单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 9281 - 9300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9281 | 2025-10-07 |
Single-cell and spatially resolved interactomics of tooth-associated keratinocytes in periodontitis
2024-Jun-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49037-y
PMID:38876998
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研究论文 | 通过单细胞和空间分辨率互作组学研究牙周炎中牙齿相关角质形成细胞的作用 | 构建了人类牙周组织的综合单细胞RNA测序图谱，揭示了牙周炎中沟内和结合上皮角质形成细胞的差异化状态及与细菌的细胞特异性趋向性 | 需要进一步研究以支持慢性炎症状态下的精准牙周干预 | 研究牙周炎中牙周微环境细胞类型与微生物的关系 | 人类牙周组织中的沟内和结合上皮角质形成细胞(SK/JKs) | 单细胞组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序, 单细胞宏基因组学, 荧光原位杂交, 多重免疫荧光 | 细胞-细胞通讯分析 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 34个样本, 105,918个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9282 | 2025-10-07 |
Multimodal Learning for Mapping the Genotype-Phenotype Dynamics
2024-May-16, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4355413/v1
PMID:38798675
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研究论文 | 开发了一个多模态基础模型来探索人类转录组学在细胞水平的基因型-表型关系流形 | 提出了计算整合遗传学框架，同时分析基因型和表型的高维景观，通过多模态基础模型揭示传统基因表达分析无法检测的跨组织生物标志物 | NA | 解析基因表达与表型表现之间的动态相互作用关系 | 人类转录组学数据，特别是内皮细胞中的VWF基因 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，语言模型 | 多模态基础模型，语言模型 | 基因表达数据，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9283 | 2025-10-07 |
Spinster homolog 2 reduces malignancies of glioblastoma via PTEN/PI3K/AKT pathway
2024-03, IUBMB life
IF:3.7Q2
DOI:10.1002/iub.2785
PMID:37728571
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研究论文 | 本研究探讨SPNS2通过PTEN/PI3K/AKT通路抑制胶质母细胞瘤恶性进展的分子机制 | 首次揭示SPNS2在胶质母细胞瘤中的抑癌功能及其通过PTEN/PI3K/AKT通路调控肿瘤恶性进展和免疫浸润的新机制 | 未明确SPNS2调控PTEN/PI3K/AKT通路的具体分子机制，缺乏临床样本验证 | 探究SPNS2在胶质母细胞瘤中的生物学功能和分子机制 | 胶质母细胞瘤细胞系和体内移植瘤模型 | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | RNA测序, 单细胞测序, 基因富集分析, 细胞功能实验, 体内移植瘤实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 利用TCGA和CGGA数据库的胶质瘤样本，具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 9284 | 2025-10-07 |
High-throughput single nucleus total RNA sequencing of formalin-fixed paraffin-embedded tissues by snRandom-seq
2023-05-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38409-5
PMID:37173341
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研究论文 | 开发了一种名为snRandom-seq的高通量单核总RNA测序技术，用于福尔马林固定石蜡包埋组织 | 使用随机引物捕获全长总RNA，相比现有技术具有更低的双胞率、更高的RNA覆盖度，并能检测更多非编码RNA和新生RNA | NA | 开发适用于FFPE组织的单核RNA测序技术 | 福尔马林固定石蜡包埋组织样本 | 单细胞测序 | 肝癌 | 单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 人类肝癌FFPE标本 | NA | 单核RNA测序 | snRandom-seq | 基于液滴的单核总RNA测序技术，使用随机引物捕获全长RNA |
| 9285 | 2025-10-07 |
Elite control of HIV is associated with distinct functional and transcriptional signatures in lymphoid tissue CD8+ T cells
2019-12-18, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.aax4077
PMID:31852798
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞方法揭示了HIV精英控制者淋巴组织中CD8+ T细胞的功能和转录特征 | 首次在淋巴组织中系统比较精英控制者与慢性进展者的HIV特异性CD8+ T细胞特征，发现非细胞毒性抑制病毒复制的新机制 | 样本量有限，研究仅针对淋巴组织，未涉及其他潜在影响因素 | 探究HIV精英控制者淋巴组织中CD8+ T细胞的功能和分子特征 | HIV精英控制者和慢性进展者的淋巴组织CD8+ T细胞 | 免疫学 | HIV/AIDS | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | HIV精英控制者和慢性进展者淋巴组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9286 | 2025-10-07 |
Deciphering the Dysregulating IGF-1-SP1-CD248 Pathway in Fibroblast Functionality during Diabetic Wound Healing
2025-May, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.07.035
PMID:39293711
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研究论文 | 本研究揭示了IGF-1-SP1-CD248信号轴在糖尿病伤口愈合过程中调控成纤维细胞功能的关键作用 | 首次发现糖尿病伤口中CD248富集的分泌-网状成纤维细胞显著减少，并阐明IGF-1通过Akt/mTOR信号通路和SP1转录因子调控CD248表达的分子机制 | 糖尿病环境中TNFα促进IGF-1抵抗的具体机制仍需进一步研究 | 探究CD248在糖尿病伤口愈合中的作用及其调控通路 | 糖尿病患者和小鼠的皮肤伤口组织及成纤维细胞 | 分子生物学 | 糖尿病溃疡 | 单细胞转录组测序、免疫组织化学染色 | NA | 基因表达数据、组织图像数据 | 糖尿病患者和小鼠的伤口组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9287 | 2025-04-25 |
Profiling Long Noncoding RNA in Psoriatic Skin Using Single-Cell RNA Sequencing
2025-May, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.09.010
PMID:39342985
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术对银屑病患者皮肤中的长链非编码RNA（lncRNA）进行表达谱分析 | 首次在单细胞水平上对银屑病皮肤中的lncRNA进行系统性的表达谱分析，并鉴定了细胞类型特异性的lncRNA | 样本量较小（6名患者），且仅针对银屑病皮肤进行研究 | 探究lncRNA在银屑病皮肤中的表达模式及其与细胞增殖/表皮分化的关系 | 银屑病患者的皮损和未受累皮肤组织 | 基因组学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | 6名银屑病患者的配对皮损和未受累皮肤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 9288 | 2025-04-25 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Molecular Signatures that Distinguish Allergic from Irritant Contact Dermatitis
2025-May, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.09.008
PMID:39341550
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示区分过敏性接触性皮炎和刺激性接触性皮炎的分子特征 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示了过敏性接触性皮炎和刺激性接触性皮炎在转录组水平上的差异，并开发了一个高敏感性和特异性的诊断模型 | 样本量较小，且仅针对健康志愿者进行研究，未涉及不同年龄或疾病严重程度的患者 | 发现区分过敏性接触性皮炎和刺激性接触性皮炎的生物标志物 | 人类皮肤组织 | 生物医学 | 过敏性接触性皮炎和刺激性接触性皮炎 | 单细胞RNA测序 | 逻辑回归模型 | 转录组和蛋白质组数据 | 健康人类志愿者 | NA | NA | NA | NA |
| 9289 | 2025-04-25 |
Multi-omics Analysis Revealed the Diagnostic and Therapeutic Value of Immunogenic Cell Death-derived SCN5A in Hepatocellular Carcinoma
2025-Apr-24, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-025-01444-2
PMID:40272736
|
research paper | 本研究探讨了SCN5A作为免疫原性细胞死亡相关基因在肝细胞癌中的诊断和治疗潜力 | 首次将SCN5A作为免疫原性细胞死亡相关基因与肝细胞癌的预后和免疫微环境调控联系起来，并发现丙胺苯丙酮作为SCN5A的高亲和力结合剂具有抗肿瘤效果 | 研究主要基于数据库分析和体外实验，需要进一步的体内实验和临床验证 | 探索SCN5A在肝细胞癌中的诊断和治疗价值 | 肝细胞癌（HCC） | computational biology and experimental oncology | hepatocellular carcinoma | multi-omics analysis, single-cell RNA sequencing, bulk RNA sequencing, machine learning, molecular docking | machine learning-based prognostic models | RNA sequencing data, clinical data | 四个数据库的综合分析，HepG2细胞实验 | NA | NA | NA | NA |
| 9290 | 2025-04-25 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomic Analysis of Maize Embryo Development: a Sample Preparation Protocol
2025-Apr-23, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.prot108645
PMID:40268304
|
研究论文 | 本文描述了一种用于玉米胚胎发育研究的单细胞和空间转录组分析的样本制备协议 | 首次将单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组分析技术应用于玉米胚胎发育研究 | 仅提供了样本制备协议，未展示实际应用结果 | 研究玉米胚胎发育的细胞水平机制 | 玉米胚胎 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）, 空间转录组分析 | NA | 转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 9291 | 2025-04-25 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomic Analysis of Maize Embryo Development
2025-Apr-23, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.top108468
PMID:40268305
|
review | 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组学在玉米胚胎发育研究中的联合应用及其协同效果 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组学两种技术研究玉米胚胎发育，提供了高分辨率的基因表达模式和调控网络分析 | 单细胞技术难以识别特定细胞簇，而空间转录组学通常无法达到单细胞分辨率且检测到的转录本较少 | 研究玉米胚胎发育的基因表达模式和调控网络，以促进植物发育机制的理解和农业改良 | 玉米胚胎发育过程中的细胞和组织 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 (RNA-seq), 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9292 | 2025-10-07 |
scIDPMs: Single-Cell RNA-Seq Imputation Using Diffusion Probabilistic Models
2025-Apr, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2024.3430554
PMID:39093668
|
研究论文 | 提出一种基于条件扩散概率模型的新型单细胞RNA测序数据插补方法scIDPMs | 首次将条件扩散概率模型应用于单细胞RNA测序数据插补，通过注意力机制的深度神经网络有效捕捉全局基因表达特征 | 未明确说明方法在超大规模数据集上的计算效率及对特定细胞类型的适用性限制 | 解决单细胞RNA测序数据中dropout事件导致的假零值问题，提高下游分析准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 条件扩散概率模型, 深度神经网络, 注意力机制 | 基因表达数据 | 模拟和真实单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9293 | 2025-10-07 |
The Effect of Cuproptosis-Related Proteins on Macrophage Polarization in Mesothelioma is Revealed by scRNA-seq
2025-Apr, Biological trace element research
IF:3.4Q2
DOI:10.1007/s12011-024-04333-y
PMID:39177724
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示铜死亡相关蛋白对间皮瘤中巨噬细胞极化的影响 | 首次发现铜死亡相关基因在间皮瘤中的作用机制，特别是SLC31A1基因对M2巨噬细胞极化的正向调控作用 | 研究样本量有限，需要进一步临床验证 | 探索铜死亡相关基因在间皮瘤发生发展中的作用及其对肿瘤免疫的影响 | 间皮瘤患者样本和单细胞数据 | 单细胞转录组学 | 间皮瘤 | 单细胞RNA测序, 体外验证 | LASSO回归, Cox回归 | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的间皮瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9294 | 2025-10-07 |
Integrative single-cell and spatial transcriptomic analyses identify a pathogenic cholangiocyte niche and TNFRSF12A as therapeutic target for biliary atresia
2025-Apr-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001064
PMID:39178365
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研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组分析揭示胆道闭锁中致病性胆管细胞生态位及TNFRSF12A作为治疗靶点 | 首次通过整合单细胞RNA测序和空间转录组技术构建BA空间肝脏细胞图谱，发现胆管细胞富集的致病生态位并鉴定TNFRSF12A为潜在治疗靶点 | 样本量有限（12例单细胞测序+4例空间转录组），需进一步验证 | 阐明胆管细胞在胆道闭锁中的致病机制并寻找治疗靶点 | 胆道闭锁患者肝组织、小鼠疾病模型、人类胆管类器官 | 空间转录组学 | 胆道闭锁 | 单细胞RNA测序, 空间转录组, 生物信息学分析, 类器官培养 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 16例肝组织（12例单细胞测序：9例BA+3例对照；4例空间转录组：2例BA+2例对照） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | NA | NA |
| 9295 | 2025-10-07 |
CSsingle: A Unified Tool for Robust Decomposition of Bulk and Spatial Transcriptomic Data Across Diverse Single-Cell References
2025-Mar-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.07.588458
PMID:38645128
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研究论文 | 介绍了一种名为CSsingle的新方法，用于增强对批量和空间转录组数据的分解能力 | 通过ERCC spike-in对照进行细胞大小校正，解决了细胞类型间RNA含量差异的问题，实现了准确的批量数据反卷积和空间数据的精细分析 | NA | 开发统一的工具来整合批量和空间转录组数据与单细胞RNA测序数据，推进复杂生物系统和疾病过程的研究 | 700多个正常和病变的胃食管组织样本，包括Barrett食管和食管腺癌患者 | 生物信息学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，ERCC spike-in对照 | NA | 转录组数据，空间转录组数据 | 700多个正常和病变的胃食管组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 9296 | 2025-10-07 |
Heterogeneity-Preserving Discriminative Feature Selection for Disease-Specific Subtype Discovery
2025-Mar-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.14.540686
PMID:38187596
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研究论文 | 提出了一种名为PHet的统计方法，用于在疾病亚型发现中保持异质性的判别性特征选择 | 利用深度度量学习探索保持异质性所需特征的统计特性，开发了基于四分位距差异分析和Fisher方法的迭代子采样算法 | 方法在更广泛数据集上的性能仍需进一步验证 | 开发能够保持样本异质性并增强亚型聚类质量的特征选择方法 | 疾病特异性亚型发现 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq，微阵列 | 深度度量学习 | 分子数据，单细胞RNA-seq数据，微阵列数据，成像数据 | 公共单细胞RNA-seq和微阵列数据集，包括小鼠气管上皮细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9297 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing and cell-cell communication analysis reveal tumor microenvironment associated with chemotherapy responsiveness in ovarian cancer
2025-Mar, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-024-03655-6
PMID:39122983
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和细胞间通讯分析揭示卵巢癌肿瘤微环境与化疗反应性的关联 | 首次整合含化疗反应信息的卵巢癌单细胞RNA-seq数据集，系统分析不同TME组分通过细胞间通讯直接影响肿瘤细胞化疗反应的机制 | 基于现有数据集的分析，缺乏实验验证；样本量有限 | 研究肿瘤微环境对卵巢癌化疗反应性的影响机制 | 卵巢癌患者肿瘤组织中的各类细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9298 | 2025-10-07 |
Cancer-Associated Fibroblasts in Intrahepatic Cholangiocarcinoma: Insights into Origins, Heterogeneity, Lymphangiogenesis, and Peritoneal Metastasis
2025-Mar, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.07.009
PMID:39117110
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综述 | 本文系统评述了肝内胆管癌中癌症相关成纤维细胞的起源、异质性及其在淋巴管生成和腹膜转移中的作用 | 整合了最新的细胞谱系追踪研究、单细胞RNA测序和生物标志物分析，揭示了CAFs的起源和生物学复杂性 | NA | 探讨肝内胆管癌中癌症相关成纤维细胞的特征和功能 | 肝内胆管癌中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序, 细胞谱系追踪, 生物标志物分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9299 | 2025-10-07 |
Characteristics of the Dynamic Evolutionary Pathway of ADSCs Induced Differentiation into Astrocytes Based on scRNA-Seq Analysis
2025-Mar, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-024-04414-y
PMID:39190264
|
研究论文 | 基于单细胞转录组测序揭示脂肪来源基质细胞向星形胶质细胞分化的动态演化路径特征 | 首次发现ADSCs可通过直接和间接两条不同路径分化为成熟星形胶质细胞，并识别了STAT1、MYEF2和SOX6等关键转录因子的调控作用 | 研究仅基于单细胞转录组数据，缺乏功能验证实验 | 探索ADSCs向星形胶质细胞分化的动态基因表达变化和细胞分化轨迹 | 脂肪来源基质细胞及其诱导分化的星形胶质细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | Monocle2, SCENIC | 单细胞转录组数据 | 5个样本（ADSCs组和2、7、14、21天诱导组），13个细胞簇 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞测序平台 |
| 9300 | 2025-10-07 |
Helicobacter pylori induces GBA1 demethylation to inhibit ferroptosis in gastric cancer
2025-Mar, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-024-05105-x
PMID:39283563
|
研究论文 | 本研究揭示了幽门螺杆菌通过诱导GBA1基因去甲基化抑制胃癌细胞铁死亡的新机制 | 首次发现幽门螺杆菌通过GBA1基因去甲基化抑制铁死亡的机制，为胃癌治疗提供新靶点 | 研究主要基于细胞模型和动物实验，需要进一步临床验证 | 探索幽门螺杆菌感染与胃癌中铁死亡相关基因的调控机制 | 胃癌细胞系和皮下荷瘤小鼠模型 | 癌症生物学 | 胃癌 | 下一代测序、qRT-PCR、Western blot、质谱分析、单细胞测序 | 细胞模型、动物模型 | 基因组数据、蛋白质数据、代谢组数据 | TCGA-STAD数据库和单细胞数据集，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq、全基因组甲基化测序 | NA | NA |