本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']
”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!
除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
8981 | 2025-10-07 |
Checkpoint kinase 1 as a promising target in colorectal cancer management
2025-Apr-24, World journal of clinical oncology
IF:2.6Q3
DOI:10.5306/wjco.v16.i4.104213
PMID:40290692
|
评论 | 探讨检查点激酶1在结直肠癌中作为生物标志物和治疗靶点的重要作用 | 通过单细胞RNA测序和免疫组化证实CHEK1在结直肠癌组织中显著过表达,并发现氯化两面针碱作为有效的CHEK1抑制剂可破坏DNA损伤修复通路 | 需要进一步研究来解决结直肠癌治疗中的空白 | 评估CHEK1在结直肠癌管理中的治疗潜力 | 结直肠癌组织和CHEK1抑制剂 | 癌症研究 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 组织切片图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8982 | 2025-10-07 |
Candida albicans and colorectal cancer: A paradoxical role revealed through metabolite profiling and prognostic modeling
2025-Apr-24, World journal of clinical oncology
IF:2.6Q3
DOI:10.5306/wjco.v16.i4.104182
PMID:40290696
|
研究论文 | 通过代谢物分析和预后建模揭示白色念珠菌在结直肠癌中的双重作用 | 首次建立整合白色念珠菌与结直肠癌的预后模型,并发现其代谢混合物对结直肠癌的抑制作用 | 研究主要基于体外细胞实验,需要进一步体内验证 | 探究白色念珠菌在结直肠癌发生发展中的双重角色及其机制 | 结直肠癌细胞系(HT29、HCT116)和正常结肠上皮细胞(NCM460) | 生物信息学 | 结直肠癌 | 液相色谱-质谱联用,单细胞测序,空间转录组学,孟德尔随机化 | 预后模型 | 基因表达数据,代谢组数据 | 多种结直肠癌细胞系和正常结肠上皮细胞 | NA | 单细胞测序,空间转录组学 | NA | NA |
8983 | 2025-10-07 |
Single-Cell Profiling Reveals Global Immune Responses During the Progression of Murine Epidermal Neoplasms
2025-Apr-21, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17081379
PMID:40282557
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小鼠表皮肿瘤进展过程中的全局免疫细胞响应 | 首次在单细胞水平系统描绘皮肤肿瘤微环境中免疫细胞的全景图谱,发现巨噬细胞作为主要通讯枢纽的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类样本中验证 | 全面表征皮肤肿瘤进展过程中的免疫细胞响应 | 对照小鼠皮肤和皮肤肿瘤中的免疫细胞 | 单细胞组学 | 皮肤肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8984 | 2025-10-07 |
Discovery of Genomic Targets and Therapeutic Candidates for Liver Cancer Using Single-Cell RNA Sequencing and Molecular Docking
2025-Apr-17, Biology
DOI:10.3390/biology14040431
PMID:40282296
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和分子对接技术发现肝癌的基因组靶点和治疗候选药物 | 结合两种先进混合方法和四种高性能个体方法分析单细胞RNA测序数据,识别出36个枢纽基因并提出10种潜在治疗药物 | 研究基于有限的数据集和42个受体蛋白中的14个进行验证,需要进一步实验确认 | 揭示肝癌的基因组特征并发现潜在治疗药物 | 肝癌细胞 | 生物信息学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 分子对接 | 混合基因识别方法 | 单细胞RNA测序数据 | 四个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8985 | 2025-10-07 |
The integration of scRNA-seq with microarray and in-vivo experiments facilitates a comprehensive elucidation of the molecular mechanisms underlying endothelial cell involvement in myocardial infarction
2025-Apr-14, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151820
PMID:40288264
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、微阵列数据和体内实验,阐明了内皮细胞在心肌梗死中的分子机制 | 首次结合单细胞RNA测序、hdWGCNA分析和细胞通讯分析,系统识别并验证了内皮细胞在心肌梗死中的关键基因 | 研究主要依赖公共数据库数据,体内实验验证的基因数量有限 | 识别内皮细胞在心肌梗死进展中的关键基因并验证其功能 | 心肌梗死相关内皮细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 微阵列, 蛋白质-蛋白质相互作用分析, 免疫荧光, Western blot, qPCR | hdWGCNA, Seurat, CellChat, scCODE, FindMarkers | 基因表达数据, 实验数据 | 来自GEO数据库的scRNA-seq和微阵列数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列 | NA | NA |
8986 | 2025-10-07 |
G0S2 Promotes PD-L1 Expression in Monocytes and Influences the Efficacy of PD-1 Inhibitors in Hepatocellular Carcinoma
2025-Apr-13, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16040448
PMID:40282408
|
研究论文 | 本研究探讨G0S2基因在肝细胞癌单核细胞中调控PD-L1表达的作用及其对PD-1抑制剂疗效的影响 | 首次揭示G0S2通过上调单核细胞PD-L1表达抑制T细胞活性,导致PD-1抑制剂耐药的新机制 | 研究主要基于体外细胞实验和回顾性数据分析,需要更多临床前瞻性研究验证 | 阐明G0S2在肝细胞癌免疫治疗耐药中的作用机制 | 肝细胞癌患者组织样本、外周血单核细胞和THP-1单核细胞系 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序, 免疫组织化学, 流式细胞术, 基因敲低 | NA | 基因表达数据, 组织图像, 细胞表型数据 | 肝细胞癌患者组织和外周血样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8987 | 2025-10-07 |
Reduction in Liver Cancer Risk by Quercetin via Modulation of Urate Levels: Insights from Drug-Target Mendelian Randomization
2025-Apr-13, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16040449
PMID:40282409
|
研究论文 | 通过药物靶点孟德尔随机化方法研究槲皮素通过调节尿酸水平降低肝癌风险的机制 | 首次采用药物靶点孟德尔随机化方法揭示槲皮素通过ABCG2介导的尿酸调控通路对肝癌风险的预防作用 | 研究基于遗传关联和生物信息学分析,缺乏实验验证;未评估槲皮素对已确诊肝癌的治疗效果 | 探究槲皮素是否通过调节尿酸水平降低肝癌风险 | 肝细胞癌、胆管癌和肝纤维化 | 生物信息学 | 肝癌 | 药物靶点孟德尔随机化、全基因组关联研究、单细胞转录组学、免疫浸润分析 | 孟德尔随机化模型 | 基因组关联数据、转录组数据 | 公共数据库数据(MRC-IEU、GEO数据集GSE138709和GSE179443) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8988 | 2025-10-07 |
The effect of TIGIT and PD1 expression on T cell function and prognosis in adult patients with acute myeloid leukemia at diagnosis
2025-Apr-11, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04024-0
PMID:40214805
|
研究论文 | 本研究探讨TIGIT和PD1在初诊急性髓系白血病患者T细胞中的表达及其对T细胞功能和预后的影响 | 首次研究骨髓T细胞中TIGIT表达对新诊断AML患者的预后意义,并发现TIGIT+PD1+ CD8+ T细胞共表达与不良预后相关 | 样本量有限(71例患者),单细胞RNA测序仅使用3例患者样本 | 评估TIGIT和PD1在AML患者T细胞中的表达特征及其临床意义 | 71例成人初诊AML患者和31例健康供者的骨髓样本 | 免疫学 | 急性髓系白血病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, T细胞体外活化 | NA | 流式细胞数据, 单细胞RNA测序数据 | 71例AML患者, 31例健康供者, 其中15例患者和6例供者进行T细胞活化实验, 3例患者进行单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8989 | 2025-10-07 |
SIRPα + CD209 + cell: a specialized antigen-presenting cell that contributes to anti-SIRPα/RT therapy in colorectal cancer
2025-Apr-10, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04025-z
PMID:40208335
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序鉴定了一种特殊的抗原呈递细胞SIRPα+CD209+细胞,并探讨其在结直肠癌免疫调节及与放疗协同作用中的机制 | 首次发现SIRPα+CD209+细胞作为特殊抗原呈递细胞在结直肠癌中的作用,揭示了其对放疗的抵抗性及在联合抗SIRPα治疗中的关键功能 | 研究样本量有限,需要更大规模的临床验证;机制研究仍需深入 | 探索抗原呈递细胞在结直肠癌中的作用及其与放疗的协同效应 | 结直肠癌患者肿瘤微环境和外周血中的髓系细胞 | 单细胞测序 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 未明确样本数量,包含新辅助治疗前后患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8990 | 2025-10-07 |
Tff2 marks gastric corpus progenitors that give rise to pyloric metaplasia/SPEM following injury
2025-Apr-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.09.647847
PMID:40291734
|
研究论文 | 本研究通过Tff2-CreERT基因敲入小鼠模型,揭示了Tff2+胃体峡部细胞是短暂扩增祖细胞,并在损伤后成为幽门化生/SPEM的主要来源 | 挑战了传统认为化生逐步进展的观点,发现Tff2+祖细胞而非主细胞是SPEM的主要来源,且Kras突变可使这些祖细胞直接进展为异型增生 | 主要基于小鼠模型研究,人类组织验证相对有限 | 探究胃幽门化生/SPEM的细胞起源及其在胃癌发生中的作用 | Tff2+胃体峡部祖细胞、主细胞、幽门化生/SPEM病变 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多组学分析 | Tff2-CreERT基因敲入小鼠模型 | 基因表达数据,空间转录组数据 | 小鼠模型及人类组织样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
8991 | 2025-10-07 |
Integration of Microarray and Single-Cell RNA-Seq Data and Machine Learning Allows the Identification of Key Histone Modification Gene Changes in Spermatogonial Stem Cells
2025-Apr-08, Biology
DOI:10.3390/biology14040387
PMID:40282252
|
研究论文 | 整合微阵列和单细胞RNA测序数据,通过机器学习识别精子干细胞中关键组蛋白修饰基因的变化 | 首次整合微阵列和scRNA-seq数据识别与精子干细胞功能和衰老相关的组蛋白修饰基因变化 | NA | 研究精子干细胞中组蛋白修饰基因的变化及其与男性生育能力的关系 | 精子干细胞和成纤维细胞 | 机器学习 | 男性不育症 | 微阵列, 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8992 | 2025-10-07 |
Advances in Microfluidic Single-Cell RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics
2025-Apr-02, Micromachines
IF:3.0Q2
DOI:10.3390/mi16040426
PMID:40283301
|
综述 | 本文综述了微流控技术在单细胞RNA测序和空间转录组学领域的最新进展与应用 | 系统评估微流控技术在单细胞和空间多组学中的优势与局限,并强调其在发育、神经科学和疾病机制研究中的贡献 | NA | 探讨微流控技术在单细胞和空间多组学领域的发展现状与未来前景 | 微流控芯片技术及其在单细胞分析和空间转录组学中的应用 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 微流控技术 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
8993 | 2025-10-07 |
Elucidating the Role of Trem2 in Lipid Metabolism and Neuroinflammation
2025-Apr, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70338
PMID:40205810
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和代谢组学技术,揭示了Trem2在阿尔茨海默病中调控星形胶质细胞脂质代谢和神经炎症的关键作用 | 首次系统阐明Trem2通过调节脂质代谢途径影响星形胶质细胞炎症反应的具体机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证尚不充分 | 探究Trem2在阿尔茨海默病脂质代谢失调和神经炎症中的作用机制 | 阿尔茨海默病小鼠模型中的星形胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 转录组学, 高通量代谢组学 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8994 | 2025-10-07 |
Microglia-Derived IL-6 Promotes Müller Glia Reprogramming and Proliferation in Zebrafish Retina Regeneration
2025-Apr-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.4.67
PMID:40266594
|
研究论文 | 本研究揭示了斑马鱼视网膜再生中,小胶质细胞来源的IL-6通过调控Jak1-Stat3信号通路促进Müller胶质细胞重编程和增殖的机制 | 首次发现小胶质细胞来源的IL-6是激活Stat3信号的关键分子,并阐明其在视网膜再生中的双重调控作用 | 研究主要基于斑马鱼模型,在哺乳动物中的适用性仍需进一步验证 | 探索Stat3激活因子IL-6在斑马鱼视网膜再生中的表达和功能 | 成年斑马鱼视网膜 | 发育生物学 | 视网膜损伤 | 单细胞RNA测序, PCR, 谱系追踪, 免疫染色 | 斑马鱼损伤模型 | 基因表达数据, 图像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8995 | 2025-10-07 |
Emerging targets for advancing endometrial therapeutics
2025-Apr, Reproductive biomedicine online
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.rbmo.2024.104785
PMID:40287196
|
综述 | 本文总结了子宫内膜研究的最新靶点及其在妇科疾病治疗中的进展 | 聚焦单细胞RNA测序、空间转录组学、微生物组等新兴技术,提出子宫内膜衰老等较少研究的领域 | NA | 推进子宫内膜治疗研究 | 子宫内膜及其相关妇科疾病 | NA | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 微生物组分析, 类器官模型, 月经血分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
8996 | 2025-10-07 |
Targeting Hepatic Stellate Cells for the Prevention and Treatment of Liver Cirrhosis and Hepatocellular Carcinoma: Strategies and Clinical Translation
2025-Mar-31, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph18040507
PMID:40283943
|
综述 | 本文探讨了靶向肝星状细胞预防和治疗肝纤维化/肝硬化及肝细胞癌的策略与临床转化前景 | 提出利用HSC特异性表面标志物和受体实现药物、寡核苷酸和治疗肽的靶向递送,结合单细胞测序和空间转录组学等新技术发现新靶点 | NA | 研究靶向肝星状细胞在肝纤维化和肝细胞癌防治中的策略及临床转化潜力 | 肝星状细胞(HSC)、肌成纤维细胞(MFB)、癌症相关成纤维细胞(CAF) | NA | 肝细胞癌、肝硬化 | 单细胞测序、空间转录组学、组学技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
8997 | 2025-10-07 |
Enhancer RNA in cancer: identification, expression, resources, relationship with immunity, drugs, and prognosis
2025-Jan-15, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elaf007
PMID:40285345
|
综述 | 本综述系统阐述了增强子RNA在癌症中的鉴定方法、表达特征、功能机制及其与免疫治疗、药物反应和预后的关联 | 全面整合eRNA在肿瘤免疫微环境重编程中的作用,提出eRNA特征作为免疫治疗反应和化疗耐药性监测的预测生物标志物 | 属于综述性文章,未涉及原始实验数据验证 | 系统总结eRNA在癌症生物学中的调控功能及其临床转化潜力 | 增强子RNA及其在癌症中的调控机制 | 生物信息学 | 癌症 | RNA-seq, 单细胞转录组学, 表观基因组整合分析 | NA | 基因组学数据, 转录组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 表观基因组学 | NA | NA |
8998 | 2025-10-07 |
The Potential Biological Roles and Clinical Significance of Anaphase-Promoting Complex Subunit 1 in Colorectal Cancer
2025 Jan-Dec, Cancer control : journal of the Moffitt Cancer Center
IF:2.5Q3
DOI:10.1177/10732748251330059
PMID:40229946
|
研究论文 | 本研究全面评估了ANAPC1在结直肠癌中的异常表达模式、生物学行为及临床意义 | 首次整合大规模mRNA表达数据、单细胞RNA测序和免疫组化数据,全面揭示ANAPC1在结直肠癌中的生物学功能 | 研究主要基于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证 | 探讨ANAPC1在结直肠癌发生发展中的潜在生物学作用和临床意义 | 结直肠癌组织和细胞系 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, RT-PCR, western blot, CCK-8, 伤口愈合实验, 细胞周期分析, 细胞凋亡检测 | NA | mRNA表达数据, 单细胞RNA测序数据, 免疫组化图像, 体外实验数据 | 2329个mRNA表达数据样本, 416个组织样本, HCT-116细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8999 | 2025-10-07 |
Macrophages and cardiac lesion in zebrafish: what can single-cell RNA sequencing reveal?
2025, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2025.1570582
PMID:40290186
|
综述 | 本文综述了通过单细胞RNA测序技术揭示斑马鱼心脏损伤中巨噬细胞的作用 | 首次系统综述单细胞RNA测序在斑马鱼心脏再生过程中巨噬细胞表型可塑性研究的应用 | 缺乏损伤后期时间点的研究数据,不同损伤模型间的比较不够充分 | 探讨单细胞RNA测序在揭示斑马鱼心脏损伤再生过程中巨噬细胞作用的研究价值 | 斑马鱼心脏损伤模型中的巨噬细胞 | 单细胞组学 | 心肌梗死 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9000 | 2025-10-07 |
Integrating multi-omics and experimental techniques to decode ubiquitinated protein modifications in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1545472
PMID:40290433
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和实验技术,系统探索了泛素化修饰在肝细胞癌肿瘤微环境中的调控作用 | 首次系统整合多组学数据和空间转录组学分析肝细胞癌中泛素化修饰的细胞类型特异性作用,并鉴定UBE2C作为关键调控因子 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏体内实验验证和临床样本的直接验证 | 探索泛素化修饰在肝细胞癌肿瘤微环境形成和免疫调节中的作用机制 | 肝细胞癌组织、肿瘤微环境中的浆细胞、成纤维细胞、内皮细胞和上皮-间质转化细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 生物信息学分析、空间转录组学、transwell实验、CCK8实验、伤口愈合实验 | NA | 多组学数据、转录组数据、空间转录组数据、实验数据 | 多个公共肝细胞癌数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |