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当前共找到 39398 篇文献，本页显示第 881 - 900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 881 | 2026-05-05 |
Spatial proteomic mapping of the human and mouse retina using IBEX
2026-Apr-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.204535
PMID:42018650
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研究论文 | 使用IBEX技术生成人和小鼠视网膜的空间蛋白质组图谱 | 将抗体解离选项与化学漂白相结合，实现同一宿主物种抗体的灵活使用，并将其与超分辨率成像耦合，揭示了视网膜细胞群体和外界膜的超微结构特征 | NA | 绘制人和小鼠视网膜的空间蛋白质组图谱，并探究外界膜的结构组成 | 人和小鼠视网膜组织 | 数字病理学 | NA | 多重免疫组织化学 IBEX | NA | 图像 | 健康人和野生型小鼠视网膜，以及Crb1rd8小鼠模型 | NA | 空间蛋白质组学 | NA | IBEX 超分辨率成像 |
| 882 | 2026-05-05 |
FOSL2 regulates endothelial cell state and chromatin accessibility in systemic sclerosis pulmonary vascular remodeling
2026-Apr-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.189107
PMID:42018656
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研究论文 | 探究FOSL2在系统性硬化症肺部血管重塑中调控内皮细胞状态和染色质可及性的作用 | 首次通过多组学数据、转基因小鼠模型和深度学习模型ChromBPNet，揭示FOSL2在系统性硬化症相关肺动脉高压中调控内皮细胞表型的关键机制 | 未明确说明研究限制 | 阐明FOSL2在系统性硬化症肺部血管病变中对内皮细胞表型和染色质可及性的调控机制 | 系统性硬化症合并间质性肺病和肺动脉高压患者肺部组织、Fosl2转基因小鼠、Sugen/缺氧及缺氧处理小鼠、原代血管内皮细胞 | 数字病理学 | 血管疾病, 肺病, 自身免疫病 | 多组学分析、单细胞RNA测序、深度学习模型 | ChromBPNet | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 系统性硬化症患者肺部样本及多种小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 883 | 2026-05-05 |
scVIP: personalized modeling of single-cell transcriptomes for developmental and disease phenotypes
2026-Apr-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.20.717759
PMID:42079230
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研究论文 | 提出scVIP生成框架，整合单细胞转录组与表型标记预测个体化特征 | 首次通过细胞类型感知的多实例学习将单细胞转录组与个体表型（发育年龄、疾病进展、神经病理）直接关联，并实现跨数据集表型定义统一 | 基于抽象信息无法评估具体方法学缺陷或验证范围限制 | 建立单细胞转录组与个体水平表型（发育和疾病）的关联预测模型 | 单细胞转录组数据及对应的个体发育年龄、疾病进展、神经病理表型 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | 生成模型（含细胞类型感知多实例学习） | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 884 | 2026-05-05 |
Ancestry-specific rewiring of BCR-MAPK signaling in sarcoidosis B cells
2026-Apr-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.20.718985
PMID:42079256
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示结节病B细胞中BCR-MAPK信号通路的祖先特异性重构 | 首次在单细胞水平上揭示结节病B细胞中MAPK信号重编程及BCR的祖先特异性扩增，并发现与非裔和欧裔人群疾病差异相关的基因表达模式 | 未提及 | 探究B细胞在结节病发病机制中的作用及其在不同祖先人群中的差异 | 外周血单核细胞（PBMCs）来自非洲裔和欧洲裔个体，包括健康对照、结节病患者和系统性红斑狼疮（SLE）患者 | 单细胞转录组学 | 结节病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 48名健康对照、59名结节病患者、28名SLE患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 885 | 2026-05-05 |
MCT1 governs a metabolic checkpoint at pachytene during spermatogenesis
2026-Apr-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.21.720010
PMID:42079271
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研究论文 | 本文发现单羧酸转运蛋白1（MCT1）依赖的代谢检查点控制哺乳动物精子发生中的减数分裂进程，通过整合单细胞转录组学、代谢分析和计算扰动模型揭示其机制 | 首次发现MCT1介导的代谢检查点作为指导信号，通过乳酸诱导的组蛋白乳酸化修饰（H4K12la）整合代谢状态与表观遗传调控，控制减数分裂细胞命运进程 | 未提及具体限制 | 阐明代谢通量如何直接调控减数分裂进入的机制 | 哺乳动物精子发生过程中的生殖细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学、代谢分析、计算扰动建模 | NA | 单细胞转录组、代谢组、表观遗传组 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 886 | 2026-05-05 |
Dissecting the coordinated progression of cell states in spatial transcriptomics with CoPro
2026-Apr-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.17.719309
PMID:42079111
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research paper | 提出CoPro计算框架用于检测空间转录组中细胞状态的协调进展 | CoPro能够在有监督和无监督模式下识别细胞类型内部或之间的共变基因程序，并解析多重重叠的空间模式，适用于多种单细胞级空间转录组数据集 | NA | 识别基因表达程序在空间上连续变化以及在细胞类型间协调的挑战 | 结肠、脑、肝脏和肾脏组织 | machine learning | NA | MERFISH, SeqFISH+, Xenium, histology-imputed transcriptomic data | CoPro (计算框架) | 空间转录组数据 | 多组织样本（结肠、脑、肝脏和肾脏） | 10x Genomics | spatial transcriptomics | 10x Xenium | NA |
| 887 | 2026-05-05 |
Microporous annealed particle scaffolds avoid foreign body response by down regulating complement-fibroblast-macrophage signaling loop
2026-Apr-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.17.719225
PMID:42079188
|
研究论文 | 本研究通过比较微孔退火颗粒支架与纳米多孔水凝胶的皮下植入免疫反应，揭示了支架孔隙度如何调节免疫反应和补体信号通路，从而避免异物反应 | 首次揭示微孔退火颗粒支架通过下调补体-成纤维细胞-巨噬细胞信号环路（特别是C5a信号串扰通路）来减少异物反应，并利用C5缺陷小鼠验证了该机制的特异性 | 未说明 | 探究植入物孔隙度对异物反应的影响及其分子机制 | 皮下植入的微孔退火颗粒支架和纳米多孔水凝胶 | 机器学习 | NA | 质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序, 多重细胞因子分析 | NA | 质谱数据, 单细胞转录组数据, 细胞因子数据 | 小鼠皮下植入模型，具体数量未说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 888 | 2026-05-05 |
Generative AI-assisted Bayesian-frequentist Hybrid Inference in Single-cell RNA Sequencing Analysis for Genes Associated with Alzheimer's Disease
2026-Apr-20, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.04.17.26351142
PMID:42078386
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research paper | 提出了一种生成式AI辅助的贝叶斯-频率学派混合推断框架，用于单细胞RNA测序分析中与阿尔茨海默病相关的基因 | 首次将基于大语言模型的先验知识获取与混合推断理论相结合，在基因组范围贝叶斯分析中实现了计算高效和统计效能提升 | 依赖于ChatGPT-4o的标准化提示输出，可能受限于先验校准的准确性；仅在线性模型下推导了闭式混合估计量，尚未扩展到非线性模型 | 开发一种计算可扩展的贝叶斯-频率学派混合推断方法，用于高维组学数据的全基因组关联分析 | ROSMAP队列中阿尔茨海默病患者的单细胞RNA测序数据 | machine learning | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 大语言模型（ChatGPT-4o）、线性模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 889 | 2026-05-05 |
Plectin promotes an aggressive phenotype and represses cytotoxic T cell activity in pancreatic cancer
2026-Apr-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.16.718901
PMID:42079239
|
研究论文 | 揭示网蛋白(plectin)在胰腺癌中促进侵袭性表型并抑制细胞毒性T细胞活性的作用机制 | 首次发现网蛋白作为调节PDAC中T细胞抑制性肿瘤微环境的新因子，并验证抗CSP单克隆抗体可恢复抗肿瘤免疫 | 未提及具体局限性，但可能包括样本量限制、小鼠模型与人类疾病的差异等 | 探究网蛋白在胰腺癌中调节T细胞抑制性肿瘤微环境的分子机制 | 胰腺腺癌(PDAC)患者的肿瘤样本及两种小鼠PDAC模型 | 计算机视觉 | 胰腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 229例PDAC患者（scRNA-seq分析）及TCGA-PAAD数据集（未明确具体样本数） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 890 | 2026-05-05 |
PALINCODE: Recording cell lineage with ternary palindromic CRISPR bits
2026-Apr-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.16.718941
PMID:42039399
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研究论文 | 介绍PALINCODE系统，利用三元CRISPR位点随机写入细胞谱系信息，实现高密度谱系记录 | 首次提出使用三元CRISPR位点（cBits）实现更高信息密度的细胞谱系记录，通过截断的Cas9引导序列提高三元编辑效率，理论编码能力达10^25比特 | 未明确提及局限性，但可能受限于CRISPR编辑的随机性及体内应用时的脱靶效应 | 开发高密度、高精度的细胞谱系记录平台，克服传统CRISPR谱系追踪方法的局限性 | 细胞谱系记录系统及体内黑色素瘤模型中的克隆进化 | 机器学习 | 黑色素瘤 | CRISPR | NA | 单细胞测序数据 | 293T细胞及黑色素瘤体内模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 891 | 2026-05-05 |
Dynamic regulation of long non-coding RNAs across asexual and gametocyte development in Plasmodium falciparum
2026-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.15.718799
PMID:42039573
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研究论文 | 利用长读长Oxford Nanopore直接RNA测序、核糖体图谱分析和单细胞转录组学，对恶性疟原虫无性期和配子体发育过程中的长链非编码RNA进行动态调控研究 | 首次整合长读长纳米孔直接RNA测序、核糖体分析和单细胞转录组学，对恶性疟原虫lncRNA进行稳健的阶段特异性表征，揭示了其在配子体发生和传播中的潜在作用 | 研究中可能受到短读长Illumina测序、逆转录酶伪迹以及链特异性cDNA文库中第二链不完全降解的影响，这些因素阻碍了全基因组lncRNA的鉴定 | 全面鉴定恶性疟原虫无性期和配子体阶段的lncRNA，并探讨其基因表达调控中的作用 | 恶性疟原虫的无性期和配子体阶段样本 | 机器学习 | 疟疾 | 纳米孔直接RNA测序、核糖体图谱分析、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、单细胞转录组数据 | 多个无性期和配子体阶段样本，具体数量未说明 | Oxford Nanopore Technologies | 直接RNA测序、单细胞RNA测序 | Oxford Nanopore直接RNA测序平台 | NA |
| 892 | 2026-05-05 |
Nanoparticle-delivered resiquimod induces brain tumor regression in medulloblastoma and diffuse midline glioma models by interrupting paracrine growth support and activating myeloid immune signaling and phagocytosis
2026-Apr-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.07.714454
PMID:41993485
|
研究论文 | 使用纳米颗粒递送的瑞西莫德通过激活髓系免疫信号和吞噬作用诱导髓母细胞瘤和弥漫性中线胶质瘤模型中的脑肿瘤消退 | 本研究首次使用聚恶唑啉纳米颗粒包裹TLR7/8激动剂瑞西莫德（ResiPOx），证明其能有效穿透血脑屏障，并在两种儿童脑肿瘤模型中诱导抗肿瘤免疫反应，包括髓母细胞瘤和弥漫性中线胶质瘤 | 主要限制是研究仅限于小鼠和非人灵长类动物模型，尚未在人类患者中进行验证 | 研究使用聚恶唑啉纳米颗粒递送的TLR7/8激动剂瑞西莫德（ResiPOx）对髓母细胞瘤和弥漫性中线胶质瘤中肿瘤相关髓系细胞的先天免疫功能的影响 | 髓母细胞瘤和弥漫性中线胶质瘤肿瘤模型中的肿瘤相关髓系细胞 | 机器学习 | 髓母细胞瘤, 弥漫性中线胶质瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 流式细胞术, 免疫组化, 质谱成像, 免疫印迹 | NA | 基因表达数据 | 免疫活性小鼠（MB和DMG模型）和恒河猴（非人灵长类模型） | Illumina | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | Illumina NovaSeq | 用于单细胞RNA-seq和批量RNA-seq的Illumina NovaSeq测序平台 |
| 893 | 2026-05-05 |
CEP-IP: An explainable framework for cell subpopulation identification in single-cell transcriptomics
2026-Apr-16, Computer methods and programs in biomedicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.cmpb.2026.109372
PMID:42070479
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研究论文 | 提出了一种名为CEP-IP的可解释机器学习框架，用于在单细胞转录组学中识别具有强配对单调基因模块关系的细胞亚群 | 将广义加性模型与拐点分析相结合，首次引入细胞解释能力分类和拐点分析，实现了对具有特定基因模块关系的细胞亚群的可解释性识别和分组 | 框架可能仅适用于本研究中检测到的GOI-DFG模块，对其他模块的泛化能力有待验证 | 解决单细胞RNA测序框架中缺乏可解释方法识别具有强配对单调基因模块关系细胞亚群的问题 | 三个独立单细胞转录组数据集，包括前列腺癌数据集、Allen中颞回数据集和Neftel胶质母细胞瘤数据集 | 机器学习 | 前列腺癌, 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 广义加性模型 | 图像, 文本 | 三个独立数据集，包含多个患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 894 | 2026-05-05 |
Transcriptomics and single cell sequencing revealed the important role of PPAR signaling pathway in zebrafish liver fibrosis induced by thioacetamide
2026-Apr-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2026.128145
PMID:41997351
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研究论文 | 利用转录组学和单细胞测序揭示PPAR信号通路在硫代乙酰胺诱导的斑马鱼肝纤维化中的重要作用 | 首次通过转录组和单细胞测序联合分析，发现PPAR信号通路在TAA诱导的斑马鱼肝纤维化中起关键作用，并通过干预实验验证 | 未明确提及具体局限性，可能缺乏人类样本验证或临床相关性分析 | 探究硫代乙酰胺诱导斑马鱼肝纤维化的分子机制，特别是PPAR信号通路的作用 | 斑马鱼肝纤维化模型 | 转录组学， 单细胞测序 | 肝纤维化 | 转录组测序， 单细胞测序 | NA | 转录组数据， 单细胞数据 | 斑马鱼肝纤维化模型样本 | NA | bulk RNA-seq， 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 895 | 2026-05-05 |
Whole-organism spatial transcriptomics at single-cell resolution in C. elegans
2026-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.09.717568
PMID:41993495
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研究论文 | 展示了一种在秀丽隐杆线虫完整个体中实现单细胞分辨率空间转录组学的工作流程 | 首次在完整生物体上实现单细胞分辨率的多重空间转录成像，通过最多40个基因的连续成像保留空间背景，并结合标记基因面板实现神经元可重复识别 | 目前仅适用于线虫紧凑透明的体型，可能难以直接扩展到更大或更复杂的生物体 | 开发一种可扩展的空间转录组学框架，用于分析完整生物体中的基因表达和细胞身份 | 秀丽隐杆线虫 | 数字病理学 | NA | 单分子荧光原位杂交（smFISH），多重成像 | NA | 图像 | 整个秀丽隐杆线虫个体 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 896 | 2026-05-05 |
Dysregulation of Hippo Signaling Pathway as a Convergent Mechanism Underlying Choroid Plexus Defects in Bipolar Disorder
2026-Apr-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.10.717745
PMID:41993308
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研究论文 | 发现Hippo信号通路失调是双相情感障碍中脉络丛缺陷的汇聚机制 | 首次通过人类大脑类器官和脉络丛类器官揭示Hippo通路激活驱动脉络丛过度生长，并整合遗传学证据表明该通路在双相情感障碍病理中的关键作用 | 未提及具体局限性 | 探究双相情感障碍中脉络丛异常的分子机制 | 双相情感障碍患者与健康对照者来源的人类皮层类器官和脉络丛类器官 | 数字病理学 | 双相情感障碍 | 单细胞转录组学，全基因组关联研究，结构磁共振成像 | NA | 基因表达数据，影像数据 | 双相情感障碍患者和健康对照者来源的类器官及结构磁共振成像扫描 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序，全基因组测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒进行单细胞转录组测序，Illumina NovaSeq平台进行全基因组测序 |
| 897 | 2026-05-05 |
SCOPE: Localizing fate-decision states and their regulatory drivers in single-cell differentiation
2026-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.07.717037
PMID:41993275
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研究论文 | 提出SCOPE框架，利用半监督共形预测将单细胞分化中的命运决策状态及表观遗传预启动局部化至离散转录组学窗口 | 首次通过共形推断形式化命运不确定性，在高维单细胞数据中严格界定细胞命运承诺的边界，并揭示染色质可及性先于基因表达的时序滞后 | 依赖于共形预测的假设（数据可交换性），在高度噪声或样本量较小的数据中性能可能受限 | 定位单细胞分化中命运决策的关键转录组学状态及调控因子 | 模拟数据、谱系追踪的小鼠造血系统、多个人类造血数据集和人类视网膜发生数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、多组学测序 | 半监督共形预测 | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 涵盖模拟、小鼠造血、人类造血及人类视网膜发生的多个数据集 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、单细胞多组学 | NA | NA |
| 898 | 2026-05-05 |
Chemotherapy-Induced Oral Mucosal Injury Is Defined by p53 Activation, Cell Cycle Arrest and Diverse Epithelial Progenitor Dynamics
2026-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.06.716752
PMID:41993375
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研究论文 | 通过小鼠模型研究化疗诱导的口腔黏膜损伤的机制，定义p53激活、细胞周期阻滞和不同上皮祖细胞动态变化 | 首次揭示化疗诱导的口腔黏膜损伤主要由细胞周期阻滞而非凋亡驱动，并发现口腔黏膜独特的代谢重编程和p53/AP-1基因特征的化学耐药细胞群 | 研究局限于小鼠模型，可能无法完全代表人类口腔黏膜对化疗的反应 | 阐明化疗诱导的口腔黏膜损伤和修复的分子机制 | 5-氟尿嘧啶诱导的口腔黏膜炎小鼠模型中的口腔黏膜组织 | 自然语言处理 | 口腔黏膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量，涉及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 899 | 2026-05-05 |
Genetic interaction between Adgrg6 and Sox9 reveals a feedforward mechanism for postnatal spinal stability
2026-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.06.716681
PMID:41993334
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研究论文 | 利用空间转录组学揭示Adgrg6与Sox9在脊柱稳定中的遗传互作机制 | 首次提出Adgrg6和Sox9之间的前馈调控环路，为青少年特发性脊柱侧凸的遗传机制提供新见解 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 阐明Adgrg6和Sox9在脊柱稳定中的功能互作及对青少年特发性脊柱侧凸的致病机制 | Adgrg6条件敲除小鼠及Sox9低表达等位基因小鼠的脊柱组织 | 机器学习 | 青少年特发性脊柱侧凸 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 小鼠脊柱组织样本，具体数量未提及 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 900 | 2026-05-05 |
Transcriptional profiling of extraocular motor neurons reveals sim1a as a candidate strabismus-related gene
2026-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.07.717009
PMID:41993546
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研究论文 | 通过斑马鱼外眼运动神经元的转录组分析，发现 sim1a 是潜在的斜视相关基因 | 利用斑马鱼作为模型进行外眼运动神经元的单细胞和批量测序，揭示了 nIII/nIV 脑神经核中运动神经元亚群的转录组多样性，并建立了研究眼运动疾病病因的筛选管道 | 仅进行了 CRISPR/Cas9 介导的基因敲除功能验证，未在人类样本中直接验证；仅检测了前庭眼反射行为，未评估其他眼动功能 | 鉴定调控外眼运动神经元发育并与斜视相关的候选基因 | 斑马鱼幼虫的外眼运动神经元（颅神经核 nIII/nIV 中的神经元亚群） | 数字病理学 | 斜视 | NGS, 单细胞测序, 批量RNA测序, CRISPR/Cas9 | NA | 转录组数据（RNA-seq） | 斑马鱼幼虫（未具体说明数量） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |