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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 9081 - 9100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9081 | 2025-10-07 |
Integrating Prior Knowledge Using Transformer for Gene Regulatory Network Inference
2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202409990
PMID:39605181
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研究论文 | 提出一种基于Transformer的基因调控网络推断框架GRNPT，整合大型语言模型和时序卷积网络自编码器 | 首次将大型语言模型嵌入与scRNA-seq轨迹数据结合，能够预测未见细胞类型和调控因子的调控关系 | NA | 开发更准确和通用的基因调控网络推断方法 | 基因调控网络 | 自然语言处理, 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Transformer, 大型语言模型, 时序卷积网络自编码器 | 基因表达数据, 文本数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9082 | 2025-10-07 |
Accurate Spatial Heterogeneity Dissection and Gene Regulation Interpretation for Spatial Transcriptomics using Dual Graph Contrastive Learning
2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202410081
PMID:39605202
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研究论文 | 开发了一种名为stDCL的双图对比学习方法，用于空间转录组数据的空间域识别和基因调控解释 | 提出双图对比学习框架，同时捕捉空间结构和基因调控信息，实现高精度的空间异质性解析 | NA | 准确解析空间转录组数据的空间异质性并解释基因调控机制 | 空间转录组数据，包括复杂皮层数据集和阿尔茨海默病相关星形胶质细胞亚型 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 图对比学习，图嵌入自编码器 | 双图对比学习，图嵌入自编码器 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9083 | 2025-10-07 |
Qingfei Yin alleviates Streptococcus pneumoniae pneumonia by promoting complete autophagy to suppress necroptosis
2025-Jan, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2024.156280
PMID:39637472
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研究论文 | 本研究探讨清肺饮通过促进完全自噬抑制坏死性凋亡缓解肺炎链球菌肺炎的作用机制 | 首次结合单细胞转录组学揭示清肺饮通过下调p62表达促进完全自噬进而抑制坏死性凋亡的新机制 | 研究主要聚焦肺上皮细胞，其他细胞类型的作用尚未深入探讨 | 探究清肺饮治疗肺炎链球菌肺炎的分子机制 | 肺炎链球菌感染的小鼠模型和TC-1小鼠肺上皮细胞 | 单细胞转录组学 | 肺炎 | 单细胞转录组测序, 蛋白质印迹, 免疫荧光, 吖啶橙染色, 碘化丙啶染色 | 动物模型, 细胞模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 图像数据 | 113,353个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9084 | 2025-10-07 |
Matrix glycosaminoglycans and proteoglycans in human cornea organoids and similarities with fetal corneal stages
2025-Jan, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2024.11.007
PMID:39615587
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组织化学分析，比较了人角膜类器官与胎儿角膜发育阶段的糖胺聚糖和蛋白聚糖表达模式 | 首次系统比较人角膜类器官与不同发育阶段胎儿角膜的糖胺聚糖沉积模式，并评估类器官的成熟度 | 类器官仍表现出不成熟组织的特征，糖胺聚糖沉积模式与成熟角膜存在差异 | 评估人角膜类器官的发育成熟度及其与胎儿角膜发育阶段的相似性 | 人角膜类器官和胎儿角膜组织 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, MetaNeighbor分析 | NA | 基因表达数据, 组织切片图像 | 两个iPSC细胞系(IMR90.4和NCRM-1)衍生的角膜类器官，以及不同发育阶段的胎儿角膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9085 | 2025-10-07 |
Harnessing machine learning and multi-omics to explore tumor evolutionary characteristics and the role of AMOTL1 in prostate cancer
2025-Jan, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.138402
PMID:39643184
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研究论文 | 本研究结合机器学习和多组学技术探索前列腺癌的肿瘤进化特征及AMOTL1基因的作用 | 开发了肿瘤进化特征预测指标TECPI，在预后预测和疗效指导方面优于传统临床预测因子和81个已发表模型 | NA | 探索前列腺癌肿瘤进化特征及其在精准医疗中的应用 | 前列腺癌肿瘤细胞 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞测序, bulk RNA测序, 多组学整合分析 | 机器学习 | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 9086 | 2025-10-07 |
PPARα agonist ameliorates cholestatic liver injury by regulating hepatic macrophage homeostasis
2025-Jan, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.138510
PMID:39647740
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研究论文 | 本研究探讨PPARα激动剂通过调节肝脏巨噬细胞稳态改善胆汁淤积性肝损伤的免疫调控机制 | 首次结合CyTOF和单细胞RNA测序技术揭示PPARα激动剂通过调节巨噬细胞发育轨迹和极化状态改善胆汁淤积性肝损伤 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 阐明PPARα激动剂改善胆汁淤积性肝损伤的免疫调控机制 | 胆汁淤积小鼠模型中的肝脏巨噬细胞和免疫细胞 | 免疫学 | 胆汁淤积性肝病 | CyTOF, scRNA-seq | NA | 单细胞蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | 胆汁淤积小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 9087 | 2025-10-07 |
Expansion of peripheral cytotoxic CD4+ T cells in Alzheimer's disease: New insights from multi-omics evidence
2025-Jan, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2024.110976
PMID:39657893
|
研究论文 | 通过多组学证据揭示阿尔茨海默病患者外周血中细胞毒性CD4+T细胞的扩增现象及其机制 | 首次在阿尔茨海默病患者外周血中发现CD4细胞毒性T细胞的显著扩增，并鉴定出关键转录因子TBX21和MYBL1以及风险基因SRGN和ITGB1 | 研究主要聚焦于外周血单核细胞，未深入探讨中枢神经系统的免疫反应 | 探究阿尔茨海默病中适应性免疫反应的作用机制 | 阿尔茨海默病患者的外周血单核细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 阿尔茨海默病患者外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9088 | 2025-10-07 |
Control of Cellular Differentiation Trajectories for Cancer Reversion
2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202402132
PMID:39661721
|
研究论文 | 提出单细胞布尔网络推断与控制计算框架，识别分化轨迹主调控因子并实现结直肠癌细胞向正常肠上皮细胞逆转 | 开发BENEIN计算框架首次系统识别分化轨迹主调控因子，并通过联合抑制实现癌细胞表型逆转 | 仅针对人类大肠单细胞转录组数据验证，未涉及其他癌症类型或组织 | 识别细胞分化轨迹关键调控因子并探索癌细胞表型逆转策略 | 人类大肠单细胞转录组数据和结直肠癌细胞 | 计算生物学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序 | 布尔网络模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9089 | 2025-10-07 |
Identification of core immune-related genes CTSK, C3, and IFITM1 for diagnosing Helicobacter pylori infection-associated gastric cancer through transcriptomic analysis
2025-Jan, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.138645
PMID:39667460
|
研究论文 | 通过转录组分析鉴定与幽门螺杆菌感染相关胃癌诊断的核心免疫相关基因CTSK、C3和IFITM1 | 首次整合差异表达基因分析、WGCNA和随机森林模型识别出CTSK、C3和IFITM1作为幽门螺杆菌相关胃癌的关键诊断标志物 | 研究基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 识别幽门螺杆菌感染导致胃癌的诊断基因和相关机制 | 幽门螺杆菌感染相关胃癌患者的基因表达数据 | 生物信息学 | 胃癌 | 转录组分析, 单细胞RNA测序, 随机森林模型 | 随机森林 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的多个数据集 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9090 | 2025-10-07 |
Cholesterol restriction primes antiviral innate immunity via SREBP1-driven noncanonical type I IFNs
2025-Jan, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-024-00346-9
PMID:39668245
|
研究论文 | 本研究揭示了胆固醇限制通过SREBP1驱动的非经典I型干扰素增强抗病毒天然免疫的机制 | 首次发现胆固醇合成限制通过SREBP1转录因子诱导非经典I型干扰素（如IFN-ω）表达，从而增强RIG-I介导的抗病毒信号通路 | 研究主要关注特定细胞类型，在人类临床应用的转化价值需要进一步验证 | 探究胆固醇代谢与天然免疫应答之间的分子机制联系 | 细胞系、小鼠模型、肺泡巨噬细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 化学筛选、单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型和特定细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9091 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing unveils dynamic transcriptional profiles during the process of donkey spermatogenesis and maturation
2025-Jan, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2024.110974
PMID:39694081
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了驴精子发生和成熟过程中的动态转录谱 | 首次在驴中构建了精子发生和成熟过程的单细胞转录图谱，鉴定了特定生殖细胞和附睾主细胞的标志基因 | 未在摘要中明确提及研究局限性 | 提供驴精子发生和成熟的全面单细胞景观分析 | 驴睾丸和附睾组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未在摘要中明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9092 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity of myofibroblasts in wound repair
2025-Jan, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2024.110982
PMID:39706310
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示伤口修复中肌成纤维细胞的异质性 | 首次在皮肤溃疡、瘢痕疙瘩和正常疤痕中系统鉴定出13个细胞簇和11个肌成纤维细胞亚群，发现溃疡中特异性富集的亚群1具有独特的分子特征 | 样本来源仅限于皮肤伤口，未涉及其他组织类型的伤口修复研究 | 探究不同伤口愈合场景下肌成纤维细胞的多样性特征 | 皮肤溃疡、瘢痕疙瘩和正常疤痕组织 | 单细胞组学 | 皮肤伤口愈合障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 89,148个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9093 | 2025-10-07 |
SuperSpot: coarse graining spatial transcriptomics data into metaspots
2024-Dec-26, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae734
PMID:39657949
|
研究论文 | 提出一种名为SuperSpot的工作流程，将空间转录组学数据中的相邻且转录组相似的spots聚合成metaspots | 基于metacell概念，首次提出将空间邻近性和转录组相似性结合的空间spots聚合方法 | NA | 减少空间转录组数据的规模和稀疏性，促进大型数据集分析 | 空间转录组学数据中的spots（细胞或区域） | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 图神经网络，层次聚类 | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | VisiumHD | NA |
| 9094 | 2025-10-07 |
Scope+: an open source generalizable architecture for single-cell RNA-seq atlases at sample and cell levels
2024-Dec-26, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae727
PMID:39705183
|
研究论文 | 提出了一种名为Scope+的开源通用架构，用于单细胞RNA测序图谱在样本和细胞级别的快速访问和元分析 | 开发了首个支持细胞级别元分析的开源单细胞图谱架构，采用细胞为单元的数据建模、创新的数据库优化技术和软件架构设计 | 目前主要应用于COVID-19血液和免疫细胞数据，在其他疾病和组织类型中的通用性需要进一步验证 | 解决大规模单细胞RNA测序图谱数据难以快速访问和进行元分析的问题 | 单细胞RNA测序图谱数据，特别是COVID-19相关的血液和免疫细胞 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 500万个COVID-19血液和免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9095 | 2025-10-07 |
Metalloproteinase inhibitors regulate biliary progenitor cells through sDLK1 in organoid models of liver injury
2024-Dec-19, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI164997
PMID:39699962
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研究论文 | 本研究通过器官样模型揭示金属蛋白酶抑制剂通过sDLK1调控胆道祖细胞在肝损伤中的作用机制 | 首次发现TIMP/ADAM/NOTCH/DLK1轴在肝祖细胞维持和胆管细胞分化中的调控作用 | 研究主要基于动物模型和器官样模型，尚未在人体内验证 | 探索肝损伤中胆道祖细胞的命运调控机制 | 肝祖细胞、胆管细胞、门静脉间充质细胞 | 细胞生物学 | 肝病 | 单细胞RNA测序、RNAscope、器官样培养 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 小鼠模型和患者来源的肝器官样 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9096 | 2025-10-07 |
Highly neurogenic glia from human and mouse myenteric ganglia generate functional neurons following culture and transplantation into the gut
2024-11-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114919
PMID:39471175
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研究论文 | 本研究开发了从人和小鼠肠肌层神经节中分离高神经源性肠神经干细胞的方法，并验证了其移植后生成功能性神经元的能力 | 首次发现肠肌层神经节内的胶质细胞亚群是具有高神经源性潜能的肠神经干细胞库，并建立了选择性分离这些细胞的新方法 | 研究主要基于动物模型和异种移植实验，人类临床应用仍需进一步验证 | 开发更有效的肠神经干细胞分离方法，用于神经肠道疾病的再生治疗 | 人和小鼠肠肌层神经节中的肠胶质细胞 | 干细胞与再生医学 | 神经肠道疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 多组学分析, 光遗传学刺激 | NA | 基因表达数据, 生理功能数据 | 人和小鼠肠道组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9097 | 2025-10-07 |
Resident Synovial Macrophages in Synovial Fluid: Implications for Immunoregulation in Infectious and Inflammatory Arthritis
2024-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.29.560183
PMID:37873090
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研究论文 | 本研究通过鉴定滑膜液中定居滑膜巨噬细胞的特征，揭示其在感染性和炎症性关节炎中的免疫调节作用 | 首次在滑膜液中鉴定出CD14dim/OPG+/ZO-1+的定居滑膜巨噬细胞群体，并证明其迁移能力和M2极化特征 | 样本量有限，主要针对未分化关节炎患者，需要更大规模研究验证 | 探究定居滑膜巨噬细胞在关节炎发病机制中的免疫调节功能 | 人类关节炎患者的滑膜液和外周血样本 | 免疫学 | 关节炎 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, ELISA, 迁移实验 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | 多名未分化关节炎患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9098 | 2025-10-07 |
Identifying similar populations across independent single cell studies without data integration
2025-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf042
PMID:40276039
|
研究论文 | 提出一种无需数据整合即可量化独立单细胞研究间细胞群相似性的统计方法 | 开发了无需数据校正或整合即可跨数据集比较细胞群相似性的新方法，避免了信息丢失和人为误差 | NA | 开发跨独立单细胞研究识别相似细胞群体的计算方法 | 单细胞数据中的细胞群体 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 单细胞蛋白质组学 | 统计方法 | 单细胞多组学数据 | 成年小鼠运动皮层和脊髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 9099 | 2025-10-07 |
Metabolic alterations and immune heterogeneity in gastric cancer metastasis
2025-May-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112296
PMID:40276776
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了胃癌转移过程中的代谢重编程和免疫异质性 | 首次发现线粒体ATP合成酶亚基ATP5MC2在胃癌早期转移中的独特改变，并构建了胃癌转移的单细胞图谱 | 样本量相对有限（11个胃癌样本和8个转移灶），需要更大规模验证 | 探究胃癌转移过程中的代谢改变和免疫异质性机制 | 胃癌组织样本和转移病灶 | 单细胞测序分析 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 19个样本（11个胃癌原发灶和8个转移灶），共92,842个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9100 | 2025-10-07 |
Integration of Single-Cell and Spatial Transcriptomic Data Reveals Spatial Architecture and Potential Biomarkers in Alzheimer's Disease
2025-May, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-024-04617-3
PMID:39543008
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研究论文 | 本研究整合单细胞和空间转录组数据，揭示阿尔茨海默病患者前额叶皮层的空间结构和潜在生物标志物 | 首次整合多个单细胞RNA测序数据集构建AD患者前额叶皮层的空间架构，发现少突胶质细胞亚型在疾病中的新作用并鉴定出潜在血液生物标志物PLXDC2 | 研究样本数量有限，主要关注前额叶皮层区域，需要更多独立队列验证生物标志物的临床应用价值 | 揭示阿尔茨海默病患者前额叶皮层的细胞组成、空间结构和分子特征 | 正常对照和阿尔茨海默病患者的脑组织样本 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 微阵列 | CARD工具, 无监督聚类 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 微阵列数据 | 8个单细胞RNA测序数据集（包含正常对照和AD患者） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |