单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 9141 - 9160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9141 | 2025-10-07 |
All the single cells: Single-cell transcriptomics/epigenomics experimental design and analysis considerations for glial biologists
2025-Mar, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24633
PMID:39558887
|
综述 | 为胶质细胞生物学家提供单细胞转录组学实验设计与分析的入门指南 | 专门针对胶质细胞研究领域系统梳理单细胞组学实验设计与分析的关键决策点 | 主要关注单细胞RNA-seq分析，未深入探讨其他单细胞组学技术的具体应用 | 提升胶质细胞生物学家对单细胞组学数据的分析与解读能力 | 胶质细胞及其在神经疾病中的亚型与功能 | 生物信息学 | 神经疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9142 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing to Guide Autologous Preterm Cord Mesenchymal Stromal Cell Therapy
2025-Mar, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202403-0569OC
PMID:39586004
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序评估早产脐带间充质基质细胞在实验性支气管肺发育不良中的治疗潜力 | 首次使用单细胞RNA测序比较不同妊娠并发症来源的UC-MSCs转录组特征及其治疗潜力 | 样本量有限（5例足月供体+16例早产供体），未探索其他妊娠并发症的影响 | 评估妊娠并发症是否改变UC-MSCs在支气管肺发育不良中的治疗潜力 | 人脐带来源间充质基质细胞和新生儿真皮成纤维细胞 | 单细胞组学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序，单核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5例足月供体+16例早产供体+人新生儿真皮成纤维细胞对照 | NA | 单细胞RNA测序，单核RNA测序 | NA | NA |
| 9143 | 2025-10-07 |
Analysis of human neutrophils from nasal polyps by single-cell RNA sequencing reveals roles of neutrophils in chronic rhinosinusitis
2025-Mar, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.10.032
PMID:39522652
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析鼻息肉中的人类中性粒细胞，揭示其在慢性鼻窦炎中的作用 | 开发了新型微孔板单细胞RNA测序方法，首次系统揭示鼻息肉组织中中性粒细胞的异质性和功能状态 | 样本量较小（5例对照组织，5例鼻息肉组织），仅分析了粒细胞富集样本 | 揭示中性粒细胞在鼻息肉组织中的作用和异质性 | 人类鼻息肉组织、对照鼻窦组织和患者匹配的外周血样本中的中性粒细胞 | 单细胞组学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序 | Benjamini-Hochberg算法，通路富集分析，Gene Ontology富集分析 | 单细胞转录组数据 | 5例对照鼻窦组织，5例鼻息肉组织，患者匹配外周血样本，共分析17,878个细胞（1,151个NP中性粒细胞，13,591个PB中性粒细胞，3,136个对照组织中性粒细胞） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 微孔板单细胞RNA测序方法 |
| 9144 | 2025-10-07 |
Melatonin treatment increases skin microbiota-derived propionic acid to alleviate atopic dermatitis
2025-Mar, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.11.019
PMID:39579877
|
研究论文 | 本研究揭示了褪黑素通过调节皮肤微生物群产生丙酸来缓解特应性皮炎的新机制 | 首次发现褪黑素通过皮肤微生物群/丙酸/GPR43/FABP5轴缓解特应性皮炎 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验，尚未在人体临床试验中验证 | 探究褪黑素通过调节皮肤微生物群缓解特应性皮炎的机制 | 特应性皮炎小鼠模型和HaCaT细胞 | 微生物组学 | 特应性皮炎 | 16S rRNA测序,单细胞测序,转录组分析,定量RT-PCR,Western blotting | 动物模型,细胞模型 | 基因组数据,转录组数据,蛋白质数据 | AD小鼠模型和HaCaT细胞系 | NA | 16S rRNA测序,单细胞测序,转录组测序 | NA | NA |
| 9145 | 2025-10-07 |
Aged hippocampal single-cell atlas screening unveils disrupted neuroglial system in postoperative cognitive impairment
2025-Mar, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14406
PMID:39540334
