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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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9181 | 2025-10-07 |
Spatial and Single-Cell Analyses Reveal Heterogeneity of DNAM-1 Receptor-Ligand Interactions That Instructs Intratumoral γδT-cell Activity
2025-Jan-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-1509
PMID:39514370
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研究论文 | 本研究通过空间和单细胞分析揭示DNAM-1受体-配体相互作用的异质性如何指导肿瘤内γδT细胞活性 | 首次系统揭示CD112/CD155表达比例通过调控DNAM-1受体表达影响γδT细胞功能分化的机制 | 研究主要聚焦神经母细胞瘤,在其他肿瘤类型中的普适性需要进一步验证 | 探究肿瘤细胞配体CD112和CD155如何通过DNAM-1受体调控γδT细胞活化 | 神经母细胞瘤肿瘤微环境中的γδT细胞和肿瘤细胞 | 单细胞生物学 | 神经母细胞瘤 | 空间转录组测序, 单细胞RNA测序, 空间代谢组学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 代谢组数据 | 神经母细胞瘤患者样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
9182 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals common interactions between follicle immune cells and granulosa cells in premature ovarian insufficiency patients†
2025-Jan-14, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioae157
PMID:39513542
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示早发性卵巢功能不全患者卵泡免疫细胞与颗粒细胞之间的相互作用 | 首次在POI患者中揭示单核细胞与颗粒细胞间VEGFA-FLT1相互作用的缺失及其与内质网和核糖体通路富集的关联 | 样本量较小(仅9名参与者),且仅分析不含卵丘细胞的首次穿刺卵泡 | 研究POI、正常卵巢储备和高龄产妇卵泡微环境特征,寻找潜在治疗靶点 | 接受体外受精或卵胞浆内单精子注射的POI、正常卵巢储备和高龄产妇患者的卵泡细胞 | 单细胞测序分析 | 早发性卵巢功能不全 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 9名女性(3名POI、3名正常、3名AMA),共87,323个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9183 | 2025-10-07 |
MobiChIP: a compatible library construction method of single-cell ChIP-seq based droplets
2025-Jan-13, Molecular omics
IF:3.0Q3
DOI:10.1039/d4mo00111g
PMID:39513632
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研究论文 | 开发了一种基于液滴的单细胞ChIP-seq文库构建方法MobiChIP | 开发了兼容现有测序平台的单细胞ChIP-seq文库构建方法,无需定制引物即可实现稳健的核小体扩增和灵活测序 | NA | 开发单细胞表观遗传分析工具以阐明表观遗传异质性 | 外周血单个核细胞(PBMCs)和不同组织或物种的样本 | 表观遗传学 | NA | 单细胞ChIP-seq, 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | 表观基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞ChIP-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | 基于液滴的单细胞ChIP-seq文库构建方法 |
9184 | 2025-10-07 |
Efficient Predictor for Immunotherapy Efficacy: Detecting Pan-Clones Effector Tumor Antigen-Specific T Cells in Blood by Nanoparticles Loading Whole Tumor Antigens
2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202409913
PMID:39498880
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研究论文 | 开发了一种通过纳米颗粒负载全肿瘤抗原检测血液中泛克隆效应肿瘤抗原特异性T细胞的方法,用于预测免疫治疗效果 | 首次使用纳米颗粒负载全细胞肿瘤抗原来激活和检测血液中的泛克隆ETASTs,将ETASTs与其他T细胞的差异转化为激活状态差异 | NA | 开发预测免疫治疗疗效的高精度生物标志物 | 肺癌患者、健康个体和良性肺结节患者的血液样本 | 生物医学工程 | 肺癌 | 纳米颗粒技术、单细胞测序 | NA | 血液样本、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
9185 | 2025-10-07 |
Enhanced BMP Signaling Alters Human β-Cell Identity and Function
2025-Jan, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400470
PMID:39499224
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研究论文 | 本研究探讨增强的BMP信号通路在炎症诱导的人类β细胞功能衰竭和身份丧失中的作用 | 首次发现炎症因子通过激活BMP信号通路损害β细胞功能,并提出BMP信号可作为糖尿病治疗新靶点 | 研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证 | 探索炎症环境下β细胞功能衰竭的分子机制 | 人类胰岛β细胞 | 细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞转录组测序, qPCR | NA | 基因表达数据 | 原代人类胰岛样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9186 | 2025-10-07 |
