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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 921 | 2026-06-06 |
Differential Roles of Notch Receptors in Regulating Activation of Intact Adult Mouse Spinal Cord-Derived NSCs
2026-Jan, Developmental neurobiology
IF:2.7Q3
DOI:10.1002/dneu.70013
PMID:41581227
|
research paper | 研究成年小鼠脊髓来源神经干细胞中Notch受体在调控其激活中的差异角色 | 首次揭示Notch1和Notch2在成年脊髓神经干细胞激活和静息状态中的不同调控作用 | 研究对象仅局限于8周龄C57/BL6小鼠的脊髓神经干细胞,且未涉及体内环境验证 | 探究Notch受体在调控成年脊髓神经干细胞激活中的具体作用机制 | 8周龄C57/BL6小鼠脊髓来源的神经干细胞 | digital pathology | spinal cord injury | single-cell RNA sequencing, lentiviral vector infection, Western blot analysis | NA | single-cell transcriptome data | 8周龄C57/BL6小鼠脊髓来源的神经干细胞 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 922 | 2026-06-06 |
Intrahepatic Lymphangiogenesis Is Associated with Early Post-Hepatectomy Liver Regeneration, in Part via IL-6/STAT3 Signaling
2026, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.106849
PMID:41583514
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研究论文 | 研究揭示肝内淋巴管生成通过IL-6/STAT3信号通路部分促进肝切除术后早期肝脏再生 | 首次阐明肝内淋巴管生成在肝脏再生中的具体作用及其通过IL-6/STAT3信号通路的机制 | 研究基于小鼠模型,需在人类样本中进一步验证;部分依赖于IL-6/STAT3信号,可能还有其他通路参与 | 探讨肝内淋巴管生成在肝脏再生中的作用及潜在机制 | 肝内淋巴管内皮细胞(LyECs)以及肝切除术后的小鼠肝脏组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序,qRT-PCR,Western blotting,免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型(70%肝切除术后),具体样本量未在摘要中提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 923 | 2026-06-06 |
Exploring the Dynamic Changes of Intercellular Connections in Cervical Cancer: Insights From Transcriptomic Data Combined With Single-Cell Sequencing
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/8140041
PMID:41584728
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研究论文 | 利用转录组数据和单细胞测序探索宫颈癌细胞间连接的动态变化 | 通过单细胞测序揭示宫颈癌上皮细胞亚群间的相互作用,鉴定出低CNV评分的细胞簇,并构建基于标志基因的预后模型,发现COL4A1作为潜在治疗靶点 | 需要进一步验证模型和靶点在更大样本和临床实践中的有效性 | 研究宫颈癌肿瘤微环境中上皮细胞亚群间的相互作用并构建预后模型 | 宫颈癌上皮细胞亚群及其细胞间相互作用 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据和单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 924 | 2026-06-06 |
Unveiling the molecular mechanisms of burn injury through integrated single-cell and bulk transcriptomic analysis
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0341725
PMID:41592030
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组分析揭示烧伤的分子机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统解析烧伤微环境的细胞图谱,并结合机器学习方法鉴定关键标记基因 | 样本量有限且缺乏实验验证 | 探究烧伤损伤的免疫学微环境及其分子机制 | 烧伤微环境中的细胞亚群,特别是巨噬细胞和其他免疫细胞 | 机器学习, 数字病理学 | 烧伤 | 单细胞RNA测序, LASSO回归, 随机森林 | UMAP | 基因表达数据 | 9248个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 925 | 2026-06-06 |
Exploring key genes related to air pollutants in polycystic ovary syndrome: A comprehensive analysis from transcriptome and single-cell analysis combined with network toxicology
2026-Jan-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.119623
PMID:41601053
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研究论文 | 结合转录组和单细胞分析以及网络毒理学,探索空气污染物与多囊卵巢综合征相关的关键基因 | 首次整合批量RNA-seq、单细胞RNA-seq数据与空气污染物相关分子靶点,采用差异表达、机器学习、功能富集和分子对接分析,鉴定了ESR2、FAAH和MAOB三个关键基因,并揭示其与污染物诱导内分泌紊乱的关联 | NA | 探讨空气污染物与多囊卵巢综合征的关联机制并识别潜在的分子生物标志物 | 多囊卵巢综合征患者与健康对照的转录组和单细胞数据 | 机器学习 | 多囊卵巢综合征 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据, 单细胞数据 | NA | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 926 | 2026-06-06 |
SpaConTDS: A multimodal contrastive learning framework for identifying spatial domains by applying tuple disturbing strategy
2026-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013893
PMID:41610146
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research paper | 提出了一种名为SpaConTDS的多模态对比学习框架,通过应用元组扰动策略来识别空间域 | 将强化学习与自监督多模态对比学习相结合,通过数据增强和伪标签元组扰动策略生成正负样本,动态优化模型超参数,无需先验对齐即可整合多个组织切片并校正批次效应 | 未在摘要中明确提及 | 准确识别空间域,探索细胞结构和功能 | 多模态空间转录组学数据 | machine learning | NA | 空间转录组学 | 多模态对比学习框架 | 空间转录组学数据 | NA | NA | spatial transcriptomics | NA | NA |
| 927 | 2026-06-06 |
PIK3R1 as a Gastric Cancer Biomarker Linked to CD73 + Treg-Mediated Immunosuppression
2026, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2025.069453
PMID:41613810
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research paper | 研究PIK3R1作为胃癌生物标志物与CD73+Treg介导的免疫抑制作用的关系 | 首次建立整合PIK3R1和CD73表达与临床参数的预后模型,用于胃癌患者风险分层 | NA | 探究PIK3R1在胃癌中的预后意义及其与肿瘤免疫微环境的关联 | 胃癌患者(包括TCGA和中山大学肿瘤防治中心队列) | machine learning | 胃癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 免疫组化图像 | TCGA和SYSUCC两个队列的胃癌患者样本 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | TCGA数据集使用Illumina平台进行RNA测序 |
| 928 | 2026-06-06 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Suggests That JUN May Regulate BAMBI to Promote Osteosarcoma Cell Migration and Invasion
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/9261651
PMID:42211757
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示JUN可能通过调控BAMBI促进骨肉瘤细胞迁移和侵袭 | 首次利用单细胞RNA测序技术解析骨肉瘤转移过程中的细胞异质性,并发现JUN通过调控BAMBI表达激活TGF-β信号通路促进转移的新机制 | 未在体内模型中验证该调控机制,且BAMBI在更大样本中的临床相关性有待进一步确认 | 探究骨肉瘤转移的分子机制并识别免疫诊断和治疗标志物 | 骨肉瘤患者瘤内异质性及转移相关细胞亚群 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 骨肉瘤患者样本(具体数量文中未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 929 | 2026-06-06 |
dNK3 cells in normal pregnancy and recurrent pregnancy loss: from molecular identity to functional imbalance
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1822205
PMID:42212143
|
研究论文 | 探讨dNK3细胞在正常妊娠和复发性流产中的分子特征与功能失衡 | 首次系统阐明dNK3细胞的分子特征、功能特性及其在复发性流产中的比例失衡现象,并提出dNK1/dNK3比值作为诊断生物标志物和潜在治疗靶点 | 目前证据尚不足以支持临床转化,需解决因果关系、跨研究可比性以及dNK3/ieILC1发育关系等关键问题 | 研究dNK3细胞在正常妊娠和复发性流产中的分子身份与功能失衡 | 蜕膜自然杀伤(dNK)细胞,特别是dNK3亚群 | 机器学习 | 复发性流产 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个独立研究的样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 930 | 2026-06-06 |
Single-cell transcriptomic profiling of halo nevi and normal nevi reveals CD8+ T cell activation in melanocytic autoimmunity
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1771401
PMID:42220500
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研究论文 | 研究对晕痣和正常痣进行单细胞RNA测序,揭示了CD8+ T细胞在黑色素细胞自身免疫中的活化机制 | 首次构建晕痣与正常痣的单细胞转录组图谱,发现黑色素细胞亚群中抗原呈递分子和干扰素刺激基因显著上调,揭示了黑色素细胞内源性和免疫介导的自身免疫破坏机制,以及与白癜风的共同致病通路 | 未明确说明上游触发因素,且样本量较小,可能影响结论的普适性 | 探索晕痣中CD8+ T细胞活化的上游触发因素和黑色素细胞自身免疫的分子机制 | 晕痣和正常痣组织 | 单细胞转录组学 | 自身免疫性皮肤病 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 晕痣和正常痣样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 931 | 2026-06-06 |
Immunometabolic reprogramming and glycolysis-associated signatures in sepsis: insights from single-cell RNA sequencing and machine learning
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1817391
PMID:42220506
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和机器学习揭示脓毒症中的免疫代谢重编程和糖酵解相关特征 | 整合单细胞转录组和全血芯片数据,利用多种机器学习算法筛选出五种糖酵解相关基因,并识别出TGFBI作为单核细胞中心通信网络的关键生物标志物 | 仅基于公开数据集和动物模型验证,缺乏大规模临床队列的进一步验证 | 阐明脓毒症中免疫代谢重塑的糖酵解相关生物标志物及其细胞类型背景 | 人外周血单细胞和全血样本,以及小鼠盲肠结扎穿刺模型 | 自然语言处理 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 芯片, qRT-PCR | LASSO, 随机森林, Boruta | 单细胞转录组数据, 全血芯片数据, qRT-PCR数据 | 公开数据集GSE175453(单细胞)和GSE100159(芯片),以及CLP手术小鼠与对照小鼠 | NA | 单细胞RNA测序, 芯片, qRT-PCR | GSE175453, GSE100159 | NA |
| 932 | 2026-06-06 |
Integrated multi-omics deciphers sepsis immune dysregulation: a dual-pathway targeted small-molecule therapy improves survival and ameliorates multi-organ dysfunction
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1809540
PMID:42220532
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研究论文 | 整合多组学数据解析脓毒症免疫失调,提出双通路小分子联合疗法改善生存并减轻多器官功能障碍 | 通过整合多组学数据(单细胞RNA-seq、miRNA-seq、RNA-seq)解析脓毒症免疫细胞动态和失调通路,设计靶向炎症和Hippo/Wnt再生通路的双通路小分子组合疗法,显著提升生存率并减轻多器官损伤 | 未提及具体局限性,但可能涉及样本量、模型外推性及临床转化挑战 | 解析脓毒症免疫失调机制并开发有效的联合治疗策略 | 脓毒症患者免疫细胞及小鼠模型中免疫反应与组织修复 | 机器学习和数字病理学(通过多组学分析) | 脓毒症(全身性感染相关器官功能障碍) | 单细胞RNA-seq、miRNA-seq、RNA-seq | NA(未提及具体模型类型) | 转录组数据(单细胞RNA-seq、miRNA-seq、RNA-seq) | NA(摘要未明确说明样本量) | 10x Genomics, Illumina, BGI(推测的多组学数据来源) | 单细胞RNA-seq、miRNA-seq、批量RNA-seq | 10x Chromium(单细胞RNA-seq)、Illumina NovaSeq(RNA-seq)、BGISEQ(miRNA-seq) | 10x Chromium单细胞3'测序、Illumina NovaSeq批量RNA-seq、BGISEQ miRNA测序 |
| 933 | 2026-06-06 |
Associations Between Immune Senescence and Immune Reconstitution Among People Living With HIV Undergoing Antiretroviral Therapy
2026, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/jimr/8683624
PMID:42227661
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研究论文 | 本研究探讨了免疫衰老与HIV感染者接受抗逆转录病毒治疗后免疫重建失败之间的关联 | 首次利用公共单细胞RNA测序数据中SenMayo基因集评分,结合前瞻性队列研究,系统评估了基线免疫衰老特征对ART治疗后免疫重建失败的影响 | 未明确提及,但可能包括样本量有限、观察周期仅为48周、未深入机制验证等 | 探究ART治疗前免疫衰老特征在免疫重建失败中的作用 | 510名开始ART治疗的HIV感染者 | 免疫学 | 艾滋病 | 单细胞RNA测序、免疫表型分析、细胞因子检测、细胞衰老标志物评估 | 逻辑回归 | 基因表达数据、免疫表型数据、细胞因子数据 | 510名HIV感染者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 来源于公共数据库的CD4+ T细胞单细胞RNA测序数据 |
| 934 | 2026-06-06 |
Immune Cell Infiltration and Kynurenine Pathway Activation Define Early Injury and Progression in Diabetic Nephropathy
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.122164
PMID:41608614
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研究论文 | 整合单细胞RNA测序、体内糖尿病模型和2型糖尿病患者临床样本,研究糖尿病肾病不同阶段免疫炎症动态变化 | 首次揭示CCL4⁺髓源性抑制细胞在早期糖尿病肾病中的主导浸润作用,发现MALAT1维持其功能,并阐明犬尿氨酸途径代谢物与MDSC诱导和不良肾结局的关联 | 未提供明显局限性信息 | 阐明糖尿病肾病进展过程中的免疫炎症动态变化及关键分子机制 | 糖尿病肾病小鼠模型和2型糖尿病患者 | 机器学习 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 多个小鼠模型和2型糖尿病患者临床样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 935 | 2026-06-06 |
Integrating network toxicology, machine learning, and single-cell sequencing to reveal the FASN-mediated role of phenolic endocrine disruptors in water in promoting prostate cancer
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0350638
PMID:42228706
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研究论文 | 整合网络毒理学、机器学习和单细胞测序揭示水中酚类内分泌干扰物通过FASN促进前列腺癌的作用 | 首次利用网络毒理学、机器学习和单细胞测序多维框架,系统揭示酚类内分泌干扰物(NP/OP)通过FASN基因促进前列腺癌的潜在分子机制 | 研究基于计算分析和已有数据集,缺乏实验验证;FASN作为分子枢纽的因果关系仍需进一步实验确认 | 探究水中酚类内分泌干扰物(NP/OP)促进前列腺癌的分子机制 | 前列腺癌相关基因和酚类内分泌干扰物靶点 | 机器学习, 生物信息学, 网络毒理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟 | ANN, LASSO, SVM-RFE, GSVA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | GSE46602数据集(36个肿瘤样本 vs 14个良性样本),GSE137829数据集(6个前列腺癌样本) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 936 | 2026-06-06 |
The Research Progress of Tumor-Associated Macrophages in Prostate Cancer
2026, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/jimr/6287638
PMID:42244152
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综述 | 文章综述了肿瘤相关巨噬细胞在前列腺癌中的研究进展,包括其促进肿瘤进展和免疫治疗耐药的机制,以及靶向TAMs的精准治疗策略 | 基于单细胞RNA测序细化了TAMs的经典M1/M2分型,提出增殖性TAM和免疫调节性TAM等新亚型,并探讨了巨噬细胞胞外陷阱在转移中的作用 | 靶向治疗面临肿瘤微环境复杂性、TAM异质性、药物生产和递送障碍以及毒性管理等挑战 | 基于患者肿瘤内TAM亚群的组成、功能状态和信号依赖性开发个性化靶向策略,实现从“一刀切”方法向精准医学的转变 | 肿瘤相关巨噬细胞 | 机器学习教育 | 前列腺癌 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 937 | 2026-06-06 |
Multisystem regulation of reward and addiction: beyond the dopaminergic system
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1840096
PMID:42244883
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综述 | 综述了奖赏与成瘾的多系统调控机制,超越了多巴胺能系统的单一视角 | 提出奖赏和厌恶应在一个统一的价处理框架下理解,并鉴定出下丘脑被盖核(SVTg)作为新的脑干节点,整合多系统信号 | 未提供具体实验数据,主要基于现有文献的综合分析 | 阐述奖赏和成瘾的多系统、网络基础模型,强调超越多巴胺能系统的调控机制 | 奖赏与成瘾相关神经环路及分子机制 | 机器学习 | 成瘾 | 单细胞转录组学、实时神经影像学、计算精神病学、药物基因组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 938 | 2026-06-06 |
ecPICK: A deep learning-enabled spatial diagnostic platform for direct ecDNA identification and clinical prognosis across pan-cancer histopathology
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.134316
PMID:42244994
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研究论文 | 开发深度学习框架ecPICK,从常规H&E染色全切片图像中识别和定位染色体外DNA,实现跨癌种病理诊断与预后预测 | 首次将深度学习应用于常规病理切片的ecDNA检测,无需昂贵测序即可实现空间定位,并揭示ecDNA富集区域的独特微环境特征 | 依赖H&E染色质量,可能与FISH验证存在偏差,计算成本或受限于大规模临床部署 | 建立低成本、可临床转化的ecDNA空间诊断平台,用于泛癌病理分析及预后评估 | 来自20种不同癌症的4280张H&E染色全切片图像及其对应ecDNA数据 | 机器视觉, 数字病理学 | 泛癌 | 深度学习, 荧光原位杂交, 空间转录组学 | ecPICK深度学习框架 | 图像 | 20种癌症类型的4280张全切片图像 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 939 | 2026-06-06 |
Epigenetic subtypes of high-grade T1 bladder cancer reveal intra-tumor heterogeneity and distinct interactions with tumor microenvironment
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.129729
PMID:42244999
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研究论文 | 该研究通过整合染色质图谱、单核RNA-seq、免疫组化和空间转录组学,定义了高级别T1期膀胱癌的表观遗传亚型,揭示了肿瘤内异质性及其与肿瘤微环境的相互作用 | 首次通过整合多种技术定义了高级别T1期膀胱癌的表观遗传亚型,并揭示了其与微环境的特异性相互作用及空间分布特征 | 研究中未提及明显的局限性信息 | 定义高级别T1期膀胱癌的表观遗传亚型,表征异质性,并探索肿瘤-微环境相互作用 | 高级别T1期膀胱癌患者肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 批量染色质分析、单核RNA测序、免疫组化、空间转录组学 | NA | 图像、文本 | 未明确说明具体样本数量,但涉及高级别T1期膀胱癌患者 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 940 | 2026-06-06 |
Scalable differentiation of human cardiac organoids from iPSCs generates cardiac tissues for cardiac cell therapy
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.127654
PMID:42245001
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研究论文 | 本研究提出了一种可扩展的方法,从iPSC分化出心脏类器官,用于心脏细胞治疗,并在猪心肌梗死模型中验证了其移植效果 | 首次在20天内从iPSC分化出含有心肌细胞、心脏成纤维细胞和内皮细胞的成熟心脏类器官,并验证了生物反应器辅助放大策略和猪体内移植可行性 | 仅使用了少量类器官(3500个),且随访时间较短(8-30天),长期效果和安全性需进一步评估 | 开发可扩展的心脏类器官分化技术,用于改善心肌梗死细胞治疗的细胞植入效果 | 人诱导多能干细胞(iPSC)衍生的心脏类器官 | 数字病理学 | 心血管疾病 | NA | NA | 图像 | 3500个心脏类器官,移植到猪心肌梗死模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |