单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 8881 - 8900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8881 | 2025-10-07 |
SPP1-mediated M2 macrophage polarization shapes the tumor microenvironment and enhances prognosis and immunotherapy guidance in nasopharyngeal carcinoma
2025-Feb-06, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113944
PMID:39742726
|
研究论文 | 本研究探讨SPP1在鼻咽癌肿瘤微环境中的作用及其通过调控M2巨噬细胞极化影响预后的机制 | 首次揭示SPP1通过CD44/JAK2/STAT3信号通路促进M2巨噬细胞极化的机制，并建立基于机器学习的SPP1相关M2巨噬细胞特征标志 | 研究主要基于回顾性数据，需要进一步的前瞻性研究验证 | 探索SPP1在鼻咽癌肿瘤微环境中的作用及其临床意义 | 鼻咽癌患者样本和肿瘤细胞-巨噬细胞共培养体系 | 肿瘤免疫学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析，体外共培养实验 | 机器学习框架 | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 福建肿瘤医院鼻咽癌队列、GEO数据库数据集和单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8882 | 2025-10-07 |
Unveiling the role of ACTL6A in uveal melanoma metastasis and immune microenvironment
2025-Feb-06, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113841
PMID:39746274
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析揭示ACTL6A在葡萄膜黑色素瘤转移和免疫微环境中的作用 | 发现ACTL6A作为葡萄膜黑色素瘤预后不良的风险因子，并通过单细胞转录组测序鉴定出新的免疫细胞亚群 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证 | 评估ACTL6A在葡萄膜黑色素瘤预后和发展中的机制和临床价值 | 葡萄膜黑色素瘤患者样本和肿瘤微环境 | 生物信息学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | Kaplan-Meier分析, QUANTISEQ, MCP-counter | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 来自TCGA和8个GEO数据库的葡萄膜黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 8883 | 2025-10-07 |
Shared chemoresistance genes in ESCC and cervical Cancer: Insights from pharmacogenomics and Mendelian randomization
2025-Feb-06, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113933
PMID:39755112
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化和药物基因组学方法，识别食管鳞状细胞癌和宫颈癌中共享的化疗耐药基因 | 首次结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法，系统分析CD8+T效应记忆细胞在两种上皮源性肿瘤化疗耐药中的关键作用 | 研究依赖于现有基因组关联研究数据，样本来源和数量可能存在限制 | 探索食管鳞状细胞癌和宫颈癌化疗耐药的共同遗传机制 | 食管鳞状细胞癌和宫颈癌患者样本 | 生物信息学 | 食管癌,宫颈癌 | 单细胞RNA测序,孟德尔随机化,MTT检测,免疫组化 | 孟德尔随机化模型 | 基因组数据,单细胞转录组数据 | 多个队列的基因组关联研究数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8884 | 2025-10-07 |
KLF2-dependent transcriptional regulation safeguards the heart against pathological hypertrophy
2025-Feb, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2024.12.010
PMID:39733990
|
研究论文 | 本研究揭示了转录因子KLF2在心脏中的保护作用，证明其通过直接调控与心脏肥大相关基因来抑制病理性心脏肥大 | 首次证明KLF2是心脏肥大的负调控因子，并发现辛伐他汀可通过提升KLF2表达缓解心肌细胞肥大 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，尚未在人类临床环境中验证 | 探究转录因子KLF2在心肌细胞生物学中的作用及其对心脏肥大的调控机制 | 雄性C57BL/6J小鼠、新生大鼠心室肌细胞、人胚胎干细胞来源的心肌细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, RNA-seq, CUT&Tag | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 多种动物模型和细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 8885 | 2025-10-07 |
Laser-capture microdissection for spatial transcriptomics of immunohistochemically detected neurons
2025-Feb, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2024.108150
PMID:39736395
|
研究论文 | 开发了一种用于免疫组化检测神经元空间转录组学的IHC/LCM-Seq方法 | 使用铝试剂和聚乙烯磺酸开发创新的RNA保存策略，在4%甲醛固定脑组织的游离切片中保持RNA完整性 | NA | 开发用于免疫组化检测神经元空间转录组学的高灵敏度方法 | 纹状体胆碱能中间神经元和促性腺激素释放激素(GnRH)神经元 | 空间转录组学 | NA | 激光捕获显微切割，免疫组织化学，RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 成年雄性大鼠和小鼠的GnRH神经元 | Illumina | bulk RNA-seq | NextSeq | Illumina NextSeq平台 |
| 8886 | 2025-10-07 |
Sex-dependent molecular landscape of Alzheimer's disease revealed by large-scale single-cell transcriptomics
2025-Feb, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.14476
PMID:39737748
|
研究论文 | 通过大规模单细胞转录组学研究揭示阿尔茨海默病中性别依赖的分子特征 | 首次利用大规模单细胞转录组图谱系统揭示阿尔茨海默病中性别特异的分子变化，包括细胞类型特异性基因表达、通路改变和细胞间通讯模式 | 研究仅基于前额叶皮层样本，未涵盖其他脑区；机制验证实验不足 | 探究阿尔茨海默病中性别差异的分子机制 | 人类前额叶皮层细胞 | 单细胞转录组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 差异基因表达分析、通路富集分析、基因调控网络构建、细胞通讯分析 | 单细胞转录组数据 | 大规模人类前额叶皮层单细胞图谱 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8887 | 2025-10-07 |
Aldehyde Dehydrogenase 2 Lactylation Aggravates Mitochondrial Dysfunction by Disrupting PHB2 Mediated Mitophagy in Acute Kidney Injury
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202411943
PMID:39737891
|
研究论文 | 本研究揭示了ALDH2乳酸化通过破坏PHB2介导的线粒体自噬加重急性肾损伤中线粒体功能障碍的机制 | 首次发现ALDH2蛋白的K52位点乳酸化修饰及其在急性肾损伤中的致病作用，并阐明其通过促进PHB2泛素化降解抑制线粒体自噬的分子机制 | 研究主要基于细胞和小鼠模型，在人类患者中的验证仍需进一步研究 | 探究乳酸化修饰在急性肾损伤发病机制中的作用及分子机制 | 急性肾损伤患者和小鼠的肾组织、HK-2人肾小管上皮细胞 | 分子生物学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序, 免疫沉淀-质谱分析, 腺相关病毒感染 | NA | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据 | AKI患者和小鼠肾组织样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8888 | 2025-10-07 |
A Distinguished Roadmap of Fibroblast Senescence in Predicting Immunotherapy Response and Prognosis Across Human Cancers
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202406624
PMID:39739618
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现成纤维细胞在肿瘤相关细胞群中表现出最显著的细胞衰老特征，并开发了成纤维细胞衰老相关转录组特征用于预测免疫检查点抑制剂反应和预后 | 首次系统性地揭示了成纤维细胞衰老在肿瘤免疫治疗耐药中的关键作用，并开发了基于机器学习的预测框架 | 需要进一步的临床验证来确认这些发现的临床应用价值 | 探究细胞衰老与肿瘤免疫治疗耐药的关系，并开发预测免疫治疗反应的生物标志物 | 人类多种癌症类型中的成纤维细胞和肿瘤微环境 | 生物信息学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9筛选, 机器学习 | 机器学习框架 | 单细胞转录组数据, 基因组编辑数据 | 多个验证队列和内部队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8889 | 2025-10-07 |
Tertiary Lymphoid Structures are Linked to Enhanced Antitumor Immunity and Better Prognosis in Muscle-Invasive Bladder Cancer
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202410998
PMID:39739621
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法探讨三级淋巴结构在肌层浸润性膀胱癌中的预后价值及免疫机制 | 首次系统揭示CXCL13+ T细胞通过CXCR5/NR4A2轴促进三级淋巴结构形成的机制，并开发了TLS特异性基因标志物 | 研究样本量有限，机制研究仍需进一步实验验证 | 探究三级淋巴结构与肌层浸润性膀胱癌预后的关系及其免疫机制 | 肌层浸润性膀胱癌患者样本 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序,免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据,组织图像数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 8890 | 2025-10-07 |
Clonal GZMK+CD8+ T cells are identified as a hallmark of the pathogenesis of cGVHD-induced bronchiolitis obliterans syndrome after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation
2025-Feb, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105535
PMID:39740295
|
研究论文 | 本研究通过多组学技术鉴定出克隆性GZMK+CD8+ T细胞是cGVHD诱导的闭塞性细支气管炎综合征发病机制的关键标志物 | 首次发现循环GZMK+CD8+ T细胞在cGVHD-BOS患者中积累，并证实GZMK可诱导人成纤维细胞表达纤维化必需蛋白 | 样本量有限（22例cGVHD患者和11例对照），需更大规模研究验证 | 探索cGVHD诱导的闭塞性细支气管炎综合征的发病机制 | 异基因造血干细胞移植后患者和小鼠模型 | 免疫学 | 移植物抗宿主病 | 质谱流式细胞术,RNA测序,定量细胞因子阵列,单细胞RNA测序,单细胞V(D)J测序 | NA | 单细胞数据,基因表达数据,蛋白质数据 | 22例cGVHD患者和11例无cGVHD患者 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞V(D)J测序 | NA | NA |
| 8891 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics of esophageal squamous cell carcinoma with lymph node metastases
2025-Feb, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01369-x
PMID:39741182
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术研究食管鳞癌淋巴结转移的细胞和分子特征 | 首次结合单细胞测序、空间转录组学和多重免疫组化技术系统分析食管鳞癌淋巴结转移的细胞亚群和分子机制 | 样本量较小（12例患者），需要更大规模研究验证 | 探索食管鳞癌淋巴结转移的细胞和分子特征 | 食管鳞癌患者的原发肿瘤组织、癌旁组织、转移性和非转移性淋巴结 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫组化 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 免疫组化图像 | 12例转移性食管鳞癌患者，共分析161,333个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8892 | 2025-10-07 |
CD300E+ macrophages facilitate liver regeneration after splenectomy in decompensated cirrhotic patients
2025-Feb, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01371-3
PMID:39741181
|
研究论文 | 本研究探讨脾切除术后CD300E+巨噬细胞在肝硬化患者肝脏再生中的作用机制 | 首次发现CD300E+巨噬细胞通过分泌NAMPT促进肝细胞NAD合成从而驱动肝脏再生 | 样本量有限（54例患者，3对配对肝组织），需更大规模研究验证 | 探索脾切除后肝硬化患者肝脏再生的免疫机制 | 失代偿期肝硬化患者及小鼠肝硬化模型 | 单细胞生物学 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序 | 小鼠肝硬化模型，共培养系统 | 单细胞转录组数据，临床数据 | 54例患者，3对配对肝组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8893 | 2025-10-07 |
SPOCK2 controls the proliferation and function of immature pancreatic β-cells through MMP2
2025-Feb, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01380-2
PMID:39741186
|
研究论文 | 本研究揭示了SPOCK2通过调控MMP2表达抑制未成熟胰腺β细胞增殖的分子机制 | 首次发现SPOCK2作为细胞外基质蛋白通过MMP2-β整合素-FAK-c-JUN通路调控未成熟β细胞增殖的新机制 | 研究主要基于干细胞来源的β细胞，需要进一步验证在原生胎儿β细胞中的适用性 | 探索调控未成熟胰腺β细胞增殖和功能的分子机制 | 人多能干细胞来源的β细胞(SC-β-cells) | 干细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 双向表达调控 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8894 | 2025-10-07 |
Genetic associations between immune-related plasma proteins and neurodegenerative diseases
2025-Feb, Neurological research
IF:1.7Q4
DOI:10.1080/01616412.2024.2448745
PMID:39743746
|
研究论文 | 本研究通过整合全基因组关联研究和血浆蛋白质组分析，探讨免疫相关血浆蛋白与神经退行性疾病风险之间的关联 | 首次系统性地将4907种免疫相关血浆蛋白的GWAS数据与四种主要神经退行性疾病风险进行关联分析，并结合单细胞RNA测序数据验证蛋白表达分布 | 研究主要基于遗传关联分析，需要进一步实验验证这些血浆蛋白在神经退行性疾病中的具体作用机制 | 探究免疫相关血浆蛋白与神经退行性疾病风险之间的遗传关联 | 阿尔茨海默病、帕金森病、肌萎缩侧索硬化症和多发性硬化症四种神经退行性疾病 | 生物信息学 | 神经退行性疾病 | 全基因组关联研究(GWAS), 单细胞RNA测序, 血浆蛋白质组分析 | 遗传关联分析 | 基因组数据, 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | 涉及4907种免疫相关血浆蛋白的GWAS数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 全基因组关联分析, 血浆蛋白质组分析 | NA | NA |
| 8895 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomics Identifies Selective Lineage-Specific Regulation of Genes in Aortic Smooth Muscle Cells in Mice
2025-Feb, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321482
PMID:39744838
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学识别小鼠主动脉平滑肌细胞中谱系特异性基因调控差异 | 首次在正常对照主动脉中发现心脏神经嵴和第二心场来源的平滑肌细胞存在预设的转录组差异 | 研究仅针对14周龄雄性小鼠，样本来源和年龄范围有限 | 探究不同胚胎来源的主动脉平滑肌细胞在转录组水平的差异 | 小鼠主动脉根部和升主动脉的平滑肌细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,单核转座酶可及染色质测序,RNA原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据,表观基因组数据 | 14周龄SHF追踪和CNC追踪雄性小鼠 | NA | 单细胞RNA测序,单核ATAC测序 | NA | NA |
| 8896 | 2025-10-07 |
Circulatory age-associated B cells: Their distinct transcriptomic characteristics and clinical significance in drug-naïve patients with rheumatoid arthritis
2025-Feb, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110425
PMID:39746429
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了类风湿关节炎患者循环年龄相关B细胞的转录组特征及其临床意义 | 首次在类风湿关节炎患者中发现循环年龄相关B细胞具有髓系特征，并确定SYK为其关键调控因子 | 研究样本仅限于初治类风湿关节炎患者，未涉及治疗中患者或其他自身免疫疾病对照 | 探究循环年龄相关B细胞在类风湿关节炎中的转录组特征和临床意义 | 类风湿关节炎患者的循环年龄相关B细胞 | 单细胞组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 网络分析, 体外实验 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 类风湿关节炎患者外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8897 | 2025-10-07 |
Cardiac conduction system regeneration prevents arrhythmias after myocardial infarction
2025-Feb, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-024-00586-x
PMID:39753976
|
研究论文 | 本研究通过比较新生小鼠心脏再生与成年期病理重塑过程，揭示了心肌梗死后心脏传导系统再生机制及其与心律失常的关系 | 首次系统揭示心脏传导系统在再生过程中的恢复机制，并通过组织透明化全器官成像和单细胞测序技术发现传导纤维紊乱与His-Purkinje系统破坏是心律失常的关键原因 | 研究主要基于小鼠模型，人类心脏数据通过建模推断，需要进一步临床验证 | 探究心肌梗死后心脏传导系统再生机制及心律失常发生原理 | 新生和成年小鼠心脏组织，人类心脏梗死模型 | 心血管研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 组织透明化全器官成像 | 小鼠心脏再生模型, 人类心脏梗死模型 | 基因表达数据, 影像数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8898 | 2025-10-07 |
Inferring multi-slice spatially resolved gene expression from H&E-stained histology images with STMCL
2025-Feb, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2024.11.016
PMID:39755346
|
研究论文 | 提出一种名为STMCL的多模态对比学习框架，用于从H&E染色组织学图像推断空间基因表达 | 首次整合组织学图像、基因表达特征和空间位置信息的多模态对比学习框架，能够准确预测空间基因表达谱 | 仅测试了10X Genomics平台生成的数据集，未验证在其他平台上的适用性 | 开发从H&E染色组织学图像预测空间基因表达的深度学习方法 | 多切片空间转录组数据集 | 数字病理学 | 癌症 | 深度学习，对比学习 | 多模态对比学习框架 | 组织学图像，基因表达数据，空间位置数据 | 四个不同类型的多切片空间转录组数据集 | 10X Genomics | 空间转录组学 | 10X Genomics平台 | 多切片空间转录组数据集 |
| 8899 | 2025-10-07 |
Sonic Hedgehog signaling regulates the optimal differentiation pace from early-stage mesoderm to cardiogenic mesoderm in mice
2025-Feb, Development, growth & differentiation
DOI:10.1111/dgd.12955
PMID:39783159
|
研究论文 | 本研究揭示了Sonic Hedgehog信号通路在小鼠早期心脏分化过程中调控分化速度的机制 | 发现SHH信号通过抑制T细胞向Mesp1新生中胚层细胞的过早分化来调控心脏分化节奏 | 研究主要基于小鼠模型，人类心脏发育可能存在差异 | 阐明Shh信号在心脏分化最早阶段的作用机制 | 小鼠早期中胚层细胞和心脏中胚层细胞 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8900 | 2025-10-07 |
Single-cell and spatial transcriptomic analyses reveal heterogeneity characteristics and specific cell subtype regulators in growth hormone-secreting pituitary adenomas
2025-Feb-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002178
PMID:39784532
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组分析揭示生长激素型垂体腺瘤的异质性特征及特定细胞亚型调控因子 | 构建了首个GHPA的单细胞和空间转录组图谱，识别了16种肿瘤细胞亚型及三种恶性偏向亚型 | 样本量有限（10个GHPA样本），需要更大规模验证 | 识别GHPA肿瘤异质性及预后相关标志物 | 生长激素型垂体腺瘤患者样本和正常垂体样本 | 单细胞组学 | 垂体腺瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | 多种算法分析 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 10个GHPA样本（其中4个同时进行空间转录组测序）和4个正常垂体对照样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | NA |