单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27967 篇文献，本页显示第 9041 - 9060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9041 | 2024-09-17 |
Cell therapy using ex vivo reprogrammed macrophages enhances antitumor immune responses in melanoma
2024-Sep-14, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03182-w
PMID:39272209
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研究论文 | 研究通过体外重编程巨噬细胞进行细胞疗法，增强黑色素瘤中的抗肿瘤免疫反应 | 首次展示了使用HDAC6抑制剂体外重编程巨噬细胞作为治疗实体瘤的可行性细胞疗法 | NA | 设计新策略以增加肿瘤微环境中M1/M2比例，从而增强基于巨噬细胞的细胞疗法 | 巨噬细胞、肿瘤微环境、黑色素瘤 | 细胞疗法 | 黑色素瘤 | HDAC6抑制剂、流式细胞术、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用SM1小鼠黑色素瘤模型和NSG-SGM3人源化小鼠模型进行研究 |
| 9042 | 2024-09-17 |
Single-cell profiling uncovers proliferative cells as key determinants of survival outcomes in lower-grade glioma patients
2024-Sep-14, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01302-8
PMID:39276278
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和批量RNA测序，识别出一种与低级别胶质瘤患者预后不良相关的新型细胞类型，并构建了基于该细胞类型的预测模型 | 本研究首次识别出一种名为“Prol”的细胞类型，该细胞类型与低级别胶质瘤患者的预后不良相关，并构建了基于该细胞类型的预测模型，具有泛癌预测潜力 | NA | 本研究旨在通过单细胞RNA测序和批量RNA测序，识别出与低级别胶质瘤患者预后相关的新型细胞类型，并开发新的预测模型 | 低级别胶质瘤患者及其细胞类型 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | AI网络 | RNA | NA |
| 9043 | 2024-09-17 |
Single-cell RNA sequencing analysis of peripheral blood mononuclear cells in PD-1-induced renal toxicity in patients with lung cancer
2024-Sep-14, BMC nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1186/s12882-024-03754-0
PMID:39277735
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研究论文 | 研究分析了PD-1治疗引起的肾毒性中，外周血单核细胞的单细胞RNA测序特征 | 首次通过单细胞RNA测序分析了PD-1治疗引起的肾毒性中，外周血单核细胞的差异表达基因及其富集的生物学过程 | 样本量较小，仅包括六名患者 | 旨在分析PD-1治疗引起的肾毒性中，外周血单核细胞的特征 | 外周血单核细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6名患者 |
| 9044 | 2024-09-17 |
Single-cell RNA sequencing reveals the differentiation and regulation of endplate cells in human intervertebral disc degeneration
2024-Sep-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-71891-5
PMID:39271714
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了人类椎间盘退变中的终板细胞的分化和调控 | 首次通过单细胞RNA测序分析了退变终板细胞的细胞命运和特性，并发现了两种软骨细胞分化途径 | NA | 揭示椎间盘退变过程中终板细胞的分化和调控机制 | 人类椎间盘退变中的终板细胞 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 8534个单细胞 |
| 9045 | 2024-09-17 |
Machine learning algorithms for predicting glioma patient prognosis based on CD163+FPR3+ macrophage signature
2024-Sep-13, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00692-w
PMID:39271911
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研究论文 | 研究利用机器学习算法基于CD163+FPR3+巨噬细胞特征预测胶质瘤患者预后 | 首次基于CD163+FPR3+巨噬细胞相关特征构建了预测胶质瘤患者预后的机器学习模型，并展示了其优于传统临床因素和其他已发表签名的预测准确性 | NA | 开发一种基于CD163+FPR3+巨噬细胞特征的机器学习模型，以提高胶质瘤患者预后的预测准确性 | 胶质瘤患者及其肿瘤相关巨噬细胞 | 机器学习 | 脑肿瘤 | 单细胞测序分析 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 六个胶质瘤队列 |
| 9046 | 2024-09-17 |
scBubbletree: computational approach for visualization of single cell RNA-seq data
2024-Sep-13, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05927-y
PMID:39271980
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scBubbletree的新方法，用于可视化单细胞RNA测序数据 | scBubbletree方法通过将细胞聚类可视化为树状图上的气泡，解决了现有方法在可视化高维数据时的过绘制、缺乏定量信息和扭曲全局及局部生物模式的问题 | NA | 开发一种新的可视化方法，以更好地量化和展示单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | scRNA-seq数据 | 包括一个超过120万细胞的大规模数据集 |
| 9047 | 2024-09-17 |
Permethrin exposure primes neuroinflammatory stress response to drive depression-like behavior through microglial activation in a mouse model of Gulf War Illness
2024-Sep-13, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03215-3
PMID:39272155
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研究论文 | 研究评估了接触除虫菊酯如何通过小胶质细胞激活引发与海湾战争疾病相关的抑郁样行为 | 首次揭示了除虫菊酯暴露通过小胶质细胞激活引发抑郁样行为的机制，并使用单细胞RNA测序分析了相关转录网络 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 评估除虫菊酯暴露对神经炎症应激反应的影响，并探讨其与海湾战争疾病相关抑郁样行为的关系 | 小鼠模型中的小胶质细胞激活和抑郁样行为 | 神经科学 | 精神疾病 | 单细胞RNA测序 | 深度学习模型 | 基因表达数据 | 21,566个单核细胞 |
| 9048 | 2024-09-17 |
Single-cell, single-nucleus and xenium-based spatial transcriptomics analyses reveal inflammatory activation and altered cell interactions in the hippocampus in mice with temporal lobe epilepsy
2024-Sep-13, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00636-3
PMID:39272194
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、单核RNA测序和基于Xenium的空间转录组学分析，揭示了颞叶癫痫小鼠海马体中炎症激活和细胞相互作用的改变 | 首次建立了颞叶癫痫小鼠海马体的高分辨率单细胞转录组图谱，揭示了潜在的内在机制驱动炎症激活和细胞相互作用的改变 | NA | 探讨颞叶癫痫相关海马硬化发展的潜在机制 | 颞叶癫痫小鼠海马体中的胶质细胞和神经元 | 数字病理学 | 癫痫 | 单细胞RNA测序、单核RNA测序、Xenium空间转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 31,390个胶质细胞和48,221个神经元核 |
| 9049 | 2024-09-17 |
CYR61/CCN1: A Novel Mediator of Redox Response in Corneal Stromal Cells of Keratoconus
2024-Sep-12, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.110093
PMID:39277098
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研究论文 | 研究探讨了CYR61/CCN1在圆锥角膜基质细胞氧化应激反应中的作用 | 首次揭示了CYR61在圆锥角膜基质细胞氧化应激反应中的关键作用 | 研究主要集中在细胞水平，缺乏临床数据支持 | 阐明氧化应激在圆锥角膜病理生理中的分子机制 | 圆锥角膜基质细胞 | NA | 圆锥角膜 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 圆锥角膜组和对照组的基质细胞 |
| 9050 | 2024-09-17 |
Single-Cell RNA Sequencing Revealing that MMP12+ Macrophages are Associated with Cancer Liver Metastasis
2024-Sep-12, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 研究探讨了MMP12+巨噬细胞在结直肠癌肝转移中的作用 | 首次揭示了MMP12+巨噬细胞在结直肠癌肝转移中的关键作用及其相关信号通路 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，未涉及体内实验验证 | 探讨MMP12+巨噬细胞在结直肠癌肝转移中的功能 | MMP12+巨噬细胞及其在结直肠癌肝转移中的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 结直肠癌及其肝转移组织的单细胞RNA测序数据 |
| 9051 | 2024-09-17 |
Analysis of the Mechanism Underlying Radiotherapy Resistance Caused by Oligodendroglia Cells in Glioblastoma by Applying the Single-cell RNA Sequencing Technology
2024-Sep-12, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了胶质母细胞瘤中少突胶质细胞导致放疗抵抗的分子机制 | 首次识别出两个少突胶质细胞亚群（ODC3和ODC4）作为胶质母细胞瘤放疗抵抗的群体，并揭示了它们通过不同的分子机制发展放疗抵抗 | 研究依赖于公共数据库的数据，可能存在数据质量和样本代表性的限制 | 探索胶质母细胞瘤放疗抵抗的分子机制并识别关键影响因素 | 胶质母细胞瘤中的少突胶质细胞及其放疗抵抗机制 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 从Gene Expression Omnibus (GEO)数据库下载的胶质母细胞瘤单细胞RNA测序数据 |
| 9052 | 2024-09-17 |
Approximating mutual information of high-dimensional variables using learned representations
2024-Sep-03, ArXiv
PMID:39279839
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研究论文 | 本文提出了一种名为潜在互信息（LMI）近似的方法，用于在高维数据中近似互信息 | LMI方法利用高维数据中的低维结构，通过非参数互信息估计器和简单理论模型架构学习到的低维表示来近似高维变量间的互信息 | NA | 探索在高维数据中利用低维结构近似互信息的方法 | 高维变量间的互信息 | 机器学习 | NA | 非参数互信息估计器 | 理论模型架构 | 高维数据 | NA |
| 9053 | 2024-09-17 |
FateNet: an integration of dynamical systems and deep learning for cell fate prediction
2024-Sep-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae525
PMID:39177093
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研究论文 | 本文介绍了一种名为FateNet的计算方法，结合动力系统理论和深度学习，用于预测细胞命运 | FateNet通过整合动力系统理论和深度学习，提高了细胞命运决策点的预测精度，并提供了对生物系统新状态的定性见解 | NA | 理解细胞决策过程及其对生物系统（如组织健康和功能）的影响 | 细胞命运决策和细胞状态动态 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 深度学习 | 基因表达数据 | 使用不同的scRNA-seq数据进行验证 |
| 9054 | 2024-09-17 |
Systematic comparison of sequencing-based spatial transcriptomic methods
2024-Sep, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02325-3
PMID:38965443
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研究论文 | 本文系统比较了11种基于测序的空间转录组学方法 | 首次全面基准测试不同的空间转录组学平台，并强调了分子扩散作为不同方法和组织中的变量参数 | 现有技术之间的变异性和数据集的多样性使得制定标准化的评估指标具有挑战性 | 帮助生物学家选择空间转录组学平台，并促进评估标准的共识 | 11种空间转录组学方法 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个参考组织和区域 |
| 9055 | 2024-09-17 |
Unlocking reproducible transcriptomic signatures for acute myeloid leukaemia: Integration, classification and drug repurposing
2024-Sep, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70085
PMID:39267259
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研究论文 | 本研究通过整合34个数据集，识别出10,000个与急性髓系白血病（AML）相关的基因，并利用机器学习技术发现191个AML特征，同时开发了一个用户友好的数据库平台CSAMLdb，以促进研究结果的复用和个性化分析 | 本研究通过整合多源数据集和使用机器学习技术，成功识别出AML相关的基因和特征，并开发了一个用户友好的数据库平台，以增强研究的复现性和可定制性 | NA | 解决急性髓系白血病（AML）转录组研究中的异质性问题，并发现新的治疗策略 | 急性髓系白血病（AML）及其亚型 | 机器学习 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | XGBoost | 转录组数据 | 34个数据集，包括26个对照组、6个预后数据集和2个单细胞RNA测序数据集 |
| 9056 | 2024-09-17 |
Single-Cell RNA-Sequencing: Opening New Horizons for Breast Cancer Research
2024-Aug-31, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25179482
PMID:39273429
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在乳腺癌研究中的应用及其对理解乳腺癌生物学和个性化治疗策略的潜在影响 | 单细胞RNA测序技术为乳腺癌研究提供了前所未有的细胞异质性和复杂性洞察 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在乳腺癌研究中的应用及其对个性化治疗策略的潜在影响 | 乳腺癌细胞及其微环境中的细胞类型和状态 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA |
| 9057 | 2024-09-17 |
Deciphering Dormant Cells of Lung Adenocarcinoma: Prognostic Insights from O-glycosylation-Related Tumor Dormancy Genes Using Machine Learning
2024-Aug-31, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25179502
PMID:39273449
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和机器学习技术，揭示了肺腺癌中休眠细胞与O-糖基化相关基因的关系，并开发了一个预测肺腺癌预后的风险评分模型 | 首次揭示了O-糖基化在肺腺癌休眠细胞中的关键作用，并开发了一个基于机器学习的高精度预后预测模型 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，未涉及临床样本的验证 | 揭示肺腺癌中休眠细胞的分子机制，并开发一个预测肺腺癌预后的模型 | 肺腺癌中的休眠细胞及其与O-糖基化相关基因的关系 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 机器学习 | 基因表达数据 | 来自肺腺癌患者的单细胞RNA测序数据 |
| 9058 | 2024-09-17 |
Potential molecular metabolic mechanisms underlying the effects of cimifugin in gastric cancer through single-cell and bulk RNA sequencing combined with network pharmacology
2024-Aug-31, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-24-413
PMID:39279957
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研究论文 | 研究了传统中药刺五加素在胃癌中的潜在分子代谢机制，通过单细胞和批量RNA测序结合网络药理学的方法 | 首次通过单细胞RNA测序和网络药理学方法，揭示了刺五加素在胃癌微环境和代谢途径中的潜在作用机制 | 研究主要基于体外实验和数据库分析，缺乏体内实验验证 | 探讨刺五加素在胃癌中的分子机制，为胃癌治疗提供新的策略 | 胃癌细胞、胃癌微环境细胞类型及其代谢途径 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、网络药理学 | NA | RNA | 使用了GSE134520数据库中的单细胞RNA测序数据和TCGA数据库中的胃腺癌数据集 |
| 9059 | 2024-09-17 |
Proteome-wide Mendelian randomization and single-cell sequencing analysis identify the association between plasma proteins and gastric cancer
2024-Aug-31, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-24-200
PMID:39279974
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组范围的孟德尔随机化分析和单细胞测序分析，识别了与胃癌相关的血浆蛋白质 | 首次通过孟德尔随机化分析和单细胞测序技术，系统地识别了与胃癌因果相关的血浆蛋白质 | 研究仅基于现有数据进行分析，未进行实验验证 | 识别与胃癌因果相关的血浆蛋白质，探索新的遗传靶点 | 胃癌及其相关血浆蛋白质 | 数字病理学 | 胃癌 | 孟德尔随机化分析、单细胞测序 | NA | 蛋白质数据、基因表达数据 | 4907个血浆蛋白质样本、基因表达数据库中的单细胞测序数据 |
| 9060 | 2024-09-17 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Early Effects of Ionizing Radiation on Bone Marrow Mononuclear Cells in Mice
2024-Aug-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25179287
PMID:39273235
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组测序揭示电离辐射对小鼠骨髓单核细胞的早期影响 | 首次通过单细胞转录组测序技术研究电离辐射对骨髓中不同造血细胞群体的早期响应基因，揭示了放射敏感性和放射抗性细胞之间的基因表达差异 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类样本 | 探讨电离辐射对骨髓中不同造血细胞群体的放射敏感性和抗性的分子机制 | 小鼠骨髓中的单核细胞，包括粒细胞-巨噬细胞祖细胞、造血干细胞/祖细胞、B细胞、中性粒细胞、自然杀伤细胞、T细胞和树突状细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 多种骨髓造血细胞群体 |