单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 34043 篇文献,本页显示第 901 - 920 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
901 2025-12-04
MAGIC: A Multimodal Adaptive GRN Inference Constructor
2025-Dec-02, Journal of chemical information and modeling IF:5.6Q1
研究论文 本研究提出了一种名为MAGIC的多模态自适应基因调控网络推断方法,通过整合基因表达、序列和语义特征来改进单细胞RNA测序数据的GRN推断 首次将基因表达、序列结构和语义功能三种模态特征进行对齐与整合,并构建共识相似性网络与已知GRN形成双拓扑网络,同时采用共享图注意力权重对齐模块和知识感知多模态融合模块来分别解决GRN稀疏连接和scRNA-seq数据稀疏性问题 方法在七个scRNA-seq数据集上进行了验证,但尚未在更广泛的疾病类型或更大规模的数据集上进行全面测试 改进单细胞RNA测序数据中基因调控网络的推断准确性和鲁棒性 基因调控网络、转录因子及其靶基因 生物信息学 膀胱癌、乳腺癌 单细胞RNA测序、空间转录组学 图注意力网络、多模态融合模型 基因表达数据、DNA序列数据、生物知识库语义数据 七个scRNA-seq数据集和两个空间转录组数据集(膀胱癌和乳腺癌) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
902 2025-12-04
Hypoxia-induced USP13 expression drives ferroptosis resistance and tumor immune evasion in hepatocellular carcinoma through the stabilization of ACLY
2025-Dec-02, Cell death discovery IF:6.1Q1
研究论文 本研究揭示了缺氧诱导的USP13表达通过稳定ACLY蛋白,驱动肝细胞癌的铁死亡抵抗和肿瘤免疫逃逸 首次阐明了缺氧-HIF-1α-USP13-ACLY轴在调控肝细胞癌细胞铁死亡抵抗和免疫逃逸中的新机制,并验证了USP13抑制剂2-Methoxyestradiol的治疗潜力 研究主要基于体外模型和动物模型,其临床转化效果仍需进一步的人体试验验证 探索USP13在肝细胞癌进展中的作用,并评估其作为诱导铁死亡和增强免疫反应的治疗靶点的潜力 肝细胞癌患者来源的类器官、肝细胞癌细胞系和动物模型 肿瘤生物学 肝细胞癌 单细胞RNA测序、流式细胞术分析 NA 基因表达数据、细胞表型数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
903 2025-12-04
Folic acid prevents inner hair cell degeneration via genomic stability
2025-Dec-02, Cell death discovery IF:6.1Q1
研究论文 本研究揭示了钙稳态失衡在耳蜗内毛细胞损伤中的作用,并发现叶酸可通过维持基因组稳定性来预防内毛细胞退化 首次发现低频与高频区域的内毛细胞在钙清除速率上存在差异,并建立了内毛细胞特异性Pmca1敲除小鼠模型,证明了叶酸对噪声和遗传因素所致内毛细胞损伤的保护作用 研究主要基于小鼠模型,其在人类中的适用性尚需验证;叶酸的具体作用机制和最佳治疗剂量有待进一步探索 探究内毛细胞损伤的机制及预防策略 小鼠耳蜗内毛细胞 听觉神经生物学 听力损失 单细胞RNA测序 基因敲除小鼠模型 基因表达数据、钙成像数据 Pmca1条件性敲除小鼠及对照组 NA 单细胞RNA-seq NA NA
904 2025-12-04
Promoting astrocyte-neuron triiodothyronine shuttling attenuates brain damage in neonatal hypoxic-ischemic encephalopathy
2025-Dec-02, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析,揭示了新生儿缺氧缺血性脑病中星形胶质细胞与神经元之间的相互作用机制,并发现了一种具有神经保护功能的星形胶质细胞亚群 首次识别并功能表征了Dio2⁺Slc1a2⁺星形胶质细胞亚群,揭示了其在缺氧缺血性脑损伤中的耗竭及修复潜力,并提出了通过增强星形胶质细胞Dio2或外源性T3递送来促进神经修复的新治疗策略 研究基于大鼠模型,结果在人类中的适用性需进一步验证;单细胞测序和蛋白质组学分析可能未完全捕捉所有细胞类型或分子变化 探索星形胶质细胞与神经元之间的信号传递在新生儿缺氧缺血性脑病中的作用,并寻找新的治疗靶点 出生后第7天的大鼠幼崽,以及经过氧糖剥夺处理的星形胶质细胞 神经科学 新生儿缺氧缺血性脑病 单细胞RNA测序,蛋白质组学分析,多重免疫荧光,ELISA,Western blotting Rice-Vannucci模型 RNA测序数据,蛋白质组数据,图像数据 未明确指定样本数量,但涉及大鼠幼崽和体外星形胶质细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
905 2025-12-04
Single-cell transcriptomic profiling reveals aberrant CD4⁺ naive T cell differentiation driving immune activation in Behçet's uveitis
2025-Dec-02, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序揭示了白塞病葡萄膜炎中CD4⁺初始T细胞异常分化驱动免疫激活的机制 首次整合外周血和眼内房水样本的单细胞转录组数据,系统描绘了白塞病葡萄膜炎中CD4⁺ T细胞从循环系统到眼内微环境的动态分化轨迹,并鉴定出IL-32和CXCR4作为关键调控因子 样本量相对有限,功能验证主要在体外进行,缺乏动物模型验证 阐明白塞病葡萄膜炎中T细胞功能障碍和局部免疫激活的精确机制 白塞病葡萄膜炎患者的外周血单个核细胞和房水样本 单细胞转录组学 白塞病葡萄膜炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 白塞病葡萄膜炎患者和健康对照的外周血单个核细胞样本,以及公开可用的房水样本单细胞转录组数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
906 2025-12-04
Sex-dimorphic reprogramming of fetal mouse brain development by maternal estradiol excess
2025-Dec-02, Biology of sex differences IF:4.9Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,探讨了母体高雌激素暴露对小鼠胎儿大脑发育的性别二态性重编程影响 首次系统性地揭示了母体高雌激素暴露如何通过性别特异性的分子和细胞响应,差异性地影响雄性和雌性胎儿大脑区域,特别是对雄性偏向基因的下调效应与其基线雄性偏向程度成正比 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;且主要关注胎儿期,未探讨长期神经发育后果 探究母体高雌激素暴露导致性别特异性神经发育障碍的潜在机制 小鼠胎儿大脑 空间转录组学 神经发育障碍 空间转录组学,免疫荧光 NA 空间转录组数据,图像数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
907 2025-12-04
A Microbiota- and IL-15-Dependent Innate-Like B Cell Progenitor Expressing E4BP4
2025-Dec-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文发现了一种表达E4BP4的先天样B细胞祖细胞,其发育受肠道微生物群和IL-15信号调控 首次鉴定并描述了NK-B细胞这一独特细胞群体,揭示了其受微生物群和IL-15协同调控的E4BP4依赖性发育途径 研究主要基于小鼠模型,人类中是否存在类似细胞群体尚需验证 探究表达NK和B细胞双重标记的细胞群体的存在、特性及调控机制 小鼠骨髓中的CD3⁻NKp46⁺CD19⁺NK1.1⁺细胞(NK-B细胞) 免疫学 NA 单细胞RNA测序,高维流式细胞术,过继转移实验 NA 单细胞转录组数据,流式细胞术数据 PDK1缺陷小鼠和野生型小鼠的骨髓细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
908 2025-12-04
HCMV immediate-early protein IE2 induces neurotoxicity and hearing loss by disrupting TSC2-mTOR signaling and metabolic homeostasis
2025-Dec-02, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本研究揭示了人巨细胞病毒(HCMV)立即早期蛋白IE2通过破坏TSC2-mTOR信号通路和代谢稳态,导致神经毒性和听力损失的机制 首次发现HCMV IE2蛋白通过直接与TSC2相互作用,导致mTOR信号过度激活、代谢失调和线粒体功能障碍,从而引起感音神经性听力损失(SNHL),并证明mTOR抑制剂可缓解IE2诱导的听觉缺陷 研究主要基于转基因小鼠模型,其在人类HCMV感染病理中的完全相关性仍需进一步验证;mTOR抑制剂的长期疗效和潜在副作用未在研究中探讨 探究HCMV立即早期蛋白IE1和IE2在感音神经性听力损失(SNHL)发生中的作用及其分子机制 表达HCMV IE1和IE2蛋白的转基因小鼠模型,以及其听觉功能和耳蜗病理变化 神经生物学与听觉病理学 感音神经性听力损失(SNHL),先天性HCMV感染 单细胞RNA测序(scRNA-seq),透射电子显微镜(TEM),听觉脑干反应(ABR)测量 转基因小鼠模型 基因表达数据,形态学图像数据,生理测量数据 转基因小鼠模型(具体数量未在摘要中明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
909 2025-12-04
Strategic trimodal therapy enhances radiation-induced abscopal response in renal cancer
2025-Dec-02, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究开发并评估了一种结合靶向药物递送、放疗和免疫疗法的三模式疗法,以增强肾癌中的远隔效应 提出了一种新颖的三模式疗法(肿瘤靶向脂质体依维莫司和YM155、局部放疗、系统性IL-2),能显著增强免疫原性癌症中的远隔效应 在LVRCC67模型中效果较为温和,可能归因于模型间免疫应答性的差异 开发并评估一种能可靠增强肾细胞癌放疗后远隔效应的新型治疗策略 两种小鼠肾癌模型(Renca和LVRCC67) 数字病理学 肾癌 空间转录组学,免疫组织化学,CD8+ T细胞耗竭 NA 图像,转录组数据 两种小鼠肾癌模型,使用双侧肿瘤设置 NA 空间转录组学 NA NA
910 2025-12-04
Efficient Spatial Gene Expression Profiling Using Split-Probe Ligation and Rolling Circle Amplification
2025-Dec-02, Small methods IF:10.7Q1
研究论文 本文介绍了一种基于分裂探针连接和滚环扩增的空间基因表达分析方法,用于在组织切片和全组织样本中进行RNA原位检测和基因分型 该方法通过分裂探针连接和滚环扩增技术,实现了高灵敏度的原位RNA成像和空间基因表达谱分析,并成功应用于糖尿病肾脏的空间转录组研究 NA 开发一种高效的空间基因表达分析方法,以揭示基因在组织中的空间分布模式 健康与糖尿病小鼠的肾脏组织 空间转录组学 糖尿病 分裂探针连接、滚环扩增、原位测序 NA RNA图像、空间基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
911 2025-12-04
Elevated 5-HTR7 deteriorates dysregulated megakaryocytopoiesis in immune thrombocytopenic purpura via upregulating the PKA/Orai1/ERK1/2 pathway
2025-Dec-01, Haematologica IF:8.2Q1
研究论文 本研究探讨了5-羟色胺受体7(5-HTR7)在免疫性血小板减少性紫癜(ITP)中通过上调PKA/Orai1/ERK1/2通路损害巨核细胞成熟并导致血小板减少的机制 首次揭示了5-HTR7在ITP发病机制中的具体作用,并阐明了其通过PKA/Orai1/ERK轴抑制钙离子内流从而损害巨核细胞成熟的新机制 研究主要基于体外实验和动物模型,其临床转化效果仍需进一步验证 探究5-HTR7在ITP中调控巨核细胞生成障碍的分子机制 ITP患者的巨核细胞及小鼠ITP模型 NA 免疫性血小板减少性紫癜 流式细胞术、免疫荧光、单细胞RNA测序、Western blot、共聚焦显微镜 NA 测序数据、图像数据、蛋白质印迹数据 未明确具体样本数量,涉及ITP患者和健康对照 NA 单细胞RNA测序 NA NA
912 2025-12-04
Igf2 regulates early postnatal DPP4+ preadipocyte pool expansion
2025-Dec-01, Genes & development IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了早期小鼠皮下脂肪组织中DPP4+前脂肪细胞群的扩张机制,并发现IGF2在此过程中驱动细胞增殖而非分化 首次识别出断奶前小鼠皮下脂肪网状间质中表达IGF2的DPP4+前体细胞群,并阐明IGF2在促进前脂肪细胞扩张中的时间限制性作用 研究仅基于小鼠模型,未在人类组织中验证;单细胞测序数据可能受技术偏差影响 探究早期生命阶段脂肪组织快速扩张的细胞机制,以理解代谢健康性肥胖 断奶前和成年小鼠的皮下脂肪组织 单细胞组学 肥胖 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠皮下脂肪组织样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
913 2025-12-04
Depleting IL1R2+ Tumor-Infiltrating Regulatory T Cells with an ADCC-Prone Nanobody Construct Boosts the Efficacy of Anti-PD-1 Immunotherapy
2025-Dec-01, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究通过靶向肿瘤浸润调节性T细胞(tiTreg)表面的IL1R2,开发了一种ADCC倾向的纳米抗体构建体,以增强抗PD-1免疫疗法的疗效 首次将IL1R2鉴定为高度活化和强抑制性肿瘤浸润调节性T细胞(tiTreg)的表面标志物,并开发了具有优化ADCC功能的抗IL1R2纳米抗体-Fc构建体,可特异性清除IL1R2+ tiTregs,并与抗PD-1疗法产生协同抗肿瘤效应 研究主要基于小鼠模型和人类数据集的分析,尚未在临床环境中验证;IL1R2受体本身对tiTreg的丰度和活化并非必需,其具体功能机制有待进一步阐明 探索特异性靶向肿瘤浸润调节性T细胞(tiTreg)以增强免疫检查点阻断疗法疗效的策略 三阴性乳腺癌(TNBC)和结直肠癌小鼠模型以及人类TNBC和结直肠癌数据集中的肿瘤浸润调节性T细胞(tiTreg) 肿瘤免疫学 三阴性乳腺癌,结直肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),细胞转录组和表位测序索引(CITE-seq),荟萃分析 NA 单细胞转录组数据,表位数据,测序数据 来自小鼠模型和人类数据集(TNBC和结直肠癌)的样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
914 2025-12-04
CCNE1 Exerts a Protective Effect on Parkinson's Disease by Regulating Ferroptosis-Related Proteins
2025-Dec, Brain and behavior IF:2.6Q3
研究论文 本研究通过孟德尔随机化分析揭示了CCNE1通过上调PARP16表达调控铁死亡,从而对帕金森病发挥神经保护作用的分子机制 首次从分子层面阐明了CCNE1通过调控铁死亡关键蛋白PARP16发挥神经保护作用的机制,为帕金森病研究提供了新视角 孟德尔随机化分析存在潜在的多效性偏倚风险,且机制验证主要依赖于生物信息学分析 探究铁死亡相关蛋白如何通过遗传变异调控帕金森病风险 帕金森病患者相关的蛋白质与基因 生物信息学 帕金森病 孟德尔随机化分析、全基因组关联研究、单细胞RNA测序、转录组分析 两样本孟德尔随机化、中介分析 遗传变异数据、蛋白质定量性状位点数据、基因表达数据 基于UKB-PPP和deCODE研究的pQTL数据及PD GWAS数据,涉及210个显著相关蛋白 NA 单细胞RNA-seq NA NA
915 2025-12-04
Development and Validation of a Prognostic Model for Lung Cancer Based on Machine Learning and Immune Microenvironment Analysis
2025-Dec, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究基于机器学习和免疫微环境分析,开发并验证了一个用于肺癌的预后模型 整合了多种机器学习算法和单细胞RNA测序数据,识别了关键的免疫基因和细胞间通讯网络,为肺癌预后提供了新的预测工具和免疫学见解 研究依赖于公共数据库(TCGA和GEO)的数据,可能存在样本选择偏差,且模型在独立队列中的验证未在摘要中明确说明 开发一个准确的肺癌预后预测工具,并探究免疫微环境在肺癌进展和治疗反应中的作用 肺癌患者及其RNA表达谱和临床数据 机器学习 肺癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序 多种机器学习算法组合 RNA表达谱数据, 临床数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
916 2025-12-04
Epigenetic Regulation of G6PD Drives Metabolic Reprogramming in Intrahepatic Cholangiocarcinoma
2025-Dec, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 本研究探讨了肿瘤特异性增强子在肝内胆管癌代谢重编程中的作用,特别是G6PD和戊糖磷酸途径的调控 首次将增强子介导的表观遗传调控与肝内胆管癌中的G6PD过表达和戊糖磷酸途径活性联系起来,揭示了肿瘤特异性增强子作为关键表观遗传驱动因子的新作用 未来研究需探索将增强子分析整合到精准医学框架中,并开发新的增强子靶向策略 研究肿瘤特异性增强子在肝内胆管癌代谢重编程中的作用及其治疗潜力 肝内胆管癌肿瘤上皮细胞 表观遗传学 肝内胆管癌 原生延伸转录本捕获分析基因表达,单细胞RNA测序 NA 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
917 2025-12-04
Single-Cell RNA-Seq Reveals the Effect of Commensal Bacteria on the Multistep Development of Esophageal Cancer
2025-Dec, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了食管共生菌在食管鳞状细胞癌多阶段发展中的作用,包括其对上皮细胞恶性转化和炎症性成纤维细胞形成的影响 首次在单细胞水平上系统分析了食管共生菌在ESCC肿瘤微环境中的异质性分布及其对慢性炎症和免疫抑制状态的调控机制 研究基于小鼠模型,结果向人类临床转化的适用性需进一步验证;抗生素处理可能产生非特异性效应 阐明食管共生菌在食管鳞状细胞癌发生发展中的具体作用机制 小鼠自发性食管鳞状细胞癌模型中的54,562个单细胞 数字病理学 食管癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 54,562个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
918 2025-12-04
Integration of scRNA-Seq and scATAC-Seq Reveals Malignant Characteristics of Sarcomatoid Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2025-Dec, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据,揭示了肉瘤样透明细胞肾细胞癌的恶性特征 首次利用scATAC-seq识别肉瘤样分化肿瘤细胞的转录调控特征,并鉴定出DST、FRMD4A和PREX2作为该疾病的肿瘤标志物 研究仅基于单例患者样本,样本量较小,可能影响结果的普遍性 阐明肉瘤样透明细胞肾细胞癌的恶性特征,为诊断和治疗提供新见解 肉瘤样透明细胞肾细胞癌患者样本 数字病理学 肾细胞癌 scRNA-seq, scATAC-seq, WES NA 单细胞转录组数据、单细胞染色质可及性数据、全外显子组测序数据 1例肉瘤样ccRCC患者样本,以及19例经典ccRCC样本(共19,819个肿瘤细胞和21,684个细胞核) NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
919 2025-12-04
MedakaBase as a unified genomic resource platform for medaka fish biology
2025-Dec-01, DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes IF:3.9Q1
研究论文 本文介绍了MedakaBase作为一个统一的基因组资源平台,用于支持青鳉鱼生物学研究,整合了多物种的基因组数据和分析工具 首次为青鳉鱼建立了一个统一的基因组资源平台,整合了分散的组学数据,并提供面向基因的分析功能,包括单细胞转录组优化的基因模型 平台目前主要覆盖七个Oryzias物种,数据范围可能有限,且依赖于NBRP团队生成的部分原始数据 为青鳉鱼生物学研究提供一个统一的基因组资源平台,整合和分析多物种的组学数据 青鳉鱼(Oryzias latipes)及其他六个Oryzias物种的基因组数据 基因组学 NA 基因组测序、转录组分析、单细胞转录组分析 NA 基因组序列、转录组数据、基因组变异数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
920 2025-12-04
β-catenin initiates peritoneal fibrosis by triggering mitochondrial fission-mediated mesothelial cell senescence fate transition
2025-Dec-01, Military Medical Research IF:16.7Q1
研究论文 本研究揭示了β-catenin通过触发线粒体分裂介导的间皮细胞衰老命运转变,从而启动腹膜纤维化的机制 首次在单细胞水平上明确了长期腹膜透析患者中间皮细胞向衰老命运的转变,并阐明了β-catenin-Drp1-线粒体分裂-TGF-β1信号轴在驱动这一过程及后续纤维化中的关键作用 研究主要基于动物模型和体外细胞实验,其结论在人体中的普适性及长期疗效仍需进一步临床验证 探究腹膜纤维化的起始机制,并寻找潜在的治疗靶点 腹膜间皮细胞、来自腹膜透析患者的透析液流出物和腹膜活检标本、PDF诱导的小鼠模型、原代培养的间皮细胞 单细胞组学与分子病理学 终末期肾病相关的腹膜纤维化 单细胞RNA测序,转录组测序,免疫荧光,Western blotting NA 单细胞RNA测序数据,转录组数据,蛋白质印迹数据,免疫荧光图像 包含腹膜透析患者临床队列、小鼠模型及原代细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部