单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 9041 - 9060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9041 | 2024-09-06 |
Transcriptomics and RNA-Based Therapeutics as Potential Approaches to Manage SARS-CoV-2 Infection
2022-Sep-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms231911058
PMID:36232363
|
研究论文 | 本文探讨了转录组学和基于RNA的疗法在管理SARS-CoV-2感染中的潜在应用 | 本文介绍了转录组学方法在监测、检测、诊断和治疗SARS-CoV-2中的临床应用，并讨论了RNA疗法与SARS-CoV-2的关系 | NA | 探讨转录组学和基于RNA的疗法在管理SARS-CoV-2感染中的应用 | SARS-CoV-2病毒及其感染过程 | 数字病理学 | COVID-19 | 转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 9042 | 2024-09-06 |
Comparative single-cell transcriptional atlases of Babesia species reveal conserved and species-specific expression profiles
2022-09, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3001816
PMID:36137068
|
研究论文 | 本文比较了三种巴贝斯虫属物种的单细胞转录组图谱，揭示了保守和物种特异的表达谱 | 本文首次应用单细胞RNA测序技术对三种巴贝斯虫属物种进行研究，构建了伪同步的时间进程基因表达谱，并识别了协调表达的基因簇和物种特异的共表达网络 | 由于巴贝斯虫属寄生虫的同步化限制，无法获得精细的时间进程转录组资源 | 研究巴贝斯虫属寄生虫的无性血液感染阶段的复制周期进展和调控 | 巴贝斯虫属的三种物种（B. divergens, B. bovis, 和 B. bigemina） | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 高斯图形模型 | 基因表达数据 | 三种巴贝斯虫属物种的单细胞样本 |
| 9043 | 2024-09-06 |
Single-cell immune repertoire sequencing of B and T cells in murine models of infection and autoimmunity
2022-09, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-022-00180-w
PMID:36028771
|
研究论文 | 本文研究了在小鼠感染和自身免疫模型中单细胞免疫组库中B细胞和T细胞的转录组和免疫组库信息 | 利用单细胞测序技术，同时获取了适应性免疫受体序列和转录组信息，揭示了克隆扩增、胚系基因使用和克隆趋同性与细胞表型之间的关系 | NA | 研究小鼠模型中感染和自身免疫状态下B细胞和T细胞的免疫组库和转录组信息 | 小鼠模型中的B细胞和T细胞，包括T滤泡辅助细胞、CD8+ T细胞和神经系统中的B细胞和T细胞 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据和免疫组库数据 | 涉及多种小鼠模型中的B细胞和T细胞样本 |
| 9044 | 2024-09-06 |
Statistical analysis of spatially resolved transcriptomic data by incorporating multiomics auxiliary information
2022-07-30, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyac095
PMID:35731210
|
研究论文 | 本文提出了一种结合多组学辅助信息的空间转录组数据统计分析方法 | 扩展了OrderShapeEM方法，使其能够整合多个外部组学研究的信息，从而提高空间表达模式检测的统计效能 | NA | 提高空间转录组数据分析中的统计效能，同时控制错误发现率 | 空间转录组数据和外部多组学数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学、RNA测序 | OrderShapeEM | 转录组数据 | NA |
| 9045 | 2024-09-06 |
Circadian Regulator CLOCK Drives Immunosuppression in Glioblastoma
2022-06-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-21-0559
PMID:35413115
|
研究论文 | 研究揭示了生物钟调节因子CLOCK及其异二聚体伙伴BMAL1在胶质母细胞瘤干细胞中驱动免疫抑制的分子机制 | 首次揭示了CLOCK-BMAL1复合物通过调控LGMN和OLFML3在胶质母细胞瘤干细胞中驱动免疫抑制的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和人类数据集，需要进一步的临床验证 | 探讨胶质母细胞瘤中癌症干细胞与肿瘤微环境相互作用的分子机制 | 胶质母细胞瘤干细胞、CLOCK、BMAL1、LGMN、OLFML3等 | NA | 脑癌 | 转录组分析、单细胞RNA测序、TCGA数据集分析 | NA | 转录组数据、单细胞RNA数据 | 小鼠模型和人类胶质母细胞瘤样本 |
| 9046 | 2024-09-06 |
Dormant Nfatc1 reporter-marked basal stem/progenitor cells contribute to mammary lobuloalveoli formation
2022-Mar-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.103982
PMID:35310332
|
研究论文 | 研究了休眠的Nfatc1报告基因标记的基底干细胞/祖细胞在乳腺小叶形成中的作用 | 首次揭示了Nfatc1报告基因标记的基底干细胞/祖细胞在乳腺小叶形成中的作用，并发现这些细胞在怀孕期间迅速分裂并参与小叶发育 | 研究主要集中在怀孕期间的乳腺发育，未涉及其他生理状态下的情况 | 探讨休眠的乳腺基底干细胞/祖细胞在怀孕期间乳腺小叶形成中的作用 | Nfatc1报告基因标记的基底干细胞/祖细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个怀孕期间的乳腺样本 |
| 9047 | 2024-09-06 |
Characterization of cancer-related fibroblasts (CAF) in hepatocellular carcinoma and construction of CAF-based risk signature based on single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq data
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1009789
PMID:36211448
|
研究论文 | 研究探讨了肝细胞癌中的癌症相关成纤维细胞（CAF）特征，并基于单细胞RNA测序和批量RNA测序数据构建了CAF相关的风险特征 | 首次基于单细胞RNA测序数据识别出肝细胞癌中的四个CAF簇，并构建了包含六个基因的CAF相关风险特征，用于预测肝细胞癌的预后 | 研究依赖于公开数据库的数据，可能存在数据质量和样本代表性的限制 | 探索肝细胞癌中CAF的特征，并建立基于CAF的风险特征以预测肝细胞癌患者的预后 | 肝细胞癌中的癌症相关成纤维细胞（CAF）及其相关的风险特征 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序 | Lasso回归 | RNA测序数据 | 使用了来自GEO和TCGA数据库的单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据 |
| 9048 | 2024-09-06 |
Prognostic characteristics of immune subtypes associated with acute myeloid leukemia and their identification in cell subsets based on single-cell sequencing analysis
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.990034
PMID:36211454
|
研究论文 | 研究分析了急性髓系白血病（AML）患者的免疫亚型特征及其在细胞亚群中的识别 | 通过单细胞测序分析，识别了与AML预后相关的九个关键免疫基因，并构建了预测模型 | 研究结果需要在更大样本量的研究中进一步验证 | 探讨AML患者的免疫微环境特征及其在细胞亚群中的表达，并构建预后评估模型 | 急性髓系白血病（AML）患者的免疫亚型和细胞亚群 | 数字病理学 | 血液肿瘤 | 单细胞测序 | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据 | 151名AML患者 |
| 9049 | 2024-09-06 |
Mapping and modeling the genomic basis of differential RNA isoform expression at single-cell resolution with LR-Split-seq
2021-10-07, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02505-w
PMID:34620214
|
研究论文 | 开发并表征了一种名为LR-Split-seq的长读长单细胞RNA测序技术，用于在单细胞分辨率下识别全长转录本异构体 | LR-Split-seq结合了组合条形码技术，能够在相对经济和设计灵活的情况下对单细胞进行长读长测序 | NA | 研究单细胞分辨率下RNA异构体表达的基因组基础 | C2C12肌生成系统中的单细胞 | 基因组学 | NA | LR-Split-seq | NA | RNA序列 | C2C12肌生成系统中的单细胞 |
| 9050 | 2024-09-06 |
OVOL1 Regulates Psoriasis-Like Skin Inflammation and Epidermal Hyperplasia
2021-06, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2020.10.025
PMID:33333123
|
研究论文 | 研究揭示了OVOL1在调节银屑病样皮肤炎症和表皮增生中的保护作用 | 首次发现OVOL1在银屑病样皮肤炎症中的保护作用，并通过RNA测序揭示了Ovol1缺失对表皮分化和炎症反应的影响 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在人类银屑病患者中验证 | 探讨OVOL1在银屑病样皮肤炎症和表皮增生中的分子机制 | OVOL1在银屑病样皮肤炎症中的作用及其对表皮分化和免疫细胞的影响 | NA | 银屑病 | RNA测序 | NA | RNA | Ovol1缺失小鼠的皮肤样本 |
| 9051 | 2024-09-06 |
Integrated Single-Cell Transcriptomics and Chromatin Accessibility Analysis Reveals Regulators of Mammary Epithelial Cell Identity
2020-10-20, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108273
PMID:33086071
|
研究论文 | 本文通过整合单细胞转录组学和染色质可及性分析，揭示了乳腺上皮细胞身份的调控因子 | 本文首次通过整合单细胞转录组学和染色质可及性分析，无偏倚地重建了小鼠乳腺上皮细胞系统的细胞类型及其基因调控特征，并定义了分泌型腔细胞内的分化状态 | NA | 揭示乳腺上皮细胞身份及其分化的调控机制 | 小鼠乳腺上皮细胞系统及其基因调控特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学和染色质可及性分析 | NA | 转录组数据和染色质可及性数据 | 小鼠乳腺上皮细胞系统中的多个细胞样本 |
| 9052 | 2024-09-06 |
Coronavirus disease-19 and fertility: viral host entry protein expression in male and female reproductive tissues
2020-07, Fertility and sterility
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.fertnstert.2020.05.001
PMID:32622411
|
研究论文 | 研究分析了男性和女性生殖系统中SARS-CoV-2感染风险相关的细胞类型 | 首次系统分析了男性和女性生殖组织中SARS-CoV-2进入宿主细胞的关键基因和蛋白的表达情况 | 研究基于已有的基因和蛋白表达数据，未涉及临床患者样本 | 识别男性和女性生殖系统中因表达SARS-CoV-2进入细胞所需基因和蛋白而易受感染的细胞类型 | 男性和女性生殖系统中的细胞类型 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组和蛋白质组数据 | 18个人类卵丘细胞样本 |
| 9053 | 2024-09-06 |
Approaches for integrating heterogeneous RNA-seq data reveal cross-talk between microbes and genes in asthmatic patients
2020-06-22, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02033-z
PMID:32571363
|
研究论文 | 研究开发了一种集成降维和统计建模的流程，用于解析哮喘患者痰液样本中复杂的RNA-seq数据，揭示微生物与基因之间的相互作用 | 提出了LDA-link方法，通过降维的LDA主题将微生物与基因连接起来，并验证了该方法的有效性 | NA | 研究哮喘患者痰液样本中微生物与基因之间的相互作用 | 哮喘患者的痰液样本 | 生物信息学 | 哮喘 | RNA-seq | LDA | RNA-seq数据 | NA |
| 9054 | 2024-09-05 |
Single-cell spatial transcriptomics in cardiovascular development, disease, and medicine
2024-Nov, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2023.101163
PMID:39224111
|
研究论文 | 本文介绍了单细胞空间转录组学在心血管发育、疾病和医学中的应用，并强调了其在心血管研究中的最新进展。 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，提供了对心血管疾病发病机制的多维度、多层次、多视角和动态的理解。 | NA | 探讨单细胞空间转录组学技术在心血管疾病风险分层和个体化治疗中的应用。 | 心血管疾病的发病机制、细胞间相互作用以及疾病进展的时空特征。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 9055 | 2024-09-05 |
Single-cell sequencing reveals that specnuezhenide protects against osteoporosis via activation of METTL3 in LEPR+ BMSCs
2024-Oct-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2024.176908
PMID:39154827
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了specnuezhenide通过激活METTL3在LEPR+ BMSCs中保护骨质疏松的分子机制 | 首次揭示了specnuezhenide通过激活METTL3在LEPR+ BMSCs中保护骨质疏松的分子机制 | NA | 阐明骨质疏松发病机制并提出新型治疗药物 | 骨质疏松和LEPR+ BMSCs | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠骨质疏松模型 |
| 9056 | 2024-09-05 |
CelltypeR: A flow cytometry pipeline to characterize single cells from brain organoids
2024-Sep-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110613
PMID:39224516
|
研究论文 | 本文开发了一个完整的流程，用于在复杂组织中可重复地表征细胞类型，特别是脑组织和诱导多能干细胞（iPSC）衍生的脑模型 | 结合流式细胞术（FC）抗体面板与计算流程CelltypeR，实现了数据对齐、无监督聚类优化、细胞类型注释和统计比较 | NA | 开发一个通用的方法，用于在复杂组织中可重复地识别细胞类型 | 人诱导多能干细胞衍生的中脑类器官中的主要脑细胞类型 | 数字病理学 | 帕金森病 | 流式细胞术（FC）, 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 9057 | 2024-09-05 |
Gut Microbiota Defines Functional Direction of Colonic Regulatory T Cells with Unique TCR Repertoires
2024-Sep-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300395
PMID:39101764
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，比较了无特定病原体和无菌小鼠结肠调节T细胞的转录组和TCR特异性，发现肠道微生物群影响结肠调节T细胞的功能方向和克隆型扩展 | 首次揭示了肠道微生物群与免疫细胞相互作用的新模块，该模块可能有助于开发治疗肠道炎症疾病的新疗法 | NA | 研究肠道微生物群如何改变结肠调节T细胞的转录组和TCR特异性 | 结肠调节T细胞 | 免疫学 | 肠道炎症疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 无特定病原体和无菌小鼠的结肠调节T细胞 |
| 9058 | 2024-09-05 |
Glycolysis in Peritubular Endothelial Cells and Microvascular Rarefaction in CKD
2024-Sep-03, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000488
PMID:39226371
|
研究论文 | 本研究探讨了慢性肾脏病（CKD）中肾小管周围内皮细胞的糖酵解代谢重编程及其对微血管稀疏的影响。 | 首次揭示了肾小管周围内皮细胞中糖酵解失调是CKD中微血管稀疏的启动因素，并通过恢复糖酵解改善了微血管稀疏和纤维化病变。 | NA | 研究CKD中肾小管周围内皮细胞的代谢重编程及其对微血管稀疏的影响。 | CKD患者的肾小管周围内皮细胞和CKD小鼠模型。 | NA | 慢性肾脏病 | 单细胞测序和代谢分析 | NA | 细胞代谢数据 | CKD患者和CKD小鼠模型的肾小管周围内皮细胞 |
| 9059 | 2024-09-05 |
The heterogeneity of erythroid cells: insight at the single-cell transcriptome level
2024-Sep, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-024-03903-9
PMID:38953986
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组测序技术在红细胞研究中的最新进展及其对红细胞功能异质性、新亚群识别、不同红细胞谱系追踪和命运决定机制揭示的贡献 | 强调了单细胞转录组测序技术在红细胞研究中的应用，特别是在识别前所未知的细胞亚群、分析细胞异质性和单个细胞的转录组特征方面的优势 | NA | 系统总结单细胞转录组测序技术的最新发展及其对红细胞研究的影响 | 红细胞及其在血液中的异质性和功能 | 生命科学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 9060 | 2024-08-07 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq reveals heterogeneity in epithelial cells between high- and low-grade bladder urothelial carcinoma
2024-Sep, Asian journal of surgery
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.asjsur.2024.05.078
PMID:38796363
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |