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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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9161 | 2025-10-07 |
Mouse Bladder Smooth Muscle Lack the Functional Active NMDAR
2025-Feb, Neurourology and urodynamics
IF:1.8Q3
DOI:10.1002/nau.25631
PMID:39552551
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研究论文 | 本研究通过多方法验证发现小鼠膀胱平滑肌缺乏功能性NMDAR | 首次通过单细胞RNA测序和功能实验证实膀胱平滑肌缺乏功能性N-甲基-D-天冬氨酸受体 | 研究主要基于小鼠模型,人类膀胱组织的验证相对有限 | 探究NMDAR在膀胱平滑肌功能中的作用及其作为膀胱过度活动症治疗靶点的潜力 | 小鼠和人类膀胱平滑肌组织 | 分子生物学 | 膀胱过度活动症 | 肌动描记术,钙成像,单细胞RNA测序,免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据,图像数据,生理测量数据 | 小鼠和人类膀胱组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9162 | 2025-10-07 |
PD-L1 promotes tumor metastasis by regulating the infiltration of FGFBP2(+)Tm cells in colorectal cancer
2025-Feb, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-03223-w
PMID:39558101
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研究论文 | 本研究揭示PD-L1通过调控FGFBP2(+)记忆T细胞浸润促进结直肠癌转移的机制 | 首次发现PD-L1通过抑制CXCL9/CXCL10分泌减少FGFBP2(+)记忆T细胞浸润,并证实该细胞亚群在转移灶中通过促血管生成促进肿瘤转移 | NA | 探究PD-L1表达与肿瘤转移的关系及其免疫调控机制 | 结直肠癌患者样本和小鼠转移模型 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 测序数据、病理样本 | 外周血、淋巴结、结肠息肉、原发肿瘤和肝转移样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9163 | 2025-10-07 |
E2F1 Promotes the Occurrence of Head and Neck Squamous Cell Carcinoma and Serves as a Prognostic Biomarker
2025-Feb, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-024-05097-w
PMID:39565537
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研究论文 | 本研究探讨E2F1在头颈部鳞状细胞癌中的生物学功能及预后价值 | 首次结合转录组和单细胞测序数据系统分析E2F1在HNSCC中的预后价值及免疫调控作用 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 探索E2F1在头颈部鳞状细胞癌中的生物学功能和预后价值 | 头颈部鳞状细胞癌患者样本 | 生物信息学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | Lasso-Cox回归模型,列线图模型 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | TCGA和GEO数据库中的HNSCC患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9164 | 2025-10-07 |
The critical role of endoplasmic reticulum stress and the stimulator of interferon genes (STING) pathway in kidney fibrosis
2025-Feb, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2024.10.021
PMID:39566842
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研究论文 | 本研究揭示了STING通路作为内质网应激上游激活因子在肾脏纤维化中的关键作用 | 首次发现STING与PERK之间存在物理相互作用,并证实STING是肾小管细胞内质网应激的重要上游调节因子 | 内质网应激在肾脏疾病中的精确激活机制仍不完全清楚 | 探究内质网应激和STING通路在肾脏纤维化中的作用机制 | 慢性肾病患者、小鼠肾脏损伤模型(顺铂和单侧输尿管梗阻)、肾小管细胞 | 病理生物学 | 肾脏疾病 | 转录组学分析、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、转录组数据 | 慢性肾病患者肾脏样本、多种小鼠肾脏损伤模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
9165 | 2025-10-07 |
Integrated analysis and systematic characterization of the regulatory network for human germline development
2025-Feb, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.11.005
PMID:39571792
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研究论文 | 通过整合多组学数据构建人类原始生殖细胞数据库并系统解析其调控网络 | 首次系统整合人类原始生殖细胞发育不同阶段的多组学数据,构建了hPGCdb数据库并识别了关键转录因子和调控网络 | 人类原始生殖细胞发育过程难以直接观察,主要依赖已有数据整合分析 | 解析人类原始生殖细胞发育的调控机制 | 人类原始生殖细胞(PGCs) | 生物信息学 | NA | RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq, 单细胞RNA-seq, CRISPRi | NA | 基因组学数据 | 581个RNA-seq样本, 54个ATAC-seq样本, 45个ChIP-seq样本, 69个单细胞RNA-seq样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq | NA | NA |
9166 | 2025-10-07 |
TRAIL induces podocyte PANoptosis via death receptor 5 in diabetic kidney disease
2025-Feb, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2024.10.026
PMID:39571905
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研究论文 | 本研究揭示TRAIL通过死亡受体5诱导足细胞发生PANoptosis在糖尿病肾病中的关键作用 | 首次发现TRAIL/DR5信号通路在糖尿病肾病足细胞PANoptosis中的核心作用机制 | 样本量较小(3例正常 vs 3例DKD),主要依赖小鼠模型验证 | 探究TRAIL/DR5信号通路在糖尿病肾病足细胞损伤中的作用机制 | 人类肾脏样本、培养的人足细胞、糖尿病小鼠模型 | 单细胞生物学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, siRNA沉默, 基因过表达 | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | 3例正常人肾脏样本, 3例糖尿病肾病患者肾脏样本, 多种糖尿病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9167 | 2025-10-07 |
A Study on the Inflammatory Response of the Brain in Neurosyphilis
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202406971
PMID:39574316
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研究论文 | 本研究通过整合蛋白质组学和单细胞转录组学分析,揭示了神经梅毒中炎症介导脑损伤的机制 | 首次通过整合蛋白质组学和单细胞转录组学方法鉴定出Toll样/NF-κB信号通路是神经梅毒中枢神经系统损伤的关键通路,并发现单核细胞来源的巨噬细胞是关键的炎症反应细胞 | 未明确说明样本数量和具体实验设计的局限性 | 探究神经梅毒中炎症介导脑损伤的分子机制 | 神经梅毒患者的中枢神经系统和外周血炎症细胞 | 神经科学 | 神经梅毒 | 蛋白质组学, 单细胞转录组学, 体外脑类器官模型 | 体外脑类器官模型 | 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
9168 | 2025-10-07 |
High CD44 expression and enhanced E-selectin binding identified as biomarkers of chemoresistant leukemic cells in human T-ALL
2025-Feb, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02473-7
PMID:39580584
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别了T细胞急性淋巴细胞白血病中化疗耐药细胞的特征标志物 | 首次在人类T-ALL中发现具有高CD44表达和增强E-选择素结合能力的化疗耐药白血病细胞群体 | 样本量相对有限(39例人类T-ALL样本),需要更大规模研究验证 | 探索T-ALL化疗耐药机制并识别相关生物标志物 | 人类T-ALL细胞和患者样本 | 单细胞组学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 39例人类T-ALL样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9169 | 2025-10-07 |
In silico integrative scRNA analysis of human colonic epithelium indicates four tuft cell subtypes
2025-Feb-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00182.2024
PMID:39589317
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研究论文 | 通过整合分析人类结肠单细胞RNA测序数据,揭示了四种不同的簇细胞亚型及其在健康与炎症性肠病中的差异 | 首次在人类结肠中鉴定出四种簇细胞亚型,并发现这些亚型在健康人群和炎症性肠病患者中存在显著差异 | 研究基于公开数据集进行计算机模拟分析,缺乏实验验证 | 探索人类结肠簇细胞的异质性及其在肠道健康与疾病中的作用 | 人类结肠上皮细胞,特别是簇细胞 | 单细胞转录组学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | 计算机模拟分析 | 单细胞RNA测序数据 | 四个公开数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9170 | 2025-10-07 |
Fibroblastic reticular cells generate protective intratumoral T cell environments in lung cancer
2025-Jan-23, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.10.042
PMID:39566495
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研究论文 | 本研究揭示了肺腺癌中表达CCL19的成纤维网状细胞通过形成相互连接的T细胞环境调控抗肿瘤免疫应答的机制 | 首次发现成纤维网状细胞在肿瘤微环境中形成专门的T细胞生态位,并阐明其起源于壁层和外膜祖细胞 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仍需进一步扩展 | 探究肿瘤微环境中成纤维网状细胞对T细胞免疫应答的调控机制 | 非小细胞肺癌患者样本和小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞转录组测序,细胞命运图谱分析 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 人类非小细胞肺癌样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9171 | 2025-10-07 |
A deconvolution framework that uses single-cell sequencing plus a small benchmark data set for accurate analysis of cell type ratios in complex tissue samples
2025-Jan-22, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278822.123
PMID:39586714
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研究论文 | 开发了一种使用单细胞测序和小型基准数据集的解卷积框架DeMixSC,用于准确分析复杂组织样本中的细胞类型比例 | 提出基于加权非负最小二乘的新型解卷积框架,能够识别和调整高技术差异基因,并将基准数据与大型患者队列对齐 | 需要依赖良好匹配的基准数据集才能实现准确解卷积 | 解决跨测序平台技术差异对细胞类型比例分析准确性的限制 | 健康视网膜组织、卵巢癌组织、年龄相关性黄斑变性患者队列、卵巢癌患者队列 | 生物信息学 | 年龄相关性黄斑变性,卵巢癌 | 单细胞RNA测序,单细胞核RNA测序 | 加权非负最小二乘框架 | 单细胞测序数据,批量测序数据 | 两个基准数据集+453名年龄相关性黄斑变性患者+30名卵巢癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞核RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
9172 | 2025-10-07 |
Application of computational algorithms for single-cell RNA-seq and ATAC-seq in neurodegenerative diseases
2025-Jan-15, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elae044
PMID:39500613
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综述 | 本文综述了整合单细胞RNA测序和ATAC测序数据的计算工具及其在神经退行性疾病研究中的应用 | 整合scRNA-seq和scATAC-seq数据的计算方法,实现转录组数据与染色质可及性谱的联合分析 | 面临数据稀疏性和计算需求高的挑战 | 促进对神经退行性疾病致病机制的理解和潜在治疗靶点的识别 | 阿尔茨海默病和帕金森病等神经退行性疾病 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 计算算法 | 基因表达数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
9173 | 2025-10-07 |
Spatial and Single-Cell Analyses Reveal Heterogeneity of DNAM-1 Receptor-Ligand Interactions That Instructs Intratumoral γδT-cell Activity
2025-Jan-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-1509
PMID:39514370
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研究论文 | 本研究通过空间和单细胞分析揭示DNAM-1受体-配体相互作用的异质性如何指导肿瘤内γδT细胞活性 | 首次系统揭示CD112/CD155表达比例通过调控DNAM-1受体表达影响γδT细胞功能分化的机制 | 研究主要聚焦神经母细胞瘤,在其他肿瘤类型中的普适性需要进一步验证 | 探究肿瘤细胞配体CD112和CD155如何通过DNAM-1受体调控γδT细胞活化 | 神经母细胞瘤肿瘤微环境中的γδT细胞和肿瘤细胞 | 单细胞生物学 | 神经母细胞瘤 | 空间转录组测序, 单细胞RNA测序, 空间代谢组学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 代谢组数据 | 神经母细胞瘤患者样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
9174 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals common interactions between follicle immune cells and granulosa cells in premature ovarian insufficiency patients†
2025-Jan-14, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioae157
PMID:39513542
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示早发性卵巢功能不全患者卵泡免疫细胞与颗粒细胞之间的相互作用 | 首次在POI患者中揭示单核细胞与颗粒细胞间VEGFA-FLT1相互作用的缺失及其与内质网和核糖体通路富集的关联 | 样本量较小(仅9名参与者),且仅分析不含卵丘细胞的首次穿刺卵泡 | 研究POI、正常卵巢储备和高龄产妇卵泡微环境特征,寻找潜在治疗靶点 | 接受体外受精或卵胞浆内单精子注射的POI、正常卵巢储备和高龄产妇患者的卵泡细胞 | 单细胞测序分析 | 早发性卵巢功能不全 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 9名女性(3名POI、3名正常、3名AMA),共87,323个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9175 | 2025-10-07 |
MobiChIP: a compatible library construction method of single-cell ChIP-seq based droplets
2025-Jan-13, Molecular omics
IF:3.0Q3
DOI:10.1039/d4mo00111g
PMID:39513632
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研究论文 | 开发了一种基于液滴的单细胞ChIP-seq文库构建方法MobiChIP | 开发了兼容现有测序平台的单细胞ChIP-seq文库构建方法,无需定制引物即可实现稳健的核小体扩增和灵活测序 | NA | 开发单细胞表观遗传分析工具以阐明表观遗传异质性 | 外周血单个核细胞(PBMCs)和不同组织或物种的样本 | 表观遗传学 | NA | 单细胞ChIP-seq, 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | 表观基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞ChIP-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | 基于液滴的单细胞ChIP-seq文库构建方法 |
9176 | 2025-10-07 |
Efficient Predictor for Immunotherapy Efficacy: Detecting Pan-Clones Effector Tumor Antigen-Specific T Cells in Blood by Nanoparticles Loading Whole Tumor Antigens
2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202409913
PMID:39498880
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研究论文 | 开发了一种通过纳米颗粒负载全肿瘤抗原检测血液中泛克隆效应肿瘤抗原特异性T细胞的方法,用于预测免疫治疗效果 | 首次使用纳米颗粒负载全细胞肿瘤抗原来激活和检测血液中的泛克隆ETASTs,将ETASTs与其他T细胞的差异转化为激活状态差异 | NA | 开发预测免疫治疗疗效的高精度生物标志物 | 肺癌患者、健康个体和良性肺结节患者的血液样本 | 生物医学工程 | 肺癌 | 纳米颗粒技术、单细胞测序 | NA | 血液样本、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
9177 | 2025-10-07 |
Enhanced BMP Signaling Alters Human β-Cell Identity and Function
2025-Jan, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400470
PMID:39499224
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研究论文 | 本研究探讨增强的BMP信号通路在炎症诱导的人类β细胞功能衰竭和身份丧失中的作用 | 首次发现炎症因子通过激活BMP信号通路损害β细胞功能,并提出BMP信号可作为糖尿病治疗新靶点 | 研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证 | 探索炎症环境下β细胞功能衰竭的分子机制 | 人类胰岛β细胞 | 细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞转录组测序, qPCR | NA | 基因表达数据 | 原代人类胰岛样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9178 | 2025-10-07 |
Deep learning-based models for preimplantation mouse and human embryos based on single-cell RNA sequencing
2025-Jan, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02511-3
PMID:39543284
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研究论文 | 开发基于单细胞RNA测序的深度学习模型,用于识别小鼠和人类胚胎发育过程中的细胞类型、谱系和状态 | 利用深度学习工具整合和分类多个单细胞转录组数据集,建立能够无偏倚识别细胞类型并同时确定模型所用基因集的分类模型 | 研究材料难以获取和处理,主要依赖公开可用数据 | 定义小鼠和人类胚胎细胞类型、谱系和状态,为早期胚胎发生提供动态参考 | 小鼠和人类早期胚胎发育及多能干细胞模型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 单细胞转录组数据 | 公开可用的小鼠和人类胚胎发育阶段数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9179 | 2025-10-07 |
Integrated proteomics and scRNA-seq analyses of ovarian cancer reveal molecular subtype-associated cell landscapes and immunotherapy targets
2025-Jan, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02894-2
PMID:39548315
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研究论文 | 通过整合蛋白质组学和单细胞RNA测序分析,揭示了卵巢癌分子亚型相关的细胞景观和免疫治疗靶点 | 首次结合蛋白质组学和单细胞RNA测序对卵巢癌进行综合分析,识别了四种具有临床意义的蛋白质组亚型,并发现CD40作为C2亚型的特异性预后因子 | 样本量相对有限,特别是单细胞RNA测序仅包含8个肿瘤样本 | 探索卵巢癌分子亚型与治疗意义之间的联系 | 154例上皮性卵巢癌肿瘤样本、29例正常输卵管样本和8例额外卵巢癌肿瘤 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 质谱蛋白质组学分析, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | 154个肿瘤样本 + 29个正常样本 + 8个肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
9180 | 2025-10-07 |
The role of FOXK2-FBXO32 in breast cancer tumorigenesis: Insights into ribosome-associated pathways
2025-Jan, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.15482
PMID:39552461
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研究论文 | 本研究探讨FOXK2-FBXO32轴在乳腺癌肿瘤发生中的作用及其在核糖体相关通路中的机制 | 首次通过单细胞测序分析FOXK2基因在泛癌中的表达模式,并发现其下游基因FBXO32与癌症免疫应答的关联 | 需要进一步研究FOXK2和FBXO32在癌症中的具体作用机制,以及靶向FOXK2治疗癌症的潜在益处 | 寻找能够预测肿瘤免疫治疗效果和预后的新生物标志物 | 多种癌症类型(前列腺癌、子宫内膜癌、膀胱癌、结直肠癌、胰腺癌、胃癌、肺癌、甲状腺癌)的肿瘤和癌旁组织 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞测序, bulk RNA-seq, ChIP-seq, 免疫浸润分析算法 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | TCGA数据库中的泛癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |