本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 901 | 2026-04-11 |
CCS-mediated mechanistic link between gestational diabetes mellitus and carpal tunnel syndrome: a multi-omics MR framework
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1766134
PMID:41890708
|
研究论文 | 本研究通过多组学孟德尔随机化框架揭示了妊娠期糖尿病与腕管综合征之间的因果关联,并识别出CCS基因作为关键分子介质 | 首次采用多组学整合方法(包括遗传相关性分析、孟德尔随机化、eQTL/pQTL分析、单细胞转录组等)系统阐明GDM通过CCS介导的氧化、免疫和纤维化通路导致CTS的机制 | 研究主要基于欧洲人群的遗传数据,可能限制其跨人群普适性;动物模型和分子对接结果需进一步实验验证 | 探究妊娠期糖尿病是否以及如何通过分子通路因果增加腕管综合征风险 | 妊娠期糖尿病女性与腕管综合征患者 | 生物信息学与多组学整合 | 妊娠期糖尿病与腕管综合征 | 连锁不平衡评分回归、双样本孟德尔随机化、全基因组关联研究、eQTL/pQTL分析、贝叶斯共定位、RNA-seq、单细胞RNA-seq、组织学、免疫荧光、分子对接 | 孟德尔随机化框架、贝叶斯模型 | 遗传数据、转录组数据、蛋白质组数据、单细胞数据、动物实验数据 | 基于FinnGen和UK Biobank的大规模人群队列,具体样本量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 902 | 2026-04-11 |
A lactylation modification-related prediction model for the diagnosis of ulcerative colitis based on machine learning
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1717232
PMID:41890712
|
研究论文 | 本研究基于机器学习方法,通过分析GEO数据库中的溃疡性结肠炎数据集,识别了与乳酸化修饰相关的核心基因,并构建了一个高预测性能的诊断模型 | 首次将乳酸化修饰与溃疡性结肠炎诊断相结合,利用机器学习方法从多组学数据中筛选核心基因,并构建了具有高AUC值的诊断预测模型 | 研究主要基于公共数据集,缺乏大规模独立队列验证,体外实验验证范围有限 | 探究乳酸化修饰在溃疡性结肠炎发病机制中的作用,并开发基于乳酸化相关基因的诊断预测模型 | 溃疡性结肠炎患者样本数据及体外细胞实验 | 机器学习 | 溃疡性结肠炎 | RNA测序,单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 三个GEO数据集(GSE206285、GSE75214、GSE87466) | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 903 | 2026-04-11 |
Comprehensive management of hematopoietic stem cell transplantation complications: from infection prevention to immune microenvironment reconstruction
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1740067
PMID:41890754
|
综述 | 本文系统综述了造血干细胞移植(HSCT)关键并发症(如感染、移植物抗宿主病、肝窦阻塞综合征)的管理,并探讨了从感染预防到免疫微环境重建的综合策略 | 强调了优化预处理方案以降低感染风险,讨论了来特莫韦等新型抗病毒药物在感染控制中的作用转变,分析了涉及效应与调节性T细胞失衡的GVHD发病机制,并指出肠道微生物群调节是一种有前景的干预措施 | 作为一篇综述文章,未报告原始研究数据,其结论基于现有文献的综合分析 | 系统回顾并探讨造血干细胞移植并发症的综合管理策略及未来研究方向 | 造血干细胞移植(HSCT)患者及其相关并发症 | NA | NA | 单细胞测序,微生物组分析 | 人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 904 | 2026-04-11 |
Renshen-Baidu-San restores epithelial-immune crosstalk and drives type 2 immune repair in ulcerative colitis: an integrated multi-omics study
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1777808
PMID:41890762
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学方法,揭示了人参败毒散通过调节代谢通路、恢复上皮-免疫细胞互作并驱动2型免疫修复来治疗溃疡性结肠炎的机制 | 首次结合血清代谢组学、网络药理学、分子对接和单细胞RNA测序,系统阐明了人参败毒散在溃疡性结肠炎中恢复上皮-免疫串扰并促进2型免疫修复的多重作用机制 | 研究基于DSS诱导的小鼠溃疡性结肠炎模型,其结论在人类患者中的普适性仍需进一步验证 | 阐明人参败毒散治疗溃疡性结肠炎的潜在生物学机制 | DSS诱导的溃疡性结肠炎小鼠模型及结肠类器官 | 多组学整合分析 | 溃疡性结肠炎 | 血清代谢组学, 网络药理学, 分子对接, 单细胞RNA测序, 结肠类器官实验 | NA | 代谢组数据, 转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 905 | 2026-04-11 |
M2-type tumor-associated macrophages promote invasion of canine breast cancer through ADAM9 upregulation
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1777860
PMID:41890767
|
研究论文 | 本研究通过犬乳腺肿瘤模型和人类转录组数据集,揭示了ADAM9作为M2型肿瘤相关巨噬细胞促进肿瘤侵袭的关键效应分子 | 首次在跨物种水平上确认ADAM9在M2极化TAMs中的富集,并阐明其通过ECM重塑和细胞骨架调控介导肿瘤侵袭的机制 | 研究主要基于体外模型和转录组数据分析,缺乏体内实验验证;犬模型与人类疾病的直接可比性需进一步确认 | 探究肿瘤相关巨噬细胞驱动肿瘤侵袭的分子机制,并识别关键效应分子 | 犬乳腺肿瘤模型、人类转录组数据集、IL-4诱导的M2巨噬细胞、肿瘤球体模型 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、转录组分析、基因敲低、条件培养基实验 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 906 | 2026-04-11 |
Sparse dimensionality reduction for analyzing single-cell-resolved interactions
2026, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbag047
PMID:41890810
|
研究论文 | 本文提出了一种针对单细胞细胞间相互作用数据的端到端降维工作流程,旨在简化细胞对间相互作用模式的分析 | 采用稀疏降维方法(特别是Boosting Autoencoder)来精确定位与细胞对簇相关的特定配体-受体相互作用,并提供包括结果可视化在内的全面工作流程 | 未在摘要中明确提及具体限制,但可能依赖于已知配体-受体相互作用的先验信息 | 增强单细胞转录组学数据中细胞间相互作用的重建和分析 | 单细胞细胞间相互作用数据,特别是基于配体-受体相互作用的细胞对 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学 | Boosting Autoencoder | 单细胞转录组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 907 | 2026-04-11 |
Signaling Through SCFA Receptors Gpr43 and Gpr109a Drives Pro-Inflammatory M1 Macrophage Polarization in Periodontitis
2026, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/3542645
PMID:41948871
|
研究论文 | 本研究探讨了牙周炎中微生物群衍生的短链脂肪酸失衡与宿主免疫失调之间的联系,重点关注炎症性巨噬细胞的代谢重编程 | 通过整合系统综述、meta分析、批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,揭示了牙周炎中M1巨噬细胞极化受SCFA受体Gpr43和Gpr109a信号驱动的机制,并提出了“SCFA受体-代谢感应-炎症转录”的新疾病进展模型 | meta分析显示丁酸盐水平下降趋势不显著;研究主要基于转录组学数据,缺乏蛋白质或功能验证 | 阐明牙周炎中短链脂肪酸代谢失衡如何通过影响巨噬细胞极化驱动疾病进展 | 人类牙龈组织、小鼠骨髓细胞 | 生物信息学 | 牙周炎 | RNA-seq, scRNA-seq, 系统综述与meta分析 | CIBERSORT, 伪时间轨迹分析 | 转录组测序数据 | 人类牙龈组织样本24例,小鼠单细胞数据未明确样本数 | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 908 | 2026-04-11 |
EZH2-Mediated Epigenetic Modifications Induce Pyroptosis in Dental Pulp Endothelial Cells via Activation of NLRP6 Inflammasome During Pulpitis Development
2026, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/5876995
PMID:41948911
|
研究论文 | 本研究探讨了牙髓炎发展过程中牙髓组织细胞组成和焦亡途径的变化,并初步验证了EZH2通过NLRP6调节LPS诱导的血管内皮细胞焦亡的调控作用 | 揭示了EZH2介导的表观遗传修饰通过激活NLRP6炎性体诱导牙髓内皮细胞焦亡的新机制,为理解牙髓炎发病机制提供了新视角 | 研究主要基于体外细胞模型和生物信息学分析,缺乏体内实验的全面验证,且样本规模有限 | 探索牙髓炎中细胞焦亡的调控机制,为牙髓炎治疗提供潜在靶点 | 牙髓组织、血管内皮细胞(EOMA细胞系) | 生物信息学 | 牙髓炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、微阵列分析、RNA测序(RNA-seq) | EZH2抑制模型、NLRP6敲低模型 | 基因表达数据 | 未明确具体样本数量,涉及公共数据库数据和实验模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 909 | 2026-04-11 |
Single-cell analysis of inhibitory efferent neurons of the zebrafish lateral line
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0346255
PMID:41950195
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了斑马鱼侧线系统中抑制性传出神经元(REN、ROLE和RELL)的转录组特征,并评估了它们对神经丘毛细胞的支配模式 | 首次在斑马鱼幼虫中对侧线系统的抑制性传出神经元亚型进行单细胞转录组分析,并揭示了它们在神经丘支配模式上的差异 | 转录组分析未发现明显的细胞功能差异通路,且关于膜电位相关基因表达差异的功能验证尚未完成 | 探究斑马鱼侧线系统中不同抑制性传出神经元亚型是否存在功能差异 | 斑马鱼幼虫(5日龄)的侧线系统抑制性传出神经元(REN、ROLE、RELL细胞) | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5日龄斑马鱼幼虫的REN、ROLE和RELL神经元 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 910 | 2026-04-11 |
Protocol: A multi-factorial, multi-centre study, for biomarker identification in healthy controls for comparison to babies with moderate-severe NESHIE
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0346798
PMID:41950213
|
研究论文 | 本研究是一项多中心观察性研究,旨在通过整合临床和分子数据,全面比较中度至重度新生儿缺氧缺血性脑病(NESHIE)患儿与健康足月对照,以阐明NESHIE的临床和生物学机制 | 提供了南非队列中NESHIE分子和微生物景观的多维视角,整合了基因组学、表观遗传学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、微生物组学和病理学等多种分析手段 | 研究设计为观察性研究,无法确定因果关系;样本来自特定地理区域(南非),可能限制结果的普适性 | 阐明新生儿缺氧缺血性脑病(NESHIE)的临床和生物学机制,以支持早期诊断生物标志物的开发、改善风险分层并指导新的治疗策略 | 中度至重度NESHIE新生儿和健康足月新生儿 | 数字病理学 | 新生儿缺氧缺血性脑病 | 全基因组测序、亚硫酸氢盐测序、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、液相色谱-质谱联用技术 | NA | 基因组数据、DNA甲基化数据、基因表达数据、蛋白质组数据、代谢组数据、微生物组数据、组织病理学图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 911 | 2026-04-11 |
Multidimensional tumor heterogeneity and its role in therapeutic resistance
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1794130
PMID:41958668
|
综述 | 本文综述了肿瘤异质性在实体瘤治疗抵抗中的作用,特别关注黏膜屏障部位肿瘤的独特免疫环境 | 系统整合了肿瘤内在异质性(遗传、表观遗传、表型、空间、时间)与黏膜免疫微环境(免疫耐受、慢性炎症、持续抗原暴露)之间的相互作用,并强调了髓系细胞可塑性在这一过程中的关键界面作用 | 作为一篇综述文章,未报告原始研究数据,主要基于现有文献的综合分析 | 阐明多维肿瘤异质性如何驱动治疗抵抗,并探讨克服抵抗的转化策略 | 实体恶性肿瘤,特别是结直肠癌和肺癌等典型黏膜肿瘤,以及乳腺癌、黑色素瘤和接受免疫治疗的恶性肿瘤 | 肿瘤免疫学 | 多种癌症(结直肠癌、肺癌、乳腺癌、黑色素瘤等) | 单细胞测序、空间转录组学、多重成像、液体活检、人工智能分析 | NA | 多组学数据、空间数据、影像数据、液体活检数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 912 | 2026-04-11 |
Preoperative systemic inflammation and muscle fatty infiltration are prognostic factors for quadriceps atrophy following anterior cruciate ligament reconstruction
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1796054
PMID:41958664
|
研究论文 | 本研究探讨了前交叉韧带重建术后股四头肌萎缩的预后因素及其潜在的细胞机制 | 首次结合临床队列与单细胞RNA测序分析,揭示了术前肌肉脂肪浸润和全身性炎症是术后肌肉萎缩的独立预测因子,并发现凋亡的肌肉卫星细胞通过抑制铁死亡激活纤维/脂肪祖细胞,从而促进脂肪浸润的新机制 | 样本量较小(仅26名患者),且为观察性研究,因果关系需进一步验证 | 探究前交叉韧带重建术后肌肉萎缩的预后因素和细胞分子机制 | 前交叉韧带重建术后患者及固定状态下的肌肉组织 | 数字病理学 | 骨科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、单细胞RNA测序数据 | 26名前交叉韧带重建术后患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 913 | 2026-04-11 |
Hyaluronic acid-CD44 signaling from decidual stromal cells orchestrates dNK1 differentiation and immune tolerance in early pregnancy
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1777567
PMID:41958673
|
研究论文 | 本研究揭示了蜕膜基质细胞通过透明质酸-CD44信号通路调控dNK1细胞分化,促进早期妊娠免疫耐受的机制 | 首次发现蜕膜基质细胞来源的透明质酸通过CD44-Wnt-FOSL2轴驱动外周NK细胞向组织驻留型dNK1样表型转化 | 研究主要基于体外实验和单细胞数据分析,缺乏体内直接验证;样本量相对有限 | 探究蜕膜基质细胞如何通过透明质酸信号调控自然杀伤细胞功能以维持母胎界面免疫耐受 | 蜕膜基质细胞、蜕膜自然杀伤细胞、早期妊娠组织样本 | 生殖免疫学 | 自然流产 | 单细胞RNA测序、Western blotting、功能实验 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据 | 自然流产与正常妊娠的蜕膜组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 914 | 2026-04-11 |
Dissecting tumor heterogeneity in colorectal cancer: uncovering the role of BCL2L1+ cells through single-cell analysis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1742767
PMID:41958675
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析结直肠癌原发灶和肝转移灶,揭示了BCL2L1+肿瘤细胞亚型在肝转移中的关键作用及其通过代谢重编程和免疫逃逸促进肿瘤进展的机制 | 首次在单细胞水平上鉴定出结直肠癌肝转移中富集的BCL2L1+肿瘤细胞亚型,并发现转录因子CEBPG通过调控BCL2L1表达促进肿瘤生存和迁移,同时构建了基于该亚型的预后风险分层模型 | 样本量相对有限,功能验证主要依赖体外实验,缺乏体内模型和临床队列的进一步验证 | 解析结直肠癌肝转移的肿瘤异质性,鉴定驱动转移的关键细胞亚型和分子机制,寻找新的治疗靶点 | 结直肠癌原发灶和肝转移灶组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | Seurat, Harmony, inferCNV, CytoTRACE, Slingshot, CellChat, pySCENIC | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量,包括原发性和肝转移性结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 915 | 2026-04-11 |
Revealing key genes and molecular mechanisms associated with dietary restriction in ulcerative colitis
2026, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2026.1786138
PMID:41959722
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析揭示了与溃疡性结肠炎饮食限制相关的关键基因及其分子机制 | 首次结合饮食限制相关基因与溃疡性结肠炎差异表达基因,利用机器学习算法识别出CPT1A、ANGPTL4和CLDN1三个关键基因,并构建了深度神经网络模型和诊断列线图 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,实验验证样本量有限,需要进一步的前瞻性临床研究确认 | 探索饮食限制相关基因在溃疡性结肠炎中的作用机制,为精准治疗提供新方向 | 溃疡性结肠炎患者和饮食限制相关基因 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | 生物信息学分析、机器学习、单细胞RNA测序、实验验证 | 深度神经网络、诊断列线图 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 基于GEO数据库中的GSE75214和GSE73661数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 916 | 2026-04-11 |
Spatial localization of arachidonic acid in human carotid atherosclerotic plaques reveals a pro-inflammatory metabolic program in macrophages
2026, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2026.1786539
PMID:41959723
|
研究论文 | 本研究通过空间组学技术揭示了花生四烯酸在人类颈动脉粥样硬化斑块中的空间定位及其与巨噬细胞的关联,证实了其促炎作用 | 首次应用空间代谢组学技术直接展示了“亚油酸-花生四烯酸-白三烯D4”代谢轴在斑块内的动态空间分布,为花生四烯酸的促炎角色提供了直接空间证据 | 研究样本来源于颈动脉内膜切除术,可能无法完全代表所有类型的动脉粥样硬化病变;空间代谢组学技术的分辨率可能限制了对细胞亚型更精细定位的分析 | 识别与动脉粥样硬化疾病进展相关的关键分子,特别是促炎代谢物的空间分布及其与炎症细胞的关联 | 人类颈动脉粥样硬化斑块组织,包括稳定和不稳定斑块 | 空间组学 | 心血管疾病 | 代谢组学、空间代谢组学、单细胞转录组学、基质辅助激光解吸/电离质谱成像 | NA | 代谢物数据、空间分布数据、单细胞转录组数据 | 通过颈动脉内膜切除术收集的人类颈动脉粥样硬化斑块组织,具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq、空间代谢组学 | NA | NA |
| 917 | 2026-04-11 |
Combined single-cell transcriptome and Mendelian randomization to identify and validate prognostic genes associated with endoplasmic reticulum stress and butyrate metabolism in lung adenocarcinoma
2026, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2026.1781852
PMID:41960145
|
研究论文 | 本研究整合单细胞转录组分析和孟德尔随机化方法,鉴定并验证了与内质网应激和丁酸代谢相关的肺腺癌预后基因 | 首次结合单细胞转录组与孟德尔随机化识别肺腺癌中内质网应激和丁酸代谢共调控的预后基因,并构建风险模型和列线图 | 需要临床队列和功能研究进一步验证以转化至临床应用 | 识别和验证与内质网应激和丁酸代谢相关的肺腺癌预后基因,以改善诊断、预后和潜在治疗靶点 | 肺腺癌患者数据及非小细胞肺癌细胞系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组分析, 孟德尔随机化, RT-qPCR | 加权基因共表达网络分析, 风险模型, 列线图 | 转录组数据, 单细胞数据 | 公共数据集及不同非小细胞肺癌细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 918 | 2026-04-11 |
Multifaceted mechanistic exploration of Geranium wilfordii Maxim. in asthma treatment: integrating network pharmacology, machine learning, Mendelian randomization and experimental validation
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1761424
PMID:41960185
|
研究论文 | 本研究通过整合网络药理学、机器学习、孟德尔随机化和实验验证,探讨了老鹳草治疗哮喘的多层面作用机制 | 首次将网络药理学、机器学习、孟德尔随机化分析与动物实验相结合,系统性地揭示了老鹳草通过调控NOTCH2、HDAC2和MAPK1等关键靶点,影响CD4+ T细胞和调节性T细胞活性,从而发挥抗哮喘作用的机制 | 研究主要基于公开的GEO数据集和动物模型,尚未在人体临床试验中得到验证,且具体化合物与靶点相互作用的详细分子通路有待进一步阐明 | 探究传统中药老鹳草治疗哮喘的活性成分及其通过免疫细胞调控发挥作用的分子机制 | 老鹳草(Geranium wilfordii Maxim.)的化合物、哮喘相关的分子靶点及免疫细胞 | 机器学习 | 哮喘 | UPLC-QE-Orbitrap-MS、网络药理学、机器学习、孟德尔随机化、分子对接、免疫浸润分析、单细胞RNA测序分析 | 机器学习模型(未指定具体类型) | 质谱数据、基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 919 | 2026-04-11 |
The LAMB3-ITGA6 axis orchestrates epithelial repair in periodontitis via hemidesmosomal regulation and keratinization modulation
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1764896
PMID:41960183
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和体外细胞模型,揭示了LAMB3-ITGA6轴在牙周炎上皮修复中的核心调控作用,为牙周愈合提供了精准医学框架 | 首次利用单细胞测序解析牙周炎治疗后牙龈上皮的基因表达模式,并发现LAMB3-ITGA6轴作为协调上皮粘附和强度的中枢枢纽,通过视黄酸调控角质化过程 | 研究主要基于体外细胞模型和小鼠皮肤伤口模型,未直接在牙周炎动物模型中验证LAMB3-ITGA6轴的功能,且样本来源可能有限 | 探究牙周炎治疗后上皮修复的调控机制,特别是半桥粒相关基因的作用 | 牙周炎患者的牙龈上皮组织、人口腔角质细胞、小鼠背部全层皮肤伤口模型 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 牙周炎患者牙龈组织、人口腔角质细胞、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 920 | 2026-04-11 |
Use of Single-Cell Data and scPagwas Analysis to Identify T Cell Subsets and Construct a Prognostic Model for Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/1916444
PMID:41960370
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序、GWAS和TCGA等多组学数据,通过scPagwas算法识别T细胞亚群,构建了一个包含七个风险基因的临床预后模型,用于透明细胞肾细胞癌的预后预测和潜在治疗靶点探索 | 首次结合scPagwas算法将GWAS与单细胞RNA测序数据整合,识别KIRC中的特征性T细胞亚群,并构建基于机器学习的临床预后模型,同时通过药物敏感性分析和分子对接预测了针对DOCK8的潜在治疗药物 | 研究依赖于公共数据集,可能存在批次效应;模型验证仅使用了两个外部数据集,需要更多独立队列验证;药物预测结果尚未经过实验验证 | 构建透明细胞肾细胞癌的新预后模型以优化治疗决策、改善临床获益,并探索潜在治疗靶点 | 透明细胞肾细胞癌患者 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序, GWAS, 加权相关网络分析, 差异表达基因分析, 机器学习算法, 分子对接 | XGBoost, LightGBM | 单细胞RNA测序数据, 基因组关联研究数据, 转录组数据, 临床数据 | 包括GSE171306单细胞数据集、TCGA-KIRC数据集、GSE29609和E-MTAB-1980验证数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |