单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 39702 篇文献,本页显示第 881 - 900 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
881 2026-05-18
Tuft Cells in the Gut Limit Cognitive Disorders by Regulating Gut Homeostasis
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 该文章研究了肠道簇细胞通过调节肠道稳态来限制认知障碍的机制 首次揭示了肠道簇细胞在认知障碍中的作用,并阐明了其通过调节肠道菌群和2型免疫来影响认知功能的机制 未提及具体局限性,但研究仅在动物模型中进行,尚未验证在人类中的相关性 探究肠道簇细胞在认知障碍中的作用及其机制 小鼠(缺簇细胞小鼠Pou2f3-/-和野生型WT小鼠,阿尔茨海默病模型小鼠) 机器学习 阿尔茨海默病 16S rRNA测序、FITC-葡聚糖实验、流式细胞术、单细胞RNA测序、荧光成像、结肠类器官 NA 序列数据、图像数据 10月龄小鼠(缺簇细胞小鼠和野生型小鼠),阿尔茨海默病模型小鼠 NA 单细胞RNA测序 NA NA
882 2026-05-18
Spatial Analysis of Intraductal Papillary Mucinous Neoplasms Defines a Paradoxical Keratin 17-Positive, Low-Grade Epithelial Population Harboring Malignant Features
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 通过空间转录组学和单细胞RNA测序,发现导管内乳头状黏液性肿瘤中组织学低级别上皮细胞中存在表达恶性转录特征的角蛋白17阳性亚群 首次在组织学低级别IPMN中识别出表达恶性特征(KRT17、S100A10、CEACAM5)的上皮细胞亚群,挑战了传统组织学分级对恶性潜能的判断 未明确说明样本量大小和外部验证集的代表性,可能影响结论的普适性 探究IPMN进展过程中的转录组变化,识别高风险恶变亚群 包含低级别异型增生、高级别异型增生和IPMN来源癌变的患者组织样本 数字病理学 胰腺导管腺癌 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色 NA 基因表达数据, 组织图像 包含多个患者样本的大型队列及外部空间转录组数据集 Nanostring 空间转录组学, 单细胞RNA测序 Nanostring GeoMx Nanostring GeoMx空间转录组学系统
883 2026-05-18
Uncovering core stemness biomarkers in HBV-HCC through integrated multi-omics
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 通过整合多组学分析揭示HBV相关肝细胞癌的核心干性生物标志物 首次通过整合单细胞和批量转录组数据,识别出与HBV感染相关的肝细胞癌干性内皮亚群,并发现SSR2和UBE2D3作为候选诊断和预后生物标志物 基于计算机模拟分析,缺乏实验验证;样本量有限,需进一步在更大队列中验证 鉴定HBV相关肝细胞癌中与癌症干细胞特征相关的核心调控因子 HBV相关肝细胞癌患者的单细胞和批量转录组数据 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 随机森林 转录组数据 多个独立队列 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
884 2026-05-18
Unraveling the significance of decorin in endometriosis development through single cell sequencing and experimental approaches
2026, PloS one IF:2.9Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
885 2026-05-18
GLP-1R Agonism Directly Improves the Pumping Capacity of Murine Collecting Lymphatic Vessels
