单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 9301 - 9320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9301 | 2024-09-08 |
Interferon-γ induces combined pyroptotic angiopathy and APOL1 expression in human kidney disease
2024-Jun-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114310
PMID:38838223
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研究论文 | 研究探讨了干扰素-γ在人类肾脏疾病中的作用，特别是其诱导的焦亡性血管病变和APOL1表达 | 首次揭示了干扰素-γ信号通路在诱导焦亡性血管病变和APOL1表达中的双重作用，并提出了针对这一机制的治疗策略 | 研究主要基于体外实验和患者样本，缺乏体内实验验证 | 探讨干扰素-γ在肾脏疾病中的直接作用及其机制 | 人类肾脏类器官、原代内皮细胞和患者样本 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序、免疫印迹、定量荧光分析 | NA | RNA | 涉及COVID-19、蛋白尿性肾脏疾病和塌陷性肾小球病的患者样本 |
| 9302 | 2024-09-08 |
Unveiling the hidden role of disulfidptosis in kidney renal clear cell carcinoma: a prognostic signature for personalized treatment
2024-Jun, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-023-01933-2
PMID:38296888
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研究论文 | 本研究探讨了硫化物凋亡相关生物标志物在肾透明细胞癌中的预后预测和个体化治疗中的作用 | 首次揭示了硫化物凋亡在肾透明细胞癌中的潜在作用，并构建了一个基于硫化物凋亡相关预后特征的模型 | 研究主要基于发现队列和外部验证队列，需要进一步的多中心验证 | 探索硫化物凋亡在肾透明细胞癌中的作用，并开发一个预后预测模型以指导个体化治疗 | 肾透明细胞癌患者及其预后和治疗反应 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞转录组学、空间转录组学、定量RT-qPCR、免疫组化 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 发现队列和外部验证队列的肾透明细胞癌患者 |
| 9303 | 2024-09-08 |
A novel mitochondrial unfolded protein response-related risk signature to predict prognosis, immunotherapy and sorafenib sensitivity in hepatocellular carcinoma
2024-Jun, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-01945-6
PMID:38493408
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研究论文 | 本文构建了一种基于线粒体未折叠蛋白反应（UPR）相关基因的风险特征，用于预测肝细胞癌（HCC）患者的预后、免疫治疗反应和索拉非尼敏感性 | 首次基于UPR相关基因构建了HCC的预后风险特征，并研究了其对免疫细胞浸润、免疫治疗和化疗反应的影响 | NA | 建立一种新的基于UPR相关基因的风险特征，用于预测HCC患者的预后、免疫细胞浸润、免疫治疗和化疗反应 | 肝细胞癌（HCC）患者的预后、免疫细胞浸润、免疫治疗反应和索拉非尼敏感性 | 数字病理学 | 肝癌 | LASSO回归分析、TIMER算法、免疫组化（IHC）、单细胞RNA测序、空间转录组分析 | 风险模型 | 转录组数据 | TCGA和ICGC数据库中的转录组数据和临床信息 |
| 9304 | 2024-09-08 |
Universal recording of immune cell interactions in vivo
2024-Mar, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07134-4
PMID:38448581
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研究论文 | 本文介绍了一种名为uLIPSTIC的新技术，用于在体内记录免疫细胞间的物理相互作用 | 开发了一种通用的LIPSTIC版本（uLIPSTIC），能够记录免疫细胞与非免疫细胞之间的物理相互作用，不受受体和配体类型的限制 | NA | 研究免疫细胞在体内的瞬时物理相互作用 | 免疫细胞与非免疫细胞的相互作用 | 免疫学 | NA | LIPSTIC | NA | 单细胞转录组学 | NA |
| 9305 | 2024-09-08 |
Cardiac reprogramming reduces inflammatory macrophages and improves cardiac function in chronic myocardial infarction
2024-01-01, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2023.149272
PMID:37992523
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研究论文 | 本文研究了心脏重编程对慢性心肌梗死后炎症巨噬细胞和心脏功能的影响 | 首次展示了心脏重编程可以减少心肌梗死后的炎症巨噬细胞，并改善心脏功能 | 尚未明确心脏重编程通过MGTH过表达影响炎症细胞的具体机制 | 探讨心脏重编程在慢性心肌梗死后减少炎症和改善心脏功能的作用 | 慢性心肌梗死后的心脏纤维母细胞和炎症细胞 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 9306 | 2024-09-08 |
Research progress and application strategies of sugar transport mechanisms in rice
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1454615
PMID:39233915
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综述 | 本文综述了水稻中糖运输机制的遗传和分子基础及其调控 | 本文强调了质外体途径在水稻韧皮部装载中的主导作用，并总结了糖运输基因的调控途径 | 本文指出当前研究方法的不足，并讨论了先进的分析技术如质谱成像和单细胞RNA测序的潜在应用 | 本文旨在深入理解水稻中糖运输过程及其调控机制，为高产水稻育种提供指导 | 本文主要研究水稻中的糖运输机制及其相关蛋白质和基因 | NA | NA | 质谱成像和单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 9307 | 2024-09-08 |
Comprehensive analysis of hypoxia-related genes in diagnosis and immune infiltration in acute myocardial infarction: based on bulk and single-cell RNA sequencing data
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1448705
PMID:39234566
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研究论文 | 本文通过批量和单细胞RNA测序数据，全面分析了缺氧相关基因在急性心肌梗死诊断和免疫浸润中的作用 | 开发了一个基于缺氧相关基因的急性心肌梗死预测模型，并验证了其与免疫细胞浸润的强关联 | NA | 研究缺氧相关基因在急性心肌梗死中的作用及其与免疫细胞浸润的关系 | 急性心肌梗死患者及其缺氧相关基因 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | 随机森林模型 | RNA | 训练数据集GSE66360，验证数据集GSE48060，单细胞RNA数据集GSE163956 |
| 9308 | 2024-09-08 |
Single-cell transcriptomics supports presence of cryptic species and reveals low levels of population genetic diversity in two testate amoebae morphospecies with large population sizes
2023-11-02, Evolution; international journal of organic evolution
DOI:10.1093/evolut/qpad158
PMID:37672006
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研究论文 | 研究分析了两种形态种的单细胞转录组数据，评估了其种群遗传多样性 | 首次使用单细胞转录组数据研究不可培养的异养原生生物的种群遗传学，揭示了隐秘物种的存在 | 研究样本仅来自新英格兰沼泽，可能无法代表所有种群 | 评估两种形态种的种群遗传多样性，揭示隐秘物种的存在 | 两种形态种的单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 72个单细胞转录组数据，来自两种形态种 |
| 9309 | 2024-09-08 |
Loss of autism-candidate CHD8 perturbs neural crest development and intestinal homeostatic balance
2023-01, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202201456
PMID:36375841
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研究论文 | 本文研究了CHD8基因突变对神经嵴发育和肠道稳态平衡的影响 | 首次揭示了CHD8基因突变与神经嵴发育、肠道稳态以及自闭症相关胃肠道症状之间的因果关系 | 研究仅限于斑马鱼模型，尚未在人类中验证 | 探讨CHD8基因突变对神经嵴发育和肠道稳态的影响及其与自闭症相关胃肠道症状的关系 | CHD8基因突变对神经嵴细胞、肠道神经和胶质前体细胞、肠道稳态以及免疫平衡的影响 | 发育生物学 | 自闭症 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 斑马鱼模型 |
| 9310 | 2024-09-08 |
Single-cell RNA-seq analysis to identify potential biomarkers for diagnosis, and prognosis of non-small cell lung cancer by using comprehensive bioinformatics approaches
2023-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2022.101571
PMID:36401966
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序数据和生物信息学方法，识别非小细胞肺癌的潜在生物标志物 | 利用单细胞RNA测序数据和生物信息学技术，识别了12个关键基因及其相关的转录因子和miRNA，这些基因在非小细胞肺癌的诊断和预后中具有潜在作用 | 研究依赖于公开数据库中的数据，可能存在数据质量和样本代表性的限制 | 识别非小细胞肺癌的诊断和预后生物标志物 | 非小细胞肺癌的基因生物标志物及其调控因子和信号通路 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从GEO数据库获取的单细胞RNA测序数据 |
| 9311 | 2024-09-08 |
Understanding the aging hypothalamus, one cell at a time
2022-12, Trends in neurosciences
IF:14.6Q1
DOI:10.1016/j.tins.2022.10.004
PMID:36272823
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综述 | 本文综述了下丘脑功能对衰老的贡献，并强调了单细胞研究在理解下丘脑衰老及其在长寿中的作用方面的潜力 | 利用单细胞RNA测序等技术，颠覆了关于下丘脑细胞类型转录身份的假设，揭示了不同细胞类型随年龄的变化 | NA | 总结当前关于下丘脑功能对衰老贡献的知识，并探讨单细胞'组学技术在进一步理解下丘脑衰老及其在长寿中作用的方法 | 下丘脑的神经肽能神经元及其在衰老过程中的变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 9312 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome reveals differentiation between adaxial and abaxial mesophyll cells in Brassica rapa
2022-12, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.13919
PMID:36039389
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9313 | 2024-09-08 |
Spatially aware dimension reduction for spatial transcriptomics
2022-11-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34879-1
PMID:36418351
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研究论文 | 本文开发了一种空间感知降维方法SpatialPCA，用于空间转录组数据的分析 | SpatialPCA能够提取空间转录组数据中的低维表示，保留生物信号和空间相关结构 | NA | 开发一种新的方法来分析空间转录组数据，并应用于肿瘤微环境和大脑皮层的分析 | 空间转录组数据，特别是肿瘤微环境和大脑皮层的转录组数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组技术 | PCA | 转录组数据 | NA |
| 9314 | 2024-09-08 |
NetREX-CF integrates incomplete transcription factor data with gene expression to reconstruct gene regulatory networks
2022-11-23, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-04226-7
PMID:36418514
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研究论文 | 本文介绍了一种名为NetREX-CF的方法，通过整合不完整的转录因子数据和基因表达数据来重建基因调控网络 | NetREX-CF结合了协同过滤技术来解决先验知识的不完整性，并使用基于稀疏网络成分分析的生物学合理模型来处理基因表达数据 | NA | 解决基因调控网络重建中先验知识不完整的问题 | 酵母和果蝇Schneider 2细胞的基因调控网络 | 系统生物学 | NA | RNA-Seq | 协同过滤 | 基因表达数据 | 465个表达的转录因子 |
| 9315 | 2024-09-08 |
Identification and Validation of UPF1 as a Novel Prognostic Biomarker in Renal Clear Cell Carcinoma
2022-11-20, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13112166
PMID:36421841
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研究论文 | 研究探讨了UPF1在肾透明细胞癌中的表达及其作为预后生物标志物的潜力 | 首次系统分析了UPF1在肾透明细胞癌中的表达及其对免疫微环境的影响，并验证了其作为预后生物标志物的潜力 | 研究主要基于数据库分析和体外实验，缺乏体内实验验证 | 探讨UPF1在肾透明细胞癌中的表达及其临床意义 | UPF1在肾透明细胞癌中的表达及其对免疫微环境的影响 | 数字病理学 | 肾癌 | RNA测序 | NA | RNA | 使用了来自TCGA、GEO和ArrayExpress数据库的bulk RNA测序数据以及肾透明细胞癌的单细胞测序数据 |
| 9316 | 2024-09-08 |
How does the structure of data impact cell-cell similarity? Evaluating how structural properties influence the performance of proximity metrics in single cell RNA-seq data
2022-11-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac387
PMID:36151725
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研究论文 | 本文探讨了数据结构如何影响细胞间相似性，并评估了结构属性对单细胞RNA测序数据中邻近度量性能的影响 | 开发了一个框架，深入评估了17种邻近度量在单细胞RNA测序数据核心结构属性方面的性能 | 研究仅限于单细胞RNA测序数据，未涵盖其他类型的生物数据 | 评估不同邻近度量在单细胞RNA测序数据中的性能，并探讨数据结构属性对其影响 | 单细胞RNA测序数据中的邻近度量和数据结构属性 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 9317 | 2024-09-08 |
Single cell sequencing maps skeletal muscle cellular diversity as disease severity increases in dystrophic mouse models
2022-Nov-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105415
PMID:36388984
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了在杜氏肌营养不良症（DMD）小鼠模型中，随着疾病严重程度增加，骨骼肌细胞的多样性变化 | 首次利用单细胞RNA测序技术探索了健康、肌营养不良和严重肌营养不良小鼠模型中骨骼肌细胞群的差异 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 深入了解DMD疾病严重程度增加时骨骼肌细胞的异质性 | 健康、肌营养不良和严重肌营养不良小鼠模型的骨骼肌细胞 | 数字病理学 | 肌肉萎缩症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 健康、肌营养不良和严重肌营养不良小鼠模型的骨骼肌样本 |
| 9318 | 2024-09-08 |
SpaceX: gene co-expression network estimation for spatial transcriptomics
2022-11-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac645
PMID:36179087
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研究论文 | 开发了一种用于空间转录组学的统计框架SpaceX，用于检测空间结构组织中的基因共表达模式 | 提出了SpaceX方法，结合空间泊松模型和高维因子模型，能够识别共享和集群特异性共表达网络，并提高了计算效率 | NA | 增强空间转录组技术在生物发现中的能力和潜力 | 空间结构组织中的基因共表达模式 | 空间转录组学 | NA | 空间泊松模型和高维因子模型 | 贝叶斯方法 | 转录组数据 | 小鼠下丘脑和人类乳腺癌的空间转录组数据 |
| 9319 | 2024-09-08 |
Multi-omic analyses of changes in the tumor microenvironment of pancreatic adenocarcinoma following neoadjuvant treatment with anti-PD-1 therapy
2022-11-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2022.10.001
PMID:36306792
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研究论文 | 研究了抗PD-1疗法在新辅助治疗后胰腺导管腺癌肿瘤微环境中的多组学变化 | 揭示了GVAX疫苗与nivolumab联合治疗后肿瘤微环境中的免疫调节机制，特别是T细胞和肿瘤相关中性粒细胞的变化 | 研究样本量较小，且仅限于特定的治疗组合 | 探讨抗PD-1疗法在新辅助治疗后胰腺导管腺癌中的免疫反应机制 | 胰腺导管腺癌患者在接受GVAX疫苗与nivolumab联合治疗前后的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 多组学分析 | NA | RNA序列 | 前后的配对样本 |
| 9320 | 2024-09-08 |
SRSF10 is essential for progenitor spermatogonia expansion by regulating alternative splicing
2022-Nov-10, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.78211
PMID:36355419
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研究论文 | 研究了SRSF10在调节选择性剪接中的作用，及其对精原细胞扩展和男性生育能力的影响 | 首次揭示了SRSF10在精原细胞扩展中的关键作用，并通过选择性剪接调控这一过程 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨选择性剪接在精子发生中的作用 | SRSF10基因及其在精原细胞扩展中的作用 | NA | NA | RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |