NPY/Y1R信号通过p38和JNK通路驱动促炎性巨噬细胞极化 | 未明确提及 | 探究交感神经支配是否以及如何通过调节巨噬细胞表型和功能促进动脉粥样硬化 | ApoE-/-小鼠及其巨噬细胞，交感神经元 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，组织病理学染色，qPCR，ELISA，Western blot | NA | 图像，文本 | ApoE-/-小鼠，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 935 | 2026-07-02 |
Single-cell Transcriptomics Reveals that the SORBS1/FBXO22/BAG3 Axis Drives Astrocyte Senescence via Calcium Signaling and Affects Alzheimer's Disease-Related Neuronal Damage
2026-06-17, Neuromolecular medicine
IF:3.3Q2
DOI:10.1007/s12017-026-08937-6
PMID:42307825
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research paper | 通过单细胞转录组学揭示SORBS1/FBXO22/BAG3轴通过钙信号驱动星形胶质细胞衰老并影响阿尔茨海默病相关神经元损伤 | 首次发现SORBS1/FBXO22/BAG3轴通过调节钙信号驱动星形胶质细胞衰老，进而影响阿尔茨海默病相关神经元损伤，为治疗阿尔茨海默病提供了潜在靶点 | NA | 探究阿尔茨海默病中星形胶质细胞衰老的分子机制及其对神经元损伤的影响 | 阿尔茨海默病和对照大脑的scRNA-seq数据、淀粉样蛋白-β处理的星形胶质细胞、星形胶质细胞-神经元共培养模型 | machine learning | Alzheimer's disease | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、Co-IP、体外泛素化测定 | NA | 单细胞基因表达数据 | 从GEO检索的AD和对照大脑的scRNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | NA |
| 936 | 2026-07-02 |
Subgroup-Specific Associations of GRIA Genes Encoding AMPA Glutamate Receptor Subunits with Patient Survival in Medulloblastoma
2026-06-11, Neuromolecular medicine
IF:3.3Q2
DOI:10.1007/s12017-026-08935-8
PMID:42277445
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研究论文 | 分析GRIA基因编码的AMPA谷氨酸受体亚基在髓母细胞瘤中的表达及其与患者生存的亚组特异性关联 | 首次揭示AMPA受体亚基基因GRIA1-4在髓母细胞瘤不同分子亚群中的表达模式差异及其与预后的亚组特异性关联，特别是GRIA3和GRIA4在SHH亚群中具有强烈但相反的预后关联 | 主要基于公开数据集和细胞系分析，缺乏大型独立验证队列的确认；未深入探讨GRIA表达差异的分子机制 | 探索AMPA受体亚基基因GRIA1-4在髓母细胞瘤中的表达模式及其与患者生存的预后价值 | 髓母细胞瘤肿瘤样本和细胞系 | 机器学习 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR | NA | 基因表达数据 | 多个髓母细胞瘤公开数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序用于分析GRIA基因在不同髓母细胞瘤亚群中的富集情况 |
| 937 | 2026-07-02 |
Impaired keratinization activity in perianal Crohn's fistulas is associated with poor prognosis
2026-Jun-07, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjag092
PMID:42378710
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研究论文 | 本研究分析了肛周克罗恩病瘘管中角质化活性受损与不良预后的关联 | 首次揭示角质化相关基因模块在肛周瘘管愈合过程中的作用，并证明其可作为预测长期预后的生物标志物 | 样本量相对较小（49例），且未涉及功能验证的动物模型 | 识别影响肛周瘘管临床行为的生物学因素，以改善患者分层 | 49例肛周瘘管患者（36例克罗恩病相关，13例隐腺性）的内瘘开口及瘘管组织 | 数字病理学 | 克罗恩病 | RNA测序，空间转录组学，人类成人类器官培养 | 基因模块评分模型 | 基因表达数据，空间转录组数据 | 49例患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 938 | 2026-07-02 |
Atlas-Level Single-Cell and Spatial Transcriptomics Data Integration via PRIME
2026-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.20.726698
PMID:42239079
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研究论文 | 提出PRIME框架，用于整合单细胞RNA测序和空间转录组学的图谱级数据 | PRIME通过随机投影共识锚定、图拉普拉斯校正和可选空间邻域正则化，在整合异质数据集时同时保留细微生物变异并处理大规模计算问题，且能原生适应空间坐标 | 未明确提及局限性，但方法依赖随机投影和共识投票，可能对高维噪声敏感 | 开发一个可扩展且通用的整合框架，以稳健处理单细胞RNA测序和空间转录组学的异质性批次效应，并保留生物学结构 | 人类造血系统、背外侧前额叶皮层、扰动图谱细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | PRIME（基于投影的稳健整合流形嵌入） | 基因表达数据、空间坐标数据 | 人类造血系统基准数据集（8个供体，约33000个细胞）、背外侧前额叶皮层空间转录组数据集、扰动图谱（超过100万个细胞） | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 939 | 2026-07-02 |
A simple cell-cycle control system in Marchantia polymorpha provides a framework for understanding plant cell proliferation
2026-Jun-02, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koag103
PMID:41967031
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研究论文 | 通过研究地钱MpCYCD的细胞周期基因系统，揭示了早期陆地植物细胞增殖的简单控制机制，为理解多细胞增殖及其演化提供框架 | 首次在非种子植物地钱中发现简化的核心细胞周期基因系统，并利用单细胞RNA-seq和活体成像揭示每个细胞周期阶段（G1、S、G2/M）主要由一种细胞周期蛋白主导，同时通过功能研究证明MpCYCD；1足以促进细胞周期再进入 | 本研究主要基于地钱营养体阶段，未涉及生殖阶段或环境胁迫下的细胞周期调控，且基因操作可能未完全模拟自然条件 | 理解早期陆地植物细胞增殖的演化及细胞周期控制的保守特征 | 地钱MpCYCD细胞周期基因系统 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 活体成像 | NA | 基因表达数据, 图像 | 地钱营养体组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3'基因表达文库制备 |
| 940 | 2026-07-02 |
Ketogenic Diet as an Epigenetic Therapy in SETD1B-Related Epilepsy
2026-06, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.70345
PMID:41714828
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研究论文 | 报告一名SETD1B相关失神癫痫患儿通过改良阿特金斯生酮饮食实现癫痫发作减少超过90%，并利用单细胞RNA测序揭示生酮饮食对染色质、核糖体、免疫和线粒体通路的改善作用 | 首次提出生酮饮食作为SETD1B相关癫痫的表观遗传疗法，通过单细胞RNA测序揭示其对全血细胞基因表达的广泛调节作用 | 单病例报告，样本量小（仅一名患者及一名年龄匹配对照），结论外推性有限 | 探究生酮饮食对SETD1B相关癫痫的表观遗传调控机制 | 一名SETD1B相关失神癫痫患儿及一名年龄匹配的健康对照 | 数字病理学 | 癫痫 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3份外周血单个核细胞样本（基线、治疗3个月、年龄匹配对照），共25,159个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |