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当前共找到 38003 篇文献,本页显示第 921 - 940 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
921 2026-03-21
Integrating trajectory inference and self-explainable predictive models to explore cell state transitions in breast cancer at single-cell resolution
2026, Frontiers in bioinformatics IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序数据、伪时间轨迹推断和可解释的机器学习模型,探索乳腺癌中细胞状态转换的分子驱动因素 结合伪时间轨迹推断与基于树的可解释机器学习模型,提供透明、基于规则的转录重编程洞察,而非黑盒模型 仅基于一个浸润性导管乳腺癌样本的单细胞数据,样本量有限,可能无法代表所有乳腺癌亚型 探索乳腺癌中细胞状态转换的分子驱动因素,以改进分子分类和推进精准治疗发展 乳腺癌肿瘤微环境中的恶性克隆和细胞群 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 基于树的机器学习模型 单细胞RNA测序数据 超过5,000个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
922 2026-03-21
Integrated Multi-Omics Profiling Identifies CD84-Associated Microglial Alterations in Focal Cortical Dysplasia Type II
2026, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究采用整合多组学方法,揭示了CD84相关的小胶质细胞改变在局灶性皮质发育不良II型中的作用 首次通过整合蛋白质组学、转录组学和单细胞RNA测序数据,系统解析了FCDII的分子病理,并识别出CD84作为关键枢纽分子,其在小胶质细胞亚群中的特异性表达和细胞间通讯作用 研究主要基于生物信息学分析和初步验证,缺乏深入的体内外功能实验验证CD84的具体机制 解析局灶性皮质发育不良II型的分子发病机制,特别是神经炎症的作用 局灶性皮质发育不良II型患者的脑组织样本 数字病理学 癫痫 数据非依赖性采集质谱蛋白质组学, 转录组学重分析, 单细胞RNA测序 NA 蛋白质组数据, 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 未明确具体样本数量,涉及FCDII组织样本和公共数据集 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
923 2026-03-21
Distinct populations of lung capillary endothelial cells and their functional significance
2025-Dec-26, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学技术揭示了肺毛细血管内皮细胞的分子异质性,识别出五个新的gCaps亚群及其功能角色 首次在肺毛细血管中识别出五个新的gCaps亚群,包括表达Scn7a和Clic4离子转运蛋白的两种主要亚群、有丝分裂活跃的'根'细胞以及表达Lingo2的静脉-毛细血管内皮,并阐明了它们在血管表型转换、再生修复和血管生成调节中的作用 研究主要基于单细胞转录组学数据,功能验证可能有限,且缺氧模型可能无法完全模拟所有肺疾病的病理条件 探究肺毛细血管内皮细胞的分子异质性及其在正常生理和肺疾病病理生物学中的功能意义 肺毛细血管内皮细胞 数字病理学 肺疾病 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
924 2026-03-21
Single-cell transcriptome profiling reveals immunological fitness of HIV long-term non-progressors
2025-12-23, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序,揭示了HIV长期不进展者(LTNPs)相较于典型进展者(TPs)具有更平衡和有利的免疫学特征 首次在单细胞分辨率下系统比较了LTNPs、TPs和健康供体的免疫细胞转录组特征,并应用高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)揭示了LTNPs特有的先天免疫/髓系相关模块高表达及B细胞/细胞毒性相关模块低表达模式 样本量较小(仅12名个体),且为横断面研究,无法确定观察到的转录组差异是HIV不进展的原因还是结果 探究与HIV慢性感染中疾病不进展相关的免疫学特征 HIV长期不进展者(LTNPs)、典型进展者(TPs)和健康供体(HDs)的外周血单个核细胞 单细胞转录组学 HIV感染 单细胞RNA测序 高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA) 单细胞转录组数据 12名个体(4名LTNPs、4名TPs、4名HDs) NA 单细胞RNA-seq NA NA
925 2026-03-21
Cmss1 limits FMDV infection by enhancing antigen presentation and CD8+ T cell responses
2025-12-23, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本研究通过构建小鼠感染模型和单细胞RNA测序,揭示了FMDV感染如何改变树突状细胞亚群比例并抑制抗原呈递过程,并鉴定出Cmss1作为拮抗该抑制、限制FMDV致病性的新型宿主因子 首次在缺乏I型干扰素受体的小鼠模型中,利用单细胞RNA测序绘制了FMDV感染后脾脏树突状细胞的高分辨率图谱,并鉴定出Cmss1作为调控抗原呈递过程、限制FMDV感染的新型宿主因子 研究主要基于小鼠模型,其在免疫应答方面与猪(FMDV的自然宿主)存在差异;单细胞测序仅针对脾脏组织,未涵盖其他免疫器官 探究树突状细胞在FMDV感染中的作用机制,寻找限制病毒感染的新型宿主因子 缺乏I型干扰素受体的C57BL/6小鼠、FMDV病毒、树突状细胞 免疫学 口蹄疫 单细胞RNA测序、基因编辑、抗原呈递能力评估系统 NA 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,使用基因编辑小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
926 2026-03-21
Single-cell sequencing of rodent ventral pallidum reveals diverse neuronal subtypes with noncanonical interregional continuity
2025-Dec-05, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序技术,揭示了啮齿动物腹侧苍白球(VP)的神经元亚型多样性及其跨区域连续性 首次在跨物种(小鼠和大鼠)水平上对VP进行转录组表征,识别出16个保守的神经元亚类,并发现这些亚类超越了传统VP边界,与纹状体、下丘脑和扩展杏仁核等区域共享细胞类型 研究主要基于啮齿动物模型,结果在人类中的适用性尚需验证;高脂饮食的影响分析可能未涵盖所有相关基因或通路 探究腹侧苍白球的区域身份和细胞类型多样性,及其在摄食等行为中的作用 小鼠和大鼠的腹侧苍白球组织 单细胞测序 NA 单细胞核RNA测序 NA RNA序列数据 啮齿动物(小鼠和大鼠)的腹侧苍白球组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
927 2026-03-21
Matrix Stiffness Directs Early Injury and Ketogenesis Programs to Prime Kidney Repair
2025-Dec-03, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过整合多种技术方法,揭示了细胞外基质刚度在急性肾损伤修复中的关键作用,并识别出Mfap2作为通过非经典Hippo通路调控酮生成和修复的核心介质 首次绘制了AKI肾脏基质支架的全面蛋白质组图谱,并发现Mfap2通过LATS1介导的非经典Hippo通路调控机械代谢信号,而不影响整合素受体活性 研究主要基于动物模型,其发现向人类临床转化的有效性尚需进一步验证 探究细胞外基质如何调控急性肾损伤的修复机制 急性肾损伤动物模型、肾脏成纤维细胞、周细胞及肾小管细胞 数字病理 急性肾损伤 数据非依赖性采集全局与磷酸化蛋白质组学、空间转录组学、组织工程方法 NA 蛋白质组数据、磷酸化蛋白质组数据、空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
928 2026-03-21
Genome doubling as a dynamic driver of ovarian cancer evolution: insights from single-cell sequencing
2025-Nov-19, Journal of ovarian research IF:3.8Q1
综述 本文综述了全基因组加倍(WGD)作为卵巢癌进化动态驱动因子的最新见解,特别是通过单细胞测序技术揭示其在高级别浆液性卵巢癌中的作用 重新定义了WGD的角色,从基因组不稳定的结果转变为肿瘤进化的核心动态驱动因子,并解决了WGD驱动的染色体不稳定性与免疫抑制表型相关的生物学悖论 NA 探讨全基因组加倍在卵巢癌,特别是高级别浆液性卵巢癌进化中的动态驱动作用及其临床意义 高级别浆液性卵巢癌(HGSOC) 基因组学 卵巢癌 单细胞测序 NA 基因组数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
929 2026-03-21
Bile acids engage the SIPR-STAT3 signaling axis to modulate regulatory T cell responses in fibrosing cholangiopathies
2025-Nov, Journal of hepatology IF:26.8Q1
研究论文 本研究探讨了胆汁酸通过S1PR-STAT3信号轴调节调节性T细胞(Treg)在纤维化胆管病中的应答,揭示了其抑制Treg功能并促进Th17样表型的机制 首次在单细胞水平上揭示了胆汁酸通过S1PR-STAT3信号轴抑制Treg功能并促进其向Th17样表型极化的机制,并提出了通过IBAT抑制剂恢复Treg功能的新治疗策略 研究主要基于小鼠模型,虽然验证了部分人类样本,但临床转化仍需进一步临床试验验证 阐明胆汁酸在纤维化胆管病中如何调节调节性T细胞(Treg)的应答机制 小鼠模型(包括硬化性胆管炎模型和Abcb4-/-模型)以及130例胆道闭锁婴儿的肝组织样本 单细胞组学 纤维化胆管病(包括胆道闭锁和原发性硬化性胆管炎) 单细胞RNA测序(scRNA-seq),单细胞ATAC测序(scATAC-seq),功能验证实验 NA 单细胞转录组数据,单细胞染色质可及性数据,临床肝组织样本数据 多个小鼠模型及130例胆道闭锁婴儿肝组织样本 NA 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq NA NA
930 2026-03-21
Single-cell transcriptional landscape of liver transplant rejection reveals tissue persistence of clonally expanded, treatment-resistant T cells
2025-Nov, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons IF:8.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组库分析,揭示了肝移植排斥中克隆扩增、治疗抵抗性T细胞的转录景观及其在组织中的持久性 首次在儿科肝移植排斥中,利用单细胞技术全面描绘了CD8 T细胞的克隆扩增、基因表达、空间定位及其在组织中的持久性,并揭示了库普弗细胞与CD8 T细胞间的差异互作机制 样本量相对较小(30例冷冻肝活检),且仅针对儿科患者,可能限制了结果的普遍性 探究肝移植后T细胞介导的排斥反应中CD8 T细胞的克隆扩增、持久性及分子机制 儿科肝移植患者的冷冻肝活检样本(包括排斥和非排斥状态) 数字病理学 肝移植排斥 单细胞RNA测序,免疫组库分析 MultiNicheNet分析 单细胞转录组数据,免疫组库数据 30例冷冻肝活检样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
931 2026-03-21
Integrated spatial and single-cell transcriptomics reveal PAK kinase as a therapeutic target in fibroblastic foci and dense fibrosis of idiopathic pulmonary fibrosis
2025-Oct, The European respiratory journal
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学,揭示了特发性肺纤维化中PAK激酶作为治疗靶点,特别是在成纤维细胞灶和致密纤维化区域 首次结合单细胞RNA测序与空间转录组学,识别出在成纤维细胞灶和致密纤维化区域富集的新型肌成纤维细胞群,并发现PAK2激酶在这些区域的激活,为IPF提供了新的治疗靶点 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本的验证可能有限,且PAK抑制剂在人体中的长期疗效和安全性需进一步评估 探究特发性肺纤维化中成纤维细胞灶和致密纤维化的细胞异质性及分子机制,以识别治疗靶点 特发性肺纤维化患者的肺组织样本、IPF来源的成纤维细胞以及博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型 数字病理学 肺纤维化 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA RNA测序数据, 空间转录组数据 未明确指定样本数量,但涉及人类IPF肺组织样本和小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
932 2026-03-21
Single-Cell RNA Sequencing Identifies a Unique Macrophage Population in a Mouse Model of Ozone-induced Asthma Exacerbation
2025-Oct, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,在小鼠臭氧诱导哮喘加重模型中识别了一个独特的巨噬细胞群体 首次通过单细胞RNA测序揭示臭氧暴露后肺泡巨噬细胞和单核细胞亚群的独特转录特征,并发现这些细胞在哮喘加重中的关键作用 研究仅基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类哮喘患者 探究臭氧吸入诱发哮喘气道高反应性的免疫细胞机制 小鼠肺部免疫细胞,特别是肺泡巨噬细胞和单核细胞 单细胞组学 哮喘 单细胞RNA测序,流式细胞术 NA 单细胞转录组数据 暴露于尘螨、豚草、臭氧或组合处理的小鼠肺部细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
933 2026-03-21
Gastric cancer adapts high lipid microenvironment via suppressing PPARG-FABP1 axis after arriving in the lymph node
2025-09, Redox biology IF:10.7Q1
研究论文 本研究探讨了胃癌细胞在淋巴结转移过程中通过抑制PPARG-FABP1轴适应高脂微环境的机制 揭示了胃癌细胞在淋巴结转移中通过下调PPARγ-FABP1轴来适应高脂微环境并避免铁死亡的新机制 NA 研究胃癌细胞在淋巴结转移过程中的代谢适应,特别是脂质代谢重编程 胃癌细胞 肿瘤代谢 胃癌 非靶向脂质组学测序、肿瘤细胞流式分选、RNA测序、单细胞测序、透射电子显微镜、BODIPY 581/591染色、ChIP-qPCR NA 测序数据、显微镜图像、染色数据 NA NA 单细胞测序、RNA测序、脂质组学 NA NA
934 2026-03-21
Multi-Omics Integrated Analysis of the Protective Effect of Tertiary Lymphoid Structures and Associated Key Regulatory Genes in Human Gallbladder Cancer
2025-09, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过多组学整合分析探讨了三级淋巴结构(TLSs)在人类胆囊癌中的保护作用及其相关关键调控基因 首次在胆囊癌中系统评估TLS与预后的关联,并利用单细胞RNA测序、批量RNA测序和深度学习筛选出六个TLS相关候选基因,通过实验验证了CTSG和HSPB8在免疫调节中的作用 样本量相对较小(85例患者),且研究主要基于回顾性分析,需要更大规模的前瞻性研究验证 探究TLS在胆囊癌中的预后价值及其相关基因的调控机制 胆囊癌患者组织样本及相关基因 数字病理学 胆囊癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 深度学习 深度学习 RNA测序数据 85例胆囊癌患者 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
935 2026-03-21
Single-Cell RNA Sequencing of Peripheral Blood Mononuclear Cells in Patients With Single Ventricle/Hypoplastic Left Heart Syndrome
2025-08, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了单心室/左心发育不全综合征患者外周血单个核细胞的转录组特征,揭示了疾病对不同细胞类型的差异影响 首次在SV/HLHS患者中应用单细胞RNA测序技术,系统性地揭示了PBMCs中不同细胞类型的转录组变化,并强调了MYC和IFN-γ活性的精确调控在疾病中的新见解 样本量相对较小(33名患者和33名对照),且仅关注了PBMCs,未涉及其他组织或器官的免疫细胞变化 探究SV/HLHS患者外周血单个核细胞的转录组特征,以理解疾病对免疫系统的影响 33名儿科SV/HLHS患者(10名女性和23名男性)的外周血单个核细胞,并与33名无心脏病的对照进行比较 单细胞转录组学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 66名参与者(33名SV/HLHS患者和33名对照) NA 单细胞RNA-seq NA NA
936 2026-03-21
Emergence of regulatory and matrix-producing stromal cells during adipogenic induction in human ceiling culture-derived preadipocytes
2025-07-22, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和表观遗传分析,探索了人类天花板培养来源的前脂肪细胞在脂肪生成诱导早期的转录组变化 首次在单细胞水平上揭示了ccdPAs对脂肪生成诱导的响应,并发现ATOH8转录因子在ccdPAs中表达显著高于ASCs,且其表观遗传状态支持这一差异 研究仅关注早期转录组变化,未涉及长期分化过程或功能验证 探究人类天花板培养来源的前脂肪细胞在脂肪生成诱导下的细胞异质性和转录调控机制 人类天花板培养来源的前脂肪细胞和脂肪来源的干细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序, 表观遗传分析 NA 单细胞转录组数据, 表观遗传数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
937 2026-03-21
EVscope: A Comprehensive Bioinformatics Pipeline for Accurate and Robust Analysis of Total RNA Sequencing from Extracellular Vesicles
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一个名为EVscope的开源生物信息学流程,专门用于处理细胞外囊泡RNA测序数据,以提高RNA生物标志物和细胞间通讯研究的准确性和鲁棒性 EVscope采用优化的全基因组期望最大化算法,通过有效利用比对分数和局部读取覆盖度,在单碱基分辨率上显著改进了多映射读取分配,特别针对片段化和低丰度的EV RNA;此外,它首次生成基于EM的BigWig文件用于下游分析,这是现有工具不具备的功能 NA 开发一个标准化的计算工作流程,以应对EV RNA测序中由于低丰度、片段化、组织来源广泛以及共分离材料污染带来的分析挑战 细胞外囊泡RNA测序数据集 生物信息学 NA 总RNA测序 期望最大化算法 RNA测序数据 NA NA NA NA NA
938 2026-03-21
Lung endothelial cell heterogeneity in health and pulmonary vascular disease
2025-Jun-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
综述 本文探讨了肺内皮细胞在健康和肺血管疾病中的异质性,重点关注单细胞RNA测序技术带来的新见解 通过单细胞RNA测序技术揭示了肺内皮细胞的新型亚群(如肺泡毛细血管内皮细胞和通用毛细血管内皮细胞)及其在肺动脉高压发病机制中的新通路和机制 作为一篇小型综述,可能未涵盖所有最新研究或技术细节,且依赖于现有文献的总结 综述肺内皮细胞异质性在肺血管疾病(特别是肺动脉高压)中的作用及研究进展 肺内皮细胞 数字病理学 肺动脉高压 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
939 2026-03-21
Integrated Single-Cell Transcriptome and eQTL Analyses Reveal the Role of PZP in Aging and Chronic Kidney Disease
2025-03, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组和eQTL分析,揭示了PZP蛋白在衰老和慢性肾病(CKD)相互作用中的关键作用 首次整合单细胞RNA测序、eQTL和孟德尔随机化分析,系统揭示了CD8+中央记忆T细胞及其关键基因PZP在连接衰老与CKD中的遗传和免疫机制 样本来源仅限于外周血,未直接分析肾脏组织;样本量相对有限;机制验证主要在关联分析层面,需要进一步的功能实验证实 探索衰老与慢性肾病(CKD)相互作用的遗传和免疫机制,并寻找潜在生物标志物和治疗靶点 年轻对照个体、老年个体以及慢性肾病(CKD)患者的外周血样本 数字病理学 慢性肾病 单细胞RNA测序, eQTL分析, 孟德尔随机化分析 NA 单细胞转录组数据, 基因组数据, 临床指标数据 年轻对照、老年个体和CKD患者的外周血样本(具体数量未在摘要中明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
940 2026-03-21
Gut microbial production of lithocholic acid reprograms pro-resolutive macrophages to enhance vedolizumab responsiveness via the TGR5/FXR-NF-κB axis
2025-Jan-02, The ISME journal
研究论文 本研究揭示了肠道微生物代谢物石胆酸通过TGR5/FXR-NF-κB轴重编程巨噬细胞为促消退表型,从而增强克罗恩病患者对维多珠单抗治疗反应性的机制 首次阐明肠道微生物来源的石胆酸通过调控巨噬细胞表型转换来增强维多珠单抗疗效的分子机制,并发现TGR5/FXR-NF-κB轴在这一过程中的关键作用 研究主要基于人源化小鼠模型,临床验证尚需进一步开展;机制研究多依赖体外实验,体内复杂微环境的影响需更深入探索 探究克罗恩病患者对维多珠单抗治疗反应差异的机制,寻找预测治疗反应的生物标志物 克罗恩病患者肠道微生物代谢物、肠道巨噬细胞、人源化小鼠结肠炎模型 微生物组学与免疫学 克罗恩病 宏基因组学、代谢组学、单细胞RNA测序、转录组分析、粪便微生物移植 人源化小鼠模型 基因组数据、代谢组数据、转录组数据 未明确说明具体样本数量,涉及临床供体粪便样本和人源化小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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