单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28561 篇文献，本页显示第 9121 - 9140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9121 | 2024-10-01 |
scGAA: a general gated axial-attention model for accurate cell-type annotation of single-cell RNA-seq data
2024-Sep-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-73356-1
PMID:39333739
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scGAA的新型细胞类型注释模型，用于单细胞RNA测序数据的准确注释 | 提出了基于transformer框架的轴向注意力机制，将传统的自注意力机制分解为水平和垂直注意力，显著提高了计算效率，并集成了门控单元以增强基因间关系的捕捉 | NA | 开发一种高效的细胞类型注释模型，以应对单细胞RNA测序数据的高维度和稀疏性挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | transformer | 基因表达数据 | NA |
| 9122 | 2024-10-01 |
Oncogenic ACSM6 impairs CD8+ T cell-based immune response in bladder cancer
2024-Sep-27, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00657-y
PMID:39334304
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研究论文 | 研究了致癌基因ACSM6在膀胱癌中对CD8+ T细胞免疫反应的影响 | 发现ACSM6通过抑制CD8 T细胞的趋化性和肿瘤杀伤能力，导致非炎症性免疫微环境，从而影响膀胱癌的免疫治疗效果 | NA | 探讨ACSM6在膀胱癌免疫治疗中的作用及其作为预测膀胱癌进展的生物标志物的潜力 | 膀胱癌中的ACSM6表达及其对CD8+ T细胞功能的影响 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 9123 | 2024-10-01 |
Single-cell sequencing to multi-omics: technologies and applications
2024-Sep-27, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00643-4
PMID:39334490
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术及其在多组学中的应用 | 介绍了单细胞多组学技术的发展及其在生物学研究和临床应用中的最新进展 | 讨论了单细胞多组学技术的局限性和面临的挑战 | 探讨单细胞测序技术在多组学中的应用及其在生物学研究和临床中的潜力 | 单细胞RNA测序及其与其他多组学的结合 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 9124 | 2024-10-01 |
Functional heterogeneity of cancer-associated fibroblasts with distinct neoadjuvant immunotherapy plus chemotherapy response in esophageal squamous cell carcinoma
2024-Sep-27, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00656-z
PMID:39334513
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研究论文 | 研究了食管鳞状细胞癌中癌症相关成纤维细胞在术前免疫治疗联合化疗中的功能异质性及其对治疗反应的影响 | 首次通过单细胞RNA测序和多重免疫荧光染色技术，揭示了食管鳞状细胞癌肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞在术前治疗后的显著变化，并发现了与不良治疗反应相关的功能性成纤维细胞亚群 | 研究样本来自单一临床试验，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨食管鳞状细胞癌中癌症相关成纤维细胞在术前免疫治疗联合化疗中的功能异质性及其对治疗反应的影响 | 食管鳞状细胞癌患者的肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自术前抗PD1联合治疗临床试验的食管鳞状细胞癌样本 |
| 9125 | 2024-10-01 |
YTHDF1 in periaqueductal gray inhibitory neurons contributes to morphine withdrawal responses in mice
2024-Sep-20, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-024-03634-2
PMID:39304892
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研究论文 | 本文研究了YTHDF1在导水管周围灰质抑制性神经元中的作用，及其对小鼠吗啡戒断反应的影响 | 首次揭示了YTHDF1在导水管周围灰质抑制性神经元中的表达上调与吗啡戒断反应的关系，并探讨了其通过调节NF-κB表达和磷酸化来调控吗啡戒断反应的机制 | 研究仅限于小鼠模型，且未探讨YTHDF1在其他脑区或人类中的作用 | 探讨YTHDF1在吗啡戒断反应中的作用及其机制 | YTHDF1在导水管周围灰质抑制性神经元中的表达及其对吗啡戒断反应的影响 | NA | NA | 腺相关病毒转染、单细胞RNA测序 | NA | RNA | C57/BL6小鼠或转基因小鼠 |
| 9126 | 2024-10-01 |
Berberine Targets PKM2 to Activate the t-PA-Induced Fibrinolytic System and Improves Thrombosis
2024-Sep-17, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph17091219
PMID:39338381
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研究论文 | 研究探讨了小檗碱通过靶向PKM2激活t-PA诱导的纤溶系统，从而改善血栓形成的作用 | 首次揭示了小檗碱通过调节PKM2表达来影响纤溶系统中t-PA的表达，从而改善血栓形成 | 研究主要在动物模型中进行，需要进一步在临床试验中验证其效果 | 探讨小檗碱治疗动脉血栓的潜在机制 | 小檗碱对血栓形成的影响及其分子机制 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 质谱分析和单细胞RNA测序 | NA | mRNA和蛋白质表达数据 | 使用大鼠作为实验对象，具体样本数量未明确提及 |
| 9127 | 2024-10-01 |
TRPC3 suppression ameliorates synaptic dysfunctions and memory deficits in Alzheimer's disease
2024-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.16.611061
PMID:39345364
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研究论文 | 研究探讨了TRPC3通道在阿尔茨海默病中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次揭示了TRPC3在阿尔茨海默病发病机制中的独特作用，并验证了其作为治疗靶点的有效性 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人类患者中进行验证 | 探讨TRPC3在阿尔茨海默病中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | TRPC3通道在阿尔茨海默病中的表达和功能 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序、钙成像 | NA | RNA序列数据 | 包括阿尔茨海默病患者和小鼠模型的样本 |
| 9128 | 2024-10-01 |
scVGATAE: A Variational Graph Attentional Autoencoder Model for Clustering Single-Cell RNA-seq Data
2024-Sep-11, Biology
DOI:10.3390/biology13090713
PMID:39336140
|
研究论文 | 提出了一种名为scVGATAE的无监督聚类方法，用于单细胞RNA测序数据的细胞亚群识别 | 引入了一种结合图注意力网络的变分图自编码器模型，通过网络去噪构建可靠的细胞图，并自适应确定模型训练迭代次数 | 未提及具体局限性 | 开发一种新的无监督聚类方法，以提高单细胞RNA测序数据中细胞亚群识别的准确性和效率 | 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分图自编码器（VGAE） | 单细胞RNA测序数据 | 九个公共数据集 |
| 9129 | 2024-10-01 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals an Atlas of Hezuo Pig Testis Cells
2024-Sep-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25189786
PMID:39337274
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了合作猪睾丸细胞图谱 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面分析了合作猪睾丸细胞的转录组特征，揭示了不同细胞类型在精子发生过程中的动态变化 | 研究仅限于4个月大的成熟合作猪，未涵盖不同年龄段的合作猪 | 探究合作猪睾丸细胞在精子发生过程中的转录组变化 | 合作猪睾丸中的生殖细胞和体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 16,082个细胞 |
| 9130 | 2024-10-01 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Dynamic Cellular Processes in Corneal Epithelium During Wound Healing in Cynomolgus Monkeys
2024-Sep-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.65.11.43
PMID:39330987
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了食蟹猴角膜上皮细胞在伤口愈合过程中的细胞活动和转录变化 | 首次全面探索了非人灵长类动物角膜细胞在伤口愈合过程中的详细转录组特征 | NA | 揭示角膜伤口愈合过程中的动态调控机制 | 食蟹猴角膜上皮细胞在不同愈合阶段的细胞活动和转录变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 食蟹猴角膜边缘组织在未受伤、1天和3天愈合阶段的样本 |
| 9131 | 2024-10-01 |
ICOS-expressing Regulatory T Cells Influence the Composition of Antitumor CTL Populations
2024-Sep-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300154
PMID:38995175
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研究论文 | 研究探讨了ICOS在抗肿瘤T细胞反应和肿瘤进展中的作用，发现ICOS在调节性T细胞中的特异性敲除可以减少肿瘤负担并增加CD8+ CTLs的数量 | 首次揭示了ICOS在调节性T细胞中对CTL成熟过程的抑制作用，并提出了ICOS激动剂抗体在低调节性T细胞肿瘤中的潜在治疗效果 | 研究仅在实验小鼠模型中进行，结果可能不完全适用于人类 | 探讨ICOS在抗肿瘤T细胞反应中的作用及其对肿瘤进展的影响 | ICOS在调节性T细胞和所有T细胞中的特异性敲除对肿瘤进展的影响 | 肿瘤学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 实验小鼠模型 |
| 9132 | 2024-10-01 |
IFIT3 mediates TBK1 phosphorylation to promote activation of pDCs and exacerbate systemic sclerosis in mice
2024-Sep, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1800
PMID:39305055
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研究论文 | 研究IFIT3/TBK1信号通路在激活浆细胞样树突状细胞（pDCs）及其在系统性硬化症（SSc）发展中的作用 | 揭示了IFIT3作为TBK1的上游调节因子，通过干预IFIT3/TBK1信号通路抑制pDC激活和纤维母细胞功能，为SSc提供了新的治疗靶点 | NA | 评估IFIT3/TBK1信号通路在激活pDCs和系统性硬化症（SSc）发展中的作用 | 浆细胞样树突状细胞（pDCs）和系统性硬化症（SSc） | NA | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和高通量转录组RNA测序 | NA | RNA | 构建了IFIT3-/-小鼠模型 |
| 9133 | 2024-10-01 |
Imprinting as Basis for Complex Evolutionary Novelties in Eutherians
2024-Aug-31, Biology
DOI:10.3390/biology13090682
PMID:39336109
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综述 | 本文综述了基因组印记在真兽类进化中的作用及其对复杂进化新奇性的影响 | 提出基因组印记不仅是基因剂量控制的机制，还增加了细胞多样性和可塑性，并促进了进化新奇性如胎盘和真兽类大脑的进化扩展 | NA | 探讨基因组印记在真兽类进化中的作用及其对复杂进化新奇性的影响 | 基因组印记及其在真兽类中的表现 | NA | NA | 单细胞转录组分析和表观遗传研究 | NA | NA | NA |
| 9134 | 2024-10-01 |
Factors Affecting Cell Viability during the Enzymatic Dissociation of Human Endocrine Tumor Tissues
2024-Aug-27, Biology
DOI:10.3390/biology13090665
PMID:39336093
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研究论文 | 研究了酶解法分离人内分泌肿瘤组织过程中影响细胞活力的因素 | 探讨了不同酶解参数对不同类型肿瘤细胞活力的影响，强调了优化组织消化协议的重要性 | 未详细说明具体的优化方法和实验结果 | 研究酶解法分离人内分泌肿瘤组织过程中影响细胞活力的因素 | 人内分泌肿瘤组织及其细胞 | 数字病理学 | 内分泌肿瘤 | 酶解法 | NA | 细胞 | 未具体说明样本数量 |
| 9135 | 2024-10-01 |
Helicobacter pylori CagA Promotes the Formation of Gallstones by Increasing the Permeability of Gallbladder Epithelial Cells
2024 May-Jun, Helicobacter
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/hel.13100
PMID:38873839
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研究论文 | 研究了幽门螺杆菌CagA通过增加胆囊上皮细胞的通透性促进胆结石形成的作用 | 首次发现幽门螺杆菌CagA是导致胆结石形成的关键致病因素 | 研究主要基于小鼠模型和少量患者样本，需要进一步的人体研究验证 | 探索导致慢性炎症和胆结石形成的关键致病菌及其机制 | 胆结石患者和小鼠模型的胆囊上皮细胞 | NA | 胆结石 | 单细胞转录组测序、bulk转录组测序、16S rRNA测序 | NA | 转录组数据、微生物组数据 | 6名胆结石患者和6名肝移植供体的胆囊黏膜样本，以及胆结石小鼠模型 |
| 9136 | 2024-10-01 |
Revealing the impact of CD70 expression on the manufacture and functions of CAR-70 T-cells based on single-cell transcriptomics
2023-Oct, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03475-7
PMID:37382633
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研究论文 | 研究基于单细胞转录组学揭示CD70表达对CAR-70 T细胞制造和功能的影响 | 首次探讨了在CAR T细胞制造过程中敲除CD70对T细胞扩增、存活和抗肿瘤效果的影响 | 研究仅限于实验室环境，尚未在临床上验证其效果 | 探讨CD70表达对CAR-70 T细胞制造和功能的影响，为CAR T细胞治疗T细胞癌症提供指导 | CD70敲除和野生型CAR-70 T细胞的制造和抗肿瘤能力 | 细胞治疗 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序和TCR测序 | NA | 基因表达数据 | CD70敲除和野生型CAR-70 T细胞 |
| 9137 | 2024-10-01 |
Identification of an antigen-presenting cells/T/NK cells-related gene signature to predict prognosis and CTSL to predict immunotherapeutic response for lung adenocarcinoma: an integrated analysis of bulk and single-cell RNA sequencing
2023-Oct, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03485-5
PMID:37458771
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研究论文 | 本研究旨在通过综合分析bulk和单细胞RNA测序数据，识别与抗原呈递细胞（APC）/T/NK细胞相关的基因特征（ATNKGS）和潜在的免疫细胞相关基因（IRGs），以实现肺癌腺癌（LUAD）患者的危险分层、预后预测和免疫治疗反应预测 | 本研究首次构建了一个包含16个基因的ATNKGS，用于预测LUAD患者的总体生存率，并揭示了CTSL在免疫治疗反应预测中的重要作用 | 本研究主要基于公共数据集和外部免疫治疗队列进行验证，未来需要更多的临床试验数据来进一步验证这些发现 | 识别与APC/T/NK细胞相关的基因特征和潜在的免疫细胞相关基因，以实现LUAD患者的危险分层、预后预测和免疫治疗反应预测 | 肺癌腺癌（LUAD）患者 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | LASSO Cox回归 | RNA测序数据 | 1108名患者 |
| 9138 | 2024-10-01 |
Female Gene Networks Are Expressed in Myofibroblast-Like Smooth Muscle Cells in Vulnerable Atherosclerotic Plaques
2023-10, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.319325
PMID:37589136
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研究论文 | 研究探讨了女性基因网络在易损性动脉粥样硬化斑块中的平滑肌细胞中的表达 | 首次揭示了女性基因网络在易损性动脉粥样硬化斑块中的平滑肌细胞中的表达，并识别了两个主要的平滑肌细胞基因调控网络 | 研究主要集中在人类颈动脉斑块和Apoe-/-小鼠模型上，可能无法完全代表所有动脉粥样硬化情况 | 探讨女性基因网络在易损性动脉粥样硬化斑块中的作用 | 人类颈动脉斑块和Apoe-/-小鼠模型 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类颈动脉斑块样本和Apoe-/-小鼠模型 |
| 9139 | 2024-10-01 |
Single-Cell RNA Sequencing and Its Applications in the Study of Psychiatric Disorders
2023-Jul, Biological psychiatry global open science
DOI:10.1016/j.bpsgos.2022.03.013
PMID:37519459
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术及其在精神疾病研究中的应用 | 介绍了单细胞RNA测序技术在神经科学领域的创新应用，能够更准确地分类神经元和胶质细胞亚型，并发现新的细胞类型 | 目前对转录组的知识主要来自批量RNA测序，可能忽略单细胞分辨率下的微小转录组差异 | 探讨单细胞RNA测序技术在脑细胞分类、神经发育和精神疾病研究中的应用 | 神经元和胶质细胞亚型、神经发育过程、精神疾病 | 基因组学 | 精神疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 9140 | 2024-10-01 |
Effects of 3-HAA on HCC by Regulating the Heterogeneous Macrophages-A scRNA-Seq Analysis
2023-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202207074
PMID:37013458
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研究论文 | 研究3-HAA对肝细胞癌（HCC）的免疫调节作用及其对异质性巨噬细胞的影响 | 首次通过scRNA-Seq分析揭示了3-HAA在HCC中的免疫调节作用及其对巨噬细胞亚群的影响 | 研究仅限于实验模型，尚未在临床环境中验证 | 探讨3-HAA在肝细胞癌中的免疫调节作用 | 3-HAA对HCC模型中巨噬细胞亚群的影响 | 数字病理学 | 肝癌 | scRNA-Seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 涉及HCC模型的多个细胞亚群 |