本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']
”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!
除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
9321 | 2025-10-07 |
The Histone Methyltransferase SETDB2 Modulates Tissue Inhibitors of Metalloproteinase-Matrix Metalloproteinase Activity During Abdominal Aortic Aneurysm Development
2023-09-01, Annals of surgery
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/SLA.0000000000005963
PMID:37325923
|
研究论文 | 本研究揭示组蛋白甲基转移酶SETDB2通过调控TIMP-MMP活性在腹主动脉瘤发展中的关键作用 | 首次发现SETDB2通过H3K9me3修饰抑制TIMP1-3基因表达,从而调控巨噬细胞介导的蛋白酶活性 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仍需进一步扩展 | 探究巨噬细胞特异性表观遗传酶在腹主动脉瘤发展中的作用机制 | 人类主动脉组织样本和髓系特异性SETDB2缺陷小鼠模型 | 表观遗传学 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序,基因敲除,表观遗传分析 | NA | 基因表达数据,组织学数据 | 人类AAA组织和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9322 | 2025-10-07 |
Macrophage-mediated PDGF Activation Correlates With Regenerative Outcomes Following Musculoskeletal Trauma
2023-08-01, Annals of surgery
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/SLA.0000000000005704
PMID:36111847
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析巨噬细胞亚群与肌肉骨骼损伤后再生或纤维化愈合的关系 | 首次在多种肌肉骨骼损伤模型中系统鉴定出与再生和纤维化愈合相关的巨噬细胞亚群,并发现血小板衍生生长因子信号在再生条件下的增强作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 识别与肌肉骨骼损伤后再生或纤维化愈合相关的巨噬细胞亚群和基因特征 | 小鼠肌肉骨骼损伤模型,包括再生性和纤维化肌肉损失、再生性指端截肢和异位骨化 | 单细胞转录组学 | 肌肉骨骼损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多种小鼠损伤模型的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9323 | 2025-10-07 |
Construction and validation of renal cell carcinoma tumor cell differentiation-related prognostic classification (RCC-TCDC): an integrated bioinformatic analysis and clinical study
2025-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2025.2490830
PMID:40248945
|
研究论文 | 通过整合生物信息学分析和临床研究,构建并验证了肾细胞癌肿瘤细胞分化相关的预后分类系统 | 首次基于肿瘤细胞分化特征构建肾细胞癌分子分类系统,整合单细胞和bulk RNA-seq数据 | 研究样本量相对有限,需要更大规模的外部验证 | 开发基于肿瘤细胞分化的肾细胞癌分子分类系统,用于精准风险分层和个性化治疗 | 肾细胞癌患者 | 生物信息学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 免疫组织化学染色 | Lasso回归, 多变量预后模型, Cox回归分析 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA-KIRC队列和新华队列370例肾肿瘤患者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
9324 | 2025-10-07 |
Mitigating ambient RNA and doublets effects on single cell transcriptomics analysis in cancer research
2025-Jun-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217693
PMID:40185305
|
研究论文 | 本文探讨了单细胞转录组学分析中环境RNA污染和双细胞效应的缓解方法 | 采用深度学习技术同时解决环境RNA污染和背景噪声问题,提供端到端的数据准备策略 | NA | 提高单细胞转录组数据分析的准确性以支持精准肿瘤学发展 | 肿瘤微环境中的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9325 | 2025-10-07 |
Apigenin inhibits recurrent bladder cancer progression by targeting VEGF-β
2025-Jun-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217676
PMID:40185304
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和分子对接技术,揭示了芹菜素通过靶向VEGF-β抑制复发性膀胱癌进展的机制 | 首次发现VEGF-β在复发性膀胱癌成纤维细胞中显著上调,并证实芹菜素通过靶向VEGF-β抑制肿瘤进展 | 研究主要基于体外实验,缺乏体内动物模型验证 | 探究芹菜素抑制复发性膀胱癌进展的分子机制 | 膀胱癌细胞和成纤维细胞 | 癌症研究 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 分子对接, 体外实验 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9326 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic analysis identifies tissue-specific fibroblasts as the main modulators of myeloid cells in peritoneal metastasis of different origin
2025-Jun-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217678
PMID:40154914
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析发现组织特异性成纤维细胞是不同来源腹膜转移中髓系细胞的主要调节者 | 首次在结直肠癌腹膜转移中发现一种新型成纤维细胞亚群,该亚群具有免疫调节特性并在多种来源的腹膜恶性肿瘤中普遍存在 | 研究样本量有限,需要进一步验证该成纤维细胞亚群的功能机制 | 探究腹膜转移微环境中不同细胞类型间的相互作用机制 | 结直肠癌腹膜转移患者及结直肠癌患者的肿瘤组织和远端正常组织 | 单细胞组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据,组织图像数据 | 结直肠癌腹膜转移和结直肠癌患者的组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9327 | 2025-10-07 |
Exploring OLR1-mediated inflammatory mechanisms in the hematoma microenvironment of acute intracerebral hemorrhage
2025-May-07, Neuroscience
IF:2.9Q2
|
研究论文 | 本研究探讨OLR1在急性脑出血血肿微环境中的炎症机制及其对免疫反应的影响 | 首次系统揭示OLR1在脑出血血肿微环境中的特异性上调及其与单核细胞/巨噬细胞驱动的神经炎症的关联 | 研究主要基于生物信息学分析,需要更多实验验证OLR1的具体作用机制 | 探索OLR1在脑出血血肿微环境中的作用机制及其临床意义 | 脑出血患者的血肿样本、脑组织和外周血样本 | 生物信息学 | 脑出血 | 单细胞RNA测序, 实时定量PCR, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 来自GEO数据库的多个数据集,包含外周血、脑组织和血肿样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
9328 | 2025-10-07 |
Using Single-Cell RNA sequencing with Drosophila, Zebrafish, and mouse models for studying Alzheimer's and Parkinson's disease
2025-May-07, Neuroscience
IF:2.9Q2
|
综述 | 本文通过评述果蝇、斑马鱼和小鼠模型在阿尔茨海默病与帕金森病研究中的应用,重点探讨单细胞RNA测序技术如何推动神经退行性疾病研究进展 | 系统评估三种模式生物与单细胞RNA测序技术结合在神经退行性疾病研究中的协同价值,强调多学科整合方法的重要性 | 作为综述文章未涉及原始实验数据,主要基于现有文献进行批判性讨论 | 推进阿尔茨海默病和帕金森病的基础与转化研究 | 果蝇、斑马鱼和小鼠疾病模型 | 生物信息学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序,高通量测序,计算方法 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9329 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing and functional analysis reveal the role of altered glycosylation levels of hepatic macrophages in liver cirrhosis
2025-May, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-025-02218-y
PMID:39888412
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肝硬变中肝巨噬细胞糖基化水平变化及其在免疫调节中的作用 | 首次在单细胞水平揭示肝硬变中巨噬细胞糖基化水平变化及其对免疫微环境的重塑作用 | NA | 探究肝硬变中糖基化修饰对免疫细胞功能的影响 | 肝硬变和健康对照的肝组织样本 | 单细胞组学 | 肝硬变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 糖基化数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9330 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals a reprogramming of hepatic immune cells and a protective role for B cells in MASH-driven HCC
2025-May-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000668
PMID:40257356
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示MASH驱动肝癌中肝脏免疫细胞的重编程及B细胞的保护作用 | 首次在MASH驱动肝癌模型中系统揭示肝脏免疫细胞的重编程特征,并发现具有抗肿瘤特征的活化B细胞亚群 | 研究基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究代谢功能障碍相关脂肪性肝炎驱动肝癌中的免疫景观和B细胞的抗肿瘤作用 | MASH驱动肝癌小鼠模型中的肝内免疫细胞 | 单细胞测序 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | MASH驱动肝癌小鼠模型的肝内免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9331 | 2025-10-07 |
Maternal COVID-19 infection associated with offspring neurodevelopmental disorders
2025-May, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-024-02822-z
PMID:39521839
|
研究论文 | 本研究探讨了孕期母体COVID-19感染如何通过改变免疫环境导致子代神经发育障碍风险增加 | 首次在单细胞水平揭示母体COVID-19感染通过CD4增殖T细胞影响子代神经细胞发育的机制,并建立了47个基因的风险评分模型 | 未明确说明样本量大小,机制研究仍需进一步验证 | 阐明母体COVID-19感染与子代神经发育障碍之间的因果关系和分子机制 | 孕期感染COVID-19的母体及其子代的免疫和神经细胞 | 生物医学 | 神经发育障碍 | 单细胞转录组测序, 孟德尔随机化分析, 全表型关联研究 | 风险评分模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9332 | 2025-10-07 |
A Single-Cell Atlas Revealed Altered B Cells and Neutrophils Immune Signatures and Inflammatory Responses in SFTSV Infection
2025-May, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70354
PMID:40263930
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示SFTSV感染期间B细胞和中性粒细胞的免疫特征改变及炎症反应 | 首次在单细胞水平系统描绘SFTSV感染的免疫图谱,发现B细胞和中性粒细胞是除单核细胞外的主要病毒感染靶点 | 研究样本仅来自住院患者,未包含轻症或无症状感染者 | 解析SFTSV感染的免疫发病机制和免疫学影响 | SFTSV感染患者的PBMC样本 | 单细胞生物学 | 病毒感染 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 住院SFTSV感染患者的PBMC样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9333 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic data reveal the cellular heterogeneity of glutamine metabolism in gastric premalignant lesions and early gastric cancer
2025-Apr-23, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025061
PMID:40264416
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组数据分析揭示了胃部癌前病变和早期胃癌中谷氨酰胺代谢的细胞异质性 | 首次在单细胞水平系统描绘胃部癌前病变和恶性病变中的谷氨酰胺代谢特征,并鉴定ERO1LB作为关键调控因子 | 样本量相对有限,仅包含癌前病变和早期胃癌病例 | 探究胃部癌前病变和早期胃癌中谷氨酰胺代谢的细胞异质性特征 | 慢性萎缩性胃炎和早期胃癌病变组织 | 单细胞组学 | 胃癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 22511个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9334 | 2025-10-07 |
CXCR4-targeted sensitive magnetic particle imaging for abdominal aortic aneurysm early detection and prognosis evaluation by recognizing total inflammatory cells
2025-Apr-22, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae255
PMID:39658102
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序识别CXCR4作为腹主动脉瘤炎症标志物,开发靶向探针实现早期检测和预后评估 | 首次将CXCR4确定为标记所有AAA相关免疫细胞和炎症血管细胞的趋化因子受体,并开发了CXCR4靶向多模态成像探针 | 研究基于小鼠模型,尚未在人体验证;早期检测能力需进一步临床确认 | 开发腹主动脉瘤早期检测和预后评估的新型成像方法 | 腹主动脉瘤小鼠模型、人类主动脉瘤单细胞测序数据 | 医学影像 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、磁粒子成像、荧光成像 | NA | 单细胞测序数据、影像数据 | 人类主动脉瘤数据集GSE155468和GSE166676、AAA小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9335 | 2025-10-07 |
Proteomic Profiles of Neutrophils from Behcet's Uveitis Patients and their Sex Differences
2025-Apr-22, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02305-5
PMID:40263198
|
研究论文 | 本研究通过蛋白质组学分析揭示了白塞病葡萄膜炎患者中性粒细胞的蛋白质表达谱及其性别差异 | 首次系统揭示白塞病葡萄膜炎患者中性粒细胞的蛋白质组变化特征及其性别特异性功能差异 | 样本量有限,未验证蛋白质组学发现的功能机制 | 探究白塞病葡萄膜炎患者中性粒细胞的蛋白质组特征及其性别差异 | 活动期白塞病葡萄膜炎患者的外周血中性粒细胞 | 蛋白质组学 | 白塞病葡萄膜炎 | 蛋白质组学分析, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据, 单细胞RNA测序数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9336 | 2025-10-07 |
Unraveling the Therapeutic Potential of Scutellarin for Clear Cell Renal Cell Carcinoma: A Comprehensive Molecular Analysis
2025-Apr-22, Current pharmaceutical design
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 通过综合分子分析探讨野黄芩素对透明细胞肾细胞癌的治疗潜力 | 首次通过多数据库整合、单细胞RNA测序和分子动力学模拟系统揭示野黄芩素在ccRCC中的作用靶点和机制 | 需要进一步的临床前和临床研究验证野黄芩素的精确分子机制和治疗优势 | 探索野黄芩素对透明细胞肾细胞癌的治疗作用机制 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)及相关分子靶点 | 生物信息学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序,分子对接,分子动力学模拟,蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | WGCNA,分子对接模型,分子动力学模型 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | TCGA-KIRC和GSE53757数据集,GSE222703单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
9337 | 2025-10-07 |
A Multi-omics approach to identify and validate shared genetic architecture in rheumatoid arthritis, multiple sclerosis, and type 1 diabetes: integrating GWAS, GEO, MSigDB, and scRNA-seq data
2025-Apr-21, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01598-x
PMID:40254686
|
研究论文 | 通过多组学方法鉴定并验证了ROMO1在类风湿关节炎、多发性硬化和1型糖尿病中的共享遗传结构 | 首次发现ROMO1是三种自身免疫疾病的共享遗传因子,并揭示了其在单核细胞中通过ROS通路调控疾病风险的机制 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证 | 探索自身免疫疾病共享遗传结构和机制 | 类风湿关节炎、多发性硬化和1型糖尿病患者样本 | 生物信息学 | 自身免疫疾病 | GWAS, RNA-seq, scRNA-seq, GSEA, LASSO回归, ROC分析, 孟德尔随机化 | LASSO, ROC | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
9338 | 2025-10-07 |
NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S8 expression and functional significance in non-small cell lung cancer
2025-Apr-21, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07638-5
PMID:40258810
|
研究论文 | 本研究探讨了NDUFS8在非小细胞肺癌中的表达及其通过调控线粒体功能促进肿瘤生长的作用机制 | 首次系统揭示NDUFS8通过调控线粒体复合物I活性影响非小细胞肺癌能量代谢和放射抵抗性的新机制 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床样本验证仍需扩展 | 阐明NDUFS8在非小细胞肺癌发生发展中的生物学功能和分子机制 | 非小细胞肺癌细胞系、原代肿瘤细胞和小鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、shRNA沉默、CRISPR/Cas9基因敲除、腺相关病毒递送 | 基因敲除/过表达模型 | 基因表达数据、功能实验数据 | 多种非小细胞肺癌细胞系和裸鼠移植瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9339 | 2025-10-07 |
Deconvolution of cell types and states in spatial multiomics utilizing TACIT
2025-Apr-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58874-4
PMID:40258827
|
研究论文 | 开发了一种名为TACIT的无监督算法,用于空间多组学数据中的细胞类型和状态解卷积 | 提出无需训练数据的无监督细胞注释算法,采用无偏阈值方法区分阳性细胞与背景,专注于相关标记物识别多组学检测中的模糊细胞 | NA | 解决空间生物学中细胞类型和状态识别的挑战 | 细胞类型和状态在空间多组学数据中的识别 | 空间生物学 | 炎症性腺体疾病 | 空间转录组学,空间蛋白质组学,多组学分析 | 无监督算法 | 空间多组学数据 | 5个数据集,5,000,000个细胞,51种细胞类型 | NA | 空间转录组学,空间蛋白质组学,单细胞多组学 | NA | NA |
9340 | 2025-10-07 |
Stereopy: modeling comparative and spatiotemporal cellular heterogeneity via multi-sample spatial transcriptomics
2025-Apr-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58079-9
PMID:40258830
|
研究论文 | 开发了一个名为Stereopy的灵活框架,用于建模和分析多样本空间转录组数据中的比较和时空模式 | 提出了专门针对多样本多模态数据设计的通用容器、范围控制器和集成转换器,能够统一整合多样本数据探索细胞异质性 | NA | 通过多样本空间转录组数据建模比较和时空细胞异质性 | 多样本空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |