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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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8901 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics of esophageal squamous cell carcinoma with lymph node metastases
2025-Feb, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01369-x
PMID:39741182
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术研究食管鳞癌淋巴结转移的细胞和分子特征 | 首次结合单细胞测序、空间转录组学和多重免疫组化技术系统分析食管鳞癌淋巴结转移的细胞亚群和分子机制 | 样本量较小(12例患者),需要更大规模研究验证 | 探索食管鳞癌淋巴结转移的细胞和分子特征 | 食管鳞癌患者的原发肿瘤组织、癌旁组织、转移性和非转移性淋巴结 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫组化 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 免疫组化图像 | 12例转移性食管鳞癌患者,共分析161,333个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
8902 | 2025-10-07 |
CD300E+ macrophages facilitate liver regeneration after splenectomy in decompensated cirrhotic patients
2025-Feb, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01371-3
PMID:39741181
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研究论文 | 本研究探讨脾切除术后CD300E+巨噬细胞在肝硬化患者肝脏再生中的作用机制 | 首次发现CD300E+巨噬细胞通过分泌NAMPT促进肝细胞NAD合成从而驱动肝脏再生 | 样本量有限(54例患者,3对配对肝组织),需更大规模研究验证 | 探索脾切除后肝硬化患者肝脏再生的免疫机制 | 失代偿期肝硬化患者及小鼠肝硬化模型 | 单细胞生物学 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序 | 小鼠肝硬化模型,共培养系统 | 单细胞转录组数据,临床数据 | 54例患者,3对配对肝组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8903 | 2025-10-07 |
SPOCK2 controls the proliferation and function of immature pancreatic β-cells through MMP2
2025-Feb, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01380-2
PMID:39741186
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研究论文 | 本研究揭示了SPOCK2通过调控MMP2表达抑制未成熟胰腺β细胞增殖的分子机制 | 首次发现SPOCK2作为细胞外基质蛋白通过MMP2-β整合素-FAK-c-JUN通路调控未成熟β细胞增殖的新机制 | 研究主要基于干细胞来源的β细胞,需要进一步验证在原生胎儿β细胞中的适用性 | 探索调控未成熟胰腺β细胞增殖和功能的分子机制 | 人多能干细胞来源的β细胞(SC-β-cells) | 干细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 双向表达调控 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8904 | 2025-10-07 |
Genetic associations between immune-related plasma proteins and neurodegenerative diseases
2025-Feb, Neurological research
IF:1.7Q4
DOI:10.1080/01616412.2024.2448745
PMID:39743746
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研究论文 | 本研究通过整合全基因组关联研究和血浆蛋白质组分析,探讨免疫相关血浆蛋白与神经退行性疾病风险之间的关联 | 首次系统性地将4907种免疫相关血浆蛋白的GWAS数据与四种主要神经退行性疾病风险进行关联分析,并结合单细胞RNA测序数据验证蛋白表达分布 | 研究主要基于遗传关联分析,需要进一步实验验证这些血浆蛋白在神经退行性疾病中的具体作用机制 | 探究免疫相关血浆蛋白与神经退行性疾病风险之间的遗传关联 | 阿尔茨海默病、帕金森病、肌萎缩侧索硬化症和多发性硬化症四种神经退行性疾病 | 生物信息学 | 神经退行性疾病 | 全基因组关联研究(GWAS), 单细胞RNA测序, 血浆蛋白质组分析 | 遗传关联分析 | 基因组数据, 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | 涉及4907种免疫相关血浆蛋白的GWAS数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 全基因组关联分析, 血浆蛋白质组分析 | NA | NA |
8905 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomics Identifies Selective Lineage-Specific Regulation of Genes in Aortic Smooth Muscle Cells in Mice
2025-Feb, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321482
PMID:39744838
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研究论文 | 通过单细胞转录组学识别小鼠主动脉平滑肌细胞中谱系特异性基因调控差异 | 首次在正常对照主动脉中发现心脏神经嵴和第二心场来源的平滑肌细胞存在预设的转录组差异 | 研究仅针对14周龄雄性小鼠,样本来源和年龄范围有限 | 探究不同胚胎来源的主动脉平滑肌细胞在转录组水平的差异 | 小鼠主动脉根部和升主动脉的平滑肌细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,单核转座酶可及染色质测序,RNA原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据,表观基因组数据 | 14周龄SHF追踪和CNC追踪雄性小鼠 | NA | 单细胞RNA测序,单核ATAC测序 | NA | NA |
8906 | 2025-10-07 |
Circulatory age-associated B cells: Their distinct transcriptomic characteristics and clinical significance in drug-naïve patients with rheumatoid arthritis
2025-Feb, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110425
PMID:39746429
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了类风湿关节炎患者循环年龄相关B细胞的转录组特征及其临床意义 | 首次在类风湿关节炎患者中发现循环年龄相关B细胞具有髓系特征,并确定SYK为其关键调控因子 | 研究样本仅限于初治类风湿关节炎患者,未涉及治疗中患者或其他自身免疫疾病对照 | 探究循环年龄相关B细胞在类风湿关节炎中的转录组特征和临床意义 | 类风湿关节炎患者的循环年龄相关B细胞 | 单细胞组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 网络分析, 体外实验 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 类风湿关节炎患者外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8907 | 2025-10-07 |
Cardiac conduction system regeneration prevents arrhythmias after myocardial infarction
2025-Feb, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-024-00586-x
PMID:39753976
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研究论文 | 本研究通过比较新生小鼠心脏再生与成年期病理重塑过程,揭示了心肌梗死后心脏传导系统再生机制及其与心律失常的关系 | 首次系统揭示心脏传导系统在再生过程中的恢复机制,并通过组织透明化全器官成像和单细胞测序技术发现传导纤维紊乱与His-Purkinje系统破坏是心律失常的关键原因 | 研究主要基于小鼠模型,人类心脏数据通过建模推断,需要进一步临床验证 | 探究心肌梗死后心脏传导系统再生机制及心律失常发生原理 | 新生和成年小鼠心脏组织,人类心脏梗死模型 | 心血管研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 组织透明化全器官成像 | 小鼠心脏再生模型, 人类心脏梗死模型 | 基因表达数据, 影像数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8908 | 2025-10-07 |
Inferring multi-slice spatially resolved gene expression from H&E-stained histology images with STMCL
2025-Feb, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2024.11.016
PMID:39755346
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研究论文 | 提出一种名为STMCL的多模态对比学习框架,用于从H&E染色组织学图像推断空间基因表达 | 首次整合组织学图像、基因表达特征和空间位置信息的多模态对比学习框架,能够准确预测空间基因表达谱 | 仅测试了10X Genomics平台生成的数据集,未验证在其他平台上的适用性 | 开发从H&E染色组织学图像预测空间基因表达的深度学习方法 | 多切片空间转录组数据集 | 数字病理学 | 癌症 | 深度学习,对比学习 | 多模态对比学习框架 | 组织学图像,基因表达数据,空间位置数据 | 四个不同类型的多切片空间转录组数据集 | 10X Genomics | 空间转录组学 | 10X Genomics平台 | 多切片空间转录组数据集 |
8909 | 2025-10-07 |
Sonic Hedgehog signaling regulates the optimal differentiation pace from early-stage mesoderm to cardiogenic mesoderm in mice
2025-Feb, Development, growth & differentiation
DOI:10.1111/dgd.12955
PMID:39783159
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研究论文 | 本研究揭示了Sonic Hedgehog信号通路在小鼠早期心脏分化过程中调控分化速度的机制 | 发现SHH信号通过抑制T细胞向Mesp1新生中胚层细胞的过早分化来调控心脏分化节奏 | 研究主要基于小鼠模型,人类心脏发育可能存在差异 | 阐明Shh信号在心脏分化最早阶段的作用机制 | 小鼠早期中胚层细胞和心脏中胚层细胞 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8910 | 2025-10-07 |
Single-cell and spatial transcriptomic analyses reveal heterogeneity characteristics and specific cell subtype regulators in growth hormone-secreting pituitary adenomas
2025-Feb-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002178
PMID:39784532
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组分析揭示生长激素型垂体腺瘤的异质性特征及特定细胞亚型调控因子 | 构建了首个GHPA的单细胞和空间转录组图谱,识别了16种肿瘤细胞亚型及三种恶性偏向亚型 | 样本量有限(10个GHPA样本),需要更大规模验证 | 识别GHPA肿瘤异质性及预后相关标志物 | 生长激素型垂体腺瘤患者样本和正常垂体样本 | 单细胞组学 | 垂体腺瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | 多种算法分析 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 10个GHPA样本(其中4个同时进行空间转录组测序)和4个正常垂体对照样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | NA |
8911 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomic analysis reveals significant differences in tumor microenvironment in HPV-dependent and HPV-independent vulvar squamous cell carcinoma
2025-Feb, Gynecologic oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.ygyno.2025.01.002
PMID:39787746
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学分析HPV依赖型和HPV非依赖型外阴鳞状细胞癌肿瘤微环境的差异 | 首次在外阴鳞状细胞癌中应用空间转录组学技术,揭示了HPV依赖型和HPV非依赖型肿瘤在免疫细胞组成和基因表达谱上的显著差异 | 样本量较小(仅4例早期VSCC病例),需要更大规模研究验证发现 | 探索HPV依赖型和HPV非依赖型外阴鳞状细胞癌肿瘤微环境的差异 | 外阴鳞状细胞癌患者组织样本 | 空间转录组学 | 外阴鳞状细胞癌 | 空间转录组测序,CIBERSORTx细胞类型推断 | NA | 空间基因表达数据 | 4例早期外阴鳞状细胞癌病例(2例HPV依赖型,2例HPV非依赖型),28,183个Visium检测点 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Genomics Visium空间转录组平台 |
8912 | 2025-10-07 |
Multi-omics-based mapping of decidualization resistance in patients with a history of severe preeclampsia
2025-Feb, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-024-03407-7
PMID:39775038
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研究论文 | 通过多组学策略解析严重先兆子痫患者子宫内膜蜕膜化抵抗的细胞和分子特征 | 首次采用多组学方法系统揭示严重先兆子痫患者子宫内膜蜕膜化抵抗的细胞组成变化和细胞间通讯异常 | 样本量相对有限(sPE组11例,对照组12例),需要进一步验证 | 探究严重先兆子痫患者子宫内膜蜕膜化抵抗的分子机制 | 严重先兆子痫患者和对照组的子宫内膜样本 | 数字病理学 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,激光捕获显微切割/质谱分析 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,质谱数据,组织图像数据 | sPE患者11例,对照组12例 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,质谱分析 | NA | NA |
8913 | 2025-10-07 |
The epitranscriptional factor PCIF1 orchestrates CD8+ T cell ferroptosis and activation to control antitumor immunity
2025-Feb, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-02047-w
PMID:39762445
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研究论文 | 本研究揭示RNA甲基转移酶PCIF1通过调控CD8+ T细胞的铁死亡和活化来抑制抗肿瘤免疫 | 首次发现PCIF1通过m6A修饰调控铁死亡抑制基因和T细胞活化基因,影响CD8+ T细胞的抗肿瘤功能 | 研究主要基于小鼠模型,临床相关性仍需进一步验证 | 探究PCIF1在CD8+ T细胞抗肿瘤免疫中的调控机制 | CD8+ T细胞、肿瘤浸润淋巴细胞 | 免疫学、肿瘤学 | 癌症 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、m6A测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质组数据、表观转录组数据 | 小鼠模型及临床患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8914 | 2025-10-07 |
Immunophenotyping of Synovial Tissue in Adolescents Undergoing ACL Reconstruction: What Is the Role of Synovial Inflammation in Arthrofibrosis?
2025-Feb, The American journal of sports medicine
DOI:10.1177/03635465241305411
PMID:39772756
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研究论文 | 通过滑膜组织免疫表型分析探讨青少年前交叉韧带重建术后关节纤维化的机制 | 首次在青少年ACLR患者中通过单细胞RNA测序识别出三种不同的滑膜免疫表型,并发现T细胞浸润与术后关节活动度呈负相关 | 样本量较小(n=17),证据等级为4级,需要更大规模研究验证 | 探究滑膜炎症在ACL重建术后关节纤维化中的作用 | 10-18岁接受初次ACL重建的青少年患者 | 数字病理学 | 骨科疾病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | 主成分分析, 聚类分析 | 基因表达数据, 临床数据 | 17例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8915 | 2025-10-07 |
Multimodal transcriptomics reveal neurogenic aging trajectories and age-related regional inflammation in the dentate gyrus
2025-Feb, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01848-4
PMID:39762661
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示了齿状回神经源性衰老轨迹及与年龄相关的区域炎症 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,首次系统揭示了神经干细胞从静息激活到命运决定后代的终生分子动态变化及早期神经炎症对神经源性活动的影响 | 研究主要关注齿状回区域,未全面评估整个海马体的年龄相关变化 | 探究齿状回神经源性细胞的衰老轨迹及年龄相关的分子变化 | 哺乳动物齿状回的神经干细胞及其周围微环境细胞 | 单细胞生物学 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
8916 | 2025-10-07 |
Development of a ferroptosis-related gene prognostic model and molecular subgroups characterization in sepsis
2025-Feb, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2024.12.008
PMID:39764891
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研究论文 | 开发基于铁死亡相关基因的脓毒症预后模型并鉴定分子亚型 | 首次构建基于铁死亡相关基因的脓毒症预后模型,发现TFRC是抑制铁死亡的关键调控因子 | 研究样本量有限,需要进一步临床验证 | 建立脓毒症预后预测模型并探索铁死亡相关基因的分子机制 | 脓毒症患者基因表达数据 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞测序, siRNA转染, MDA测定, Western blot, ROS测定 | Cox回归, LASSO回归 | 基因表达数据 | GSE65682数据集样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8917 | 2025-10-07 |
A CRISPR view on genetic screens in Toxoplasma gondii
2025-Feb, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2024.102577
PMID:39778479
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综述 | 本文综述了CRISPR-Cas9筛选技术在弓形虫基因研究中的应用现状与前景 | 系统总结了CRISPR-Cas9技术在弓形虫研究中的最新进展,包括非生存表型筛选方法的开发 | 存在当前技术局限性,需进一步开发适用于其他顶复门寄生虫的筛选方法 | 探讨CRISPR-Cas9筛选技术在弓形虫基因功能研究中的应用 | 顶复门寄生虫弓形虫及其与宿主的相互作用 | 基因编辑技术 | 寄生虫感染 | CRISPR-Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序, 成像技术 | NA | 基因筛选数据, 表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 高通量筛选 | NA | NA |
8918 | 2025-10-07 |
Neural pathways of nausea and roles in energy balance
2025-Feb, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2024.102963
PMID:39765206
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综述 | 本文总结恶心神经通路及其在能量平衡调节作用的最新研究进展 | 通过单细胞测序和功能图谱技术阐明脑干最后区参与的恶心神经通路,并发现新的恶心感觉信号 | NA | 探讨恶心感觉的神经基础及其在能量平衡调节中的作用 | 胃肠道相关感觉的神经编码机制 | 神经科学 | 代谢疾病 | 单细胞测序,功能图谱 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
8919 | 2025-10-07 |
A Universal Strategy of Anti-Tumor mRNA Vaccine by Harnessing "Off-the-Shelf" Immunity
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202401287
PMID:39761175
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研究论文 | 本研究开发了一种利用现成免疫的通用抗肿瘤mRNA疫苗策略 | 通过利用已知抗原的现成免疫,克服了个性化新抗原疫苗识别困难的限制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 开发通用型抗肿瘤mRNA疫苗策略 | 肿瘤细胞、细胞毒性T淋巴细胞、肿瘤微环境 | 生物医学工程 | 肿瘤 | 单细胞测序、mRNA疫苗技术 | NA | 测序数据、实验观察数据 | 三种小鼠皮下实体瘤模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
8920 | 2025-10-07 |
Posttranscriptional Control of Neural Progenitors Temporal Dynamics During Neocortical Development by Syncrip
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202411732
PMID:39776340
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研究论文 | 本研究揭示了Syncrip通过转录后调控机制调控大脑皮层神经发生过程中放射状胶质细胞命运进展的作用 | 首次发现Syncrip通过相分离机制调控Notch信号通路,控制大脑皮层神经发生的时间动态 | 研究主要基于小鼠模型,人类突变的功能验证仍需进一步研究 | 探究大脑皮层发育过程中神经前体细胞时间动态的转录后调控机制 | 小鼠大脑皮层放射状胶质细胞和神经发生过程 | 发育神经生物学 | 神经系统发育疾病 | 单细胞RNA测序,基因敲除 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |