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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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8921 | 2025-10-07 |
SEE: A Method for Predicting the Dynamics of Chromatin Conformation Based on Single-Cell Gene Expression
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202406413
PMID:39778075
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研究论文 | 提出了一种基于单细胞基因表达预测染色质构象动态的人工智能方法SEE | 结合自编码器和transformer技术,利用单细胞RNA测序数据和少量单细胞Hi-C图谱分析染色质动态 | 仅使用有限数量的单细胞Hi-C图谱 | 开发预测染色质构象动态的计算方法 | 染色质构象动态 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞Hi-C | 自编码器, transformer | 基因表达数据, 染色质构象数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞Hi-C | NA | NA |
8922 | 2025-10-07 |
Animal and vegetal materials of mouse oocytes segregate at first zygotic cleavage: a simple mechanism that makes the two-cell blastomeres differ reciprocally from the start
2025-Jan-17, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaae045
PMID:39786543
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研究论文 | 本研究通过控制小鼠卵母细胞受精位点,揭示了第一次合子分裂时动植物物质分离的机制 | 首次证明哺乳动物第一次卵裂会分离动植物物质,使两个卵裂球从一开始就具有差异 | 研究仅限于小鼠模型,需要进一步验证在其他哺乳动物中的适用性 | 探究两个细胞期胚胎卵裂球差异形成的机制 | 小鼠卵母细胞和两个细胞期胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组分析、ICSI(卵胞浆内单精子注射)、图像分析 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 不同受精位点的小鼠卵母细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8923 | 2025-10-07 |
Transcriptional dynamics during karyogamy in rice zygotes
2025-Jan-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204497
PMID:39777484
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示水稻合子核配过程中的基因表达动态 | 首次在植物合子中系统分析核配期间的转录动态,发现父本等位基因在核融合开始时激活表达 | 仅关注早期发育阶段(6小时内),未涉及更后期的胚胎发育过程 | 探究植物合子核配过程中的转录调控机制 | 水稻合子 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,时间序列分析 | NA | 转录组数据 | 六个发育时间点的水稻合子(15分钟,30分钟,1小时,2小时,4小时,6小时) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8924 | 2025-10-07 |
[WWP1 plays a positive role in ameloblast differentiation and enamel formation in mice]
2025-Jan-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 本研究探讨了WWP1在小鼠成釉细胞分化和釉质形成中的积极作用 | 首次通过单细胞RNA测序和基因敲除模型系统揭示了WWP1在釉质发育中的关键功能 | 研究仅限于小鼠模型,样本量相对较小(每组3-6只小鼠) | 研究WWP1在釉质发育中的作用机制 | 小鼠切牙组织和下颌第一磨牙牙胚 | 发育生物学 | 牙釉质发育异常 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 显微CT, 扫描电镜, 能量色散谱, 免疫荧光, Western blot | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 影像数据, 蛋白质表达数据 | P1和P7每组3只小鼠,P14、P28、2月龄和3月龄每组6只小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8925 | 2025-10-07 |
[Advances in tooth development studies based on single-cell RNA sequencing]
2025-Jan-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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综述 | 总结单细胞RNA测序技术在牙齿发育研究中的最新进展 | 利用单细胞RNA测序技术揭示牙齿发育过程中的细胞异质性和发育轨迹 | NA | 阐明牙齿发育的复杂生物学过程并识别潜在治疗靶点 | 牙齿发育过程中的上皮细胞和间充质细胞 | 单细胞生物学 | 口腔发育疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8926 | 2025-10-07 |
Tumor-initiating cells escape tumor immunity via CCL8 from tumor-associated macrophages in mice
2025-Jan-07, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI180893
PMID:39774471
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤起始细胞通过肿瘤相关巨噬细胞分泌的CCL8逃避免疫清除的机制 | 首次发现WNT激活的恶性细胞亚群作为肿瘤起始细胞,并阐明其通过GAS6/AXL/MERTK信号通路与调节性TAMs相互作用介导免疫逃逸的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究肿瘤起始细胞逃避免疫清除的分子机制 | 小鼠肿瘤模型中的肿瘤起始细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,双重组酶谱系追踪,基因敲除 | Axl/Mertk条件性双敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
8927 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing identifies CXADR as a fate determinant of the placental exchange surface
2025-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55597-w
PMID:39747179
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术识别CXADR作为胎盘交换表面命运决定因子的研究 | 首次发现连接区前体细胞与迷路层Syncytiotrophoblast-I谱系具有相似分化轨迹,并鉴定CXADR作为调控胎盘迷路层两个合体层分化动态的关键表面蛋白 | 研究仅基于小鼠模型,人类胎盘发育可能存在差异 | 解析滋养层细胞谱系分化的分子机制及其在胎盘形成中的作用 | 小鼠滋养层干细胞及其早期分化过程 | 单细胞生物学 | 妊娠并发症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠滋养层干细胞分化过程中的单细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8928 | 2025-10-07 |
Orthologous marker groups reveal broad cell identity conservation across plant single-cell transcriptomes
2025-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55755-0
PMID:39747890
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研究论文 | 开发了一种名为OMG的计算方法,用于识别植物单细胞转录组中的细胞类型并比较跨物种细胞类型保守性 | 提出无需跨物种数据整合即可准确确定物种间细胞相似性的新计算策略 | NA | 解决植物单细胞RNA测序中细胞类型标记基因稀缺和表达模式分歧的问题 | 15种不同植物物种的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 100万个细胞,268个细胞簇,涵盖15种植物物种 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8929 | 2025-10-07 |
Physiological premature aging of ovarian blood vessels leads to decline in fertility in middle-aged mice
2025-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55509-y
PMID:39747922
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研究论文 | 通过全器官成像和单细胞测序技术揭示中年小鼠卵巢血管生理性早衰导致生育力下降的机制 | 首次发现卵巢血管内皮细胞衰老是导致生育力下降的主要因素,并验证了红景天苷可逆转血管衰老 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探究中年雌性生育力下降的机制及干预策略 | 中年雌性小鼠的卵巢血管系统 | 生殖医学 | 生育力下降 | 单细胞测序, 全器官成像, 基因修饰小鼠模型 | NA | 图像数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8930 | 2025-10-07 |
Decoding the role of SLC25A5 in osteosarcoma drug resistance and CD8+ T cell exhaustion: The therapeutic potential of phyllanthin
2025-Jan, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2024.156291
PMID:39752785
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析骨肉瘤肿瘤免疫微环境,揭示SLC25A5基因在促进CD8+ T细胞耗竭和药物抵抗中的作用,并发现叶下珠素通过抑制SLC25A5表达增强化疗敏感性 | 首次探索骨肉瘤的单细胞时空进化,发现SLC25A5在药物抵抗和免疫逃逸中的新致病作用,提出叶下珠素作为潜在治疗药物 | NA | 研究骨肉瘤的发病机制及药物抵抗机制 | 骨肉瘤细胞、CD8+ T细胞、肿瘤免疫微环境 | 单细胞测序分析 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序、功能实验验证 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8931 | 2025-10-07 |
Blood DNA virome associates with autoimmune diseases and COVID-19
2025-Jan, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-02022-z
PMID:39753770
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研究论文 | 通过分析血液DNA病毒组与自身免疫疾病和COVID-19的关联 | 首次在人群规模上系统量化血液DNA病毒组成分与自身免疫疾病的关联,并发现eHHV-6B整合到22号染色体 | 研究主要基于日本人群,需要在其他人群中验证 | 探索人类病毒组与自身免疫和传染病的关联机制 | 6321名日本个体,包括自身免疫疾病患者、COVID-19患者和健康对照 | 基因组学 | 自身免疫疾病 | 全基因组测序、GWAS、长读长测序、单细胞RNA测序、表位作图 | NA | 基因组测序数据 | 6321名日本个体 | NA | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8932 | 2025-10-07 |
Exploring the therapeutic potential of fibroadipogenic progenitors in muscle disease
2025 Jan-Feb, Journal of neuromuscular diseases
IF:3.2Q2
DOI:10.1177/22143602241298545
PMID:39973455
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综述 | 探讨纤维脂肪生成祖细胞在肌肉疾病中的治疗潜力 | 整合单细胞RNA测序等新技术对FAPs功能特化的最新认知,提出靶向FAPs的治疗干预策略 | NA | 解析FAPs在肌肉稳态维持和疾病发生中的作用机制 | 纤维脂肪生成祖细胞及其与肌肉驻留细胞的相互作用 | NA | 肌病和肌营养不良症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8933 | 2025-10-07 |
Intercellular Communication Network of CellChat Uncovers Mechanisms of Kidney Fibrosis Based on Single-Cell RNA Sequencing
2025, Kidney & blood pressure research
IF:2.3Q2
DOI:10.1159/000545209
PMID:40112793
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析细胞间通讯网络,揭示恩格列净在非糖尿病慢性肾病模型中抑制肾纤维化的作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序与CellChat分析方法,系统揭示恩格列净通过调节M2巨噬细胞介导的细胞间通讯网络抑制肾纤维化的新机制 | 研究仅基于大鼠模型,尚未在人体验证;样本量有限 | 探究恩格列净对非糖尿病慢性肾病模型中肾纤维化的影响及其作用机制 | 5/6肾切除大鼠模型 | 单细胞组学 | 慢性肾病 | 单细胞RNA测序 | CellChat细胞通讯网络分析 | 单细胞转录组数据 | 三组大鼠模型(假手术组、5/6肾切除安慰剂组、5/6肾切除恩格列净治疗组) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8934 | 2025-10-07 |
Multi-omics Analysis of Histone-related Genes in Osteosarcoma: A Multidimensional Integrated Study Revealing Drug Sensitivity and Immune Microenvironment Characteristics
2025 Jan-Dec, Technology in cancer research & treatment
IF:2.7Q3
DOI:10.1177/15330338251336275
PMID:40241525
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据和临床信息,系统分析骨肉瘤中组蛋白修饰的空间异质性及其临床意义 | 首次系统揭示骨肉瘤中组蛋白修饰的空间异质性,提出'表观遗传-免疫'调控网络假说并开发基于组蛋白修饰的预后模型 | NA | 研究骨肉瘤中组蛋白修饰的临床意义及其与免疫微环境和药物敏感性的关系 | 骨肉瘤患者样本 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, LASSO Cox回归, 细胞通讯网络分析 | 预后模型 | 单细胞RNA测序数据, 临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8935 | 2025-10-07 |
A novel Wnt/β-catenin signaling gene signature for progression and metastasis of gastric cancer
2025, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2024.054366
PMID:40296906
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研究论文 | 本研究通过识别Wnt/β-catenin信号通路相关基因特征,开发了胃癌预后预测模型并揭示了AEBP1与TCF3在胃癌转移中的协同作用机制 | 首次发现AEBP1和TCF3在细胞核内相互作用并协同增强Wnt信号通路基因表达,促进胃癌侵袭转移 | 研究未明确说明样本量大小及数据来源的具体细节 | 开发胃癌预后预测基因特征并探索其分子机制 | 胃癌细胞及相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 胃癌 | LASSO回归, 单细胞RNA测序, 双荧光素酶报告基因检测, 基因敲低和过表达实验 | LASSO回归模型 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8936 | 2025-10-07 |
Ginkgo biloba extract EGb 761® ameliorates cognitive impairment and alleviates TNFα response in 5xFAD Alzheimer's disease model mice
2025-Jan, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2024.156327
PMID:39778487
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研究论文 | 本研究探讨银杏叶提取物EGb 761®在5xFAD阿尔茨海默病模型小鼠中的认知改善作用及其抗炎机制 | 首次系统揭示EGb 761®通过影响疾病相关小胶质细胞DAM2亚型发挥抗炎作用,并发现其疗效具有性别特异性 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类中验证;单细胞RNA测序仅针对雄性小鼠前额叶皮层 | 探究EGb 761®在阿尔茨海默病中的药理作用机制和性别依赖性效应 | 5xFAD阿尔茨海默病模型小鼠和野生型小鼠 | 神经药理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,器官型脑切片培养,行为学测试,基因表达分析 | 动物模型(小鼠) | 基因表达数据,行为数据,组织病理数据 | 8周龄5xFAD和野生型小鼠,治疗周期8周 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8937 | 2025-10-07 |
scRNA-Seq-Based Transcriptome Profiling and Relevant Bioinformatics Approaches to Uncover Novel Insights in Studying Human Spermatogenesis
2025, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-82990-1_9
PMID:40301258
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术研究人类精子发生过程及其在病理条件下的分子机制 | 揭示了支持细胞在精子发生中的关键作用及其在病理条件下的功能紊乱 | NA | 研究人类精子发生的细胞和分子机制 | 人类睾丸组织中的支持细胞、间质细胞和生殖细胞 | 生物信息学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8938 | 2025-10-07 |
Computational Approaches in Spatial Transcriptomics for the Study of Mammalian Spermatogenesis
2025, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-82990-1_8
PMID:40301257
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术在哺乳动物精子发生研究中的计算方法与应用 | 将空间转录组学技术引入精子发生研究,从单细胞水平扩展到二维空间坐标系统,揭示睾丸组织中细胞类型的空间定位和分子互作 | NA | 探讨空间转录组学计算方法在哺乳动物精子发生研究中的应用 | 啮齿类和人类睾丸组织中的精子发生过程 | 空间转录组学 | 男性不育 | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
8939 | 2025-10-07 |
Cytokines reprogram airway sensory neurons in asthma
2024-12-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.115045
PMID:39661516
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研究论文 | 本研究揭示了哮喘中细胞因子通过JAK/STAT6通路重编程气道伤害感受神经元获得促炎表型的机制 | 首次发现IL-13通过JAK/STAT6通路触发伤害感受神经元中Npy1r过表达,并揭示NPY/NPY1R信号轴在限制神经元兴奋性中的代偿作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究过敏反应中伤害感受神经元获得促炎特性的分子机制 | 小鼠气道伤害感受神经元 | 神经免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序,逆行追踪,谱系报告,细胞因子筛选 | NA | 基因表达数据,细胞成像 | 卵清蛋白诱导的过敏性气道炎症小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8940 | 2025-10-07 |
Cytokines reprogram airway sensory neurons in asthma
2024-Sep-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.26.525731
PMID:39345572
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研究论文 | 本研究揭示了哮喘中细胞因子如何重编程气道感觉神经元及其在过敏反应中的作用机制 | 发现了一类特异性支配气道的炎症性迷走伤害感受神经元,并阐明了IL-13通过JAK/STAT6通路驱动神经元重编程的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究过敏性气道炎症中伤害感受神经元获得促炎特性的分子机制 | 小鼠气道伤害感受神经元和肺免疫细胞 | 神经免疫学 | 哮喘 | 逆行追踪、谱系报告、单细胞RNA测序、细胞特异性基因敲除 | NA | 基因表达数据、细胞测序数据 | 卵清蛋白诱导的气道炎症小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |