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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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9241 | 2025-10-07 |
Glial 'omics in ischemia: Acute stroke and chronic cerebral small vessel disease
2025-Mar, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24634
PMID:39463002
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综述 | 本文综述了胶质细胞在急慢性脑缺血疾病中的转录组学研究进展 | 整合单细胞RNA测序、空间转录组学和核糖体标记技术揭示胶质细胞亚群在缺血中的新型功能 | 主要基于现有研究综述,缺乏原始实验数据验证 | 阐明胶质细胞在急慢性脑缺血疾病中的分子响应机制 | 脑缺血和小血管疾病中的胶质细胞(小胶质细胞和星形胶质细胞) | 生物信息学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 流式细胞分选, 多组学分析 | NA | 转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多组学 | NA | NA |
9242 | 2025-10-07 |
Seq-Scope: repurposing Illumina sequencing flow cells for high-resolution spatial transcriptomics
2025-Mar, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01065-0
PMID:39482362
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研究论文 | 本研究开发了一种名为Seq-Scope的高分辨率空间转录组技术,通过重新利用Illumina测序平台克服现有技术的局限性 | 将Illumina测序平台重新用于空间转录组分析,实现亚微米级分辨率、高捕获效率和低成本 | 需要研究人员具备分子生物学、组织学和基础Unix技能 | 开发高分辨率空间转录组技术 | 新鲜冷冻组织切片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序 | NA | 图像, 转录组数据 | 多个组织切片,覆盖7mm×7mm或更大区域 | Illumina | 空间转录组学 | Illumina NovaSeq 6000 | Illumina NovaSeq 6000测序流动槽 |
9243 | 2025-10-07 |
A multiplex single-cell RNA-Seq pharmacotranscriptomics pipeline for drug discovery
2025-Mar, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01761-8
PMID:39482470
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研究论文 | 开发了一种结合药物筛选与单细胞RNA测序的药理转录组学流程,用于探索卵巢癌细胞的药物反应机制 | 首次将活细胞条形码技术与96重单细胞RNA测序相结合,实现高通量药理转录组分析 | 研究主要聚焦于高级别浆液性卵巢癌,尚未验证其他癌症类型的适用性 | 解析癌症药物反应的基因调控动态机制 | 原发性高级别浆液性卵巢癌细胞 | 单细胞转录组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 45种药物处理的原代HGSOC细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 96重单细胞RNA测序 |
9244 | 2025-10-07 |
Recent advances in basic research on prostate cancer: Where we are heading?
2025-Mar, International journal of urology : official journal of the Japanese Urological Association
IF:1.8Q3
DOI:10.1111/iju.15628
PMID:39474871
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综述 | 概述前列腺癌基础研究的最新进展,重点关注癌细胞及其肿瘤微环境两大领域 | 整合雄激素受体信号机制、基因组分析、液体活检与肿瘤微环境研究,强调单细胞RNA测序和空间转录组学等先进技术带来的新见解 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据,主要基于现有文献进行总结和分析 | 探讨前列腺癌研究的现状和未来发展方向 | 前列腺癌细胞及其肿瘤微环境 | 基础医学研究 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 液体活检, 基因组分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 临床样本数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
9245 | 2025-10-07 |
Integrating bulk RNA-seq and scRNA-seq data to explore diverse cell death patterns and develop a programmed cell death-related relapse prediction model in pediatric B-ALL
2025-02-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86148-y
PMID:39955305
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研究论文 | 本研究通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,探索了儿童B细胞急性淋巴细胞白血病中多种程序性细胞死亡模式,并开发了与复发相关的预测模型 | 首次系统整合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据分析儿童B-ALL中16种程序性细胞死亡模式,并构建了基于7个关键基因的复发预测模型 | NA | 识别程序性细胞死亡相关生物标志物并开发儿童B-ALL复发预测模型 | 儿童B细胞急性淋巴细胞白血病患者 | 生物信息学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | RNA-seq, scRNA-seq, Cox回归分析 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
9246 | 2025-10-07 |
B-cell signatures characterize the immune landscape and predict LUAD prognosis via the integration of scRNA-seq and bulk RNA-seq
2025-02-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-89213-8
PMID:39953119
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,构建基于B细胞特征的肺腺癌预后风险模型 | 首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据识别B细胞特征基因,构建肺腺癌预后风险模型 | 研究基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步实验验证 | 阐明B细胞在肺腺癌中的作用并构建预后预测模型 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | LASSO回归模型 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的4个数据集(GSE164983, GSE50081, GSE37745, GSE30219)和TCGA-LUAD数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
9247 | 2025-10-07 |
B-cell interleukin 1 receptor 1 modulates the female adipose tissue immune microenvironment during aging
2025-Feb-13, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae219
PMID:39378334
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研究论文 | 本研究探讨B细胞中IL-1β信号通路在衰老过程中对雌性脂肪组织免疫微环境的调控作用 | 首次揭示B细胞特异性IL-1受体1在雌性衰老脂肪组织免疫调节中的性别特异性作用机制 | 研究主要聚焦于雌性模型,性别差异机制的全面解析尚不充分 | 阐明IL-1β-B细胞信号通路在衰老相关脂肪组织炎症中的作用 | 衰老小鼠内脏白色脂肪组织及其免疫细胞 | 免疫学 | 衰老相关代谢疾病 | 单细胞RNA测序,基因敲除技术 | B细胞特异性Il1r1敲除小鼠模型 | 基因表达数据,细胞比例数据 | 未明确样本数量,使用BKO小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9248 | 2025-10-07 |
Glioblastoma Cortical Organoids Recapitulate Cell-State Heterogeneity and Intercellular Transfer
2025-Feb-07, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-23-1336
PMID:39373549
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研究论文 | 本研究利用胶质母细胞瘤皮质类器官模型,揭示了肿瘤细胞与非恶性细胞间广泛的mRNA和GFP转移现象 | 相比匹配的胶质瘤球模型,GBM皮质类器官更准确地重现了患者肿瘤中恶性细胞状态的多样性和表达程序,并首次系统观察到细胞间广泛的转录本转移 | 模型系统仍为体外类器官,可能无法完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性 | 建立更真实的胶质母细胞瘤微环境模型,研究肿瘤细胞与非恶性细胞间的相互作用 | 胶质母细胞瘤皮质类器官中的恶性细胞和神经胶质细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9249 | 2025-10-07 |
Multimodal Profiling of Peripheral Blood Identifies Proliferating Circulating Effector CD4+ T Cells as Predictors for Response to Integrin α4β7-Blocking Therapy in Inflammatory Bowel Disease
2025-Feb, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.09.021
PMID:39343250
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研究论文 | 通过多模态分析外周血免疫特征,识别增殖性循环效应CD4+T细胞作为炎症性肠病患者对整合素α4β7阻断治疗反应的预测标志物 | 首次整合多组学数据识别出对vedolizumab治疗无应答者的特异性T细胞特征,并建立机器学习预测模型 | 样本量相对有限,需要在更大队列中验证预测模型的普适性 | 寻找炎症性肠病生物治疗反应的可靠预测标志物 | 接受vedolizumab治疗的炎症性肠病患者外周血样本 | 生物医学 | 炎症性肠病 | 质谱流式细胞术,单细胞RNA测序,单细胞BCR/TCR测序,血清蛋白质组学,多参数流式细胞术 | 机器学习 | 单细胞多组学数据 | 2个前瞻性队列的炎症性肠病患者 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞BCR/TCR测序,质谱流式细胞术,蛋白质组学 | NA | NA |
9250 | 2025-10-07 |
Matrix stiffness regulates mitochondria-lysosome contacts to modulate the mitochondrial network, alleviate the senescence of MSCs
2025-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13746
PMID:39353686
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研究论文 | 本研究探讨基质硬度通过调控线粒体-溶酶体接触影响间充质干细胞衰老的机制 | 首次揭示基质硬度通过调控M-L接触影响线粒体网络和功能进而导致MSC衰老的分子机制 | 未明确M-L接触调控线粒体稳态的具体信号通路 | 探究基质硬度如何通过调控线粒体-溶酶体接触影响间充质干细胞衰老 | 人间充质干细胞 | 细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序,原子力显微镜 | NA | 基因表达数据,力学性能数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9251 | 2025-10-07 |
Maternal infection with SARS-CoV-2 during early pregnancy induces hypoxia at the maternal-fetal interface
2025-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13749
PMID:39375953
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研究论文 | 本研究探讨了孕早期SARS-CoV-2感染对母胎界面缺氧状态的影响 | 首次发现孕早期SARS-CoV-2感染会诱导母胎界面缺氧并伴随代谢异常,且这种影响随孕周增加而逐渐缓解 | 样本量有限,长期影响仍需进一步研究 | 探究SARS-CoV-2感染对母胎界面的影响机制 | 孕早期感染SARS-CoV-2孕妇的胎盘样本 | 病理学 | COVID-19 | 免疫荧光,免疫组化,单细胞RNA测序,代谢组学测序 | NA | 组织样本,基因表达数据,代谢数据 | 孕6-8周和12-16周孕妇胎盘样本 | NA | 单细胞RNA测序,代谢组学测序 | NA | NA |
9252 | 2025-10-07 |
The role of fibroblast in chronic rhinosinusitis with nasal polyps: a key player in the inflammatory process
2025-Feb, Expert review of clinical immunology
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/1744666X.2024.2414774
PMID:39378160
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综述 | 本文综述了鼻息肉来源成纤维细胞在慢性鼻-鼻窦炎伴鼻息肉发病机制中的关键作用 | 强调了成纤维细胞在触发和加剧炎症反应中的新作用,并利用单细胞RNA测序技术探索其异质性和功能机制 | 成纤维细胞靶向治疗的临床开发仍面临挑战 | 阐明成纤维细胞在CRSwNP发病机制中的具体作用机制 | 鼻息肉来源成纤维细胞(NPDFs) | 病理学 | 慢性鼻-鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序 | NA | 文献数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9253 | 2025-10-07 |
Extraembryonic mesoderm cells derived from human embryonic stem cells rely on Wnt pathway activation
2025-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13761
PMID:39385268
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研究论文 | 本研究开发了一种通过激活Wnt通路从人primed胚胎干细胞分化产生胚外中胚层细胞及其后续间充质干细胞的方案 | 首次证明人primed胚胎干细胞可分化为胚外中胚层细胞并产生具有特定分化潜能的间充质干细胞 | 未明确说明样本数量和研究规模 | 探索人primed胚胎干细胞向胚外中胚层细胞分化的可能性及其后续发育潜能 | 人primed胚胎干细胞、胚外中胚层细胞、间充质干细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞转录组分析、免疫染色分析、细胞分选、三维分化培养 | NA | 转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9254 | 2025-10-07 |
Evidence for a lipofibroblast-to-Cthrc1 + myofibroblast reversible switch during the development and resolution of lung fibrosis in young mice
2025-Feb, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00482-2023
PMID:39401861
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研究论文 | 本研究通过遗传谱系追踪和单细胞转录组学揭示了年轻小鼠肺纤维化过程中脂成纤维细胞与Cthrc1+肌成纤维细胞之间的可逆转换机制 | 首次发现活化的肌成纤维细胞包含四个具有不同促肺泡生成和促纤维化特征的亚群,并证实脂成纤维细胞特征高的细胞群在纤维化发生和消退过程中分别作为起源和归宿 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据仅通过数据挖掘获得,需要进一步实验验证 | 解析肺纤维化过程中活化肌成纤维细胞的异质性及其在纤维化消退过程中的分化轨迹 | 年轻小鼠肺组织及人类特发性肺纤维化数据集 | 单细胞生物学 | 肺纤维化 | 遗传谱系追踪, 单细胞转录组学, 数据挖掘, 类器官培养 | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | 小鼠模型和人类IPF数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9255 | 2025-10-07 |
Myeloid Mir34a suppresses colitis-associated colon cancer: characterization of mediators by single-cell RNA sequencing
2025-Feb, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-024-01380-9
PMID:39425000
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了髓系细胞中Mir34a缺失通过调控巨噬细胞极化状态抑制结肠炎相关结肠癌的机制 | 首次在体内证明髓系特异性Mir34a通过维持巨噬细胞M1样状态发挥肿瘤抑制作用,并发现新的炎症性CAC细胞亚型 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 阐明髓系细胞中Mir34a在结肠炎相关结肠癌中的肿瘤抑制机制 | 髓系特异性Mir34a敲除小鼠的结肠炎相关结肠癌模型 | 单细胞测序 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9256 | 2025-10-07 |
Aging alters the effect of adiponectin receptor signaling on bone marrow-derived mesenchymal stem cells
2025-Feb, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14390
PMID:39462849
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研究论文 | 本研究探讨衰老如何改变脂联素受体信号对骨髓间充质干细胞的影响 | 首次揭示衰老通过改变脂联素受体表达和下游信号通路激活差异,逆转脂联素受体激动剂对骨再生的治疗效果 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类样本中验证 | 阐明衰老对脂联素受体信号在骨稳态和骨折修复中作用的调节机制 | 年轻和老年小鼠的骨髓间充质干细胞 | 干细胞生物学 | 骨质疏松 | 单细胞测序, 体内染色 | NA | 基因表达数据, 蛋白表达数据 | 年轻和老年小鼠骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9257 | 2025-10-07 |
Sensory neuroimmune signaling in the pathogenesis of Stevens-Johnson syndrome and toxic epidermal necrolysis
2025-Feb, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.10.015
PMID:39481654
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研究论文 | 本研究探讨了感觉神经免疫信号在史蒂文斯-约翰逊综合征和中毒性表皮坏死松解症发病机制中的作用 | 首次揭示CGRP-RAMP1轴通过HCN2离子通道增强CD8+T细胞IL-15/IL-18受体表达和细胞毒性,阐明神经元素在皮肤炎症中的调控机制 | 未明确不同触发药物对神经免疫信号通路的影响差异 | 探究SJS/TEN发病过程中的神经免疫调节机制 | 健康对照和SJS/TEN患者的循环CD8+T细胞及皮肤组织 | 免疫学 | 史蒂文斯-约翰逊综合征/中毒性表皮坏死松解症 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,ELISA,LEGENDplex,免疫荧光染色,钙成像,Smart-seq,3D皮肤模型 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,图像数据 | 健康对照和SJS/TEN患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9258 | 2025-10-07 |
From metabolomics to therapeutics: identifying causal metabolites and potential drugs for the treatment of osteoarthritis
2025-Feb, Inflammopharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s10787-024-01594-w
PMID:39488818
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研究论文 | 通过代谢组学孟德尔随机化研究识别骨关节炎的因果代谢物和潜在治疗靶点 | 首次采用大规模代谢组学孟德尔随机化方法系统识别与骨关节炎因果相关的血液代谢物 | 研究基于欧洲人群数据,结果可能不适用于其他族裔群体 | 识别骨关节炎的因果代谢物和潜在治疗靶点 | 骨关节炎患者和健康对照人群 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 孟德尔随机化, 全基因组关联研究, 单细胞测序, 蛋白质相互作用网络分析 | NA | 基因组数据, 代谢组数据, 基因表达数据 | 总计231,625例病例和1,218,499例对照 | NA | 全基因组关联分析, 单细胞测序 | NA | NA |
9259 | 2025-10-07 |
p53 mutation biases squamocolumnar junction progenitor cells towards dysplasia rather than metaplasia in Barrett's oesophagus
2025-Jan-17, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332095
PMID:39353725
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研究论文 | 本研究探讨p53突变在Barrett食管向食管腺癌进展过程中对贲门祖细胞命运和功能的影响 | 首次揭示p53突变通过Notch信号通路激活抑制干细胞分化,直接导致发育异常而非通过化生阶段 | 研究基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明p53突变在Barrett食管癌变过程中的作用机制 | 贲门祖细胞(Cck2r+ cardia progenitor cells) | 分子病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序,谱系追踪,类器官培养,原位移植 | L2-IL1β小鼠模型 | 基因表达数据,病理图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9260 | 2025-10-07 |
Development of the TP53 mutation associated hypopharyngeal squamous cell carcinoma prognostic model through bulk multi-omics sequencing and single-cell sequencing
2025 Jan-Feb, Brazilian journal of otorhinolaryngology
IF:1.7Q2
DOI:10.1016/j.bjorl.2024.101499
PMID:39341197
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研究论文 | 本研究基于TP53突变构建了下咽鳞状细胞癌预后模型,并通过单细胞测序验证了模型相关基因的表达特征 | 首次结合bulk多组学测序和单细胞测序技术,构建基于TP53突变的下咽鳞状细胞癌预后风险评分模型 | 研究主要依赖公共数据库数据,缺乏独立的前瞻性验证队列 | 构建基于TP53突变的下咽鳞状细胞癌预后预测模型 | 下咽鳞状细胞癌患者样本 | 生物信息学 | 下咽鳞状细胞癌 | bulk多组学测序, 单细胞测序, GSEA, Cox分析, LASSO分析 | 预后风险评分模型 | 基因组突变数据, 转录组数据, 单细胞测序数据 | 来自TCGA和6个GEO数据集的下咽鳞状细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |