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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 901 | 2025-11-27 |
Liver Colonization by Colorectal Cancer Metastases Requires YAP-Controlled Plasticity at the Micrometastatic Stage
2022-05-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-21-0933
PMID:35570706
|
研究论文 | 本研究揭示了结直肠癌肝转移过程中YAP控制的细胞可塑性在微转移阶段的关键作用 | 发现微转移灶缺乏癌症干细胞,而明显转移灶通过多细胞阶段的细胞可塑性重新产生癌症干细胞 | NA | 研究结直肠癌肝转移的分子机制和细胞动态变化 | 结直肠癌患者肝标本、小鼠肝脏转移模型、患者来源的结直肠癌类器官 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 活体显微镜、单细胞RNA测序、类器官培养 | NA | 图像、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 902 | 2025-11-26 |
Fibroblastic FLT3L supports lymph node dendritic cells in the interfollicular niche
2025-Dec, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02332-2
PMID:41249485
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研究论文 | 本研究揭示了表达Gremlin1的淋巴结成纤维网状细胞通过提供FLT3L支持树突状细胞稳态的机制 | 首次发现GREM1+成纤维网状细胞是淋巴结中提供FLT3L支持树突状细胞稳态的特定生态位 | NA | 探索淋巴结中维持树突状细胞稳态的特定生态位和机制 | 人和小鼠淋巴结中的树突状细胞和成纤维网状细胞 | 细胞生物学 | NA | 空间转录组学,细胞流式分析,遗传模型 | NA | 基因表达数据,细胞定位数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 903 | 2025-11-26 |
Macrophage Cell and Diagnostic Biomarkers in BLCA: Integrating Machine Learning With Single-Cell Analysis
2025-Dec, Clinical genitourinary cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1016/j.clgc.2025.102447
PMID:41139554
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞分析和机器学习方法,识别膀胱癌中巨噬细胞亚型并构建预后预测模型 | 首次系统识别膀胱癌中9种巨噬细胞亚型,并基于7个巨噬细胞相关基因构建预后模型 | 研究依赖于公共数据库数据,缺乏独立的前瞻性验证队列 | 探索膀胱癌中巨噬细胞异质性并开发诊断生物标志物 | 膀胱癌患者的外周血单核细胞、膀胱癌细胞和尿路上皮来源细胞 | 机器学习 | 膀胱癌 | 单细胞测序, 伪时间分析, 细胞间通讯分析, 加权基因共表达网络分析 | LASSO回归, 随机森林 | 单细胞测序数据, 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA数据库的膀胱癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 904 | 2025-11-26 |
Construction of a deep learning model and identification of BSG, PPARD, and SLC16A8 expression as potential indicators in the context of strategies for precision therapy to acute myeloid leukemia
2025-Dec, Hematology (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1080/16078454.2025.2592516
PMID:41284982
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析急性髓系白血病肿瘤微环境中T细胞的异质性,构建了基于BSG、PPARD和SLC16A8基因的预后风险模型 | 首次在AML中基于特定T细胞亚群(Cluster 4)构建深度学习预后模型,并鉴定BSG、PPARD和SLC16A8作为独立预后标志物 | 研究依赖于外部数据集进行验证,需要进一步实验验证基因功能机制 | 探索AML肿瘤微环境中T细胞异质性,寻找精准治疗的生物标志物 | 急性髓系白血病患者的T细胞亚群 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 随机森林, LASSO回归 | 基因表达数据 | AML患者单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 905 | 2025-11-26 |
Integrated bulk and single-cell RNA profiling implicates MFAP5+ CAFs in potential role in peritoneal metastasis of gastric cancer
2025-Nov-28, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152841
PMID:41205579
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序分析,揭示了MFAP5+ CAFs在胃癌腹膜转移中的关键作用 | 首次系统鉴定胃癌腹膜转移中CAF亚群的异质性,发现MFAP5+ CAFs作为终末促转移亚群的特异性富集 | NA | 探究胃癌腹膜转移的基质微环境驱动机制 | 配对的原发性胃癌和腹膜转移组织 | 单细胞组学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 多重免疫组化, 传统免疫组化 | NA | RNA测序数据, 免疫组化图像 | 配对的胃癌原发和转移组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 906 | 2025-11-26 |
Dexamethasone-induced immunosuppression in Pneumocystis pneumonia reprograms neutrophil metabolism and impairs antimicrobial function
2025-Nov-28, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152889
PMID:41205576
|
研究论文 | 本研究揭示了地塞米松在肺孢子菌肺炎中通过重编程中性粒细胞代谢状态损害其抗菌功能的机制 | 首次发现地塞米松诱导的免疫抑制通过特异性抑制脂肪酸氧化代谢通路损害中性粒细胞功能 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 探究地塞米松在肺孢子菌肺炎中改变肺部免疫的免疫学和代谢机制 | 地塞米松处理的免疫缺陷小鼠肺组织中的中性粒细胞 | 免疫代谢学 | 肺孢子菌肺炎 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,RT-qPCR,批量RNA测序,代谢组学 | NA | 基因表达数据,代谢数据 | 对照和地塞米松处理的小鼠肺组织 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 907 | 2025-11-26 |
Integrative Analysis of Lactylation-Associated Features in Abdominal Aortic Aneurysm and Its Immune Microenvironment Utilizing scRNA-seq and Bulk RNA Sequencing
2025-Nov-25, Circulation journal : official journal of the Japanese Circulation Society
IF:3.1Q2
DOI:10.1253/circj.CJ-24-0892
PMID:40301103
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,揭示了乳酰化修饰在腹主动脉瘤免疫微环境中的关键作用 | 首次系统性地探讨了乳酰化修饰在腹主动脉瘤中的特征及其与免疫微环境的关联,并利用113种机器学习算法组合识别出8个乳酰化相关枢纽基因 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限,需要进一步的功能实验确认机制 | 阐明乳酰化与腹主动脉瘤免疫反应之间的相互关系 | 腹主动脉瘤患者和动物模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, bulk RNA测序, 机器学习算法 | 多种机器学习算法组合 | 单细胞RNA测序数据, bulk RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 908 | 2025-11-26 |
PPARα Activation-Mediated Testosterone Reduction as the Key Adverse Outcome Pathway for Cd-Induced Male Infertility: A Novel Integrated Approach
2025-Nov-25, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.5c09190
PMID:41231235
|
研究论文 | 本研究通过整合多种方法识别了镉诱导男性不育的关键不良结局通路 | 首次系统构建了镉诱导男性不育的AOP网络,并确定PPARα激活介导的睾酮减少是关键通路 | NA | 识别镉诱导男性不育的关键不良结局通路 | 镉暴露的男性不育机制 | 环境毒理学 | 男性不育 | 网络毒理学,单细胞测序,NHANES研究,动物实验,分子建模 | NA | 基因表达数据,流行病学数据,实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 909 | 2025-11-26 |
Decoding crops one cell at a time: from cell atlases to single-cell genetics
2025-Nov-25, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/eraf516
PMID:41287580
|
综述 | 本文综述了单细胞和空间转录组学技术在作物研究中的应用及其潜力 | 将哺乳动物细胞单细胞筛选的经验应用于植物研究,提出整合单细胞技术与性状相关位点的策略 | 存在技术和生物学障碍需要克服 | 加速作物改良关键遗传变异的鉴定 | 作物细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 910 | 2025-11-26 |
A conserved differentiation program facilitates inhibitory neuron production in the developing mouse and human cerebellum
2025-Nov-25, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204811
PMID:41287940
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠和人类小脑发育过程中抑制性神经元分化的保守调控机制 | 首次发现FOXO1作为ASCL1下游关键调控因子,并证实WNT信号通路在促进神经元生成中的保守作用 | 研究主要基于新生小鼠小脑,人类样本验证相对有限 | 解析小脑发育过程中抑制性神经元分化的分子机制 | 小鼠和人类小脑中的巢蛋白表达祖细胞 | 发育生物学 | 脊髓小脑性共济失调 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 新生小鼠小脑NEPs和人类原代NEP培养物 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 911 | 2025-11-26 |
Integrated single-cell multi-omics profiling reveals a senescence-associated hematopoietic landscape and regulatory network in aging bone marrow
2025-Nov-24, Biogerontology
IF:4.4Q1
DOI:10.1007/s10522-025-10352-6
PMID:41284112
|
研究论文 | 通过整合单细胞多组学分析揭示衰老骨髓中与衰老相关的造血景观和调控网络 | 发现了一个新型造血亚群(占衰老样本的3.19%),该亚群激活细胞衰老通路并通过NMU信号增强与CD8⁺ T细胞的炎症串扰,建立了连接单细胞动态与组织水平衰老的关键分子模块 | 样本量较小(6个年轻和衰老骨髓样本),需要在更大队列中验证 | 表征骨髓中与年龄相关的变化并识别关键驱动因素 | 年轻和衰老骨髓样本 | 单细胞多组学 | 衰老相关疾病 | scRNA-seq, 蛋白质组学, 伪批量转录组学, WGCNA, CellChat分析, 差异表达分析, Cox回归模型, ROC曲线分析, 免疫组织化学, Western blot, 分子对接 | WGCNA转录因子网络模型, Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据, 批量RNA测序数据 | 6个骨髓样本(年轻和衰老)+ 2个独立批量RNA队列(n=58) | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 912 | 2025-11-26 |
Spanve: A Statistical Method for Downstream-friendly Spatially Variable Genes in Large-scale Data
2025-Nov-24, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf111
PMID:41284930
|
研究论文 | 开发了一种用于大规模空间转录组数据中空间可变基因检测的非参数统计方法 | 通过量化每个点或细胞与其局部邻居之间的表达差异来识别空间依赖性,无需分布假设,假阳性较少 | NA | 改进空间转录组学分析中空间可变基因的识别准确性 | 空间转录组数据中的基因表达模式 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 非参数统计方法 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 913 | 2025-11-26 |
Normal cardiac lymphatics and their mimics
2025-Nov-24, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00549.2025
PMID:41285409
|
研究论文 | 本研究通过淋巴管报告基因小鼠系统描绘了心脏各解剖部位淋巴管的正常分布模式 | 首次全面绘制小鼠心脏淋巴管的空间分布图谱,并发现淋巴管内皮细胞存在六种亚型 | 研究仅限于小鼠模型,人类心脏淋巴管分布可能有所不同 | 明确心脏各解剖部位淋巴管的结构和分布模式 | Prox1-tdTomato淋巴管报告基因小鼠的心脏组织 | 心血管生物学 | 心血管疾病 | 光片显微镜、冰冻切片、振动切片、免疫染色、单细胞RNA测序 | NA | 图像数据、基因表达数据 | 未明确样本数量的小鼠心脏组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 914 | 2025-11-26 |
Spatially resolved multi-omics of human metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2025-Nov-24, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02407-8
PMID:41286103
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间多组学技术构建了人类代谢功能障碍相关脂肪肝病的空间多组学图谱 | 首次在人类MASLD中整合单细胞转录组、空间转录组和空间代谢组数据,发现了MITF调控脂质相关巨噬细胞功能的新机制 | 样本量相对有限(共61例),且为观察性研究 | 揭示代谢功能障碍相关脂肪肝病的分子机制和细胞间相互作用 | 人类肝脏组织样本 | 空间多组学 | 代谢功能障碍相关脂肪肝病 | 单细胞转录组测序,空间转录组学,空间代谢组学,质谱成像 | NA | 转录组数据,代谢组数据,空间数据 | 61例人类肝脏(对照组10例,MASL 17例,MASH 34例) | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,空间代谢组学 | NA | NA |
| 915 | 2025-11-26 |
From slices to deep dishes: spatial transcriptomics and translatomics of thick tissue blocks
2025-Nov-24, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02815-y
PMID:41286202
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 916 | 2025-11-26 |
The Alzheimer's therapeutic Lecanemab attenuates Aβ pathology by inducing an amyloid-clearing program in microglia
2025-Nov-24, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-02125-8
PMID:41286448
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研究论文 | 本研究揭示了阿尔茨海默病治疗药物Lecanemab通过激活小胶质细胞清除Aβ病理的机制 | 首次证明Lecanemab通过Fc片段激活小胶质细胞,诱导特异性转录程序促进Aβ清除,并鉴定SPP1/骨桥蛋白为关键介质 | 使用人源小胶质细胞异种移植小鼠模型,可能与人类疾病存在差异 | 阐明抗淀粉样蛋白免疫疗法的分子机制 | 阿尔茨海默病相关的Aβ病理和小胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 人源小胶质细胞异种移植小鼠模型 | 基因表达数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 917 | 2025-11-26 |
Single-cell aggrephagy landscape delineates intercellular communication of tumor microenvironment associated with ovarian cancer progression and immunotherapy
2025-Nov-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04060-3
PMID:41286472
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了聚集自噬在卵巢癌肿瘤微环境细胞间通讯中的作用机制 | 首次系统描绘了聚集自噬调控因子介导的肿瘤微环境细胞间通讯在卵巢癌进展和抗肿瘤免疫调节中的作用 | 样本量相对有限(12个样本),需要进一步验证 | 探索聚集自噬在卵巢癌肿瘤微环境中的功能作用及其与免疫治疗的关系 | 卵巢癌组织和正常组织中的单细胞 | 单细胞组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序,非负矩阵分解,伪时间轨迹分析,CellChat分析 | NMF | 单细胞转录组数据 | 12个样本(7个卵巢癌组织,5个正常组织)共65,820个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 918 | 2025-11-26 |
Single-cell RNA sequencing revealed the association between proximal tubular epithelial cells and renal interstitial cells in chronic kidney disease progression
2025-Nov-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-28988-2
PMID:41286490
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示慢性肾脏病进展中近端肾小管上皮细胞与肾间质细胞的关联机制 | 识别出位于S1段的特定损伤PTEC亚群(PT_5),发现其通过多种配体-受体对协调间质重塑的多细胞串扰机制 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 阐明慢性肾脏病进展中损伤的近端肾小管上皮细胞特征及其与间质细胞的协调机制 | 慢性肾脏病小鼠模型中的肾脏细胞 | 单细胞生物学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 分别饲喂0.2%腺嘌呤饮食2、4、8周的CKD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 919 | 2025-11-26 |
Senescence-related gene signatures in Crohn's disease: integrating bulk and single-cell RNA sequencing analysis
2025-Nov-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-29727-3
PMID:41286494
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序分析,识别了与克罗恩病相关的衰老相关基因并构建诊断模型 | 首次系统整合bulk RNA-seq和scRNA-seq数据研究克罗恩病中的细胞衰老特征,并在单细胞水平揭示衰老异质性 | 需要进一步的功能实验验证这些基因在克罗恩病发病机制中的具体作用 | 探究衰老相关基因在克罗恩病中的作用及其对预后的影响 | 克罗恩病患者肠道组织、小鼠模型和临床样本 | 生物信息学 | 克罗恩病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 机器学习算法 | 机器学习算法, CIBERSORT算法 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 多个独立外部数据集、小鼠模型和临床样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 920 | 2025-11-26 |
LETM2 regulates mitochondrial function and autophagy in diabetic foot ulcers: implications for oxidative stress and therapeutic targeting
2025-Nov-22, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01748-1
PMID:41272316
|
研究论文 | 本研究通过分析糖尿病足溃疡的RNA测序数据,发现LETM2基因在维持线粒体功能和自噬中的关键作用 | 首次通过整合单细胞RNA测序数据识别LETM2作为糖尿病足溃疡中线粒体功能障碍的关键调控基因,并验证其在氧化应激条件下的功能 | 研究主要基于体外细胞模型,需要进一步体内实验验证;样本量有限 | 探索糖尿病足溃疡中线粒体功能障碍的分子机制和潜在治疗靶点 | 糖尿病足溃疡患者样本、人脐静脉内皮细胞 | 生物信息学 | 糖尿病足溃疡 | RNA测序、单细胞RNA测序、siRNA敲低、功能富集分析 | LASSO、SVM-RFE | 转录组数据、单细胞数据 | 多个公共数据集(GSE134431、GSE80178、GSE245703)和机构内部队列 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |