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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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9141 | 2024-08-07 |
Advancing sequencing-based spatial transcriptomics with a comprehensive benchmarking study
2024-Sep, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02326-2
PMID:38977827
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
9142 | 2024-09-15 |
Regulator of G-protein signaling expression in human intestinal enteroendocrine cells and potential role in satiety hormone secretion in health and obesity
2024-Sep, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105283
PMID:39142076
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研究论文 | 研究了人类肠道肠内分泌细胞中G蛋白信号调节因子(RGS)的表达及其在肥胖和健康状态下对饱腹激素分泌的潜在作用 | 首次揭示了RGS在人类肠内分泌细胞中的表达谱及其在肥胖状态下的变化,并提出了RGS蛋白作为肠道肠内分泌细胞分泌GLP-1和PYY的调节因子的可能性 | 研究样本量有限,且主要集中在肠道组织,未来需要更大规模的研究来验证这些发现 | 探讨RGS在人类肠内分泌细胞中的表达及其在肥胖和健康状态下对饱腹激素分泌的影响 | 人类肠道肠内分泌细胞中的RGS表达及其在肥胖和健康状态下的变化 | NA | 肥胖 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | RNA | 61名患者(其中42名肥胖,19名健康)的肠道组织和部分患者的餐后血浆 |
9143 | 2024-09-15 |
Lymphotoxin-β promotes breast cancer bone metastasis colonization and osteolytic outgrowth
2024-Sep, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-024-01478-9
PMID:39147874
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研究论文 | 研究探讨了淋巴毒素-β在乳腺癌骨转移中的作用及其分子机制 | 首次揭示了淋巴毒素-β在乳腺癌骨转移中的关键作用,并提出了其作为治疗靶点的潜力 | NA | 研究淋巴毒素-β在乳腺癌骨转移中的分子机制及其治疗潜力 | 乳腺癌骨转移中的肿瘤细胞和骨微环境 | NA | 乳腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个乳腺癌模型中的肿瘤细胞和骨微环境样本 |
9144 | 2024-09-15 |
Loss-of-function variants in RNA binding motif protein X-linked induce neuronal defects contributing to amyotrophic lateral sclerosis pathogenesis
2024-Sep, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.712
PMID:39263607
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研究论文 | 研究探讨了m6A相关基因的遗传缺陷在肌萎缩侧索硬化症(ALS)发病机制中的作用 | 揭示了RNA结合基序蛋白X-linked(RBMX)变异在ALS患者中的显著富集,并发现这些变异与不良临床结果显著相关 | 研究样本仅包括508名ALS患者和1660名匹配的对照组,样本量有限 | 探索m6A相关基因的遗传缺陷在ALS发病机制中的作用 | m6A相关基因的突变情况及其在ALS中的作用 | 数字病理学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 全外显子测序 | NA | 基因数据 | 508名ALS患者和1660名匹配的对照组 |
9145 | 2024-09-15 |
Adenoid cystic carcinoma: insights from molecular characterization and therapeutic advances
2024-Sep, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.734
PMID:39263605
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综述 | 本文综述了腺样囊性癌(ACC)的病理和分子特征,并探讨了基于单细胞RNA测序(scRNA-seq)的最新治疗进展 | 利用单细胞RNA测序揭示了ACC的异质性和亚群多样性,为个性化治疗提供了新视角 | NA | 探讨腺样囊性癌的分子特征和治疗进展 | 腺样囊性癌 | NA | 唾液腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA |
9146 | 2024-09-15 |
Identifying epithelial-mesenchymal transition-related genes as prognostic biomarkers and therapeutic targets of hepatocellular carcinoma by integrated analysis of single-cell and bulk-RNA sequencing data
2024-Aug-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-24-521
PMID:39262476
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据,开发了一种用于肝细胞癌(HCC)预后预测的新型模型 | 本研究的创新点在于结合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序(bulk RNA-seq)数据,开发了一种新的肝细胞癌预后预测模型,并揭示了与上皮-间质转化(EMT)相关的基因在HCC进展中的临床意义 | 本研究的局限性在于仅基于特定的基因表达数据构建模型,未考虑其他可能影响预后的因素 | 本研究旨在通过整合单细胞和批量RNA测序数据,发现新的肝细胞癌预后生物标志物,并提高预后预测的准确性 | 本研究的研究对象是肝细胞癌(HCC)患者及其预后相关的基因和临床特征 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序(bulk RNA-seq) | Cox比例风险模型 | 基因表达数据 | NA |
9147 | 2024-09-15 |
Upregulation of CKS2 in immunosuppressive cells is associated with metastasis and poor prognosis in prostate cancer: a single-cell RNA-sequencing analysis
2024-Aug-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-23-2100
PMID:39262475
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研究论文 | 研究探讨了免疫抑制细胞中CKS2的上调与前列腺癌转移和预后不良的关系 | 首次通过单细胞RNA测序分析揭示了CKS2在免疫抑制细胞中的上调与前列腺癌转移和预后不良的关联 | 研究主要基于GEO数据库的数据,可能存在数据偏差 | 探究免疫抑制环境如何促进前列腺癌转移并恶化患者预后 | 前列腺癌患者的免疫抑制细胞和CKS2基因 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
9148 | 2024-09-15 |
Identifying novel risk genes in intracranial aneurysm by integrating human proteomes and genetics
2024-Aug-01, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awae111
PMID:39084678
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研究论文 | 本研究通过整合人类蛋白质组和遗传数据,识别颅内动脉瘤的新风险基因 | 采用多维高通量数据整合蛋白质组关联研究、转录组关联研究、孟德尔随机化分析和贝叶斯共定位分析,优先筛选出可能增加颅内动脉瘤风险的基因 | 未发现具有顺式调控血浆蛋白水平的显著基因与颅内动脉瘤相关 | 识别颅内动脉瘤的新风险基因 | 颅内动脉瘤的风险基因 | 生物信息学 | 脑血管疾病 | 全基因组关联研究 (GWAS), 蛋白质组关联研究 (PWAS), 转录组关联研究 (TWAS), 孟德尔随机化 (MR), 贝叶斯共定位分析, 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 基因集富集分析 (GSEA) | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据, 基因组数据 | NA |
9149 | 2024-09-15 |
Dissection of triple-negative breast cancer microenvironment and identification of potential therapeutic drugs using single-cell RNA sequencing analysis
2024-Aug, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2024.100975
PMID:39263352
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了三阴性乳腺癌的微环境特征,并识别出潜在的治疗药物 | 首次在单细胞分辨率下解析了三阴性乳腺癌的微环境,并发现了与肿瘤细胞增殖相关的关键细胞亚群和潜在治疗靶点 | 研究结果主要基于体外实验和动物模型,需要在临床试验中进一步验证 | 揭示三阴性乳腺癌的微环境特征,并寻找潜在的治疗药物 | 三阴性乳腺癌的肿瘤微环境和潜在治疗靶点 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括肿瘤和健康乳腺组织样本 |
9150 | 2024-09-15 |
Validation of an organ mapping antibody panel for cyclical immunofluorescence microscopy on normal human kidneys
2024-Jul-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00426.2023
PMID:38721662
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研究论文 | 本文验证了一种用于正常人肾脏循环免疫荧光显微镜的器官映射抗体面板 | 本文采用标准化方法验证了一组抗体,用于通过免疫荧光显微镜识别18种主要细胞类型和5种细胞外基质,并开发了二维和三维循环免疫荧光(CyCIF)技术,提供了一种更详细的组织分割和体积评估方法 | NA | 解决抗体验证缺乏标准化导致的人类研究不可重复性问题 | 正常人肾脏中的18种主要细胞类型和5种细胞外基质 | 数字病理学 | NA | 免疫荧光显微镜 | NA | 图像 | NA |
9151 | 2024-09-15 |
Single-cell sequencing revealed metabolic reprogramming and its transcription factor regulatory network in prostate cancer
2024-Jun, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.101925
PMID:38447277
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研究论文 | 研究利用单细胞测序技术揭示了前列腺癌中的代谢重编程及其转录因子调控网络 | 首次通过单细胞测序技术全面分析了前列腺癌中代谢变化及其转录因子调控网络,并发现了抑制剂Betulin在抑制前列腺癌生长中的潜在治疗作用 | NA | 研究前列腺癌中的代谢重编程变化并识别潜在的治疗靶点 | 前列腺癌及其良性前列腺组织 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 多种前列腺癌亚型及良性前列腺组织样本 |
9152 | 2024-09-15 |
MIF as a potential diagnostic and prognostic biomarker for triple-negative breast cancer that correlates with the polarization of M2 macrophages
2024-May-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202400578R
PMID:38787620
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研究论文 | 研究探讨了MIF作为三阴性乳腺癌的潜在诊断和预后生物标志物,并分析了其与M2巨噬细胞极化的关系 | 首次揭示了MIF在三阴性乳腺癌中通过调节巨噬细胞极化影响肿瘤微环境和预后的机制 | 研究样本量较小,且仅限于特定患者群体,需要进一步的大规模验证 | 探讨MIF在三阴性乳腺癌中的作用及其作为诊断和预后标志物的潜力 | 三阴性乳腺癌患者的肿瘤微环境和预后 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间转录组学 | NA | RNA | 41,567个细胞来自10个三阴性乳腺癌肿瘤样本和2名患者的空间转录组数据 |
9153 | 2024-09-15 |
Scuphr: A probabilistic framework for cell lineage tree reconstruction
2024-May, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012094
PMID:38723024
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研究论文 | 本文介绍了一种基于概率框架的细胞谱系树重建方法Scuphr | Scuphr采用距离法结合批量和单细胞DNA测序数据,解决了单细胞DNA测序中的常见挑战,如等位基因丢失和扩增错误,并在速度和准确性上优于现有方法 | NA | 开发一种用于细胞谱系树重建的方法,以研究细胞发育、分化和癌症进展 | 健康组织的批量和单细胞DNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞DNA测序 | 距离法 | DNA测序数据 | 18个细胞的生物数据集和多种合成数据集 |
9154 | 2024-09-15 |
Dihydroartemisinin Regulated the MMP-Mediated Cellular Microenvironment to Alleviate Rheumatoid Arthritis
2024, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0459
PMID:39257420
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研究论文 | 研究了双氢青蒿素通过调节MMP介导的细胞微环境来缓解类风湿性关节炎的作用机制 | 揭示了双氢青蒿素通过抑制MMP2和MMP3来改善类风湿性关节炎的免疫微环境的机制 | 研究主要集中在体外和体内实验,缺乏临床试验数据 | 揭示双氢青蒿素对抗类风湿性关节炎的药理机制 | 类风湿性关节炎的免疫微环境和双氢青蒿素的作用 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序(RNA-seq)、蛋白质组学、转录组学 | NA | RNA、蛋白质 | 涉及RA大鼠和MH7A细胞 |
9155 | 2024-09-15 |
Single-cell and spatial transcriptome assays reveal heterogeneity in gliomas through stress responses and pathway alterations
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1452172
PMID:39257581
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研究论文 | 研究通过单细胞和空间转录组学分析揭示了胶质瘤在应激反应和通路改变中的异质性 | 首次从空间角度探讨了氧化应激反应在胶质瘤异质性中的机制 | 研究主要集中在高级别和低级别胶质瘤,未涵盖所有胶质瘤类型 | 探讨胶质瘤异质性的分子机制,特别是氧化应激反应的影响 | 高级别和低级别胶质瘤中的氧化应激反应基因 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间转录组学(ST) | NA | 转录组数据 | 涉及高级别和低级别胶质瘤的样本 |
9156 | 2024-09-15 |
Exploring the molecular mechanisms of macrophages in islet transplantation using single-cell analysis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1407118
PMID:39267737
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析探索了巨噬细胞在胰岛移植中的分子机制 | 揭示了巨噬细胞在同种异体移植中的复杂相互作用和调控机制,并发现了潜在的治疗靶点 | NA | 研究巨噬细胞在胰岛移植中的作用及其对移植存活的影响 | 巨噬细胞在胰岛移植中的分子机制 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序(ScRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 来自GSE198865的同种异体和异种胰岛移植移植物的ScRNA-seq数据 |
9157 | 2024-09-15 |
Application and research progress of single cell sequencing technology in leukemia
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1389468
PMID:39267837
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在白血病研究中的应用和进展 | 单细胞测序技术能够在单细胞水平上研究白血病的基因表达谱、突变和表观遗传特征,为白血病研究提供了新的视角 | NA | 探讨单细胞测序技术在白血病研究中的应用,增强对白血病发病机制的理解,发现治疗靶点和个性化治疗 | 白血病细胞的基因表达谱、突变和表观遗传特征 | 数字病理 | 白血病 | 单细胞测序技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
9158 | 2024-09-15 |
Multi-omics analysis reveals the landscape of tumor microenvironments in left-sided and right-sided colon cancer
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1403171
PMID:39267963
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了左侧和右侧结肠癌肿瘤微环境的差异 | 首次通过多组学分析揭示了左侧和右侧结肠癌肿瘤微环境中免疫细胞浸润的显著差异,并发现右侧结肠癌中肿瘤细胞具有更高的突变频率和更强的免疫原性 | 研究样本量较小,可能影响结果的普适性 | 探讨左侧和右侧结肠癌肿瘤微环境的差异及其对免疫治疗效果的影响 | 左侧和右侧结肠癌的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 结肠癌 | 多组学分析,包括bulk RNA测序、单细胞RNA测序和全外显子测序 | NA | 基因组数据 | 左侧结肠癌115例,右侧结肠癌162例 |
9159 | 2024-09-15 |
Single-cell transcriptomics reveals tumor microenvironment remodeling in hepatocellular carcinoma with varying tumor subclonal complexity
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1467682
PMID:39268081
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研究论文 | 研究探讨了肝细胞癌中肿瘤亚克隆复杂性与肿瘤微环境重塑之间的关系 | 提出了一个基于离散拷贝数变异(CNVs)的稳健指标,用于准确量化每个样本的亚克隆复杂度 | NA | 揭示肝细胞癌中肿瘤亚克隆复杂性与肿瘤微环境之间的关系 | 肝细胞癌中的肿瘤亚克隆复杂性和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 30个样本 |
9160 | 2024-09-15 |
Dynamic changes in cellular atlases and communication patterns within yak ovaries across diverse reproductive states unveiled by single-cell analysis
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1444706
PMID:39268087
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了牦牛卵巢在不同生殖状态下的细胞图谱和细胞间通信模式的动态变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术描绘了牦牛卵巢在不同生殖状态下的细胞图谱,并构建了细胞间通信网络 | NA | 研究牦牛卵巢在不同生殖状态下的细胞和分子特征,以深入了解其卵巢功能 | 牦牛卵巢在不同生殖状态下的细胞图谱和细胞间通信模式 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |