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当前共找到 40084 篇文献，本页显示第 901 - 920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 901 | 2026-05-29 |
Metabolic RNA Labeling-Enabled Time-Resolved Single-Cell RNA Sequencing
2026-03-17, Accounts of chemical research
IF:16.4Q1
DOI:10.1021/acs.accounts.6c00010
PMID:41758996
|
综述 | 本文综述了代谢RNA标记结合时间分辨单细胞RNA测序技术的最新进展，包括Well-TEMP-seq、scDUAL-seq、Dyna-vivo-seq等方法，并探讨了该技术在揭示细胞异质性和动态基因表达调控中的应用潜力 | 系统总结了基于代谢RNA标记的时间分辨单细胞RNA测序技术的创新，如双核苷酸标记的scDUAL-seq能同时监测RNA合成与降解，以及从体外细胞培养扩展到体内动物模型（Dyna-vivo-seq）的能力，并整合空间转录组学以解析时空动态 | 当前化学工具在单细胞RNA动态分析中存在局限性，如核苷酸标记效率、成本、体内外应用差异，以及时空整合的复杂度 | 探讨代谢RNA标记增强时间分辨单细胞RNA测序技术，以理解异质性和动态基因表达调控 | 单细胞RNA代谢标记、时间分辨测序技术及其在生物过程（如胚胎发育、疾病进展）中的应用 | 机器学习 | NA | 代谢RNA标记、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 902 | 2026-05-29 |
FineST: contrastive learning integrates histology and spatial transcriptomics for nuclei-resolved ligand-receptor analysis
2026-Mar-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70528-7
PMID:41839892
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研究论文 | FineST通过对比学习整合组织学和空间转录组学数据，实现核分辨率下的配体-受体分析 | 利用组织学基础模型的深度对比学习，实现核精度的RNA表达插补和细胞间通信分析，在VisiumHD和Xenium数据集上显著优于现有方法 | 主要聚焦于Visium平台，可能在其他平台上的泛化能力有限；数据稀疏性和分辨率限制在复杂组织中仍存在挑战 | 开发高分辨率空间转录组学分析方法以揭示细胞间通信模式 | 结直肠癌VisiumHD和乳腺癌Xenium数据集，以及多种癌症类型的肿瘤-免疫相互作用 | 计算机视觉, 机器学习, 数字病理学 | 结直肠癌, 乳腺癌, 鼻咽癌, 肝细胞癌 | 空间转录组学, 对比学习 | 对比学习模型 | 组织学图像, 空间转录组学数据 | 结直肠癌VisiumHD和乳腺癌Xenium数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, 10x VisiumHD, 10x Xenium | 10x Visium平台用于空间基因表达分析，VisiumHD用于高分辨率数据，Xenium用于乳腺癌原位验证 |
| 903 | 2026-05-29 |
The single cell transcriptomic landscape of recurrent giant cell tumor of bone following neoadjuvant denosumab therapy
2026-Mar-04, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.03.001
PMID:41786203
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析新辅助地诺单抗治疗后复发骨巨细胞瘤的转录组特征 | 首次通过单细胞RNA测序揭示新辅助DMAb治疗后GCTB复发的潜在机制，包括肿瘤细胞转化及免疫抑制微环境形成 | 未提及 | 探索新辅助地诺单抗治疗增加骨巨细胞瘤局部复发风险的潜在机制 | 未经治疗的原发性GCTB、新辅助DMAb治疗的原发性GCTB以及刮除后停用DMAb的复发性GCTB | 单细胞转录组学 | 骨巨细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 33,440个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 904 | 2026-05-29 |
BET inhibition blunts antibody production and macrophage-mediated fibrosis to restore lung function in murine cGVHD
2026-03-02, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025031983
PMID:41770848
|
研究论文 | 在慢性移植物抗宿主病模型中，BET抑制通过降低抗体产生和巨噬细胞介导的纤维化来恢复肺功能 | 首次揭示BET蛋白在慢性移植物抗宿主病肺部纤维化中调控抗体产生和巨噬细胞极化的新机制 | 主要基于小鼠模型，缺乏临床样本验证 | 研究BET抑制对慢性移植物抗宿主病相关闭塞性细支气管炎综合征的治疗效果和机制 | 慢性移植物抗宿主病小鼠模型中的免疫细胞（T细胞、B细胞、巨噬细胞）和肺组织 | 医学研究 | 移植物抗宿主病，闭塞性细支气管炎综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 慢性移植物抗宿主病小鼠与对照小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 905 | 2026-05-29 |
Neuro-epithelial circuits promote sensory convergence and intestinal immunity
2026-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09921-z
PMID:41501470
|
研究论文 | 发现TRPV1疼痛感知伤害感受器与化学感应上皮簇细胞协同，驱动2型炎症和肠道免疫的神经-上皮回路 | 首次揭示TRPV1伤害感受器通过CGRP信号调控上皮簇细胞增殖分化，形成神经-上皮回路整合感觉输入驱动2型免疫 | 未明确其他感觉神经元类型在该回路中的作用，且机制验证主要在小鼠模型中完成 | 阐明神经、上皮和免疫细胞如何协调感知输入以启动2型炎症反应 | 小鼠肠道中的TRPV1伤害感受器、上皮簇细胞及CGRP神经纤维 | 机器学习 | 寄生虫感染相关2型免疫疾病 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、化学遗传学沉默/激活 | NA | 基因表达数据 | 小鼠肠道组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'端测序, 10x Visium空间基因表达分析 |
| 906 | 2026-05-29 |
Single-cell profiling of HDAC inhibitor-induced EBV lytic heterogeneity defines abortive and refractory states in B lymphoblasts
2026-03, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013610
PMID:41871169
|
research paper | 通过单细胞RNA测序揭示了HDAC抑制剂诱导的EBV溶解裂解异质性，定义了B淋巴母细胞中的流产和难治状态 | 首次在单细胞水平上解析HDAC抑制剂诱导EBV裂解反应的异质性，发现NF-κB及CD137信号轴在阻止成功裂解再激活中的作用 | 研究仅限于四种EBV阳性细胞系，且裂解再激活仅在少数细胞中成功，可能未全面反映体内微环境的影响 | 探讨HDAC抑制剂对EBV阳性恶性肿瘤的裂解再激活机制及宿主因素的作用 | EBV阳性细胞系，包括P3HR1-ZHT Burkitt淋巴瘤、Jijoye Burkitt淋巴瘤、IBL-1免疫母细胞淋巴瘤和新生感染衍生的淋巴母细胞系 | machine learning | Burkitt淋巴瘤、Hodgkin淋巴瘤、鼻咽癌、胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 4种EBV阳性细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 907 | 2026-05-29 |
BARTsc identifies key transcriptional regulators from single-cell omics data
2026-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.24.707729
PMID:42124611
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 908 | 2026-05-29 |
A Pan-Cancer Single-Cell Atlas to Evaluate Tumor Identity, Cell Line Concordance, and Dependency Mapping
2026-Feb-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.14.705396
PMID:42124572
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建泛癌图谱，评估肿瘤身份、细胞系一致性和依赖性图谱 | 开发了一种基于马氏距离的严格整合框架，优先考虑代表性恶性转录状态，构建高质量泛癌单细胞图谱，并利用该图谱推断肿瘤-细胞系一致性和癌症特异性基因依赖性 | 未在摘要中提及具体限制，如可变数据质量、注释不一致等问题仍可能存在 | 建立可扩展的泛癌单细胞图谱，用于肿瘤身份推断、癌症细胞系基准测试和系统识别遗传脆弱性 | 来自499个样本的135,424个高质量恶性细胞，涵盖36种成人和儿童癌症 | 数字病理学 | 泛癌（包括成人和儿童癌症） | 单细胞RNA测序 | ElasticNet | 单细胞转录组数据 | 499个样本，135,424个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 基于马氏距离的批次校正潜在空间选择 |
| 909 | 2026-05-29 |
Pixel2Gene enables histology-guided reconstruction and prediction of spatial gene expression
2026-Feb-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.21.707168
PMID:42124685
|
研究论文 | Pixel2Gene是一个深度学习框架，通过整合组织学图像和空间转录组数据，实现基于组织学引导的空间基因表达重建和预测 | 首次利用共配准的组织学图像与空间转录组数据，通过深度学习实现高分辨率空间基因表达的重建和预测，无需直接转录组分析即可扩展至新样本 | 当前高分辨率空间转录组平台仍存在高成本、有限组织覆盖和技术伪影，导致数据噪声高、稀疏且不完整，可能影响分析准确性和生物学解释 | 开发一种成本效益高、可扩展的空间基因表达分析方法，通过常规组织学图像实现全组织尺度转录组分析 | 多种组织类型和疾病背景下的临床样本 | 计算机视觉, 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 深度学习框架 | 图像, 基因表达数据 | 多个高分辨率空间转录组平台（Visium HD、Xenium、CosMx）上的临床样本 | NA | 空间转录组学 | Visium HD, Xenium, CosMx | NA |
| 910 | 2026-05-29 |
Cardiac Macrophages Across Space and Time: Roles in Homeostasis, Disease, and Remodeling
2026-Feb-19, The Canadian journal of cardiology
DOI:10.1016/j.cjca.2026.02.025
PMID:41722856
|
综述 | 综述心脏巨噬细胞在不同空间和时间生态位中的稳态维持、疾病响应及损伤后重塑功能，重点强调其异质性和空间互作机制 | 首次系统整合单细胞与空间转录组学数据，提出区域特异性和环境依赖性巨噬细胞靶向治疗策略，并揭示衰老对巨噬细胞空间组织的重塑作用 | 未纳入巨噬细胞与其他免疫细胞类型（如中性粒细胞、T细胞）的空间互作分析，且缺乏直接验证区域特异性靶向效果的动物模型或临床数据 | 阐明心脏巨噬细胞在稳态、疾病和修复中的时空动态调控机制，为精准免疫治疗提供理论框架 | 心脏驻留巨噬细胞（胚胎来源）与骨髓招募CCR2+巨噬细胞，以及心肌细胞、成纤维细胞、内皮细胞和周细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序，10x Visium用于空间转录组学分析 |
| 911 | 2026-05-29 |
Cell-dependent contributions of thrombospondin-1 to the rupture of abdominal aortic aneurysm in mice
2026-02-14, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf243
PMID:41252281
|
研究论文 | 该研究探讨了血栓反应蛋白1（TSP1）在不同细胞类型中对小鼠腹主动脉瘤破裂的差异性贡献 | 首次通过细胞类型特异性敲除小鼠模型揭示髓系来源TSP1在抑制动脉瘤破裂中的关键保护作用，并阐明其通过促进基质修复表型增强血管壁完整性的机制 | 研究仅限于小鼠模型，其结论在人类中的适用性尚需验证；未探索其他可能TSP1来源细胞（如成纤维细胞）的作用 | 探究不同细胞类型（巨噬细胞、内皮细胞、平滑肌细胞）中TSP1缺失对腹主动脉瘤破裂的影响 | 腹主动脉瘤小鼠模型（Apoe敲除、AAV-PCSK9诱导高胆固醇血症） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，条件性基因敲除，组织学分析 | 细胞类型特异性条件性敲除小鼠模型 | 基因表达数据，组织学图像 | 涉及全局敲除、髓系特异性敲除、内皮特异性敲除和平滑肌细胞特异性敲除小鼠多组对比实验 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 912 | 2026-05-29 |
Advances in single-cell transcriptomics: unraveling the pathogenesis of calcific aortic valve disease
2026-02-14, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf255
PMID:41264422
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综述 | 综述了单细胞RNA测序在钙化性主动脉瓣疾病研究中的应用，揭示了细胞异质性、谱系分化和细胞间相互作用 | 全面总结了单细胞转录组学在CAVD研究中的最新进展，包括瓣膜细胞群体、疾病相关表型转变和分子通路，并探讨了单细胞技术的转化潜力 | 当前单细胞技术面临的技术挑战和未来发展方向 | 评估单细胞RNA测序在CAVD研究中的应用现状，为发现新治疗靶点提供依据 | 钙化性主动脉瓣疾病中的心脏瓣膜细胞 | 单细胞转录组学 | 钙化性主动脉瓣疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 913 | 2026-05-29 |
ARX mutation-associated interneuron defects provide insights into mechanisms underlying developmental epilepsies
2026-Feb-03, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awag036
PMID:41630162
|
研究论文 | 本研究揭示ARX突变通过影响皮质中间神经元发育和迁移导致发育性癫痫的机制 | 首次结合单细胞RNA测序和ChIP-seq揭示ARX调控细胞周期进程、中间神经元亚型分化及迁移的分子机制，并发现LMO1通过抑制Cxcr4表达调控中间神经元迁移的新通路 | 主要在动物模型中验证，仅有一例患者脑组织数据；未完全阐明ARX下游所有靶基因的功能 | 阐明ARX突变导致皮质中间神经元功能障碍进而引发发育性癫痫的病理机制 | 小鼠模型和一名携带ARX致病突变并诊断为发育性癫痫脑病的患者脑组织 | 数字病理学 | 发育性癫痫、神经发育障碍 | 单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀测序、皮层切片培养 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据、染色质结合数据、组织病理数据 | 小鼠模型和1例患者脑组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 914 | 2026-05-29 |
Single-cell atlas of the transcriptome and chromatin accessibility in the human retina
2026-Feb, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02454-1
PMID:41578023
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研究论文 | 构建了人类视网膜的单细胞转录组和染色质可及性整合图谱 | 整合了来自125名捐赠者的约390万个细胞，包含已发表和未发表数据，鉴定出130多种细胞类型，并分析了跨细胞类型的转录组、染色质和基因调控网络差异 | 未明确提及局限性 | 创建全面的人类视网膜细胞图谱，促进对视网膜功能和病理的理解 | 人类视网膜细胞 | 单细胞组学 | 视网膜疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组和染色质可及性数据 | 约390万个细胞，来自125名捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 915 | 2026-05-29 |
In Vivo CRISPR Interference Screen Reveals Long Noncoding RNA Portfolio Crucial for Cutaneous Squamous Cell Carcinoma Tumor Growth
2026-Jan, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.04.038
PMID:40441291
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研究论文 | 通过体内CRISPR干扰筛选，揭示了长链非编码RNA在皮肤鳞状细胞癌肿瘤生长中的关键作用 | 首次利用体内CRISPR干扰筛选结合单细胞测序数据，系统鉴定出影响皮肤鳞状细胞癌生长的长链非编码RNA谱系 | NA | 探索长链非编码RNA在皮肤鳞状细胞癌生长中的作用 | 皮肤鳞状细胞癌细胞系和异种移植模型 | 机器学习和数字病理学 | 皮肤鳞状细胞癌 | CRISPR干扰筛选、单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 正常和皮肤鳞状细胞癌人类皮肤组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 916 | 2026-05-29 |
Pharmacovigilance-Based Identification and Mechanistic Exploration of Periodontitis-Related Drugs
2026-01, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.70040
PMID:40957584
|
研究论文 | 基于药物警戒数据挖掘与单细胞RNA测序分析，识别与牙周炎相关的药物及其潜在分子机制 | 首次利用大型真实世界FAERS数据库联合四种信号检测算法及逻辑回归，系统识别与牙周炎显著相关的药物，并通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序验证候选基因VEGFA的因果作用及细胞类型特异性表达 | 因果关系需进一步验证，且数据来源可能受报告偏倚影响 | 从真实世界数据中识别牙周炎相关药物的潜在风险并探索其分子机制 | 牙周炎患者及药物相关蛋白靶点 | 自然语言处理 | 牙周炎 | FAERS数据挖掘、孟德尔随机化、单细胞RNA测序 | 逻辑回归、信号检测算法 | 文本（药物不良反应报告）、基因表达数据 | FAERS数据库大量报告，UKB-PPP和deCODE队列，牙龈及外周血单细胞RNA测序样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒 |
| 917 | 2026-05-29 |
Spatial Transcriptomic Assessments of Gene Expression Profiles in Human Peri-Implant Lesions
2026-01, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.70008
PMID:41077421
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研究论文 | 通过空间转录组学、RNA测序和免疫组化分析人类种植体周围病变组织的基因表达谱 | 首次采用空间转录组学技术研究人类种植体周围炎病变的组织特异性基因表达模式，结合RNA测序和免疫组化进行多维度验证 | 样本量较小（空间转录组学n=4，RNA测序n=20），可能限制发现的广泛适用性 | 分析种植体周围炎和健康种植体部位人类组织样本的基因表达差异及其生物学通路 | 人类种植体周围软组织活检样本，包括严重种植体周围炎患者和相邻无炎症对照种植体 | 数字病理学 | 种植体周围炎 | 空间转录组学, RNA-seq, 免疫组化 | NA | 基因表达数据 | 空间转录组学4例，RNA测序20例，免疫组化38例 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 918 | 2026-05-29 |
Advancing lupus nephritis research through multi-omics and predictive modeling
2026 Jan-Dec, Innate immunity
IF:2.8Q3
DOI:10.1177/17534259261426818
PMID:42041246
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，结合机器学习模型，揭示狼疮性肾炎的细胞和分子驱动因素 | 首次通过非负矩阵分解识别免疫元程序，并利用细胞间通讯网络分析，结合399种机器学习预测模型，实现高精度诊断 | 样本量限制可能影响模型泛化性，分子对接模拟结果仍需实验验证 | 解析狼疮性肾炎的细胞异质性和分子机制，构建精准诊断模型 | 狼疮性肾炎患者的肾活检组织及外部验证队列的批量转录组数据 | 机器学习 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、非负矩阵分解、细胞通讯分析、分子对接 | 机器学习预测模型（399种） | 基因表达数据 | 狼疮性肾炎活检样本（具体数量未说明）及大规模批量RNA测序队列 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 919 | 2026-05-29 |
Identification of Gene Signatures and Molecular Mechanisms for Diagnosing Parkinson's Disease and Nonalcoholic Fatty Liver Disease Using Machine Learning
2026, Parkinson's disease
DOI:10.1155/padi/8731032
PMID:42205493
|
研究论文 | 利用机器学习方法识别帕金森病与非酒精性脂肪肝病共病相关的基因标志物和分子机制 | 首次通过整合转录组数据、机器学习和单细胞RNA测序，系统揭示了NAFLD与PD在分子层面的关联，并筛选出核心候选基因及治疗药物 | 研究主要依赖公开数据库的转录组数据，未进行实验验证，且样本量有限可能影响结果的普适性 | 探索非酒精性脂肪肝病与帕金森病之间的分子联系，识别共病诊断的生物标志物和潜在治疗靶点 | 非酒精性脂肪肝病和帕金森病患者的转录组数据以及相关分子特征 | 机器学习 | 帕金森病, 非酒精性脂肪肝病 | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | LASSO, 神经网络, 随机森林 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 920 | 2026-05-29 |
Nitidine chloride suppresses polo-like kinase 1 via MYCN-associated transcriptional regulation in colorectal cancer: a multi-omics and spatial transcriptomics study
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1824796
PMID:42205755
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研究论文 | 本研究结合多组学和空间转录组学，揭示了氯化两面针碱通过MYCN相关转录调控抑制结直肠癌中PLK1的机制 | 首次通过多组学整合、单细胞和空间转录组学分析，系统阐明氯化两面针碱靶向PLK1并通过MYCN-PLK1轴发挥抗结直肠癌作用 | 尚未明确PLK1与MYCN之间的直接转录调控关系，以及NC在CRC中的其他潜在靶点 | 阐明氯化两面针碱在结直肠癌中的分子靶点及其作用机制 | 结直肠癌组织和细胞系（HCT116），以及异种移植肿瘤模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序、单细胞转录组学、空间转录组学、分子动力学模拟、ChIP-seq、AlphaFold-Multimer对接、RT-qPCR、免疫组化 | GROMACS分子动力学模拟、AlphaFold-Multimer | 基因表达数据、测序数据、分子结构数据、图像数据 | 3,513个标本（2,256个肿瘤和1,257个非肿瘤样本） | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA |