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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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8901 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomic analysis reveals significant differences in tumor microenvironment in HPV-dependent and HPV-independent vulvar squamous cell carcinoma
2025-Feb, Gynecologic oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.ygyno.2025.01.002
PMID:39787746
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学分析HPV依赖型和HPV非依赖型外阴鳞状细胞癌肿瘤微环境的差异 | 首次在外阴鳞状细胞癌中应用空间转录组学技术,揭示了HPV依赖型和HPV非依赖型肿瘤在免疫细胞组成和基因表达谱上的显著差异 | 样本量较小(仅4例早期VSCC病例),需要更大规模研究验证发现 | 探索HPV依赖型和HPV非依赖型外阴鳞状细胞癌肿瘤微环境的差异 | 外阴鳞状细胞癌患者组织样本 | 空间转录组学 | 外阴鳞状细胞癌 | 空间转录组测序,CIBERSORTx细胞类型推断 | NA | 空间基因表达数据 | 4例早期外阴鳞状细胞癌病例(2例HPV依赖型,2例HPV非依赖型),28,183个Visium检测点 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Genomics Visium空间转录组平台 |
8902 | 2025-10-07 |
Multi-omics-based mapping of decidualization resistance in patients with a history of severe preeclampsia
2025-Feb, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-024-03407-7
PMID:39775038
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研究论文 | 通过多组学策略解析严重先兆子痫患者子宫内膜蜕膜化抵抗的细胞和分子特征 | 首次采用多组学方法系统揭示严重先兆子痫患者子宫内膜蜕膜化抵抗的细胞组成变化和细胞间通讯异常 | 样本量相对有限(sPE组11例,对照组12例),需要进一步验证 | 探究严重先兆子痫患者子宫内膜蜕膜化抵抗的分子机制 | 严重先兆子痫患者和对照组的子宫内膜样本 | 数字病理学 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,激光捕获显微切割/质谱分析 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,质谱数据,组织图像数据 | sPE患者11例,对照组12例 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,质谱分析 | NA | NA |
8903 | 2025-10-07 |
The epitranscriptional factor PCIF1 orchestrates CD8+ T cell ferroptosis and activation to control antitumor immunity
2025-Feb, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-02047-w
PMID:39762445
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研究论文 | 本研究揭示RNA甲基转移酶PCIF1通过调控CD8+ T细胞的铁死亡和活化来抑制抗肿瘤免疫 | 首次发现PCIF1通过m6A修饰调控铁死亡抑制基因和T细胞活化基因,影响CD8+ T细胞的抗肿瘤功能 | 研究主要基于小鼠模型,临床相关性仍需进一步验证 | 探究PCIF1在CD8+ T细胞抗肿瘤免疫中的调控机制 | CD8+ T细胞、肿瘤浸润淋巴细胞 | 免疫学、肿瘤学 | 癌症 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、m6A测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质组数据、表观转录组数据 | 小鼠模型及临床患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8904 | 2025-10-07 |
Immunophenotyping of Synovial Tissue in Adolescents Undergoing ACL Reconstruction: What Is the Role of Synovial Inflammation in Arthrofibrosis?
2025-Feb, The American journal of sports medicine
DOI:10.1177/03635465241305411
PMID:39772756
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研究论文 | 通过滑膜组织免疫表型分析探讨青少年前交叉韧带重建术后关节纤维化的机制 | 首次在青少年ACLR患者中通过单细胞RNA测序识别出三种不同的滑膜免疫表型,并发现T细胞浸润与术后关节活动度呈负相关 | 样本量较小(n=17),证据等级为4级,需要更大规模研究验证 | 探究滑膜炎症在ACL重建术后关节纤维化中的作用 | 10-18岁接受初次ACL重建的青少年患者 | 数字病理学 | 骨科疾病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | 主成分分析, 聚类分析 | 基因表达数据, 临床数据 | 17例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8905 | 2025-10-07 |
Multimodal transcriptomics reveal neurogenic aging trajectories and age-related regional inflammation in the dentate gyrus
2025-Feb, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01848-4
PMID:39762661
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示了齿状回神经源性衰老轨迹及与年龄相关的区域炎症 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,首次系统揭示了神经干细胞从静息激活到命运决定后代的终生分子动态变化及早期神经炎症对神经源性活动的影响 | 研究主要关注齿状回区域,未全面评估整个海马体的年龄相关变化 | 探究齿状回神经源性细胞的衰老轨迹及年龄相关的分子变化 | 哺乳动物齿状回的神经干细胞及其周围微环境细胞 | 单细胞生物学 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
8906 | 2025-10-07 |
Development of a ferroptosis-related gene prognostic model and molecular subgroups characterization in sepsis
2025-Feb, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2024.12.008
PMID:39764891
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研究论文 | 开发基于铁死亡相关基因的脓毒症预后模型并鉴定分子亚型 | 首次构建基于铁死亡相关基因的脓毒症预后模型,发现TFRC是抑制铁死亡的关键调控因子 | 研究样本量有限,需要进一步临床验证 | 建立脓毒症预后预测模型并探索铁死亡相关基因的分子机制 | 脓毒症患者基因表达数据 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞测序, siRNA转染, MDA测定, Western blot, ROS测定 | Cox回归, LASSO回归 | 基因表达数据 | GSE65682数据集样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8907 | 2025-10-07 |
A CRISPR view on genetic screens in Toxoplasma gondii
2025-Feb, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2024.102577
PMID:39778479
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综述 | 本文综述了CRISPR-Cas9筛选技术在弓形虫基因研究中的应用现状与前景 | 系统总结了CRISPR-Cas9技术在弓形虫研究中的最新进展,包括非生存表型筛选方法的开发 | 存在当前技术局限性,需进一步开发适用于其他顶复门寄生虫的筛选方法 | 探讨CRISPR-Cas9筛选技术在弓形虫基因功能研究中的应用 | 顶复门寄生虫弓形虫及其与宿主的相互作用 | 基因编辑技术 | 寄生虫感染 | CRISPR-Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序, 成像技术 | NA | 基因筛选数据, 表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 高通量筛选 | NA | NA |
8908 | 2025-10-07 |
Neural pathways of nausea and roles in energy balance
2025-Feb, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2024.102963
PMID:39765206
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综述 | 本文总结恶心神经通路及其在能量平衡调节作用的最新研究进展 | 通过单细胞测序和功能图谱技术阐明脑干最后区参与的恶心神经通路,并发现新的恶心感觉信号 | NA | 探讨恶心感觉的神经基础及其在能量平衡调节中的作用 | 胃肠道相关感觉的神经编码机制 | 神经科学 | 代谢疾病 | 单细胞测序,功能图谱 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
8909 | 2025-10-07 |
A Universal Strategy of Anti-Tumor mRNA Vaccine by Harnessing "Off-the-Shelf" Immunity
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202401287
PMID:39761175
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研究论文 | 本研究开发了一种利用现成免疫的通用抗肿瘤mRNA疫苗策略 | 通过利用已知抗原的现成免疫,克服了个性化新抗原疫苗识别困难的限制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 开发通用型抗肿瘤mRNA疫苗策略 | 肿瘤细胞、细胞毒性T淋巴细胞、肿瘤微环境 | 生物医学工程 | 肿瘤 | 单细胞测序、mRNA疫苗技术 | NA | 测序数据、实验观察数据 | 三种小鼠皮下实体瘤模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
8910 | 2025-10-07 |
Posttranscriptional Control of Neural Progenitors Temporal Dynamics During Neocortical Development by Syncrip
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202411732
PMID:39776340
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研究论文 | 本研究揭示了Syncrip通过转录后调控机制调控大脑皮层神经发生过程中放射状胶质细胞命运进展的作用 | 首次发现Syncrip通过相分离机制调控Notch信号通路,控制大脑皮层神经发生的时间动态 | 研究主要基于小鼠模型,人类突变的功能验证仍需进一步研究 | 探究大脑皮层发育过程中神经前体细胞时间动态的转录后调控机制 | 小鼠大脑皮层放射状胶质细胞和神经发生过程 | 发育神经生物学 | 神经系统发育疾病 | 单细胞RNA测序,基因敲除 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8911 | 2025-10-07 |
SEE: A Method for Predicting the Dynamics of Chromatin Conformation Based on Single-Cell Gene Expression
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202406413
PMID:39778075
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研究论文 | 提出了一种基于单细胞基因表达预测染色质构象动态的人工智能方法SEE | 结合自编码器和transformer技术,利用单细胞RNA测序数据和少量单细胞Hi-C图谱分析染色质动态 | 仅使用有限数量的单细胞Hi-C图谱 | 开发预测染色质构象动态的计算方法 | 染色质构象动态 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞Hi-C | 自编码器, transformer | 基因表达数据, 染色质构象数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞Hi-C | NA | NA |
8912 | 2025-10-07 |
Animal and vegetal materials of mouse oocytes segregate at first zygotic cleavage: a simple mechanism that makes the two-cell blastomeres differ reciprocally from the start
2025-Jan-17, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaae045
PMID:39786543
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研究论文 | 本研究通过控制小鼠卵母细胞受精位点,揭示了第一次合子分裂时动植物物质分离的机制 | 首次证明哺乳动物第一次卵裂会分离动植物物质,使两个卵裂球从一开始就具有差异 | 研究仅限于小鼠模型,需要进一步验证在其他哺乳动物中的适用性 | 探究两个细胞期胚胎卵裂球差异形成的机制 | 小鼠卵母细胞和两个细胞期胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组分析、ICSI(卵胞浆内单精子注射)、图像分析 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 不同受精位点的小鼠卵母细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8913 | 2025-10-07 |
Transcriptional dynamics during karyogamy in rice zygotes
2025-Jan-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204497
PMID:39777484
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示水稻合子核配过程中的基因表达动态 | 首次在植物合子中系统分析核配期间的转录动态,发现父本等位基因在核融合开始时激活表达 | 仅关注早期发育阶段(6小时内),未涉及更后期的胚胎发育过程 | 探究植物合子核配过程中的转录调控机制 | 水稻合子 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,时间序列分析 | NA | 转录组数据 | 六个发育时间点的水稻合子(15分钟,30分钟,1小时,2小时,4小时,6小时) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8914 | 2025-10-07 |
[WWP1 plays a positive role in ameloblast differentiation and enamel formation in mice]
2025-Jan-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 本研究探讨了WWP1在小鼠成釉细胞分化和釉质形成中的积极作用 | 首次通过单细胞RNA测序和基因敲除模型系统揭示了WWP1在釉质发育中的关键功能 | 研究仅限于小鼠模型,样本量相对较小(每组3-6只小鼠) | 研究WWP1在釉质发育中的作用机制 | 小鼠切牙组织和下颌第一磨牙牙胚 | 发育生物学 | 牙釉质发育异常 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 显微CT, 扫描电镜, 能量色散谱, 免疫荧光, Western blot | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 影像数据, 蛋白质表达数据 | P1和P7每组3只小鼠,P14、P28、2月龄和3月龄每组6只小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8915 | 2025-10-07 |
[Advances in tooth development studies based on single-cell RNA sequencing]
2025-Jan-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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综述 | 总结单细胞RNA测序技术在牙齿发育研究中的最新进展 | 利用单细胞RNA测序技术揭示牙齿发育过程中的细胞异质性和发育轨迹 | NA | 阐明牙齿发育的复杂生物学过程并识别潜在治疗靶点 | 牙齿发育过程中的上皮细胞和间充质细胞 | 单细胞生物学 | 口腔发育疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8916 | 2025-10-07 |
Tumor-initiating cells escape tumor immunity via CCL8 from tumor-associated macrophages in mice
2025-Jan-07, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI180893
PMID:39774471
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤起始细胞通过肿瘤相关巨噬细胞分泌的CCL8逃避免疫清除的机制 | 首次发现WNT激活的恶性细胞亚群作为肿瘤起始细胞,并阐明其通过GAS6/AXL/MERTK信号通路与调节性TAMs相互作用介导免疫逃逸的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究肿瘤起始细胞逃避免疫清除的分子机制 | 小鼠肿瘤模型中的肿瘤起始细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,双重组酶谱系追踪,基因敲除 | Axl/Mertk条件性双敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
8917 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing identifies CXADR as a fate determinant of the placental exchange surface
2025-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55597-w
PMID:39747179
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术识别CXADR作为胎盘交换表面命运决定因子的研究 | 首次发现连接区前体细胞与迷路层Syncytiotrophoblast-I谱系具有相似分化轨迹,并鉴定CXADR作为调控胎盘迷路层两个合体层分化动态的关键表面蛋白 | 研究仅基于小鼠模型,人类胎盘发育可能存在差异 | 解析滋养层细胞谱系分化的分子机制及其在胎盘形成中的作用 | 小鼠滋养层干细胞及其早期分化过程 | 单细胞生物学 | 妊娠并发症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠滋养层干细胞分化过程中的单细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8918 | 2025-10-07 |
Orthologous marker groups reveal broad cell identity conservation across plant single-cell transcriptomes
2025-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55755-0
PMID:39747890
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研究论文 | 开发了一种名为OMG的计算方法,用于识别植物单细胞转录组中的细胞类型并比较跨物种细胞类型保守性 | 提出无需跨物种数据整合即可准确确定物种间细胞相似性的新计算策略 | NA | 解决植物单细胞RNA测序中细胞类型标记基因稀缺和表达模式分歧的问题 | 15种不同植物物种的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 100万个细胞,268个细胞簇,涵盖15种植物物种 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8919 | 2025-10-07 |
Physiological premature aging of ovarian blood vessels leads to decline in fertility in middle-aged mice
2025-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55509-y
PMID:39747922
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研究论文 | 通过全器官成像和单细胞测序技术揭示中年小鼠卵巢血管生理性早衰导致生育力下降的机制 | 首次发现卵巢血管内皮细胞衰老是导致生育力下降的主要因素,并验证了红景天苷可逆转血管衰老 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探究中年雌性生育力下降的机制及干预策略 | 中年雌性小鼠的卵巢血管系统 | 生殖医学 | 生育力下降 | 单细胞测序, 全器官成像, 基因修饰小鼠模型 | NA | 图像数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8920 | 2025-10-07 |
Decoding the role of SLC25A5 in osteosarcoma drug resistance and CD8+ T cell exhaustion: The therapeutic potential of phyllanthin
2025-Jan, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2024.156291
PMID:39752785
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析骨肉瘤肿瘤免疫微环境,揭示SLC25A5基因在促进CD8+ T细胞耗竭和药物抵抗中的作用,并发现叶下珠素通过抑制SLC25A5表达增强化疗敏感性 | 首次探索骨肉瘤的单细胞时空进化,发现SLC25A5在药物抵抗和免疫逃逸中的新致病作用,提出叶下珠素作为潜在治疗药物 | NA | 研究骨肉瘤的发病机制及药物抵抗机制 | 骨肉瘤细胞、CD8+ T细胞、肿瘤免疫微环境 | 单细胞测序分析 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序、功能实验验证 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |