单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 9281 - 9300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9281 | 2024-08-28 |
Lamc1 promotes osteogenic differentiation and inhibits adipogenic differentiation of bone marrow-derived mesenchymal stem cells
2024-08-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-69629-4
PMID:39179716
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研究论文 | 本研究探讨了骨髓间充质干细胞（BMSCs）晚期分化的分子机制，并鉴定了四个关键基因Lamc1、Tln2、Hexb和St3gal5在BMSCs分化中的作用 | 首次揭示了Lamc1在BMSCs晚期分化中的重要作用，并验证了其在脂肪形成和骨形成中的调控作用 | 研究主要基于公共数据集和单细胞RNA测序数据，未进行体内实验验证 | 阐明骨髓间充质干细胞晚期分化的关键生物过程 | 骨髓间充质干细胞（BMSCs）的晚期分化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 分析了约14天的骨髓间充质干细胞在成骨、成脂和软骨分化后的公共转录组数据 |
| 9282 | 2024-08-28 |
Single-cell profiling reveals altered immune landscape and impaired NK cell function in gastric cancer liver metastasis
2024-Aug, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-03114-0
PMID:39060439
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨胃癌肝转移的免疫景观，揭示了肿瘤免疫微环境中多种免疫抑制成分的变化，并发现NK细胞功能受损与TGFβ的诱导有关 | 首次揭示胃癌肝转移中免疫微环境的详细变化，并发现TGFβ在NK细胞功能障碍中的作用，提出联合TGFβ抑制和NK细胞免疫疗法的新策略 | NA | 探讨胃癌肝转移的免疫景观及其对患者预后的影响 | 胃癌肝转移中的免疫细胞及其功能 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个胃癌肝转移样本 |
| 9283 | 2024-08-28 |
CD28-expressing δ T cells are increased in perivascular adipose tissue of hypertensive mice and in subcutaneous adipose tissue of obese humans
2024-Jul-01, Journal of hypertension
IF:3.3Q1
DOI:10.1097/HJH.0000000000003725
PMID:38704218
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研究论文 | 本研究探讨了高血压小鼠的肠系膜动脉周围脂肪组织（MV/PVAT）和肥胖人类皮下脂肪组织（SAT）中表达CD28的δ T细胞的增加情况。 | 首次揭示了在高血压小鼠和肥胖人类中，CD28高表达的δ T效应记忆细胞的增加，并提出了这些细胞可能在肥胖相关高血压中具有致病作用。 | 研究仅限于小鼠模型和人类样本，可能需要更多种类的样本和更广泛的人群来验证结果。 | 验证高血压小鼠和肥胖人类中γδ T细胞亚型的相似性，并探讨这些细胞在高血压发展中的作用。 | 高血压小鼠的肠系膜动脉周围脂肪组织和肥胖人类的皮下脂肪组织中的γδ T细胞。 | 免疫学 | 高血压 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 小鼠实验包括高血压小鼠的MV/PVAT T细胞；人类实验包括三名瘦女性和三名肥胖女性的SAT CD45+细胞。 |
| 9284 | 2024-08-28 |
Single cell RNA-sequencing reveals the cellular senescence of placental mesenchymal stem/stromal cell in preeclampsia
2024-05, Placenta
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.placenta.2024.03.014
PMID:38588616
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了子痫前期中胎盘间充质干细胞/基质细胞的细胞衰老机制 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了子痫前期中胎盘间充质干细胞/基质细胞的细胞衰老特征，并鉴定了与子痫前期相关的特征基因CTSZ | NA | 揭示子痫前期中胎盘间充质干细胞/基质细胞的细胞衰老机制 | 胎盘间充质干细胞/基质细胞在子痫前期中的细胞衰老 | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自GEO数据库的多个数据集，包括GSE173193、GSE99007和GSE75010 |
| 9285 | 2024-08-28 |
Single-cell RNA sequencing reveals association of aberrant placental trophoblasts and FN1 reduction in late-onset fetal growth restriction
2024-02, Placenta
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.placenta.2023.12.022
PMID:38160601
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了异常胎盘滋养层细胞与FN1减少在晚发型胎儿生长受限中的关联 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了胎盘细胞的异质性，并探讨了滋养层亚型在胎儿生长受限发病机制中的细胞和分子水平作用 | 研究样本量较小，仅包括四名孕妇的胎盘样本，可能影响结果的普遍性 | 旨在表征胎盘细胞在单细胞水平的异质性，并研究滋养层亚型在胎儿生长受限发病机制中的作用 | 胎盘细胞，特别是滋养层细胞及其亚型 | 数字病理学 | 胎儿生长受限 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 39,161个细胞，来自两名正常孕妇和两名患有胎儿生长受限的孕妇的胎盘 |
| 9286 | 2024-08-28 |
MZB1-expressing cells are essential for local immunoglobulin production in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2024-02, Annals of allergy, asthma & immunology : official publication of the American College of Allergy, Asthma, & Immunology
DOI:10.1016/j.anai.2023.10.008
PMID:37852603
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研究论文 | 研究MZB1阳性B细胞在慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）中的作用及其对局部免疫球蛋白过度产生的影响 | 首次揭示了MZB1在CRSwNP中与局部IgE产生的关系，并通过单细胞RNA测序等技术详细分析了MZB1阳性B细胞的特征 | 研究主要集中在CRSwNP患者，可能需要进一步的研究来验证这些发现是否适用于其他疾病或更广泛的人群 | 探讨MZB1阳性B细胞在CRSwNP中的作用及其对局部免疫球蛋白产生的影响 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）患者中的MZB1阳性B细胞 | 免疫学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫组织化学，免疫荧光染色，Western blot，QuantiGene Plex assay，B-cell ImmunoSpot assay，Luminex assay，酶联免疫吸附试验 | NA | 单细胞RNA测序数据 | CRSwNP患者与健康对照组的鼻组织和外周血单个核细胞 |
| 9287 | 2024-08-28 |
Single-cell RNA sequencing of aging neural progenitors reveals loss of excitatory neuron potential and a population with transcriptional immune response
2024, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2024.1400963
PMID:39184324
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了衰老神经前体细胞的转录变化，发现兴奋性神经元潜能的丧失及具有转录免疫反应的细胞群 | 首次在单细胞水平上比较了不同神经发生区域的前体细胞转录谱，并揭示了衰老相关炎症对这些细胞的影响 | NA | 探究衰老过程中神经前体细胞的转录变化及其与衰老相关炎症的关系 | 成年小鼠大脑中的神经干细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 9288 | 2024-08-28 |
Characteristics and impact of infiltration of B-cells from systemic sclerosis patients in a 3D healthy skin model
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1373464
PMID:39185406
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研究论文 | 研究了系统性硬化症（SSc）患者B细胞与健康皮肤模型中成纤维细胞的相互作用及其影响 | 首次展示了激活的B细胞改变了健康和SSc成纤维细胞的转录组特征，向促炎（TNF和IL-17信号传导）和干扰素特征转变 | NA | 探讨B细胞与成纤维细胞在组织水平上的相互作用及其机制 | 系统性硬化症患者B细胞与三维重建的健康皮肤模型中的成纤维细胞、角质形成细胞和细胞外基质的共培养 | NA | 系统性硬化症 | 细胞成像策略、流式细胞术、批量和单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 9289 | 2024-08-28 |
Pandemic influenza A (H1N1) virus causes abortive infection of primary human T cells
2022-Dec, Emerging microbes & infections
IF:8.4Q1
DOI:10.1080/22221751.2022.2056523
PMID:35317717
|
研究论文 | 研究探讨了甲型流感病毒H1N1对人类T细胞的感染及其对免疫反应的影响 | 通过单细胞转录组分析揭示了不同CD4 T和CD8 T细胞亚群对病毒感染的异质性及生物学反应 | NA | 探究甲型流感病毒H1N1对人类T细胞的感染机制及其对免疫系统的影响 | 人类T细胞及其亚群 | 免疫学 | 流感 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 多种CD4 T和CD8 T细胞亚群 |
| 9290 | 2024-08-28 |
Modeling zero inflation is not necessary for spatial transcriptomics
2022-05-18, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02684-0
PMID:35585605
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研究论文 | 本文对20个来自11种不同技术的空间转录组数据集进行了综合分析，以表征表达计数数据的分布特性并理解零值的统计本质 | 研究表明，在空间转录组学中，大量的零值并非由于零膨胀，支持使用不含零膨胀成分的计数模型 | NA | 探究空间转录组学数据中零值的来源及其统计特性 | 20个空间转录组数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | 泊松模型和负二项模型 | 基因表达数据 | 20个数据集，来自11种不同技术 |
| 9291 | 2024-08-28 |
Human liver single nucleus and single cell RNA sequencing identify a hepatocellular carcinoma-associated cell-type affecting survival
2022-05-17, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01055-5
PMID:35581624
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研究论文 | 本文通过整合肝脏单核（snRNA-seq）、单细胞（scRNA-seq）和批量RNA测序（RNA-seq）数据，识别出与肝细胞癌（HCC）相关的细胞类型，该细胞类型影响患者的生存率 | 本文首次通过整合多组学数据，发现了一种与HCC相关的增殖细胞类型（Prol），并揭示了其与TP53和RB1体细胞突变的关联 | NA | 旨在识别影响肝细胞癌患者生存率的特定细胞类型 | 肝细胞癌（HCC）及其相关细胞类型 | 数字病理学 | 肝癌 | 单核RNA测序（snRNA-seq）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA序列数据 | 健康肝脏队列（9个非HCC样本）、HCC队列（1个非HCC，14个HCC肿瘤，14个邻近非肿瘤样本）、另一个HCC队列（3个HCC肿瘤，3个邻近非肿瘤样本）、TCGA多中心队列（361个HCC肿瘤，49个邻近非肿瘤组织）、LCI队列（221个HCC，209个邻近非肿瘤肝脏微阵列样本） |
| 9292 | 2024-08-28 |
Single-cell profiling of human dura and meningioma reveals cellular meningeal landscape and insights into meningioma immune response
2022-05-10, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01051-9
PMID:35534852
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术首次对非肿瘤相关的人类硬脑膜和原发性脑膜瘤样本进行了表征 | 揭示了人类硬脑膜中复杂的免疫微环境，并展示了与脑膜瘤不同的转录特征，同时描述了非免疫细胞（如内皮细胞和成纤维细胞）的功能多样性和异质性 | 研究主要基于单细胞RNA测序技术，可能无法全面反映所有细胞类型的功能和相互作用 | 探究人类硬脑膜和脑膜瘤的免疫和非免疫细胞景观，并提供新的见解 | 非肿瘤相关的人类硬脑膜和原发性脑膜瘤样本 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 7个非肿瘤相关的人类硬脑膜样本和6个原发性脑膜瘤肿瘤样本（4个匹配和2个非匹配） |
| 9293 | 2024-08-28 |
Benchmarking of a Bayesian single cell RNAseq differential gene expression test for dose-response study designs
2022-05-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac019
PMID:35061903
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研究论文 | 本文提出了一种多重校正的贝叶斯测试方法，用于剂量反应设计的单细胞RNA测序差异基因表达分析，并与其他八种方法进行了比较 | 本文提出的贝叶斯测试方法在广泛的准确性指标上优于所有其他测试方法，特别是在控制假阳性错误率方面 | NA | 评估和比较不同差异基因表达分析方法在剂量反应单细胞RNA测序实验中的性能 | 单细胞RNA测序数据在药物和毒理学反应中的应用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯测试方法 | RNA测序数据 | NA |
| 9294 | 2024-08-28 |
scMAGIC: accurately annotating single cells using two rounds of reference-based classification
2022-05-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab1275
PMID:34986249
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scMAGIC的新方法，该方法通过两轮基于参考的分类来准确注释单细胞 | scMAGIC引入了第二轮基于参考的分类，使用第一轮中自信验证的查询细胞作为新参考，从而消除参考数据和查询数据之间的批次效应 | NA | 开发一种新的方法来提高单细胞RNA测序数据的注释准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 基于参考的分类 | RNA测序数据 | 涉及86个基准测试 |
| 9295 | 2024-08-28 |
Mapping the epithelial-immune cell interactome upon infection in the gut and the upper airways
2022-05-02, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-022-00224-x
PMID:35501398
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研究论文 | 本文提出了一种综合计算生物学框架，用于模拟感染如何改变上皮细胞的细胞内信号传导，并通过修改上皮细胞与局部免疫细胞群的相互作用来影响全身免疫反应 | 本文创新性地整合了细胞内和细胞间网络与单细胞RNA测序数据，以揭示感染期间驱动炎症的特定上皮-免疫相互作用 | NA | 研究病毒感染如何改变上皮-免疫细胞相互作用，从而调控炎症反应 | 肠道和上呼吸道上皮感染 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及SARS-CoV-2感染的人回肠和结肠类器官以及感染的呼吸道纤毛上皮细胞 |
| 9296 | 2024-08-28 |
Characterization of cell-cell communication in autistic brains with single-cell transcriptomes
2022-05-02, Journal of neurodevelopmental disorders
IF:4.1Q2
DOI:10.1186/s11689-022-09441-1
PMID:35501678
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组技术分析自闭症患者大脑中的细胞间通讯 | 采用先进的计算和模式识别方法分析单细胞RNA测序数据，推断和比较自闭症大脑与对照组之间的细胞类型间信号通讯 | 研究结果显示的变化幅度中等，且并非所有细胞间信号通路中的基因都显示出差异表达 | 揭示自闭症大脑中潜在的细胞间信号通路中断情况 | 自闭症患者大脑中的细胞间通讯 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 9297 | 2024-08-28 |
Neuronal apoptosis drives remodeling states of microglia and shifts in survival pathway dependence
2022-04-28, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.76564
PMID:35481836
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研究论文 | 研究探讨了凋亡神经元如何影响小胶质细胞的状态，包括溶酶体和脂质代谢基因表达以及对集落刺激因子1受体（CSF1R）生存依赖性的影响。 | 通过单细胞RNA测序（scRNAseq）分析了小胶质细胞在与凋亡神经元相互作用时的多样性和基因表达变化，发现这些相互作用推动了小胶质细胞的多种重塑状态，并改变了其对生存途径CSF1R的依赖性。 | 研究主要集中在早期幼鼠视网膜的小胶质细胞上，可能不完全代表所有神经系统的情况。 | 探究凋亡神经元与小胶质细胞相互作用如何影响小胶质细胞的状态和生存途径依赖性。 | 早期幼鼠视网膜的小胶质细胞，包括野生型、缺乏神经元凋亡（Bax KO）和CSF1R抑制剂处理的小鼠。 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 基因表达数据 | 涉及野生型、Bax KO和PLX3397处理的小鼠视网膜小胶质细胞样本 |
| 9298 | 2024-08-28 |
Single-Cell RNA Sequencing for Plant Research: Insights and Possible Benefits
2022-Apr-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23094497
PMID:35562888
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在植物研究中的应用，强调了其在揭示细胞类型和状态方面的潜力 | scRNA-seq技术提高了生物系统分析的时空分辨率，能够全面表征常见和稀有细胞类型及细胞状态 | 文章未明确提及具体限制 | 探讨scRNA-seq在植物科学中的应用及其在环境应激适应中的作用 | 植物细胞类型和状态 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | NA |
| 9299 | 2024-08-28 |
A mesenchymal to epithelial switch in Fgf10 expression specifies an evolutionary-conserved population of ionocytes in salivary glands
2022-04-12, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110663
PMID:35417692
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和Fgf10:R26-tdTomato小鼠模型，揭示了FGF10细胞在唾液腺中的表达从间充质向上皮细胞的转变，并探讨了这一转变对唾液腺离子细胞功能的影响。 | 首次展示了FGF10细胞在唾液腺中的表达从间充质向上皮细胞的转变，并发现上皮FGF10细胞表达古代离子细胞标志物，表明这些细胞可能是唾液腺中的特化离子细胞。 | NA | 探讨FGF10在唾液腺发育中的作用及其在上皮细胞中的表达变化。 | 唾液腺中的FGF10细胞及其在发育过程中的表达变化。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 使用tamoxifen诱导的Fgf10:R26-tdTomato小鼠模型进行研究 |
| 9300 | 2024-08-28 |
Cellular and molecular atlas of the placenta from a COVID-19 pregnant woman infected at midgestation highlights the defective impacts on foetal health
2022-Apr, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13204
PMID:35141964
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研究论文 | 本研究跟踪了一名在孕中期感染SARS-CoV-2的孕妇，通过对其胎盘和胎儿组织的组织学检查及单细胞RNA测序，揭示了COVID-19对胎盘和胎儿健康的缺陷影响。 | 首次详细描述了孕中期SARS-CoV-2感染对胎盘和胎儿健康的细胞和分子层面的影响。 | 研究样本仅为一例，可能不足以代表所有孕中期COVID-19感染的情况。 | 探讨孕中期SARS-CoV-2感染对母婴健康的影响。 | 孕中期感染SARS-CoV-2的孕妇及其胎盘和胎儿组织。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 组织 | 1例 |