Deep learning-based models for preimplantation mouse and human embryos based on single-cell RNA sequencing
2025-Jan, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02511-3
PMID:39543284
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研究论文 | 开发基于单细胞RNA测序的深度学习模型,用于识别小鼠和人类胚胎发育过程中的细胞类型、谱系和状态 | 利用深度学习工具整合和分类多个单细胞转录组数据集,建立能够无偏倚识别细胞类型并同时确定模型所用基因集的分类模型 | 研究材料难以获取和处理,主要依赖公开可用数据 | 定义小鼠和人类胚胎细胞类型、谱系和状态,为早期胚胎发生提供动态参考 | 小鼠和人类早期胚胎发育及多能干细胞模型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 单细胞转录组数据 | 公开可用的小鼠和人类胚胎发育阶段数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9187 | 2025-10-07 |
Integrated proteomics and scRNA-seq analyses of ovarian cancer reveal molecular subtype-associated cell landscapes and immunotherapy targets
2025-Jan, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02894-2
PMID:39548315
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研究论文 | 通过整合蛋白质组学和单细胞RNA测序分析,揭示了卵巢癌分子亚型相关的细胞景观和免疫治疗靶点 | 首次结合蛋白质组学和单细胞RNA测序对卵巢癌进行综合分析,识别了四种具有临床意义的蛋白质组亚型,并发现CD40作为C2亚型的特异性预后因子 | 样本量相对有限,特别是单细胞RNA测序仅包含8个肿瘤样本 | 探索卵巢癌分子亚型与治疗意义之间的联系 | 154例上皮性卵巢癌肿瘤样本、29例正常输卵管样本和8例额外卵巢癌肿瘤 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 质谱蛋白质组学分析, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | 154个肿瘤样本 + 29个正常样本 + 8个肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
9188 | 2025-10-07 |
The role of FOXK2-FBXO32 in breast cancer tumorigenesis: Insights into ribosome-associated pathways
2025-Jan, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.15482
PMID:39552461
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研究论文 | 本研究探讨FOXK2-FBXO32轴在乳腺癌肿瘤发生中的作用及其在核糖体相关通路中的机制 | 首次通过单细胞测序分析FOXK2基因在泛癌中的表达模式,并发现其下游基因FBXO32与癌症免疫应答的关联 | 需要进一步研究FOXK2和FBXO32在癌症中的具体作用机制,以及靶向FOXK2治疗癌症的潜在益处 | 寻找能够预测肿瘤免疫治疗效果和预后的新生物标志物 | 多种癌症类型(前列腺癌、子宫内膜癌、膀胱癌、结直肠癌、胰腺癌、胃癌、肺癌、甲状腺癌)的肿瘤和癌旁组织 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞测序, bulk RNA-seq, ChIP-seq, 免疫浸润分析算法 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | TCGA数据库中的泛癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
9189 | 2025-10-07 |
Deficiency of FABP7 Triggers Premature Neural Differentiation in Idiopathic Normocephalic Autism Organoids
2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202406849
PMID:39556706
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研究论文 | 本研究通过自闭症谱系障碍患者来源的脑类器官揭示FABP7缺陷通过MEK通路导致神经干细胞过早分化的机制 | 首次在头围正常的自闭症患者类器官中发现FABP7缺陷导致神经干细胞过早分化,并阐明FABP7/MEK信号通路在其中的作用 | 研究样本来源于特定临床表型的自闭症患者群体,结果可能不适用于所有自闭症亚型 | 探究头围正常自闭症患者神经发育异常的分子机制 | 自闭症谱系障碍患者来源的诱导多能干细胞脑类器官和基因修饰小鼠模型 | 发育神经生物学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序,组织形态学分析,基因敲除,基因过表达 | 脑类器官模型,小鼠模型 | 单细胞转录组数据,组织形态数据,行为学数据 | 前瞻性出生队列中头围正常的自闭症患者多细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9190 | 2025-10-07 |
Novel integrated multiomics analysis reveals a key role for integrin beta-like 1 in wound scarring
2025-Jan, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-024-00322-3
PMID:39558136
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研究论文 | 本研究开发了一种新型空间多组学方法,揭示了整合素β样1在伤口瘢痕形成中的关键作用 | 开发了整合空间转录组学与单细胞RNA测序的高分辨率空间多组学方法,首次发现Itgbl1在成纤维细胞介导的瘢痕形成中的核心机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探索伤口修复过程中分子与空间组织的相互关系,揭示瘢痕形成的分子机制 | 小鼠模型、人类和小鼠原代成纤维细胞 | 空间生物学 | 皮肤创伤修复 | 空间转录组学,scRNA-Seq | NA | 转录组数据,空间表达数据 | PU.1缺陷小鼠模型和转基因小鼠实验 | 10x Genomics | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组技术 |
9191 | 2025-10-07 |
scPharm: Identifying Pharmacological Subpopulations of Single Cells for Precision Medicine in Cancers
2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202412419
PMID:39560158
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研究论文 | 开发了一种整合药理学特征与单细胞RNA测序数据的计算框架scPharm,用于识别肿瘤中药理学亚群并推荐个性化药物 | 首次将药理学特征与单细胞RNA测序数据整合,在单细胞分辨率下识别药理学亚群,并评估药物组合策略和毒性 | NA | 开发精准医疗方法,通过揭示单细胞水平的治疗异质性来改善癌症治疗 | 人类乳腺癌组织(ER阳性和HER2阳性)、人类PC9细胞系、小鼠模型 | 计算生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,基因集富集分析 | 计算框架 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9192 | 2025-10-07 |
Repurposing large-format microarrays for scalable spatial transcriptomics
2025-Jan, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02501-5
PMID:39562752
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研究论文 | 开发了一种利用传统寡核苷酸微阵列进行空间转录组分析的新方法Array-seq | 将传统DNA微阵列重新用于空间转录组分析,实现了低成本、易操作且可扩展的空间分子研究平台 | NA | 开发易于采用、低成本且可扩展的空间转录组分析工具 | 小鼠组织切片、多器官切片、连续切片和完整人类器官 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学, 下一代测序 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 微阵列技术 | Array-seq | 基于定制设计探针的微阵列载玻片,包含侧翼有共同序列的独特条形码 |
9193 | 2025-10-07 |
Serinc5 Regulates Sequential Chondrocyte Differentiation by Inhibiting Sox9 Function in Pre-Hypertrophic Chondrocytes
2025-Jan, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31490
PMID:39568258
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现Serinc5是前肥大软骨细胞的标志基因,并揭示其通过抑制Sox9功能调控软骨细胞顺序分化的机制 | 首次鉴定Serinc5为前肥大软骨细胞的标志基因,并阐明其在软骨细胞分化过程中的调控机制 | 前肥大软骨细胞的分子基础仍有许多未明确之处 | 探究前肥大软骨细胞的分子特征及其在软骨细胞分化中的调控作用 | 生长板软骨细胞,特别是前肥大软骨细胞 | 发育生物学 | 骨骼发育疾病 | scRNA-seq, ChIP-seq, ATAC-seq, 组织学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 染色质免疫沉淀测序数据, 染色质可及性测序数据 | 荧光标记的生长板软骨细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序, 染色质可及性测序 | NA | NA |
9194 | 2025-10-07 |
Cryptotanshinone alleviates immunosuppression in endometriosis by targeting MDSCs through JAK2/STAT3 pathway
2025-Jan, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2024.156227
PMID:39580997
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研究论文 | 本研究探讨了隐丹参酮通过JAK2/STAT3通路调控髓源性抑制细胞,从而缓解子宫内膜异位症免疫抑制的机制 | 首次证明隐丹参酮通过靶向JAK2/STAT3通路调节MDSCs,是治疗子宫内膜异位症的潜在天然化合物 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床转化价值需进一步验证 | 研究隐丹参酮通过JAK2/STAT3信号通路调节MDSCs的治疗潜力及其对EMS免疫微环境和病灶生长的影响 | 子宫内膜异位症患者组织样本、C57BL/6J小鼠模型、骨髓源性MDSCs | 生物医学研究 | 子宫内膜异位症 | 转录组测序、单细胞RNA测序、网络药理学分析、表面等离子共振、细胞热位移分析、流式细胞术、免疫荧光、Western blot | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、蛋白质印迹数据 | 使用公共数据库GSE141549和GSE213216数据,建立小鼠模型进行体内外验证 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
9195 | 2025-10-07 |
Comprehensive single-cell aging atlas of healthy mammary tissues reveals shared epigenomic and transcriptomic signatures of aging and cancer
2025-Jan, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-024-00751-8
PMID:39587369
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研究论文 | 本研究通过单细胞分辨率构建健康乳腺组织衰老图谱,揭示衰老与癌症共享的表观基因组和转录组特征 | 首次在单细胞分辨率系统揭示乳腺组织衰老过程中的转录组和表观基因组重编程,并发现衰老特征与人类乳腺癌的潜在联系 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究衰老如何影响乳腺组织细胞和分子程序,及其与癌症发生的关联 | 小鼠乳腺组织中的上皮细胞、基质细胞和免疫细胞 | 单细胞生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
9196 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA-Seq and Histological Analysis Reveals Dynamic Lrig1 Expression During Salivary Gland Development
2025-Jan, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31487
PMID:39587709
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和组织学分析揭示了Lrig1在唾液腺发育过程中的动态表达模式 | 首次系统揭示LRIG1在唾液腺发育各阶段的动态表达特征及其与祖细胞标记物的共定位关系 | 研究主要基于小鼠模型,人类细胞验证仅限于HSG细胞系 | 探究Lrig1在发育和成熟小鼠颌下腺中的表达模式和功能 | 小鼠颌下腺组织、人类唾液腺细胞系 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 免疫荧光, RNAscope染色 | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据, 图像数据 | 不同发育阶段的小鼠颌下腺组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9197 | 2025-10-07 |
H. Pylori-Facilitated TERT/Wnt/β-Catenin Triggers Spasmolytic Polypeptide-Expressing Metaplasia and Oxyntic Atrophy
2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202401227
PMID:39587848
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研究论文 | 本研究揭示了幽门螺杆菌通过CagA激活TERT/Wnt/β-Catenin通路促进胃主细胞去分化和SPEM发生的分子机制 | 首次发现CagA通过破坏TERT与其新型E3连接酶SYVN1的相互作用来稳定TERT蛋白,并证实Tert敲除可抑制Wnt/β-Catenin通路和SPEM发生 | NA | 阐明幽门螺杆菌诱导胃黏膜SPEM发生的分子机制 | 胃主细胞和幽门螺杆菌感染模型 | 分子生物学 | 胃部癌前病变 | 单细胞RNA测序,基因敲除 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9198 | 2025-10-07 |
Spatiotemporal Cellular Dynamics of Germinal Center Reaction in Coronavirus Disease 2019 Lung-Draining Lymph Node Based on Imaging-Based Spatial Transcriptomics
2025-Jan, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2024.102180
PMID:39522760
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研究论文 | 利用成像空间转录组学揭示COVID-19康复期和再感染过程中肺引流淋巴结生发中心反应的细胞动态变化 | 首次通过成像空间转录组学解析SARS-CoV-2感染过程中淋巴组织结构恢复的时空动态特征 | 研究基于非人灵长类动物模型,结果向人类临床转化的适用性需进一步验证 | 阐明SARS-CoV-2感染后淋巴结构恢复特征及其对免疫记忆的影响 | SARS-CoV-2感染的非人灵长类动物肺引流淋巴结 | 空间转录组学 | COVID-19 | 成像空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
9199 | 2025-10-07 |
PKMζ, a Brain-specific PKCζ Isoform, is Required for Glycolysis and Myofibroblastic Activation of Hepatic Stellate Cells
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.101429
PMID:39542399
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研究论文 | 本研究揭示了脑特异性PKCζ异构体PKMζ在肝星状细胞糖酵解和肌成纤维细胞活化中的关键作用 | 首次发现PKMζ通过磷酸化VASP促进Glut1在质膜上的锚定,驱动肝星状细胞的代谢重编程和活化 | 研究主要基于体外细胞实验和小鼠模型,尚未在人类肝脏疾病中进行临床验证 | 阐明肝星状细胞中葡萄糖转运蛋白Glut1在质膜上锚定/停靠的分子机制 | 人源和鼠源肝星状细胞、结直肠肝转移瘤相关成纤维细胞 | 细胞生物学 | 肝纤维化、结直肠肝转移 | RT-PCR、Western blotting、免疫荧光、shRNA、过表达、生物素化、2-NBDG检测、Seahorse糖酵解压力测试、位点定向突变、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞功能数据 | 原代人源和鼠源肝星状细胞、结直肠肝转移患者和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | NA |
9200 | 2025-10-07 |
Spatial and Single-Cell Transcriptomics Unraveled Spatial Evolution of Papillary Thyroid Cancer
2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202404491
PMID:39540244
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示甲状腺乳头状癌的空间异质性和进化机制 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,在保留空间信息和形态特征的同时解析甲状腺乳头状癌的肿瘤内异质性 | NA | 阐明甲状腺乳头状癌空间异质性、恶性进展和转移的分子机制 | 甲状腺乳头状癌组织和细胞 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |