单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 9041 - 9060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9041 | 2025-10-07 |
Single-cell data-driven design of armed oncolytic virus to boost cooperative innate-adaptive immunity against cancer
2025-Feb-05, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.12.017
PMID:39674886
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析设计了一种表达五个非冗余功能基因的武装溶瘤病毒OV-5A，用于增强抗肿瘤免疫反应 | 采用单细胞数据驱动方法设计多基因武装溶瘤病毒，激活协同先天-适应性免疫反应对抗肿瘤 | NA | 开发更有效的溶瘤病毒疗法以克服患者对癌病毒治疗的异质性反应 | 肿瘤免疫微环境、溶瘤病毒疗法、小鼠模型、人源化异种移植模型、类器官-免疫细胞共培养系统、患者组织切片 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9042 | 2025-10-07 |
Fusobacterium nucleatum promotes colorectal cancer through neogenesis of tumor stem cells
2025-Feb-03, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI181595
PMID:39656543
|
研究论文 | 本研究揭示了具核梭杆菌通过LY6A/RPS14信号轴促进肠道隐窝细胞重编程为肿瘤干细胞，从而加速结直肠癌发生的机制 | 首次发现具核梭杆菌通过LY6A受体激活RPS14信号通路，驱动复活干细胞向肿瘤干细胞转化 | 研究主要基于小鼠模型，临床验证仍需进一步扩大样本量 | 探究具核梭杆菌促进结直肠癌发生的分子机制 | 结直肠癌患者样本和小鼠模型 | 肿瘤生物学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 临床结直肠癌队列和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9043 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic profiling of heart reveals ANGPTL4 linking fibroblasts and angiogenesis in heart failure with preserved ejection fraction
2025-Feb, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.02.006
PMID:38346487
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示HFpEF心脏中成纤维细胞通过分泌ANGPTL4与血管内皮细胞相互作用导致血管生成障碍的机制 | 首次在单细胞分辨率下系统描述HFpEF心脏的血管生成障碍，发现成纤维细胞通过过度分泌ANGPTL4与内皮细胞相互作用的新机制 | 研究基于小鼠模型，尚未在人体验证；机制研究主要依赖相关性分析 | 探究HFpEF的细胞异质性和潜在病理机制 | HFpEF小鼠模型的心脏组织细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光染色, 批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | HFpEF小鼠模型心脏细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9044 | 2025-10-07 |
Massively parallel flow-cytometry-based screening of hematopoietic lineage cell populations from up to 25 donors simultaneously
2025-Feb, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2024.11.014
PMID:39608688
|
研究论文 | 开发了一种基于流式细胞术的高通量筛选方法，可同时分析25个供体的造血谱系细胞表面标记物 | 利用CD45和CD71标记创建荧光条形码，实现25个样本的并行分析；结合机器学习算法精确预测数百种标记物的共表达 | 主要适用于免疫细胞丰富的组织，对于低细胞计数的后续实验需要额外验证 | 开发高维度和技术统一的细胞表面标记物筛选方法 | 造血起源细胞，包括免疫细胞和红系祖细胞 | 细胞分析技术 | NA | 流式细胞术，免疫荧光染色，机器学习算法 | 机器学习算法 | 流式细胞数据 | 最多25个供体样本 | NA | 流式细胞术，免疫表型分析 | NA | 基于PE标记抗体的多重染色技术 |
| 9045 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic profiling of maize cell heterogeneity and systemic immune responses against Puccinia polysora Underw
2025-Feb, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14519
PMID:39612313
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术解析了玉米对锈菌感染的细胞异质性反应和系统免疫机制 | 创建了首个玉米叶片在真菌攻击下的单细胞图谱，揭示了抗性品系R99在不同叶细胞类型中的多样化调控程序 | NA | 研究玉米对南方锈菌感染的细胞异质性反应和抗性机制 | 玉米叶片细胞 | 植物生物学 | 植物真菌病害 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 易感品系N110和抗性品系R99的叶片细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9046 | 2025-10-07 |
Zinc ions facilitate metabolic bioenergetic recovery post spinal cord injury by activating microglial mitophagy through the STAT3-FOXO3a-SOD2 pathway
2025-Feb-01, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本研究揭示了锌离子通过STAT3-FOXO3a-SOD2通路激活小胶质细胞线粒体自噬，促进脊髓损伤后代谢功能恢复的机制 | 首次发现锌离子通过诱导FOXO3a核转位激活线粒体自噬，并阐明STAT3-FOXO3a-SOD2轴在调节小胶质细胞能量稳态中的关键作用 | FOXO3a在脊髓损伤后小胶质细胞代谢中的作用尚未充分探索，具体分子机制需进一步验证 | 探究锌离子调节小胶质细胞代谢功能在脊髓损伤修复中的作用机制 | 脊髓损伤后的小胶质细胞 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9047 | 2025-10-07 |
Integrative mapping of human CD8+ T cells in inflammation and cancer
2025-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02530-0
PMID:39614111
|
研究论文 | 本研究开发了深度学习模型scAtlasVAE，构建了全面的人类CD8+ T细胞图谱，揭示了其在炎症和癌症中的克隆景观和动态变化 | 开发了scAtlasVAE深度学习模型用于整合大规模单细胞RNA测序数据和跨图谱比较，首次构建了包含超过115万个细胞的人类CD8+ T细胞综合图谱 | NA | 全面理解人类CD8+ T细胞在炎症和癌症中的克隆景观、动态变化和功能转变 | 人类CD8+ T细胞 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | VAE（变分自编码器） | 单细胞RNA测序数据 | 1,151,678个细胞，来自961个样本，涵盖68项研究和42种疾病状态 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9048 | 2025-10-07 |
ATP2A3 in Primary Aldosteronism: Machine Learning-Based Discovery and Functional Validation
2025-Feb, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
|
研究论文 | 本研究通过机器学习方法发现ATP2A3是醛固酮腺瘤的关键特征基因，并通过多平台验证其在醛固酮生成中的调控作用 | 首次结合机器学习与空间转录组学技术鉴定ATP2A3作为醛固酮腺瘤的新型生物标志物，并系统验证其功能机制 | 研究主要基于已发表的RNA测序数据，部分功能验证仅在细胞系和动物模型中进行 | 发现醛固酮腺瘤的新型生物标志物并阐明其病理生理机制 | 醛固酮腺瘤组织样本、猪肾上腺、人肾上腺皮质细胞系 | 机器学习 | 原发性醛固酮增多症 | RNA测序, 空间转录组学, 体外功能验证 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 已发表RNA测序数据集、APA组织样本、猪肾上腺样本、人肾上腺皮质细胞系 | NA | 空间转录组学, RNA-seq | NA | NA |
| 9049 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis of human peripheral blood reveals high immune response activity in successful ageing individuals
2025-Feb, Mechanisms of ageing and development
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.mad.2024.112011
PMID:39622417
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类外周血，揭示成功老龄化个体中免疫系统的高活性响应 | 首次在百岁老人和超级百岁老人群体中发现CD8效应记忆T细胞和终末分化B细胞的富集现象，并揭示CD14单核细胞通过Fc-γ受体信号增强抗原呈递能力 | 样本量相对有限（7名超级百岁老人、3名百岁老人和4名老年对照），需进一步扩大验证 | 探究老龄化过程中免疫系统动态调控的分子机制 | 人类外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 老龄化相关免疫变化 | 单细胞RNA测序，荧光激活细胞分选 | 生物信息学分析，动物实验验证 | 单细胞转录组数据 | 87,215个外周血单核细胞，来自14个个体（7名超级百岁老人+3名百岁老人+4名老年对照） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9050 | 2025-10-07 |
Nicotinamide N-methyltransferase negatively regulates metastasis-promoting property of cancer-associated fibroblasts in lung adenocarcinoma
2025-Feb, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12633
PMID:39623600
|
研究论文 | 本研究探讨了烟酰胺N-甲基转移酶在肺腺癌癌症相关成纤维细胞中的代谢和表观遗传调控作用 | 首次发现NNMT在CAFs中通过调节甲硫氨酸循环和H3K4me3甲基化水平，负向调控细胞外基质重塑基因表达 | 研究机制仍需进一步深入验证，临床转化潜力有待评估 | 探索肺腺癌复发和转移的代谢调控机制 | 肺腺癌组织和癌症相关成纤维细胞 | 癌症生物学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 代谢组学分析, 多重免疫荧光, 染色质免疫沉淀 | NA | 基因表达数据, 代谢组数据, 组织图像 | 肺腺癌患者组织和原代培养的CAFs | NA | 单细胞RNA-seq, 代谢组学 | NA | NA |
| 9051 | 2025-10-07 |
Exploring the tumor microenvironment of colorectal cancer patients post renal transplantation by single-cell analysis
2025-Feb, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16409
PMID:39623744
|
研究论文 | 通过单细胞分析探索肾移植后结直肠癌患者的肿瘤微环境特征 | 首次在肾移植后结直肠癌患者中应用单细胞RNA测序技术，揭示免疫抑制剂对肿瘤免疫微环境的特异性影响 | 样本量较小（仅4例移植患者），需要更大规模研究验证 | 理解免疫抑制剂对结直肠癌肿瘤免疫微环境的影响机制 | 肾移植后结直肠癌患者的肿瘤和正常组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4例肾移植后CRC患者+23例非移植CRC患者（公开数据） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9052 | 2025-10-07 |
Capture of Totipotency in Mouse Embryonic Stem Cells in the Absence of Pdzk1
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202408852
PMID:39630006
|
研究论文 | 通过删除Pdzk1基因在小鼠胚胎干细胞中建立全能性状态 | 首次发现单基因敲除即可使胚胎干细胞获得全能性特征 | 研究仅限于小鼠模型，尚未验证在人类细胞中的适用性 | 探索干细胞分化潜能扩展机制 | 小鼠胚胎干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序, bulk RNA-seq | 基因敲除模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9053 | 2025-10-07 |
Oxygen-dependent alternative mRNA splicing and a cone-specific motor protein revealed by single-cell RNA sequencing in hypoxic retinas
2025-Feb, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.110190
PMID:39638278
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究缺氧视网膜中特定细胞类型的转录组响应机制 | 首次在缺氧视网膜中发现锥细胞特异性运动蛋白Kif4的上调，并揭示了缺氧条件下RNA结合蛋白的异构体转换和表观转录组调控机制 | 研究仅使用小鼠模型，未验证在人类视网膜中的适用性 | 理解特定视网膜细胞类型对缺氧的分子响应机制 | 缺氧处理的小鼠视网膜细胞 | 单细胞转录组学 | 视网膜退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 缺氧处理小鼠的视网膜细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9054 | 2025-10-07 |
Central and peripheral kynurenine pathway metabolites in COVID-19: Implications for neurological and immunological responses
2025-Feb, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2024.11.031
PMID:39615604
|
研究论文 | 本研究通过检测COVID-19患者脑脊液和血浆中的犬尿氨酸通路代谢物，揭示了该通路在神经系统和免疫反应中的激活机制 | 首次发现COVID-19患者中枢神经系统内犬尿氨酸代谢物水平升高，并揭示了外周至中枢的犬尿氨酸转运机制 | 样本量有限（53例患者和12例对照），且为单中心研究 | 探究COVID-19患者犬尿氨酸通路代谢物与神经免疫反应的关系 | COVID-19患者和非炎症性神经系统疾病对照者 | 代谢组学 | COVID-19 | 超高效液相色谱-串联质谱（UPLC-MS/MS），单细胞转录组学 | NA | 代谢组数据，转录组数据 | 53例COVID-19患者，12例对照，另引用130例患者的单细胞转录组数据 | NA | 代谢组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9055 | 2025-10-07 |
Prenatal exposure on nanoplastics: A study of spatial transcriptomics in hippocampal offspring
2025-Feb-01, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2024.125480
PMID:39644950
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术探究母体暴露于纳米塑料对大鼠后代海马区发育的影响 | 首次应用空间转录组学技术系统研究纳米塑料暴露对后代海马区细胞类型特异性基因表达的影响 | 研究仅针对大鼠模型，人类相关性需进一步验证 | 探究母体纳米塑料暴露对后代海马区发育的神经毒性机制 | 母体暴露于聚苯乙烯纳米塑料的大鼠后代海马区组织 | 空间转录组学 | 神经发育障碍 | 空间转录组测序 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9056 | 2025-10-07 |
Multiplexing cortical brain organoids for the longitudinal dissection of developmental traits at single-cell resolution
2025-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02555-5
PMID:39653820
|
研究论文 | 开发了脑类器官多重分析方法和计算工具，用于在单细胞分辨率下解析神经发育轨迹 | 开发了互补的多重分析策略和新的计算方法SCanSNP，克服了双细胞和低质量细胞识别的关键问题 | NA | 建立高度可扩展的脑疾病和神经多样性建模资源 | 人多能干细胞系来源的脑类器官 | 单细胞分析 | 脑疾病 | 单细胞RNA测序 | SCanSNP | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9057 | 2025-10-07 |
DEHP-mediated oxidative stress leads to impaired testosterone synthesis in Leydig cells through the cAMP/PKA/SF-1/StAR pathway
2025-Feb-01, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2024.125503
PMID:39657860
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析结合体内外实验，揭示了DEHP通过诱导氧化应激抑制cAMP/PKA/SF-1/StAR通路，从而损害睾丸间质细胞睾酮合成的机制 | 首次整合单细胞RNA测序与功能验证，阐明DEHP通过氧化应激-cAMP/PKA/SF-1/StAR轴损害睾酮合成的新机制 | 未明确DEHP暴露的具体剂量-效应关系，且机制研究主要集中于单一信号通路 | 探究环境塑化剂DEHP损害睾丸间质细胞功能的具体分子机制 | 小鼠睾丸间质细胞 | 分子毒理学 | 男性生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序, 体外细胞实验, 体内动物实验, 氧化应激指标检测 | NA | 单细胞转录组数据, 生化指标数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9058 | 2025-10-07 |
Heterogeneity of tertiary lymphoid structures predicts the response to neoadjuvant therapy and immune microenvironment characteristics in triple-negative breast cancer
2025-Feb, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02917-y
PMID:39658606
|
研究论文 | 本研究通过多组学技术分析三阴性乳腺癌中三级淋巴结构的异质性及其对新辅助治疗反应和免疫微环境特征的预测价值 | 首次系统评估三级淋巴结构异质性对三阴性乳腺癌新辅助治疗反应的预测作用，并开发基于影像的生物标志物评分系统 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证 | 探索三级淋巴结构在三阴性乳腺癌新辅助治疗中的免疫调节作用及预后价值 | 三阴性乳腺癌患者样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫荧光染色,影像组学 | NA | 基因表达数据,影像数据,免疫组化数据 | 三阴性乳腺癌患者治疗前后样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 9059 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome sequencing analysis of physiological and immune profiling of crucian carp (Carassius auratus) gills
2025-Feb, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2024.110087
PMID:39662647
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析鲫鱼鳃组织的生理和免疫功能特征 | 首次在单细胞水平注释并分析鲫鱼鳃瓣间细胞团的功能异质性，建立基因调控网络并识别免疫调节相关关键基因 | 仅针对鲫鱼单一物种进行研究，未涉及其他鱼类或更广泛的比较分析 | 探究鲫鱼鳃组织在单细胞水平的生理和免疫功能特征 | 鲫鱼鳃组织细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序，组织学分析，加权基因共表达网络分析 | NA | 单细胞转录组数据，组织学图像 | 鲫鱼鳃组织样本（鉴定出19种细胞类型） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9060 | 2025-10-07 |
TEAD1-Mediated Trans-Differentiation of Vascular Smooth Muscle Cells into Fibroblast-Like Cells Contributes to the Stabilization and Repair of Disrupted Atherosclerotic Plaques
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202407408
PMID:39665254
|
研究论文 | 本研究揭示了TEAD1通过Wnt4/β-Catenin通路促进血管平滑肌细胞向成纤维样细胞转分化，从而增强动脉粥样硬化斑块稳定性和破裂后修复机制 | 首次发现TEAD1是驱动VSMCs向成纤维样细胞转分化的关键转录因子，并阐明其通过Wnt4/β-Catenin通路发挥作用 | 研究主要基于小鼠TS模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究动脉粥样硬化斑块破裂后修复机制及潜在治疗靶点 | 血管平滑肌细胞(VSMCs)及其转分化过程 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 谱系追踪, 药理学处理, AAV基因治疗 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 动脉粥样硬化小鼠TS模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |