单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27967 篇文献，本页显示第 9101 - 9120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9101 | 2024-09-16 |
Glucose deprivation-induced disulfidptosis in human nucleus pulposus cells: a novel pathological mechanism of intervertebral disc degeneration
2024-Sep-12, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-024-00528-4
PMID:39267140
|
研究论文 | 研究了葡萄糖剥夺诱导的人椎间盘髓核细胞中的二硫化物死亡，揭示了椎间盘退变的新病理机制 | 首次揭示了葡萄糖剥夺诱导的二硫化物死亡在椎间盘退变中的作用，并鉴定了一个新的二硫化物死亡相关细胞亚群 | 研究仅限于体外实验和单细胞RNA测序分析，缺乏体内实验验证 | 探讨葡萄糖剥夺诱导的二硫化物死亡在椎间盘退变中的病理机制 | 人椎间盘髓核细胞和椎间盘退变样本 | 数字病理学 | 椎间盘退变 | RNA测序、单细胞RNA测序、全基因组DNA甲基化 | 机器学习 | 基因表达数据 | 一个正常样本和一个椎间盘退变样本 |
| 9102 | 2024-09-16 |
Identification of macrophage driver genes in fibrosis caused by different heart diseases based on omics integration
2024-Sep-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05624-7
PMID:39267173
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学和批量RNA测序分析，探讨了不同心脏病引起的纤维化中巨噬细胞驱动基因的关系 | 首次通过整合单细胞转录组学和批量RNA测序数据，揭示了四种心脏病中巨噬细胞介导的心肌纤维化的驱动基因，并验证了左心室辅助装置（LVAD）对心衰患者的治疗效果 | NA | 探讨不同心脏病引起的心肌纤维化中巨噬细胞的遗传病理生理机制 | 巨噬细胞在心肌纤维化中的作用及其驱动基因 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、批量RNA测序 | NA | 转录组数据 | 四种心脏病（扩张型心肌病、缺血性心肌病、心肌梗死、心衰）的单细胞数据 |
| 9103 | 2024-09-16 |
Construction and validation of a TAMRGs prognostic signature for gliomas by integrated analysis of scRNA and bulk RNA sequencing data
2024-Sep-11, Brain research
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.brainres.2024.149237
PMID:39270996
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，构建并验证了一种基于肿瘤相关巨噬细胞相关基因的胶质瘤预后模型 | 首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据，构建了一种新的预后模型，并验证了其在胶质瘤患者中的预后价值 | NA | 构建并验证一种基于肿瘤相关巨噬细胞相关基因的胶质瘤预后模型 | 胶质瘤患者的预后预测 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序 | LASSO回归和多变量Cox回归分析 | RNA测序数据 | 三个内部胶质瘤组织样本和TCGA-GTEx数据集 |
| 9104 | 2024-09-16 |
Mechanical stimuli-induced CCL2 restores adult mouse cells to regenerate hair follicles
2023-Jun-13, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2023.03.002
PMID:37020681
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研究论文 | 研究机械刺激如何通过CCL2介导的微环境调控机制促进成年小鼠毛囊再生 | 首次揭示了机械刺激通过CCL2介导的化学信号通路促进毛囊再生的机制 | NA | 探讨机械刺激诱导毛囊再生的机制 | 成年小鼠的皮肤细胞和毛囊 | NA | NA | RNA测序（RNA-seq）和单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 涉及多个时间点的皮肤细胞样本和毛囊移植实验 |
| 9105 | 2024-09-16 |
Age or lifestyle-induced accumulation of genotoxicity is associated with a length-dependent decrease in gene expression
2023-Apr-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106368
PMID:37013186
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研究论文 | 研究探讨了基因长度与基因表达在衰老过程中的关系 | 发现了基因长度依赖的基因表达下降与衰老相关的普遍现象，并揭示了紫外线辐射和吸烟暴露对基因表达的影响 | 研究主要基于小鼠和人类的数据，可能需要更多物种和数据来验证结论 | 探讨DNA损伤积累与基因表达变化在衰老中的作用 | 基因长度与基因表达的关系 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠和人类的多个组织和细胞类型 |
| 9106 | 2024-09-16 |
Clinical, genetic, epidemiologic, evolutionary, and functional delineation of TSPEAR-related autosomal recessive ectodermal dysplasia 14
2023-04-13, HGG advances
DOI:10.1016/j.xhgg.2023.100186
PMID:37009414
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研究论文 | 本文详细描述了TSPEAR相关常染色体隐性外胚层发育不良14型的临床特征、遗传变异、流行病学、进化历史和功能机制 | 首次结合AlphaFold预测结构分析和单细胞RNA测序数据，揭示了TSPEAR蛋白在牙釉质结中的作用及其与wnt10a的相互作用 | 研究主要基于基因数据和模型动物，缺乏直接的人体功能验证 | 探讨TSPEAR在胚层发育中的作用及其相关疾病的机制 | TSPEAR基因及其相关的外胚层发育不良14型 | 遗传学 | 外胚层发育不良 | AlphaFold结构预测、单细胞RNA测序、基因组数据分析 | NA | 基因组数据、RNA测序数据 | 100000个基因组项目数据、多个群体的创始变异分析 |
| 9107 | 2024-09-16 |
Unraveling Psychiatric Disorders through Neural Single-Cell Transcriptomics Approaches
2023-03-22, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14030771
PMID:36981041
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综述 | 本文综述了通过单细胞和单核转录组技术揭示精神障碍分子和细胞异质性的最新进展 | 强调了非神经元细胞在精神障碍病理中的重要作用 | NA | 更新当前关于大脑转录组的发现，并探讨在抑郁症、压力、神经退行性疾病、精神分裂症、阿片类药物使用障碍以及酒精和精神兴奋剂滥用中识别的转录组改变的分子研究 | 人类和动物模型中的精神障碍 | 数字病理学 | 精神疾病 | 单细胞和单核转录组技术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 9108 | 2024-09-16 |
The cell type composition of the adult mouse brain revealed by single cell and spatial genomics
2023-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.06.531307
PMID:36945580
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研究论文 | 本文通过结合单核RNA测序和空间转录组学技术，构建了成年小鼠大脑中每个神经解剖结构的细胞类型图谱 | 首次全面揭示了成年小鼠大脑中各神经解剖结构的细胞类型组成，并开发了一个用于遗传访问每种细胞类型的框架 | NA | 构建成年小鼠大脑中每个神经解剖结构的细胞类型图谱 | 成年小鼠大脑中的细胞类型及其在神经解剖结构中的位置 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 整个小鼠大脑 |
| 9109 | 2024-09-16 |
Revealing the Heterogeneity of the Tumor Ecosystem of Cholangiocarcinoma through Single-Cell Transcriptomics
2023-03-10, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12060862
PMID:36980203
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综述 | 本文综述了通过单细胞转录组学揭示胆管癌肿瘤生态系统的异质性 | 利用单细胞RNA测序技术详细描述了肿瘤内基质和恶性细胞的异质性，提供了肿瘤和基质细胞（包括浸润性免疫细胞）的表型和功能多样性的新视角 | 讨论了当前研究中的局限性，并提出了未来的研究方向和潜在的临床应用 | 探讨胆管癌肿瘤生态系统中细胞成分的异质性及其相互作用 | 胆管癌肿瘤生态系统中的细胞异质性及其相互作用 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 9110 | 2024-09-16 |
Sensitive cluster-free differential expression testing
2023-Mar-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.08.531744
PMID:36945506
|
研究论文 | 本文介绍了一种无聚类的差异表达测试框架miloDE，用于单细胞RNA测序数据 | 提出了miloDE框架，通过利用单细胞数据的图表示法，将相对同质的相邻细胞分配到重叠的邻域中，从而避免了传统聚类方法的局限性 | NA | 开发一种新的方法来提高单细胞RNA测序数据中差异表达测试的敏感性和特异性 | 单细胞RNA测序数据中的差异表达基因 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括模拟数据和真实数据，真实数据涉及缺乏Tal1的嵌合小鼠胚胎和特发性肺纤维化患者中的巨噬细胞 |
| 9111 | 2024-09-16 |
A cellular taxonomy of the adult human spinal cord
2023-02-01, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.01.007
PMID:36731429
|
研究论文 | 本文通过单核RNA测序结合空间转录组学和抗体验证，对成人脊髓进行了细胞分类 | 首次对成人脊髓进行了详细的细胞分类，并发现了与肌萎缩侧索硬化症（ALS）相关的基因特征 | 研究主要集中在成人脊髓，未涉及其他年龄段或病理状态 | 揭示成人脊髓的细胞多样性及其在人类疾病中的作用 | 成人脊髓中的神经元和胶质细胞 | 数字病理学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单核RNA测序、空间转录组学、抗体验证 | NA | RNA序列 | 29个胶质细胞簇和35个神经元簇 |
| 9112 | 2024-09-16 |
Integrative network-based analysis on multiple Gene Expression Omnibus datasets identifies novel immune molecular markers implicated in non-alcoholic steatohepatitis
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1115890
PMID:37008925
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研究论文 | 本研究通过整合多个GEO数据集，利用网络生物学方法识别与非酒精性脂肪性肝炎（NASH）相关的新型免疫分子标记 | 首次通过整合多个GEO数据集，利用加权基因共表达网络分析（WGCNA）识别与NASH相关的免疫响应模块，并验证了关键基因在临床样本和NASH小鼠模型中的表达 | 研究依赖于公开的GEO数据集，可能存在数据质量和样本代表性的局限性 | 探索与非酒精性脂肪性肝炎（NASH）相关的新基因 | 非酒精性脂肪性肝炎（NASH）相关的基因和免疫分子标记 | 生物信息学 | 肝病 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | NA | 基因表达数据 | 五个独立的GEO数据集 |
| 9113 | 2024-09-16 |
Host cell maturation modulates parasite invasion and sexual differentiation in Plasmodium berghei
2022-04-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abm7348
PMID:35476438
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研究论文 | 本文研究了宿主细胞成熟对疟原虫入侵和性分化的影响 | 首次全面分析了宿主细胞成熟状态对疟原虫适应性的关键作用 | NA | 探讨宿主细胞成熟状态如何影响疟原虫的入侵和性分化 | 疟原虫在宿主红细胞中的复制和性分化过程 | NA | 疟疾 | 流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 9114 | 2024-09-16 |
Whole-animal multiplexed single-cell RNA-seq reveals transcriptional shifts across Clytia medusa cell types
2021-Nov-26, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abh1683
PMID:34826233
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研究论文 | 本文介绍了水螅水母的整个生物体的转录组细胞图谱，并描述了其组成细胞类型对扰动的响应 | 本文引入了高分辨率、全生物体、多重单细胞基因组学的工作流程，适用于其他传统或非传统模式生物 | NA | 研究水螅水母细胞类型对扰动的响应 | 水螅水母的细胞类型及其对扰动的响应 | 基因组学 | NA | 多重单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 多个水螅水母样本，包括对照和扰动条件 |
| 9115 | 2024-09-16 |
Macrophages orchestrate the expansion of a proangiogenic perivascular niche during cancer progression
2021-Nov-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abg9518
PMID:34730997
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研究论文 | 研究肿瘤相关巨噬细胞在癌症进展中调控血管周围微环境的作用 | 首次揭示了Lyve-1阳性巨噬细胞在维持血管周围间充质细胞群体中的关键作用，并阐明了其通过调控血小板衍生生长因子-CC依赖的血管周围间充质细胞扩增，促进血管生成微环境的形成 | 研究基于自发的小鼠乳腺腺癌模型，结果的临床转化性有待进一步验证 | 探讨肿瘤相关巨噬细胞在癌症进展中的作用机制 | 肿瘤相关巨噬细胞及其在血管生成中的作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自自发小鼠乳腺腺癌模型的肿瘤相关巨噬细胞样本 |
| 9116 | 2024-09-15 |
Spatial transcriptomics in pancreatic cancer: Advances, prospects and challenges
2024-Nov, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2024.104430
PMID:38942220
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综述 | 本文综述了空间转录组学在胰腺癌研究中的进展、前景和挑战 | 空间转录组学技术整合了细胞位置和全转录表达信息，提供了对胰腺癌微环境中细胞亚型时空变化的详细观察 | 空间转录组学技术在胰腺癌中的临床应用场景和技术局限性仍需进一步探索 | 探讨空间转录组学在胰腺癌研究中的应用及其对肿瘤异质性和免疫微环境的理解 | 胰腺癌中的肿瘤细胞、基质细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 9117 | 2024-09-15 |
A prognostic biomarker of disulfidptosis constructed by machine learning framework model as potential reporters of pancreatic adenocarcinoma
2024-Nov, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111371
PMID:39209222
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研究论文 | 本文通过机器学习框架模型构建了与胰腺腺癌相关的硫化物死亡的预后生物标志物 | 首次将硫化物死亡与胰腺腺癌的机制和免疫浸润模式联系起来，并构建了相关的预后模型 | 研究样本量较小，仅基于GSE154778 scRNA-seq数据集的16个样本进行分析 | 探索胰腺腺癌的机制和免疫浸润模式，并构建相关的预后生物标志物 | 胰腺腺癌患者的硫化物死亡相关基因和免疫浸润模式 | 数字病理学 | 胰腺癌 | LASSO回归 | LASSO回归模型 | 单细胞RNA测序数据 | 16个胰腺腺癌样本 |
| 9118 | 2024-09-15 |
Identification of gene and protein signatures associated with long-term effects of COVID-19 on the immune system after patient recovery by analyzing single-cell multi-omics data using a machine learning approach
2024-Oct-03, Vaccine
IF:4.5Q2
DOI:10.1016/j.vaccine.2024.126253
PMID:39182316
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研究论文 | 本文通过分析单细胞多组学数据，使用机器学习方法识别与COVID-19长期免疫效应相关的基因和蛋白质特征 | 首次结合单细胞多组学数据和多种机器学习算法，系统分析了COVID-19康复患者免疫系统的长期变化 | 研究样本量较小，且仅限于COVID-19康复患者和健康对照组，未来需扩大样本量和研究范围 | 探究COVID-19康复患者免疫系统的长期变化及其分子机制 | COVID-19康复患者和健康对照组的免疫细胞亚型及其多组学特征 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞多组学分析 | LASSO、MCFS、RF、CATBoost、XGBoost、决策树、k-近邻 | 单细胞RNA测序、表面蛋白、转录组 | COVID-19康复患者和健康对照组，具体数量未明确提及 |
| 9119 | 2024-09-15 |
Biomarker discovery in hepatocellular carcinoma (HCC) for personalized treatment and enhanced prognosis
2024-Oct, Cytokine & growth factor reviews
IF:9.3Q1
DOI:10.1016/j.cytogfr.2024.08.006
PMID:39191624
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研究论文 | 本文探讨了肝细胞癌（HCC）中生物标志物的发现及其在个性化治疗和预后改善中的应用 | 本文介绍了下一代测序（NGS）、质谱分析和液体活检等先进技术在HCC分子景观研究中的应用，并强调了免疫标志物如PD-L1表达和肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）在指导免疫治疗中的作用 | 本文指出生物标志物验证、标准化、临床实践整合和成本相关障碍等挑战 | 本文旨在通过发现生物标志物来解决HCC诊断和治疗中的挑战，以实现早期检测、精确诊断和个性化治疗 | 本文主要研究肝细胞癌（HCC）及其相关生物标志物 | 数字病理学 | 肝癌 | 下一代测序（NGS）、质谱分析、液体活检 | NA | NA | NA |
| 9120 | 2024-09-15 |
Exploring the role of KIR3DL2 on NK cells in hepatocellular carcinoma and its potential prognostic implications
2024-Sep-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110637
PMID:39262781
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研究论文 | 本研究探讨了KIR3DL2在肝细胞癌中对自然杀伤细胞的作用及其潜在的预后意义 | 首次通过单细胞测序分析了原发性和复发性肝细胞癌患者肿瘤及邻近组织中免疫细胞的数量和基因表达谱，揭示了KIR3DL2表达与NK细胞耗竭及预后的关系 | 研究样本量较小，需要进一步的大规模验证 | 识别肝细胞癌的预后分子标志物 | 肝细胞癌患者的肿瘤及邻近组织 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 原发性和复发性肝细胞癌患者的肿瘤及邻近组织样本 |