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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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9021 | 2025-10-07 |
Fibroblast Activation Protein-α Expression in Cancer-Associated Fibroblasts Shows the Poor Survival of Colorectal Cancer via Immune-Mediated Pathways : Implications of FAP in Cancer-Associated Fibroblasts Link Immune Dysregulation to Adverse Survival in Colorectal Cancer
2025-Mar, Annals of surgical oncology
IF:3.4Q1
DOI:10.1245/s10434-024-16593-y
PMID:39623187
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研究论文 | 本研究探讨了癌症相关成纤维细胞中FAP-α表达通过免疫介导途径影响结直肠癌患者生存的机制 | 首次通过免疫组化和单细胞RNA测序相结合的方法,系统揭示FAP表达与肿瘤免疫微环境及患者生存的关联 | 样本量相对有限,且为单中心回顾性研究 | 阐明FAP在结直肠癌肿瘤微环境中的作用及其对患者生存的影响 | 结直肠癌患者肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 免疫组化染色, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 基因表达数据 | 178例患者共180个病理切片,另加10例未治疗患者的单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9022 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals a key regulator ZmEREB14 affecting shoot apex development and yield formation in maize
2025-Mar, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14537
PMID:39630144
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示ZmEREB14转录因子调控玉米茎尖分生组织发育和产量形成的机制 | 首次在单细胞分辨率下解析玉米茎尖分生组织的细胞异质性,并鉴定出ZmEREB14等关键转录因子调控发育过程 | 研究仅针对5日龄玉米茎尖组织,未涵盖其他发育阶段 | 探究玉米茎尖分生组织发育的分子机制 | 玉米茎尖分生组织细胞 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约12,700个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9023 | 2025-10-07 |
Hypoxia regulates small extracellular vesicle biogenesis and cargo sorting through HIF-1α/HRS signaling pathway in head and neck squamous cell carcinoma
2025-Mar, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111546
PMID:39631619
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研究论文 | 本研究揭示了头颈鳞状细胞癌中缺氧通过HIF-1α/HRS信号通路调控小细胞外囊泡生物发生和货物分选的机制 | 首次发现HIF-1α转录激活HRS调控sEV生物发生,建立了缺氧反应与sEV货物包装的直接联系 | 研究主要聚焦于头颈鳞状细胞癌细胞系,缺乏体内实验验证 | 探索缺氧肿瘤微环境对小细胞外囊泡生物发生和货物分选的调控机制 | 头颈鳞状细胞癌细胞 | 细胞生物学 | 头颈鳞状细胞癌 | 空间转录组学,免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
9024 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-seq reveals diverse molecular signatures associated with Methotrexate resistance in primary central nervous system lymphoma cells
2025-Mar, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-024-04893-y
PMID:39636551
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示原发性中枢神经系统淋巴瘤细胞中与甲氨蝶呤耐药相关的分子特征 | 首次在单细胞水平分析PCNSL细胞对甲氨蝶呤的耐药机制,并鉴定出HLA-DRβ1、HLA-DQβ1和SNRPG等关键枢纽基因 | 研究基于培养细胞系,未涉及临床患者样本验证 | 探索PCNSL细胞对甲氨蝶呤耐药的分子机制,为复发患者寻找挽救性化疗方案 | 亲代和甲氨蝶呤耐药的原发性中枢神经系统淋巴瘤细胞 | 单细胞测序分析 | 原发性中枢神经系统淋巴瘤 | 单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 两个数据集(HKBML和TK)的PCNSL细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9025 | 2025-10-07 |
Cancer-associated fibroblast-derived MMP11 promotes tumor progression in pancreatic cancer
2025-Mar, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16418
PMID:39639765
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研究论文 | 本研究揭示了胰腺导管腺癌中癌症相关成纤维细胞来源的MMP11通过PI3K/AKT通路促进肿瘤进展的新机制 | 首次在单细胞水平明确MMP11在胰腺癌中的表达模式,发现癌细胞通过TGF-β1/pSmad2/3通路激活CAFs产生MMP11,并证明MMP11通过诱导上皮间质转化而非细胞外基质重塑促进肿瘤进展 | 研究主要聚焦于MMP11的促癌功能,对其他可能的调控机制和临床转化价值探讨有限 | 探究MMP11在胰腺导管腺癌中的表达模式、细胞来源及其促进肿瘤进展的分子机制 | 胰腺导管腺癌组织、癌症相关成纤维细胞、AsPC-1和BxPC-3胰腺癌细胞系、裸鼠模型 | 肿瘤生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、共免疫荧光染色、基因敲低、体外功能实验、动物模型 | NA | 基因表达数据、免疫荧光图像、功能实验数据 | 胰腺癌组织样本、两种胰腺癌细胞系、裸鼠移植瘤模型 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
9026 | 2025-10-07 |
DRIM modulates Src activation and regulates angiogenic functions in vascular endothelial cells
2025-Mar, Cell biology international
IF:3.3Q3
DOI:10.1002/cbin.12265
PMID:39648301
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研究论文 | 本研究揭示了DRIM蛋白在血管内皮细胞中的双重定位及其通过调控Src激酶影响血管生成功能的新机制 | 首次发现DRIM在血管内皮细胞中同时存在于细胞核和细胞骨架,并证实其通过调控Src激酶活性影响血管生成功能 | 研究仅限于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证 | 探究DRIM蛋白在血管内皮细胞中的定位、功能及其分子机制 | 人血管内皮细胞 | 细胞生物学 | 血管疾病 | 蛋白质分馏法、细胞成像、蛋白质组学分析、蛋白质相互作用检测 | 基因敲低模型 | 蛋白质定位图像、蛋白质组学数据、磷酸化检测数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
9027 | 2025-10-07 |
Fuzzy-Based Identification of Transition Cells to Infer Cell Trajectory for Single-Cell Transcriptomics
2025-Mar, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2023.0432
PMID:39670822
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研究论文 | 提出一种基于模糊聚类的单细胞轨迹推断方法scFCTI,用于识别过渡细胞并重建细胞发育轨迹 | 引入模糊聚类和细胞不确定性量化,能够识别不稳定细胞状态中的过渡细胞 | NA | 开发更精确的单细胞轨迹推断方法 | 单细胞转录组数据中的细胞发育轨迹 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 模糊聚类 | 单细胞转录组数据 | 五个真实数据集和四个不同结构模拟数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9028 | 2025-10-07 |
Spatially Resolved Single-Cell Transcriptome Analysis of Mycosis Fungoides Reveals Distinct Biomarkers GNLY and FYB1 Compared With Psoriasis and Chronic Spongiotic Dermatitis
2025-Mar, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2024.100681
PMID:39675427
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研究论文 | 通过空间分辨单细胞转录组分析鉴定蕈样肉芽肿与银屑病和慢性海绵水肿性皮炎的区别性生物标志物GNLY和FYB1 | 首次使用空间分辨单细胞转录组技术分析表皮内T细胞,发现GNLY和FYB1作为区分蕈样肉芽肿与炎症性皮肤病的特异性生物标志物 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证生物标志物的临床适用性 | 探索区分蕈样肉芽肿与炎症性皮肤病的诊断标志物 | 蕈样肉芽肿斑块、银屑病和慢性海绵水肿性皮炎患者的表皮内T细胞 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞转录组测序,免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据,空间分子成像数据 | 150例患者(56例蕈样肉芽肿,48例银屑病,46例慢性湿疹) | CosMx | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | CosMx空间分子成像仪 | 使用CD3和CD4等表面标记物的CosMx空间分子成像技术 |
9029 | 2025-10-07 |
Creatine promotes endometriosis progression by inducing M2 polarization of peritoneal macrophages
2025-Mar-01, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-24-0278
PMID:39679878
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研究论文 | 本研究揭示了肌酸通过诱导腹膜巨噬细胞M2极化促进子宫内膜异位症进展的机制 | 首次发现肌酸在子宫内膜异位症患者腹膜巨噬细胞中显著富集,并证实其通过重编程巨噬细胞M2极化促进疾病进展 | 研究主要基于体外实验,需要进一步体内实验验证 | 探讨肌酸在子宫内膜异位症发病机制中的作用 | 子宫内膜异位症患者的腹膜巨噬细胞、子宫内膜基质细胞和HUVECs | 免疫学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞测序, RNA测序, 体外共培养实验 | NA | 单细胞测序数据, RNA测序数据 | 子宫内膜异位症患者与健康女性的腹膜巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9030 | 2025-10-07 |
TEAD3 and TEAD4 play overlapping role in bovine preimplantation development
2025-Mar-01, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-24-0307
PMID:39679917
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研究论文 | 本研究揭示了TEAD3和TEAD4在牛胚胎植入前发育过程中对滋养外胚层命运决定的重要且冗余的功能 | 首次发现TEAD3在牛滋养外胚层细胞中特异性表达,并证明TEAD3与TEAD4在牛胚胎发育中具有功能冗余性,这与小鼠模型中的机制不同 | 研究仅针对牛胚胎发育模型,未在其他哺乳动物中进行验证 | 确定TEAD3在牛胚胎植入前发育中的功能作用 | 牛胚胎植入前发育阶段的胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,RNA干扰,碱基编辑技术,RNA测序分析,免疫荧光分析 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
9031 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing of chronic idiopathic erythroderma defines disease-specific markers
2025-Mar, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.11.037
PMID:39694280
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析慢性特发性红皮病的分子特征,揭示其特异性生物标志物 | 首次在慢性特发性红皮病中发现CD8A+KLRK1+ T细胞克隆的持续低水平扩增特征,并鉴定出CCR10+FUT7+皮肤归巢T细胞的特异性表达模式 | 样本量较小(5例CIE患者),需要更大规模研究验证发现 | 建立慢性特发性红皮病的分子疾病图谱 | 慢性特发性红皮病患者的血液和皮肤组织 | 单细胞基因组学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序,T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5例慢性特发性红皮病,8例红皮病性皮肤T细胞淋巴瘤,15例中重度特应性皮炎,10例银屑病,20例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9032 | 2025-10-07 |
Radiotherapy-resistant prostate cancer cells escape immune checkpoint blockade through the senescence-related ataxia telangiectasia and Rad3-related protein
2025-Mar, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12636
PMID:39698847
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研究论文 | 本研究揭示了放疗抵抗性前列腺癌细胞通过衰老相关的ATR蛋白逃逸免疫检查点阻断的分子机制 | 首次发现胞质ATR通过磷酸化CD86并增强其与E3连接酶MARCH1的相互作用,从而降低抗原呈递能力,介导免疫检查点阻断抵抗 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型,临床样本验证有限 | 探究前列腺癌放疗后对免疫检查点阻断产生抵抗的分子机制 | 前列腺癌细胞(LNCaP)、临床患者样本、小鼠移植瘤模型 | 癌症免疫学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 免疫共沉淀, 点突变, Western blotting | 小鼠异种移植模型 | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9033 | 2025-10-07 |
Human Pancreatic Cancer Single-Cell Atlas Reveals Association of CXCL10+ Fibroblasts and Basal Subtype Tumor Cells
2025-Feb-17, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2183
PMID:39636224
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研究论文 | 通过构建人类胰腺癌单细胞图谱,揭示了CXCL10+成纤维细胞与基底亚型肿瘤细胞之间的空间关联 | 发现了CXCL10+癌症相关成纤维细胞与基底肿瘤细胞的新型富集和空间关联,并证实导管细胞也表达CXCL10受体CXCR3 | 研究主要基于公共数据的整合分析,需要进一步实验验证 | 开发胰腺导管腺癌的基因组资源,识别新的治疗靶点 | 人类胰腺癌组织样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫染色 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 免疫染色图像 | 229例患者样本的单细胞数据, 744例批量RNA-seq, 22例空间转录组 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
9034 | 2025-10-07 |
NLRP3 inflammasome mediates pyroptosis of alveolar macrophages to induce radiation lung injury
2025-Feb-15, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136740
PMID:39642726
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研究论文 | 本研究揭示NLRP3炎症小体通过介导肺泡巨噬细胞焦亡诱导放射性肺损伤的机制 | 首次阐明肺泡巨噬细胞是放射性肺损伤中最早发生焦亡的细胞类型,并证实NLRP3炎症小体在其中起核心作用 | NA | 探究放射性肺损伤中肺泡巨噬细胞焦亡和炎症小体激活的分子机制 | 肺泡巨噬细胞、免疫细胞、肺组织微环境 | 生物医学研究 | 放射性肺损伤 | 多色流式细胞术、单细胞RNA测序、质谱分析、免疫共沉淀、Duolink邻近连接技术 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质相互作用数据、细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9035 | 2025-10-07 |
Diffusion-based generation of gene regulatory networks from scRNA-seq data with DigNet
2025-Feb-14, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279551.124
PMID:39694856
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研究论文 | 提出了一种名为DigNet的离散扩散生成模型,能够从单细胞RNA测序数据生成基因调控网络 | 采用多步恢复过程的离散扩散生成模型,通过iMetacell整合和非欧几里得离散空间建模,确保全局网络结构与调控模块的兼容性 | NA | 从单细胞RNA测序数据逆向工程构建细胞特异性基因调控网络 | 基因调控网络和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 扩散模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9036 | 2025-10-07 |
Cardiac Reprogramming and Gata4 Overexpression Reduce Fibrosis and Improve Diastolic Dysfunction in Heart Failure With Preserved Ejection Fraction
2025-Feb-11, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究探讨心脏重编程和Gata4过表达对HFpEF小鼠模型中心脏纤维化和舒张功能障碍的改善作用 | 首次证明Gata4单独过表达足以抑制心脏成纤维细胞活化并改善HFpEF,无需生成新的心肌细胞 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用效果需进一步验证 | 探索心脏重编程对HFpEF的治疗潜力 | Tcf21iCre/Tomato/MGTH2A转基因小鼠和人类心脏成纤维细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | RNA测序,单细胞RNA测序,空间转录组学 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据 | 转基因小鼠模型和人类心脏成纤维细胞 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
9037 | 2025-10-07 |
Highly efficient combination of multiple single cells using a deterministic single-cell combinatorial reactor
2025-Feb-11, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d4lc00951g
PMID:39679936
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研究论文 | 介绍一种新型微流控设备DSCR,用于高效组合多个单细胞 | 开发了结合多层互连Si/SiO控制电路的微流控设备,实现多细胞群体的确定性组合 | 仅使用PC3细胞系进行验证,未在其他细胞类型中测试 | 实现多个单细胞的高效配对和组合 | PC3前列腺癌细胞 | 单细胞技术 | 前列腺癌 | 微流控技术,荧光染色 | NA | 荧光成像数据 | 三组不同荧光染色的PC3细胞 | NA | 单细胞组合分析 | DSCR设备 | 确定性单细胞组合反应器,包含SiO钝化层蚀刻的细胞尺寸陷阱孔和多层电极互连系统 |
9038 | 2025-10-07 |
The retinoic acid family-like nuclear receptor SmRAR identified by single-cell transcriptomics of ovarian cells controls oocyte differentiation in Schistosoma mansoni
2025-Feb-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1228
PMID:39676663
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研究论文 | 通过曼氏血吸虫卵巢细胞的单细胞转录组学鉴定出视黄酸家族样核受体SmRAR,并发现其控制卵母细胞分化 | 首次在寄生虫扁形动物中应用单细胞转录组学技术研究生殖发育,鉴定出新的转录因子SmRAR及其在卵母细胞分化中的关键作用 | 研究仅针对曼氏血吸虫,对其他扁形动物的适用性有待验证;样本来源仅限于配对雌虫的卵巢 | 探索曼氏血吸虫卵巢发育和卵母细胞分化的分子机制 | 曼氏血吸虫的卵巢细胞和卵母细胞 | 单细胞转录组学 | 血吸虫病 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 1967个卵母细胞,表达7872个基因 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9039 | 2025-10-07 |
Advancing our understanding of root development: Technologies and insights from diverse studies
2025-Feb-07, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiae605
PMID:39688896
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综述 | 本文综述了根系发育研究中的关键技术进展,重点介绍了单细胞基因表达分析技术的变革性影响 | 强调单细胞RNA测序技术如何革新根系生物学研究,实现细胞特异性基因表达分析,构建根系图谱和基因调控网络 | NA | 探讨根系发育研究的技术进展及其在植物生物学中的应用 | 植物根系发育过程及相关技术方法 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、多模态分析、生物信息学、成像技术、建模、CRISPR基因编辑、生物传感器、微流控设备 | NA | 基因表达数据、成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9040 | 2025-10-07 |
Exosomal miRNA reprogramming in pyroptotic macrophage drives silica-induced fibroblast-to-myofibroblast transition and pulmonary fibrosis
2025-Feb-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136629
PMID:39603130
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研究论文 | 本研究揭示二氧化硅纳米颗粒通过诱导巨噬细胞焦亡释放外泌体miRNA,驱动成纤维细胞向肌成纤维细胞转化并促进肺纤维化的机制 | 首次发现焦亡巨噬细胞来源的外泌体miRNA重编程在硅肺纤维化中的关键作用,并采用单细胞测序和高通量miRNA测序技术系统解析其分子机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验,尚未在人体中验证相关机制 | 阐明二氧化硅诱导肺纤维化的分子机制 | 巨噬细胞、成纤维细胞、肺组织 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序, miRNA测序, 高光谱成像 | 人工智能病理识别 | 基因表达数据, 图像数据 | 硅肺小鼠模型及体外细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |