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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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9061 | 2025-10-07 |
Activation of STAT6 in Intestinal Epithelial Cells Predisposes to Gut Inflammation
2025-Feb, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202451394
PMID:39670708
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研究论文 | 本研究通过构建肠道上皮细胞STAT6持续激活的小鼠模型,揭示了STAT6信号通路在肠道炎症发生中的关键作用 | 首次在肠道上皮细胞中特异性研究STAT6激活对肠道炎症的影响,并发现其通过调控未折叠蛋白反应、MTORC和MYC信号通路等机制加剧结肠炎 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据的验证相对有限 | 探究STAT6在肠道上皮细胞中的激活对肠道炎症的调控机制 | VillinCre_STAT6vt转基因小鼠和人类IBD患者队列 | 分子生物学 | 炎症性肠病 | RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 转基因小鼠模型和人类IBD患者队列 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
9062 | 2025-10-07 |
iFlpMosaics enable the multispectral barcoding and high-throughput comparative analysis of mutant and wild-type cells
2025-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02534-w
PMID:39672980
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研究论文 | 介绍iFlpMosaics工具包,用于在相同组织微环境中实现突变型和野生型细胞的多光谱标记与高通量比较分析 | 开发了能够实现比率依赖性诱导和单细胞克隆追踪的新遗传工具,可在同一时间窗口和组织微环境中同时标记多种荧光标记的野生型和Cre突变细胞 | NA | 更准确地理解诱导基因突变如何影响组织发育、稳态和疾病过程中的单细胞生物学 | 小鼠遗传嵌合体中的突变型和野生型细胞 | 遗传学 | NA | 多光谱成像、荧光激活流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 图像、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9063 | 2025-10-07 |
Prevention of Intrauterine Adhesion with Platelet-Rich Plasma Double-Network Hydrogel
2025-Feb, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400336
PMID:39673358
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研究论文 | 研究富血小板血浆双网络水凝胶预防宫腔粘连的效果及机制 | 开发了基于海藻酸钠的PRP双网络水凝胶,通过蛋盒离子交联和纤维蛋白双网络结构增强治疗效果 | 未明确说明研究样本量及临床转化时间表 | 探索新型水凝胶材料对宫腔粘连的预防和治疗效果 | 宫腔粘连患者子宫内膜组织 | 组织工程与再生医学 | 宫腔粘连 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9064 | 2025-10-07 |
Dissecting the cellular reprogramming and tumor microenvironment in left- and right-sided Colorectal Cancer by single cell RNA sequencing
2025-Feb, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2024.12.002
PMID:39675521
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析左右侧结直肠癌的细胞重编程和肿瘤微环境差异 | 首次在单细胞水平系统比较左右侧结直肠癌的肿瘤微环境特征和细胞间相互作用 | 使用公共数据库数据,样本来源可能存在异质性 | 解析左右侧结直肠癌肿瘤微环境的细胞组成和功能差异 | 结直肠癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 55个结直肠癌样本中的126,279个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9065 | 2025-10-07 |
SYISL Knockout Promotes Embryonic Muscle Development of Offspring by Modulating Maternal Gut Microbiota and Fetal Myogenic Cell Dynamics
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202410953
PMID:39680624
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研究论文 | 本研究揭示SYISL基因敲除通过调节母体肠道微生物群和胎儿肌源性细胞动态促进胚胎肌肉发育的机制 | 首次发现SYISL通过母体肠道微生物-丁酸-HDAC-H3K9ac/H3K27ac通路和独立于组蛋白乙酰化的肌源性细胞动态调控双重途径影响胚胎肌肉发育 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类或其他物种中验证 | 探究SYISL基因敲除促进胚胎肌肉发育的分子机制 | 小鼠胚胎肌肉组织和母体肠道微生物群 | 发育生物学 | 肌肉疾病 | RNA-seq, ChIP-seq, scRNA-seq, 粪便微生物移植 | 基因敲除小鼠模型 | 基因组学数据,单细胞转录组数据 | 野生型和SYISL敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq, 染色质免疫沉淀测序, 转录组测序 | NA | NA |
9066 | 2025-10-07 |
Mesenchymal Stem Cells Prevent SLC39A14-Dependent Hepatocyte Ferroptosis through Exosomal miR-16-5p in Liver Graft
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202411380
PMID:39680749
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研究论文 | 本研究揭示了间充质干细胞通过外泌体miR-16-5p抑制SLC39A14依赖的肝细胞铁死亡,从而预防肝移植缺血再灌注损伤的机制 | 首次发现SLC39A14作为肝细胞铁死亡的促发靶点,并阐明hBMSCs通过外泌体miR-16-5p调控该过程的治疗机制 | 研究主要聚焦于SLC39A14和miR-16-5p的机制,可能涉及其他未探索的调控通路 | 探究肝移植缺血再灌注损伤中肝细胞铁死亡的分子机制及治疗策略 | 人肝移植组织、肝细胞、人骨髓源性间充质干细胞 | 单细胞测序分析 | 肝移植缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、体外和体内实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9067 | 2025-10-07 |
Single-Nucleus and Spatial Transcriptome Profiling Delineates the Multicellular Ecosystem in Hepatocellular Carcinoma After Hepatic Arterial Infusion Chemotherapy
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405749
PMID:39686623
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学描绘了肝动脉灌注化疗后肝细胞癌的多细胞生态系统 | 首次整合单核RNA测序和空间转录组学技术系统分析HAIC治疗后肝癌的肿瘤生态系统,发现三级淋巴结构形成和中间耗竭CD8 T细胞扩增等新现象 | 样本量相对有限,需要更大规模验证研究 | 阐明肝动脉灌注化疗后肝细胞癌的肿瘤微环境变化 | 初治和HAIC治疗后的肝细胞癌肿瘤样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 治疗初治和HAIC治疗后肝癌样本 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
9068 | 2025-10-07 |
Aberrant Chitinase 3-Like 1 Expression in Basal Cells Contributes to Systemic Sclerosis Fibrosis
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202310169
PMID:39686726
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现系统性硬化症中基底细胞异常表达的几丁质酶3样1蛋白通过IL-17RA信号通路促进纤维化 | 首次在系统性硬化症中鉴定出高表达Chi3L1的基底细胞亚群,并阐明其通过IL-17RA介导的NF-κB和MAPK信号通路促进纤维化的新机制 | 研究样本量有限,动物模型不能完全模拟人类疾病复杂性 | 探究系统性硬化症纤维化的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 系统性硬化症患者皮肤样本、血清样本和博来霉素诱导的小鼠模型 | 单细胞组学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 系统性硬化症患者和健康对照的皮肤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9069 | 2025-10-07 |
Application of Single-Cell Genomics to Animal Models of Periodontitis and Peri-Implantitis
2025-Feb, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.14093
PMID:39695834
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综述 | 本综述探讨了单细胞基因组学技术与牙周炎和种植体周围炎动物模型结合应用的现状与前景 | 整合单细胞RNA测序技术与动物模型,揭示牙周疾病中的细胞异质性和细胞特异性作用,并开始应用于种植体周围炎研究 | 叙述性综述,缺乏系统性文献检索和质量评估 | 综合当前关于单细胞基因组学技术与牙周炎和种植体周围炎动物模型整合应用的知识 | 牙周炎和种植体周围炎的动物模型 | 单细胞基因组学 | 牙周疾病 | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | 基因敲除模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间基因组学 | NA | NA |
9070 | 2025-10-07 |
Resident synovial macrophages in synovial fluid: Implications for immunoregulation
2025-Feb, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110422
PMID:39701169
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研究论文 | 本研究通过鉴定滑液中的常驻滑膜巨噬细胞来评估滑膜屏障完整性,并揭示其在炎症性关节炎中的促纤维化和促破骨细胞通路作用 | 首次在人类滑液中鉴定常驻滑膜巨噬细胞,并建立新型体外外植体模型验证发现 | 滑膜屏障破坏后这些细胞是否持续或引发慢性炎症仍未知 | 评估滑膜屏障完整性及其与关节结构损伤的潜在关联 | 人类滑液和滑膜组织 | 免疫学 | 关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9071 | 2025-10-07 |
Tracking adipose-derived stem cell exosomes applied in a mouse crush injury model: insights from fluorescent labeling and spatial transcriptomics - an experimental study
2025-Feb-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002166
PMID:39705130
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研究论文 | 本研究通过荧光标记和空间转录组学追踪脂肪来源干细胞外泌体在小鼠坐骨神经挤压伤模型中的作用机制 | 首次结合荧光标记和空间转录组学技术系统追踪ADSC-exos在神经再生过程中的分布及分子机制 | 本研究为动物实验,结果向临床转化需进一步验证;样本量有限 | 探究脂肪来源干细胞外泌体促进神经再生的具体作用机制 | 小鼠坐骨神经挤压伤模型 | 空间转录组学 | 周围神经损伤 | 荧光标记, 空间转录组学, 基因本体分析 | NA | 空间基因表达数据, 荧光成像数据 | 小鼠神经挤压伤模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
9072 | 2025-10-07 |
Mechanistic study of the regulation of mitochondrial function by the GPNMB/Nrf2/NF-κB signaling pathway mediated by Quzhi Tang to alleviate chondrocyte senescence
2025-Jan-31, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2024.119165
PMID:39617085
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研究论文 | 本研究探讨祛痹汤通过调控GPNMB/Nrf2/NF-κB信号通路修复线粒体损伤并缓解软骨细胞衰老的机制 | 首次结合单细胞转录组分析识别衰老关键靶点GPNMB,并阐明祛痹汤通过该靶点调控线粒体功能的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体临床样本中验证 | 探究祛痹汤治疗膝骨关节炎的药理机制 | 小鼠软骨细胞及软骨组织 | 分子生物学 | 骨关节炎 | 单细胞转录组分析,siRNA干扰,慢病毒转染,分子生物学方法 | NA | 转录组数据,组织病理学数据 | 小鼠软骨组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9073 | 2025-10-07 |
mSphere of Influence: How the single cell contributes to the collective
2025-Jan-28, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00431-24
PMID:39660837
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评论 | 本文讨论了细菌单细胞RNA测序技术如何帮助理解单个细胞对微生物生态系统过程的贡献 | 重点介绍了两种新兴的细菌单细胞RNA测序方法及其在微生物生态学研究中的应用价值 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术如何促进对微生物生态系统中单个细胞作用的理解 | 人类微生物组中的细菌单细胞 | 微生物生态学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 组合索引法和分池条形码法两种细菌单细胞RNA测序技术 |
9074 | 2025-10-07 |
The role of CD101 and Tim3 in the immune microenvironment of gastric cancer and their potential as prognostic biomarkers
2025-Jan-27, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113835
PMID:39700955
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研究论文 | 本研究探讨CD101和Tim3在胃癌免疫微环境中的作用及其作为预后生物标志物的潜力 | 首次系统分析CD101-Tim3+ CD8+ T细胞和CD101+Tim3+ CD8+ T细胞的差异表达基因,并构建基于14个预后基因的风险评分模型 | 未明确说明样本来源和样本量,缺乏外部验证队列 | 阐明胃癌的分子机制,发现新的生物标志物和治疗策略 | 胃癌患者及其免疫微环境中的CD8+ T细胞亚群 | 生物信息学 | 胃癌 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 细胞通讯分析, 富集分析, 药物敏感性分析 | 风险评分模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
9075 | 2025-10-07 |
SLAM-seq reveals independent contributions of RNA processing and stability to gene expression in African trypanosomes
2025-Jan-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1203
PMID:39673807
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研究论文 | 本研究通过开发代谢RNA标记方法,揭示了RNA加工和稳定性对非洲锥虫基因表达的独立贡献 | 开发了高效的代谢RNA标记方法,结合超短代谢标记和TT-seq技术,首次在非洲锥虫中全局量化RNA加工速率和半衰期 | 研究聚焦于单一寄生虫物种,结果在其他生物中的普适性需要进一步验证 | 探究RNA加工和降解等转录后过程对基因表达的调控作用 | 布氏锥虫(Trypanosoma brucei)——一种被认为缺乏转录调控的单细胞寄生虫 | 分子生物学 | 寄生虫感染 | SLAM-seq, TT-seq, 单细胞RNA测序, 代谢RNA标记 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 代谢测序 | NA | NA |
9076 | 2025-10-07 |
Inferring disease progression stages in single-cell transcriptomics using a weakly supervised deep learning approach
2025-Jan-22, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278812.123
PMID:39622637
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研究论文 | 提出一种名为scIDST的弱监督深度学习方法,用于从单细胞转录组数据推断疾病进展阶段 | 开发了首个利用弱监督深度学习框架推断单细胞疾病进展水平的方法 | NA | 解决患者来源组织中细胞异质性问题,识别真正的疾病相关分子特征 | 单细胞转录组数据中的个体细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9077 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis of cerebrospinal fluid reveals common features of neuroinflammation
2025-Jan-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101733
PMID:39708811
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析脑脊液免疫细胞,揭示不同神经系统疾病中神经炎症的共同特征 | 首次系统比较不同神经疾病中脑脊液免疫细胞的转录组特征,发现跨疾病的共同神经炎症特征 | 样本来源和数量可能限制结论的普适性,需要更大规模验证 | 探索脑脊液免疫细胞在不同神经系统疾病中的功能特征和转录组变化 | 患有炎症性、感染性和非炎症性神经系统疾病患者的脑脊液样本 | 单细胞 genomics | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多种神经系统疾病患者的脑脊液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9078 | 2025-10-07 |
Evaluation of T Cell Receptor Construction Methods from scRNA-Seq Data
2025-Jan-15, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae086
PMID:39666949
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研究论文 | 评估从单细胞RNA测序数据构建T细胞受体的不同方法性能 | 开发了新型模拟器YASIM-scTCR,并首次对多种TCR构建方法进行了系统性基准测试 | 研究主要基于模拟和实验数据集,未涉及所有可能的真实临床场景 | 评估不同TCR构建方法的性能并指导方法选择 | T细胞受体构建方法和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9079 | 2025-10-07 |
Applications of Nanotechnology for Spatial Omics: Biological Structures and Functions at Nanoscale Resolution
2025-01-14, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c11505
PMID:39704725
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综述 | 探讨纳米技术在空间组学中的应用及其对生物结构和功能纳米级分辨率研究的推动作用 | 系统阐述纳米技术如何突破传统空间组学的分辨率限制,实现纳米级精度的生物分子空间分布分析 | 作为综述文章,未涉及具体实验数据验证,主要基于现有文献总结 | 综述纳米技术在空间组学各领域的应用进展与发展前景 | 空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学、表观基因组学和多组学方法 | 空间组学 | NA | 超分辨率显微镜、质谱成像、DNA纳米结构、微流控芯片、DNA条形码 | NA | 空间分子分布数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 空间代谢组学, 空间表观基因组学, 空间多组学 | NA | NA |
9080 | 2025-10-07 |
A comprehensive analysis framework for evaluating commercial single-cell RNA sequencing technologies
2025-Jan-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1186
PMID:39675380
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研究论文 | 本研究对九种商业单细胞RNA测序技术进行了全面评估和比较 | 引入了读取利用率指标来区分不同scRNA-seq试剂盒的性能,并首次对四种技术类别的九种商业试剂盒进行系统性比较 | 仅使用单一供体的外周血单个核细胞进行评估,可能无法完全代表其他细胞类型或样本的适用性 | 评估商业单细胞RNA测序技术的性能、成本和实用性 | 外周血单个核细胞(PBMCs) | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 169,262个细胞 | 10x Genomics, BD Biosciences | 单细胞RNA-seq | Chromium Fixed RNA Profiling kit, Rhapsody WTA kit | 10x Genomics Chromium Fixed RNA Profiling(基于探针的RNA检测方法), BD Rhapsody WTA kit |