2025-Dec-27, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 GLP-1R激动剂直接提高小鼠集合淋巴管的泵血能力 首次发现GLP-1R激动剂(如semaglutide)可直接作用于淋巴管内皮细胞(LECs),通过血管舒张增加淋巴管泵血能力,且该作用独立于体重减轻带来的系统性益处 机制中除一氧化氮、活性氧和血管舒张性前列腺素外,其他信号成分尚待阐明 研究GLP-1R激动剂对淋巴管功能的直接作用及其分子机制 健康野生型小鼠、饮食诱导肥胖小鼠和高胆固醇血症ApoE KO小鼠的淋巴管 数字病理学 继发性淋巴水肿 单细胞RNA测序、荧光共聚焦显微镜、压力肌动描记术 NA 图像、基因表达数据 小鼠淋巴管样本,具体数量未报告 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序用于淋巴管细胞转录组分析
886 2026-05-18
Integrating pathology genomics and single-cell genomics to identify lactate metabolism-related prognostic features and therapeutic strategies for melanoma
2025-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 通过整合病理基因组学与单细胞基因组学,识别与黑色素瘤乳酸代谢相关的预后特征和治疗策略 首次整合病理图像特征、单细胞转录组、空间转录组等多组学数据,构建乳酸代谢预后模型(LMS),并发现RAB32在肿瘤代谢重编程和侵袭性中的核心作用 未提及明显的局限性 系统表征黑色素瘤中乳酸代谢的分子特征,构建预后模型并探索潜在治疗策略 皮肤黑色素瘤(SKCM)患者的病理图像、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据及临床信息 数字病理学、机器学习 黑色素瘤 单细胞RNA测序、空间转录组学、深度学习、基因集变异分析、RAB32敲低实验 ResNet50卷积神经网络、LMS预后模型(基于10种机器学习算法的101种组合) 图像、文本(基因表达数据)、视频(非核心) TCGA训练集和验证集样本、单细胞测序样本、小鼠异种移植模型样本(具体数量未提供) NA 单细胞RNA测序技术、空间转录组学技术、病理图像分析技术 NA NA
887 2026-05-18
Endothelial SPRY1 deficiency associates with angiogenic-metabolic reprogramming in pulmonary arterial hypertension: a multi-omics analysis of bulk and single-cell transcriptomic profiles
2025-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 通过多组学分析揭示内皮SPRY1缺陷与肺动脉高压中血管生成-代谢重编程的关系 首次通过整合单细胞RNA测序数据和高维加权基因共表达网络分析与机器学习,鉴定SPRY1为肺动脉高压发病机制中的新型关键生物标志物,并证实其在疾病中的显著下调 研究仅基于数据库分析,且仅在一个大鼠模型中验证,缺乏更多临床样本和功能验证实验 探究肺动脉高压中内皮细胞稳态失调的分子机制,特别是SPRY1在血管重塑中的作用 肺动脉高压患者和正常对照的肺组织样本,以及野百合碱诱导的PAH大鼠模型 机器学习 肺动脉高压 单细胞RNA测序、高维加权基因共表达网络分析、机器学习 高维加权基因共表达网络分析、机器学习模型 基因表达数据 来自GEO数据库的肺动脉高压患者和正常对照肺组织样本,以及野百合碱诱导的PAH大鼠模型组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
888 2026-05-18
ERO1A-positive tumor epithelial cells in colorectal cancer progression: a multi-omics perspective
2025-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 本研究采用多组学方法,整合21个多中心结直肠癌队列数据,鉴定了ERO1A阳性肿瘤上皮细胞亚群,并发现其与癌症进展和不良预后相关 首次鉴定出ERO1A阳性上皮细胞亚群在结直肠癌进展中的关键作用,并构建了基于该细胞亚群与肿瘤微环境相互作用的风险预测模型ETSRM,该模型优于111个现有结直肠癌模型 未提及明显局限 探讨ERO1A阳性肿瘤上皮细胞在结直肠癌进展中的作用及其作为预后标志物的潜力 结直肠癌肿瘤上皮细胞,特别是ERO1A阳性上皮细胞亚群 数字病理学 结直肠癌 单细胞转录组学、批量转录组学、空间转录组学、蛋白质组学 风险预测模型(ETSRM) 转录组数据、空间转录组数据、蛋白质组数据 2767名患者,来自21个结直肠癌队列 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
889 2026-05-18
LCN2 drives ferroptosis-associated ischemia-reperfusion injury after renal transplantation: integrated machine learning and in vivo validation
2025-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 通过整合机器学习与体内验证,揭示LCN2在肾移植后铁死亡相关缺血再灌注损伤中的关键作用 首次结合加权基因共表达网络分析、113种机器学习算法和单细胞测序,系统鉴定并验证LCN2在肾移植缺血再灌注损伤中驱动铁死亡和免疫失调的核心机制,提出新型诊断框架和治疗靶点 研究主要基于小鼠模型和有限的人类移植队列数据,LCN2抑制剂的临床转化效果和长期安全性尚需进一步验证 探究LCN2在肾移植后铁死亡相关缺血再灌注损伤中的作用,并构建基于机器学习的诊断模型 小鼠缺血再灌注损伤模型和人类肾移植队列样本 机器学习 肾脏疾病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 加权基因共表达网络分析, 机器学习的 逻辑回归, 随机森林, 集成模型 基因表达数据, 转录组数据 6个小鼠IRI转录组数据集(83个样本)和2个人类移植队列(212个样本) NA 单细胞RNA-seq NA 使用GSE237429单细胞RNA-seq数据集
890 2026-05-18
Transcriptomic plasticity of cholinergic adipose macrophages in the acute thermogenic response
2025-12, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2
研究论文 利用单细胞RNA测序技术,研究了寒冷暴露后皮下白色脂肪组织中胆碱能脂肪巨噬细胞的转录组可塑性和起源 首次对胆碱能脂肪巨噬细胞在急性热生成反应中的转录组动态进行高分辨率评估,揭示了其混合起源和寒冷诱导的广泛基因表达变化 NA(摘要未提及局限性) 阐明胆碱能脂肪巨噬细胞在急性冷暴露中的转录组动态及其起源与身份 小鼠皮下白色脂肪组织中的ChAT-eGFP+细胞 单细胞转录组学 代谢疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 小鼠皮下白色脂肪组织样本(热中性或急性冷暴露后) NA 单细胞RNA测序 NA NA
891 2026-05-18
Neutrophil CD11b is a pivotal PANoptosis marker correlated with disease activity in antineutrophil cytoplasmic antibody-associated vasculitis
2025-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 本研究鉴定CD11b为中性粒细胞PANoptosis的关键标志物,并发现其活性与ANCA相关性血管炎疾病活动度呈正相关 首次发现CD11b作为PANoptosis关键基因在AAV中的枢纽作用,并揭示其通过脂肪酸代谢异常调控中性粒细胞活化与PANoptosis的机制 未明确说明样本量大小及多中心验证,动物模型仅使用ANCA-GN小鼠,临床相关性分析可能受限于单中心数据 鉴定ANCA相关性血管炎中PANoptosis关键标志物并探索其与疾病活动度的关联 AAV患者外周血中性粒细胞、尿液及血浆样本、肾活检标本、ANCA-GN小鼠模型 数字病理学 心血管疾病 基因微阵列,单细胞测序,免疫荧光染色,代谢途径分析 综合生物信息分析 基因表达数据,单细胞转录组数据 AAV患者血液、尿液和肾标本,ANCA-GN小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA 来自GEO数据库的基因微阵列数据及小鼠单细胞测序数据
892 2026-05-18
Deciphering macrophage heterogeneity and factors driving M2 polarization in lung adenocarcinoma through single-cell RNA sequencing
2025-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序解析肺腺癌中巨噬细胞的异质性及驱动M2极化的因素 首次发现BCAT1在免疫耐药患者组织中与M2巨噬细胞浸润正相关,并证实BCAT1可通过驱动M2极化促进免疫抑制微环境 未提及具体局限性 揭示肺腺癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性和可塑性,并识别影响其极化的基因 肺腺癌患者组织中的肿瘤相关巨噬细胞 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 使用公开数据集GSE207422 NA 单细胞RNA测序 NA NA
893 2026-05-18
Multi-omics nominates VDAC2 as a candidate protective locus in sepsis-associated cholesterol dysregulation
2025-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 利用多组学和机器学习方法探索败血症中胆固醇代谢失调的机制,并识别候选保护基因VDAC2 首次通过整合转录组、单细胞RNA测序和机器学习算法,将VDAC2确定为败血症相关胆固醇代谢失调的候选保护基因,并构建了高精度的诊断和预后模型 NA 探索败血症中胆固醇代谢失调的分子机制,识别新的治疗靶点 败血症患者的转录组和单细胞RNA测序数据 机器学习和多组学 败血症 转录组测序、单细胞RNA测序、机器学习 加权基因共表达网络分析(WGCNA)、非负矩阵分解(NMF)、101种机器学习算法集成模型 基因表达数据 多个队列的败血症患者样本,具体数量未提及 NA 转录组测序、单细胞RNA测序 NA NA
894 2026-05-18
Brain somatic mutations in Alzheimer's disease: linking genetic mosaicism to neurodegeneration
2025-10-09, Molecular neurodegeneration IF:14.9Q1
review 探讨阿尔茨海默病中脑体细胞突变如何将遗传嵌合现象与神经退行性病变相联系 系统总结了体细胞突变在阿尔茨海默病发病和进展中的作用,特别是神经元中突变负荷增加与关键致病基因(如PSEN1、PSEN2、APP)的关联,并提出了体细胞突变的神经保护性角色可能 体细胞突变导致神经功能紊乱的机制仍不完全清楚,且部分突变的神经保护作用需要进一步验证 综述体细胞突变在阿尔茨海默病中的新兴作用,并强调未来整合先进测序和基因编辑技术以发现新治疗靶点的潜力 阿尔茨海默病相关脑体细胞突变的研究文献 NA 阿尔茨海默病 单细胞测序、全基因组分析 NA NA NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
895 2026-05-18
Cell-type-directed network-correcting combination therapy for Alzheimer's disease
2025-Oct-02, Cell IF:45.5Q1
研究论文 提出一种基于单细胞转录组学和真实世界证据的细胞类型特异性多靶点药物发现策略,用于阿尔茨海默病的联合治疗 首次结合单细胞转录组学、药物扰动数据库和临床记录,开发细胞类型定向的网络校正联合疗法,并验证了来曲唑和伊立替康在阿尔茨海默病小鼠模型中通过细胞类型特异性方式逆转疾病相关基因网络 未被明确提及 开发细胞类型特异性的多靶点药物发现策略,以应对阿尔茨海默病的异质性和治疗挑战 阿尔茨海默病小鼠模型(同时具有Aβ和tau沉积) 机器学习 阿尔茨海默病 单核转录组测序 NA 基因表达数据,临床记录 小鼠模型样本(具体数量未提及) NA 单细胞转录组学 NA NA
896 2026-05-18
Microglia networks within the tapestry of alzheimer's disease through spatial transcriptomics
2025-09-29, Molecular neurodegeneration IF:14.9Q1
综述 利用空间转录组学技术探讨阿尔茨海默病中小胶质细胞网络及其与多种细胞类型的相互作用 综合了成像和测序方法的空间转录组学进展,揭示小胶质细胞在淀粉样斑块微环境中的区域异质性和功能多样性,以及它们与星形胶质细胞、神经元和少突胶质细胞在衰老和AD中的动态相互作用 可能受限于当前空间转录组学技术的分辨率和通量,以及来自动物模型和人类组织的数据整合的挑战 全面理解细胞相互作用在阿尔茨海默病发病机制中的驱动作用,并探索潜在治疗途径 小胶质细胞、星形胶质细胞、神经元、少突胶质细胞在阿尔茨海默病和衰老过程中的相互作用 数字病理学 阿尔茨海默病 空间转录组学(包括基于成像和测序的方法) NA 基因表达数据 AD小鼠模型和人体组织样本 NA 空间转录组学 NA NA
897 2026-05-18
Intramuscular enteric glia persist in Hirschsprung disease and undergo neurogenesis in response to GDNF-NCAM1 signaling
2025-Sep-26, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 研究Hirschsprung病中肌层内肠胶质细胞的分子身份、起源和神经发生潜能 首次发现HSCR无神经节段中EG胶质细胞和SLCs具有神经发生能力,且GDNF可通过非经典NCAM1依赖途径促进其神经发生 主要依赖小鼠模型和体外实验,人类样本数量有限,体内机制尚需进一步验证 探究HSCR无神经节结肠中肠胶质细胞的神经发生潜能及分子机制 Ednrb基因敲除小鼠(Plp1-GFP;Baf-tdT;Ednrb)和人类HSCR组织样本 分子神经生物学 Hirschsprung病 单细胞RNA测序、免疫组织化学、体外细胞培养 NA 基因表达数据、组织图像 Ednrb基因敲除小鼠(Plp1-GFP;Baf-tdT;Ednrb)和人类HSCR组织样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 测序平台
898 2026-05-18
Biomarkers and therapeutic strategies targeting microglia in neurodegenerative diseases: current status and future directions
2025-07-10, Molecular neurodegeneration IF:14.9Q1
综述 本文综述了靶向小胶质细胞的生物标志物和治疗策略在神经退行性疾病中的现状与未来方向 系统总结了从成熟靶点(如TREM2、PGRN、SORT1)到新兴候选标志物(如LILRB4、P2Y6R、TAM受体)的全景,并引入肿瘤学伴随诊断(CDx)模型,提出整合多模态生物标志物策略以指导个性化干预 多数生物标志物仍局限于临床前研究,面临物种差异、缺乏标准化及临床异质性等转化挑战 探讨小胶质细胞功能障碍在神经退行性疾病(如阿尔茨海默病、肌萎缩侧索硬化症、帕金森病、额颞叶痴呆)中的核心作用,并评估相关治疗靶点及生物标志物 小胶质细胞及相关生物标志物与治疗靶点 机器学习 神经退行性疾病 单细胞组学、空间转录组学 NA 多模态数据(含血液、脑脊液、影像数据) NA NA 单细胞组学,空间转录组学 NA NA
899 2026-05-18
Single-cell RNA sequencing-derived signatures define response patterns to atezolizumab + bevacizumab in advanced hepatocellular carcinoma
2025-06, Journal of hepatology IF:26.8Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序技术揭示阿替利珠单抗联合贝伐珠单抗在晚期肝细胞癌中的反应模式 首次从单细胞层面解析晚期肝细胞癌对阿替利珠单抗+贝伐珠单抗治疗的两种不同反应模式(免疫胜任型和血管生成驱动型),并鉴定出原发性耐药的关键细胞和通路特征 样本量有限(共422例),且主要基于转录组数据,缺乏蛋白层面验证;需要更大规模前瞻性研究进一步验证分子分型的临床指导价值 阐明晚期肝细胞癌对阿替利珠单抗联合贝伐珠单抗治疗产生临床获益或耐药的潜在细胞和分子机制 接受阿替利珠单抗+贝伐珠单抗治疗的晚期肝细胞癌患者(317例),以及阿替利珠单抗(47例)或索拉非尼(58例)治疗的对照组患者 机器学习 肝细胞癌 单细胞RNA测序、RNA测序 NA 基因表达数据 422例晚期肝细胞癌患者的RNA测序样本(包括317例联合治疗组、47例阿替利珠单抗组、58例索拉非尼组)及单细胞RNA测序数据 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
900 2026-05-18
Bioengineered Extracellular Vesicles Delivering siMDM2 Sensitize Oxaliplatin Therapy Efficacy in Colorectal Cancer
2025-03, Advanced healthcare materials IF:10.0Q1
研究论文 结合单细胞转录组测序与动态网络生物标志物,发现线粒体电子传递链复合体I的早期抑制是结直肠癌铂类药物耐药的关键机制,并通过工程化细胞外囊泡递送siMDM2增强奥沙利铂疗效 首次利用单细胞转录组测序结合动态网络生物标志物(DNB)揭示结直肠癌铂类药物耐药早期事件,发现MDM2介导NDUFB8泛素化降解的机制,并构建工程化细胞外囊泡递送siMDM2的治疗策略 该研究主要基于小鼠模型和体外实验,缺乏大规模临床样本验证;工程化细胞外囊泡的制备和递送效率需进一步优化 阐明结直肠癌铂类药物耐药的早期分子机制并开发新型靶向治疗策略 结直肠癌细胞系、患者源性异种移植(PDX)模型及肝肺转移小鼠模型 数字病理学, 机器学习 结直肠癌 单细胞转录组测序, 电穿孔 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部