单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
9241 2024-08-29
Distinct granzyme k expression in immune cells: a single-cell rna-seq meta-analysis
2024-Sep, Genes & genomics IF:1.6Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序元分析,探讨了GZMK在不同免疫细胞类型中的表达模式 首次通过单细胞RNA测序元分析揭示了GZMK在不同免疫细胞和组织中的独特表达调控机制 NA 揭示GZMK在不同免疫细胞类型中的表达模式 GZMK在不同免疫细胞类型中的表达 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA 涉及成熟T细胞、NK细胞、B细胞和NKT细胞等多种免疫细胞类型
9242 2024-08-29
Identification of miRNA signature in cancer-associated fibroblast to predict recurrent prostate cancer
2024-Sep, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,建立了一个与癌症相关成纤维细胞(CAFs)相关的miRNA模型,用于评估前列腺癌的预后差异、肿瘤微环境和抗癌药物筛选 首次通过单细胞转录组学分析,确定了89个与CAFs相关的mRNAs,并建立了一个基于9个CAFs相关miRNA的预后模型,用于预测前列腺癌的生化复发 研究主要基于数据库中的数据进行分析,未涉及大规模的临床试验验证 建立一个与CAFs相关的miRNA模型,用于个性化和精准治疗前列腺腺癌患者 前列腺癌相关成纤维细胞(CAFs)及其相关的miRNAs 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序(buRNA-seq) 支持向量机(SVM) RNA测序数据 34名前列腺癌患者
9243 2024-08-29
Inhalable Stem Cell Exosomes Promote Heart Repair After Myocardial Infarction
2024-Aug-27, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 本文报道了一种通过吸入方式递送干细胞衍生的外泌体(SCENT)促进心肌梗死后心脏修复的非侵入性和可重复方法 首次提出通过吸入方式递送外泌体进行心脏修复,并使用单细胞RNA测序探索其作用机制 研究主要在动物模型中进行,临床应用的可行性和安全性需要进一步验证 验证SCENT治疗急性心肌梗死损伤的可行性、有效性和安全性,并探索其作用机制 C57BL/6小鼠和猪的心肌梗死模型 NA 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 图像 C57BL/6小鼠和猪的心肌梗死模型
9244 2024-08-29
Single-cell RNA-sequencing Analysis Reveals the Promoting Role of the Hedgehog Pathway in Epithelial Cells during Cervical Cancer Progression
2024-Aug-26, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析探讨了Hedgehog通路在宫颈癌进展中对上皮细胞的促进作用 发现了Hedgehog通路在STYK1+和TP73+上皮细胞亚型中的异常激活,并揭示了其在宫颈癌上皮细胞增殖和病毒过程中的作用 NA 全面分析Hedgehog通路在宫颈癌上皮细胞中的激活机制及其对肿瘤进展的影响 宫颈癌上皮细胞中的Hedgehog通路 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) NA 基因表达数据 9种主要细胞亚群
9245 2024-08-29
Comprehensive Analysis and Experimental Validation of TLL2 as a Potential New Prognostic Biomarker Associated with Immune Infiltration in Lung Adenocarcinoma
2024-Aug-26, Recent patents on anti-cancer drug discovery IF:2.5Q3
研究论文 本研究全面分析并实验验证了TLL2作为肺腺癌中与免疫浸润相关的潜在新型预后生物标志物 首次详细探讨了TLL2在肺腺癌中的表达与免疫浸润、肿瘤干细胞指数及药物敏感性的关联 NA 旨在深入分析TLL2在肺腺癌中的功能及其作为预后标志物的潜力 TLL2在肺腺癌中的表达及其与临床症状、预后和免疫浸润的关系 数字病理学 肺腺癌 实时定量PCR NA 基因表达数据 使用了TCGA数据库中的数据以及GSE87340和细胞系样本
9246 2024-08-29
Endothelial cell heterogeneity in colorectal cancer: tip cells drive angiogenesis
2024-Aug-22, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1
研究论文 本研究旨在揭示结直肠癌(CRC)中内皮细胞(ECs)的异质性及其在血管生成中的关键作用,特别是尖端细胞的作用 通过单细胞RNA测序分析ECs,发现CRC中的ECs主要表现为增强的血管生成和减少的抗原呈递,这种表型转变主要由尖端细胞驱动 NA 揭示结直肠癌中内皮细胞的异质性及其在血管生成中的作用 结直肠癌中的内皮细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA
9247 2024-08-29
Dual nature of type I interferon responses and feedback regulations by SOCS1 dictate malaria mortality
2024-Aug-22, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析、流式细胞术和数学建模,探讨了I型干扰素(IFN-I)在对抗疟原虫感染中的双重作用及其调控机制。 首次采用比较方法,利用两种疟原虫模型研究IFN-I反应的潜在机制,并揭示了SOCS1在IFN-α/β动态中的作用。 NA 探讨I型干扰素在疟疾感染中的作用及其调控机制。 I型干扰素(IFN-I)在疟原虫感染中的作用及其调控机制。 免疫学 疟疾 单细胞RNA测序分析(scRNA-seq)、流式细胞术 数学模型 RNA 涉及P. yoelii 17XL和P. berghei ANKA两种疟原虫模型
9248 2024-08-29
Exploration of bacterial lipopolysaccharide-related genes signature based on T cells for predicting prognosis in colorectal cancer
2024-Aug-06, Aging
研究论文 本研究通过分析细菌脂多糖(LPS)相关基因与免疫细胞的关系,探索了基于T细胞的LPS相关基因特征,用于预测结直肠癌(CRC)的预后 首次建立了基于T细胞的LPS相关基因风险特征,用于预测CRC的预后和免疫治疗效果 研究受限于技术手段,对微生物在CRC中的影响尚未完全理解 探索新的生物标志物,用于预测结直肠癌的预后 结直肠癌(CRC)的预后和免疫治疗 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 基因数据 TCGA-COAD队列和GSE39582队列
9249 2024-08-29
NNMT switches the proangiogenic phenotype of cancer-associated fibroblasts via epigenetically regulating ETS2/VEGFA axis
2024-Aug, Oncogene IF:6.9Q1
研究论文 本研究探讨了尼古丁酰胺N'-甲基转移酶(NNMT)通过表观遗传调控ETS2/VEGFA轴在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中促进血管生成的机制 首次揭示了NNMT在癌症相关成纤维细胞(CAFs)中通过表观遗传重编程ETS2-VEGFA信号轴促进血管生成的作用 研究主要基于单细胞RNA测序和临床样本分析,未来需更多体内外实验验证 阐明NNMT在OSCC中促进血管生成的表观遗传分子调控网络 NNMT在癌症相关成纤维细胞中的作用及机制 数字病理学 口腔鳞状细胞癌 单细胞RNA测序 NA RNA 多个临床样本
9250 2024-08-29
Egr1 regulates regenerative senescence and cardiac repair
2024-Aug, Nature cardiovascular research IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过蛋白质组学和单细胞RNA测序技术,揭示了成年小鼠心脏中再生性衰老的多组学特征,并探讨了其在新生小鼠心脏再生和成年小鼠心脏修复中的作用 首次报道了Egr1作为再生性衰老的调控因子,并揭示了其在新生和成年小鼠心脏再生中的具体作用机制 NA 探讨再生性衰老在心脏再生中的分子特征和功能益处 成年和新生小鼠心脏 NA 心血管疾病 蛋白质组学, 单细胞RNA测序 NA 蛋白质, RNA 成年和新生小鼠心脏样本
9251 2024-08-29
APOE-NOTCH axis governs elastogenesis during human cardiac valve remodeling
2024-Aug, Nature cardiovascular research IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析人类胎儿心脏瓣膜,揭示了APOE-NOTCH轴在瓣膜重塑过程中弹性蛋白生成的调控作用 首次发现APOE在胎儿心脏瓣膜间质细胞中调控弹性蛋白生成,并通过NOTCH2信号通路介导这一过程 研究主要集中在胎儿瓣膜,未来需进一步探讨在成人瓣膜中的作用 探讨APOE和NOTCH在人类心脏瓣膜重塑中调控弹性蛋白生成的机制 人类胎儿心脏瓣膜间质细胞和内皮细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 涉及人类胎儿心脏瓣膜的单细胞RNA测序数据
9252 2024-08-29
Varied cellular abnormalities in thin vs. normal endometrium in recurrent implantation failure by single-cell transcriptomics
2024-Jul-31, Reproductive biology and endocrinology : RB&E IF:4.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学方法,比较了薄型和正常厚度子宫内膜在反复植入失败中的细胞异常情况 首次系统地研究了薄型和正常厚度子宫内膜在反复植入失败中的分子特征、细胞相互作用和结构变化 需要进一步的研究来验证这些发现并将其转化为临床应用 阐明薄型和正常厚度子宫内膜在反复植入失败中的差异 反复植入失败患者和生育能力正常个体的子宫内膜 数字病理学 生殖系统疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组 TE-RIF组3人,NE-RIF组2人,对照组3人
9253 2024-08-29
Single-cell RNA-Seq analysis reveals cell subsets and gene signatures associated with rheumatoid arthritis disease activity
2024-Jul-02, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析外周血单个核细胞,揭示了与类风湿性关节炎疾病活动相关的细胞亚群和细胞类型特异性基因特征 本研究首次揭示了IFN诱导的跨膜3过表达的IFN激活单核细胞亚群,并观察到疾病活动水平不同的患者中特定细胞亚群的变化 NA 旨在通过单细胞RNA测序技术,识别与类风湿性关节炎疾病活动相关的细胞亚群和基因特征 外周血单个核细胞 数字病理学 类风湿性关节炎 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 36名个体(18名类风湿性关节炎患者和18名匹配的对照组)
9254 2024-08-29
Machine learning for the identification of neoantigen-reactive CD8 + T cells in gastrointestinal cancer using single-cell sequencing
2024-Jul, British journal of cancer IF:6.4Q1
研究论文 本文通过单细胞转录组测序技术,开发了一种基于26个基因的机器学习模型,用于识别胃肠道癌症中的新抗原反应性CD8+ T细胞。 本文创新性地利用机器学习模型快速识别新抗原反应性T细胞及其对应的T细胞受体,加速了新抗原反应性T细胞的治疗应用。 NA 开发一种快速识别胃肠道癌症中新抗原反应性CD8+ T细胞的方法。 胃肠道癌症中的新抗原反应性CD8+ T细胞及其T细胞受体。 机器学习 胃肠道癌症 单细胞测序 机器学习模型 转录组数据 数千个肿瘤浸润淋巴细胞
9255 2024-08-29
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Dysregulated POSTN+WNT5A+ Fibroblast Subclusters in Prurigo Nodularis
2024-Jul, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了28,695个病灶和非病灶性痒疹结节(PN)细胞,揭示了PN中失调的POSTN+WNT5A+成纤维细胞亚群 首次揭示了PN中POSTN+WNT5A+成纤维细胞亚群的失调,并发现其与癌症相关成纤维细胞的关联 NA 探究痒疹结节(PN)的发病机制 痒疹结节(PN)中的成纤维细胞和肌成纤维细胞 数字病理学 皮肤病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 28,695个病灶和非病灶性PN细胞
9256 2024-08-29
SLC45A3 Serves as a Potential Therapeutic Biomarker to Attenuate White Matter Injury After Intracerebral Hemorrhage
2024-Jun, Translational stroke research IF:3.8Q2
研究论文 本研究通过基因共表达网络分析和单细胞RNA测序,确定SLC45A3基因在脑出血后白质损伤中的作用,并验证其作为治疗靶点的潜力。 首次确定SLC45A3基因在脑出血后白质损伤中的关键作用,并提出其作为治疗靶点的可能性。 研究主要基于小鼠模型,需要进一步的人体临床试验验证。 探讨脑出血后白质损伤的分子机制及潜在治疗靶点。 脑出血后的白质损伤及SLC45A3基因的功能。 数字病理学 脑血管疾病 基因共表达网络分析、单细胞RNA测序、扩散张量成像 NA 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 两个数据集(GSE24265和GSE125512)及单细胞RNA测序数据(GSE167593)
9257 2024-08-29
Human Pluripotent Stem Cells Derived Endothelial Cells Repair Choroidal Ischemia
2024-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文研究了从人多能干细胞衍生的内皮细胞修复脉络膜缺血的能力 首次证明了人多能干细胞衍生的内皮细胞能够整合到脉络膜血管中,并改善动物模型的视觉功能 NA 探索人多能干细胞衍生的内皮细胞在修复脉络膜缺血中的应用 人多能干细胞衍生的内皮细胞及其在脉络膜缺血修复中的作用 NA 年龄相关性黄斑变性,视网膜色素变性,病理性近视 单细胞RNA测序 NA NA 涉及大鼠模型
9258 2024-08-29
Unbiased Single-Cell Sequencing of Hematopoietic and Immune Cells from Aplastic Anemia Reveals the Contributors of Hematopoiesis Failure and Dysfunctional Immune Regulation
2024-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过无偏差的单细胞RNA测序技术,构建了再生障碍性贫血患者的细胞图谱和微环境相互作用,揭示了造血功能衰竭和免疫调节功能障碍的贡献者。 发现了新的KIR CD8调节性T细胞亚群,并揭示了其参与免疫稳态的机制,以及铁死亡在造血干细胞破坏中的作用。 NA 揭示再生障碍性贫血的造血功能衰竭和免疫调节功能障碍的机制。 再生障碍性贫血患者的造血和免疫细胞。 数字病理学 血液疾病 单细胞RNA测序 NA RNA-seq NA
9259 2024-08-29
Targeting the cGAS-STING Pathway Inhibits Peripheral T-cell Lymphoma Progression and Enhances the Chemotherapeutic Efficacy
2024-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究探讨了cGAS-STING通路在周围T细胞淋巴瘤(PTCL)进展中的作用及其机制 发现cGAS抑制剂能抑制肿瘤生长并损害DNA损伤修复,CLK1抑制能增强对cGAS抑制剂的敏感性 NA 研究cGAS-STING通路在PTCL中的作用,以优化治疗策略 周围T细胞淋巴瘤(PTCL) NA 淋巴瘤 单细胞RNA测序 NA RNA NA
9260 2024-08-29
Highly Accurate Estimation of Cell Type Abundance in Bulk Tissues Based on Single-Cell Reference and Domain Adaptive Matching
2024-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文介绍了一种名为SCROAM的新型计算方法,用于基于单细胞参考和域自适应匹配,准确估计大量组织中的细胞类型丰度 SCROAM方法通过将单细胞和大量RNA测序数据转换到共享特征空间,有效消除了潜在空间中的分布差异,从而提高了细胞类型识别的准确性 NA 旨在提高对复杂组织细胞组成的识别准确性,以更好地理解疾病发病机制、早期诊断和预防 单细胞和大量RNA测序数据,以及小鼠脊髓组织 数字病理学 肝癌,胶质母细胞瘤 RNA测序 NA RNA测序数据 涉及小鼠脊髓组织和多种癌症组织
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