单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
9101	2024-09-05	Coronary blood vessels from distinct origins converge to equivalent states during mouse and human development 2021-12-15, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.70246 PMID:34910626	研究论文	本文通过结合谱系追踪和单细胞RNA测序技术，研究了小鼠和人类心脏冠状血管在发育过程中的转录状态和功能差异	首次揭示了冠状血管内皮细胞在发育过程中转录异质性的变化，以及这种异质性如何受谱系和位置的影响	研究主要集中在小鼠和人类胚胎及成年心脏的冠状血管，未涉及其他物种或发育阶段	探讨冠状血管内皮细胞在发育过程中的转录状态和功能差异	小鼠和人类心脏冠状血管内皮细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	胚胎和成年小鼠心脏以及人类发育中的冠状血管样本
9102	2024-09-05	Human and rat skeletal muscle single-nuclei multi-omic integrative analyses nominate causal cell types, regulatory elements, and SNPs for complex traits 2021-Dec, Genome research IF:6.2Q1 DOI:10.1101/gr.268482.120 PMID:34815310	研究论文	本文优化了单核ATAC-seq和单核RNA-seq技术，对人和大鼠的骨骼肌细胞进行了多组学整合分析，识别了与复杂性状相关的细胞类型、调控元件和SNPs	本文首次使用单核ATAC-seq和单核RNA-seq技术，成功捕获了I型和II型肌纤维特征，并进行了跨模态和跨物种的整合分析	NA	研究骨骼肌细胞的细胞特异性染色质可及性和转录组，以及与复杂性状相关的遗传变异	人和大鼠的骨骼肌细胞	数字病理学	糖尿病	单核ATAC-seq, 单核RNA-seq	回归模型	基因表达数据, 染色质可及性数据	33,862个细胞核
9103	2024-09-04	Liquid Biopsy for Proliferative Diabetic Retinopathy: Single-Cell Transcriptomics of Human Vitreous Reveals Inflammatory T-Cell Signature 2024 Nov-Dec, Ophthalmology science IF:3.2Q1 DOI:10.1016/j.xops.2024.100539 PMID:39220810	研究论文	本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了增生性糖尿病视网膜病变（PDR）患者玻璃体中的炎症T细胞特征。	首次在疾病状态下对人类玻璃体进行单细胞转录组学表征，展示了PDR玻璃体主要由T细胞组成，其活性和比例与外周血中的T细胞不同，且玻璃体中几乎没有中性粒细胞。	NA	旨在通过阐明PDR患者玻璃体的单细胞景观，识别可靶向的细胞类型和相应的信号通路。	增生性糖尿病视网膜病变（PDR）患者的玻璃体和外周血。	数字病理学	糖尿病视网膜病变	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组	5名成年患者的6只眼睛的玻璃体细胞和外周血单个核细胞（PBMCs）。
9104	2024-09-04	SCG2 mediates blood-brain barrier dysfunction and schizophrenia-like behaviors after traumatic brain injury 2024-Sep-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.202401117R PMID:39225388	研究论文	研究通过单细胞RNA测序评估创伤性脑损伤后额叶皮层细胞的转录变化，并探讨了SCG2在TBI诱发的精神分裂症中的介导作用及其机制。	首次揭示了SCG2通过CypA-MMP-9信号通路触发血脑屏障破坏，并提供了治疗TBI后精神障碍的新疗法。	NA	探究创伤性脑损伤后神经功能障碍的机制及其与精神分裂症样行为的关系。	创伤性脑损伤后的额叶皮层细胞及SCG2的作用。	神经科学	精神分裂症	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	具体样本数量未在摘要中提及
9105	2024-09-04	Single-cell transcriptomics reveals tumor-infiltrating B cell function after neoadjuvant pembrolizumab and chemotherapy in non-small cell lung cancer 2024-Sep-02, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2 DOI:10.1093/jleuko/qiad138 PMID:37931147	研究论文	本研究通过单细胞转录组测序分析了12名III期非小细胞肺癌患者的免疫细胞，探讨了新辅助化疗免疫治疗后B细胞亚型及其功能	首次详细探讨了肿瘤浸润B细胞在非小细胞肺癌中的抗肿瘤作用及其与新辅助化疗免疫治疗效果的关系	研究样本量有限，且仅限于III期非小细胞肺癌患者	探讨非小细胞肺癌中新辅助化疗免疫治疗后B细胞亚型及其功能	III期非小细胞肺癌患者的免疫细胞	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	12名III期非小细胞肺癌患者
9106	2024-09-04	Characteristics and functions of an atypical inflammation-associated GZMK+GZMB+CD8+ T subset in people living with HIV-1 2024-Sep, Molecular immunology IF:3.2Q3 DOI:10.1016/j.molimm.2024.07.003 PMID:39053388	research paper	本研究通过分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）和匹配的T细胞受体序列（TCR）数据，深入探讨了HIV-1感染者中GZMKCD8 T细胞的特征及其与疾病的相关性	发现了HIV-1感染者中GZMKCD8 T细胞的异质性，并进一步细分为GZMKGZMB子集和GZMKGZMB子集，后者在HIV-1感染者中显著富集	NA	探讨HIV-1感染者中GZMKCD8 T细胞的表型和功能特征及其与疾病的相关性	HIV-1感染者中的GZMKCD8 T细胞	免疫学	HIV-1感染	单细胞RNA测序（scRNA-seq），流式细胞术	NA	单细胞RNA测序数据	NA
9107	2024-09-04	Unraveling flavivirus pathogenesis: from bulk to single-cell RNA-sequencing strategies 2024-Sep-01, The Korean journal of physiology & pharmacology : official journal of the Korean Physiological Society and the Korean Society of Pharmacology DOI:10.4196/kjpp.2024.28.5.403 PMID:39198221	综述	本文综述了从批量到单细胞RNA测序策略在解析黄病毒发病机制中的应用	介绍了病毒包含的单细胞RNA测序（viscRNA-seq）这一创新技术，解决了非多聚腺苷酸黄病毒基因组带来的挑战	NA	探讨RNA测序技术在细胞系实验和黄病毒感染患者研究中的应用，加速有效诊断和治疗的发展	黄病毒及其与宿主的相互作用	生物信息学	NA	RNA测序（RNA-seq）	NA	转录组数据	NA
9108	2024-09-04	Hydatidiform mole identification using non-invasive single-cell sequencing of fetal circulating extravillous trophoblasts isolated from maternal blood 2024-Sep, Ultrasound in obstetrics & gynecology : the official journal of the International Society of Ultrasound in Obstetrics and Gynecology IF:6.1Q1 DOI:10.1002/uog.27615 PMID:38354218	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
9109	2024-09-04	Exploring the potential mechanisms of Rehmannia glutinosa in treating sepsis based on network pharmacology 2024-Aug-31, BMC infectious diseases IF:3.4Q2 DOI:10.1186/s12879-024-09796-x PMID:39217296	研究论文	本研究利用网络药理学方法探索地黄在治疗脓毒症中的潜在作用机制	通过RNA测序、蛋白质-蛋白质相互作用网络构建、分子对接和分子动力学模拟等技术，全面分析了地黄的活性成分及其在脓毒症治疗中的潜在靶点和机制	NA	探索地黄在治疗脓毒症中的作用机制	地黄的活性成分及其在脓毒症治疗中的潜在靶点和机制	药物学	脓毒症	RNA测序、分子对接、分子动力学模拟	NA	RNA序列数据	23名脓毒症患者和10名健康个体的外周血样本
9110	2024-09-04	Microglia LILRB4 upregulation reduces brain damage after acute ischemic stroke by limiting CD8+ T cell recruitment 2024-Aug-31, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1 DOI:10.1186/s12974-024-03206-4 PMID:39217343	研究论文	本研究探讨了微胶质细胞中LILRB4上调通过限制CD8+ T细胞招募减少急性缺血性卒中后脑损伤的作用及其机制	首次揭示了LILRB4在微胶质细胞中通过调节CD8+ T细胞浸润和激活在卒中后免疫反应中的关键作用	研究仅在动物模型中进行，尚未在人类中验证	研究LILRB4在急性缺血性卒中后调节免疫反应及其对脑损伤的保护作用	微胶质细胞中的LILRB4及其对CD8+ T细胞招募的影响	神经科学	卒中	空间转录组学分析、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、免疫荧光染色	NA	转录组数据	使用LILRB4条件性敲除(LILRB4-KO)和过表达转基因(LILRB4-TG)小鼠进行研究
9111	2024-09-04	Single-cell sequencing reveals glial cell involvement in development of neuropathic pain via myelin sheath lesion formation in the spinal cord 2024-Aug-31, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1 DOI:10.1186/s12974-024-03207-3 PMID:39217340	研究论文	本研究通过单细胞测序技术揭示了脊髓中的少突胶质细胞在神经病理性疼痛发展中的作用及其与髓鞘损伤的关系	首次详细描述了少突胶质细胞在神经病理性疼痛发展中的作用及其与其他胶质细胞的相互作用，并提出了潜在的治疗靶点	研究仅在 mice 模型上进行，结果的普遍性和临床应用尚需进一步验证	探索神经病理性疼痛发展中少突胶质细胞的功能及其与其他胶质细胞的相互作用	少突胶质细胞、小胶质细胞和星形胶质细胞在神经病理性疼痛中的作用	数字病理学	神经病理性疼痛	单细胞测序	NA	细胞	使用慢性束缚损伤（CCI）模型的小鼠脊髓组织
9112	2024-09-04	V1bR enhances glucose-stimulated insulin secretion by paracrine production of glucagon which activates GLP-1 receptor 2024-Aug-31, Cell & bioscience DOI:10.1186/s13578-024-01288-4 PMID:39217353	研究论文	本研究探讨了精氨酸加压素（AVP）及其受体V1bR对胰岛素分泌和血糖稳态的调节机制	发现AVP通过V1bR激活α细胞分泌胰高血糖素，进而通过旁分泌方式激活β细胞上的GLP-1R，促进葡萄糖依赖的胰岛素分泌	研究未详细说明AVP对胰岛素分泌的具体分子机制	揭示AVP/V1bR与胰高血糖素/GLP-1R之间的相互作用，为开发新的血糖控制疗法提供机制基础	精氨酸加压素（AVP）、V1bR受体、α细胞和β细胞	NA	NA	单细胞转录组分析	NA	转录组数据	未具体说明样本数量
9113	2024-09-04	Dynamic upregulation of retinoic acid signal in the early postnatal murine heart promotes cardiomyocyte cell cycle exit and maturation 2024-08-30, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-70918-1 PMID:39215116	研究论文	本文研究了新生小鼠心脏中视黄酸信号的动态上调如何促进心肌细胞退出细胞周期并成熟	首次揭示了新生期心脏中心肌细胞成熟过程中视黄酸信号的作用	NA	探讨视黄酸信号在新生期心脏发育中对心肌细胞增殖和成熟的影响	新生小鼠心脏中的心肌细胞和心脏成纤维细胞	NA	NA	单细胞转录组分析、免疫组织化学、RNA测序	NA	mRNA表达数据	新生小鼠和新生大鼠的心肌细胞及人类心肌细胞
9114	2024-09-04	Novel insights into vancomycin-loaded calcium sulfate and negative pressure wound therapy in preventing infections in open fractures 2024-Aug-29, Journal of orthopaedic surgery and research IF:2.8Q1 DOI:10.1186/s13018-024-04931-5 PMID:39198853	研究论文	本研究探讨了万古霉素负载硫酸钙（VLCS）和负压伤口疗法（NPWT）在开放性骨折中预防感染的作用，并评估了它们对巨噬细胞行为的影响。	研究发现VLCS和NPWT能够促进巨噬细胞向M2极化，增强感染抵抗力和愈合效果，尤其是在联合使用时效果更佳。	NA	研究VLCS和NPWT在开放性骨折中预防感染的效果及其对巨噬细胞行为的影响。	开放性骨折患者的巨噬细胞行为及其在VLCS和NPWT治疗下的变化。	数字病理学	创伤	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	开放性骨折患者的巨噬细胞样本
9115	2024-09-04	Single-cell transcriptome sequencing reveals altered peripheral blood immune cells in patients with severe tuberculosis 2024-Aug-29, European journal of medical research IF:2.8Q2 DOI:10.1186/s40001-024-01991-5 PMID:39198909	研究论文	本研究通过单细胞转录组测序揭示了严重结核病患者外周血免疫细胞的变化	首次详细描述了不同阶段结核感染中循环细胞亚群的特征和功能，特别是严重结核病患者中CD8+ T细胞的高交互强度	研究仅限于外周血免疫细胞的分析，未涉及其他组织或器官的免疫细胞变化	探讨结核病患者外周血免疫细胞的变化及其对疾病严重程度的影响	健康捐赠者、轻度结核病患者和严重结核病患者的外周血免疫细胞	数字病理学	结核病	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	包括健康捐赠者、轻度结核病患者和严重结核病患者的外周血免疫细胞样本
9116	2024-09-04	Investigating the role of senescence biomarkers in colorectal cancer heterogeneity by bulk and single-cell RNA sequencing 2024-08-29, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-70300-1 PMID:39209895	研究论文	本研究通过批量和单细胞RNA测序探讨了细胞衰老标志物在结直肠癌异质性中的作用	开发了一个与衰老相关的模型来计算衰老相关评分，全面探索每个结直肠癌样本的异质性，并通过单细胞分析和免疫荧光染色验证了不同衰老相关模型基因富集组间的免疫细胞浸润差异	NA	探索细胞衰老对结直肠癌预后、肿瘤微环境和治疗的影响	结直肠癌样本的异质性和细胞衰老标志物	数字病理学	结直肠癌	RNA测序	NA	RNA	多个结直肠癌样本
9117	2024-09-04	Bioinformatic analysis reveals the relationship between macrophage infiltration and Cybb downregulation in hyperoxia-induced bronchopulmonary dysplasia 2024-08-29, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-70877-7 PMID:39209930	研究论文	本研究通过生物信息学分析探讨了巨噬细胞浸润与Cybb下调在超氧诱导的支气管肺发育不良中的关系	首次揭示了Cybb下调与巨噬细胞浸润在支气管肺发育不良中的密切关系，并通过细胞间相互作用分析探索了潜在的信号通路	研究主要基于mRNA-seq和scRNA-seq数据集，需要在更多样本和实验中进一步验证	探索支气管肺发育不良的免疫特征及其相关基因	支气管肺发育不良中的免疫细胞类型及相关基因	生物信息学	支气管肺发育不良	mRNA-seq, scRNA-seq	NA	基因表达数据	使用GSE25286和GSE209664数据集，具体样本数量未详细说明
9118	2024-09-04	Convergent alterations in the tumor microenvironment of MYC-driven human and murine prostate cancer 2024-Aug-28, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-51450-2 PMID:39198404	研究论文	本文通过单细胞RNA测序和分子病理学研究，探讨了MYC驱动的肿瘤微环境在人类和小鼠前列腺癌中的变化	首次通过单细胞RNA测序和分子病理学方法，系统地研究了MYC信号在人类和小鼠前列腺癌肿瘤微环境中的作用	由于无法在人类组织中进行疾病的纵向研究，部分研究结果受限	揭示前列腺癌细胞及其前体如何通过改变肿瘤微环境来驱动前列腺癌进展	人类和小鼠的前列腺癌肿瘤微环境	数字病理学	前列腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	涉及人类和小鼠的前列腺癌组织
9119	2024-09-04	GSDMD-Dependent Neutrophil Extracellular Traps Mediate Portal Vein Thrombosis and Associated Fibrosis in Cirrhosis 2024-Aug-22, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms25169099 PMID:39201786	研究论文	本研究通过两步法全门静脉结扎在健康和硫代乙酰胺（TAA）诱导的肝硬化大鼠中建立了一种新的门静脉血栓（PVT）模型，并探讨了中性粒细胞外陷阱（NETs）在肝硬化PVT及其相关纤维化中的作用机制。	本研究首次验证了NETs通过促进巨噬细胞-肌成纤维细胞转化（MMT）介导肝硬化PVT及其相关纤维化，并发现GSDMD抑制剂disulfiram可抑制肝硬化PVT并预防相关纤维化。	NA	研究肝硬化门静脉血栓（PVT）的自然病程和机制。	肝硬化患者循环和肝脏浸润的中性粒细胞，以及肝硬化大鼠模型。	NA	肝硬化	多重免疫荧光和单细胞测序	NA	NA	健康和硫代乙酰胺（TAA）诱导的肝硬化大鼠
9120	2024-09-04	Disturbance of Immune Microenvironment in Androgenetic Alopecia through Spatial Transcriptomics 2024-Aug-20, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms25169031 PMID:39201715	研究论文	本研究通过空间转录组学技术探讨了雄激素性脱发（AGA）中围绕毛囊上段主要部分——漏斗部的免疫细胞浸润（PII）的免疫干扰模式	采用空间转录组学这一高通量分析技术，详细分析了PII区域的免疫干扰，包括免疫浸润评估、基因集富集分析、细胞解卷积、差异表达分析等	NA	揭示雄激素性脱发中免疫微环境的精确干扰模式	雄激素性脱发患者的毛囊上段免疫细胞浸润	数字病理学	雄激素性脱发	空间转录组学	NA	转录组数据	具体样本数量未在摘要中提及