单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 8961 - 8980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8961 | 2025-10-07 |
Discovering governing equations of biological systems through representation learning and sparse model discovery
2025-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf048
PMID:40290314
|
研究论文 | 提出了一种名为CLERA的端到端计算框架，通过表示学习和稀疏模型发现来揭示生物系统的控制方程 | 将监督自编码器架构与非线性动力学稀疏识别相结合，利用先验知识同时提取低维表示并发现驱动过程的潜在动力系统 | NA | 从单细胞RNA测序数据中发现简约的动态模型并识别活跃基因程序 | 合成数据和生物数据中的基因表达动态 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 监督自编码器, Sparse Identification of Nonlinear Dynamics | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8962 | 2025-10-07 |
ScRNA-Seq reveals T cell immunity in COVID-19 patients and implications for immunotherapy
2025-May-16, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114663
PMID:40233451
|
综述 | 通过单细胞RNA测序技术揭示COVID-19患者T细胞免疫特征及其对免疫治疗的启示 | 首次系统阐述scRNA-seq在解析COVID-19患者T细胞异质性和功能障碍中的应用，揭示不同临床表型患者的T细胞特征差异 | 现有靶向T细胞的治疗策略效果不一致，需联合治疗方法 | 阐明T细胞异质性对COVID-19疾病严重程度的影响机制 | COVID-19患者的常规T细胞（CD8、CD4 T细胞）和非常规T细胞（NKT、MAIT、γδT细胞） | 单细胞组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 不同临床表现的COVID-19患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8963 | 2025-10-07 |
Therapeutic and prognostic values of ferroptosis signature in glioblastoma
2025-May-16, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114597
PMID:40239336
|
研究论文 | 探讨铁死亡特征在胶质母细胞瘤中的治疗和预后价值 | 通过单细胞RNA测序揭示胶质母细胞瘤中铁死亡的分子特征及其与肿瘤微环境的相互作用 | 铁死亡与GBM免疫景观的关系复杂，可能产生正向或负向影响 | 研究铁死亡在胶质母细胞瘤中的治疗潜力和预后价值 | 胶质母细胞瘤细胞及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8964 | 2025-10-07 |
Characterization of the Biochemical Recurrence Prediction Ability and Progression Correlation of Peroxiredoxins Family in Prostate Cancer Based on Integrating Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq Cohorts
2025-May, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70855
PMID:40281661
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，探讨了过氧化物氧化还原酶家族在前列腺癌中的预后预测价值及与疾病进展的关联 | 首次系统评估PRDXs家族在前列腺癌中的临床价值，发现PRDX5与疾病进展最相关，并开发了整合PRDX5表达和临床特征的预测模型 | 研究主要基于公共数据集，部分发现需进一步实验验证 | 评估PRDXs家族在前列腺癌预后预测和治疗反应中的作用 | 前列腺癌患者样本和去势抵抗性前列腺癌细胞系 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫组织化学, 体外细胞实验 | 列线图预测模型 | 基因表达数据, 临床数据 | 2个单细胞RNA数据集和8个批量RNA数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 8965 | 2025-10-07 |
Role of different Lyl1 transcripts in zebrafish primitive hematopoiesis
2025-May, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.24-288
PMID:40287790
|
研究论文 | 本研究通过分析斑马鱼单细胞RNA测序数据，发现Lyl1基因存在长短两种转录本，并在原始造血过程中发挥不同调控作用 | 首次在斑马鱼和人类中发现Lyl1基因的长短转录本，并揭示它们在原始髓系造血中的不同功能 | 研究主要基于斑马鱼模型，人类中的功能验证需要进一步研究 | 探究Lyl1不同转录本在原始造血过程中的作用机制 | 斑马鱼胚胎造血细胞 | 发育生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, 5'RACE, Morpholino基因敲降 | NA | 单细胞RNA测序数据, RNA测序数据 | 斑马鱼造血细胞 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 8966 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptome Reveals the Cellular Response to PEG-Induced Stress in Wheat Leaves
2025-Apr-27, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c12749
PMID:40287963
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了小麦叶片在PEG诱导胁迫下的细胞响应机制 | 首次构建小麦叶片单细胞图谱，揭示不同细胞类型在干旱胁迫下的响应异质性和调控网络 | 研究仅基于PEG模拟的干旱胁迫，未涉及真实田间干旱条件 | 探究小麦在细胞水平对干旱胁迫的响应机制 | 抗旱和感旱小麦幼苗叶片 | 单细胞组学 | 植物胁迫响应 | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8967 | 2025-10-07 |
Single-nucleus RNA sequencing and spatial transcriptomics reveal the mechanism by which Xiaozhiling injection treats internal hemorrhoids
2025-Apr-27, World journal of gastrointestinal surgery
IF:1.8Q2
DOI:10.4240/wjgs.v17.i4.103494
PMID:40291892
|
研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学揭示了消痔灵注射液治疗内痔的作用机制 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组学技术研究消痔灵注射液治疗内痔的分子机制，发现Sphk1-S1P通路在促进纤维化中的关键作用 | 研究仅基于大鼠模型，缺乏人类临床样本验证 | 探究消痔灵注射液治疗内痔的分子机制 | 内痔模型大鼠的成纤维细胞 | 空间转录组学 | 内痔 | 单核RNA测序,空间转录组学,电子显微镜,免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据,图像数据 | 大鼠内痔模型（分为对照组和治疗组） | NA | 单核RNA测序,空间转录组学 | Stereo-seq | NA |
| 8968 | 2025-10-07 |
Integrated Analysis of Single-Cell and Transcriptome Data Reveals the Role and Regulatory Mechanisms of Neuroinflammation in Parkinson's Disease
2025-Apr-26, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02306-4
PMID:40285838
|
研究论文 | 通过整合单细胞和转录组数据分析，揭示神经炎症在帕金森病中的作用及STAT3转录因子的调控机制 | 首次通过整合单细胞RNA测序和微阵列数据，系统揭示STAT3作为小胶质细胞促炎活化的核心调控因子在帕金森病中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库数据，样本来源有限；动物和细胞模型可能无法完全模拟人类疾病复杂性 | 探究帕金森病中不同细胞类型的炎症特征及其调控机制 | 人类PD中脑黑质致密部组织、MPTP诱导的PD小鼠模型、MPP+诱导的BV2细胞和SH-SY5Y细胞 | 生物信息学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序, 微阵列分析, GSVA, GSEA, KEGG, GO分析, 轨迹分析, SCENIC分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据 | 来自GEO数据库的人类PD中脑组织数据，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列 | NA | NA |
| 8969 | 2025-10-07 |
Blockade of TIGAR prevents CD8+ T cell dysfunction and elicits anti-AML immunity
2025-Apr-26, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04042-y
PMID:40285889
|
研究论文 | 本研究通过阻断TIGAR基因表达，揭示了其能够防止CD8+ T细胞功能失调并诱导抗急性髓系白血病免疫反应的机制 | 首次证明TIGAR沉默不仅能直接抑制AML细胞，还能增强T细胞功能，通过调节糖代谢途径逆转T细胞耗竭状态 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探究TIGAR沉默是否能够消除AML细胞并恢复功能失调的T细胞功能 | C57BL/6J背景的TIGAR基因敲除小鼠和C1498细胞建立的AML小鼠模型 | 免疫学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，细胞因子检测 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据，细胞表型数据，生存数据 | 未明确说明具体样本数量，使用基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8970 | 2025-10-07 |
In silico-based analysis and in vitro experiments identify SIGMAR1 as a potential marker of putative lung cancer stem cells
2025-Apr-26, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02394-6
PMID:40285994
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析结合体外实验，鉴定SIGMAR1作为肺癌干细胞潜在标志物 | 首次通过单细胞RNA测序数据识别SIGMAR1在肺癌干细胞中的特异性表达，并验证其在调控干细胞自我更新能力中的功能 | 研究主要基于体外实验和已有数据集，未来需要进一步探索SIGMAR1调控干细胞特性的具体机制 | 识别肺癌干细胞的新型标志物并验证其功能 | A549细胞系来源的肿瘤球体及人类肺癌组织单细胞测序数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，轨迹分析，siRNA敲低 | NA | 单细胞RNA测序数据，体外实验数据 | 两个公共单细胞RNA测序数据集及A549细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8971 | 2025-10-07 |
Perturbing local steroidogenesis to improve breast cancer immunity
2025-Apr-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59356-3
PMID:40287432
|
研究论文 | 通过抑制局部类固醇生成来增强三阴性乳腺癌的抗肿瘤免疫反应 | 首次揭示免疫细胞局部类固醇生成在乳腺癌免疫抑制中的作用机制，并发现泊沙康唑可作为类固醇生成抑制剂 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证 | 探索通过调控局部类固醇生成改善乳腺癌免疫治疗效果的策略 | 三阴性乳腺癌患者肿瘤样本和人源化TNBC小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 靶向代谢组学,免疫组织化学,单细胞转录组学,代谢建模 | NA | 代谢组数据,转录组数据,组织切片图像 | TNBC患者肿瘤样本和实验小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,靶向代谢组分析 | NA | NA |
| 8972 | 2025-10-07 |
Comprehensive single-cell transcriptome analysis of autologous platelet-rich plasma therapy on human thin endometrium
2025-Apr-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-99468-w
PMID:40287476
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究自体富血小板血浆治疗对人类薄型子宫内膜的影响 | 首次通过单细胞转录组分析研究PRP治疗机制，发现PRP治疗能增强细胞干性、促进间质-上皮转化并增强巨噬细胞功能 | 样本量较小（仅10名患者），需要更大规模研究验证 | 探究自体富血小板血浆治疗薄型子宫内膜的分子机制 | 薄型子宫内膜患者的子宫内膜组织 | 单细胞转录组学 | 薄型子宫内膜 | 单细胞RNA测序，苏木精-伊红染色，免疫组织化学 | CytoTRACE细胞轨迹重建分析，基因集变异分析 | 单细胞转录组数据，组织学图像数据 | 10名薄型子宫内膜患者的配对样本（治疗前后） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8973 | 2025-10-07 |
Dynamics of tertiary lymphoid structures and immune cross talk in early versus advanced colorectal cancer: potential implications for immunotherapy
2025-Apr-26, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04027-x
PMID:40287532
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了早期与晚期结直肠癌中三级淋巴结构动态变化及其对免疫治疗的影响 | 发现CD8+Tex细胞表达CXCL13以及CD4+Tfh与BGC细胞间的CD40-CD40L相互作用是三级淋巴结构功能的关键调节因子 | 研究主要基于三个内部队列，需要更大规模的外部验证 | 探究早期与晚期结直肠癌肿瘤微环境和三级淋巴结构的差异及其对免疫治疗的潜在影响 | 结直肠癌患者肿瘤组织 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA转录分析, 病理组织分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA转录数据, 病理组织数据 | 三个内部队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8974 | 2025-10-07 |
A specific microbial consortium enhances Th1 immunity, improves LCMV viral clearance but aggravates LCMV disease pathology in mice
2025-Apr-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59073-x
PMID:40274773
|
研究论文 | 本研究揭示了特定微生物群落通过增强Th1免疫反应促进LCMV病毒清除但加重疾病病理的机制 | 首次证明特定简化微生物群落（OMM）而非完全无菌环境能增强抗病毒免疫反应，并通过单细胞RNA测序揭示其促进Th1细胞炎症反应的机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证；微生物群落的作用机制仍需进一步探索 | 探究肠道微生物组对抗病毒免疫反应的影响机制 | 小鼠模型及其肠道微生物组 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序，适应性T细胞转移 | 动物模型 | 基因表达数据 | 不同微生物状态的小鼠组（无菌鼠、OMM定植鼠、SPF鼠） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8975 | 2025-10-07 |
The P2X7R/NLRP3 inflammasome axis suppresses enthesis regeneration through inflammatory and metabolic macrophage-stem cell cross-talk
2025-Apr-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adr4894
PMID:40279432
|
研究论文 | 本研究揭示了P2X7R/NLRP3炎症小体轴通过调节巨噬细胞与干细胞间的相互作用抑制肌腱止点再生 | 首次发现P2X7R/NLRP3炎症小体轴通过炎症和代谢性巨噬细胞-干细胞相互作用抑制肌腱止点再生 | NA | 探索肌腱止点再生不良的关键调控机制 | 肌腱止点损伤模型中的巨噬细胞和干细胞 | 再生医学 | 肌腱止点损伤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 基因敲除 | NA | 基因表达数据, 组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8976 | 2025-10-07 |
Exosomes derived from ccRCC cells confers fibroblasts activation to foster tumor progression through Warburg effect by downregulating PANK3
2025-Apr-25, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02434-8
PMID:40280913
|
研究论文 | 本研究揭示肾透明细胞癌来源的外泌体通过下调PANK3诱导成纤维细胞活化，促进肿瘤进展的机制 | 首次发现外泌体通过下调PANK3诱导成纤维细胞Warburg效应，建立癌细胞与成纤维细胞间的代谢共生关系 | 机制研究尚未完全阐明，缺乏临床验证 | 探索肿瘤来源外泌体在肾癌微环境重塑中的作用机制 | 肾透明细胞癌组织、癌症相关成纤维细胞(CAFs)、正常成纤维细胞(NFs) | 肿瘤微环境研究 | 肾细胞癌 | 单细胞测序、转录组测序、能量代谢检测 | NA | 单细胞测序数据、转录组数据、代谢数据 | 不同进展阶段的肾透明细胞癌组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8977 | 2025-10-07 |
Telomere-related gene risk model predicts prognostic and immune microenvironment alterations in prostate cancer
2025-Apr-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-98663-z
PMID:40280966
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序数据构建了端粒相关基因风险模型，用于预测前列腺癌的预后和免疫微环境变化 | 首次识别髓样树突状细胞作为端粒活性细胞在前列腺癌发展中的关键作用，并构建了基于两个枢纽基因的风险预测模型 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 改善前列腺癌的预测能力和疾病管理 | 前列腺癌患者和细胞系 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 伪时序分析, 细胞间通讯分析, siRNA转染 | 风险预测模型 | 基因表达数据 | 147,856个细胞，包含15种不同细胞类型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 8978 | 2025-10-07 |
Direct cell interactions potentially regulate transcriptional programmes that control the responses of high grade serous ovarian cancer patients to therapy
2025-Apr-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-98463-5
PMID:40280979
|
研究论文 | 通过分析单细胞RNA测序中的生物双联体，揭示高级别浆液性卵巢癌患者对治疗反应的细胞间直接相互作用调控机制 | 首次利用单细胞RNA测序中的生物双联体推断细胞间物理相互作用网络，并将其与临床治疗反应相关联 | 样本量较小（7名患者），仅针对治疗初期的卵巢癌患者 | 探索细胞间直接物理相互作用如何调控高级别浆液性卵巢癌患者对标准治疗的反应 | 高级别浆液性卵巢癌患者的肿瘤微环境细胞 | 单细胞基因组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 基因调控网络分析、轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 约18,000个细胞，来自7名治疗初期的卵巢癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8979 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing dissects the immunosuppressive signatures in Helicobacter pylori-infected human gastric ecosystem
2025-Apr-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59339-4
PMID:40281037
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析幽门螺杆菌感染的人类胃生态系统中的免疫抑制特征 | 首次在单细胞分辨率下整合单细胞RNA测序和TCR分析，揭示幽门螺杆菌驱动的单细胞向C1QC巨噬细胞分化轨迹，并鉴定出表达HLA-DRs和CTLA4的T细胞群体 | 样本量相对有限（23名个体），未涉及机制验证实验 | 解析幽门螺杆菌感染如何重塑人类胃生态系统并建立免疫抑制微环境 | 人类胃组织细胞 | 单细胞组学 | 幽门螺杆菌感染 | 单细胞RNA测序，TCR分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 187,192个细胞，来自11名幽门螺杆菌阴性个体和12名阳性个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8980 | 2025-10-07 |
Advances in single-cell DNA sequencing enable insights into human somatic mosaicism
2025-Apr-25, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-025-00832-3
PMID:40281095
|
综述 | 本文综述了单细胞DNA测序技术在揭示人类体细胞嵌合现象方面的最新进展 | 单细胞DNA测序技术能够解析传统批量测序无法揭示的组织内遗传异质性和体细胞嵌合机制 | NA | 探讨单细胞DNA测序技术在研究体细胞嵌合现象中的应用价值 | 人类体细胞和组织样本 | 基因组学 | 癌症和非癌性疾病 | 单细胞DNA测序，全基因组扩增，全基因组测序 | NA | DNA序列数据 | NA | NA | 单细胞DNA测序 | NA | NA |