单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 9361 - 9380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9361 | 2024-09-07 |
Sex and disease regulate major histocompatibility complex class I expression in human lung epithelial cells
2024-Sep, Physiological reports
IF:2.2Q3
DOI:10.14814/phy2.70025
PMID:39223101
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研究论文 | 研究探讨了人类肺上皮细胞中主要组织相容性复合体I类（MHC I）表达在性别和疾病状态下的调节机制 | 首次揭示了人类肺上皮细胞中MHC I表达的性别差异及其在慢性呼吸系统疾病中的上调现象 | 研究仅限于人类肺上皮细胞，未涉及其他细胞类型或物种 | 探讨人类肺上皮细胞中MHC I表达的调控机制及其在慢性呼吸系统疾病中的作用 | 人类肺上皮细胞及其在慢性呼吸系统疾病中的MHC I表达 | 免疫学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序和免疫染色 | NA | RNA | 来自肺实质移植的人类肺上皮细胞样本 |
| 9362 | 2024-09-07 |
scRNA-Explorer: An End-user Online Tool for Single Cell RNA-seq Data Analysis Featuring Gene Correlation and Data Filtering
2024-Sep-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2024.168654
PMID:39237193
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研究论文 | 介绍了一个名为scRNA-Explorer的在线工具，用于单细胞RNA测序数据分析，支持基因相关性和数据过滤 | 开发了一个开源的在线工具scRNA-Explorer，简化了单细胞RNA测序数据的分析流程，并提供了基因相关性分析和基因富集分析功能 | NA | 开发一个用户友好的在线工具，用于简化单细胞RNA测序数据的分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 9363 | 2024-09-07 |
Decoding 11-oxygenated androgen synthesis: insights from enzyme gene expression and LC-MS/MS quantification
2024-Aug-30, European journal of endocrinology
IF:5.3Q1
DOI:10.1093/ejendo/lvae104
PMID:39219353
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研究论文 | 本研究通过分析大量正常人体组织的RNA和蛋白质数据，揭示了11-氧代雄激素在肾脏和肠道中的合成机制 | 首次系统性地研究了11-氧代雄激素在不同组织中的合成途径，并开发了TransMap网站用于可视化转录组数据 | 研究主要集中在正常人体组织，未涉及疾病状态下的情况 | 探讨11-氧代雄激素在外周组织中的合成机制及其在人体中的潜在作用 | 11-氧代雄激素的合成酶基因表达及其在不同组织中的分布 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA)、免疫组化、液相色谱-串联质谱 (LC-MS/MS) | NA | RNA、蛋白质 | 30种组织的bulk RNA数据、16种组织的单细胞RNA测序数据、29种组织的蛋白质数据 |
| 9364 | 2024-09-07 |
ScRNAs reveals high-frequency rTMS-induced pericyte differentiation: Potential implications for vascular regeneration and blood-brain barrier stability in stroke
2024-Aug-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e35339
PMID:39229501
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研究论文 | 研究探讨了重复经颅磁刺激（rTMS）对中风后血脑屏障（BBB）的影响及其潜在机制 | 通过单细胞测序（ScRNAs）揭示了rTMS诱导的周细胞分化，并发现了新的周细胞亚群作为中风治疗的潜在靶点 | 研究仅在动物模型中进行，尚未在人类中验证 | 探讨rTMS对中风后血脑屏障修复和血管再生的影响 | 中风后血脑屏障的修复和血管再生 | 数字病理学 | 中风 | 单细胞测序（ScRNAs） | NA | 单细胞数据 | 使用短暂性大脑中动脉闭塞（tMCAO）大鼠模型进行研究 |
| 9365 | 2024-09-07 |
Single-cell network analysis reveals gene expression programs for Arabidopsis root development and metabolism
2024-Aug-12, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2024.100978
PMID:38783601
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研究论文 | 本文通过单细胞基因共表达网络分析，揭示了拟南芥根发育和代谢的基因表达程序 | 首次对拟南芥根的单细胞RNA测序数据进行全面的基因共表达网络分析，并识别出149个基因共表达模块，这些模块被认为是基因表达程序 | NA | 揭示拟南芥根发育和代谢的基因表达程序 | 拟南芥根的单细胞RNA测序数据 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | SingleCellGGM算法 | 基因表达数据 | 公开的拟南芥根单细胞RNA测序数据集 |
| 9366 | 2024-09-07 |
Single-cell transcriptome atlases of soybean root and mature nodule reveal new regulatory programs that control the nodulation process
2024-Aug-12, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2024.100984
PMID:38845198
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研究论文 | 研究使用单细胞转录组测序和分子图谱技术，分析了成熟大豆根瘤细胞的转录组特征，揭示了氮固定和衰老细胞的共存现象，并鉴定了新的调控基因 | 首次对成熟大豆根瘤细胞的转录组进行精确表征，揭示了氮固定和衰老细胞的共存现象，并发现了新的调控基因 | NA | 研究大豆根瘤细胞的转录组特征，揭示氮固定过程中的新调控机制 | 大豆根和成熟根瘤细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 9367 | 2024-09-07 |
A single-cell transcriptome atlas reveals the trajectory of early cell fate transition during callus induction in Arabidopsis
2024-Aug-12, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2024.100941
PMID:38720464
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研究论文 | 研究报告了拟南芥根外植体在愈伤组织诱导培养基中0、1和4天的单细胞转录组时间序列实验，构建了愈伤组织诱导过程的详细单细胞转录组图谱 | 首次揭示了LRPI-like细胞和QC-like细胞在愈伤组织形成早期的细胞命运转变轨迹，并识别了调控这些细胞的转录因子和基因表达特征 | NA | 揭示拟南芥愈伤组织诱导过程中细胞异质性和细胞命运转变的机制 | 拟南芥根外植体在愈伤组织诱导培养基中的单细胞转录组 | 植物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 拟南芥根外植体在愈伤组织诱导培养基中0、1和4天的样本 |
| 9368 | 2024-09-07 |
Pericytes recruited by CCL28 promote vascular normalization after anti-angiogenesis therapy through RA/RXRA/ANGPT1 pathway in lung adenocarcinoma
2024-Jul-29, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03135-3
PMID:39075504
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研究论文 | 研究了CCL28在抗血管生成治疗后通过RA/RXRA/ANGPT1途径促进肺腺癌血管正常化的分子机制 | 首次详细报道了抗血管生成治疗后血管正常化的分子机制 | NA | 探讨抗血管生成治疗后肿瘤血管正常化的分子机制 | 肺腺癌细胞和人源及鼠源的肺腺癌细胞系 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞测序、免疫荧光、多重免疫组化、磁激活细胞分选、实时定量PCR、Western blotting、LC-MS技术、ChIP-qPCR | NA | 细胞、组织 | 人源肺腺癌细胞系A549和鼠源肺腺癌细胞系LLC，以及临床活检样本和原代肺腺癌肿瘤组织中的周细胞 |
| 9369 | 2024-09-07 |
Communication between alveolar macrophages and fibroblasts via the TNFSF12-TNFRSF12A pathway promotes pulmonary fibrosis in severe COVID-19 patients
2024-Jul-29, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05381-7
PMID:39075394
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研究论文 | 研究探讨了TNFSF12-TNFRSF12A通路在严重COVID-19患者中促进肺纤维化的机制 | 首次揭示了TNFSF12-TNFRSF12A通路在肺泡巨噬细胞和成纤维细胞间通信中的关键作用 | 研究仅限于体外实验和单细胞RNA测序分析，缺乏体内实验验证 | 探讨严重COVID-19患者中肺纤维化的细胞通信机制 | 肺泡巨噬细胞和成纤维细胞 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 严重COVID-19患者和健康对照的肺组织样本 |
| 9370 | 2024-09-07 |
ST-SCSR: identifying spatial domains in spatial transcriptomics data via structure correlation and self-representation
2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae437
PMID:39228303
|
研究论文 | 提出了一种名为ST-SCSR的新算法，用于在空间转录组数据中识别空间域，该算法结合了局部信息、全局信息和空间域的相似性 | ST-SCSR通过矩阵三因子分解同时分解表达谱和空间网络，融合了表达和空间特征，并通过局部保留和稀疏约束增强了图的质量 | NA | 开发一种新的算法来解决现有空间域识别方法中忽略局部信息和空间域关系的问题 | 空间转录组数据中的空间域 | 生物信息学 | NA | 矩阵三因子分解 | NA | 转录组数据 | NA |
| 9371 | 2024-09-07 |
Advanced sequencing-based high-throughput and long-read single-cell transcriptome analysis
2024-05-14, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d4lc00105b
PMID:38669201
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综述 | 本文综述了基于高级测序技术的高通量和长读长单细胞转录组分析方法 | 介绍了下一代测序（NGS）和第三代测序（TGS）技术在解决单细胞转录组分析中低丰度和异质性问题方面的进展 | NA | 探讨单细胞转录组分析在揭示细胞类型、状态及其在发育、健康和疾病中的相互作用中的重要性 | 单细胞转录组 | 基因组学 | NA | NGS, TGS | NA | 转录组数据 | NA |
| 9372 | 2024-09-07 |
Proteomic analysis of serum small extracellular vesicles identifies diagnostic biomarkers for neuroblastoma
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1367159
PMID:39228987
|
研究论文 | 本文通过蛋白质组学分析血清中小细胞外囊泡，识别神经母细胞瘤的诊断生物标志物 | 首次通过蛋白质组学分析血清中小细胞外囊泡，识别出神经母细胞瘤的潜在诊断生物标志物 | 需要进一步的临床验证和大规模样本研究以确认这些生物标志物的诊断效用 | 识别神经母细胞瘤的诊断生物标志物 | 血清中的小细胞外囊泡 | 蛋白质组学 | 神经母细胞瘤 | 无标签蛋白质组学、多反应监测、Western blot分析 | NA | 蛋白质数据、RNA-seq数据 | 104个差异表达蛋白质，26个潜在生物标志物 |
| 9373 | 2024-09-07 |
Single-cell RNA sequencing in endometrial cancer: exploring the epithelial cells and the microenvironment landscape
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1425212
PMID:39229264
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在子宫内膜癌中的应用，探讨了肿瘤细胞和微环境的复杂性 | 本文强调了单细胞RNA测序技术在揭示子宫内膜癌肿瘤细胞和微环境复杂性方面的贡献 | 本文指出了单细胞RNA测序研究中存在的技术偏差和样本量限制，并强调需要更大规模的研究来涵盖更广泛的子宫内膜癌组织学亚型 | 本文旨在通过综述单细胞RNA测序技术在子宫内膜癌中的应用，推动对该复杂疾病的理解 | 本文主要研究对象是子宫内膜癌的肿瘤细胞和微环境 | 数字病理学 | 妇科肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 本文未具体提及样本量 |
| 9374 | 2024-09-07 |
Effects of Leydig cell elimination on testicular interstitial cell populations: characterization by scRNA-seq and immunocytochemical techniques
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1423801
PMID:39229372
|
研究论文 | 研究了睾丸间质细胞群在莱迪细胞消除后的变化，并通过单细胞RNA测序和免疫细胞化学技术进行了表征 | 首次通过单细胞RNA测序和免疫细胞化学技术详细表征了成年大鼠睾丸间质细胞的类型及其动态变化，并分析了莱迪细胞消除对间质稳态的影响 | 研究仅限于成年大鼠，结果可能不适用于其他物种 | 表征睾丸间质细胞的类型及其动态变化，并分析莱迪细胞消除对间质稳态的影响 | 成年大鼠的睾丸间质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序和免疫细胞化学技术 | NA | 转录组数据 | 成年大鼠 |
| 9375 | 2024-09-07 |
Remodeling of the osteoimmune microenvironment after biomaterials implantation in murine tibia: Single-cell transcriptome analysis
2023-Apr, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2022.10.009
PMID:36311047
|
研究论文 | 研究了在小鼠胫骨中植入生物材料后骨免疫微环境的重组，通过单细胞转录组分析揭示了不同细胞群的异质性和动态变化 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了植入材料对骨免疫微环境的影响，并探讨了中性粒细胞在骨整合中的作用 | 研究仅限于小鼠模型，且样本量相对较小 | 探讨生物材料植入后骨免疫微环境的重组及其对骨整合的影响 | 小鼠胫骨中植入不锈钢和钛合金生物材料后的骨免疫微环境 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 40043个细胞，分为五个不同组 |
| 9376 | 2024-09-07 |
Correspondence analysis for dimension reduction, batch integration, and visualization of single-cell RNA-seq data
2023-01-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-26434-1
PMID:36681709
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研究论文 | 本文介绍了一种基于对应分析（CA）的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据降维、批次整合和可视化方法 | 提出了一种基于对应分析（CA）的替代PCA的方法，避免了log转换对数据的扭曲，并提出了五种CA的适应性改进，这些改进在计算细胞嵌入时表现更好或与标准CA和glmPCA相当 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的降维和批次整合方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 对应分析（CA） | 基因表达数据 | 9个数据集 |
| 9377 | 2024-09-07 |
speedingCARs: accelerating the engineering of CAR T cells by signaling domain shuffling and single-cell sequencing
2022-11-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34141-8
PMID:36323661
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研究论文 | 本文介绍了一种名为speedingCARs的方法，通过信号域重排和单细胞测序加速CAR T细胞工程 | 利用CRISPR-Cas9技术生成180种独特的CAR变体，并通过单细胞RNA测序和单细胞CAR测序进行高通量筛选，识别出具有肿瘤杀伤特性的变体 | NA | 扩展CAR信号域组合空间，为CAR T细胞的工程化提供工具 | CAR T细胞及其信号域 | 生物工程 | NA | CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序, 单细胞CAR测序 | NA | 基因组数据, 单细胞RNA数据 | 180种独特的CAR变体 |
| 9378 | 2024-09-07 |
spliceJAC: transition genes and state-specific gene regulation from single-cell transcriptome data
2022-11, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.202211176
PMID:36321549
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研究论文 | 本文介绍了一种名为spliceJAC的方法，用于从单细胞转录组数据中量化多变量mRNA剪接，并构建细胞状态特异性的基因-基因调控网络 | spliceJAC方法通过利用未剪接和剪接的mRNA计数矩阵，构建细胞状态特异性的基因-基因调控网络，并应用稳定性分析预测细胞状态转换中的关键驱动基因 | NA | 本文旨在从单细胞转录组数据中提取动态信息，以增进对细胞状态转换和基因间相互作用的理解 | 本文研究了胰腺内皮发育和A549肺癌细胞中的上皮-间质转化（EMT） | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涉及胰腺内皮发育和A549肺癌细胞的单细胞转录组数据 |
| 9379 | 2024-09-07 |
Cell therapy attenuates endothelial dysfunction in hypertensive rats with heart failure and preserved ejection fraction
2022-11-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00287.2022
PMID:36083797
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研究论文 | 研究细胞疗法对高血压伴心力衰竭和保留射血分数大鼠的血管内皮功能障碍的影响 | 首次使用心脏球来源的细胞（CDCs）治疗高血压伴心力衰竭和保留射血分数的大鼠，发现其能减少炎症和纤维化，改善功能、结构和生存率 | 研究仅在动物模型中进行，尚未在人类中验证其疗效 | 验证炎症在心力衰竭伴保留射血分数（HFpEF）中的作用，并测试细胞疗法的效果 | 高血压伴心力衰竭和保留射血分数的大鼠 | 心血管疾病 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Dahl盐敏感大鼠，分为CDCs治疗组和对照组 |
| 9380 | 2024-09-07 |
Patient-Derived Organoids from Colorectal Cancer with Paired Liver Metastasis Reveal Tumor Heterogeneity and Predict Response to Chemotherapy
2022-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202204097
PMID:36058001
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研究论文 | 本文构建了一个包含50个结直肠癌肝转移患者来源的类器官生物库，并分析了其多组学数据，揭示了肿瘤异质性并预测化疗反应 | 首次构建了结直肠癌肝转移患者来源的类器官生物库，并利用多组学数据全面分析了肿瘤异质性，预测了化疗反应和临床预后 | NA | 开发一种有效的方法来预测结直肠癌肝转移患者的化疗反应和术后预后 | 结直肠癌肝转移患者及其来源的类器官 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 多组学数据 | 50个结直肠癌肝转移患者来源的类器官 |