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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 901 | 2026-06-06 |
Reactive oligodendrocytes promote glioblastoma progression through CCL5/CCR5-mediated glioma stem cell maintenance
2026-Jan-21, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2025.12.012
PMID:41570802
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学等方法证明,胶质母细胞瘤细胞通过fractalkine信号招募少突胶质细胞至肿瘤边界,后者进入IFN诱导的反应状态并分泌CCL5,通过CCR5信号促进胶质瘤干细胞维持和肿瘤进展 | 首次揭示反应性少突胶质细胞在胶质母细胞瘤中的促肿瘤作用,并确立CCL5/CCR5轴为可药物靶点 | 未提及研究局限性 | 研究少突胶质细胞与胶质母细胞瘤细胞的功能互作及其在肿瘤进展中的作用机制 | 少突胶质细胞、胶质瘤干细胞、胶质母细胞瘤肿瘤微环境 | 机器学习和数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、免疫组化、细胞因子分析、迁移实验 | NA | 基因表达数据、组织图像 | 原发性和复发性胶质母细胞瘤肿瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 902 | 2026-06-06 |
Glycolytic heterogeneity drives metabolic-targeted therapy in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Jan-20, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02546-8
PMID:41554705
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研究论文 | 利用空间转录组学、单细胞和批量RNA测序以及多组学方法,揭示胰腺导管腺癌中糖酵解异质性并探索其临床意义和治疗潜力 | 首次系统揭示PDAC中糖酵解活动的异质性,并基于糖酵解表型提出患者分层框架,指导个性化代谢治疗 | 未提及具体局限性,可能涉及样本量有限或体外模型与体内环境的差异 | 研究PDAC中糖酵解异质性及其对代谢靶向治疗的影响 | 胰腺导管腺癌患者肿瘤组织、患者来源的细胞模型、类器官 | 数字病理学 | 胰腺导管腺癌 | 空间转录组学,单细胞RNA测序,批量RNA测序,代谢组学,蛋白质组学,脂质组学 | NA | 空间转录组数据,单细胞转录组数据,批量转录组数据,代谢组数据,蛋白质组数据,脂质组数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 903 | 2026-06-06 |
ASB5 is a specific marker for muscle satellite cells but dispensable for skeletal muscle development and regeneration
2026-Jan-19, Skeletal muscle
IF:5.3Q2
DOI:10.1186/s13395-025-00409-y
PMID:41549311
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研究论文 | 本研究识别ASB5为肌肉卫星细胞的特异性标志物,但发现其对于骨骼肌发育和再生并非必需 | 首次通过单细胞RNA测序数据鉴定ASB5为肌肉卫星细胞的特异性标志物,并利用CRISPR-Cas9基因编辑技术生成Asb5敲除小鼠模型,系统评估其在肌肉发育和再生中的功能 | 研究仅在正常生理条件下评估Asb5功能,未探讨在病理或应激条件下的作用;未进行体外分化实验以直接验证Asb5对肌源性分化的影响 | 鉴定新的肌肉卫星细胞分子标志物并阐明其在骨骼肌发育和再生中的功能 | 肌肉卫星细胞及其祖细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9基因编辑, 实时荧光定量PCR | NA | 单细胞RNA测序数据 | Asb5敲除小鼠品系:通过CRISPR-Cas9删除外显子4生成;使用公开数据集Tabula Muris和GSE150366 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 904 | 2026-06-06 |
Targeting thymidylate synthase enhances CD8 + T-cell infiltration and inhibits tumor growth in cervical cancer
2026-Jan-19, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-026-03250-5
PMID:41553654
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序、功能实验和体内模型,揭示了胸苷酸合酶在宫颈癌中通过调节CD8+ T细胞浸润来影响肿瘤生长的免疫代谢调控机制 | 首次阐明胸苷酸合酶作为免疫代谢调控因子在宫颈癌肿瘤微环境中的作用,并开发了包含TYMS、MYO6、SPINT1和ESD的T细胞相关预后特征 | 研究主要基于体外和动物模型,缺乏大规模临床样本验证;分子对接仅鉴定了一种抑制剂的可能靶点,需进一步实验确认 | 探究胸苷酸合酶在宫颈癌免疫代谢调控中的功能及其作为治疗靶点的潜力 | 宫颈癌肿瘤微环境中的胸苷酸合酶、CD8+ T细胞及相关信号通路 | 机器学习 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序、功能实验、体内模型 | NA | 单细胞转录组数据、转录组数据 | 47,589个细胞 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 905 | 2026-06-06 |
Thrombospondin 1 and 2 regulate mesenchymal progenitor cell fate and matrix organization
2026-Jan-19, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-025-00493-2
PMID:41554713
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研究论文 | 揭示血小板反应蛋白1和2在间充质祖细胞命运决定和细胞外基质组织中的调控作用 | 首次发现血小板反应蛋白1和2在创伤诱导的异位骨化形成中调控间充质祖细胞与细胞外基质相互作用,并通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了其差异表达模式 | 仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证; 未能完全阐明TSP1/2调控MPC分化的具体分子机制 | 阐明TSP1和TSP2在间充质祖细胞/细胞外基质相互作用以及异位骨化形成和进展中的角色 | 创伤诱导异位骨化小鼠模型中的间充质祖细胞和巨噬细胞 | 机器学习 | 异位骨化 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | TSP1/2双敲除小鼠及野生型对照小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3' 和 10x Visium 空间基因表达分析 |
| 906 | 2026-06-06 |
The Role of Cancer-Associated Fibroblasts and Tumor-Associated Macrophages in the Tumor Microenvironment and Their Impact on Ovarian Cancer Survival and Therapy
2026-Jan-19, Current oncology (Toronto, Ont.)
DOI:10.3390/curroncol33010059
PMID:41590379
|
综述 | 本文综述了肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞(CAFs)和肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)在上皮性卵巢癌中的作用,以及它们对肿瘤进展、治疗耐药和免疫逃逸的影响,并探讨了靶向这些细胞的新型治疗策略 | 利用单细胞测序和空间转录组学等先进技术,更精确地识别CAFs和TAMs亚型,为开发更精准的靶向治疗提供新思路 | 作为综述,未提供原始实验数据;CAFs和TAMs的异质性和动态相互作用机制仍有待进一步阐明 | 总结CAFs和TAMs在卵巢癌肿瘤微环境中的作用及其对治疗的影响,探索靶向这些细胞以改善治疗效果的可能性 | 上皮性卵巢癌中的癌症相关成纤维细胞(CAFs)和肿瘤相关巨噬细胞(TAMs) | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序,空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 907 | 2026-06-06 |
Spatial Imbalance of Innate-like T-Cell Niches Underlies Clinical Trajectories in Psoriasis
2026-Jan-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27020715
PMID:41596369
|
研究论文 | 利用空间转录组学揭示银屑病中先天性样T细胞(iLTC)生态位的空间失衡及其与临床轨迹的关联 | 首次通过空间转录组学描绘银屑病皮肤中γδT细胞和MAIT细胞生态位的层特异性分布,并发现其动态变化与临床严重程度相关 | 未提及,但可能包括样本量有限或需进一步功能验证 | 探究先天性样T细胞在银屑病炎症中的空间组织及其与临床结局的关系 | 银屑病患者皮肤组织中的γδT细胞和黏膜相关不变T细胞(MAIT)生态位 | 数字病理学 | 银屑病 | 空间转录组学、CITE-seq | NA | 空间转录组数据、单细胞蛋白质组数据 | 多个独立队列的银屑病皮肤样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台用于皮肤组织分析 |
| 908 | 2026-06-06 |
Revealing hidden regulatory dependencies: multi-perspective graph learning for single-cell gene regulatory network inference
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf733
PMID:41554051
|
研究论文 | 提出了ATFGRN,一种自适应拓扑特征融合图神经网络框架,用于从单细胞转录组数据中推断基因调控网络 | 创新性地融合了三个互补视角(子图结构编码、表达引导模块和相似性结构模块)的特征,通过注意力机制进行加权融合,实现了结构、表达和相似性信息的互补整合 | 未提及 | 提高从复杂高维单细胞转录组数据中推断基因调控网络的准确性 | 基因调控关系及其网络 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序 | 图神经网络、图卷积网络、图注意力网络 | 基因表达矩阵 | 未提及 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 909 | 2026-06-06 |
Insights into Cardiomyocyte Regeneration from Screening and Transcriptomics Approaches
2026-Jan-07, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27020601
PMID:41596256
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综述 | 本文通过对比高通量筛选和转录组学方法,总结了心肌细胞再生的最新研究进展,包括促增殖靶点的发现及不同筛选模型的优缺点 | 整合高通量筛选与单细胞组学数据,揭示了心肌细胞异质性对再生能力的影响,提出了多系统整合策略的重要性 | 缺乏临床转化验证,现有模型在模拟人类心脏微环境方面仍存在局限性,需进一步研究安全有效的促增殖靶点 | 系统比较用于发现心肌细胞增殖靶点的高通量筛选策略,并整合组学数据以推动心脏再生研究 | 包括斑马鱼胚胎、啮齿类心肌细胞、人诱导多能干细胞来源的心肌细胞和心脏类器官等模型 | 计算生物学 | 心血管疾病 | 高通量筛选, 单细胞核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics, Illumina | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 单细胞核RNA测序和空间转录组学平台 |
| 910 | 2026-06-06 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Conserved Cellular Communication Mechanisms Governing Ocular Lineage Specification from Human iPS Cells
2026-Jan-07, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15020104
PMID:41597181
|
研究论文 | 利用人诱导多能干细胞(hiPSCs)分化为眼类器官的单细胞RNA测序数据,揭示控制眼部谱系规范的保守细胞通讯机制 | 首次通过单细胞RNA测序分析hiPSCs向眼类器官分化过程中的细胞通讯网络,发现保守的发育信号通路(如Activin、FGF、BMP、WNT和视黄酸家族)在眼部器官形成中的作用 | NA | 研究早期眼睛发育过程中细胞命运决定的复杂性,并利用hiPSCs模拟这一过程 | 人诱导多能干细胞(hiPSCs)及其分化的二维眼类器官 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 911 | 2026-06-06 |
LncRNAs at the frontline of neuroimmune crosstalk in oral cancer
2026-Jan-06, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1093/cei/uxag007
PMID:41660801
|
综述 | 本文综述了长链非编码RNA在口腔癌神经免疫串扰中的作用 | 首次聚焦长链非编码RNA介导的神经免疫交叉通路,提出神经-免疫-癌症轴的概念 | 缺乏口腔鳞状细胞癌特异性功能研究、长链非编码RNA活性的空间或单细胞分辨率数据有限、评估长链非编码RNA驱动神经侵犯的体内模型不足 | 探讨长链非编码RNA在口腔癌中调控神经免疫相互作用的机制及其潜在治疗靶点 | 口腔鳞状细胞癌中的长链非编码RNA、神经免疫相互作用 | 数字病理学 | 口腔癌 | 功能基因组学、空间转录组学、神经-肿瘤共培养模型 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 912 | 2026-06-06 |
PAX6 Deficiency Compromises the Ability of Limbal Epithelial Stem Cells to Properly Differentiate Into Mature Corneal Epithelial Cells
2026-Jan-05, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.1.56
PMID:41590604
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析Pax6杂合小鼠模型,揭示PAX6缺陷导致角膜缘上皮干细胞向成熟角膜上皮细胞分化障碍的分子机制 | 首次在单细胞分辨率下阐明PAX6缺乏导致角膜缘上皮干细胞/早期瞬时扩增细胞功能异常,并阻碍其向角膜上皮细胞命运分化的分子机制 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人体组织中验证,且未深入探讨PAX6突变导致干细胞功能障碍的具体信号通路 | 探究PAX6突变引起无虹膜相关性角膜病变的分子病理机制 | 野生型和Pax6杂合小鼠的角膜及角膜缘组织 | 数字病理学 | 角膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量,涉及野生型和Pax6杂合小鼠的角膜/角膜缘组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒 |
| 913 | 2026-06-06 |
GSTO1 as a Potential Risk Factor for Diabetic Nephropathy: Evidence From Mendelian Randomisation and Multi-Omics Analyses
2026-Jan, Nephrology (Carlton, Vic.)
DOI:10.1111/nep.70165
PMID:41549440
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和多组学分析探讨GSTO1与糖尿病肾病的潜在因果关系 | 首次利用孟德尔随机化联合单细胞RNA测序和多组学数据揭示GSTO1在糖尿病肾病中的因果作用 | 研究结果基于公共数据库和体外实验,尚需更大样本量和体内实验验证 | 探究GSTO1与糖尿病肾病风险之间的潜在因果关系 | GSTO1基因变异、糖尿病肾病样本及高糖处理HK-2细胞 | 机器学习和生物信息学 | 糖尿病肾病 | 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、表达分析 | NA | 基因型数据、表达谱数据、单细胞RNA测序数据 | MR分析包含GWAS汇总数据,表达分析涉及Nephroseq、GEO数据集及人肾小管上皮细胞系HK-2 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 914 | 2026-06-06 |
Increased mROS Generation Associates With Cardiovascular Risk in BioHEART-CT PBMCs
2026-Jan, Clinical and translational science
DOI:10.1111/cts.70469
PMID:41549547
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研究论文 | 研究外周血单核细胞线粒体活性氧生成与冠心病风险的关系 | 通过联合MitoSOX流式细胞术和单细胞RNA测序,初步探索CCBE1基因在PBMC中的表达差异 | 样本量较小(40例),未发现PBMC线粒体活性氧与冠心病状态的一致关联,且亚组分析结果探索性且不稳健 | 评估PBMC线粒体活性氧作为冠心病血液生物标志物的潜力 | BioHEART-CT队列参与者外周血单核细胞(PBMCs) | 医学影像学,数字病理学 | 冠心病,心血管疾病 | 流式细胞术(MitoSOX),单细胞RNA-seq | NA | 流式细胞术数据,单细胞转录组数据 | 40例BioHEART-CT参与者(不同冠心病状态) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序用于分析PBMC中CCBE1差异表达 |
| 915 | 2026-06-06 |
LncRNA ZFAS1 Promotes Alveolar Bone Resorption by Enhancing Osteoclastogenesis in Periodontitis
2026-Jan, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.70134
PMID:41549697
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研究论文 | 探究长链非编码RNA ZFAS1在牙周炎中通过增强破骨细胞生成促进牙槽骨吸收的机制 | 首次揭示lncRNA ZFAS1在牙周炎微环境中作为双重路径调控因子,同时促进破骨细胞生成和抑制成骨细胞生成,并通过单细胞和bulk RNA测序技术验证其与早期破骨标志基因的强相关性 | 未提供具体局限性信息 | 阐明lncRNA ZFAS1在牙周炎骨重塑失调中的机制作用 | 牙周炎患者和健康者的牙周组织,以及RAW264.7和MC3T3-E1细胞系 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、qPCR、组织学、免疫组化 | NA | 基因表达数据、组织图像 | 包含健康和患病牙周组织样本,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 916 | 2026-06-06 |
IL-21 mediates crosstalk between T cells and NK cells during the remission of type 1 diabetes
2026-Jan, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-025-01439-y
PMID:41566069
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研究论文 | 揭示IL-21介导T细胞与NK细胞在1型糖尿病缓解期中的相互作用机制 | 首次鉴定出在1型糖尿病发病时扩增的CD226+CD56-CD16+ NK细胞亚群,并证明其通过IL-21和mTOR信号通路受到CD161+CD4+ T细胞调控,连接适应性免疫与先天免疫 | 主要在雌性小鼠模型中验证机制,人类纵向样本量有限 | 阐明自然杀伤细胞在1型糖尿病进展和缓解中的作用及免疫调节机制 | 1型糖尿病患者及雌性小鼠模型中的NK细胞和T细胞 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1型糖尿病患者样本(横断面和纵向分析)及雌性小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 917 | 2026-06-06 |
Spatiotemporal Evolution of Malignant Hepatocyte Clones Unveils Immune Evasion Features and Therapeutic Vulnerabilities in Hepatocellular Carcinoma
2026-Jan, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70181
PMID:41566770
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研究论文 | 整合单细胞和空间转录组学分析揭示肝细胞癌中恶性肝细胞克隆的时空演化特征、免疫逃逸机制及治疗脆弱性 | 通过整合单细胞和空间转录组学数据,首次系统揭示了Scissor细胞(主要为肝细胞)向恶性细胞演化过程中的免疫逃逸特征和关键信号通路(如MDK-SDC4和COL4A-SDC)驱动机制 | 未提及具体限制 | 探究肝癌发生和进展过程中的多细胞生态系统分子特征 | 肝细胞癌患者样本中的多种细胞类型,特别是Scissor肝细胞及其演化过程中的恶性克隆 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据(单细胞和空间转录组) | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium,10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序,10x Visium空间转录组学 |
| 918 | 2026-06-06 |
Single-cell RNA-seq reveals the piperlongumine is a potential drug for ischemic stroke
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0340725
PMID:41575950
|
研究论文 | 使用单细胞RNA测序揭示胡椒碱是缺血性中风的潜在治疗药物 | 首次通过单细胞RNA测序结合Connectivity Map分析和分子对接,发现胡椒碱可通过结合Actb和Cflar编码的蛋白治疗缺血性中风 | 仅基于一个公共单细胞数据集(GSE174574)进行分析,需更多样本验证 | 探索缺血性中风的潜在分子机制和有效治疗药物 | 缺血性中风的细胞类型和分子机制 | 机器学习 | 脑血管疾病,缺血性中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 一个公共数据集(GSE174574) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 919 | 2026-06-06 |
AugGCL: Multimodal graph learning for spatial transcriptomics analysis with enhanced gene and morphological data
2026-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013912
PMID:41576146
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研究论文 | 提出AugGCL框架,通过增强基因和形态学数据的图卷积学习来改进空间转录组学分析 | 采用双流加权图卷积网络联合建模基因特征与图像形态信息,并引入图像感知辅助重建以增强弱空间信号和锐化边界 | 未提及具体局限性 | 提升空间转录组学中空间域重建的准确性和边界清晰度 | 人类背外侧前额叶皮层、乳腺癌和小鼠胚胎的组织样本 | 机器学习, 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 加权图卷积网络 | 基因表达数据和图像数据 | 多个数据集(包括人类背外侧前额叶皮层、乳腺癌和小鼠胚胎) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 920 | 2026-06-06 |
Development of an in situ small intestinal injection technique for targeted macromolecule delivery and in vivo functional studies in mice
2026-Jan, Animal models and experimental medicine
IF:3.8Q2
DOI:10.1002/ame2.70123
PMID:41577652
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研究论文 | 介绍了一种用于小鼠小肠的微创原位注射技术,实现靶向大分子递送并评估其功能性应用 | 开发了一种绕过胃部降解的微创原位注射技术,实现生物大分子精准递送至小肠上皮细胞,并成功应用于单细胞RNA测序研究 | 未提及与口服灌胃或类器官培养相比的长期功能和安全性对比数据,且仅在小鼠模型中验证 | 开发一种用于小鼠小肠的微创原位注射技术,实现靶向大分子递送并进行体内功能研究 | 小鼠小肠及肠上皮细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |