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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 9141 - 9160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9141 | 2025-10-07 |
Optimizing Xenium In Situ data utility by quality assessment and best-practice analysis workflows
2025-Apr, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02617-2
PMID:40082609
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研究论文 | 本文对10x Genomics的Xenium In Situ空间转录组平台进行独立性能评估，并提供最佳实践分析流程 | 首次系统评估25个不同组织和物种的Xenium数据集，并与8种其他空间转录组技术进行综合比较 | 研究仅针对Xenium平台，未涵盖所有空间转录组技术 | 评估Xenium平台性能并建立空间转录组数据分析的最佳实践指南 | 25个Xenium数据集，涵盖多种组织和物种 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 25个数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium In Situ | Xenium In Situ平台，具备亚细胞分辨率，可原位检测数百个基因 |
| 9142 | 2025-10-07 |
Feature selection methods affect the performance of scRNA-seq data integration and querying
2025-Apr, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02624-3
PMID:40082610
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研究论文 | 评估单细胞RNA测序数据整合中不同特征选择方法对性能的影响 | 首次系统评估特征选择方法对单细胞RNA测序数据整合和查询映射性能的影响，超越了传统的批次校正指标 | 未具体说明使用的数据集规模和实验设置细节 | 评估特征选择方法对单细胞RNA测序数据整合性能的影响 | 单细胞RNA测序数据整合和查询映射 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9143 | 2025-10-07 |
A computational pipeline for spatial mechano-transcriptomics
2025-Apr, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02618-1
PMID:40097810
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研究论文 | 开发了一个用于空间转录组学和机械信号联合统计分析的计算框架 | 首次实现了转录信号与机械信号在空间转录组学背景下的联合统计分析 | NA | 探索生物分子和机械信号在组织中的相互作用 | 小鼠胚胎发育过程中的空间转录组数据 | 计算生物学 | NA | 空间转录组学 | 地理加性结构方程模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9144 | 2025-10-07 |
scNET: learning context-specific gene and cell embeddings by integrating single-cell gene expression data with protein-protein interactions
2025-Apr, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02627-0
PMID:40097811
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研究论文 | 提出一种整合单细胞RNA测序数据与蛋白质-蛋白质相互作用网络的双视图图神经网络方法 | 采用独特的双视图架构整合基因表达和蛋白质相互作用数据，通过注意力机制优化细胞间关系建模 | 未明确说明方法对特定噪声类型或数据稀疏性的处理能力 | 改进单细胞RNA测序数据分析，更好地捕捉细胞通路和复合物的变化 | 单细胞基因表达数据和蛋白质-蛋白质相互作用网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络(GNN), 注意力机制 | 基因表达数据, 蛋白质相互作用网络 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9145 | 2025-10-07 |
Expression Distribution of Keratins in Normal and Pathological Corneas and the Regulatory Role of Krt17 on Limbal Stem Cells
2025-Apr-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.4.55
PMID:40257786
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研究论文 | 本研究比较了正常与病理条件下角膜中角蛋白的表达差异，重点探究了KRT17对角膜缘干细胞功能的调控作用 | 首次系统揭示应激性角蛋白Krt17在角膜缘干细胞中的多重调控功能，包括干细胞特性维持、增殖分化调控以及免疫防御反应 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，在人体组织中的验证仍需进一步深入 | 探究角蛋白在角膜稳态维持和病理调控中的作用机制 | 正常与病理角膜组织、小鼠角膜、人角膜缘上皮细胞 | 细胞生物学 | 角膜疾病 | mRNA测序, 蛋白质组测序, 单细胞测序, qPCR, 免疫荧光染色, 中性粒细胞趋化实验, 疱疹病毒感染实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 单细胞数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 蛋白质组测序 | NA | NA |
| 9146 | 2025-10-07 |
Angiogenesis and targeted therapy in the tumour microenvironment: From basic to clinical practice
2025-Apr, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70313
PMID:40268524
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综述 | 系统回顾肿瘤微环境中血管生成的基础研究进展及靶向治疗的临床应用 | 从单细胞视角阐释内皮细胞异质性，整合抗血管生成免疫疗法和纳米技术的最新策略 | NA | 探讨肿瘤血管生成的分子机制及靶向治疗策略 | 肿瘤微环境中的内皮细胞、基质细胞和免疫细胞 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9147 | 2025-10-07 |
Stromal Stiffness-Regulated IGF2BP2 in Pancreatic Cancer Drives Immune Evasion via Sphingomyelin Metabolism
2025-Mar-28, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.03.019
PMID:40158738
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研究论文 | 本研究揭示了胰腺癌中基质硬度通过稳定IGF2BP2调控鞘磷脂代谢促进免疫逃逸的机制 | 首次发现基质硬度通过稳定m6A阅读蛋白IGF2BP2调控鞘磷脂代谢，促进PD-L1在膜脂筏定位的免疫逃逸新机制 | 研究主要基于胰腺导管腺癌模型，在其他癌症类型中的普适性需要进一步验证 | 阐明m6A修饰与胰腺癌免疫逃逸的关联机制并探索临床干预策略 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者样本、PDAC类器官、患者来源组织片段和人源化小鼠模型 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 转录组分析、成像质谱流式、m6A定量、MeRIP、RIP、RNA pull-down、scRNA-seq、流式细胞术、多重免疫组化 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、影像数据、单细胞测序数据 | 122例多模态PDAC队列患者，并在6个独立PDAC队列中验证 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 成像质谱流式 | NA | NA |
| 9148 | 2025-10-07 |
New insights on extramedullary granulopoiesis and neutrophil heterogeneity in the spleen and its importance in disease
2025-Mar-14, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae220
PMID:39514106
|
综述 | 本文综述了脾脏髓外粒细胞生成和中性粒细胞异质性的新见解及其在疾病中的重要性 | 揭示了脾脏作为粒细胞生成器官的功能，发现脾脏中性粒细胞具有与血液中性粒细胞不同的异质性特征 | NA | 探讨脾脏微环境如何调节粒细胞生成及其在感染、炎症和肿瘤中的作用 | 脾脏中性粒细胞及其在脾脏微环境中的发育和功能 | NA | 感染、炎症、肿瘤 | 单细胞RNA测序、现代转录组学、新型成像技术 | NA | 转录组数据、成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9149 | 2025-10-07 |
Phylogenomic workflow for uncultivable microbial eukaryotes using single-cell RNA sequencing - A case study with planktonic ciliates (Ciliophora, Oligotrichea)
2025-Mar, Molecular phylogenetics and evolution
IF:3.6Q2
DOI:10.1016/j.ympev.2024.108239
PMID:39551225
|
研究论文 | 开发了一种基于单细胞RNA测序的系统发育基因组学工作流程，用于研究不可培养的微生物真核生物 | 针对不可培养微生物真核生物开发了从细胞分离到物种树推断的完整系统发育基因组学工作流程 | 需要生物信息学专业知识和计算能力，且存在非目标序列干扰的挑战 | 建立适用于不可培养微生物真核生物的系统发育基因组学分析方法 | 海洋浮游纤毛虫（寡毛纲） | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，系统发育基因组学分析 | Asteroid（基于溯祖理论的物种树推断方法） | 转录组数据 | 39个转录组（11个公开数据，28个新生成） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9150 | 2025-10-07 |
All the single cells: Single-cell transcriptomics/epigenomics experimental design and analysis considerations for glial biologists
2025-Mar, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24633
PMID:39558887
|
综述 | 为胶质细胞生物学家提供单细胞转录组学实验设计与分析的入门指南 | 专门针对胶质细胞研究领域系统梳理单细胞组学实验设计与分析的关键决策点 | 主要关注单细胞RNA-seq分析，未深入探讨其他单细胞组学技术的具体应用 | 提升胶质细胞生物学家对单细胞组学数据的分析与解读能力 | 胶质细胞及其在神经疾病中的亚型与功能 | 生物信息学 | 神经疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9151 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing to Guide Autologous Preterm Cord Mesenchymal Stromal Cell Therapy
2025-Mar, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202403-0569OC
PMID:39586004
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序评估早产脐带间充质基质细胞在实验性支气管肺发育不良中的治疗潜力 | 首次使用单细胞RNA测序比较不同妊娠并发症来源的UC-MSCs转录组特征及其治疗潜力 | 样本量有限（5例足月供体+16例早产供体），未探索其他妊娠并发症的影响 | 评估妊娠并发症是否改变UC-MSCs在支气管肺发育不良中的治疗潜力 | 人脐带来源间充质基质细胞和新生儿真皮成纤维细胞 | 单细胞组学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序，单核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5例足月供体+16例早产供体+人新生儿真皮成纤维细胞对照 | NA | 单细胞RNA测序，单核RNA测序 | NA | NA |
| 9152 | 2025-10-07 |
Analysis of human neutrophils from nasal polyps by single-cell RNA sequencing reveals roles of neutrophils in chronic rhinosinusitis
2025-Mar, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.10.032
PMID:39522652
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析鼻息肉中的人类中性粒细胞，揭示其在慢性鼻窦炎中的作用 | 开发了新型微孔板单细胞RNA测序方法，首次系统揭示鼻息肉组织中中性粒细胞的异质性和功能状态 | 样本量较小（5例对照组织，5例鼻息肉组织），仅分析了粒细胞富集样本 | 揭示中性粒细胞在鼻息肉组织中的作用和异质性 | 人类鼻息肉组织、对照鼻窦组织和患者匹配的外周血样本中的中性粒细胞 | 单细胞组学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序 | Benjamini-Hochberg算法，通路富集分析，Gene Ontology富集分析 | 单细胞转录组数据 | 5例对照鼻窦组织，5例鼻息肉组织，患者匹配外周血样本，共分析17,878个细胞（1,151个NP中性粒细胞，13,591个PB中性粒细胞，3,136个对照组织中性粒细胞） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 微孔板单细胞RNA测序方法 |
| 9153 | 2025-10-07 |
Melatonin treatment increases skin microbiota-derived propionic acid to alleviate atopic dermatitis
2025-Mar, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.11.019
PMID:39579877
|
研究论文 | 本研究揭示了褪黑素通过调节皮肤微生物群产生丙酸来缓解特应性皮炎的新机制 | 首次发现褪黑素通过皮肤微生物群/丙酸/GPR43/FABP5轴缓解特应性皮炎 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验，尚未在人体临床试验中验证 | 探究褪黑素通过调节皮肤微生物群缓解特应性皮炎的机制 | 特应性皮炎小鼠模型和HaCaT细胞 | 微生物组学 | 特应性皮炎 | 16S rRNA测序,单细胞测序,转录组分析,定量RT-PCR,Western blotting | 动物模型,细胞模型 | 基因组数据,转录组数据,蛋白质数据 | AD小鼠模型和HaCaT细胞系 | NA | 16S rRNA测序,单细胞测序,转录组测序 | NA | NA |
| 9154 | 2025-10-07 |
Aged hippocampal single-cell atlas screening unveils disrupted neuroglial system in postoperative cognitive impairment
2025-Mar, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14406
PMID:39540334
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了老年小鼠海马神经胶质系统在术后认知障碍中的分子机制及右美托咪定的治疗潜力 | 首次构建老年海马单细胞图谱，发现术后神经胶质系统代谢紊乱和细胞间通讯异常的新机制 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究术后认知障碍中神经胶质相互作用的分子机制和治疗靶点 | 老年小鼠海马组织中的神经元和胶质细胞（小胶质细胞、星形胶质细胞、少突胶质细胞） | 神经科学 | 术后认知障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 老年小鼠海马组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9155 | 2025-10-07 |
Investigating biological nitrogen fixation via single-cell transcriptomics
2025-Feb-25, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erae454
PMID:39563004
|
综述 | 本文总结了单细胞转录组学在解析豆科植物根瘤共生分子机制方面的关键发现 | 首次系统整合多个豆科植物的单细胞转录组数据，揭示根瘤共生的保守转录程序和细胞谱系动态 | 仅涵盖三种模式豆科植物的研究，未涉及非豆科作物的工程化应用 | 探索通过单细胞转录组学解析生物固氮机制，为工程化根瘤共生提供理论基础 | 蒺藜苜蓿、百脉根和大豆的根瘤共生系统 | 植物生物学 | NA | 单细胞转录组学 | 轨迹推断，RNA速率分析 | 单细胞RNA测序数据 | 三种豆科植物的根瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9156 | 2025-10-07 |
Mapping of the T-cell Landscape of Biliary Tract Cancer Unravels Anatomic Subtype-Specific Heterogeneity
2025-Feb-17, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-1173
PMID:39570809
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间分析揭示胆道癌不同解剖亚型中T细胞景观的特异性异质性 | 首次在单细胞和空间水平系统描绘胆道癌各亚型的T细胞多样性，发现肝外胆管癌特有的T细胞耗竭特征和肝内胆管癌的免疫抑制特征 | 样本量相对有限（16例患者），需要更大规模研究验证发现 | 阐明胆道癌不同解剖亚型的T细胞免疫特征差异 | 胆道癌患者（包括肝内胆管癌、肝外胆管癌和胆囊癌）的CD3+ T细胞 | 单细胞生物学 | 胆道癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序, 空间分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间分布数据, 病理切片图像 | 16例患者的36个样本，分析355张病理切片 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9157 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing applications in acute myeloid leukemia
2025-Feb, Leukemia & lymphoma
IF:2.2Q3
DOI:10.1080/10428194.2024.2422833
PMID:39496597
|
综述 | 本文综述单细胞测序技术在急性髓系白血病研究中的应用进展 | 系统总结单细胞测序从细胞处理到生物信息分析的技术进展及其在AML研究中的创新应用 | 未涉及具体实验数据验证，主要为文献综述性质 | 探讨单细胞测序技术如何推动急性髓系白血病研究并改善临床实践 | 急性髓系白血病的遗传和表型异质性 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9158 | 2025-10-07 |
CD137 Protein Expression Pattern Determines the Functional Role of Galectin-9 in Colorectal Cancer
2025-Feb, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.23838
PMID:39503215
|
研究论文 | 本研究通过分析结直肠癌单细胞测序数据开发预后评分系统，并探讨LGALS9基因作为治疗靶点的潜力 | 发现LGALS9在结直肠癌中的作用取决于CD137蛋白表达模式，提出CD137水平可作为LGALS9靶向治疗疗效预测指标 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步临床验证 | 开发结直肠癌预后工具并探索LGALS9基因的治疗潜力 | 结直肠癌患者数据和小鼠结直肠癌模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | Scissor算法 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9159 | 2025-10-07 |
COMPREHENSIVE CHARACTERIZATION OF CYTOKINES IN PATIENTS UNDER EXTRACORPOREAL MEMBRANE OXYGENATION: EVIDENCE FROM INTEGRATED BULK AND SINGLE-CELL RNA SEQUENCING DATA USING MULTIPLE MACHINE LEARNING APPROACHES
2025-Feb-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002425
PMID:39503329
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研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据，利用多种机器学习方法构建了细胞因子相关基因分类器，用于预测ECMO患者的预后 | 首次整合bulk和单细胞RNA测序数据，应用多种机器学习算法识别关键细胞因子相关基因，并构建ECMO预后预测模型 | 研究样本量有限，仅基于三个ECMO支持数据集和医院队列 | 全面表征ECMO患者细胞因子表达特征，构建预后预测模型 | 接受体外膜肺氧合(ECMO)治疗的患者 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | SVM, RF, Lasso, XGBoost, ANN | 基因表达数据 | 三个ECMO支持数据集（两个bulk RNA-seq和一个单细胞RNA-seq）及医院队列 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9160 | 2025-10-07 |
Inorganic pyrophosphatase 1: a key player in immune and metabolic reprogramming in ankylosing spondylitis
2025-Feb, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-024-00308-0
PMID:39511317
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和单细胞测序分析无机焦磷酸酶1在强直性脊柱炎免疫代谢重编程中的关键作用 | 首次结合孟德尔随机化和单细胞测序技术揭示PPA1基因通过调控阿魏酸硫酸盐表达影响CD8+记忆T细胞代谢的机制 | 样本量较小（仅3例患者），需要更大规模研究验证 | 阐明强直性脊柱炎中免疫细胞与代谢物的相互作用机制 | 强直性脊柱炎患者椎体骨髓血样本 | 单细胞组学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 表达数量性状位点分析 | NA | 单细胞基因表达数据, 基因型数据 | 3例患者（包含AS患者和对照） | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x单细胞测序平台 |