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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 881 | 2025-11-27 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Therapeutic Effects of Electroacupuncture at BL23 on Hyperuricemia-Induced Nephritis
2025, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/2494933
PMID:41278550
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示电针刺激BL23穴对高尿酸血症诱导的肾炎的治疗效果 | 首次结合单细胞RNA测序技术系统阐明电针BL23穴通过抑制NLRP3炎症小体和IL-6/JAK/STAT3信号通路发挥肾脏保护作用的分子机制 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探究电针BL23穴对高尿酸血症及其诱导的肾脏炎症和功能障碍的治疗作用 | 高尿酸血症诱导的肾炎小鼠模型 | 单细胞测序 | 高尿酸血症肾病 | 单细胞RNA测序, Western blot | 动物模型 | 单细胞转录组数据, 蛋白质印迹数据 | 未明确样本数量的小鼠肾脏组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 882 | 2025-11-27 |
Microglial TREM2 and cognitive impairment: insights from Alzheimer's disease with implications for spinal cord injury and AI-assisted therapeutics
2025, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2025.1705069
PMID:41280332
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综述 | 探讨小胶质细胞TREM2在阿尔茨海默病和脊髓损伤认知障碍中的作用及人工智能辅助治疗的潜力 | 首次系统提出TREM2可能连接脊髓损伤引起的神经炎症与认知缺陷,并引入人工智能方法加速相关研究 | TREM2在脊髓损伤中与高级认知功能的关系尚未经过系统实验验证 | 研究TREM2在神经退行性疾病和创伤性中枢神经系统疾病认知障碍中的作用机制 | 阿尔茨海默病和脊髓损伤患者的小胶质细胞及TREM2受体 | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学、神经影像学、人工智能分析 | NA | 临床数据、转录组数据、影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 883 | 2025-11-27 |
Transcriptome analysis of classical blood cells reveals downregulation of pro-inflammatory genes in the classical monocytes of long COVID patients
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1710783
PMID:41280901
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析长新冠患者经典单核细胞的转录组特征 | 首次在长新冠患者经典单核细胞中发现促炎基因下调及单核细胞分化受损现象 | 样本量有限(88例),需更大规模研究验证 | 探索长新冠的免疫学发病机制 | 长新冠患者和康复对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 长新冠 | 单细胞RNA测序,Luminex细胞因子检测 | NA | 单细胞转录组数据,细胞因子数据 | 88例(44例长新冠患者,44例匹配康复者) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 884 | 2025-11-27 |
Neutrophil gene expression in COVID-19 patients with acute respiratory distress syndrome
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1620745
PMID:41280914
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研究论文 | 本研究通过RNA测序分析探讨了COVID-19相关ARDS患者中性粒细胞基因表达与临床病程的关系 | 首次结合bulk RNA测序和单细胞RNA测序分析COVID-19相关ARDS患者的中性粒细胞转录组特征 | 样本量较小(28例患者和16例对照),单细胞测序仅包含5例患者 | 探索COVID-19相关ARDS患者中性粒细胞基因表达与临床病程的关联 | COVID-19相关ARDS患者和健康对照者的外周血样本 | 生物信息学 | COVID-19 | RNA测序,单细胞RNA测序,聚类分析 | 聚类分析 | 基因表达数据 | 28例COVID-19相关ARDS患者,16例健康对照,5例患者进行单细胞测序 | NA | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 885 | 2025-11-27 |
Integrated Analysis of Single-Cell RNA Sequencing and Machine Learning Reveals a T Cell-Specific PANoptosis Signature Predicting Prognosis and Immunotherapy in Prostate Cancer
2025, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/8889021
PMID:41281377
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和机器学习方法,建立了一个T细胞特异性PAN凋亡特征来预测前列腺癌的预后和免疫治疗效果 | 首次结合单细胞RNA测序和10种机器学习算法构建T细胞特异性PAN凋亡特征,用于前列腺癌预后预测和免疫治疗反应评估 | 研究基于公开数据集GSE185344,需要进一步实验验证和更大样本量的临床验证 | 建立前列腺癌预后预测模型并评估免疫治疗反应 | 前列腺癌患者和癌细胞系 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,机器学习算法 | 集成学习模型(10种算法) | 基因表达数据 | GSE185344数据集,4个独立免疫治疗队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 886 | 2025-11-27 |
GDF10 attenuates MASH progression by restoring quiescent hepatic stellate cells via competitive inhibition of TGF-β/SMAD2 signaling
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.123784
PMID:41281741
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研究论文 | 本研究揭示了GDF10通过竞争性抑制TGF-β/SMAD2信号通路恢复肝星状细胞静止状态,从而减缓MASH进展的机制 | 首次发现GDF10作为肝星状细胞静止的主调控因子,并开发了靶向递送GDF10 mRNA的肝靶向脂质纳米颗粒治疗策略 | NA | 探索肝纤维化的治疗新靶点和策略 | 肝星状细胞、小鼠MASH模型、CCl4诱导纤维化模型、人类肝硬化肝脏 | 分子生物学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 887 | 2025-11-27 |
Targeting FTL regulates ferroptosis and remodels lymph node metastasis microenvironment in esophageal squamous cell carcinoma
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.112017
PMID:41281761
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现铁死亡在食管鳞癌淋巴结转移中的重要作用,并确定FTL为关键靶基因 | 首次揭示FTL通过NRF2通路促进食管鳞癌发展和转移,并通过NCOA4蛋白抑制铁死亡的新机制 | NA | 探究FTL在食管鳞癌淋巴结转移中的作用机制 | 食管鳞癌患者组织样本和癌细胞 | 单细胞测序分析 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 888 | 2025-11-27 |
Prognostic value and immune infiltration of anoikis-related genes in osteosarcoma
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1669470
PMID:41282023
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研究论文 | 基于单细胞RNA测序和失巢凋亡相关基因构建骨肉瘤预后预测模型并分析免疫浸润特征 | 首次结合单细胞RNA测序和失巢凋亡相关基因构建骨肉瘤预后模型,并验证模型在免疫治疗预测中的价值 | NA | 开发骨肉瘤预后预测模型并探索其与免疫治疗的关系 | 骨肉瘤患者和骨肉瘤细胞 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 免疫组化 | LASSO回归模型 | 基因表达数据 | TARGET数据库数据集和两个验证集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 889 | 2025-11-27 |
KSRV: a Kernel PCA-Based framework for inferring spatial RNA velocity at single-cell resolution
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1695803
PMID:41282470
|
研究论文 | 提出了一种基于核主成分分析的空间RNA速度推断计算框架KSRV | 首次将核主成分分析用于整合单细胞RNA测序和空间转录组数据,实现单细胞分辨率的空间RNA速度推断 | 未提及方法在更复杂组织或疾病模型中的验证 | 开发计算框架以推断空间分辨组织中的RNA速度 | 小鼠大脑和小鼠器官发生过程 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 核主成分分析(Kernel PCA) | 基因表达数据,空间位置数据 | 未明确说明具体样本数量 | 10x Genomics,Vizgen | 空间转录组学,单分子荧光原位杂交 | 10x Visium,MERFISH | 10x Visium空间转录组平台,MERFISH单分子成像技术 |
| 890 | 2025-11-27 |
Deciphering the role of Hat1 in spermatogenesis: Chromatin organization and beyond
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.20240
PMID:41282984
|
研究论文 | 本研究通过多学科方法揭示了组蛋白乙酰转移酶Hat1在小鼠精子发生过程中的动态表达模式及其在染色质组织中的阶段特异性功能 | 首次系统阐明了Hat1在精子发生不同阶段的特异性表达定位及其在染色质组织中的动态功能转换 | 需要进一步的功能验证实验来确认Hat1的具体作用机制 | 探究Hat1在小鼠睾丸中的时空表达模式及其在精子发生过程中染色质组织的具体作用 | 小鼠睾丸组织及雄性生殖细胞 | 表观遗传学 | 男性不育 | RT-qPCR, Western blot, 免疫荧光定位, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 3周龄和8周龄小鼠睾丸组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基于单细胞测序数据集GSE214315 |
| 891 | 2025-11-27 |
Single-Cell Multiomics Identifies Glycan Epitope LacNAc as a Potential Cell-Surface Effector Marker of Peripheral T Cells in Bladder Cancer Patients
2024-12-20, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.4c00635
PMID:39582226
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学技术首次系统整合了膀胱癌患者外周血中单细胞转录组、T细胞受体谱和糖基化表位LacNAc分析 | 首次系统整合单细胞转录组、TCR谱和糖基化表位LacNAc分析,开发了不改变免疫细胞转录状态的单细胞糖组学多组学平台 | NA | 探索膀胱癌患者外周T细胞的糖基化表位标志物及其免疫功能 | 膀胱癌患者的外周血免疫细胞 | 单细胞多组学 | 膀胱癌 | 单细胞多组学,化学酶标记,DNA条形码 | NA | 单细胞转录组,T细胞受体谱,糖基化数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | 利用化学酶标记与DNA条形码的单细胞糖组学多组学平台 |
| 892 | 2025-11-27 |
Genetic and immune determinants of E. coli liver abscess formation
2023-Dec-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2310053120
PMID:38096412
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术,揭示了E. coli肝脓肿形成的宿主遗传和免疫决定因素 | 首次发现肝脓肿易感性是多基因性状并以性别依赖方式遗传,且与早期炎症反应强度相关 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性尚需验证 | 探究E. coli肝脓肿形成的宿主遗传和免疫机制 | 小鼠肝脏组织和免疫细胞 | 空间生物学 | 肝脓肿 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 多种小鼠品系(包括C57BL/6N等) | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 893 | 2025-11-27 |
Fasting-Mimicking Diet Drives Antitumor Immunity against Colorectal Cancer by Reducing IgA-Producing Cells
2023-11-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-0323
PMID:37602826
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研究论文 | 本研究揭示模拟禁食饮食通过抑制IgA+B细胞激活抗肿瘤免疫从而抑制结直肠癌的机制 | 首次发现模拟禁食饮食通过促进脂肪酸氧化诱导RUNX3乙酰化,进而抑制IgA类型转换和CD8+T细胞抑制 | 研究主要基于小鼠模型,临床样本验证有限 | 阐明模拟禁食饮食在结直肠癌中激活抗肿瘤免疫的具体分子机制 | 结直肠癌小鼠模型和患者样本 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 894 | 2025-11-27 |
Radiotherapy-Induced Neurocognitive Impairment Is Driven by Heightened Apoptotic Priming in Early Life and Prevented by Blocking BAX
2023-10-13, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-1337
PMID:37470810
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了放疗引起神经认知损伤的年龄依赖性机制,并发现阻断BAX可预防此类损伤 | 首次发现幼年神经细胞存在更高的凋亡启动状态,并阐明BAX介导的凋亡通路是放疗神经毒性的关键机制 | 研究基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 探究放疗引起年龄依赖性神经认知损伤的分子机制及防护策略 | 小鼠神经干细胞、祖细胞、神经元和星形胶质细胞 | 神经科学 | 中枢神经系统肿瘤 | 单细胞RNA测序,BH3分析,组织学分析 | 小鼠放疗模型 | 基因表达数据,组织学图像 | 不同年龄阶段的小鼠神经细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 895 | 2025-11-27 |
Single-Cell Characterization of Pulmonary Nodules Implicates Suppression of Immunosurveillance across Early Stages of Lung Adenocarcinoma
2023-10-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-0128
PMID:37477508
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析早期肺腺癌肺结节的免疫特征,发现免疫监视在早期阶段即受到抑制 | 首次在早期肺腺癌谱系中系统揭示自然杀伤细胞和自然杀伤T细胞细胞毒性活性下降及调节性T细胞早期增加 | 样本来源仅限于手术切除的肺结节,未涵盖更广泛的早期病变类型 | 阐明早期肺肿瘤发生的免疫发病机制 | 手术切除的肺结节及相关正常肺组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据,免疫荧光图像 | 多个手术切除肺结节样本及相关正常组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 896 | 2025-11-27 |
Elevated Mast Cell Abundance Is Associated with Enrichment of CCR2+ Cytotoxic T Cells and Favorable Prognosis in Lung Adenocarcinoma
2023-08-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-3140
PMID:37249584
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序分析肺腺癌患者样本,揭示肥大细胞在肿瘤微环境中的功能异质性及其与CCR2+细胞毒性T细胞的相互作用 | 首次发现肺腺癌中肥大细胞的功能异质性及其通过CCL2-CCR2轴招募细胞毒性T细胞的机制 | 肥大细胞浸润与化疗后生存改善无关联,且样本来源仅限于肺腺癌患者 | 探究肥大细胞在肺腺癌肿瘤微环境中的调控机制和功能作用 | 肺腺癌患者肿瘤组织样本 | 单细胞测序分析 | 肺腺癌 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 肺腺癌患者样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 897 | 2025-11-27 |
Chi3l1 Is a Modulator of Glioma Stem Cell States and a Therapeutic Target in Glioblastoma
2023-06-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-21-3629
PMID:37101376
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研究论文 | 本研究揭示Chi3l1通过调控胶质瘤干细胞状态促进胶质母细胞瘤生长的分子机制 | 首次发现Chi3l1通过CD44受体诱导Akt/β-catenin信号通路和MAZ转录活性,形成促进间质表型的正向反馈环路 | NA | 探究Chi3l1在胶质母细胞瘤干细胞状态调控中的作用及其治疗潜力 | 患者来源的胶质瘤干细胞 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,ATAC-seq,RNA velocity | NA | 基因表达数据,表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,ATAC-seq | NA | NA |
| 898 | 2025-11-27 |
Spatially Resolved Transcriptomics Deconvolutes Prognostic Histological Subgroups in Patients with Colorectal Cancer and Synchronous Liver Metastases
2023-04-14, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-2794
PMID:37057593
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术解析结直肠癌肝转移患者预后相关的组织学亚群 | 首次将空间转录组学应用于同步切除的结直肠癌原发灶和肝转移灶,揭示了肿瘤内部和病灶间的异质性及驱动不同表型的转录组程序 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证 | 确定组织学评估在预测结直肠癌肝转移同步切除术后预后的实际应用价值,并探究驱动疾病进展的功能生物学机制 | 接受同步切除的原发性结直肠癌和肝转移患者样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 组织学评估、基因组panel分析、bulk转录组、免疫组化、空间转录组学 | NA | 组织样本、转录组数据、空间转录组数据 | 接受同步切除的结直肠癌肝转移患者样本 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx | GeoMx空间转录组分析 |
| 899 | 2025-11-27 |
Phagocytosis of Glioma Cells Enhances the Immunosuppressive Phenotype of Bone Marrow-Derived Macrophages
2023-03-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-1570
PMID:36622331
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现胶质母细胞瘤中表达巨噬细胞和肿瘤特征的双阳性TAMs亚群,并证明其通过吞噬胶质瘤细胞获得免疫抑制表型 | 首次鉴定出胶质母细胞瘤中表达双标记的TAMs亚群,并证明BMDMs通过吞噬胶质瘤细胞转化为免疫抑制表型的机制 | 研究主要基于体外实验和测序数据分析,需要进一步体内验证 | 探究肿瘤相关巨噬细胞如何转化为免疫抑制表型及其在肿瘤微环境中的作用 | 胶质母细胞瘤组织、骨髓来源巨噬细胞、肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞测序分析 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 全外显子测序 | NA | 基因表达数据, 基因组数据 | 胶质母细胞瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 全外显子测序 | NA | NA |
| 900 | 2025-11-27 |
Meta-Analysis of Human Cancer Single-Cell RNA-Seq Datasets Using the IMMUcan Database
2023-02-03, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-0074
PMID:36459564
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研究论文 | 本文介绍了IMMUcan scDB数据库的开发与应用,这是一个专门用于人类癌症单细胞RNA测序数据的集成数据库 | 开发了首个专门针对人类癌症的单细胞RNA测序数据库,包含144个数据集和56种癌症类型,提供详细的临床、技术和生物学注释 | 数据库主要基于已发表研究,可能受原始数据质量和研究异质性的限制 | 通过整合和分析多个人类癌症单细胞RNA测序数据集,促进肿瘤微环境的研究 | 人类癌症单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 细胞本体分类器 | 单细胞RNA测序数据 | 144个数据集,涵盖56种不同癌症类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |