单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 9301 - 9320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9301 | 2025-10-07 |
Immune-responsive gene-1: The mitochondrial Key to Th17 Cell Pathogenicity in CNS Autoimmunity
2025-Feb-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.24.573264
PMID:38234838
|
研究论文 | 本研究揭示了免疫应答基因1在调节中枢神经系统自身免疫疾病中致病性Th17细胞的关键作用 | 首次发现免疫应答基因1通过NLRP3/IL-1β轴调控巨噬细胞MHC II类分子表达，从而影响致病性Th17细胞极化 | 研究主要基于动物模型EAE，在人类多发性硬化症中的直接验证仍需进一步研究 | 探究免疫应答基因1在中枢神经系统自身免疫疾病中对Th17细胞致病性的调控机制 | 实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)小鼠模型、原代脑胶质细胞、骨髓嵌合体 | 免疫学 | 多发性硬化症 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 适应性转移实验 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9302 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic sequencing analysis of mechanistic insights into the IFN-γ signaling pathway in different tumor cells
2025-Feb, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-024-03574-6
PMID:39090422
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析IFN-γ信号通路在不同肿瘤微环境中的机制作用 | 首次在单细胞水平系统揭示IFN-γ通路在肿瘤细胞中的双重功能及其调控网络 | 基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证 | 探究IFN-γ信号通路在不同肿瘤微环境中的作用机制及其与预后的关系 | 多种肿瘤类型的肿瘤细胞、基质细胞和免疫细胞 | 生物信息学 | 泛癌分析 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 单变量Cox回归模型 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的多肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9303 | 2025-10-07 |
Arming AAV9 with a Single-Chain Fragment Variable Antibody Against PD-1 for Systemic Glioblastoma Therapy
2025-Feb, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-024-04406-y
PMID:39138760
|
研究论文 | 本研究开发了一种利用AAV9病毒系统递送抗PD-1单链抗体治疗胶质母细胞瘤的靶向免疫疗法 | 首次将AAV9病毒载体与抗PD-1单链抗体结合，实现系统性给药后在肿瘤微环境局部表达免疫检查点抑制剂 | 研究仅在免疫健全的小鼠模型中进行，尚未进行临床验证 | 开发针对胶质母细胞瘤的新型靶向免疫治疗策略 | 胶质母细胞瘤肿瘤微环境中的T细胞 | 癌症免疫治疗 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 免疫健全的胶质母细胞瘤小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9304 | 2025-10-07 |
LIM domain only 7: a novel driver of immune evasion through regulatory T cell differentiation and chemotaxis in pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-Feb, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-024-01358-7
PMID:39143228
|
研究论文 | 本研究发现了LMO7作为胰腺导管腺癌免疫逃逸的新驱动因子，通过促进调节性T细胞分化和趋化作用实现免疫抑制 | 首次鉴定LMO7作为PDAC免疫逃逸的关键驱动因子，揭示了LMO7-Foxp1-TGF-β/CCL5轴的新机制 | NA | 揭示胰腺导管腺癌免疫微环境异质性及免疫逃逸的分子机制 | 胰腺导管腺癌细胞、调节性T细胞、CD8 T细胞、自然杀伤细胞 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、空间蛋白质组学、体外实验、体内实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 9305 | 2025-10-07 |
Progress in toxicogenomics to protect human health
2025-Feb, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-024-00767-1
PMID:39223311
|
综述 | 本文综述了毒理基因组学在利用转录组学等分子特征评估环境与药物暴露毒性方面的研究进展 | 重点介绍了高通量剂量反应建模、单细胞转录组学和多组学等新兴方法在毒理学机制研究中的创新应用 | NA | 推动毒理基因组学在毒理学测试和风险评估中的应用以保护人类健康 | 环境与药物暴露的毒理学效应 | 生物信息学 | NA | 转录组学、单细胞转录组学、多组学分析 | 网络推断分析、模式匹配方法、人工智能 | 分子特征数据（转录本、蛋白质、代谢物、表观基因组修饰） | NA | NA | 单细胞RNA-seq、多组学分析 | NA | NA |
| 9306 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing delineates T-cell clonality and pathogenesis of the parapsoriasis disease group
2025-Feb, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.09.004
PMID:39278361
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术解析了副银屑病疾病谱中T细胞克隆性及其发病机制 | 首次在副银屑病病变中发现NPY+先天淋巴样细胞群，并提出'多克隆性斑块型副银屑病'作为独立疾病实体 | 样本量有限（大斑块病变8例，小斑块病变7例），需要更大规模研究验证 | 表征副银屑病疾病谱的细胞和分子特征 | 副银屑病至早期蕈样肉芽肿谱系患者的皮肤活检组织 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 15例副银屑病病变（8例大斑块，7例小斑块），并与特应性皮炎、银屑病和健康对照皮肤比较 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9307 | 2025-10-07 |
Evidence of Alveolar Macrophage Metabolic Shift Following Stereotactic Body Radiation Therapy -Induced Lung Fibrosis in Mice
2025-Feb-01, International journal of radiation oncology, biology, physics
DOI:10.1016/j.ijrobp.2024.09.018
PMID:39278419
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型探究立体定向放射治疗后肺泡巨噬细胞代谢变化与放射性肺纤维化的关系 | 首次发现肺泡巨噬细胞在放射性肺损伤中经历从脂肪酸代谢向胆固醇生物合成的代谢转变 | 研究局限于小鼠模型，临床转化意义需进一步验证 | 阐明巨噬细胞在放射性肺损伤发展中的作用机制 | 野生型和CCR2 KO小鼠的肺组织 | 病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，组织学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞数据，组织图像 | 小鼠肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9308 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA Sequencing Analysis Reveals Cancer-associated Fibroblast Signature for Prediction of Clinical Outcomes and Immunotherapy in Gastric Cancer
2025 Feb-Mar 01, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997)
DOI:10.1097/CJI.0000000000000539
PMID:39206772
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胃癌中的癌症相关成纤维细胞，建立CAF评分系统用于预测患者预后和免疫治疗反应 | 首次基于单细胞RNA测序建立癌症相关成纤维细胞评分系统，并验证其在预测胃癌免疫治疗反应和化疗疗效方面的价值 | NA | 开发能够预测胃癌患者免疫治疗疗效和预后的生物标志物 | 胃癌患者及其肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9309 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing comparison of CD4+, CD8+ and T-cell receptor γδ+ cutaneous T-cell lymphomas reveals subset-specific molecular phenotypes
2025-Jan-24, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljae313
PMID:39133553
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较CD4+、CD8+和TCR-γδ+皮肤T细胞淋巴瘤的分子表型差异 | 首次在单细胞水平系统比较不同T细胞表型皮肤淋巴瘤的分子特征，揭示了亚型特异性表型差异 | 样本量有限（18例活检），仅分析了皮肤组织样本 | 对不同T细胞表型的皮肤T细胞淋巴瘤进行全面的分子特征表征 | 皮肤T细胞淋巴瘤患者的皮肤活检组织 | 单细胞组学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18例皮肤活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9310 | 2025-10-07 |
Microbiota-induced S100A11-RAGE axis underlies immune evasion in right-sided colon adenomas and is a therapeutic target to boost anti-PD1 efficacy
2025-Jan-17, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332193
PMID:39251326
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组分析揭示了右侧结肠腺瘤中杯状细胞功能障碍导致细菌入侵并激活S100A11-RAGE轴促进免疫逃逸的机制 | 首次发现右侧结肠腺瘤中杯状细胞功能障碍导致细菌易位，并鉴定出S100A11+上皮细胞群体及其通过RAGE受体介导的免疫抑制机制 | NA | 阐明左右侧结肠腺瘤的差异特征及其在结肠癌免疫治疗中的意义 | 左右侧结肠腺瘤、临床标本、小鼠模型 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 9311 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA-Seq Analysis of Hearts in Patients with Fetal Tetralogy of Fallot
2025, Cardiology
IF:1.9Q3
DOI:10.1159/000540406
PMID:39097963
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析法洛四联症胎儿心脏与正常胎儿心脏的细胞特征差异 | 首次在胎儿法洛四联症中应用单细胞RNA测序技术进行细胞水平研究 | 样本量较小（仅一个患病样本和一个正常样本） | 探索法洛四联症的细胞学特征和疾病标志物差异基因 | 法洛四联症胎儿心脏和正常胎儿心脏的右心室组织 | 单细胞组学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | Seurat, Cell Ranger | 单细胞基因表达数据 | 2个样本（1个TOF患者，1个健康对照），共25,203个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | Cell Ranger分析流程 |
| 9312 | 2025-10-07 |
Identification of a Novel Activated NK-Associated Gene Score Associated with Diagnosis and Biological Therapy Response in Ulcerative Colitis
2025, Digestion
IF:3.0Q2
DOI:10.1159/000540939
PMID:39182484
|
研究论文 | 本研究建立了一种新型活化NK相关基因评分(ANAG评分)，用于溃疡性结肠炎的精确诊断和生物治疗疗效预测 | 首次开发了基于四个关键基因(SELP, TIMP1, MMP7, ABCG2)的活化NK相关基因评分系统，能够准确诊断溃疡性结肠炎并预测生物治疗反应 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步临床验证；样本量未明确说明 | 探讨活化NK相关基因评分在溃疡性结肠炎中的诊断价值及其对生物治疗反应的预测价值 | 溃疡性结肠炎患者组织和细胞数据 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, RT-qPCR, 免疫荧光 | LASSO回归, PPI分析, ssGSEA, CIBERSORT | 基因表达数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 9313 | 2025-10-07 |
Metabolic reprogramming by mutant GNAS creates an actionable dependency in intraductal papillary mucinous neoplasms of the pancreas
2024-Dec-10, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332412
PMID:39277181
|
研究论文 | 本研究揭示了胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤中KRAS和GNAS突变共同表达导致代谢重编程的机制 | 首次证明GNAS R201C突变与KRAS G12D协同作用诱导胃幽门型化生基因特征和糖酵解依赖性 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系，需要进一步在人类样本中验证 | 探究GNAS R201C突变对胰腺肿瘤表型、转录组特征和基因组依赖性的影响 | 胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤(IPMNs)和肿瘤来源细胞系 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | CRISPR/Cas9筛选, 实时代谢分析, 磷酸化分析 | 小鼠遗传模型 | 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | p48Cre; KrasLSL-G12D; Rosa26LSL-rtTA; Tg (TetO-GnasR201C)小鼠模型和肿瘤来源细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 9314 | 2025-04-25 |
Transcriptional profiles of murine oligodendrocyte precursor cells across the lifespan
2024-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.27.620502
PMID:39554158
|
research paper | 该研究通过单细胞RNA测序技术，探究了小鼠少突胶质前体细胞（OPCs）在整个生命周期中的转录组变化 | 创建了一种新型转基因小鼠系，用于高分辨率解析OPCs从静止到增殖和分化的关键转变过程中的转录变化 | 研究仅针对小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究衰老如何影响少突胶质前体细胞（OPCs）的转录组特征及其功能 | 小鼠少突胶质前体细胞（OPCs） | 生物医学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠模型 | RNA-seq数据 | 30至720天龄的小鼠OPCs | NA | NA | NA | NA |
| 9315 | 2025-10-07 |
SUB1 promotes colorectal cancer metastasis by activating NF-κB signaling via UBR5-mediated ubiquitination of UBXN1
2024-06, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-023-2429-5
PMID:38240906
|
研究论文 | 本研究揭示转录共激活因子SUB1通过UBR5介导的UBXN1泛素化激活NF-κB信号通路，从而促进结直肠癌转移的分子机制 | 首次发现SUB1通过调控UBR5介导的Lys11连接多聚泛素化降解NF-κB负调控因子UBXN1，激活NF-κB信号通路驱动结直肠癌转移 | NA | 探究SUB1在结直肠癌转移中的作用机制 | 结直肠癌细胞 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 9316 | 2025-10-07 |
IL-12/IL23 blockade reveals patterns of asynchronous inflammation in pyoderma gangrenosum
2024-Apr-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.26.591387
PMID:38746177
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析揭示坏疽性脓皮病的炎症特征及IL-12/IL-23阻断治疗的分子机制 | 首次发现坏疽性脓皮病皮损中存在B细胞大量浸润和三级淋巴结构形成，并揭示IL-12/IL-23阻断治疗对不同炎症通路的差异化影响 | 研究样本量较小（仅2名患者），需要更大规模研究验证发现 | 阐明坏疽性脓皮病的免疫失调机制及IL-12/IL-23阻断治疗的分子作用 | 坏疽性脓皮病患者皮损组织 | 空间转录组学 | 坏疽性脓皮病 | 空间转录组学，比较计算分析 | NA | 空间转录组数据 | 2名患者的治疗前后皮损活检样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9317 | 2025-10-07 |
Single cell spatial transcriptomics reveals distinct patterns of dysregulation in non-neuronal and neuronal cells induced by the Trem2R47H Alzheimer's risk gene mutation
2023-Dec-07, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3656139/v1
PMID:38106071
|
研究论文 | 通过单细胞空间转录组学分析Trem2R47H阿尔茨海默病风险基因突变对非神经元和神经元细胞的差异性调控模式 | 首次利用MERFISH空间转录组技术系统揭示Trem2R47H突变在不同脑细胞类型中的空间特异性转录调控机制 | 研究仅限于小鼠模型，样本量相对有限（15个脑切片） | 探究Trem2R47H突变对阿尔茨海默病相关转录组失调的细胞类型特异性影响 | 野生型、Trem2R47H突变型、5xFAD和Trem2R47H;5xFAD复合基因型小鼠脑组织 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | MERFISH空间转录组学 | 自定义分析流程 | 空间转录组数据、神经病理学数据 | 15个小鼠脑切片 | NA | 空间转录组学 | MERFISH | NA |
| 9318 | 2025-10-07 |
The Histone Methyltransferase SETDB2 Modulates Tissue Inhibitors of Metalloproteinase-Matrix Metalloproteinase Activity During Abdominal Aortic Aneurysm Development
2023-09-01, Annals of surgery
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/SLA.0000000000005963
PMID:37325923
|
研究论文 | 本研究揭示组蛋白甲基转移酶SETDB2通过调控TIMP-MMP活性在腹主动脉瘤发展中的关键作用 | 首次发现SETDB2通过H3K9me3修饰抑制TIMP1-3基因表达，从而调控巨噬细胞介导的蛋白酶活性 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需进一步扩展 | 探究巨噬细胞特异性表观遗传酶在腹主动脉瘤发展中的作用机制 | 人类主动脉组织样本和髓系特异性SETDB2缺陷小鼠模型 | 表观遗传学 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序，基因敲除，表观遗传分析 | NA | 基因表达数据，组织学数据 | 人类AAA组织和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9319 | 2025-10-07 |
Macrophage-mediated PDGF Activation Correlates With Regenerative Outcomes Following Musculoskeletal Trauma
2023-08-01, Annals of surgery
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/SLA.0000000000005704
PMID:36111847
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析巨噬细胞亚群与肌肉骨骼损伤后再生或纤维化愈合的关系 | 首次在多种肌肉骨骼损伤模型中系统鉴定出与再生和纤维化愈合相关的巨噬细胞亚群，并发现血小板衍生生长因子信号在再生条件下的增强作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 识别与肌肉骨骼损伤后再生或纤维化愈合相关的巨噬细胞亚群和基因特征 | 小鼠肌肉骨骼损伤模型，包括再生性和纤维化肌肉损失、再生性指端截肢和异位骨化 | 单细胞转录组学 | 肌肉骨骼损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多种小鼠损伤模型的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9320 | 2025-10-07 |
Construction and validation of renal cell carcinoma tumor cell differentiation-related prognostic classification (RCC-TCDC): an integrated bioinformatic analysis and clinical study
2025-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2025.2490830
PMID:40248945
|
研究论文 | 通过整合生物信息学分析和临床研究，构建并验证了肾细胞癌肿瘤细胞分化相关的预后分类系统 | 首次基于肿瘤细胞分化特征构建肾细胞癌分子分类系统，整合单细胞和bulk RNA-seq数据 | 研究样本量相对有限，需要更大规模的外部验证 | 开发基于肿瘤细胞分化的肾细胞癌分子分类系统，用于精准风险分层和个性化治疗 | 肾细胞癌患者 | 生物信息学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 免疫组织化学染色 | Lasso回归, 多变量预后模型, Cox回归分析 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA-KIRC队列和新华队列370例肾肿瘤患者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |