单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 34772 篇文献,本页显示第 881 - 900 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
881 2025-12-20
Exploring fibroblast activation protein as an early biomarker in chronic lung allograft dysfunction
2025-Dec-18, The European respiratory journal
研究论文 本研究探讨了成纤维细胞激活蛋白(FAP)作为慢性肺移植物功能障碍(CLAD)早期生物标志物的潜力 首次在鼠类和人类单细胞RNA测序数据中证实FAP表达在CLAD中特异性上调于致病性成纤维细胞亚群,并建立了临床队列中FAP阳性面积阈值用于早期诊断和风险分层 FAP的判别能力中等(AUC 0.78),需要在多中心队列中进行前瞻性验证 评估FAP在慢性肺移植物功能障碍中的表达变化及其作为早期诊断标志物的可行性 鼠类肺移植模型、人类肺组织样本以及240名肺移植受者的经支气管活检样本 数字病理学 肺移植相关疾病 单细胞RNA测序,免疫组织化学 NA RNA测序数据,组织图像数据 鼠类模型2种,人类对照组5例,CLAD患者5例,临床队列240名肺移植受者(62例CLAD,178例非CLAD) NA 单细胞RNA-seq NA NA
882 2025-12-20
Targeting OxLDL-mediated CD36 + CAF reprogramming potentiates PD-1 immunotherapy in osteosarcoma
2025-Dec-18, Molecular cancer IF:27.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了骨肉瘤中CD36+癌症相关成纤维细胞通过OxLDL-PPARG-ANGPTL4轴驱动免疫抑制性代谢重编程,导致CD8+ T细胞耗竭,并证明维生素E靶向该通路可增强PD-1免疫疗法的疗效 首次在骨肉瘤中鉴定出CD36+ CAF亚群,阐明其通过摄取OxLDL激活PPARG-FABP4轴并分泌ANGPTL4诱导T细胞耗竭的具体机制,并提出维生素E作为代谢靶向药物与PD-1阻断剂的联合治疗新策略 研究主要基于临床样本和临床前小鼠模型,尚未进行人体临床试验验证联合疗法的安全性与有效性 探究骨肉瘤肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞介导免疫抑制的具体机制,并寻找增强PD-1免疫疗法疗效的新策略 骨肉瘤患者组织样本、CD36+癌症相关成纤维细胞、CD8+ T细胞、小鼠骨肉瘤模型 单细胞组学与肿瘤免疫学 骨肉瘤 单细胞RNA测序、功能实验、Pull-down结合验证、PLA-flow结合验证、体内小鼠模型 NA 单细胞转录组数据、基因表达数据、信号通路数据 接受新辅助化疗和抗PD-1治疗的骨肉瘤患者组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
883 2025-12-20
CRISPRi screening in cultured human astrocytes uncovers distal enhancers controlling genes dysregulated in Alzheimer's disease
2025-Dec-18, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 本研究通过结合CRISPRi、单细胞RNA-seq和机器学习,在人类原代星形胶质细胞中构建了增强子-基因互作资源AstroREG,并开发了预测模型EGrf 首次在人类原代星形胶质细胞中系统功能测试了近1,000个PsychENCODE增强子,识别了150多个调控互作,并利用这些数据训练了高特异性的随机森林预测模型 研究仅聚焦于星形胶质细胞这一特定细胞类型,可能未涵盖其他神经细胞类型中的增强子调控网络 揭示远端增强子在星形胶质细胞中的功能状态及其与基因的调控关系,特别关注阿尔茨海默病相关基因 人类原代星形胶质细胞 机器学习 阿尔茨海默病 CRISPR抑制(CRISPRi)、单细胞RNA-seq 随机森林(RF) 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
884 2025-12-20
Pan-cancer analysis reveals TREM1+ PMN-MDSCs as critical regulators of immune suppression and tumor microenvironment remodeling
2025-Dec-18, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过整合多癌种单细胞RNA测序和空间转录组学数据,揭示了TREM1+ PMN-MDSCs作为免疫抑制和肿瘤微环境重塑的关键调节因子 首次从泛癌角度系统揭示了TREM1+ PMN-MDSCs的保守免疫抑制特征和空间互作网络,并识别TREM1为关键治疗靶点 NA 探究PMN-MDSCs的异质性、空间动态及其在肿瘤免疫抑制中的作用 19种癌症类型的576个样本中的多形核髓源性抑制细胞 数字病理学 多种癌症 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光 NA 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据, 图像数据 来自19种癌症类型的576个样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
885 2025-12-20
A chemokine-based prognostic model featuring CXCL8, ITGA5, BACE2, CCR7, CERS4, and MEI1 for cervical cancer
2025-Dec-18, European journal of medical research IF:2.8Q2
研究论文 本研究基于趋化因子相关基因构建并验证了一个包含CXCL8、ITGA5、BACE2、CCR7、CERS4和MEI1的宫颈癌预后风险评分模型 首次基于趋化因子相关基因对宫颈癌患者进行分子分型,并构建了一个包含六个基因的稳健预后模型,该模型能有效区分患者的免疫微环境特征和对免疫治疗的反应 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床队列进一步验证模型的普适性 优化宫颈癌的个性化治疗和预后评估 宫颈癌患者 生物信息学 宫颈癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qPCR, CCK-8, 伤口愈合实验, Trans-well实验 Cox回归, Lasso算法, 风险评分模型 基因表达数据, 临床数据 TCGA-CESC和GSE52903队列数据,以及单细胞数据集GSE168652 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
886 2025-12-20
CSF1R modulates megakaryopoiesis by targeting RUNX1 in immune thrombocytopenia
2025-Dec-18, Haematologica IF:8.2Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序发现CSF1R在免疫性血小板减少症患者巨核细胞中上调,并揭示其通过抑制RUNX1损害巨核细胞生成,为ITP提供了新的治疗靶点 首次发现CSF1R在ITP患者巨核细胞中上调,并阐明其通过抑制RUNX1损害巨核细胞生成的机制 样本量较小,仅包括一名新诊断ITP患者和少量临床样本进行验证 探究免疫性血小板减少症中巨核细胞功能障碍的机制 免疫性血小板减少症患者的骨髓细胞、临床样本以及小鼠ITP模型 数字病理学 免疫性血小板减少症 单细胞RNA测序,流式细胞术 NA 单细胞RNA测序数据,流式细胞术数据 一名新诊断ITP患者及额外临床样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
887 2025-12-20
Sodium butyrate inhibits colorectal cancer development by reducing M2 macrophage polarization and PD-L1 expression
2025-Dec-17, mSystems IF:5.0Q1
研究论文 本研究探讨了短链脂肪酸丁酸钠通过抑制M2巨噬细胞极化和PD-L1表达来抑制结直肠癌发展的机制 结合单细胞转录组学与小鼠模型,揭示了丁酸钠通过HDAC/TLR4/MyD88信号通路抑制M2巨噬细胞极化,并与PD-L1阻断产生协同作用 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 探索丁酸钠抑制结直肠癌发展的机制及其与现有免疫疗法的联合策略 结直肠癌小鼠模型、巨噬细胞与结直肠癌细胞共培养系统 数字病理学 结直肠癌 单细胞转录组学、RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
888 2025-12-20
Heat stress induced testicular impairment is related to orchitis and complement activation in Rongchang boars
2025-Dec-17, Journal of animal science and biotechnology IF:6.3Q1
研究论文 本研究探讨了热应激如何通过诱导睾丸炎和补体激活影响荣昌公猪的精液质量 首次在公猪中结合单细胞RNA测序技术揭示热应激诱导的睾丸炎与补体系统激活之间的关联,并明确了CD163+巨噬细胞在补体级联反应中的关键作用 样本量相对较小(26头8周龄荣昌公猪),且实验周期较短(3周),可能限制了结果的普遍性和长期效应评估 揭示热应激下公猪的潜在免疫反应及其对精液质量的影响,以解决环境温度相关的季节性不育问题并优化人工授精中的公猪选择 荣昌公猪的睾丸组织和精液样本 生殖生物学与免疫学 睾丸炎与不育症 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、组织学评估、免疫组化、精液分析 NA 基因表达数据、组织图像、精液参数 26头8周龄荣昌公猪 NA 单细胞RNA测序 NA NA
889 2025-12-20
Proinflammatory CD20+CD3+ T cells as a potential driver of macrophage reprogramming in rheumatoid arthritis
2025-Dec-17, Journal of autoimmunity IF:7.9Q1
研究论文 本文探讨了CD20+CD3+ T细胞在类风湿关节炎中通过ANXA1-FPR1信号通路驱动单核细胞来源巨噬细胞向促炎状态重编程的作用 首次揭示了CD20+CD3+ T细胞通过ANXA1-FPR1信号通路促进单核细胞来源巨噬细胞向促炎状态重编程,从而加剧类风湿关节炎的机制 研究主要基于体外共培养和小鼠模型,人类样本的临床验证有限,且未深入探讨其他潜在信号通路 探究CD20+CD3+ T细胞在类风湿关节炎进展中的作用,特别是其对巨噬细胞重编程的影响 类风湿关节炎患者和健康对照者的免疫细胞,以及胶原诱导关节炎小鼠模型 免疫学 类风湿关节炎 单细胞RNA测序、流式细胞术、共培养实验 NA 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据 类风湿关节炎患者和健康对照者(具体数量未明确),以及胶原诱导关节炎小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
890 2025-12-20
Spatial transcriptomics uncovers lipid metabolic dysregulation driving immune-stroma crosstalk in Sjögren's Disease
2025-Dec-17, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学揭示了干燥综合征(SjD)中脂质代谢失调驱动免疫-基质细胞互作的空间组织网络 首次在SjD中系统描绘了空间组织的代谢-免疫网络,发现了致病性的CCL2高表达成纤维细胞-ACKR1高表达内皮细胞轴,并揭示了脂质代谢在免疫激活和上皮细胞代谢重编程中的关键作用 研究主要基于唾液腺组织,其他受累器官的空间特征尚不清楚;功能验证主要在细胞系中进行,体内验证有待加强 阐明干燥综合征(SjD)腺体病理中空间细胞结构及代谢-免疫互作的分子机制 干燥综合征(SjD)患者的唾液腺组织 空间转录组学 干燥综合征(自身免疫性疾病) 空间转录组学,单细胞RNA测序,免疫荧光,免疫组织化学,功能实验 NA 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据,图像数据 SjD患者唾液腺组织(包含独立验证队列) NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq NA NA
891 2025-12-20
Immunosuppressive Tumor Microenvironment in Colorectal Cancer Lung Metastases: Implications for Recurrence After Metastasectomy
2025-Dec-17, Cancer research and treatment IF:4.1Q2
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了结直肠癌肺转移灶中免疫抑制性肿瘤微环境(TME)的特征,特别是SPP1+肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的富集和效应T细胞、NK细胞的耗竭,并发现这些特征与术后复发相关 首次在结直肠癌肺转移灶中综合运用多重免疫组化、全外显子组测序、转录组分析和单细胞RNA测序,系统描绘了其免疫抑制性TME,并明确了SPP1+ TAMs作为复发预测的关键细胞亚群 样本量较小(15例患者),且为回顾性研究,需要更大规模的前瞻性队列验证 表征结直肠癌肺转移灶的肿瘤微环境,并识别与术后复发相关的因素 接受肺转移灶切除术的结直肠癌患者的匹配肿瘤组织、癌旁组织和远处正常肺组织 数字病理学 结直肠癌 多重免疫组化(IHC)、全外显子组测序、转录组分析、单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 图像、基因组序列、转录组表达数据、单细胞表达数据 15名结直肠癌肺转移患者 NA 单细胞RNA-seq, 全外显子组测序, 转录组分析 NA NA
892 2025-12-20
Single-cell identification of an endothelial cell proximal SPP1+ macrophage population defines the metastatic vascular niche in lymph nodes
2025-Dec-16, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组数据,在头颈鳞状细胞癌的转移淋巴结中发现了一个独特的、高表达SPP1的肿瘤相关巨噬细胞亚群,并揭示了其通过与内皮细胞的相互作用促进血管生成,从而形成转移性血管微环境的机制 首次在头颈鳞状细胞癌的转移淋巴结中,通过单细胞分析鉴定出一个特定的、富含SPP1的肿瘤相关巨噬细胞亚群,并阐明了该亚群通过SPP1-ITGa9b1和FN1-ITGa2b1信号轴与内皮细胞相互作用,促进血管生成和淋巴转移的新机制 研究主要基于公共数据库的回顾性数据分析,样本量相对有限(n=41),且功能机制验证主要依赖生物信息学分析和免疫组化,缺乏更深入的体内外功能实验验证 探究头颈鳞状细胞癌淋巴结转移的细胞和分子机制,特别是肿瘤微环境中细胞间的相互作用 头颈鳞状细胞癌患者的原发肿瘤、转移淋巴结和非转移淋巴结组织 数字病理学 头颈鳞状细胞癌 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,免疫组化,多重免疫组化,空间分析 NA 单细胞转录组数据,bulk RNA-seq数据,图像数据 41个样本(来自多个公共数据库) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
893 2025-12-20
Single-cell and spatial transcriptomic characterization of pulmonary pleomorphic carcinoma
2025-Dec-16, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,对肺多形性癌的分子基础进行了多组学分析,揭示了其上皮和肉瘤样成分的细胞动态及潜在治疗靶点 首次结合数字空间分析和单细胞RNA测序对肺多形性癌进行多组学表征,发现MET基因和蛋白仅在上皮成分中过表达,并识别出具有中间EMT状态和ECM重塑特征的细胞群作为新治疗靶点 研究样本量较小,且为罕见肺癌亚型,可能限制结果的普遍性 阐明肺多形性癌的分子基础,包括其上皮和肉瘤样成分的细胞动态,以识别潜在治疗靶点 肺多形性癌(PPC)患者样本,包括上皮和肉瘤样成分 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),数字空间分析,多组学分析 NA 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
894 2025-12-18
ST-FFPE-mIF: integrating spatial transcriptomics and multiplex immunofluorescence in formalin-fixed paraffin-embedded tissues using Stereo-seq
2025-Dec-16, Genome biology IF:10.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
895 2025-12-20
M6A-methylated MUC1 drives silica-induced lung inflammation and fibrosis
2025-Dec-16, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1
研究论文 本研究揭示了N6-甲基腺苷(m6A)修饰的MUC1在二氧化硅诱导的肺部炎症和纤维化中的关键驱动作用 首次发现m6A修饰的MUC1通过激活NF-κB/ZEB1和β-catenin/Snail信号通路驱动硅肺病的炎症和纤维化进程 NA 探究m6A修饰的MUC1在二氧化硅诱导的肺部炎症和纤维化中的作用机制 硅肺病患者血液样本、肺上皮细胞、支气管上皮细胞 分子生物学 肺病 单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀、功能测定 NA RNA测序数据、临床数据 硅肺病患者血液样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
896 2025-12-20
Molecular markers in oral squamous cell carcinoma: Insights into the tumor microenvironment, epigenetic regulation, and intercellular communications
2025-Dec-16, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
综述 本文综述了口腔鳞状细胞癌中新型生物标志物的最新进展,重点关注肿瘤微环境、表观遗传调控和细胞间通讯 强调了细胞外囊泡作为连接肿瘤微环境和表观遗传调控网络的关键介质,并利用单细胞测序等高通量技术揭示分子机制 作为综述文章,未涉及原始实验数据,主要基于现有文献总结,可能未涵盖所有最新研究 总结口腔鳞状细胞癌的新型生物标志物研究进展,特别是肿瘤微环境、表观遗传调控和细胞间通讯的作用 口腔鳞状细胞癌(OSCC)及其肿瘤微环境、表观遗传改变和细胞外囊泡 数字病理学 口腔鳞状细胞癌 单细胞测序、质谱分析 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
897 2025-12-20
Spatial transcriptomic alignment, integration, and 3D reconstruction by STAIR
2025-Dec-15, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本文提出了一种名为STAIR的端到端解决方案,用于空间转录组学中的切片对齐、整合和3D重建 首次提出使用具有点水平和切片水平注意力机制的异构图注意力网络,实现统一嵌入空间并指导无监督3D重建,在平行切片的z轴重建方面表现出首创性性能 NA 解决空间转录组学中将多个切片合并为统一3D图谱的挑战 空间转录组学数据切片 空间转录组学 NA 空间转录组学 异构图注意力网络 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
898 2025-12-20
Differential Regulation of APOE4-Mediated Astrocytic Lipid Metabolism by BMP Signaling Exacerbates Alzheimer's Disease Pathologies in Neurons
2025-Dec-14, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了BMP信号如何通过调控APOE4介导的星形胶质细胞脂质代谢,加剧阿尔茨海默病神经元病理 首次揭示了BMP信号在APOE4与衰老相互作用中的关键角色,并建立了星形胶质细胞脂质代谢与神经元tau蛋白过度磷酸化之间的因果关系 研究主要基于体外iPSC模型,缺乏体内验证;样本规模未明确说明 探究衰老相关BMP信号与APOE4多态性在阿尔茨海默病发病机制中的相互作用 iPSC来源的星形胶质细胞与共培养的神经元 神经科学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 细胞共培养模型 转录组数据、蛋白质磷酸化数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
899 2025-12-20
ACADVL upregulation is associated with placental ferroptosis in intrahepatic cholestasis of pregnancy
2025-Dec-13, Biochimica et biophysica acta. Molecular and cell biology of lipids
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、脂质组学和公共RNA-seq数据,探讨了妊娠期肝内胆汁淤积症(ICP)中胎盘铁死亡的机制,并发现ACADVL上调与线粒体功能障碍和铁死亡相关 首次提出ACADVL、脂质代谢、线粒体功能障碍和铁死亡在ICP发病机制中的关联模型,并利用多组学方法验证 研究机制仍需进一步实验验证,样本量可能有限,且未详细探讨其他潜在影响因素 阐明ICP中胎盘功能障碍的分子机制,特别是铁死亡的作用 妊娠期肝内胆汁淤积症患者的胎盘组织 数字病理学 妊娠期肝内胆汁淤积症 单细胞RNA测序、LC-MS/MS脂质组学、RNA-seq、免疫组织化学、免疫荧光、Western blotting、透射电子显微镜 Random Forest、Support Vector Machine、LASSO回归 单细胞RNA-seq数据、脂质组学数据、公共RNA-seq数据、图像数据 未明确指定样本数量,但涉及ICP患者胎盘组织 NA 单细胞RNA-seq、脂质组学 NA NA
900 2025-12-20
Multi-omics profiling of ACOX3 unveils pan-cancer clinical biomarker potential
2025-Dec-13, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2
研究论文 本研究通过多组学分析全面评估了ACOX3作为新型泛癌生物标志物的表达异质性、临床相关性、肿瘤-免疫相互作用及治疗潜力 首次将ACOX3作为泛癌生物标志物进行系统性多组学表征,并结合单细胞与空间转录组学揭示其在肿瘤微环境中的免疫相关性 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅在HNSCC细胞系中进行,缺乏体内模型验证 评估ACOX3作为泛癌生物标志物的诊断、预后及治疗潜力 多种癌症类型(包括KICH、PRAD、THCA、COAD、HNSCC等)的肿瘤样本及HNSCC细胞系 生物信息学 泛癌 多组学分析、单细胞转录组学、空间转录组学、分子对接、分子动力学模拟 Cox回归、Kaplan-Meier生存分析、ROC分析 基因表达数据、临床数据、单细胞数据、空间转录组数据 多种癌症类型的公共数据库样本及HNSCC细胞系 NA 单细胞转录组学, 空间转录组学 NA NA
回到顶部