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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 901 | 2026-06-03 |
Decoding the role of H19 in cholestatic liver injury using snRNA-seq, spatial transcriptomics, and machine learning-based disease prediction
2026-May-29, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-026-01590-3
PMID:42216109
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研究论文 | 利用snRNA-seq、空间转录组学和机器学习解码H19在胆汁淤积性肝损伤中的作用 | 首次结合单核RNA测序、空间转录组学和机器学习预测模型,揭示H19缺失通过抑制致病性胆管细胞状态和SPP1信号通路减轻胆汁淤积性肝损伤的机制,并鉴定出跨物种保守的胆管细胞标志物 | 未提及具体局限性,但可能包括小鼠模型与人类的差异、样本量有限、机器学习模型的泛化性需进一步验证 | 阐明长链非编码RNA H19在原发性硬化性胆管炎进展中的细胞和分子机制,并开发基于机器学习的疾病预测模型 | 年龄和性别匹配的野生型、H19敲除、Mdr2敲除和双敲除小鼠的肝脏组织 | 机器学习, 数字病理学 | 胆汁淤积性肝病, 原发性硬化性胆管炎 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 机器学习 | 机器学习预测模型 | 单核RNA测序数据, 空间转录组数据 | 未明确提供具体样本数量,涉及四种基因型小鼠的肝脏组织 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | GeoMx空间转录组学平台 | 单核RNA测序和GeoMx空间转录组学分析 |
| 902 | 2026-06-03 |
Microenvironment T-Type calcium channels regulate neuronal and glial processes in tumor cells to promote glioblastoma growth
2026-May-29, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag131
PMID:42218829
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研究论文 | 该研究揭示了微环境T型钙通道(Cav3)通过调节神经元和胶质细胞过程促进胶质母细胞瘤(GBM)生长的机制 | 首次证明微环境Cav3.2在GBM进展中的关键作用,并通过单细胞RNA-seq揭示其调控神经元和胶质细胞生物过程的机制 | 未明确说明具体局限性,但可能涉及动物模型与人类疾病的差异、钙通道阻滞剂mibefradil的临床适用性等 | 阐明微环境T型钙通道在调节GBM生长中的作用 | 小鼠GBM肿瘤模型、Cav3.2基因敲除小鼠、GBM干细胞、神经元细胞 | 神经肿瘤学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据(单细胞转录组) | 具体样本数量未说明,包括WT和Cav3.2 KO小鼠的肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 903 | 2026-06-03 |
Decoding anemoside B4: Core mechanistic axes and an omics-to-atom paradigm
2026-May-29, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2026.108270
PMID:42217593
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研究论文 | 本文剖析了白头翁皂苷B4(AB4)的核心作用轴,并提出了一个从组学迈向原子的研究范式 | 识别出AB4多效性作用中的四个核心机制轴,并揭示其“情境依赖性矛盾”,提出整合单细胞/空间转录组学、细胞类型特异性化学蛋白质组学、冷冻电镜和CRISPR功能基因组学的“组学至原子”研究范式 | 传统基于整体组织分析存在“分辨率上限”,掩盖了细胞类型特异性相互作用组,AB4的精确分子机制仍不完整 | 揭示白头翁皂苷B4的分子机制并提出现代天然产物药理学研究新范式 | 白头翁皂苷B4(AB4)及其在炎症、肿瘤、病毒和代谢疾病中的作用机制 | 自然语言处理 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞转录组学、空间转录组学、化学蛋白质组学、冷冻电镜、CRISPR功能基因组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 904 | 2026-06-03 |
A temporal single-cell atlas of the retina uncovers the dynamic transcriptomic landscape of sodium iodate-induced retinopathy in mice
2026-May-29, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2026.111093
PMID:42217723
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研究论文 | 通过时间序列单细胞RNA测序绘制小鼠碘酸钠诱导视网膜病变的动态转录组图谱 | 首次构建碘酸钠诱导视网膜病变的时间单细胞图谱,揭示Müller胶质细胞炎症反应亚群和感光细胞亚型差异易感性,提出早期小胶质细胞炎症与胶质-感光细胞互作导致选择性视杆细胞退化的概念模型 | 未明确说明 | 解析视网膜变性过程中细胞类型特异性轨迹和阶段依赖性相互作用 | 碘酸钠诱导氧化损伤后不同时间点的小鼠视网膜细胞 | 单细胞转录组学 | 视网膜变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠视网膜样本(具体数量未在标题和摘要中提供) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 905 | 2026-06-03 |
Application of single-cell transcriptomic technology in cell fate determination of embryonic liver
2026-May-29, Histology and histopathology
IF:2.5Q2
DOI:10.14670/HH-25-100
PMID:42227418
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综述 | 综述单细胞转录组技术在胚胎肝脏细胞命运决定中的应用,整合单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学整合和类器官建模的最新进展 | 提出细胞图谱构建、细胞间通讯分析、空间验证和类器官功能建模形成迭代循环的新范式,推动从描述性编目向机制解析的转变 | 未明确说明本综述的局限 | 总结单细胞转录组学在解析胚胎肝脏发育中细胞命运决定机制的研究进展,为先天性肝病、肿瘤分层和再生医学提供概念和方法基础 | 人及小鼠胚胎肝脏中的肝母细胞、肝细胞、胆管细胞、肝胆双能祖细胞、内皮细胞和星状细胞等非实质细胞 | 机器学习和数字病理学 | 先天性肝病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学整合、类器官建模 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、多组学数据 | 人类和小鼠胚胎肝脏样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 906 | 2026-06-03 |
GDF15 Reprograms the Microenvironment to Drive Liver Metastasis of Uveal Melanoma
2026-May-28, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0536
PMID:42207865
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示GDF15在葡萄膜黑色素瘤肝转移中重编程微环境的作用机制 | 首次发现GDF15通过BAP1基因沉默上调,并利用H3K27ac修饰促进肝星状细胞重编程,驱动血管生成和肿瘤生长 | 未提供明确的定量限制信息;可能需进一步验证抗GDF15抗体的体内治疗效果 | 探索葡萄膜黑色素瘤细胞与肝星状细胞相互作用促进肝转移的机制 | 葡萄膜黑色素瘤细胞、肝星状细胞、内皮细胞 | 单细胞转录组学 | 葡萄膜黑色素瘤肝转移 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 907 | 2026-06-03 |
Preservation and clonal behavior of extrachromosomal DNA in patient-derived xenograft models of childhood cancers
2026-May-28, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-026-01676-0
PMID:42210429
|
研究论文 | 研究患者来源异种移植模型在儿童癌症中保留额外染色体DNA及其克隆行为 | 首次系统评估PDX模型在保留肿瘤ecDNA景观方面的保真度,揭示ecDNA在PDX发展中的动态变化和克隆选择 | 未明确说明,但可能包括PDX模型与原发性肿瘤间ecDNA序列断点一致性可变及样本量限制 | 评估患者来源异种移植模型在代表原发性肿瘤额外染色体DNA方面的保真度 | 儿童实体肿瘤中的额外染色体DNA及其在PDX模型中的行为 | 数字病理学 | 儿童癌症 | 全基因组测序,RNA和ATAC单细胞测序 | NA | 基因组序列,单细胞多组学数据 | 338个PDX模型和127个对应原发性肿瘤 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 908 | 2026-06-03 |
Molecular signatures and lineage diversification of neurogenic and gliogenic radial glia in the gyrencephalic ferret cortex
2026-May-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10366-x
PMID:42203905
|
研究论文 | 利用gyrencephalic雪貂模型系统表征皮层放射状胶质细胞的分子谱系和谱系动态,揭示保守的调控程序及其在神经发生和胶质发生中的作用 | 首次在雪貂模型中系统阐明神经源性及胶质源性放射状胶质细胞的分子特征和谱系分化机制,发现ERK、PKA、YAP/TAZ和SHH信号通路构成的整合调控网络协同控制皮层神经发生、胶质发生和进化扩张 | 未提供具体限制信息 | 阐明皮层放射状胶质细胞的分子特征和谱系动态,解析保守的神经发生和胶质发生调控程序 | 雪貂和人类皮层组织中的放射状胶质细胞,包括外放射状胶质细胞(oRG)和末端放射状胶质细胞(tRG) | 数字病理学 | NA | scRNA-Seq | NA | 基因表达数据 | 雪貂和人类皮层样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 909 | 2026-06-03 |
Single-cell transcriptomic analyses provide insights into TME related with tumor-promoting in AIDS-CNS-DLBCL
2026-May-27, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111263
PMID:42208778
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示与艾滋病相关中枢神经系统弥漫大B细胞淋巴瘤(AIDS-CNS-DLBCL)中与肿瘤促进相关的肿瘤微环境(TME) | 首次在AIDS-CNS-DLBCL中发现具有神经特征的肿瘤细胞亚群(神经特征细胞),并揭示其通过ERK通路激活、谷氨酸受体上调及模拟神经生态位驱动免疫功能障碍的机制 | 样本量有限(仅7例艾滋病患者和2例免疫功能正常患者),需要更多样本验证 | 探究AIDS-CNS-DLBCL的发病机制及肿瘤微环境特征 | 艾滋病相关中枢神经系统弥漫大B细胞淋巴瘤(AIDS-CNS-DLBCL) | 肿瘤免疫学 | 艾滋病相关淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 7例艾滋病患者和2例免疫功能正常患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 910 | 2026-06-03 |
Plasma-derived exosomes from Graves' orbitopathy: Pathogenic entities causing tissue lesions
2026-May-26, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2026.111088
PMID:42203012
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研究论文 | 揭示格雷夫斯眼病血浆来源外泌体作为致病实体导致组织病变的机制 | 首次证实循环外泌体作为格雷夫斯眼病的直接致病驱动因子,通过miR-221-5p/CACNG4/AMPK通路介导眼眶组织重塑,并在体内成功建立小鼠模型重现人类疾病特征 | 未明确说明局限性(基于摘要未提及) | 探究循环外泌体在格雷夫斯眼病发病机制中的直接作用及其驱动系统性向局部疾病进展的机制 | 格雷夫斯眼病患者和健康对照者的血浆来源外泌体,原代人眼眶成纤维细胞,BALB/c小鼠 | 数字病理学 | 格雷夫斯眼病 | 外泌体分离与表征,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据(单细胞RNA测序) | 未明确说明(摘要提及来自患者和对照的血浆外泌体,但无具体数量) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 911 | 2026-06-03 |
Multiplexed single-cell transcriptomics reveals diverse phenotypic outcomes for pathogenic SHP2 variants
2026-May-22, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aea9389
PMID:42172315
|
研究论文 | 结合单细胞转录组学与蛋白生化、结构分析和细胞生物学,揭示致病性SHP2变体导致的不同表型结果 | 首次通过单细胞转录组学系统解析临床不同SHP2突变对信号通路的差异性调控,发现催化活性丧失与基因敲除不配对、不同机制突变趋同表型以及相同热点残基突变产生不同细胞状态 | 未明确提及,可能受限于单细胞分析规模和特定细胞系模型 | 理解致病性SHP2突变如何异常调控信号通路及其与人类疾病的关系 | 表达临床不同SHP2变体的细胞 | 单细胞转录组学 | 努南综合征、癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒 |
| 912 | 2026-06-03 |
Spatial transcriptomics links hippocampal synaptic remodeling to microglial phagocytosis in synucleinopathy
2026-May-22, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.05.025
PMID:42173359
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学揭示了突触核蛋白病小鼠模型中海马区突触重塑与小胶质细胞吞噬作用的关系 | 首次通过空间转录组学在突触核蛋白病小鼠模型中定位海马区选择性易损性,并发现突触相关过程及MAPK信号通路的区域特异性变化 | 文章摘要未明确提及局限性 | 确定G2-3 α-突触核蛋白转基因小鼠模型是否重现人类突触核蛋白病的区域特异性易损性,并揭示其分子和细胞机制 | G2-3 α-突触核蛋白转基因小鼠及野生型同窝对照 | 空间转录组学 | 突触核蛋白病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 6月龄G2-3小鼠及野生型同窝对照 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 913 | 2026-06-03 |
Targeting PLD3 Reverses the Immunosuppressive Niche by Reprogramming Tumor-Associated Macrophages and Potentiates Antitumor Immunity
2026-May-21, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75730
PMID:42163781
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研究论文 | 靶向PLD3通过重编程肿瘤相关巨噬细胞逆转免疫抑制微环境并增强抗肿瘤免疫 | 首次揭示磷脂酶D3(PLD3)在调节巨噬细胞表型、结直肠癌进展及免疫治疗反应中的作用,并鉴定出靶向PLD3的潜在药物Abrine | 未提及 | 明确PLD3在调控巨噬细胞表型、结直肠癌进展和免疫治疗反应中的作用,并鉴定靶向PLD3的潜在药物 | PLD3阳性巨噬细胞,结直肠癌小鼠模型 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,RNA测序,质谱分析,分子对接 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞术数据,RNA-seq数据,质谱数据 | 髓系特异性Pld3敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 914 | 2026-06-03 |
Beyond sex determination: the Y chromosome in male cancers
2026-May-21, Nature reviews. Cancer
DOI:10.1038/s41568-026-00935-x
PMID:42168613
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综述 | 综述Y染色体缺失(LOY)在男性癌症中的作用机制、功能研究及生物标志物潜力 | 系统总结Y染色体在肿瘤免疫监视、DNA修复、代谢及肿瘤微环境重塑中的多效性功能,并提出LOY作为癌症风险与精准治疗生物标志物的新见解 | LOY是癌症因果事件、协同事件还是伴随事件仍不明确,且不同肿瘤类型中LOY的影响具有背景依赖性 | 阐明Y染色体缺失对男性癌症易感性、进展及预后的影响机制 | 男性癌症患者血液及肿瘤组织中的Y染色体缺失事件 | 机器学习 | 前列腺癌, 肺癌, 心血管疾病, 老年性疾病 | CRISPR, 单细胞测序, 批量测序, LOY评分算法 | NA | 基因测序数据 | NA | Illumina, 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Illumina NovaSeq, 10x Chromium | NA |
| 915 | 2026-06-03 |
Single-cell Sequencing and Machine Learning Identify Amino Acid Metabolism-related Biomarkers and Regulatory Mechanisms in Diabetic Foot Ulcers
2026-May-21, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
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研究论文 | 通过单细胞测序和机器学习识别糖尿病足溃疡中氨基酸代谢相关的生物标志物和调控机制 | 首次结合单细胞RNA测序和机器学习方法,系统鉴定出糖尿病足溃疡中角质形成细胞亚型Kera1驱动的钙黏蛋白信号通路以及五个氨基酸代谢相关诊断标志物 | 主要基于公开数据集进行分析,临床样本验证规模有限,且分子对接结果需进一步实验验证 | 识别糖尿病足溃疡中与氨基酸代谢相关的生物标志物和调控机制,为临床诊断和靶向治疗提供分子层面的框架 | 糖尿病足溃疡患者的角质形成细胞亚型及相关氨基酸代谢基因 | 机器学习 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序、大量RNA测序、qPCR、分子对接 | 机器学习模型(具体类型未明确) | 基因表达数据 | 两个公开数据集:GSE165816(单细胞)和GSE134431(大量RNA测序),另使用临床样本进行qPCR验证(样本量未具体说明) | NA | 单细胞RNA测序, 大量RNA测序 | NA | NA |
| 916 | 2026-06-03 |
Identification of Potential Biomarkers in Autism: PRELID2, MYO1B, LRCH2, LIFR, and RERG May Serve as Regulators in Synaptic Membrane-Integrating Interneurons
2026-May-19, Current gene therapy
IF:3.8Q2
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析自閉症谱系障碍患者前额叶皮层中间神经元亚型,并鉴定出五个潜在生物标志物 | 首次通过整合单细胞和批量转录组数据,鉴定出突触膜整合中间神经元(SMI-IN)为自闭症关键细胞亚型,并发现PRELID2、MYO1B、LRCH2、LIFR和RERG五个潜在生物标志物及候选治疗化合物 | 所有发现均基于计算分析,需进一步的细胞和临床实验验证 | 识别自闭症谱系障碍中中间神经元亚型的分子特征及潜在生物标志物 | 人类前额叶皮层的中间神经元及其亚型 | 机器学习 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 自闭症和对照组的前额叶皮层样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 917 | 2026-06-03 |
Lineage and organ signals sequentially build organ intrinsic nervous systems
2026-May-13, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-026-10490-y
PMID:42129551
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研究论文 | 本研究通过跨器官分析,揭示了器官内在神经系统从共同的神经嵴细胞起源发育的机制,并提出了双重逻辑模型 | 首次提出器官内在神经系统发育的双重逻辑模型:谱系程序预构空间框架,器官特异性信号指示最终分子身份和结构精度 | 未提及 | 探究器官内在神经系统从神经嵴细胞发育的机制 | 心脏、胰腺、肠道和肺的器官内在神经系统 | 机器学习 | NA | 谱系追踪、3D成像、单细胞转录组学、遗传扰动、体外共培养 | NA | 图像、转录组数据 | 涉及心脏、胰腺、肠道和肺的样本,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 918 | 2026-06-03 |
D-SPIN constructs regulatory network models from scRNA-seq that reveal organizing principles of perturbation response
2026-May-12, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2026.04.028
PMID:42127893
|
研究论文 | 提出D-SPIN计算框架,从scRNA-seq数据推断基因调控网络模型,揭示扰动响应的组织原理 | 开发了维度可扩展的单细胞扰动整合网络(D-SPIN),能从数千种扰动条件下推断机理可解释且生成式的基因调控网络模型 | NA | 从单细胞mRNA测序数据中重建基因调控网络,揭示细胞维持稳态和执行状态转换的控制原理 | 基因调控网络模型、Perturb-seq和药物响应数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | 生成模型 | 文本 | 数千种扰动条件下采集的单细胞mRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 919 | 2026-06-03 |
Hypoxia Impairs CD8+ T Cell Fitness and Is Associated with a Dysfunctional CD8+ T Cell State in Pancreatic Cancer
2026-May-08, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18101508
PMID:42192869
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研究论文 | 研究缺氧如何通过肿瘤微环境损害CD8+ T细胞功能,并在胰腺癌中导致T细胞功能障碍 | 揭示了缺氧与肿瘤细胞和癌症相关成纤维细胞因子的协同作用对CD8+ T细胞适应性损伤的机制,并结合单细胞RNA测序数据验证了缺氧特征与T细胞终末分化和功能障碍的关联 | 使用体外系统,可能无法完全模拟体内复杂微环境;未深入探讨缺氧信号的分子机制 | 探究缺氧在胰腺癌微环境中对CD8+ T细胞适应性和功能状态的影响 | CD8+ T细胞、胰腺癌细胞、癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类胰腺癌单细胞RNA测序数据(样本量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 920 | 2026-06-03 |
Genetic suppression of myeloid receptor Clec7a attenuates microglia neuroinflammation and promotes microglial phagocytosis to delay disease progression in ALS models
2026-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.04.722437
PMID:42146463
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研究论文 | 研究发现抑制髓系受体Clec7a可减轻小胶质细胞神经炎症,促进其吞噬功能,从而延缓ALS模型疾病进展 | 首次确定Clec7a(或Dectin-1)作为ALS中疾病相关小胶质细胞的核心标志基因,在调控小胶质细胞激活和ALS疾病进展中的关键作用,并通过双光子成像揭示了Clec7a缺乏促进小胶质细胞吞噬病理hTDP43的机制 | 研究主要在动物模型(SOD1G93A小鼠)中进行,人类ALS验证可能受样本量限制,且Clec7a在其他神经退行性疾病中的角色未探讨 | 探讨Clec7a在调控小胶质细胞激活和肌萎缩侧索硬化症(ALS)疾病进展中的作用 | SOD1G93A ALS小鼠模型及人源化TDP43(hTDP43) | 机器学习 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq), 双光子成像 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | SOD1G93A小鼠(具体数量未说明)及人类ALS样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 脊髓单细胞RNA测序 |