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当前共找到 38047 篇文献，本页显示第 9001 - 9020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9001 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals palmitoylation-driven cellular heterogeneity and prognostic biomarkers in lung adenocarcinoma
2025-Nov, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102501
PMID:40811979
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示棕榈酰化驱动的肺腺癌细胞异质性并建立预后生物标志物 | 首次在单细胞水平系统分析棕榈酰化对肺腺癌细胞异质性的影响，并开发了基于棕榈酰化特征的12基因风险模型 | 研究结果需要在更多独立队列中进一步验证，实验验证主要集中于ASPH基因 | 探索棕榈酰化修饰在肺腺癌细胞异质性和预后预测中的作用 | 肺腺癌患者肿瘤细胞 | 数字病理 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序，GSVA，ssGSEA，拷贝数变异分析，伪时间序列分析，细胞互作分析 | 风险预测模型 | 单细胞RNA测序数据，批量RNA测序数据 | TCGA数据集和多个GEO数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 9002 | 2025-10-05 |
Elucidating the therapeutic mechanisms of resveratrol in benign prostatic hyperplasia via an integrated strategy of network pharmacology, multi-omics and molecular biology
2025-Nov, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157165
PMID:40839986
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研究论文 | 通过整合网络药理学、多组学分析和分子生物学方法，阐明白藜芦醇治疗良性前列腺增生的作用机制 | 首次整合网络药理学、单细胞转录组、分子对接和分子动力学模拟等多种方法系统研究白藜芦醇对BPH的治疗机制 | 研究主要基于体外实验，需要进一步体内实验验证 | 阐明白藜芦醇治疗良性前列腺增生的药理机制和关键信号通路 | 良性前列腺增生疾病模型和前列腺细胞 | 生物信息学 | 前列腺癌相关疾病 | 网络药理学, 单细胞RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟, 体外实验验证 | NA | 转录组数据, 蛋白质数据, 分子相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 9003 | 2025-10-05 |
Genistein ameliorates thoracic aortic dissection by inhibiting CB1 receptor hyperactivation and modulating its-mediated cAMP-PKA signaling
2025-Nov, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157178
PMID:40845589
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研究论文 | 本研究探讨染料木黄酮通过抑制CB1受体过度激活并调节其介导的cAMP-PKA信号通路来改善胸主动脉夹层的作用机制 | 首次揭示CB1受体在胸主动脉夹层中的过度表达及其通过抑制cAMP-PKA信号通路促进疾病发展的机制，并发现染料木黄酮通过靶向该通路发挥治疗作用 | 研究主要聚焦于CB1受体-cAMP-PKA信号轴，可能还存在其他未被探索的分子机制参与胸主动脉夹层的发病过程 | 研究染料木黄酮通过抑制CB1受体和调节cAMP-PKA信号通路缓解胸主动脉夹层进展的潜力 | 血管平滑肌细胞(VSMCs)和胸主动脉夹层动物模型 | 心血管疾病研究 | 胸主动脉夹层 | 单细胞RNA测序，体外和体内实验 | NA | 基因表达数据，病理学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9004 | 2025-10-05 |
Immune cell transcriptional profiles from pre-vaccination peripheral blood predict immune response to preventative MUC1 cancer vaccine
2025-Oct-01, European journal of cancer (Oxford, England : 1990)
DOI:10.1016/j.ejca.2025.115685
PMID:40815873
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析疫苗接种前外周血免疫细胞转录谱，预测MUC1癌症预防疫苗的免疫反应 | 首次使用单细胞RNA测序技术结合机器学习方法识别疫苗免疫反应的预测性生物标志物 | 样本量较小（16名应答者和16名无应答者），需要在更大队列中进一步验证 | 预测癌症预防疫苗的免疫反应并识别相关生物标志物 | 曾患晚期结肠腺瘤的个体 | 生物信息学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序，机器学习 | 贝叶斯图分析 | 单细胞转录组数据 | 32个疫苗接种前外周血单个核细胞样本（16名应答者和16名无应答者） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9005 | 2025-10-05 |
Selective EPAC1 activators enhance endothelial function in models of vascular inflammation
2025-Oct, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2025.107923
PMID:40848957
|
研究论文 | 本研究通过体外和离体模型探讨选择性EPAC1激活剂在血管炎症中改善内皮功能的作用机制 | 首次系统验证选择性EPAC1激活剂在多种血管炎症模型中恢复内皮功能的作用，并揭示其通过上调SOCS3抑制JAK/STAT3信号通路的分子机制 | 研究主要基于体外和离体模型，缺乏在体动物模型的验证 | 探究EPAC1在调节血管炎症和损伤中的作用及其治疗潜力 | 小鼠主动脉、人冠状动脉、血管内皮细胞、平滑肌细胞和巨噬细胞 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，三细胞共培养系统 | NA | 基因表达数据，功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9006 | 2025-10-05 |
Toxic Switch and Key Effectors of Cu in Zebrafish Gills: Coupling Single-Cell RNA Sequencing and Redox Imaging
2025-Sep-22, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.5c05966
PMID:40983989
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和氧化还原成像技术揭示了铜在斑马鱼鳃中的毒性开关机制 | 首次结合单细胞RNA测序与原位荧光探针技术，系统识别铜毒性开关和关键效应因子 | 研究仅针对斑马鱼鳃组织，结果在其他水生生物中的普适性需要进一步验证 | 探究铜污染对水生生物的毒性机制，特别是毒性开关和关键效应因子 | 斑马鱼鳃组织细胞 | 单细胞生物学 | 重金属中毒 | 单细胞RNA测序, 原位荧光成像 | NA | 单细胞转录组数据, 荧光成像数据 | 斑马鱼鳃组织细胞（6个显著变化的细胞群体） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9007 | 2025-10-05 |
Protocol for single-cell dissociation of head and neck cancer organoids
2025-Sep-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103930
PMID:40616840
|
研究论文 | 本文介绍了一种将头颈部鳞状细胞癌患者来源类器官解离为可用于下游应用的活单细胞悬液的实验方案 | 开发了通过0.05%胰蛋白酶孵育和温和机械解离最大化单细胞产量的优化方案，避免高浓度胰蛋白酶和长时间孵育导致的细胞聚集和活力下降 | NA | 建立头颈部癌症类器官单细胞解离的实验方案 | 头颈部鳞状细胞癌患者来源类器官 | NA | 头颈部癌症 | 单细胞RNA测序，药物筛选，流式细胞术，活细胞成像 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9008 | 2025-10-05 |
Protocol for predicting single- and multiple-dose-dependent gene expression using deep generative learning
2025-Sep-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103932
PMID:40650899
|
研究论文 | 提出使用深度生成学习预测单剂量和多剂量依赖性基因表达的协议 | 开发了scVIDR模型，一种专门用于模拟剂量依赖性化学扰动下单细胞基因表达的变分自编码器 | NA | 建立预测剂量依赖性基因表达的计算方法 | 单细胞基因表达数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | VAE（变分自编码器） | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9009 | 2025-10-05 |
Protocol for conducting a single-cell sequencing assay for transposase-accessible chromatin analysis
2025-Sep-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103960
PMID:40700014
|
研究论文 | 本文提供了一个使用公开数据集进行单细胞ATAC测序分析的详细操作流程 | 为scATAC-seq分析新手提供了标准化的分析流程指南，包括数据预处理、下游分析和计算多组学整合 | 仅使用公开数据集作为示例，未涉及实验设计或数据生成阶段 | 建立标准化的单细胞ATAC测序分析流程 | 单细胞染色质可及性数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞ATAC测序 | NA | 基因组测序数据 | 公开数据集（未指定具体样本数量） | NA | single-cell ATAC-seq | NA | NA |
| 9010 | 2025-10-05 |
Protocol for automated graph-based clustering of single-cell RNA-seq data with application in mouse intestinal stem cells
2025-Sep-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104000
PMID:40748762
|
研究论文 | 提出一种从小鼠肠道分离高度纯化的隐窝上皮细胞并进行单细胞RNA测序的自动化流程 | 开发了ACDC Python软件包，实现大规模单细胞RNA测据集的自动化图论聚类分析 | 主要针对小鼠空肠优化，但可适用于其他肠道区域 | 建立单细胞RNA测序数据的自动化聚类分析流程 | 小鼠肠道隐窝上皮细胞 | 单细胞测序分析 | NA | 单细胞RNA测序 | 图论聚类算法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9011 | 2025-10-05 |
Predicting the structural impact of human alternative splicing
2025-Sep-17, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03744-x
PMID:40963109
|
研究论文 | 使用AlphaFold2预测人类选择性剪接异构体的结构影响 | 首次大规模预测人类选择性剪接异构体的三维结构，并系统分析剪接对结构特性的影响 | 仅基于计算预测，缺乏实验验证 | 研究选择性剪接对蛋白质结构和功能的影响 | 11,000多个人类剪接异构体 | 计算生物学 | NA | 蛋白质结构预测，单细胞RNA测序 | AlphaFold2 | 蛋白质序列，单细胞RNA-seq数据 | 超过11,000个人类剪接异构体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | Tabula Sapiens项目的单细胞RNA-seq数据 |
| 9012 | 2025-10-05 |
LIGHT in combination with IL-13 or IL-17 drives inflammatory transcriptional signatures in human pulmonary fibroblasts relevant for human lung disease
2025-Sep-17, ImmunoHorizons
DOI:10.1093/immhor/vlaf042
PMID:40972652
|
研究论文 | 本研究探讨LIGHT与IL-13或IL-17协同作用对人肺成纤维细胞炎症转录特征的影响 | 首次揭示LIGHT与IL-13/IL-17的协同作用能诱导更强的炎症转录特征，并验证这些特征在间质性肺病患者成纤维细胞中存在 | 研究主要基于体外实验，需要进一步体内验证 | 探究驱动肺成纤维细胞炎症转录特征的细胞因子及其在肺部疾病中的作用 | 人肺成纤维细胞 | 转录组学 | 肺部疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9013 | 2025-10-05 |
Smooth muscle expression of RNA editing enzyme ADAR1 controls activation of the RNA sensor MDA5 in atherosclerosis
2025-Sep-16, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-025-00710-5
PMID:40958051
|
研究论文 | 本研究揭示了RNA编辑酶ADAR1通过调控MDA5激活在动脉粥样硬化中的保护机制 | 首次发现平滑肌细胞特异性需要RNA编辑，并阐明ADAR1-MDA5轴在动脉粥样硬化中的细胞类型特异性调控机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需进一步扩展 | 探究RNA编辑在冠状动脉疾病中的作用机制 | 人类斑块样本、人冠状动脉平滑肌细胞、条件性基因敲除小鼠模型 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，基因敲除技术 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | Athero-Express颈动脉内膜切除队列样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9014 | 2025-10-05 |
Systematic identification of oscillatory gene expression in single cell types
2025-Sep-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.02.673125
PMID:40950173
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和新型计算方法系统识别了单个细胞类型中的振荡基因表达 | 开发了识别振荡基因和细胞类型的严格统计方法，首次在胶质细胞等被忽视的细胞类型中发现振荡基因表达 | 未在神经元或肌肉细胞中检测到振荡基因表达，可能存在技术检测限制 | 系统识别单个细胞类型中的振荡基因表达模式 | 果蝇幼虫发育过程中的各种细胞类型 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, PCA分析, UMAP分析 | 统计模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9015 | 2025-10-05 |
Absolute copy number aware CNV calling of sub-megabase segments in ultra-low coverage single-cell DNA sequencing data
2025-Sep-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf919
PMID:40973453
|
研究论文 | 提出ASCENT计算方法，用于超低覆盖度单细胞DNA测序数据中的拷贝数变异检测 | 基于统计建模而非参考比较实现真正的绝对拷贝状态推断，并实现无需参考的拷贝中性杂合性缺失检测 | 未提及具体样本数量限制或方法适用范围 | 开发适用于超低覆盖度单细胞DNA测序数据的拷贝数变异检测方法 | 单细胞DNA测序数据，特别是儿科B-ALL样本 | 生物信息学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 全基因组测序，单细胞DNA测序 | 统计建模，联合分割方法 | DNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞DNA测序，全基因组测序 | NA | 基于直接tagmentation的全基因组测序 |
| 9016 | 2025-10-05 |
Mining Spatial Transcriptomics Datasets using DeepSpaceDB
2025-Sep-05, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/68892
PMID:40982393
|
研究论文 | 介绍空间转录组学数据库DeepSpaceDB及其在生物医学研究中的应用 | 开发了首个综合性动态空间转录组学数据库DeepSpaceDB，提供先进工具和交互功能 | 空间转录组学仍是一项高度专业化的实验技术，存在显著的技术和财务限制 | 促进空间转录组学数据的可及性和探索 | 小鼠脑组织样本和结直肠癌转移的鼠肝组织 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 多个公开数据集（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9017 | 2025-10-05 |
Morphogen-guided neocortical organoids recapitulate regional areal identity and model neurodevelopmental disorder pathology
2025-Sep-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.02.672952
PMID:40950130
|
研究论文 | 本研究开发了一种通过形态发生素引导生成具有区域特异性的大脑皮层类器官的方法，并利用该平台模拟神经发育障碍病理 | 通过短期早期暴露于前部或后部形态发生素，建立了能够重现大脑皮层区域特性的类器官模型 | 当前的大脑皮层类器官模型在很大程度上未能重现这种区域化模式 | 建立能够模拟大脑皮层区域特性并研究神经发育障碍病理的平台 | 人类新皮层类器官和脆性X综合征模型 | 发育神经生物学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9018 | 2025-10-05 |
Multi-omics investigation of Bisphenol A in gastrointestinal carcinogenesis: a network toxicology and molecular docking approach
2025-Sep, Environment international
IF:10.3Q1
DOI:10.1016/j.envint.2025.109785
PMID:40939530
|
研究论文 | 通过多组学方法和分子对接技术研究双酚A在胃肠道肿瘤发生中的致癌机制 | 首次系统整合转录组学和单细胞转录组学数据，揭示BPA通过代谢重编程、肿瘤微环境重塑和细胞周期失调三重机制促进胃肠道肿瘤发生 | 基于数据库分析，需要进一步实验验证 | 系统研究双酚A在胃肠道肿瘤中的潜在致癌机制 | 肝内胆管癌、结直肠癌和食管癌三种胃肠道肿瘤 | 生物信息学 | 胃肠道肿瘤 | 网络毒理学、分子对接、转录组学、单细胞转录组学 | 分子对接模型 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9019 | 2025-10-05 |
Scaling up spatial transcriptomics for large-sized tissues: uncovering cellular-level tissue architecture beyond conventional platforms with iSCALE
2025-Sep, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02770-8
PMID:40954300
|
研究论文 | 本研究开发了iSCALE方法，用于重建大规模超分辨率基因表达图谱并自动注释超出当前空间转录组平台捕获区域样本的细胞级组织结构 | 突破了现有空间转录组技术在成本、周转时间、分辨率、基因覆盖度和组织捕获面积方面的限制，能够分析超出常规平台捕获范围的大型组织样本 | 未明确说明样本数量的限制或方法在其他组织类型中的适用性 | 开发能够分析大型组织样本的空间转录组方法，揭示传统方法无法检测的细胞特征 | 多发性硬化症人类脑组织样本 | 空间转录组学 | 多发性硬化症 | 空间转录组学，免疫组织化学染色 | NA | 基因表达数据，空间位置数据，病理学注释 | NA | NA | 空间转录组学 | iSCALE | 能够重建大规模超分辨率基因表达图谱并自动注释细胞级组织结构的方法 |
| 9020 | 2025-10-05 |
A basophil-fibroblast pro-inflammatory axis fuels type 2 skin inflammation
2025-Aug-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116114
PMID:40782349
|
研究论文 | 本研究通过单细胞时空图谱揭示了嗜碱性粒细胞与成纤维细胞之间的促炎轴在2型皮肤炎症中的关键调控作用 | 首次发现嗜碱性粒细胞通过分泌OSM和IL-4协同激活促炎性成纤维细胞，形成正向反馈环路驱动皮肤炎症 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需进一步开展 | 阐明2型皮肤炎症的细胞分子机制 | 小鼠皮肤炎症模型中的细胞相互作用 | 单细胞生物学 | 特应性皮炎 | MERFISH, scRNA-seq | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 约430,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |