单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 9121 - 9140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9121 | 2025-10-07 |
Integrated multi-omics profiling characterizes the crucial role of human dental epithelium during tooth development
2025-Apr-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115437
PMID:40120109
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和分泌组学分析，构建了人类牙齿发育的多层次时空图谱 | 首次结合多种组学技术系统描绘人类牙齿发育过程，识别了未被表征的上皮亚群及其空间定位 | 研究聚焦于胎儿期牙齿发育，未涉及成年期牙齿再生过程 | 阐明人类牙齿早期发育的细胞和分子机制 | 人类胎儿牙齿原基 | 空间生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 分泌组学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间基因表达数据, 蛋白质分泌数据 | 人类胎儿牙齿发育不同时间点的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9122 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-seq analysis identifies the atlas of lymph fluid and reveals a sepsis-related T cell subset
2025-Apr-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115469
PMID:40178976
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析大鼠淋巴液免疫细胞图谱，发现与脓毒症相关的CD4 T细胞亚群 | 首次在大鼠淋巴液中鉴定出具有抗炎功能的CD4_Icos T细胞亚群，并揭示其通过Npas2转录因子调控分化为调节性T细胞的机制 | 研究主要基于大鼠模型，临床验证数据有限 | 探究淋巴液中免疫细胞组成及其在脓毒症中的作用机制 | 大鼠淋巴液免疫细胞和脓毒症患者样本 | 单细胞组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9123 | 2025-10-07 |
Ciliary marginal zone of the developing human retina maintains retinal progenitor cells until late gestational stages
2025-Apr-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115460
PMID:40178972
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研究论文 | 本研究揭示了人类发育过程中视网膜睫状体边缘区在晚期仍保持视网膜祖细胞增殖能力的现象 | 首次发现人类视网膜睫状体边缘区在发育晚期仍具有产生早期和晚期神经元类型的能力，且细胞周期较中央区视网膜祖细胞更长 | 研究仅关注发育晚期阶段，未探讨该区域在成年期的完全退化机制 | 探究人类视网膜发育过程中睫状体边缘区的神经发生持续时间 | 人类发育期视网膜组织 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 5-乙炔基-2'-脱氧尿苷示踪 | NA | 基因表达数据, 细胞增殖数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9124 | 2025-10-07 |
STAT3 signaling enhances tissue expansion during postimplantation mouse development
2025-Apr-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115506
PMID:40188437
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研究论文 | 本研究探讨STAT3信号通路在小鼠胚胎植入后发育过程中对组织扩张的调控作用 | 发现STAT3通过丝氨酸磷酸化形式调控早期胚胎发育进程，特别是在红细胞谱系中的特异性作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性仍需进一步验证 | 阐明STAT3信号在胚胎发育过程中的功能机制 | 小鼠胚胎干细胞和胚胎组织 | 发育生物学 | 生长发育障碍 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 体外分化实验 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 小鼠胚胎组织和干细胞 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 9125 | 2025-10-07 |
Age-dependent glial heterogeneity and traumatic injury responses in a vertebrate brain structure
2025-Apr-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115508
PMID:40198221
|
研究论文 | 本研究通过构建斑马鱼中脑视顶盖的单细胞转录组图谱，揭示了年龄依赖性胶质细胞异质性及其对创伤性脑损伤的响应机制 | 首次在脊椎动物大脑中系统揭示了不同发育阶段胶质细胞对创伤性脑损伤的异质性响应，并发现dla-notch3和cxcl12a-cxcr4b信号通路在年龄特异性反应中的关键作用 | 研究仅限于斑马鱼模型，需要在哺乳动物模型中进一步验证；仅关注了四个胚胎后发育阶段 | 探究年龄因素如何影响胶质细胞动态及其对创伤性脑损伤的响应 | 斑马鱼中脑视顶盖的三种主要胶质细胞类型 | 单细胞转录组学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 单细胞转录组数据 | 四个胚胎后发育阶段的斑马鱼中脑视顶盖样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9126 | 2025-10-07 |
Cannabinoid CB2 receptor controls chronic itch by regulating spinal microglial activation and synaptic transmission
2025-Apr-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115559
PMID:40222011
|
研究论文 | 本研究揭示大麻素CB2受体通过调控脊髓小胶质细胞活化和突触传递控制慢性瘙痒的机制 | 首次阐明CB2受体通过诱导SOCS3表达、抑制p38/STAT1磷酸化通路重编程小胶质细胞，进而调控GRP/GRPR中间神经元和上行投射神经元活性的神经免疫互作机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究慢性瘙痒的中枢神经机制及CB2受体的抗瘙痒作用 | 小鼠脊髓小胶质细胞、GRP/GRPR中间神经元、上行投射神经元 | 神经科学 | 慢性瘙痒 | 单细胞RNA测序、分子机制研究 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、磷酸化数据 | 皮炎和银屑病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9127 | 2025-10-07 |
THBS2-producing matrix CAFs promote colorectal cancer progression and link to poor prognosis via the CD47-MAPK axis
2025-Apr-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115555
PMID:40222008
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现分泌THBS2的基质癌相关成纤维细胞(mCAFs)在结直肠癌进展中发挥关键作用 | 首次鉴定出分泌THBS2的mCAFs亚型，揭示了THBS2通过CD47-MAPK/ERK5信号轴促进肿瘤进展的新机制，并发现CREB3L1是正常成纤维细胞向THBS2-producing mCAFs转化的调控因子 | NA | 探究结直肠癌中癌相关成纤维细胞(CAFs)的异质性及其在肿瘤进展中的作用机制 | 结直肠癌患者样本、小鼠模型、患者来源类器官和异种移植模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 免疫组织化学图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9128 | 2025-10-07 |
Desmoplastic tumor priming using clinical-stage corticosteroid liposomes
2025-Apr-22, Cell biomaterials
DOI:10.1016/j.celbio.2025.100051
PMID:40276304
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研究论文 | 本研究利用临床阶段地塞米松脂质体预处理肿瘤微环境以改善药物递送和治疗效果 | 首次使用临床阶段糖皮质激素脂质体对促结缔组织增生性肿瘤进行预处理，通过改善血管功能和减少细胞外基质沉积来增强药物递送 | NA | 改善肿瘤药物递送效率和治疗效果 | 促结缔组织增生性肿瘤微环境 | 肿瘤治疗 | 癌症 | 单细胞测序、多模态光学成像 | NA | 基因表达数据、成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9129 | 2025-10-07 |
Lamb1-mediated Wnt/β-catenin signaling pathway drives endothelial angiogenesis for fracture healing
2025-Apr-10, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149481
PMID:40221061
|
研究论文 | 本研究探讨Lamb1通过Wnt/β-catenin信号通路调控内皮细胞血管生成促进骨折愈合的机制 | 首次发现Lamb1+内皮细胞在骨折愈合过程中的动态变化及其通过Wnt/β-catenin通路调控血管生成的新机制 | 研究主要基于细胞实验，缺乏动物模型验证；样本来源和数量未明确说明 | 探究内皮细胞在骨折愈合中的作用及其分子机制 | 内皮细胞（特别是Lamb1+亚群）、人脐静脉内皮细胞（HUVEC） | 细胞生物学 | 骨折 | scRNA-seq, qRT-PCR, 细胞免疫荧光染色, transwell实验, GSVA分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据, 细胞功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9130 | 2025-10-07 |
Machine Learning-enhanced Signature of Metastasis-related T Cell Marker Genes for Predicting Overall Survival in Malignant Melanoma
2025-Apr-01, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997)
DOI:10.1097/CJI.0000000000000544
PMID:39506915
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习技术识别转移相关T细胞标志基因，构建预测恶性黑色素瘤患者总生存期的生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序和多种机器学习算法识别转移相关T细胞标志基因，并构建能够预测免疫治疗反应的生物标志物特征 | 研究样本量有限，需要更大规模验证研究的确认 | 探索原发性和转移性恶性黑色素瘤肿瘤免疫微环境差异，开发预测患者生存和免疫治疗反应的生物标志物 | 恶性黑色素瘤患者的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 恶性黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 多种机器学习算法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x单细胞RNA测序平台 |
| 9131 | 2025-10-07 |
Uncovering Molecular and Genetic Drivers of Dental Caries Via scRNA-seq and Mendelian Randomisation
2025-Apr, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2024.10.005
PMID:39510929
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法，揭示龋齿的分子和遗传驱动因素 | 首次将单细胞RNA测序与孟德尔随机化相结合，系统分析龋齿的细胞异质性和遗传风险因素 | 研究样本量有限，未来需要更大规模验证和功能实验确认基因作用机制 | 阐明导致龋齿易感性和进展的分子和遗传因素 | 健康与龋齿影响的牙髓组织 | 单细胞组学 | 龋齿 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化 | 孟德尔随机化模型 | 单细胞基因表达数据, 遗传变异数据 | GSE185222数据集中的牙髓组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9132 | 2025-10-07 |
Graft-derived extracellular vesicles transport miRNAs to modulate macrophage polarization after heart transplantation
2025-Apr, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2024.11.021
PMID:39586401
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研究论文 | 本研究探索心脏移植后移植物来源的细胞外囊泡通过运输miRNAs调控巨噬细胞极化的机制 | 首次发现CD63+移植物巨噬细胞来源的EVs通过携带miR-363和miR-709，经Fcho2/Notch1信号通路诱导受体脾脏中M1巨噬细胞极化 | 研究基于小鼠异位移植模型，结果需在人类临床样本中进一步验证 | 阐明心脏移植后急性排斥反应中的免疫细胞相互作用机制 | 小鼠心脏移植模型中的CD45免疫细胞 | 单细胞测序分析 | 心脏移植排斥反应 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 小鼠心脏移植物和脾脏CD45免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9133 | 2025-10-07 |
CK2B Induces CD8+ T-Cell Exhaustion through HDAC8-Mediated Epigenetic Reprogramming to Limit the Efficacy of Anti-PD-1 Therapy in Non-Small-Cell Lung Cancer
2025-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202411053
PMID:40013761
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研究论文 | 本研究揭示CK2B通过HDAC8介导的表观遗传重编程诱导CD8+ T细胞耗竭，从而限制非小细胞肺癌中抗PD-1疗法的疗效 | 首次发现CK2B通过HDAC8介导的表观遗传机制调控T细胞耗竭，并证实靶向CK2B可增强抗PD-1疗法疗效 | NA | 探索靶向CK2及其调节亚基CK2B来预防或逆转T细胞耗竭，以增强抗PD-1疗法在非小细胞肺癌中的疗效 | 非小细胞肺癌中的CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序，体外实验，体内实验 | NA | 基因表达数据，实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9134 | 2025-10-07 |
LIPUS Promotes Calcium Oscillation and Enhances Calcium Dependent Autophagy of Chondrocytes to Alleviate Osteoarthritis
2025-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202413930
PMID:40013941
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研究论文 | 本研究通过荧光成像技术揭示低强度脉冲超声波通过钙振荡促进软骨细胞自噬缓解骨关节炎的机制 | 首次动态可视化LIPUS的机械刺激作用，发现TRPV4离子通道介导的钙依赖性自噬新机制 | 机制研究主要在细胞和斑马鱼模型中进行，需要进一步在哺乳动物模型中验证 | 探索LIPUS缓解骨关节炎的分子机制 | 小鼠软骨细胞和活体斑马鱼 | 生物力学 | 骨关节炎 | 荧光成像技术，单细胞RNA测序 | NA | 图像数据，基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9135 | 2025-10-07 |
Revealing the Transcriptional and Metabolic Characteristics of Sebocytes Based on the Donkey Cell Transcriptome Atlas
2025-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202413819
PMID:40013957
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研究论文 | 基于德州驴20个组织的单细胞转录组测序构建转录图谱，揭示驴皮脂细胞的转录和代谢特征 | 首次构建驴的单细胞转录组图谱，发现SOX10在少突胶质细胞中的进化保守性，并阐明驴皮脂细胞的独特转录模式 | 仅针对德州驴进行研究，物种代表性有限；细胞类型注释可能不完全准确 | 深入探究驴在细胞水平的生理特征和分子机制 | 德州驴的20个组织样本 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序，代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据，代谢组数据 | 275,050个高质量细胞，84种细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 9136 | 2025-10-07 |
NETs-CD44-IL-17A Feedback Loop Drives Th17-Mediated Inflammation in Behçet's Uveitis
2025-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202411524
PMID:40013981
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研究论文 | 本研究揭示了NETs-CD44-IL-17A反馈环路在贝赫切特葡萄膜炎发病机制中的关键作用 | 首次发现NETs通过上调CD44诱导Th17分化，而Th17分泌的IL-17A又能促进中性粒细胞募集和NETs形成，形成正反馈环路 | 研究主要基于实验性自身免疫性葡萄膜炎模型，在人类患者中的验证仍需进一步研究 | 探究贝赫切特葡萄膜炎中中性粒细胞过度活化及其与Th17细胞相互作用的分子机制 | 贝赫切特葡萄膜炎患者中性粒细胞、实验性自身免疫性葡萄膜炎模型、Th17细胞 | 免疫学 | 贝赫切特葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序、多重免疫荧光、细胞通讯分析 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎动物模型 | 基因表达数据、免疫荧光图像 | 贝赫切特葡萄膜炎患者与健康对照的中性粒细胞比较 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9137 | 2025-10-07 |
scHeteroNet: A Heterophily-Aware Graph Neural Network for Accurate Cell Type Annotation and Novel Cell Detection
2025-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202412095
PMID:40042052
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研究论文 | 提出一种异质性感知的图神经网络scHeteroNet，用于精确的细胞类型注释和新细胞检测 | 利用scRNA-seq数据中的异质性，整合细胞邻域信息并引入新颖性传播机制 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型注释和新细胞检测的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群体 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络(GNN) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9138 | 2025-10-07 |
Clinical Significance of Complement and Coagulation Cascades Genes for Patients With Acute Lymphoblastic Leukemia
2025-Apr, International journal of laboratory hematology
IF:2.2Q3
DOI:10.1111/ijlh.14392
PMID:39523585
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研究论文 | 本研究通过分析补体和凝血级联通路基因在急性淋巴细胞白血病中的表达特征，评估其作为诊断和预后生物标志物的临床意义 | 首次系统分析补体和凝血级联通路基因在ALL中的表达谱，并利用机器学习建立高精度诊断模型，结合单细胞RNA测序揭示其在骨髓免疫细胞中的差异表达 | 研究基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证和前瞻性临床研究数据 | 探索补体和凝血级联通路基因在急性淋巴细胞白血病中的临床意义 | 急性淋巴细胞白血病患者和健康个体的骨髓及外周血样本 | 生物信息学 | 急性淋巴细胞白血病 | 基因表达谱分析，单细胞RNA测序，机器学习 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 998例骨髓样本和122例外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9139 | 2025-10-07 |
Tumor Microenvironment On-A-Chip and Single-Cell Analysis Reveal Synergistic Stromal-Immune Crosstalk on Breast Cancer Progression
2025-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202413457
PMID:40056038
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研究论文 | 通过肿瘤微环境芯片与单细胞分析揭示乳腺癌中基质细胞与免疫细胞的协同作用机制 | 开发了器官型3D乳腺癌微环境芯片模型，并结合单细胞RNA测序分析，首次系统评估三阴性乳腺癌细胞在患者来源CAFs和Mφs存在下的进展机制 | 研究聚焦于三阴性乳腺癌，可能不适用于其他乳腺癌亚型；芯片模型虽能模拟体内环境但仍与真实人体环境存在差异 | 探究肿瘤微环境中基质细胞与免疫细胞间的相互作用对乳腺癌进展的调控机制 | 三阴性乳腺癌细胞、患者来源的癌症相关成纤维细胞(CAFs)和巨噬细胞(Mφs) | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 3D细胞培养, 功能分析实验 | 器官芯片模型 | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9140 | 2025-10-07 |
Spotiphy enables single-cell spatial whole transcriptomics across an entire section
2025-Apr, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02622-5
PMID:40074951
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研究论文 | 开发了一种计算工具包Spotiphy，可将基于测序的空间转录组数据转化为单细胞分辨率全转录组图像 | 通过计算方法实现单细胞分辨率同时保持全基因组覆盖，解决了当前空间转录组技术的核心挑战 | NA | 开发能够实现单细胞空间全转录组分析的计算方法 | 阿尔茨海默病和健康小鼠大脑、人类乳腺癌空间转录组数据 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病, 乳腺癌 | 空间转录组学 | 计算方法/工具包 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |