单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27897 篇文献，本页显示第 9301 - 9320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9301 | 2024-09-11 |
A polymeric nanoplatform enhances the cGAS-STING pathway in macrophages to potentiate phagocytosis for cancer immunotherapy
2024-Sep, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2024.07.039
PMID:39038546
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研究论文 | 设计了一种甘露糖修饰的pH响应性纳米平台，通过共封装R848和cGAMP，促进肿瘤相关巨噬细胞的极化和SIRPα表达的下调，从而增强抗肿瘤免疫治疗 | 首次设计了一种甘露糖修饰的pH响应性纳米平台，通过共封装R848和cGAMP，促进肿瘤相关巨噬细胞的极化和SIRPα表达的下调，从而增强抗肿瘤免疫治疗 | NA | 研究通过激活cGAS-STING通路来增强巨噬细胞的吞噬作用，从而提高癌症免疫治疗的效果 | 肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）和其表达的信号调节蛋白α（SIRPα） | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 9302 | 2024-09-11 |
Comprehensive review on single-cell RNA sequencing: A new frontier in Alzheimer's disease research
2024-Sep, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2024.102454
PMID:39142391
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在阿尔茨海默病研究中的应用 | 介绍了单细胞RNA测序技术在揭示阿尔茨海默病细胞异质性方面的创新应用 | 讨论了单细胞RNA测序技术在研究阿尔茨海默病中的挑战 | 探讨单细胞RNA测序技术在阿尔茨海默病研究中的贡献 | 阿尔茨海默病的细胞多样性、疾病进展和潜在治疗靶点 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 9303 | 2024-09-11 |
Single-cell RNA sequencing reveals a high-resolution cell atlas of petals in Prunus mume at different flowering development stages
2024-Sep, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhae189
PMID:39247887
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术构建了梅花花瓣在不同开花发育阶段的细胞图谱，并揭示了花香合成的主要细胞类型 | 首次构建了梅花花瓣的单细胞图谱，揭示了花香合成的主要细胞类型和相关基因表达 | 研究仅限于特定的梅花品种和两个开花阶段，可能无法完全代表所有梅花品种和开花阶段的情况 | 探究梅花花瓣在不同开花发育阶段的细胞类型及其在花香合成中的作用 | 梅花花瓣在花蕾期和盛开期的细胞类型及其基因表达 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个开花阶段的梅花花瓣样本，每个阶段各一个 |
| 9304 | 2024-09-11 |
Leveraging single-cell RNA-seq for uncovering naïve B cells associated with better prognosis of hepatocellular carcinoma
2024-Sep, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.563
PMID:39252823
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术揭示与肝细胞癌预后改善相关的幼稚B细胞 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了肝细胞癌中幼稚B细胞的特定亚群及其与预后的关联 | 研究主要基于小鼠模型和公共数据集，尚未在人类临床样本中验证 | 探讨肝细胞癌的免疫微环境及其在肿瘤发生中的动态变化 | 肝细胞癌中的免疫细胞及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 小鼠肝细胞癌模型和人类肝细胞癌样本 |
| 9305 | 2024-09-11 |
STIE: Single-cell level deconvolution, convolution, and clustering in in situ capturing-based spatial transcriptomics
2024-Aug-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51728-5
PMID:39214995
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STIE的期望最大化算法，用于基于原位捕获的空间转录组学中单细胞水平的解卷积、卷积和聚类 | STIE算法能够将空间转录组与匹配的组织学图像对齐，并从约70%的间隙区域恢复缺失的细胞，从而实现真正的单细胞水平和全切片尺度的解卷积、卷积和聚类 | NA | 解决基于原位捕获的空间转录组学中无法精确捕获随机分布的单细胞的问题 | 单细胞水平的转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 期望最大化算法 | NA | 图像 | NA |
| 9306 | 2024-09-11 |
Potential regulation and prognostic model of colorectal cancer with extracellular matrix genes
2024-Aug-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e36164
PMID:39247375
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研究论文 | 研究了结直肠癌中细胞外基质基因的潜在调控作用及其在预后模型中的应用 | 首次系统分析了结直肠癌中细胞外基质成分的表达模式及其与患者生存的关系，并开发了一个基于细胞外基质基因的预后模型 | 研究主要基于TCGA-CRC队列数据，样本量有限，可能影响模型的泛化能力 | 探讨结直肠癌中细胞外基质基因的调控机制及其在预后预测中的潜力 | 结直肠癌中的细胞外基质成分及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理 | 结直肠癌 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 结直肠癌肿瘤及配对正常组织样本 |
| 9307 | 2024-09-11 |
Machine Learning Uncovers Vascular Endothelial Cell Identity Genes by Expression Regulation Features in Single Cells
2024-Aug-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.27.609808
PMID:39253493
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SCIG的机器学习方法，用于通过单细胞RNA-seq数据中的表达调控特征揭示血管内皮细胞的身份基因 | SCIG方法利用基因序列特征和基因表达信息，无需与其他细胞进行比较即可揭示细胞身份基因，并在网络分析中超越了表达值，揭示了调控细胞身份的主转录因子 | NA | 揭示细胞身份基因，理解细胞分化、发育及细胞身份失调相关疾病 | 血管内皮细胞的身份基因 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 机器学习方法 | 基因表达数据 | NA |
| 9308 | 2024-09-11 |
Targeting tumor-associated macrophage-derived CD74 improves efficacy of neoadjuvant chemotherapy in combination with PD-1 blockade for cervical cancer
2024-Aug-06, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009024
PMID:39107132
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研究论文 | 研究探讨了靶向肿瘤相关巨噬细胞衍生的CD74在宫颈癌新辅助化疗与PD-1阻断联合治疗中的作用 | 首次揭示了CD74在宫颈癌新辅助化疗与PD-1阻断联合治疗中的关键作用，并验证了CD74阻断可以增强治疗效果 | 研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在临床试验中验证 | 探讨新辅助化疗与PD-1阻断联合治疗对宫颈癌微环境的影响，并寻找增强治疗效果的新靶点 | 宫颈癌细胞、巨噬细胞、T细胞等 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 46,950个细胞，来自9个宫颈癌组织样本 |
| 9309 | 2024-09-11 |
BACH2 regulates diversification of regulatory and proinflammatory chromatin states in TH17 cells
2024-Aug, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01901-1
PMID:39009838
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研究论文 | 研究探讨了BACH2在TH17细胞中调控调节性和促炎染色质状态多样化的机制 | 首次揭示了BACH2在TH17细胞中促进免疫调节性npT17程序并抑制促炎性T1样程序的作用 | NA | 研究TH17细胞异质性的调控途径，并探讨BACH2在其中的作用 | TH17细胞的染色质景观及其在体内外的差异 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq）和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 染色质可及性和RNA表达数据 | NA |
| 9310 | 2024-09-11 |
Bulk and single-cell transcriptome profiling identify potential cellular targets of the long noncoding RNA Gas5 in renal fibrosis
2024-08, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2024.167206
PMID:38718848
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研究论文 | 研究探讨了长链非编码RNA Gas5在肾纤维化中的表达谱及其作为潜在生物标志物的作用 | 揭示了Gas5缺失加剧肾纤维化的机制，并发现了Gas5调控免疫细胞分化和PPAR信号通路关键基因转录的新见解 | NA | 研究Gas5在慢性肾病进展中的作用及其作为生物标志物的潜力 | Gas5在肾纤维化中的表达及其对肾损伤和细胞外基质沉积的影响 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 小鼠模型 |
| 9311 | 2024-09-11 |
Targeting JUNB to modulate M2 macrophage polarization in preeclampsia
2024-08, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2024.167194
PMID:38663490
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了子痫前期中胎盘的细胞景观，并发现转录因子JUNB在调节M2巨噬细胞极化中的关键作用 | 首次揭示了JUNB在子痫前期中调节巨噬细胞极化的机制，并提出了通过靶向JUNB来调节巨噬细胞极化以治疗子痫前期的潜在疗法 | NA | 探讨子痫前期的细胞动力学和分子机制，并开发有效的治疗策略 | 子痫前期患者的胎盘细胞和巨噬细胞 | NA | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 子痫前期样本中的11种不同细胞亚群 |
| 9312 | 2024-09-11 |
Getting to the root of root-microbe interactions
2024 Jul-Sep, Science progress
IF:2.6Q2
DOI:10.1177/00368504241278783
PMID:39234658
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评论 | 本文总结了最近关于根系与微生物相互作用的研究成果，并提出了未来研究方向 | 强调了在解释微生物模式时需要考虑根系生理和形态等微环境变异 | NA | 探讨根系与微生物相互作用及其对生态系统功能和养分流动的影响 | 细根（直径小于2毫米）及其与微生物的相互作用 | NA | NA | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 9313 | 2024-09-11 |
DRA involvement in linaclotide-stimulated bicarbonate secretion during loss of CFTR function
2024-Jun-13, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172364
PMID:38869953
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研究论文 | 研究了在CFTR功能丧失的情况下，linaclotide对十二指肠碳酸氢盐分泌的影响及其机制 | 发现linaclotide在CFTR功能丧失的情况下仍能刺激十二指肠碳酸氢盐分泌，并揭示了DRA在这一过程中的补偿作用 | 研究主要基于小鼠和人类十二指肠样本，未涉及更大规模的人体临床试验 | 探讨linaclotide在CFTR功能丧失时对十二指肠碳酸氢盐分泌的影响及其机制 | 小鼠和人类十二指肠样本，包括活体和体外实验 | NA | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和人类十二指肠样本，包括活体和体外实验 |
| 9314 | 2024-09-11 |
SFTPB in serum extracellular vesicles as a biomarker of progressive pulmonary fibrosis
2024-Jun-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.177937
PMID:38855869
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学分析血清外泌体，发现肺表面活性物质相关蛋白B（SFTPB）作为渐进性肺纤维化（PPF）的潜在生物标志物 | 首次发现SFTPB在血清外泌体中作为预测间质性肺病进展的独立预后因子，优于已知的生物标志物KL-6和SP-D | 研究仅在两个队列中验证了SFTPB的预测效用，需要更多样本和队列验证其普适性 | 寻找渐进性肺纤维化的早期检测生物标志物 | 血清外泌体中的蛋白质，特别是SFTPB及其前体形式 | NA | 肺纤维化 | 蛋白质组学分析，单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质数据 | 两个队列的样本，包括血清外泌体和血清样本 |
| 9315 | 2024-09-11 |
Transcriptomic Analysis of the Spatiotemporal Axis of Oogenesis and Fertilization in C. elegans
2024-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.03.597235
PMID:38895354
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研究论文 | 本文对秀丽隐杆线虫雌雄同体的卵母细胞形成过程进行了转录组水平分析 | 通过单细胞RNA测序技术，深入分析了不同阶段的卵母细胞转录组，揭示了基因表达和剪接事件的详细变化，并提供了卵母细胞形成过程的新见解 | NA | 研究秀丽隐杆线虫卵母细胞形成和受精过程中的时空轴转录组变化 | 秀丽隐杆线虫雌雄同体的卵母细胞和受精卵 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 7个不同阶段的卵母细胞和受精卵 |
| 9316 | 2024-09-11 |
Spatial analysis of recurrent glioblastoma reveals perivascular niche organization
2024-May-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.179853
PMID:38805346
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研究论文 | 研究分析了复发性胶质母细胞瘤的肿瘤微环境组织结构 | 首次通过成像技术同时评估肿瘤组织的缺氧、血管生成、炎症微环境、细胞外基质组织、TERT启动子突变状态和多种致癌扩增 | NA | 探讨胶质母细胞瘤中遗传多样性与肿瘤微环境之间的关系 | 复发性胶质母细胞瘤的肿瘤组织 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 成像技术 | NA | 图像 | 匹配的原发和复发性胶质母细胞瘤肿瘤组织样本 |
| 9317 | 2024-09-11 |
Selective CAR T cell-mediated B cell depletion suppresses IFN signature in SLE
2024-May-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.179433
PMID:38722688
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和T/B细胞受体分析，研究了CD19 CAR T细胞介导的B细胞耗竭对系统性红斑狼疮（SLE）患者免疫特征的影响 | 本文首次揭示了CAR T细胞介导的B细胞耗竭与SLE患者中I型干扰素信号减少之间的因果关系 | NA | 探讨CAR T细胞介导的B细胞耗竭对SLE患者免疫特征的影响及其分子机制 | 系统性红斑狼疮（SLE）患者 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | SLE患者 |
| 9318 | 2024-09-11 |
Liver sinusoidal endothelial cells contribute to portal hypertension through collagen type IV-driven sinusoidal remodeling
2024-May-07, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.174775
PMID:38713515
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研究论文 | 研究探讨了肝窦内皮细胞通过胶原蛋白IV驱动的肝窦重塑在门脉高压中的作用 | 首次揭示了肝窦内皮细胞在肝纤维化和门脉高压中通过胶原蛋白IV沉积促进肝窦重塑的作用 | NA | 探讨胶原蛋白IV在肝纤维化和门脉高压中的作用及其细胞来源和表达调控机制 | 肝窦内皮细胞、胶原蛋白IV、肝纤维化、门脉高压 | NA | 肝病 | RNA测序、免疫荧光染色、单细胞RNA测序、CRISPRi-dCas9-KRAB表观基因组编辑 | NA | RNA | 人类肝硬化肝脏样本、小鼠纤维化肝脏样本、体外培养的肝窦内皮细胞 |
| 9319 | 2024-09-11 |
CD4 T cell-secreted IFN-γ in Sjögren's syndrome induces salivary gland epithelial cell ferroptosis
2024-04, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2024.167121
PMID:38471652
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研究论文 | 研究探讨了干燥综合征中CD4 T细胞分泌的IFN-γ如何诱导唾液腺上皮细胞铁死亡 | 首次揭示了CD4 T细胞在干燥综合征中分泌的IFN-γ诱导唾液腺上皮细胞铁死亡的作用 | NA | 确定干燥综合征中IFN-γ的来源及其对唾液腺上皮细胞的影响 | 干燥综合征患者的唾液腺上皮细胞和CD4 T细胞 | NA | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 健康对照和干燥综合征小鼠的唾液腺单细胞RNA测序数据 |
| 9320 | 2024-09-11 |
Single cell and bulk RNA sequencing identifies tumor microenvironment subtypes and chemoresistance-related IGF1+ cancer-associated fibroblast in gastric cancer
2024-04, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2024.167123
PMID:38484940
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序技术，识别了胃癌肿瘤微环境亚型及与化疗耐药相关的IGF1+癌症相关成纤维细胞 | 首次通过单细胞RNA测序数据识别了胃癌肿瘤微环境的四种亚型，并发现IGF1+癌症相关成纤维细胞与化疗耐药和胃癌复发相关 | 研究样本量有限，且仅限于胃癌患者，结果的普适性有待进一步验证 | 揭示胃癌肿瘤微环境的异质性及其对治疗反应的影响机制 | 胃癌肿瘤微环境及其亚型，特别是与化疗耐药相关的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），RT-qPCR，双免疫荧光染色 | 非负矩阵分解（NMF） | RNA | 50个胃癌样本，1406名胃癌患者 |