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了老年小鼠海马神经胶质系统在术后认知障碍中的分子机制及右美托咪定的治疗潜力 | 首次构建老年海马单细胞图谱，发现术后神经胶质系统代谢紊乱和细胞间通讯异常的新机制 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究术后认知障碍中神经胶质相互作用的分子机制和治疗靶点 | 老年小鼠海马组织中的神经元和胶质细胞（小胶质细胞、星形胶质细胞、少突胶质细胞） | 神经科学 | 术后认知障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 老年小鼠海马组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9146 | 2025-10-07 |
Investigating biological nitrogen fixation via single-cell transcriptomics
2025-Feb-25, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erae454
PMID:39563004
|
综述 | 本文总结了单细胞转录组学在解析豆科植物根瘤共生分子机制方面的关键发现 | 首次系统整合多个豆科植物的单细胞转录组数据，揭示根瘤共生的保守转录程序和细胞谱系动态 | 仅涵盖三种模式豆科植物的研究，未涉及非豆科作物的工程化应用 | 探索通过单细胞转录组学解析生物固氮机制，为工程化根瘤共生提供理论基础 | 蒺藜苜蓿、百脉根和大豆的根瘤共生系统 | 植物生物学 | NA | 单细胞转录组学 | 轨迹推断，RNA速率分析 | 单细胞RNA测序数据 | 三种豆科植物的根瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9147 | 2025-10-07 |
Mapping of the T-cell Landscape of Biliary Tract Cancer Unravels Anatomic Subtype-Specific Heterogeneity
2025-Feb-17, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-1173
PMID:39570809
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间分析揭示胆道癌不同解剖亚型中T细胞景观的特异性异质性 | 首次在单细胞和空间水平系统描绘胆道癌各亚型的T细胞多样性，发现肝外胆管癌特有的T细胞耗竭特征和肝内胆管癌的免疫抑制特征 | 样本量相对有限（16例患者），需要更大规模研究验证发现 | 阐明胆道癌不同解剖亚型的T细胞免疫特征差异 | 胆道癌患者（包括肝内胆管癌、肝外胆管癌和胆囊癌）的CD3+ T细胞 | 单细胞生物学 | 胆道癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序, 空间分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间分布数据, 病理切片图像 | 16例患者的36个样本，分析355张病理切片 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9148 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing applications in acute myeloid leukemia
2025-Feb, Leukemia & lymphoma
IF:2.2Q3
DOI:10.1080/10428194.2024.2422833
PMID:39496597
|
综述 | 本文综述单细胞测序技术在急性髓系白血病研究中的应用进展 | 系统总结单细胞测序从细胞处理到生物信息分析的技术进展及其在AML研究中的创新应用 | 未涉及具体实验数据验证，主要为文献综述性质 | 探讨单细胞测序技术如何推动急性髓系白血病研究并改善临床实践 | 急性髓系白血病的遗传和表型异质性 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9149 | 2025-10-07 |
CD137 Protein Expression Pattern Determines the Functional Role of Galectin-9 in Colorectal Cancer
2025-Feb, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.23838
PMID:39503215
|
研究论文 | 本研究通过分析结直肠癌单细胞测序数据开发预后评分系统，并探讨LGALS9基因作为治疗靶点的潜力 | 发现LGALS9在结直肠癌中的作用取决于CD137蛋白表达模式，提出CD137水平可作为LGALS9靶向治疗疗效预测指标 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步临床验证 | 开发结直肠癌预后工具并探索LGALS9基因的治疗潜力 | 结直肠癌患者数据和小鼠结直肠癌模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | Scissor算法 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9150 | 2025-10-07 |
COMPREHENSIVE CHARACTERIZATION OF CYTOKINES IN PATIENTS UNDER EXTRACORPOREAL MEMBRANE OXYGENATION: EVIDENCE FROM INTEGRATED BULK AND SINGLE-CELL RNA SEQUENCING DATA USING MULTIPLE MACHINE LEARNING APPROACHES
2025-Feb-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002425
PMID:39503329
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据，利用多种机器学习方法构建了细胞因子相关基因分类器，用于预测ECMO患者的预后 | 首次整合bulk和单细胞RNA测序数据，应用多种机器学习算法识别关键细胞因子相关基因，并构建ECMO预后预测模型 | 研究样本量有限，仅基于三个ECMO支持数据集和医院队列 | 全面表征ECMO患者细胞因子表达特征，构建预后预测模型 | 接受体外膜肺氧合(ECMO)治疗的患者 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | SVM, RF, Lasso, XGBoost, ANN | 基因表达数据 | 三个ECMO支持数据集（两个bulk RNA-seq和一个单细胞RNA-seq）及医院队列 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9151 | 2025-10-07 |
Inorganic pyrophosphatase 1: a key player in immune and metabolic reprogramming in ankylosing spondylitis
2025-Feb, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-024-00308-0
PMID:39511317
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化和单细胞测序分析无机焦磷酸酶1在强直性脊柱炎免疫代谢重编程中的关键作用 | 首次结合孟德尔随机化和单细胞测序技术揭示PPA1基因通过调控阿魏酸硫酸盐表达影响CD8+记忆T细胞代谢的机制 | 样本量较小（仅3例患者），需要更大规模研究验证 | 阐明强直性脊柱炎中免疫细胞与代谢物的相互作用机制 | 强直性脊柱炎患者椎体骨髓血样本 | 单细胞组学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 表达数量性状位点分析 | NA | 单细胞基因表达数据, 基因型数据 | 3例患者（包含AS患者和对照） | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x单细胞测序平台 |
| 9152 | 2025-10-07 |
Mouse Bladder Smooth Muscle Lack the Functional Active NMDAR
2025-Feb, Neurourology and urodynamics
IF:1.8Q3
DOI:10.1002/nau.25631
PMID:39552551
|
研究论文 | 本研究通过多方法验证发现小鼠膀胱平滑肌缺乏功能性NMDAR | 首次通过单细胞RNA测序和功能实验证实膀胱平滑肌缺乏功能性N-甲基-D-天冬氨酸受体 | 研究主要基于小鼠模型，人类膀胱组织的验证相对有限 | 探究NMDAR在膀胱平滑肌功能中的作用及其作为膀胱过度活动症治疗靶点的潜力 | 小鼠和人类膀胱平滑肌组织 | 分子生物学 | 膀胱过度活动症 | 肌动描记术,钙成像,单细胞RNA测序,免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据,图像数据,生理测量数据 | 小鼠和人类膀胱组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9153 | 2025-10-07 |
PD-L1 promotes tumor metastasis by regulating the infiltration of FGFBP2(+)Tm cells in colorectal cancer
2025-Feb, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-03223-w
PMID:39558101
|
研究论文 | 本研究揭示PD-L1通过调控FGFBP2(+)记忆T细胞浸润促进结直肠癌转移的机制 | 首次发现PD-L1通过抑制CXCL9/CXCL10分泌减少FGFBP2(+)记忆T细胞浸润，并证实该细胞亚群在转移灶中通过促血管生成促进肿瘤转移 | NA | 探究PD-L1表达与肿瘤转移的关系及其免疫调控机制 | 结直肠癌患者样本和小鼠转移模型 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 测序数据、病理样本 | 外周血、淋巴结、结肠息肉、原发肿瘤和肝转移样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9154 | 2025-10-07 |
E2F1 Promotes the Occurrence of Head and Neck Squamous Cell Carcinoma and Serves as a Prognostic Biomarker
2025-Feb, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-024-05097-w
PMID:39565537
|
研究论文 | 本研究探讨E2F1在头颈部鳞状细胞癌中的生物学功能及预后价值 | 首次结合转录组和单细胞测序数据系统分析E2F1在HNSCC中的预后价值及免疫调控作用 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探索E2F1在头颈部鳞状细胞癌中的生物学功能和预后价值 | 头颈部鳞状细胞癌患者样本 | 生物信息学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | Lasso-Cox回归模型,列线图模型 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | TCGA和GEO数据库中的HNSCC患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9155 | 2025-10-07 |
The critical role of endoplasmic reticulum stress and the stimulator of interferon genes (STING) pathway in kidney fibrosis
2025-Feb, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2024.10.021
PMID:39566842
|
研究论文 | 本研究揭示了STING通路作为内质网应激上游激活因子在肾脏纤维化中的关键作用 | 首次发现STING与PERK之间存在物理相互作用，并证实STING是肾小管细胞内质网应激的重要上游调节因子 | 内质网应激在肾脏疾病中的精确激活机制仍不完全清楚 | 探究内质网应激和STING通路在肾脏纤维化中的作用机制 | 慢性肾病患者、小鼠肾脏损伤模型（顺铂和单侧输尿管梗阻）、肾小管细胞 | 病理生物学 | 肾脏疾病 | 转录组学分析、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、转录组数据 | 慢性肾病患者肾脏样本、多种小鼠肾脏损伤模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9156 | 2025-10-07 |
Integrated analysis and systematic characterization of the regulatory network for human germline development
2025-Feb, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.11.005
PMID:39571792
|
研究论文 | 通过整合多组学数据构建人类原始生殖细胞数据库并系统解析其调控网络 | 首次系统整合人类原始生殖细胞发育不同阶段的多组学数据，构建了hPGCdb数据库并识别了关键转录因子和调控网络 | 人类原始生殖细胞发育过程难以直接观察，主要依赖已有数据整合分析 | 解析人类原始生殖细胞发育的调控机制 | 人类原始生殖细胞(PGCs) | 生物信息学 | NA | RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq, 单细胞RNA-seq, CRISPRi | NA | 基因组学数据 | 581个RNA-seq样本, 54个ATAC-seq样本, 45个ChIP-seq样本, 69个单细胞RNA-seq样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq | NA | NA |
| 9157 | 2025-10-07 |
TRAIL induces podocyte PANoptosis via death receptor 5 in diabetic kidney disease
2025-Feb, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2024.10.026
PMID:39571905
|
研究论文 | 本研究揭示TRAIL通过死亡受体5诱导足细胞发生PANoptosis在糖尿病肾病中的关键作用 | 首次发现TRAIL/DR5信号通路在糖尿病肾病足细胞PANoptosis中的核心作用机制 | 样本量较小（3例正常 vs 3例DKD），主要依赖小鼠模型验证 | 探究TRAIL/DR5信号通路在糖尿病肾病足细胞损伤中的作用机制 | 人类肾脏样本、培养的人足细胞、糖尿病小鼠模型 | 单细胞生物学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, siRNA沉默, 基因过表达 | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | 3例正常人肾脏样本, 3例糖尿病肾病患者肾脏样本, 多种糖尿病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9158 | 2025-10-07 |
A Study on the Inflammatory Response of the Brain in Neurosyphilis
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202406971
PMID:39574316
|
研究论文 | 本研究通过整合蛋白质组学和单细胞转录组学分析，揭示了神经梅毒中炎症介导脑损伤的机制 | 首次通过整合蛋白质组学和单细胞转录组学方法鉴定出Toll样/NF-κB信号通路是神经梅毒中枢神经系统损伤的关键通路，并发现单核细胞来源的巨噬细胞是关键的炎症反应细胞 | 未明确说明样本数量和具体实验设计的局限性 | 探究神经梅毒中炎症介导脑损伤的分子机制 | 神经梅毒患者的中枢神经系统和外周血炎症细胞 | 神经科学 | 神经梅毒 | 蛋白质组学, 单细胞转录组学, 体外脑类器官模型 | 体外脑类器官模型 | 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 9159 | 2025-10-07 |
High CD44 expression and enhanced E-selectin binding identified as biomarkers of chemoresistant leukemic cells in human T-ALL
2025-Feb, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02473-7
PMID:39580584
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别了T细胞急性淋巴细胞白血病中化疗耐药细胞的特征标志物 | 首次在人类T-ALL中发现具有高CD44表达和增强E-选择素结合能力的化疗耐药白血病细胞群体 | 样本量相对有限（39例人类T-ALL样本），需要更大规模研究验证 | 探索T-ALL化疗耐药机制并识别相关生物标志物 | 人类T-ALL细胞和患者样本 | 单细胞组学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 39例人类T-ALL样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9160 | 2025-10-07 |
In silico integrative scRNA analysis of human colonic epithelium indicates four tuft cell subtypes
2025-Feb-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00182.2024
PMID:39589317
|
研究论文 | 通过整合分析人类结肠单细胞RNA测序数据，揭示了四种不同的簇细胞亚型及其在健康与炎症性肠病中的差异 | 首次在人类结肠中鉴定出四种簇细胞亚型，并发现这些亚型在健康人群和炎症性肠病患者中存在显著差异 | 研究基于公开数据集进行计算机模拟分析，缺乏实验验证 | 探索人类结肠簇细胞的异质性及其在肠道健康与疾病中的作用 | 人类结肠上皮细胞，特别是簇细胞 | 单细胞转录组学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | 计算机模拟分析 | 单细胞RNA测序数据 | 四个公开数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |