单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 40345 篇文献,本页显示第 881 - 900 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
881 2026-06-06
Emerging insights into MicroRNA therapeutics and diagnostics for atherosclerotic cardiovascular disease: A narrative review
2026-Feb, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
综述 本文综述了微小RNA在动脉粥样硬化性心血管疾病中作为诊断生物标志物和治疗靶点的最新进展 系统总结了循环微小RNA作为无创生物标志物的潜力,并整合了单细胞RNA测序和空间转录组学等新兴技术对斑块内微小RNA调控机制的新见解 临床转化面临靶向递送、脱靶效应和特异性等重大障碍,且缺乏稳健的标准化评估标准 探讨微小RNA在动脉粥样硬化性心血管疾病中的诊断和治疗潜力 微小RNA在动脉粥样硬化性心血管疾病中的作用 自然语言处理 心血管疾病 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 文本 NA 10x Genomics, 其他(未指定) 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
882 2026-02-03
Single-cell transcriptomics identifies altered neutrophil dynamics and accentuated T-cell cytotoxicity in tobacco-flavored e-cigarette-exposed mouse lungs
2026-Jan-29, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了不同口味电子烟暴露对小鼠肺部免疫细胞的差异化影响,特别是烟草口味电子烟导致的中性粒细胞动态改变和T细胞毒性增强 首次利用单细胞转录组学技术系统比较了不同口味电子烟暴露对肺部免疫景观的影响,并发现了口味依赖性的免疫细胞功能失调模式 研究仅基于急性暴露模型,未评估长期暴露效应;样本量相对有限;机制性研究不足 探究不同口味电子烟暴露对肺部免疫反应的细胞特异性影响 小鼠肺部免疫细胞 单细胞转录组学 呼吸系统疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq),流式细胞术 NA 单细胞转录组数据,流式细胞数据 71,725个肺细胞(来自对照组和暴露组小鼠) NA 单细胞RNA-seq NA NA
883 2026-06-06
Injured epithelial cell states impact kidney allograft survival after T-cell-mediated rejection
2026-Jan-28, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过单细胞核RNA测序、空间转录组学和免疫荧光技术,揭示T细胞介导的排斥反应诱导移植肾上皮细胞损伤状态,并确认这些状态与移植肾存活率相关 首次跨物种(小鼠与人类)结合单核RNA测序、空间转录组和免疫荧光技术,系统鉴定TCMR诱导的上皮细胞损伤状态及其对移植肾存活的影响 未在文摘中明确提及,需结合全文判断 探究T细胞介导的排斥反应后肾上皮细胞损伤状态对移植肾存活的影响机制 小鼠肾移植模型及人类移植肾活检样本 数字病理学 肾移植排斥反应 单细胞核RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光, 反卷积分析 NA 基因表达数据, 空间转录组数据, 免疫荧光图像 小鼠肾移植模型(未明确具体数量)及人类TCMR和稳定移植肾样本(未明确具体数量) 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 单核RNA测序和空间转录组学平台
884 2026-06-06
Prediction of tumor-infiltrating lymphocytes through habitat radiomics and exploration of response mechanisms in neoadjuvant immunochemotherapy-treated lung cancer
2026-Jan-27, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 通过生境影像组学预测非小细胞肺癌新辅助免疫化疗后肿瘤浸润淋巴细胞状态,并探索无应答肿瘤的免疫抑制机制 首次将生境影像组学与单细胞RNA测序结合,用于非侵入性评估非小细胞肺癌新辅助免疫化疗后的肿瘤浸润淋巴细胞状态,并揭示无应答肿瘤中SERPINB9+调节性T细胞的免疫抑制机制 回顾性研究设计,样本量有限(238例临床分析,201例影像组学分析),可能引入选择偏倚;生境影像组学模型的普适性有待外部验证 建立一种非侵入性预测肿瘤浸润淋巴细胞状态的方法,以评估非小细胞肺癌患者对新辅助免疫化疗的治疗反应 238例接受新辅助免疫化疗的非小细胞肺癌患者(其中201例符合影像组学分析条件) 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习 肺癌 CT影像组学, 单细胞RNA测序, K-means聚类, 随机森林算法, SHAP分析 随机森林 影像, 文本, 基因表达数据 238例患者(临床分析),201例患者(影像组学分析,其中训练组140例,测试组61例) NA 单细胞RNA测序 NA NA
885 2026-06-06
FAP expression as a marker of malignant transformation enabling in vivo characterization in peripheral nerve sheath tumors: a multimodal and translational study
2026-01-27, Acta neuropathologica IF:9.3Q1
研究论文 研究探索成纤维细胞激活蛋白α(FAP)作为恶性外周神经鞘瘤(MPNST)中恶性转化标志物及诊疗靶点的潜力,并通过多模式方法进行在体表征 首次系统验证FAP在MPNST中从转录到蛋白水平的过表达,结合空间转录组和单细胞分析揭示其与肿瘤细胞状态及不良预后的关联,并通过FAP靶向PET/CT临床影像证实其优于FDG-PET/CT的诊断特异性 未提及明确的局限性,但可能包括样本量有限或临床验证仅基于单例患者 评估FAP作为MPNST与良性神经纤维瘤鉴别诊断的生物标志物及诊疗靶点的可行性 恶性外周神经鞘瘤(MPNST)和良性神经纤维瘤,包括神经纤维瘤病1型(NF-1)患者 数字病理学 神经纤维瘤病,恶性外周神经鞘瘤 RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, PET/CT NA 转录组数据, 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 组织切片, PET/CT影像 多个独立批量数据集,TCGA肉瘤数据集,独立档案样本,1例NF-1患者 NA 批量RNA测序, 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA NA
886 2026-06-06
Spatial FBA reveals heterogeneous Warburg niches in renal tumors and lactate consumption in colorectal cancer
2026-Jan-27, NPJ systems biology and applications IF:3.5Q1
研究论文 提出空间通量平衡分析框架,揭示肾肿瘤中异质性Warburg生态位和结直肠癌中乳酸消耗 开发了spFBA框架,将空间转录组数据与代谢通量估计相结合,发现结直肠癌中的乳酸消耗生态位和肾癌中异质性Warburg表型 未在摘要中明确说明 研究空间约束如何影响癌症代谢 配对的原发性结直肠癌和肝转移肿瘤、肾癌组织 机器学习 结直肠癌, 肾癌 空间转录组学, 通量平衡分析 spFBA 空间基因表达数据 配对的结直肠原发肿瘤和肝转移样本(具体数量未提供)、独立公共数据集 NA 空间转录组学 NA NA
887 2026-06-06
Unveiling the early defense response dynamics in grapevines against Plasmopara viticola by single-cell transcriptomics
2026-Jan-27, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 利用单细胞转录组学揭示葡萄叶在霜霉菌感染早期的防御响应动态 首次构建了葡萄叶在霜霉菌感染过程中的单细胞转录组图谱,揭示了保卫细胞被病原菌重编程的机制 未明确指出局限性 在单细胞水平上研究葡萄对霜霉菌的早期防御响应机制 葡萄叶细胞 单细胞转录组学 葡萄霜霉病 单细胞RNA测序、空间RNA测序 NA 转录组数据 约100,000个单个细胞(约89,000个来自单细胞RNA测序,约11,000个来自空间RNA测序) 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'试剂盒,Illumina NovaSeq测序平台
888 2026-06-06
Spatially resolved molecular signatures of Lewy body dementia
2026-01-26, Acta neuropathologica IF:9.3Q1
研究论文 通过空间转录组学绘制路易体痴呆的分子图谱,揭示SNCA基因剂量和APOE4基因型对脑区与细胞类型特异性病理机制的影响 首次结合空间转录组学、单核RNA测序与iPSC衍生类器官,系统解析SNCA三倍化与APOE4基因型在皮质分层和灰白质差异中的协同作用,鉴定层5灰质为脆弱区域并发现Reelin信号通路核心作用 样本量较小(仅含SNCA三倍化或不同APOE基因型的LBD病例)且仅分析颞叶皮层,未覆盖其他脑区;机制验证主要依赖体外类器官模型,需更多体内实验确认 阐明SNCA基因剂量和APOE4基因型如何影响人脑区域与细胞类型的脆弱性及路易体痴呆病理 路易体痴呆(LBD)患者死后颞叶皮层组织,包括SNCA三倍化或不同APOE基因型病例及年龄性别匹配对照 数字病理学 路易体痴呆 空间转录组学、单核RNA测序 NA 空间转录组数据、单核RNA测序数据 LBD病例(SNCA三倍化或不同APOE基因型)及对照(年龄性别匹配)的死后颞叶皮层组织(具体数量未明确) 10x Genomics 空间转录组学、单核RNA测序 10x Visium、10x Chromium 10x Visium空间转录组平台用于组织切片基因表达图谱;10x Chromium单核RNA测序用于细胞类型去卷积
889 2026-06-06
Deficiency of SMARCB1 drives an immunosuppressive microenvironment in meningioma
2026-01-24, Acta neuropathologica communications IF:6.2Q1
研究论文 研究SMARCB1缺失如何驱动脑膜瘤中免疫抑制性微环境 首次揭示SMARCB1通过IL-17/CSF1轴调控CD163+巨噬细胞浸润的机制 基于回顾性队列研究,样本量有限(113例和35例),机制验证依赖公共数据库 阐明脑膜瘤免疫抑制微环境的生物学驱动因素 脑膜瘤患者样本(含不同WHO分级和疾病状态) 数字病理学 脑膜瘤 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 全外显子测序 NA 图像, 文本 113例(血清免疫谱队列)和35例(肿瘤微环境验证队列) Illumina 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq Illumina NovaSeq 10x Genomics单细胞RNA测序平台用于单细胞数据生成
890 2026-06-06
Single-cell transcriptomics uncover RNF130-mediated TNF-α pathway activation and worenine synergy with paclitaxel in breast cancer
2026-Jan-24, Clinical epigenetics IF:4.8Q1
研究论文 通过单细胞转录组学揭示RNF130介导的TNF-α通路激活及其与紫杉醇的协同作用在三阴性乳腺癌中的机制 首次系统阐明E3泛素连接酶RNF130在三阴性乳腺癌中的表达模式、预后意义及肿瘤微环境调节作用,并发现中药活性成分吴茱萸碱可降低RNF130表达,增强紫杉醇的抗肿瘤效果 基于数据库的分析可能存在样本偏差,具体分子机制尚需进一步验证,且中药成分的临床转化潜力有待评估 研究RNF130在三阴性乳腺癌进展中的功能及分子机制,并探索其中药靶向治疗潜力 三阴性乳腺癌患者样本、细胞系、小鼠模型及其肝转移样本 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 图像, 文本 多批次乳腺癌样本及肝转移样本 NA 单细胞RNA-seq NA 数据库来源包括TCGA和GEO
891 2026-06-06
Small molecule inhibition rescues the skeletal dysplasia phenotype of Trpv4 mutant mice
2026-Jan-23, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 发现TRPV4特异性抑制剂GSK2798745能改善Trpv4突变小鼠的骨骼发育不良表型,为TRPV4骨骼发育不良提供机制性治疗策略 首次在条件性表达p.R594H Trpv4突变的小鼠模型中验证了TRPV4通道抑制作为骨骼发育不良的治疗策略,并通过单细胞RNA测序揭示了钙介导的信号通路异常机制 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类临床试验;治疗效果的长期安全性及有效性有待进一步验证 评估TRPV4通道抑制能否治疗TRPV4突变引起的骨骼发育不良 条件性表达p.R594H Trpv4突变的敲入小鼠及软骨细胞 数字病理学 骨骼发育不良 单细胞RNA测序 条件性基因敲入小鼠模型 基因表达数据 突变小鼠及其对照组,具体样本量未明确 NA 单细胞RNA测序 NA NA
892 2026-06-06
Single-cell mapping of human endometrium and decidua reveals epithelial and stromal contributions to fertility
2026-Jan-23, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 利用单细胞和批量RNA测序,绘制了人类子宫内膜和蜕膜的单细胞图谱,揭示了上皮细胞和基质细胞对生育能力的贡献 首次在单细胞分辨率下揭示了分泌中期子宫内膜腺上皮细胞的显著转录变化和细胞间通讯改变,并鉴定出与子宫容受性相关的GERM标记 未提及 了解人类子宫内膜在月经周期和早期妊娠中的动态变化及其对胚胎着床的影响 人类子宫内膜和早期妊娠蜕膜组织 机器学习和数字病理学 不孕症 单细胞RNA测序和批量RNA测序 NA 基因表达数据(单细胞和批量) 多个样本,具体数量未提及 NA 单细胞RNA测序和批量RNA测序 NA NA
893 2026-06-06
Silencing of Ifi27l2a Attenuates Inflammation After Spinal Cord Injury by Regulating Microglial Polarization via JAK2/STAT3 Signaling
2026-Jan-23, Molecular neurobiology IF:4.6Q1
研究论文 该研究探讨了Ifi27l2a基因沉默通过JAK2/STAT3信号通路调节小胶质细胞极化从而减轻脊髓损伤后的炎症反应 首次揭示Ifi27l2a在脊髓损伤后小胶质细胞极化中的调控作用,并阐明其通过JAK2/STAT3信号通路发挥功能 研究仅基于动物模型和体外细胞实验,缺乏临床样本验证;机制研究主要依赖生物信息学预测,尚需更多实验证据 探究Ifi27l2a在脊髓损伤后小胶质细胞极化中的作用及其分子机制 脊髓损伤小鼠模型和BV-2小胶质细胞系 数字病理学 脊髓损伤 单细胞RNA测序、腺相关病毒载体技术、qRT-PCR、Western blotting、免疫荧光 NA 基因表达数据、组织切片图像 C57BL/6小鼠(具体数量未提及)和BV-2细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium NA
894 2026-06-06
Chemically guided single-cell transcriptomics reveals sulfotransferase-mediated scaffold remodeling in securinine biosynthesis
2026-Jan-23, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 结合化学逻辑、稳定同位素标记喂养实验和单细胞转录组学,揭示一叶萩碱生物合成中磺基转移酶介导的支架重塑作用 发现磺基转移酶FsNSST1和FsNSST2非传统修饰作用,而是作为关键介质促进[2.2.2]双环新一叶萩碱向[3.2.1]双环一叶萩碱的骨架重塑 未提及具体限制 阐明一叶萩属植物Flueggea suffruticosa中一叶萩碱类生物合成的核心途径 一叶萩属植物Flueggea suffruticosa 机器学习和单细胞转录组学的化学引导分析 NA 单细胞转录组学、稳定同位素标记喂养实验 NA 转录组数据 特定血管相关细胞类型的单细胞样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
895 2026-06-06
Integrative microRNA and transcriptome analysis reveals sex-specific molecular divergence in human bladder cancer
2026-Jan-23, Biology of sex differences IF:4.9Q1
研究论文 通过整合microRNA和转录组分析,揭示人类膀胱癌中性别特异的分子差异 首次系统性地结合miRNA和mRNA多组学分析,揭示膀胱癌性别差异主要由常染色体基因的转录后调控驱动,而非性染色体剂量效应,并发现性别特异性调控网络与预后相关 NA 探究膀胱癌性别差异的生物学机制,识别性别特异的分子特征和调控相互作用 膀胱癌肿瘤和正常样本中的mRNA、microRNA表达数据,以及单细胞转录组数据 数字病理学 膀胱癌 RNA-seq, microRNA测序,单细胞RNA-seq NA 转录组数据,单细胞转录组数据 来自TCGA、GEO和基因组序列归档数据库的多个数据集 NA bulk RNA-seq, microRNA测序,单细胞RNA-seq NA NA
896 2026-06-06
Single-cell atlas of human lung aging identifies cell type dyssynchrony and increased transcriptional entropy
2026-Jan-22, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序构建人类肺衰老的单细胞图谱,发现细胞类型不同步性和转录熵增加 首次在单细胞水平揭示肺衰老的细胞类型不同步性,发现肺泡上皮和内皮细胞转录变化最大,并证明转录熵是独立于衰老的预测因子 未明确提及,但可能包括样本量有限或仅关注特定细胞类型 表征人类肺衰老过程中细胞、转录和基因组景观的变化 人类肺组织样本(来自不同年龄的个体) 单细胞组学 肺衰老相关疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 多个年龄段的肺组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
897 2026-06-06
Integrative multi-omics reveal a CD4⁺ T cell-derived six-gene signature linking the immune-stromal ecosystem to prognosis and immunotherapy selection in pancreatic cancer
2026-Jan-22, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 整合多组学分析揭示胰腺癌中CD4⁺ T细胞来源的六基因标志物,关联免疫基质微环境与预后及免疫治疗选择 首次从CD4⁺ T细胞差异表达基因中推导出六基因标志物(KLF3、EZR、SMDT1、JPT1、ISG15、MT1X),该标志物能有效分层预后风险并揭示免疫-基质微环境在胰腺癌中的作用 主要基于公共数据库分析,缺乏大规模前瞻性临床验证,且实验验证仅限少数细胞系,未涉及体内模型 识别胰腺癌中免疫锚定的生物标志物,用于风险分层和指导免疫治疗选择 胰腺癌患者肿瘤组织及细胞系(H6C7、CAPAN-1、PANC-1) 机器学习 胰腺癌 RNA测序、单细胞RNA测序、定量实时聚合酶链反应、蛋白质印迹法 NA 基因表达数据、单细胞转录组数据 TCGA、GTEx和GEO数据集(GSE57495)及单细胞数据集(GSE212966) NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
898 2026-06-06
Senescence-induced endothelial-to-mesenchymal transition accelerates the subretinal fibrosis in neovascualr age-related macular degeneration
2026-Jan-22, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 研究衰老诱导的内皮-间质转化在新生血管性年龄相关性黄斑变性中加速视网膜下纤维化的作用 首次通过单细胞RNA测序揭示衰老脉络膜毛细血管内皮细胞通过内皮-间质转化促进视网膜下纤维化,并证明抗衰老治疗可减轻纤维化并恢复视网膜功能 未明确提及具体局限性,但主要基于动物模型和体外实验,临床转化需进一步验证 探讨衰老的内皮细胞在新生血管性年龄相关性黄斑变性中视网膜下纤维化中的角色及潜在治疗策略 新生血管性年龄相关性黄斑变性患者的脉络膜毛细血管内皮细胞、激光诱导的视网膜下纤维化大鼠和INK-ATTAC小鼠、人脐静脉内皮细胞 数字病理学 年龄相关性黄斑变性 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 包含nAMD患者样本、Brown-Norway大鼠(数量未明确)、INK-ATTAC小鼠(数量未明确)、年轻和老年C57BL/6J小鼠(各2-3月和18月龄,数量未明确) NA 单细胞RNA测序 NA NA
899 2026-06-06
Functional characterization of angiogenesis genes in hepatocellular carcinoma via integrated bulk and single cell RNA sequencing
2026-Jan-22, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 通过整合批量与单细胞RNA测序,系统性地探究肝细胞癌中血管生成相关基因的功能,并构建预后模型及发现潜在治疗靶点 首次全面探索所有血管生成与整合应激反应相关基因在HCC中的表达模式,并通过WGCNA识别与血管生成活性强相关的基因模块,构建预后模型用于评估免疫治疗反应,同时利用单细胞转录组分析发现DAB2在APOA2+巨噬细胞中的潜在作用及靶向药物 该文的摘要未提及研究的具体局限性 研究肝细胞癌中血管生成基因的表达变化、构建肿瘤预后预测模型,并探索潜在治疗靶点和药物 肝细胞癌患者样本及细胞数据 机器学习和数字病理学 肝细胞癌 RNA-seq、单细胞RNA-seq、分子对接 WGCNA、预后模型、药物反应模型 转录组数据(批量与单细胞) NA NA 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq NA NA
900 2026-06-06
Integrative transcriptomic profiling reveals subtype-specific therapeutic vulnerabilities and resistance mechanisms in prostate cancer
2026-Jan-21, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 整合转录组学分析揭示前列腺癌亚型特异性治疗脆弱性和耐药机制 通过CRISPR筛选、RNA测序和空间转录组学等多组学整合分析,首次识别出三种分子亚型,发现MCL1作为关键耐药驱动因子,并揭示了AR依赖性与非依赖性生存通路在治疗逃逸中的作用 未提及明显局限性,但可能受限于细胞系模型与临床样本的异质性,以及CRISPR筛选的脱靶效应 剖析前列腺癌中AR依赖性与耐药机制,识别亚型特异性治疗靶点 AR依赖性(VCaP、LNCaP、22Rv1)和AR非依赖性(DU145、PC-3、WPE1-NA22、P4E6、Shmac5)前列腺癌细胞系,TCGA-PRAD、Changhai和DKFZ队列的RNA测序数据,原发肿瘤和转移样本的空间转录组学和单细胞RNA测序数据 机器学习 前列腺癌 CRISPR-Cas9筛选、RNA测序、空间转录组学、单细胞RNA测序 共识聚类、模糊聚类 转录组数据、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 8种细胞系、TCGA-PRAD及两个外部验证队列(Changhai和DKFZ)的样本 Illumina, 10x Genomics RNA测序、空间转录组学、单细胞RNA测序 Illumina NovaSeq, 10x Visium, 10x Chromium 空间转录组学使用10x Visium,单细胞RNA测序使用10x Chromium,RNA测序使用Illumina NovaSeq
回到顶部