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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
8981 2025-10-07
Single-cell RNA sequencing dissects the immunosuppressive signatures in Helicobacter pylori-infected human gastric ecosystem
2025-Apr-25, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序解析幽门螺杆菌感染的人类胃生态系统中的免疫抑制特征 首次在单细胞分辨率下整合单细胞RNA测序和TCR分析,揭示幽门螺杆菌驱动的单细胞向C1QC巨噬细胞分化轨迹,并鉴定出表达HLA-DRs和CTLA4的T细胞群体 样本量相对有限(23名个体),未涉及机制验证实验 解析幽门螺杆菌感染如何重塑人类胃生态系统并建立免疫抑制微环境 人类胃组织细胞 单细胞组学 幽门螺杆菌感染 单细胞RNA测序,TCR分析 NA 单细胞转录组数据 187,192个细胞,来自11名幽门螺杆菌阴性个体和12名阳性个体 NA 单细胞RNA测序 NA NA
8982 2025-10-07
Advances in single-cell DNA sequencing enable insights into human somatic mosaicism
2025-Apr-25, Nature reviews. Genetics
综述 本文综述了单细胞DNA测序技术在揭示人类体细胞嵌合现象方面的最新进展 单细胞DNA测序技术能够解析传统批量测序无法揭示的组织内遗传异质性和体细胞嵌合机制 NA 探讨单细胞DNA测序技术在研究体细胞嵌合现象中的应用价值 人类体细胞和组织样本 基因组学 癌症和非癌性疾病 单细胞DNA测序,全基因组扩增,全基因组测序 NA DNA序列数据 NA NA 单细胞DNA测序 NA NA
8983 2025-10-07
scRNA-seq reveals that VEGF signaling mediates the response to neoadjuvant anlotinib combined with PD-1 blockade therapy in non-small cell lung cancer
2025-Apr-25, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示VEGF信号通路在非小细胞肺癌患者对安罗替尼联合PD-1阻断新辅助治疗反应中的关键作用 首次使用单细胞RNA测序技术系统分析安罗替尼联合免疫治疗在NSCLC新辅助治疗中的动态细胞变化,发现VEGF信号通路介导的治疗耐药机制 样本量相对有限(9例患者用于scRNA-seq分析),需要更大规模研究验证 探索非小细胞肺癌患者对安罗替尼联合PD-1阻断新辅助治疗的耐药机制和疗效预测标志物 非小细胞肺癌患者,包括初治患者、主要病理缓解患者和非主要病理缓解患者 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序,免疫组织化学,多重免疫荧光 NA 单细胞转录组数据,组织图像数据 9例患者用于scRNA-seq分析(约47,000个单细胞),135例患者用于免疫组织化学验证 NA 单细胞RNA-seq NA NA
8984 2025-10-07
Bioinformatic analysis and experimental verification reveal expansion of monocyte subsets with an interferon signature in systemic lupus erythematosus patients
2025-Apr-25, Arthritis research & therapy IF:4.4Q1
研究论文 本研究通过生物信息学分析和实验验证揭示了系统性红斑狼疮患者中具有干扰素特征的单核细胞亚群扩增现象 首次在健康人外周血中发现SIGLEC1+IRF7+单核细胞,并证明该细胞群在SLE患者中扩增且与疾病严重程度正相关 样本量有限,需要更大规模的研究验证单核细胞亚群作为生物标志物的可靠性 探究系统性红斑狼疮患者单核细胞亚群的特征及其在疾病发病机制中的作用 系统性红斑狼疮患者和健康对照者的外周血单个核细胞和单核细胞 生物信息学 系统性红斑狼疮 单细胞RNA测序,流式细胞术,转录组分析 DESeq2,limma,Seurat R包,稳健排序聚合分析 转录组数据,单细胞RNA测序数据 SLE患者和健康对照者的PBMC样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
8985 2025-10-07
Integrative analysis of taurine metabolism-related genes prognostic signature with immunotherapy and identification of ABCB1 and GORASP1 as key genes in nasopharyngeal carcinoma
2025-Apr-24, Amino acids IF:3.0Q3
研究论文 本研究构建了鼻咽癌中牛磺酸代谢相关基因的预后特征模型,并验证了ABCB1和GORASP1等关键基因的作用 首次系统研究牛磺酸代谢相关基因在鼻咽癌中的预后价值,结合多组学分析和实验验证 研究样本量有限,需要更大规模验证 探索牛磺酸代谢相关基因在鼻咽癌预后评估和免疫治疗中的作用 鼻咽癌患者和细胞 生物信息学 鼻咽癌 单细胞测序,分子对接,免疫组化,生物信息学分析 Cox回归,LASSO回归 基因表达数据,临床数据 未明确具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
8986 2025-10-07
DOCK9 as a predictive biomarker linked to angiogenesis and immune response in esophageal squamous cell carcinoma
2025-Apr-24, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究探讨DOCK9基因在食管鳞状细胞癌中的预后价值及其在血管生成和免疫反应中的作用 首次发现DOCK9在ESCC组织中表达显著降低,并揭示其通过调节血管生成和肿瘤相关成纤维细胞环境影响预后,同时提出DOCK9/CD31比率可作为免疫治疗反应的预测标志物 NA 识别食管鳞状细胞癌的预后生物标志物并探索其治疗指导价值 食管鳞状细胞癌组织和人脐静脉内皮细胞 生物信息学 食管癌 RNA微阵列分析,单细胞RNA测序,蛋白表达分析 21基因预后风险模型 基因表达数据,单细胞测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
8987 2025-10-07
Integration of single-cell sequencing and mendelian randomization reveals novel causal pathways between monocytes and hepatocellular carcinoma
2025-Apr-24, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究整合单细胞测序和孟德尔随机化方法,揭示了单核细胞与肝细胞癌之间的因果关系 首次将单细胞测序技术与孟德尔随机化分析相结合研究单核细胞与肝细胞癌的关系 NA 研究单核细胞中差异表达基因与肝细胞癌发展的关联 人类肝脏先天淋巴样细胞中的单核细胞亚群 生物信息学 肝细胞癌 单细胞转录组测序, 孟德尔随机化分析 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
8988 2025-10-07
Neutrophil single-cell analysis identifies a type II interferon-related subset for predicting relapse of autoimmune small vessel vasculitis
2025-Apr-24, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过单细胞分析鉴定自身免疫性小血管炎复发预测相关的II型干扰素相关中性粒细胞亚群 首次在单细胞水平识别出具有II型干扰素特征基因的中性粒细胞亚群(Neu_T2ISG),并发现其与疾病复发相关 研究样本量有限,需要更大规模队列验证 探索中性粒细胞自身免疫动态变化,寻找血管炎复发预测生物标志物 新发显微镜下多血管炎(MPA)患者外周血白细胞 单细胞分析 自身免疫性小血管炎 单细胞转录组测序,表面蛋白质组分析 轨迹分析,细胞间相互作用分析 单细胞RNA测序数据,蛋白质表达数据 新发MPA患者和对照组的外周血样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
8989 2025-10-07
Leveraging TME features and multi-omics data with an advanced deep learning framework for improved Cancer survival prediction
2025-Apr-24, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据和先进深度学习框架来改进胶质瘤患者的生存预测 利用单细胞RNA测序增强的自归一化网络模型,结合肿瘤微环境特征和多组学数据,实现了高精度的胶质瘤预后预测 研究样本量相对有限,需要在更大规模队列中进一步验证 提高胶质瘤患者生存预测准确性并识别治疗靶点 胶质母细胞瘤(GBM)和低级别胶质瘤(LGG)患者 机器学习 胶质瘤 单细胞RNA测序,多组学分析 自归一化网络(Self-Normalizing Network) 转录组,拷贝数变异,体细胞突变,微生物,肿瘤微环境特征 620个样本 NA 单细胞RNA-seq,多组学分析 NA NA
8990 2025-10-07
A signature based on efferocytosis-related genes for the evaluation of prognosis and the tumour microenvironment in gastric cancer
2025-Apr-24, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 基于胞葬作用相关基因构建胃癌预后评估模型并分析肿瘤微环境特征 首次在单细胞水平整合分析胞葬作用相关基因在胃癌中的表达分布,并建立基于4个关键基因的预后预测模型 样本量相对有限(10个胃癌样本),需要在更大规模数据集中验证模型性能 探索胞葬作用在胃癌进展中的作用机制并建立预后评估工具 胃癌患者样本和TCGA数据库转录组数据 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序,转录组分析 Cox回归,LASSO回归,列线图 单细胞RNA测序数据,转录组数据 10个胃癌样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
8991 2025-10-07
Integrated multi-omics reveal lactate metabolism-related gene signatures and PYGL in predicting HNSCC prognosis and immunotherapy efficacy
2025-Apr-24, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究构建了基于乳酸代谢相关基因的预后模型,并揭示了PYGL在头颈鳞状细胞癌预后和免疫治疗疗效预测中的关键作用 首次系统整合多组学数据构建乳酸代谢相关基因特征,发现PYGL在肿瘤微环境中的新功能及其与铜依赖性细胞死亡的关联 研究样本量有限,需要更大规模的前瞻性研究验证模型的临床适用性 探索乳酸代谢相关基因在头颈鳞状细胞癌预后预测和免疫治疗疗效评估中的作用 头颈鳞状细胞癌患者和肿瘤微环境中的各类细胞 生物信息学 头颈鳞状细胞癌 单细胞测序, 免疫荧光分析, 体外实验, AutoDock分子对接 多基因特征预后模型 基因组数据, 单细胞测序数据, 临床数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
8992 2025-10-07
Identification of KANK1 as a tumor suppressor gene in pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-Apr-24, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过整合mRNA-蛋白质丰度相关性分析,鉴定KANK1为胰腺导管腺癌中的新型肿瘤抑制基因 首次发现KANK1在胰腺癌中作为肿瘤抑制基因的功能,并揭示其下调由拷贝数缺失和肿瘤缺氧驱动 NA 鉴定胰腺导管腺癌中的关键肿瘤抑制基因 胰腺导管腺癌细胞和组织 癌症基因组学 胰腺癌 单细胞RNA测序,免疫印迹分析,功能实验 NA RNA测序数据,蛋白质数据,基因组数据 多个数据集(包括TCGA和CCLE数据库) NA 单细胞RNA测序 NA NA
8993 2025-10-07
Checkpoint kinase 1 as a promising target in colorectal cancer management
2025-Apr-24, World journal of clinical oncology IF:2.6Q3
评论 探讨检查点激酶1在结直肠癌中作为生物标志物和治疗靶点的重要作用 通过单细胞RNA测序和免疫组化证实CHEK1在结直肠癌组织中显著过表达,并发现氯化两面针碱作为有效的CHEK1抑制剂可破坏DNA损伤修复通路 需要进一步研究来解决结直肠癌治疗中的空白 评估CHEK1在结直肠癌管理中的治疗潜力 结直肠癌组织和CHEK1抑制剂 癌症研究 结直肠癌 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 NA 基因表达数据, 组织切片图像 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
8994 2025-10-07
Candida albicans and colorectal cancer: A paradoxical role revealed through metabolite profiling and prognostic modeling
2025-Apr-24, World journal of clinical oncology IF:2.6Q3
研究论文 通过代谢物分析和预后建模揭示白色念珠菌在结直肠癌中的双重作用 首次建立整合白色念珠菌与结直肠癌的预后模型,并发现其代谢混合物对结直肠癌的抑制作用 研究主要基于体外细胞实验,需要进一步体内验证 探究白色念珠菌在结直肠癌发生发展中的双重角色及其机制 结直肠癌细胞系(HT29、HCT116)和正常结肠上皮细胞(NCM460) 生物信息学 结直肠癌 液相色谱-质谱联用,单细胞测序,空间转录组学,孟德尔随机化 预后模型 基因表达数据,代谢组数据 多种结直肠癌细胞系和正常结肠上皮细胞 NA 单细胞测序,空间转录组学 NA NA
8995 2025-10-07
Single-Cell Profiling Reveals Global Immune Responses During the Progression of Murine Epidermal Neoplasms
2025-Apr-21, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示小鼠表皮肿瘤进展过程中的全局免疫细胞响应 首次在单细胞水平系统描绘皮肤肿瘤微环境中免疫细胞的全景图谱,发现巨噬细胞作为主要通讯枢纽的关键作用 研究仅限于小鼠模型,未在人类样本中验证 全面表征皮肤肿瘤进展过程中的免疫细胞响应 对照小鼠皮肤和皮肤肿瘤中的免疫细胞 单细胞组学 皮肤肿瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
8996 2025-10-07
Discovery of Genomic Targets and Therapeutic Candidates for Liver Cancer Using Single-Cell RNA Sequencing and Molecular Docking
2025-Apr-17, Biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和分子对接技术发现肝癌的基因组靶点和治疗候选药物 结合两种先进混合方法和四种高性能个体方法分析单细胞RNA测序数据,识别出36个枢纽基因并提出10种潜在治疗药物 研究基于有限的数据集和42个受体蛋白中的14个进行验证,需要进一步实验确认 揭示肝癌的基因组特征并发现潜在治疗药物 肝癌细胞 生物信息学 肝癌 单细胞RNA测序, 分子对接 混合基因识别方法 单细胞RNA测序数据 四个单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
8997 2025-10-07
The integration of scRNA-seq with microarray and in-vivo experiments facilitates a comprehensive elucidation of the molecular mechanisms underlying endothelial cell involvement in myocardial infarction
2025-Apr-14, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、微阵列数据和体内实验,阐明了内皮细胞在心肌梗死中的分子机制 首次结合单细胞RNA测序、hdWGCNA分析和细胞通讯分析,系统识别并验证了内皮细胞在心肌梗死中的关键基因 研究主要依赖公共数据库数据,体内实验验证的基因数量有限 识别内皮细胞在心肌梗死进展中的关键基因并验证其功能 心肌梗死相关内皮细胞 生物信息学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 微阵列, 蛋白质-蛋白质相互作用分析, 免疫荧光, Western blot, qPCR hdWGCNA, Seurat, CellChat, scCODE, FindMarkers 基因表达数据, 实验数据 来自GEO数据库的scRNA-seq和微阵列数据集 NA 单细胞RNA测序, 微阵列 NA NA
8998 2025-10-07
G0S2 Promotes PD-L1 Expression in Monocytes and Influences the Efficacy of PD-1 Inhibitors in Hepatocellular Carcinoma
2025-Apr-13, Genes IF:2.8Q2
研究论文 本研究探讨G0S2基因在肝细胞癌单核细胞中调控PD-L1表达的作用及其对PD-1抑制剂疗效的影响 首次揭示G0S2通过上调单核细胞PD-L1表达抑制T细胞活性,导致PD-1抑制剂耐药的新机制 研究主要基于体外细胞实验和回顾性数据分析,需要更多临床前瞻性研究验证 阐明G0S2在肝细胞癌免疫治疗耐药中的作用机制 肝细胞癌患者组织样本、外周血单核细胞和THP-1单核细胞系 肿瘤免疫学 肝细胞癌 单细胞测序, 免疫组织化学, 流式细胞术, 基因敲低 NA 基因表达数据, 组织图像, 细胞表型数据 肝细胞癌患者组织和外周血样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
8999 2025-10-07
Reduction in Liver Cancer Risk by Quercetin via Modulation of Urate Levels: Insights from Drug-Target Mendelian Randomization
2025-Apr-13, Genes IF:2.8Q2
研究论文 通过药物靶点孟德尔随机化方法研究槲皮素通过调节尿酸水平降低肝癌风险的机制 首次采用药物靶点孟德尔随机化方法揭示槲皮素通过ABCG2介导的尿酸调控通路对肝癌风险的预防作用 研究基于遗传关联和生物信息学分析,缺乏实验验证;未评估槲皮素对已确诊肝癌的治疗效果 探究槲皮素是否通过调节尿酸水平降低肝癌风险 肝细胞癌、胆管癌和肝纤维化 生物信息学 肝癌 药物靶点孟德尔随机化、全基因组关联研究、单细胞转录组学、免疫浸润分析 孟德尔随机化模型 基因组关联数据、转录组数据 公共数据库数据(MRC-IEU、GEO数据集GSE138709和GSE179443) NA 单细胞RNA-seq NA NA
9000 2025-10-07
The effect of TIGIT and PD1 expression on T cell function and prognosis in adult patients with acute myeloid leukemia at diagnosis
2025-Apr-11, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 本研究探讨TIGIT和PD1在初诊急性髓系白血病患者T细胞中的表达及其对T细胞功能和预后的影响 首次研究骨髓T细胞中TIGIT表达对新诊断AML患者的预后意义,并发现TIGIT+PD1+ CD8+ T细胞共表达与不良预后相关 样本量有限(71例患者),单细胞RNA测序仅使用3例患者样本 评估TIGIT和PD1在AML患者T细胞中的表达特征及其临床意义 71例成人初诊AML患者和31例健康供者的骨髓样本 免疫学 急性髓系白血病 流式细胞术, 单细胞RNA测序, T细胞体外活化 NA 流式细胞数据, 单细胞RNA测序数据 71例AML患者, 31例健康供者, 其中15例患者和6例供者进行T细胞活化实验, 3例患者进行单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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