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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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9321 | 2025-10-07 |
Mitigating ambient RNA and doublets effects on single cell transcriptomics analysis in cancer research
2025-Jun-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217693
PMID:40185305
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研究论文 | 本文探讨了单细胞转录组学分析中环境RNA污染和双细胞效应的缓解方法 | 采用深度学习技术同时解决环境RNA污染和背景噪声问题,提供端到端的数据准备策略 | NA | 提高单细胞转录组数据分析的准确性以支持精准肿瘤学发展 | 肿瘤微环境中的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9322 | 2025-10-07 |
Apigenin inhibits recurrent bladder cancer progression by targeting VEGF-β
2025-Jun-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217676
PMID:40185304
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和分子对接技术,揭示了芹菜素通过靶向VEGF-β抑制复发性膀胱癌进展的机制 | 首次发现VEGF-β在复发性膀胱癌成纤维细胞中显著上调,并证实芹菜素通过靶向VEGF-β抑制肿瘤进展 | 研究主要基于体外实验,缺乏体内动物模型验证 | 探究芹菜素抑制复发性膀胱癌进展的分子机制 | 膀胱癌细胞和成纤维细胞 | 癌症研究 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 分子对接, 体外实验 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9323 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic analysis identifies tissue-specific fibroblasts as the main modulators of myeloid cells in peritoneal metastasis of different origin
2025-Jun-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217678
PMID:40154914
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析发现组织特异性成纤维细胞是不同来源腹膜转移中髓系细胞的主要调节者 | 首次在结直肠癌腹膜转移中发现一种新型成纤维细胞亚群,该亚群具有免疫调节特性并在多种来源的腹膜恶性肿瘤中普遍存在 | 研究样本量有限,需要进一步验证该成纤维细胞亚群的功能机制 | 探究腹膜转移微环境中不同细胞类型间的相互作用机制 | 结直肠癌腹膜转移患者及结直肠癌患者的肿瘤组织和远端正常组织 | 单细胞组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据,组织图像数据 | 结直肠癌腹膜转移和结直肠癌患者的组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9324 | 2025-10-07 |
Exploring OLR1-mediated inflammatory mechanisms in the hematoma microenvironment of acute intracerebral hemorrhage
2025-May-07, Neuroscience
IF:2.9Q2
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研究论文 | 本研究探讨OLR1在急性脑出血血肿微环境中的炎症机制及其对免疫反应的影响 | 首次系统揭示OLR1在脑出血血肿微环境中的特异性上调及其与单核细胞/巨噬细胞驱动的神经炎症的关联 | 研究主要基于生物信息学分析,需要更多实验验证OLR1的具体作用机制 | 探索OLR1在脑出血血肿微环境中的作用机制及其临床意义 | 脑出血患者的血肿样本、脑组织和外周血样本 | 生物信息学 | 脑出血 | 单细胞RNA测序, 实时定量PCR, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 来自GEO数据库的多个数据集,包含外周血、脑组织和血肿样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
9325 | 2025-10-07 |
Using Single-Cell RNA sequencing with Drosophila, Zebrafish, and mouse models for studying Alzheimer's and Parkinson's disease
2025-May-07, Neuroscience
IF:2.9Q2
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综述 | 本文通过评述果蝇、斑马鱼和小鼠模型在阿尔茨海默病与帕金森病研究中的应用,重点探讨单细胞RNA测序技术如何推动神经退行性疾病研究进展 | 系统评估三种模式生物与单细胞RNA测序技术结合在神经退行性疾病研究中的协同价值,强调多学科整合方法的重要性 | 作为综述文章未涉及原始实验数据,主要基于现有文献进行批判性讨论 | 推进阿尔茨海默病和帕金森病的基础与转化研究 | 果蝇、斑马鱼和小鼠疾病模型 | 生物信息学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序,高通量测序,计算方法 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9326 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing and functional analysis reveal the role of altered glycosylation levels of hepatic macrophages in liver cirrhosis
2025-May, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-025-02218-y
PMID:39888412
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肝硬变中肝巨噬细胞糖基化水平变化及其在免疫调节中的作用 | 首次在单细胞水平揭示肝硬变中巨噬细胞糖基化水平变化及其对免疫微环境的重塑作用 | NA | 探究肝硬变中糖基化修饰对免疫细胞功能的影响 | 肝硬变和健康对照的肝组织样本 | 单细胞组学 | 肝硬变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 糖基化数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9327 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals a reprogramming of hepatic immune cells and a protective role for B cells in MASH-driven HCC
2025-May-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000668
PMID:40257356
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示MASH驱动肝癌中肝脏免疫细胞的重编程及B细胞的保护作用 | 首次在MASH驱动肝癌模型中系统揭示肝脏免疫细胞的重编程特征,并发现具有抗肿瘤特征的活化B细胞亚群 | 研究基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究代谢功能障碍相关脂肪性肝炎驱动肝癌中的免疫景观和B细胞的抗肿瘤作用 | MASH驱动肝癌小鼠模型中的肝内免疫细胞 | 单细胞测序 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | MASH驱动肝癌小鼠模型的肝内免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9328 | 2025-10-07 |
Maternal COVID-19 infection associated with offspring neurodevelopmental disorders
2025-May, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-024-02822-z
PMID:39521839
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研究论文 | 本研究探讨了孕期母体COVID-19感染如何通过改变免疫环境导致子代神经发育障碍风险增加 | 首次在单细胞水平揭示母体COVID-19感染通过CD4增殖T细胞影响子代神经细胞发育的机制,并建立了47个基因的风险评分模型 | 未明确说明样本量大小,机制研究仍需进一步验证 | 阐明母体COVID-19感染与子代神经发育障碍之间的因果关系和分子机制 | 孕期感染COVID-19的母体及其子代的免疫和神经细胞 | 生物医学 | 神经发育障碍 | 单细胞转录组测序, 孟德尔随机化分析, 全表型关联研究 | 风险评分模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9329 | 2025-10-07 |
A Single-Cell Atlas Revealed Altered B Cells and Neutrophils Immune Signatures and Inflammatory Responses in SFTSV Infection
2025-May, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70354
PMID:40263930
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示SFTSV感染期间B细胞和中性粒细胞的免疫特征改变及炎症反应 | 首次在单细胞水平系统描绘SFTSV感染的免疫图谱,发现B细胞和中性粒细胞是除单核细胞外的主要病毒感染靶点 | 研究样本仅来自住院患者,未包含轻症或无症状感染者 | 解析SFTSV感染的免疫发病机制和免疫学影响 | SFTSV感染患者的PBMC样本 | 单细胞生物学 | 病毒感染 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 住院SFTSV感染患者的PBMC样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9330 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic data reveal the cellular heterogeneity of glutamine metabolism in gastric premalignant lesions and early gastric cancer
2025-Apr-23, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025061
PMID:40264416
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组数据分析揭示了胃部癌前病变和早期胃癌中谷氨酰胺代谢的细胞异质性 | 首次在单细胞水平系统描绘胃部癌前病变和恶性病变中的谷氨酰胺代谢特征,并鉴定ERO1LB作为关键调控因子 | 样本量相对有限,仅包含癌前病变和早期胃癌病例 | 探究胃部癌前病变和早期胃癌中谷氨酰胺代谢的细胞异质性特征 | 慢性萎缩性胃炎和早期胃癌病变组织 | 单细胞组学 | 胃癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 22511个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9331 | 2025-10-07 |
CXCR4-targeted sensitive magnetic particle imaging for abdominal aortic aneurysm early detection and prognosis evaluation by recognizing total inflammatory cells
2025-Apr-22, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae255
PMID:39658102
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序识别CXCR4作为腹主动脉瘤炎症标志物,开发靶向探针实现早期检测和预后评估 | 首次将CXCR4确定为标记所有AAA相关免疫细胞和炎症血管细胞的趋化因子受体,并开发了CXCR4靶向多模态成像探针 | 研究基于小鼠模型,尚未在人体验证;早期检测能力需进一步临床确认 | 开发腹主动脉瘤早期检测和预后评估的新型成像方法 | 腹主动脉瘤小鼠模型、人类主动脉瘤单细胞测序数据 | 医学影像 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、磁粒子成像、荧光成像 | NA | 单细胞测序数据、影像数据 | 人类主动脉瘤数据集GSE155468和GSE166676、AAA小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9332 | 2025-10-07 |
Proteomic Profiles of Neutrophils from Behcet's Uveitis Patients and their Sex Differences
2025-Apr-22, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02305-5
PMID:40263198
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学分析揭示了白塞病葡萄膜炎患者中性粒细胞的蛋白质表达谱及其性别差异 | 首次系统揭示白塞病葡萄膜炎患者中性粒细胞的蛋白质组变化特征及其性别特异性功能差异 | 样本量有限,未验证蛋白质组学发现的功能机制 | 探究白塞病葡萄膜炎患者中性粒细胞的蛋白质组特征及其性别差异 | 活动期白塞病葡萄膜炎患者的外周血中性粒细胞 | 蛋白质组学 | 白塞病葡萄膜炎 | 蛋白质组学分析, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据, 单细胞RNA测序数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9333 | 2025-10-07 |
Unraveling the Therapeutic Potential of Scutellarin for Clear Cell Renal Cell Carcinoma: A Comprehensive Molecular Analysis
2025-Apr-22, Current pharmaceutical design
IF:2.6Q2
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研究论文 | 通过综合分子分析探讨野黄芩素对透明细胞肾细胞癌的治疗潜力 | 首次通过多数据库整合、单细胞RNA测序和分子动力学模拟系统揭示野黄芩素在ccRCC中的作用靶点和机制 | 需要进一步的临床前和临床研究验证野黄芩素的精确分子机制和治疗优势 | 探索野黄芩素对透明细胞肾细胞癌的治疗作用机制 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)及相关分子靶点 | 生物信息学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序,分子对接,分子动力学模拟,蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | WGCNA,分子对接模型,分子动力学模型 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | TCGA-KIRC和GSE53757数据集,GSE222703单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
9334 | 2025-10-07 |
A Multi-omics approach to identify and validate shared genetic architecture in rheumatoid arthritis, multiple sclerosis, and type 1 diabetes: integrating GWAS, GEO, MSigDB, and scRNA-seq data
2025-Apr-21, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01598-x
PMID:40254686
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研究论文 | 通过多组学方法鉴定并验证了ROMO1在类风湿关节炎、多发性硬化和1型糖尿病中的共享遗传结构 | 首次发现ROMO1是三种自身免疫疾病的共享遗传因子,并揭示了其在单核细胞中通过ROS通路调控疾病风险的机制 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证 | 探索自身免疫疾病共享遗传结构和机制 | 类风湿关节炎、多发性硬化和1型糖尿病患者样本 | 生物信息学 | 自身免疫疾病 | GWAS, RNA-seq, scRNA-seq, GSEA, LASSO回归, ROC分析, 孟德尔随机化 | LASSO, ROC | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
9335 | 2025-10-07 |
NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S8 expression and functional significance in non-small cell lung cancer
2025-Apr-21, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07638-5
PMID:40258810
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研究论文 | 本研究探讨了NDUFS8在非小细胞肺癌中的表达及其通过调控线粒体功能促进肿瘤生长的作用机制 | 首次系统揭示NDUFS8通过调控线粒体复合物I活性影响非小细胞肺癌能量代谢和放射抵抗性的新机制 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床样本验证仍需扩展 | 阐明NDUFS8在非小细胞肺癌发生发展中的生物学功能和分子机制 | 非小细胞肺癌细胞系、原代肿瘤细胞和小鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、shRNA沉默、CRISPR/Cas9基因敲除、腺相关病毒递送 | 基因敲除/过表达模型 | 基因表达数据、功能实验数据 | 多种非小细胞肺癌细胞系和裸鼠移植瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9336 | 2025-10-07 |
Deconvolution of cell types and states in spatial multiomics utilizing TACIT
2025-Apr-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58874-4
PMID:40258827
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研究论文 | 开发了一种名为TACIT的无监督算法,用于空间多组学数据中的细胞类型和状态解卷积 | 提出无需训练数据的无监督细胞注释算法,采用无偏阈值方法区分阳性细胞与背景,专注于相关标记物识别多组学检测中的模糊细胞 | NA | 解决空间生物学中细胞类型和状态识别的挑战 | 细胞类型和状态在空间多组学数据中的识别 | 空间生物学 | 炎症性腺体疾病 | 空间转录组学,空间蛋白质组学,多组学分析 | 无监督算法 | 空间多组学数据 | 5个数据集,5,000,000个细胞,51种细胞类型 | NA | 空间转录组学,空间蛋白质组学,单细胞多组学 | NA | NA |
9337 | 2025-10-07 |
Stereopy: modeling comparative and spatiotemporal cellular heterogeneity via multi-sample spatial transcriptomics
2025-Apr-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58079-9
PMID:40258830
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研究论文 | 开发了一个名为Stereopy的灵活框架,用于建模和分析多样本空间转录组数据中的比较和时空模式 | 提出了专门针对多样本多模态数据设计的通用容器、范围控制器和集成转换器,能够统一整合多样本数据探索细胞异质性 | NA | 通过多样本空间转录组数据建模比较和时空细胞异质性 | 多样本空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
9338 | 2025-10-07 |
CFTR acts as a potential therapeutic target for attention deficit-hyperactivity disorder
2025-Apr-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-98900-5
PMID:40258939
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研究论文 | 本研究通过遗传分析、斑马鱼模型和分子实验揭示了CFTR基因在注意力缺陷多动障碍发病机制中的潜在作用 | 首次发现CFTR基因突变与ADHD的共分离现象,并证实CFTR调节剂可改善ADHD样行为 | 研究样本量有限(两个近亲家庭),主要依赖斑马鱼模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探讨CFTR基因在注意力缺陷多动障碍发病机制中的作用 | CFTR基因突变携带者、斑马鱼模型 | 神经科学 | 注意力缺陷多动障碍 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 蛋白质组学分析 | 斑马鱼基因敲除模型 | 基因序列数据, 行为数据, 表达谱数据 | 两个近亲家庭的六名成员及斑马鱼模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
9339 | 2025-10-07 |
Unravelling NK cell subset dynamics and specific gene signatures post-ibrutinib therapy in chronic lymphocytic leukaemia via single-cell transcriptomics
2025-Apr-21, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14166-0
PMID:40259256
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析揭示慢性淋巴细胞白血病患者接受伊布替尼治疗后NK细胞亚群动态变化及其关键基因特征 | 首次在CLL患者中鉴定出高度细胞毒性的CLL_NK亚群,并构建了基于核心基因的细胞亚群特异性新指数(CNI)用于预测免疫治疗反应 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现 | 研究伊布替尼治疗后CLL患者NK细胞亚群动态变化及其基因特征 | 慢性淋巴细胞白血病患者的NK细胞 | 单细胞转录组学 | 慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞转录组测序,伪时序分析,孟德尔随机化分析,共定位分析 | 多种算法组合 | 单细胞RNA测序数据 | 包括MBL、新诊断CLL、伊布替尼治疗后完全缓解/部分缓解患者及Richter综合征患者的外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9340 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals cellular and molecular heterogeneity in extensive-stage small cell lung cancer with different chemotherapy responses
2025-Apr-21, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03785-z
PMID:40259334
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析广泛期小细胞肺癌化疗反应差异的细胞和分子异质性 | 首次在初治ES-SCLC患者中系统揭示不同化疗反应组的细胞生态系统差异,发现免疫相关基因表达与化疗耐药相关 | 样本量较小(仅9例),PD_PE组仅1例样本,需要更大规模研究验证 | 探究广泛期小细胞肺癌化疗反应差异的细胞和分子机制 | 9例初治广泛期小细胞肺癌患者样本 | 单细胞测序 | 小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 9例初治ES-SCLC样本(1例PD_PE,2例PD_TU,6例PR_TU) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |