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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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9201 | 2025-10-07 |
Fibroblasts fluctuating between mesenchyme and epithelium are involved in hair follicle mesenchyme development
2025-Jun, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102006
PMID:40271513
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组织化学分析,揭示了在新生小鼠皮肤中成纤维细胞在间充质和上皮间波动参与毛囊间充质发育的过程 | 首次发现表达特定标记的成纤维细胞具有向上皮细胞转换的能力,并证实这些细胞对毛囊真皮干细胞发育的重要贡献 | 研究仅限于小鼠模型,人类皮肤中的类似机制尚未验证 | 阐明上皮-间充质/间充质-上皮转换在皮肤发育中的具体作用和功能 | 新生小鼠皮肤组织 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学分析 | NA | 基因表达数据, 组织图像数据 | 小鼠皮肤样本(包括胚胎期16.5天和老年小鼠) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9202 | 2025-10-07 |
Emerging clinical applications of single-cell RNA sequencing in oncology
2025-May, Nature reviews. Clinical oncology
DOI:10.1038/s41571-025-01003-3
PMID:40021788
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综述 | 本文总结了单细胞RNA测序技术在肿瘤学中的临床应用前景 | 重点关注单细胞RNA测序在肿瘤临床相关性方面的发现,并系统归纳了四大研究方向 | 讨论了单细胞RNA测序技术本身的局限性 | 探索单细胞RNA测序在肿瘤临床应用的潜力 | 癌症患者的肿瘤样本 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 数百项研究涉及的肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9203 | 2025-10-07 |
Chemokine (C-C Motif) Ligand 2 Expressing Adventitial Fibroblast Expansion During Loeys-Dietz Syndrome Aortic Aneurysm Formation
2025-May, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322069
PMID:40109260
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了Loeys-Dietz综合征主动脉瘤形成过程中外膜成纤维细胞向促炎状态转变的关键作用 | 首次在LDS主动脉瘤中发现外膜成纤维细胞而非平滑肌细胞的表型调节是主要病理机制,并鉴定出促炎性成纤维细胞亚群 | 样本量相对有限(人类样本n=5 LDS和n=2对照),需要更大规模研究验证 | 阐明Loeys-Dietz综合征主动脉瘤形成的细胞状态转变和分子机制 | 小鼠LDS模型和人类LDS手术标本的主动脉根/升主动脉组织 | 单细胞转录组学 | 主动脉瘤 | 单细胞RNA测序, RNA原位杂交, 免疫荧光, 免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | >30,000个细胞(来自小鼠和人类样本) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9204 | 2025-10-07 |
Decoding the role of lipid metabolism in NSCLC: From macrophage subtype identification to prognostic model development
2025-Apr-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500124
PMID:40277347
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序分析,识别了与非小细胞肺癌进展相关的脂质相关巨噬细胞标志基因,并开发了预后风险评分模型 | 首次系统识别脂质相关巨噬细胞亚型及其关键标志基因S100A10、HLA-DMB和CTSL,并构建了高精度的NSCLC预后模型 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步临床验证 | 探索脂质代谢在非小细胞肺癌肿瘤微环境中的作用机制并开发预后预测工具 | 非小细胞肺癌患者样本和肿瘤微环境中的巨噬细胞 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 生存分析, ROC曲线分析, 体内实验 | 预后风险评分模型 | RNA测序数据, 突变数据 | TCGA和GEO数据库中的NSCLC患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
9205 | 2025-10-07 |
Local DIO2 Elevation Is an Adaption in Malformed Cerebrovasculature
2025-Apr-25, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325857
PMID:40130314
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研究论文 | 本研究揭示了DIO2介导的甲状腺激素信号通路在脑血管畸形中的适应性作用及其治疗潜力 | 首次发现脑血管畸形中局部DIO2升高是一种适应性机制,并阐明FOXK1-PI3K-Akt-mTOR信号轴调控DIO2转录及Pgc1a介导的线粒体功能修复机制 | 研究主要基于动物模型,人类样本验证仍需扩展 | 探究甲状腺激素信号在脑血管畸形病理过程中的作用及治疗潜力 | 人类脑血管畸形样本(脑海绵状血管畸形和脑动静脉畸形)及相应基因修饰小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 脑血管畸形 | 单细胞转录组分析、腺相关病毒介导的基因操作、药物干预 | 基因敲除小鼠模型(Pdcd10内皮特异性敲除、KrasG12D突变) | 单细胞转录组数据、组织切片 | 人类脑血管畸形单细胞样本及多种基因修饰小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9206 | 2025-10-07 |
Srsf3-Dependent APA Drives Macrophage Maturation and Limits Atherosclerosis
2025-Apr-25, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.326111
PMID:40160097
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研究论文 | 本研究揭示了Srsf3通过调控选择性多聚腺苷酸化促进巨噬细胞成熟并抑制动脉粥样硬化的新机制 | 首次发现Srsf3依赖性APA通过调控线粒体翻译驱动巨噬细胞成熟,揭示了3'UTR长度变化在动脉粥样硬化中的新作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究单核细胞向巨噬细胞转化的调控机制及其在动脉粥样硬化中的作用 | Apoe-/-小鼠动脉斑块中的单核/巨噬细胞,人类动脉粥样硬化斑块 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 3'端测序, 流式细胞术, 组织病理分析, 多核糖体分析, 代谢组学 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据, bulk RNA测序数据, 流式细胞数据, 代谢组数据 | Apoe-/-小鼠动脉斑块,人类动脉粥样硬化斑块样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 3'端测序 | NA | NA |
9207 | 2025-10-07 |
Effects of Bacterial Infections under Heatwaves on Chinese Soft-Shelled Turtles and Their Single-Cell Transcriptomic Landscapes
2025-Apr-24, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.4c09111
PMID:40274607
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研究论文 | 本研究通过整合中华鳖外周血单细胞转录组、行为和生理指标,探讨细菌感染和热浪双重胁迫对中华鳖的影响 | 首次在中华鳖中结合单细胞转录组分析与行为生理指标,揭示热浪和细菌感染双重胁迫下的免疫响应机制 | 研究样本量有限,未涉及长期暴露效应评估 | 探究热浪和细菌感染双重胁迫对中华鳖免疫响应和生理状态的影响 | 中华鳖(Pelodiscus sinensis) | 单细胞转录组学 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序 | PCA细胞聚类分析 | 单细胞转录组数据、行为数据、生理指标 | 四个处理组的中华鳖样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9208 | 2025-10-07 |
Nuclear IL-1α Triggers Pyroptosis in Porcine Intramuscular Preadipocytes
2025-Apr-24, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c00112
PMID:40275457
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现猪肌内脂肪前体细胞在成脂分化过程中表达炎症基因IL-1α,并揭示核定位IL-1α通过IRF2-NOCT-ROS通路触发细胞焦亡的新机制 | 首次发现核定位IL-1α通过IRF2-NOCT-ROS通路调控猪肌内脂肪前体细胞焦亡的新功能 | 研究仅针对猪肌内脂肪前体细胞,未验证其他物种或细胞类型中该机制是否保守 | 探究核定位IL-1α在猪肌内脂肪前体细胞中的生物学功能及其调控机制 | 猪肌内脂肪前体细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9209 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing revealed the immunophenotypic features of macrophages in cardiac transplants and uncovered Lgals9 promoted their polarization toward the M2b subtype
2025-Apr-23, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiaf009
PMID:39835675
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了心脏移植中巨噬细胞的免疫表型特征,并发现Lgals9促进其向M2b亚型极化 | 发现表达心肌收缩相关基因的新型'Myoz2+巨噬细胞'亚群,揭示Saa3+巨噬细胞的分化轨迹,首次证实Lgals9在心脏移植后表达下调并能诱导巨噬细胞向M2b表型极化 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体样本中验证 | 探索心脏移植中巨噬细胞的基因组特征及Galectin-9的调控作用 | 小鼠心脏移植模型中的巨噬细胞 | 单细胞基因组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, Western blotting, 流式细胞术, ELISA | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 小鼠心脏移植模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9210 | 2025-10-07 |
Resolving the spatial organization of fetal liver hematopoiesis by SeekSpace
2025-Apr-22, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-025-00234-0
PMID:40261503
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研究论文 | 本研究利用SeekSpace空间转录组平台解析胚胎期肝脏造血过程中造血干细胞和祖细胞的空间分布特征 | 首次使用高分辨率单核空间转录组技术揭示胎儿肝脏中不同造血祖细胞群体的空间组织结构 | 研究仅聚焦于胚胎13.5天特定发育阶段,未涵盖整个胎儿肝脏发育过程 | 阐明胎儿肝脏造血过程中造血干细胞和祖细胞的空间分布规律 | 小鼠胚胎期肝脏中的造血干细胞、多能祖细胞和限制性祖细胞 | 空间转录组学 | NA | 单核空间转录组测序 | NA | 空间转录组数据 | 胚胎13.5天胎儿肝脏样本 | NA | 空间转录组学 | SeekSpace | 高分辨率单核空间转录组平台 |
9211 | 2025-10-07 |
Mutual Regulation of Cardiovascular and Hematopoietic Development
2025-Apr-22, Current cardiology reports
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s11886-025-02236-5
PMID:40261519
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综述 | 探讨心内膜造血作用的起源、意义及其在心脏发育和巨噬细胞形成中的关键作用 | 通过单细胞RNA测序发现心内膜细胞具有独立于已知造血器官的内在造血程序,并揭示其进化保守性 | NA | 研究心血管与造血系统发育的相互调控机制 | 心内膜细胞、组织驻留巨噬细胞、心脏发育过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、谱系追踪、转录组研究 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9212 | 2025-10-07 |
Detection of viral sequences at single-cell resolution identifies novel viruses associated with host gene expression changes
2025-Apr-22, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02614-y
PMID:40263451
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研究论文 | 开发了一种基于RdRP蛋白在单细胞分辨率下检测病毒序列的新方法 | 基于高度保守的RdRP蛋白开发了可在单细胞水平检测病毒序列的方法,突破了传统方法依赖参考基因组和无法保持单细胞分辨率的限制 | NA | 开发能够在单细胞分辨率下检测病毒序列并研究病毒与宿主基因表达关系的新方法 | 恒河猴外周血单个核细胞中的病毒序列 | 生物信息学 | 埃博拉病毒病 | 单细胞转录组测序,高通量测序 | NA | 单细胞转录组数据,批量转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
9213 | 2025-10-07 |
Multi-omics analysis constructs a novel neuroendocrine prostate cancer classifier and classification system
2025-Apr-22, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-96683-3
PMID:40263498
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研究论文 | 本研究通过多组学分析结合机器学习构建了新型神经内分泌前列腺癌分类器和分类系统 | 开发了NEP100模型作为首个基于多组学数据的神经内分泌前列腺癌分类器,并识别出四种具有独特生物学特征的NEPC亚型 | 样本量相对有限,需要更多独立队列验证模型的普适性 | 构建稳健的神经内分泌前列腺癌分类器并解决肿瘤内异质性问题 | 前列腺癌样本中的神经内分泌细胞 | 机器学习 | 前列腺癌 | 多组学分析,机器学习算法 | 随机森林 | 转录组数据,单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 70个样本,包含196,309个细胞(其中9%为神经内分泌细胞) | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
9214 | 2025-10-07 |
Sleep deprivation impacts the immunological milieu of epididymis leading to low sperm quality in rats
2025-Apr-22, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08091-y
PMID:40263515
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研究论文 | 本研究揭示睡眠剥夺通过破坏附睾免疫微环境导致精子质量下降的机制 | 首次结合孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序技术,系统阐明睡眠剥夺通过改变附睾免疫微环境影响精子质量的分子机制 | 研究仅使用大鼠模型,尚未在人类中进行直接验证;观察时间较短(5天睡眠剥夺) | 探究睡眠剥夺导致男性生殖功能障碍的潜在机制 | 10周龄雄性Sprague-Dawley大鼠 | 生殖医学 | 男性不育症 | 孟德尔随机化分析, bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 组织学分析 | 动物模型 | 基因表达数据, 组织学图像, 生理指标 | 大鼠实验组与对照组 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
9215 | 2025-10-07 |
Potential application of the bulk RNA sequencing in routine MPN clinics
2025-Apr-22, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-13947-x
PMID:40264064
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研究论文 | 本研究探讨了批量RNA测序在骨髓增殖性肿瘤常规临床诊疗中的潜在应用价值 | 首次系统评估批量RNA测序在MPN临床实践中识别基因突变和免疫特征的应用潜力 | 研究样本量有限,且包含来自公共数据库的回顾性数据 | 评估批量RNA测序在MPN临床诊疗中的应用价值 | 初诊MPN患者(包括真性红细胞增多症、原发性血小板增多症和原发性骨髓纤维化)的外周血和骨髓样本 | 生物信息学 | 骨髓增殖性肿瘤 | RNA测序, 微阵列 | 生物信息学分析方法 | 基因表达数据 | 初诊MPN患者样本及公共数据集[GSE26049, GSE2191] | NA | 批量RNA测序, 微阵列 | NA | NA |
9216 | 2025-10-07 |
Identifying PSIP1 as a critical R-loop regulator in osteosarcoma via machine-learning and multi-omics analysis
2025-Apr-22, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03775-1
PMID:40264164
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研究论文 | 本研究通过机器学习和多组学分析识别PSIP1作为骨肉瘤中关键的R-loop调控因子 | 首次构建R-loop基因预后评分模型(RGPSM),并通过单细胞RNA测序结合实验验证PSIP1在骨肉瘤进展中的关键作用 | NA | 探索R-loop在骨肉瘤发生发展中的作用机制 | 骨肉瘤患者样本和细胞系 | 机器学习 | 骨肉瘤 | RNA测序,单细胞RNA测序,机器学习 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 多个骨肉瘤队列数据集 | NA | RNA-seq,scRNA-seq | NA | NA |
9217 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals the mechanism of Realgar improvement on erythropoiesis in mice with myelodysplastic syndrome
2025-Apr-08, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03768-0
PMID:40200265
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示雄黄改善骨髓增生异常综合征小鼠红细胞生成的机制 | 首次在单细胞水平研究雄黄及其活性成分AsS对小鼠成红细胞的影响,揭示其调控红细胞分化的转录组机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 探究雄黄改善骨髓增生异常综合征贫血症状的作用机制 | 小鼠成红细胞和骨髓细胞 | 单细胞测序 | 骨髓增生异常综合征 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9218 | 2025-10-07 |
Amino Acid Metabolism Subtypes in Neuroblastoma Identifying Distinct Prognosis and Therapeutic Vulnerabilities
2025-Apr-04, Journal of proteome research
IF:3.8Q1
DOI:10.1021/acs.jproteome.4c00554
PMID:39442086
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研究论文 | 基于氨基酸代谢相关基因鉴定神经母细胞瘤的三种预后和治疗敏感性不同的亚型 | 首次在神经母细胞瘤中基于氨基酸代谢相关基因建立预后分型系统,并发现不同亚型对免疫治疗和化疗的敏感性差异 | NA | 探究氨基酸代谢与神经母细胞瘤预后的关联并建立分型系统 | 神经母细胞瘤患者 | 生物信息学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,基因表达分析 | NA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9219 | 2025-10-07 |
FABP5+ lipid-loaded macrophages process tumour-derived unsaturated fatty acid signal to suppress T-cell antitumour immunity
2025-Apr, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.09.029
PMID:39357545
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研究论文 | 本研究揭示了FABP5+脂质负载巨噬细胞通过处理肿瘤来源的不饱和脂肪酸信号抑制T细胞抗肿瘤免疫的机制 | 首次发现肿瘤细胞释放的长链不饱和脂肪酸通过FABP5-PPARγ信号通路激活巨噬细胞的免疫抑制功能 | 研究主要聚焦于肝细胞癌,该机制在其他肿瘤类型中的普适性需要进一步验证 | 探究脂质代谢如何增强肿瘤相关巨噬细胞的促肿瘤作用 | 小鼠和人类肝细胞癌肿瘤样本中的肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠和人类HCC肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9220 | 2025-10-07 |
Different inflammatory, fibrotic, and immunological signatures between pre-fibrotic and overt primary myelofibrosis
2025-Apr-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2024.285598
PMID:39385733
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析原发性骨髓纤维化不同阶段的骨髓细胞特征 | 首次在单细胞水平揭示前纤维化期和显性期原发性骨髓纤维化的炎症、纤维化和免疫特征差异 | 未发现PMF进展过程中的决定性细胞亚群 | 探究原发性骨髓纤维化进展过程中的细胞分子机制 | 骨髓穿刺样本中的造血细胞 | 单细胞组学 | 骨髓增殖性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 前纤维化PMF、显性PMF及其他MPN患者的骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |